来自假交替单胞菌属的分离细菌的应用、环脂肽及其应用
【技术领域】
[0001 ]本发明涉及:一种来自假交替单胞菌(Pseudoalteromonas)属的分离的细菌用作 益生菌，所述菌株作为防腐剂的应用，可由该细菌获得的环脂肽，包括至少上述环脂肽的组 合物，以及它们的应用。
【背景技术】
[0002] 水产养殖将所有的动物或植物生产活动都集中在水性介质中。通过在海洋、河流 或池塘中进行水产养殖。从直接供应食物或载体（由例如加载了矿物质的水上升而间接产 生的载体)开始，人工鱼礁或吸引区或浓缩装置(concentration)的某些系统就与水产养殖 相似。水产养殖还涉及鱼类生产(鱼类养殖）、贝类生产（贝类养殖）、甲壳类动物的生产(鳌 4下养殖(astaciculture)和对奸养殖（shrimp farming))、鲍鱼生产（水产养殖）、牡生产 (牡蛎养殖)或进一步的藻类生产(藻类养殖）。
[0003] 水产养殖是对鱼类的过度捕捞和越来越大的需求所引起的响应之一。2008年，水 产养殖为全球提供了人类消耗的76.4%的淡水鱼类、68.2%的洄游型鱼类、64.1%的软体 动物、46.4 %的甲壳类动物和2.6 %的海水鱼类。
[0004] 水产养殖有时用于除了食物消费之外的其它目的，例如在欧洲，经由从1850年至 1870年建立的很多"鱼类养殖站"；或者在日本，为了将虾或鲍鱼重新引入到这些动物被过 度开采或因为其它原因（污染等)而消失的环境中。
[0005] 现今，生产方法的强化和气候变化使得水产养殖和牡蛎养殖的发展特别脆弱。
[0006] 在水产养殖物种的天然生物防护策略中，使用了来自健康野生动物的益生菌。如 果在养殖中广泛使用益生菌，则它们在水产养殖中的应用仍然是新颖的。
[0007] 因此，对于动物育种的生产者和工业家来说，生物发展和保护这些物种的有效策 略表现出不可否认的优点。
[0008] 此外，抗微生物剂的更新是公众和兽医卫生的重点。但它们的过度和不适当使用 选择出了多重耐药菌株，从而进入了治疗死胡同（在EEC中25,000死亡/年，WHO 2011)。
[0009] 已经30年没有在市场上出售新的抗革兰氏阴性菌的抗生素。因此，对具有抗微生 物性质的新的化合物的研究是重要，而且是迫切的。
[0010] 平行地，在植物检疫处理的领域中还需要鉴定出对环境没有害，且仍然是有效的 杀菌试剂的替代产品。
【发明内容】
[0011] 在本发明的范围内，发明人分离出了在动物卫生领域，特别在水产养殖领域中具 有有用性质的海洋细菌。
[0012] 该海洋细菌尤其产生抗菌化合物，发明人已经对这些抗菌化合物在结构和功能水 平上进行了表征。
[0013] 该细菌属于 Pseudoalteromonas属。
[0014] Gauthier等在1995年首先提出了 Pseudoalteromonas属，并且迄今为止， Pseudoalteromonas属由39种细菌组成（Gauthier，G. ,Gauthier，M.&Christen，R. (1995) Phylogenetic Analysis of the Genera Alteromonas,Shewanella,and Moritella Using Genes Coding for SmalI-Subunit rRNA Sequences and Division of the Genus Alteromonas into Two Genera , Alteromonas(Emended)and Pseudoalteromonas gen·ηον·,and Proposal of Twelve New Species Combinations.Int J Syst Bacteriol 45,755-761)。
[0015] 本申请的发明人分离出了Pseudoalteromonas hCg-6细菌，该Pseudoalteromonas hCg-6细菌能产生抗菌化合物，特别是包括七肽环和4至20个碳原子的烃链的环脂肽，更特 别是式A的环脂肽：
[0017]其中：
[0018] R选自由以下基团组成的组：
[0019]-除了壬基和十一烷基之外的含4至20个碳原子的烷基;或 [0020]-除了 ^^一碳-4-烯基和十三碳-6-烯基之外的含4至20个碳原子的烯基;或 [0021]-经-OH基取代的且含4至20个碳原子的烷基;和 [0022]-经-OH基取代的且含4至20个碳原子的烯基。
