一种新型聚合酶链反应微流体芯片控制系统及其制备方法

文档序号:8247107阅读:473来源:国知局
一种新型聚合酶链反应微流体芯片控制系统及其制备方法
【技术领域】
[0001]本发明属于微加工技术应用领域,具体涉及一种新型聚合酶链反应(PCR)微流体芯片控制系统及其制备方法。该系统在聚合酶链反应(PCR)过程前,利用微流体控制系统产生量级为纳升甚至皮升的微液滴,从而实现诸如RNA、DNA的基因扩增。
【背景技术】
[0002]聚合酶链式反应(polymerase chain react1n, PCR)是最常用的分子生物学技术之一,通过变性、退火和延伸的循环来完成核酸分子的大量扩增。PCR技术有特异性高、灵敏度强、快速、简便等诸多优点,在过去的几十年里,PCR技术已经被广泛地应用在不同的领域,比如食品工业、医学、病毒检测、生物学研究等基础领域。PCR技术自从1985年由Millus创立后,经历20多年的飞速发展,已成为不可或缺的一项重要微生物应用技术,主要包括:反转录PCR技术、定量PCR技术、实时荧光定量PCR技术、重组PCR技术、反向PCR技术和多重PCR技术等。
[0003]但是,传统的PCR技术需要大量昂贵的生物样品,使得测试成本很高,并且无法实现单个细胞的基因测试,进而不能有效识别单细胞之间的差异,使得其应用受到一定限制。近年来,随着微流体技术(Micro-fluid Technology)的快速发展,微流体生物芯片被视为是后基因时代用来解读基因序列之重要工具,受到极大的重视。微流体芯片,又被称为“芯片实验室”(Lab-on-a-chip),它是利用微机电技术将一般实验室所使用的分离纯化混合,以及酵素反应等装置微小化到芯片上,以进行生化反应、过程控制或分析,其构造远较微数组芯片复杂得多,可对微量流体(包括液体和气体)进行复杂、精确的操作,如:混合和分离微量流体、化学反应、微量分析等等。微流体芯片还可以在稀有细胞的筛选、信息核糖核酸的提取和纯化、基因测序、单细胞分析、蛋白质结晶等方面发挥独特的作用。因为其具有体积轻巧、使用样品/试剂量少、反应速度快、大量平行处理及可抛弃式等优点,因此在生物技术研究上的应用范围非常广泛。
[0004]在过去10年中,微流体芯片技术的快速发展使得PCR过程可以在微型化的系统中完成成为可能,与传统PCR系统相比,其优势是不仅大大缩短了反应时间,而且极大地降低了所需的样本量。采用微流体芯片技术可以很容易获得量级在纳升甚至皮升、且尺度上非常均匀的液滴。这些分散的液滴有效地避免了彼此间的相互干扰,保证了在PCR过程中个体的独立性。该项技术使得单细胞基因测试逐步成为现实。
[0005]传统的微流控芯片的制作通常采用玻璃、硅片或者是近几年非常流行的PDMS材料。玻璃和硅片的制作工艺复杂、成本极高,而PDMS由于其多孔性使得其在PCR过程中易造成容易的大量挥发,因此不适合制作应用于PCR过程的芯片系统。
[0006]为了解决上述传统PCR过程中遇到的问题,本发明将一种新型微流体芯片技术应用到PCR过程中,提出了一种新型聚合酶链反应(PCR)微流体芯片控制系统。

