一种立体选择性提高的菜豆环氧水解酶突变体的制作方法

文档序号:15503452发布日期:2018-09-21 22:52阅读:238来源:国知局

本发明涉及一种立体选择性提高的菜豆环氧水解酶突变体及构建方法,属于酶工程技术领域。



背景技术:

对映纯对氯环氧苯乙烷(pcso)与其水解产物对氯苯乙二醇(pcped)是多种手性药物与功能材料的重要中间体,如r型对氯环氧苯乙烷((r)-pcso)可以用于合成cb1拮抗剂;r型对氯苯乙二醇((r)-pcped)是nmda受体抑制剂——依利罗地的重要手性砌块。目前,一系列合成对映纯pcso与pcped的生物化学方法已经被报道。其中,suresh等人利用一类手性大环席夫碱类化合物催化对氯苯乙烯加氧合成(r)-pcso,其eep最高可达47%;karboune等人利用来自重组黑曲霉(aspergillusniger)的环氧化物水解酶(aneh)水解外消旋对氯环氧苯乙烷制备(r)-pcso,当转化率达到51%时,ees为87%并保留s型底物;manoj等人使用两种对映选择性互补的eh(steh与aneh)协同水解外消旋pcso合成(r)-pcped,eep达到93%。利用ehs催化制备(r)-pcso与(r)-pcped与席夫碱催化合成相比,具有eep高,来源清洁,更易分离等优势。

环氧化物水解酶(epoxidehydrolases,ehs,ec3.3.2.-)能够催化外消旋环氧化物的水解动力学拆分或对映归一性水解,保留单一构型环氧化物或转化为手性邻二醇。该反应的立体化学结果与酶对底物的立体选择性(包括对映选择性与对映归一性)紧密相关:具有对映选择性的ehs快速催化某一构型环氧化物的水解反应,得到相应的产物邻二醇以及保留另一构型环氧化物,即进行酶促动力学拆分。其中,ehs对外消旋环氧化物的对映选择率e决定环氧化物的对映体纯度。若继续反应,另一构型环氧化物也会被水解,即进行酶促对映归一性水解。底物完全转化时,区域选择性系数决定最终产物邻二醇的对映体纯度。环氧化物和邻二醇的对映体纯度通常用对映体过量值ee评价,分别表示为ees和eep。

ehs广泛存在于各生物体中,如真菌、细菌、古生菌、病毒、植物和哺乳动物等。迄今为止,ncbi数据库中收录的ehs基因序列已达数千个。pdb数据库中与ehs晶体结构相关的数据已达两百多条,根据其晶体结构与催化机理的不同,ehs分为三类:(1)α/β水解折叠ehs,例如有微生物来源的areh,植物来源的steh和动物来源的mmseh;(2)非α/β水解折叠ehs,例如来源于人的lta4h;(3)其他类型,例如来源于红串红球菌的leh。为了更好地将pveh1应用于对映纯的环氧化物与邻二醇的工业生产,对现有的ehs中进行结构和特性方面的优化显得十分必要。



技术实现要素:

为了更好地将pveh1应用于对映纯的环氧化物与邻二醇的工业生产,本发明利用定点突变获得了立体选择性提高的pveh1突变体。本发明采用全质粒pcr的方法对184位脯氨酸进行单向定点突变,获得了立体选择性和催化活性同时提高的突变酶p184l,解决了立体选择性不能满足生产高对映纯环氧化物与邻二醇的需求,为拓宽pveh1的工业应用奠定了基础。