[0023] 更特别地，分离的上述细菌是细菌Pseudoalteromonas hCg-6,是根据布达佩斯条 约于2013年5月22日保藏于微生物菌种国家保藏中心（CNCM，法国巴黎）的保藏编号为I-4753的菌株。
[0024] 菌株hCg-6是从巨属(Crassostrea)牡的血淋巴中分离出来的，并且示出能在 血淋巴和各种培养基的上清液中分泌抗菌化合物。
[0025] 如在下面实施例中所示，通过研究该菌株的基因型和生化特征，能够定义新物种。
[0026] 特别在水产养殖或植物保护领域中，对上述细菌最感兴趣的是，它在它的培养上 清液中分泌抗病原菌的活性抗菌化合物。
[0027] 根据这些方面之一，本发明涉及之前提到的分离的细菌，用作动物育种的益生菌， 特别是用作水产养殖的益生菌。
[0028] 更特别的是，本发明涉及如上所述的分离的细菌，用作鱼类养殖、贝类养殖、水产 养殖、鳌虾养殖、对虾养殖、牡蛎养殖和藻类养殖的益生菌。更特别的是，本发明涉及如上所 述的分离的细菌，用于改善鱼类、贝类、甲壳类动物、鲍鱼、牡蛎或进一步的藻类的健康。
[0029] 本发明还涉及如上所述的分离的细菌作为益生菌的应用，特别用于鱼类养殖、贝 类养殖、鳌奸养殖、对奸养殖、水产养殖、牡养殖和藻类养殖。更特别的是，本发明涉及如 上所述的分离的细菌的应用，用于改善鱼类、贝类、甲壳类动物、鲍鱼、牡蛎或进一步的藻类 的健康。
[0030] 根据这些方面的另一方面，本发明还涉及一种治疗鱼类、贝类、甲壳类动物、鲍鱼、 牡蛎或进一步的藻类的方法，该方法包括给予有效量的根据本发明的细菌。特别是，该方法 要改善鱼类、贝类、甲壳类动物、鲍鱼、牡蛎或进一步的藻类的健康。
[0031] "益生菌"指要被引入到动物食品中的食品添加剂，该食品添加剂包括有效量的根 据本发明的分离的细菌。按照0MS，益生菌是以适当量给予的，并且对宿主的健康有益的活 的微生物(0MS，2001)。
[0032] "有效量"指能实现所要求的效果的细菌的量。特别指在IO3CFU.ml- 1至IOiqCFU.ml 4之间的量。
[0033] 根据这些方面的另一方面，本发明还涉及如上所述的细菌作为植物检疫剂的应 用。
[0034]根据这些方面的另一方面，本发明还涉及一种植物检疫处理的方法，该方面包括 向特别是植物、真菌或昆虫，给予有效量的根据本发明的细菌。
[0035]此外，发明人分离了一个新家族的环脂肽。根据本发明的环脂肽包括七肽环，该七 肽环经被长度、不饱和度和羟基化水平可变的烃链酰化。
[0036]因此，本发明还涉及式A的环脂肽：
[0038]其中：
[0039] R选自由以下基团组成的组：
[0040]-除了壬基和十一烷基之外的含4至20个碳原子的烷基;或
[00411 -除了 ^^一碳-4-烯基和十三碳-6-烯基之外的含4至20个碳原子的烯基;或
[0042]-经-OH基取代的且含4至20个碳原子的烷基;和 [0043]-经-OH基取代的且含4至20个碳原子的烯基。
[0044] "烷基"指直链或支链的，任选地为环状的饱和脂肪族基团，该饱和脂肪族基团含4 至20个碳原子，更特别含6至14个碳原子。例如，烷基可为丁基、戊基、己基、庚基、辛基、癸 基、十二烷基和十三烷基等。
[0045] "烯基"指直链或支链的，任选地为环状的不饱和脂肪族基团，该不饱和脂肪族基 团含4至20个碳原子，更特别含6至14个碳原子，并且包括一个或多个双键，尤其包括1至3个 双键。例如，烯基可为丁烯基、戊烯基、己烯基、庚烯基、辛烯基、壬烯基、癸烯基、^--碳烯 基、十二碳烯基、十三碳烯基等。特别可以是壬烯基，特别是壬基-2-烯基，辛烯基，癸烯基， 十二碳烯基，癸二烯基，十三烷基三烯基等。
[0046] 例如，经-OH基取代的烷基可以是羟基壬基，特别是2-羟基壬基。
[0047] 例如，经-OH基取代的烯基可以是羟基辛烯基。
[0048] 更具体地，根据本发明的环脂肽是如上所述的式(A)的环脂肽，其中，R选自由以下 基团组成的组：
[0049] -除了壬基和十一烷基之外的含6至14个碳原子的烷基;或
[0050] -除了 ^^一碳-4-烯基和十三碳-6-烯基之外的含6至14个碳原子的烯基;或 [0051 ]-经-OH基取代的且含6至14个碳原子的烷基;和
[0052]-经-OH基取代的且含6至14个碳原子的烯基。
[0053] 仍然更具体地，根据本发明的环脂肽选自如上定义的式(A)的环脂肽，其中，R选自 由以下