【发明内容】

[0007]本发明针对传统PCR技术不能实现单细胞基因表达测试的问题,并应用一种新型微流体芯片技术,提出了一种新型聚合酶链反应(PCR)微流体芯片控制系统及其制备方法。
[0008]本发明提出的一种新型聚合酶链反应(PCR)微流体芯片控制系统,由多条实验通道I和一条参照通道II组成,所述实验通道I和参照通道II采用折流式布置,所述实验通道I入口端设有实验组油相入口 3、实验组溶液入口 4和实验组阀门6,所述实验组油相入口 3与实验组溶液入口 4相互垂直,且实验组油相入口 3通道为水平通道,实验组溶液入口4通道为竖直通道,所述实验通道I出口端设有第三出口 12和第四出口 13,实验通道I中部由若干条第二矩形通道8按照首尾相接的形式折流布置而成,第二矩形通道8的平直段上设有圆柱形空腔9,相邻圆柱形空腔9边缘距离为200 μ m ;所述参照通道II入口端设有参照组溶液入口 1、参照组油相入口 2和参照组阀门5,所述参照组油相入口 2与参照组溶液入口 I相互垂直,且参照组油相入口 2通道为水平通道,参照组溶液入口 I通道为竖直通道,所述参照通道II出口端设有第一出口 10和第二出口 11,参照通道II中部由若干条第一矩形通道7按照首尾相接的形式折流布置而成,第一矩形通道7的平直段上设有圆柱形空腔9,相邻圆柱形空腔9边缘距离为200 μ m。
[0009]本发明中,所述第一矩形通道7和第二矩形通道8的矩形截面尺寸为200μπι X100 μ m,圆柱形空腔9直径为400 μ m、300 μ m或200 μ m中任一种,高为180 μ m,圆柱形空腔底部厚度为50 μ m。
[0010]本发明中,所述第一出口 10、第二出口 11、第三出口 12和第四出口 13的出口通道可以任意夹角,参照组阀门5通道与参照通道可以任意夹角,实验组阀门6通道与实验通道可以任意夹角。
[0011]本发明提出的一种新型PCR微流体芯片控制系统的制备方法,包括(I)制备初始模板a, (2)制备PDMS模板b,(3)制备PDMS模板C,(4)制备NOA树脂通道d,(5)制备NOA树脂盖板e,(6)制备微流体芯片控制系统f,具体步骤如下:
(1),制备初始模板a:在洁净室内,将硅片置于氢氟酸里进行清洗,去除天然氧化硅表层;接着将硅片置于95°C温度下加热5分钟,去除残留的氢氟酸;采用高速旋转涂胶机在硅片上涂一层厚度为100 ym的SU-8光刻胶,将所得硅片置于65°C的烘胶平台上进行烘烤5分钟,然后再在95°C的烘胶平台上烘烤25分钟,之后采用光刻机进行软光刻;将软光刻后的硅片分别置于65°C烘胶平台上烘烤5分钟,95°C平台上烘烤10分钟,待冷却后采用SU-8显影剂进行显影以除去多余的光刻胶,显影过程为10分钟,之后采用高速氮气清洁硅片表面,即得到图1所需通道形状的母版,也就是图5中所需的初始模板a ;
(2),制备PDMS模板b:将步骤(I)得到的初始模板a放在锡纸折成的圆腔内,将按10:1质量比例混合的PDMS-RTV聚合物浇注在初始模板a的正面,并将其置于真空皿内脱气30分钟;脱气后,将其置于70°C的炉内烘烤至少I小时固化,形成初始模板a的负面模板,即PDMS模板b ;
(3),制备PDMS模板c:将步骤(2)得到的PDMS模板b从初始模板a上脱离,并采用等离子机对其通道面进行活化I分钟;接着将其置于装有三氯硅烷的封闭容器中2小时,待其在通道表面上形成一层氧化硅表层后;将所得PDMS模板b再次放在锡纸折成的圆腔内,通道面朝上,浇注按10:1质量比例混合的PDMS-RTV聚合物,再次放入真空皿内脱气30分钟,后在70°C下烘烤I小时,形成与初始模板a相同形状的PDMS模板C,并将其从PDMS模板b上剥罔,备用;
(4),制备NOA树脂通道d:将一载玻片放在一平板PDMS支撑面上,在载玻片顶部轻轻地施加压力消除存在于载玻片和平板PDMS之间的空气;在载玻片上面涂一层平均厚度约120 μ m的NOA合成树脂,将步骤(3)得到的PDMS模板c置于N0A81合成树脂上面与之对其,从顶部施加压力以排除大气泡,而小气泡则被吸收到PDMS模板c内,使得N0A81合成树脂完全将PDMS模板c的突出包住,之后将其置于强度为30%的紫外灯下照射6.5秒使N0A81合成树脂固化,最后轻轻将PDMS模板c取下,得到NOA树脂通道d ;
(5),制备NOA树脂盖板e:用喷砂机在一载玻片相应位置打十个孔,孔径均为I mm,作为整个控制系统的进出口和阀门口,后将该载玻片清洗干净;用胶带封住载玻片的一面,确保所有的孔都被封住,之后将其放在PDMS平板上,让带有胶带的一面朝下,在其上面滴上几滴N0A81合成树脂,在毛细管力作用下,树脂将分布在整个载玻片上;后将其置于强度为30%的紫外光下照射8.5秒固化树脂;固化后取下载玻片除去胶带,清洗边缘,检查载玻片上的孔以确保它们是可穿透的,即得到NOA树脂盖板e ;
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