本发明的第一个目的是提供一种环氧化物水解酶pveh1的突变体,所述突变体含有seqidno:1所示的氨基酸序列。

本发明的第二个目的是提供编码所述环氧化物水解酶突变体的基因。

在本发明的一种实施方式中,所述基因含有seqidno.2所示的核苷酸序列。

本发明的第三个目的是提供含有所述基因的载体。

本发明的第四个目的是提供表达所述突变体的细胞。

在本发明的一种实施方式中,所述细胞包括真菌细胞或细菌细胞。

在本发明的一种实施方式中,所述细胞包括大肠杆菌、酵母或枯草芽孢杆菌。

本发明的第五个目的是提供一种提高环氧化物水解酶立体选择性的方法,是将phaseolusvulgaris来源的环氧化物水解酶第184位氨基酸突变成疏水性氨酸。

在本发明的一种实施方式中,所述突变体是将genbank登录号为xm007146940的环氧化物水解酶pveh1的第184位氨基酸突变成疏水性氨酸。

在本发明的一种实施方式中,所述突变是将色氨酸突变成亮氨酸。

本发明的第六个目的是提供所述突变体在食品、医药领域中的应用。

在本发明的一种实施方式中,所述应用包括制备手性药物或功能材料。

本发明的有益效果:

本发明通过菜豆来源的环氧水解酶1(pveh1)的pro184进行单向定点突变,获得对映选择性与对映归一性(即立体选择性)提高的突变酶p184l。p184l对外消旋间氯环氧苯乙烷(rac-mcso)的最终eep,在25℃下从3.1%提高到27.3%,这表明p184l对间氯环氧苯乙烷rac-mcso的对映归一性提高了26倍。同时,与野生型相比,p184l对外消旋对氯环氧苯乙烷rac-pcso的e值从2.6提高至20,这表明p184l对rac-pcso的对映选择性提高了7.7倍。同时,该突变体的稳定性没有发生变化,有利于酶在工业生产上的应用

具体实施方式

突变体命名方式:

采用“原始氨基酸位置替换的氨基酸”来表示突变体。如p184l,表示位置184的氨基酸由亲本pveh1的pro替换成leu,位置的编号对应于亲本pveh1的氨基酸序列。

全细胞比活力和对映选择性测定

称取100mg重组菌湿菌体悬浮于1ml磷酸钠缓冲液(100mmol·l-1,ph=7.0,)中,吸取200μl菌悬液(100mg·ml-1)加入到含750μl磷酸钠缓冲液的2mlep管中,25℃孵育5min后加入50μlrac-pcso或rac-mcso(200mmol·l-1,溶剂为甲醇)至终浓度为10mmol·l-1,25℃、800r·min-1恒温震荡反应器中反应10min,取50μl样品用1ml乙酸乙酯萃取,有机相经无水硫酸镁干燥。样品分析采用高效液相色谱仪waterse2695、手性液相色谱柱和紫外检测器。rac-pcso高效液相色谱条件为:流动相为正己烷:异丙醇=80:20,柱温为30℃,流速为0.8ml·min-1,检测波长为220nm,手性液相色谱柱as-h(250mm×4.6mm×5μm)。(r)-对氯环氧苯基乙烷((r)-pcso):6.290min,(s)-p对氯环氧苯基乙烷((s)-pcso):7.062min,(r)-对氯苯基乙二醇((r)-pcped):7.977min,(s)-对氯苯基乙二醇((s)-pcped):9.059min。

rac-mcso高效液相色谱条件为:流动相为正己烷:异丙醇=90:10,柱温为30℃,流速为0.8ml·min-1,检测波长为220nm,手性液相色谱柱od-h(250mm×4.6mm×5μm)。(r)-间氯环氧苯基乙烷((r)-mcso):5.674min,(s)-p间氯环氧苯基乙烷((s)-mcso):5.786min,(r)-间氯苯基乙二醇((r)-mcped):9.766min,(s)-间氯苯基乙二醇((s)-mcped):10.972min

在上述测定条件下,酶活单位定义为每分钟消耗1μmol的pcso或rac-mcso所需的酶量定义为1个单位酶活(u)。全细胞比活力(u·g-1)计算如公式(1)所示,其中c全细胞催化rac-pcso或rac-mcso的转化率,c0为初始浓度,t为反应时间,v为反应体积,m为全细胞质量。

底物ees和产物eep的计算公式(2)和(3)所示,其中rs和ss分别代表(r)-pcso或(r)-mcso和(s)-pcso或(s)-mcso的峰面积,rp和sp表示(r)-pcped或(r)-mcped和(s)-pcped或(s)-mcped的峰面积[17]。酶的对映选择性通常用对映体比率(enantiomericratio,e)来评价,e值越高,则对映选择性越高,其计算公式如(4),其中c是转化率。

