基于宏基因技术从霉变的甘蔗叶中筛选β-葡萄糖苷酶基因的方法_3

文档序号:9703044阅读:来源:国知局
上述方法测定其酶活性,得到其最适反应pH(以酶 活力最高时记为100%)。在室温下条件,将酶液在pH4.0、5.0、6.0、7.0、8.0、9.0、10.0和 11.0的缓冲液中保存2h,35°C测定剩余酶活,得到酶的pH稳定性。结果如图4和5所示, Glu417的最适反应pH为8.0X1U417在pH4.0-11.0的范围内保持极高的稳定性。
[0071] 3)葡萄糖浓度对β_葡萄糖苷酶酶活性的影响
[0072]在酶液中加入葡萄糖使其终浓度分别为0.5,1.0,1.5,2.0和2.5Μ,室温放置2h,然 后在标准条件下测酶活力,以未加葡萄糖的酶液活力为100%。结果如图6所示,低浓度的葡 萄糖对Glu417的酶活力有促进作用,而高浓度的葡萄糖对Glu417的酶活力没有明显的影 响,葡萄糖的抑制常数Ki为1.38M。
[0073] 4)乙醇对β_葡萄糖苷酶酶活性的影响
[0074] 在酶液中加入无水乙醇使其终浓度分别为5%,10%,20%,30%和50%,室温放置 2h,然后在标准条件下测酶活力,以未加乙醇的酶液活力为100%,结果如图7所示,低浓度 的乙醇对Glu417的酶活力没有明显的影响,当乙醇浓度为5 %和10 %时,Glu417的剩余酶活 力分别为98 %和91 %,随着乙醇浓度的提高,Glu417的酶活力逐渐降低,当乙醇浓度达到 30 %时,Glu417的剩余酶活力为47 %。
[0075] 5)NaCl对β-葡萄糖苷酶酶活性的影响
[0076] 在酶液中加入NaCl使其终浓度为0.5Μ、1Μ、1.5Μ、2Μ和2.5Μ,室温放置2h,然后在标 准条件下测酶活力,以未加NaCl的酶液的活力为100%。结果如8所示,低浓度的NaCl对 G1u417的酶活力有促进作用,高浓度的NaCl对G1u417的酶活力没有明显的影响,NaC1浓度 达2.5M,Glu417仍有76%的酶活力。





【主权项】
1. 一种β-葡萄糖苷酶基因,其特征在于,其核苷酸序列如SEQIDNO. 1所示。2. -种重组β-葡萄糖苷酶,其特征在于,其氨基酸序列如SEQIDNO.2所示。3. -种重组β-葡萄糖苷酶的筛选方法,其特征在于,包括以下步骤: 1)、霉变甘蔗叶微生物宏基因组DNA的提取:收集霉变的甘蔗叶10g,并将其剪至l-3c m 长度,放入250ml三角瓶中;加入富集培养液,30°C震荡培养72h;离心收集菌体,菌体重悬于 1.35ml DNA抽提buffer,混匀后加入0.15ml 20%SDS,65°C水浴2h,期间每隔20min上下颠 倒10次并液氮冷冻2min;6000g离心lOmin,收集上清,加入等v的氯仿,上下颠倒混勾;6000g 离心lOmin,收集上清,加入0.6v的异丙醇,室温沉淀2h;16000g离心20min,弃上清,沉淀用 75%的乙醇洗涤两次后,用dd H20溶解,即得粗提液; 2) 、构建宏基因组文库:用1%琼脂糖凝胶电泳检测DNA片段的大小,用核酸电泳检测仪 检测DNA的浓度及纯度,对DNA进行纯化,并用限制性内切酶BamHI部分酶切总DNA,回收3-10kb的酶切片段;构建宏基因组文库; 3) 、从宏基因组文库中筛选出β_葡萄糖苷酶基因,其核苷酸序列如SEQIDNO. 1所示; 4)、对获得的β_葡萄糖苷酶基因进行克隆、表达,得到β_葡萄糖苷酶重组蛋白,其氨基 酸序列如SEQIDNO.2所示。4. 根据权利要求3所述的重组β-葡萄糖苷酶的筛选方法,其特征在于,所述步骤1)中富 集培养液包括以下组分:羧甲基纤维素钠5g/L;NaN03 2g/L;K2P03lg/L;KCl0.5g/L;MgS〇4 0.5g/L;FeS〇4 0.01g/L,余量为水,以上总量为100ml。5.根据权利要求3所述的重组β-葡萄糖苷酶的筛选方法,其特征在于,所述步骤1)中 DNA抽提buffer包括以下组分:100mM Tris-HCl,100mM EDTA-Na2,100mM磷酸缓冲液,1·5Μ NaCl,1%CTAB,以上组分总量为1·35ml,其中,Tris-HCl的pH为8·0,EDTA-Na2的pH为8·0,磷 酸缓冲液的pH为8.0。6. 根据权利要求3所述的重组β-葡萄糖苷酶的筛选方法,其特征在于,所述步骤2)中构 建宏基因组文库具体为:将回收得到的酶切片段和pUCl18/BamHI(ΒΑΡ)载体连接过夜,连接 产物用PCR产物纯化试剂盒进行纯化后与电转化感受态细胞混合,冰上放置5min,转移DNA/ 细胞混合物至预冷的2mm电穿孔容器中,在电压为2,500V的条件下对电穿孔容器进行脉冲, 立即添加900μ1的LB至电穿孔容器中,37°C,180r/min,震荡培养30min,转化产物涂布到含 有100yg/ml氨苄青霉素,0.5mM异丙基-β-D-硫代半乳糖吡喃糖苷和100μΜ5-溴-4-氯-3-吲 哚-β-D-半乳糖苷的平板上,平板倒置放入37°C培养箱中,培养15-18h;由此构建一个库容 量达100000个转化子、多样性好的宏基因组文库。