1.一种与谷子米粒颜色基因紧密连锁的分子标记,其特征在于,所述分子标记含有SEQ ID NO:1所示序列;优选地,所述分子标记为SEQ ID NO:1所示序列。
2.一种扩增与谷子米粒颜色基因紧密连锁的分子标记的引物对,其特征在于,所述引物对的引物1含有SEQ ID NO:2所示序列,引物2含有SEQ ID NO:3所示序列;优选地,引物1为SEQ ID NO:2所示序列,引物2为SEQ ID NO:3所示序列。
3.一种与谷子米粒颜色基因紧密连锁的分子标记,其特征在于,所述分子标记是由权利要求2所述的引物对以黄色米粒的谷子基因组DNA为模板经PCR扩增得到的。
4.如权利要求3所述的分子标记,其特征在于,所述分子标记为SEQ ID NO:1所示序列。
5.一种谷子米粒颜色基因定位的方法,其特征在于,所述方法包括使用权利要求1、3、4中任一项所述的分子标记或者权利要求2所述的引物对的步骤。
6.权利要求1所述的分子标记的检测方法,其特征在于,包括步骤:根据权利要求1所述的分子标记的核苷酸序列设计引物,以被检测谷子基因组DNA为模板进行扩增,并判断扩增产物中是否存在该分子标记。
7.如权利要求6所述的检测方法,其特征在于,所述引物为权利要求2所述的引物对。
8.权利要求1、3、4中任一项所述的分子标记或者权利要求2所述的引物对在谷子辅助育种或者谷子米粒颜色基因定位或检测中的用途。
9.一种谷子辅助育种方法,其特征在于,所述方法包括检测权利要求1、3、4中任一项所述的分子标记或者用权利要求2所述的引物对进行检测的步骤。
10.一种筛选权利要求1所述的分子标记的方法,其特征在于,包括以下步骤:
(1)获得纯合型父本、母本基因组;
(2)分别通过测序获得父本、母本基因组序列;
(3)比较父本、母本基因组序列,获得差异位点;
(4)构建遗传群体并收集表型数据;
(5)对群体中的个体进行基因型分析;
(6)结合基因型和表型数据,将谷子米粒颜色基因定位在基因组上;
(7)在靠近目标基因的区段选择候选的分子标记。