实施例1:突变质粒构建

利用高纯度质粒小提试剂盒pureplasmidminikit(购于康为试剂有限公司)从实验室保藏的e.colibl21(de3)/pet-28a-pveh1(叶慧华,胡蝶,李闯,等.新型菜豆环氧化物水解酶的异源表达及对映归一性催化特性[j].中国生物工程杂志,2016,36(10):21-27.169:41-54.)中提取质粒作为单向定点突变的模板,

所用的引物为p184l-f(5’-3’gagaccaggaccactaatactccccaa);p184l-r(5’-3’ttggggagtattagtggtcctggtctc)。

利用hspcr酶(购于takara公司)采用全质粒pcr的方法。以pveh1的质粒为模板,pcr条件:变性98℃,10s;退火55℃,5s;延伸72℃,3.5min,循环30次,72℃延伸10min。pcr产物经采用dpni酶消化模板质粒转化e.colibl21(de3)感受态细胞,转化参照sk9302超级感受态细胞制备试剂盒使用说明书,突变体经测序确认碱基序列。得到了氨基酸序列为seqidno:1的突变酶,与野生酶(phaseolusvulgaris来源的pveh1,genbankaccessionno.xm007146940)相比,第184位的氨基酸由脯氨酸突变成了亮氨酸。

实施例2:突变体酶的获取

将获得的突变酶表达载体接种(接种量为1%)于2ml含1%卡那霉素的lb培养基中,于37℃、220r·min-1培养过夜;取2ml培养液转接于100ml含1%卡那霉素的lb培养基中,培养至od600为0.6~0.8时,加入100μl的iptg(500mmol·l-1)至终浓度为0.5mmol·l-1,20℃下诱导10h后离心收集重组菌菌体。经测定,菌体的环氧化物水解酶对rac-pcso的酶活为10.0u/g菌体细胞。

实施例3:突变前后酶的对rac-pcso对映选择性比较

本发明比较了突变前后酶的立体选择性,立体选择性又包括对映选择性与对映归一性两种性质。其中野生酶是指phaseolusvulgaris来源的pveh1,genbankaccessionno.xm007146940。

每20mg湿菌体用1ml磷酸钠缓冲液(ph=7.0,100mmol·l-1)悬浮,取1ml加入到2mlep管中,加入50μl200mmol·l-1rac-pcso(溶剂为甲醇),底物终浓为10mmol·l-1。放置于25℃、220r·min-1摇床反应,分别于30min、1h、2h及24h取50μl样品用乙酸乙酯萃取三次(总量为1ml),并用无水硫酸镁干燥后利用高效液相色谱对样品进行分析。当转化率c在50%左右时测定e值,与野生型相比,p184l对外消旋对氯环氧苯乙烷rac-pcso的e值从2.6提高至20。

实施例4:突变前后酶的对rac-mcso对映归一性比较

每200mg湿菌体用1ml磷酸钠缓冲液(ph=7.0,100mmol·l-1)悬浮,取1ml加入到2mlep管中,加入50μl200mmol·l-1间氯环氧苯乙烷rac-mcso(溶剂为甲醇),底物终浓为10mmol·l-1。放置于25℃、220r·min-1摇床反应,过夜反应取50μl样品用乙酸乙酯萃取三次(总量为1ml),并用无水硫酸镁干燥后利用高效液相色谱对样品进行分析。结果发现,反应12h后,p184l对外消旋间氯环氧苯乙烷rac-mcso最终eep从3.1%提高到27.3%。

实施例5:突变前后酶的全细胞催化rac-pcso及rac-mcso的酶活比较

称取100mg重组菌湿菌体悬浮于1ml磷酸钠缓冲液(100mmol·l-1,ph=7.0)中,吸取200μl菌悬液(100mg·ml-1)加入到含750μl磷酸钠缓冲液的2mlep管中,25℃孵育5min后加入50μlrac-pcso(200mmol·l-1,溶剂为甲醇)至终浓度为10mmol·l-1,25℃、800r·min-1恒温震荡反应器中反应10min,取50μl样品用1ml乙酸乙酯萃取,有机相经无水硫酸镁干燥。样品分析采用hplc。结果发现,p184l对外消旋对氯环氧苯乙烷rac-pcso的全细胞比活力从12.7u·g-1到27u·g-1;p184l对外消旋间氯环氧苯乙烷rac-mcso的全细胞比活力从3.4u·g-1到6.4u·g-1