7. 根据权利要求3所述的重组β-葡萄糖苷酶的筛选方法,其特征在于,所述步骤3)中从 宏基因组文库中筛选出葡萄糖苷酶基因具体为: 3.1 )β_葡萄糖苷酶基因的筛选:将过夜培养物复制到筛选平板上,37°C培养72h,挑选 颜色为黑色的克隆子,其中,筛选平板为:蛋白胨l〇g/l,酵母粉5g/l,NaCl10g/l,七叶苷 lg/1,柠檬酸高铁铵2.5g/l,100μg/mlAmp和0.5mMIPTG; 3.2)β-葡萄糖苷酶基因的复选:挑取在筛选培养基上的黑色克隆子,接种到10mL含有lOOyg/mLAmp、0·5mMIPTG的LB培养基中,37°C,180r/min过夜培养,6000Xg,离心5min收集 菌体,磷酸盐缓冲液(100mM,pH7.0)洗涤菌体一次,离心收集菌体,磷酸盐缓冲液重新悬浮 菌体,超声波破碎菌体,离心收集上清作为粗酶液酶活性的检测;取l〇〇yL粗酶液和100μ1 lOmM对硝基苯-β-D-葡萄糖苷,37°C放置20min,能够使pNPG溶液由无色变为黄色的即为阳 性克隆,通过筛选得到一个阳性克隆子PUC118-1-1; 将阳性克隆子的质粒送去测序公司进行测序,测序结果显示,β-葡萄糖苷酶基因的核 苷酸序列由972个碱基组成,其核酸序列如SEQIDNO. 1所示。8.根据权利要求3所述的重组β-葡萄糖苷酶的筛选方法,其特征在于,所述步骤4中对 获得的葡萄糖苷酶基因进行克隆、表达,得到葡萄糖苷酶重组蛋白具体为: 4.1) 、基因片段的克隆:根据测序结果设计引物:Glul和Glu2,引物两端引入能插入 pET-28a( + )载体的Ncol和Xho頂每切位点,引物序列如下: Glul:5'ATGGCGGCCATTTACGGTCGGCATAT'3,其序列如SEQIDN0·3所示; Glu2:3'CTACCACGTCATCTTCAATCCCAACT'5,其序列如SEQIDN0·4所示; 利用两条引物,以质粒PUC118-1-1为模板进行PCR扩增反应,PCR程序为98°C,4mim,98 °C,30s; 56°C30s ; 72°C,30s; 25cycles,72°C,lOmin;PCR产物用PCR产物纯化试剂盒纯化后 用Ncol和Xhol双酶切14h,与经过同样处理的pET-28a( + )(Invitrogen)表达载体进行连接, 转化Escherichia coli BL21(DE3),转化液涂布在50yg/mL含卡那霉素的LB固体培养基,37 °〇培养过夜,随机挑取10株单菌落接种提取质粒DNA,双酶切验证后,送交测序; 4.2)、重组β-葡萄糖苷酶Glu417粗酶液的获得及重组β-葡萄糖苷酶:将含有经测序验 证正确质粒的菌株划线至含50yg/mL卡那霉素的LB固体培养基中,37°C培养过夜,随机挑取 重组菌接种至含50yg/mL卡那霉素的LB液体培养基中,37°C、180r/min摇床培养过夜,按1: 100的接种量转接至50mL的含50yg/mL卡那霉素的LB液体培养基中,当生长至0D6Q() = 0.6时 加入IPTG至终浓度0.3mM,37°C、200r/min培养15小时,14,000Xg离心5min,弃上清,将菌体 重悬于50mL,0.1Μ、ρΗ8.0的磷酸盐缓冲液中,用超声波破碎仪破碎细胞,4°C,12,000Xg离 心20min,收集上清,得到粗重组蛋白,其核苷酸序列如SEQIDNO.2所示。
【专利摘要】本发明公开了一种β-葡萄糖苷酶基因,其核苷酸序列如SEQ?ID?NO.1所示。本发明还公开了一种重组β-葡萄糖苷酶,其氨基酸序列如SEQ?ID?NO.2所示。本发明还公开了一种重组β-葡萄糖苷酶的筛选方法,包括以下步骤:霉变甘蔗叶微生物宏基因组DNA的提取,构建宏基因组文库,从宏基因组文库中筛选出β-葡萄糖苷酶基因,其核苷酸序列如SEQ?ID?NO.1所示;对获得的β-葡萄糖苷酶基因进行克隆、表达,得到重组β-葡萄糖苷酶,其氨基酸序列如SEQ?ID?NO.2所示。该重组β-葡萄糖苷酶在碱性条件下活性很高且对水解产物不敏感。
【IPC分类】C12Q1/68, C12N15/10, C12N9/42, C12Q1/34, C12N15/56
【公开号】CN105462999
【申请号】CN201510903621
【发明人】姚健, 陈庆隆, 张 诚, 钟国祥, 桂伦, 王洪秀, 马吉平, 陈柳萌
【申请人】江西省农业科学院农业应用微生物研究所
【公开日】2016年4月6日
【申请日】2015年12月8日
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