虽然本发明已以较佳实施例公开如上,但其并非用以限定本发明,任何熟悉此技术的人,在不脱离本发明的精神和范围内,都可做各种的改动与修饰,因此本发明的保护范围应该以权利要求书所界定的为准。

sequencelisting

<110>江南大学

<120>一种立体选择性提高的菜豆环氧水解酶突变体

<160>4

<170>patentinversion3.3

<210>1

<211>319

<212>prt

<213>人工序列

<400>1

metgluglyvalgluhisargthrvalgluvalasnglyilelysmet

151015

hisvalalaglulysglygluglyprovalvalleupheleuhisgly

202530

pheprogluleutrptyrsertrparghisglnileleualaleuser

354045

alaleuglytyrargalavalalaproaspleuargglytyrglyasp

505560

thraspalaproalaservalsersertyrthrileleuhisleuval

65707580

alaaspvalvalalaleuileaspserleuglyvalaspglnvalphe

859095

leuvalalahisaspglyalaleuvalglytrptyrthrcysleuphe

100105110

argproaspargilelysalatyrvalcysleuservalprophemet

115120125

proargasnprolysvallysprovalaspalametargalaleutyr

130135140

glyaspasptyrtyrilecysargpheglngluproglylysmetglu

145150155160

thrleutyraspasnasnilegluglualailelysasnmetleuthr

165170175

serargargproglyproleuileleuprolysgluglyalaglyser

180185190

asnproleualaserglyserleuproserargproleuprosertrp

195200205

leuserglngluaspleuthrtyrtyralaserlyspheglylysthr

210215220

glyleuthrglyglyleuasntyrtyrargasnleuasnleuasntrp

225230235240

gluleuthralaalatrpthrglyvalglnvallysvalprovallys

245250255

pheilethrglyaspleuaspilevalhisthrserleuglythrlys

260265270

asptyrilegluserglyalaphelysargaspvalpropheleuglu

275280285

gluvalvalvalglngluglyvalalahispheasnasnglngluala

290295300

alagluaspvalserasnhisiletyrasppheileasnlysphe

305310315

<210>2

<211>1125

<212>dna

<213>人工序列

<400>2

cccctctagaaataattttgtttaactttaagaaggagatataccatgggcagcagccat60

catcatcatcatcacagcagcggcctggtgccgcgcggcagccatatggaaggcgtagaa120

cacaggacagtggaagtgaatggcatcaaaatgcatgtagcagagaaaggagagggtcct180

gtcgtcttgttcctccatggcttccccgagctctggtactcctggcgccaccagattctg240

gctctcagcgccctcgggtaccgcgccgtggctcctgatctgcgtggctacggagacacc300

gatgccccggcttcggtgagcagctacaccatcttgcacctcgtggctgacgtcgtggca360

ctcattgactcacttggtgtggatcaagtcttcctcgttgcccatgattggggagcccta420

gtaggatggtacacatgtttatttcgacctgatagaatcaaggcctatgtttgcctcagc480

gtccctttcatgcccagaaacccaaaagtgaagcccgttgatgccatgcgtgccctttat540

ggggatgactactacatctgcagattccaggaaccaggcaagatggaaactctgtatgac600

aataatatcgaagaagcaatcaagaacatgcttacaagtaggagaccaggaccactaata660

ctccccaaagaaggagcgggttccaatccccttgcttcagggtcccttccatcaaggcct720

cttccatcttggctctcacaggaagatctgacttactatgcttctaaatttggcaagaca780

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<213>人工序列

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gagaccaggaccactaatactccccaa27

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<212>dna

<213>人工序列

<400>4

ttggggagtattagtggtcctggtctc27

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