一种基于非负矩阵分解的恶性胶质母细胞瘤组织分类方法

文档序号:8224159阅读:391来源:国知局
一种基于非负矩阵分解的恶性胶质母细胞瘤组织分类方法
【技术领域】
[0001] 本发明属于医学信号处理技术领域,设及一种基于非负矩阵分解的恶性胶质母细 胞瘤组织分类方法。
【背景技术】
[0002] 胶质细胞瘤(即神经胶质细胞瘤)是中枢神经系统中最常见的原发性神经系统肿 瘤。胶质细胞瘤在神经系统肿瘤中所占比例约为33%,在恶性肿瘤中的比例约为80%。其 中,I级和II级胶质细胞瘤为良性肿瘤,良性胶质细胞瘤患者可W存活很多年。III级和IV 级胶质细胞瘤为恶性肿瘤。恶性胶质母细胞瘤(glioblastoma, GBM)是最高级别的胶质细 胞瘤,其预后性极差、异质性程度很高,并且具有很强的弥漫浸润性,该些特性使得GBM的 诊断和预后变得非常困难。
[000引核磁共振(Nuclear Ma即etic Resonance, NMR)技术是目前最常用的脑肿 瘤诊断手段,常常被用于脑肿瘤的初步诊断。核磁共振谱成像(Magnetic Resonance Spectroscopy Imaging, MRSI)技术在脑肿瘤的分类方面有着显著的优势。MRSI通过人 体的化学成分提供人体组织生物化学的空间信息,并且通过疾病情况下代谢物浓度的变 化,可W区分正常及肿瘤组织。对MRSI数据的处理需要用到盲信号分离炬lind Source S巧aration,BS巧技术,BSS算法的主要思想是将矩阵近似地分解为两个矩阵和的乘积。非 负矩阵分解(Non-negative Matrix F'actorization, NMF)是BSS算法中的一类,强制限定 和因子为非负,用NMF对MRSI数据进行处理可W得到理想的处理结果。
[0004] 2004年,P. Sajda等人提出了约束非负矩阵分解算法(constrained NMF,cNMF), 该是首次采用NMF来解决long-TE MRSI数据的组织分类问题。cNMF算法可W有效地提取 出具有重要物理意义的谱源,但该算法强调的是区分正常组织与非正常组织,却无法在非 正常组织中准确识别GBM组织。
[0005] 李雨谦等人提出分层非负矩阵分解算法(hierarchical, hNMF),首先使用一次 NMF方法将正常组织与非正常组织分开,然后通过设定合适的口限值在非正常组织中再次 应用NMF,从而识别出GBM组织。在第二级NMF前的口限选择上,该hNMF算法中在计算口限 值时只是沿着肿瘤缩小的方向进行,而沿着肿瘤缩小方向得到的口限值与沿着肿瘤扩大得 到的口限值是不同的。

【发明内容】

[0006] 本发明的目的在于克服上述技术存在的缺陷,提供一种基于非负矩阵分解的恶性 胶质母细胞瘤组织分类方法,通过图像处理技术分析核磁共振谱成像数据,进而完成对脑 胶质细胞瘤的组织分类。本发明通过对病人的MRSI数据进行两次NMF分解,从而将胶质细 胞瘤的=种组织类型(正常、肿瘤、坏死)进行识别和分类。首先对MRSI数据进行波源数 为2的NMF分解,得到正常组织和非正常组织对应的波源和空间分布h-map。然后确定最 佳掩膜并在掩膜上再次进行波源数为2的NMF分解,得到肿瘤组织和坏死组织对应的波源。 最后用NNLS估计出=个波源所对应的空间分布h-map。其具体技术方案为:
[0007] 一种基于非负矩阵分解的恶性胶质母细胞瘤组织分类方法,包括W下步骤:
[0008] 第一步;第一级NMF ;在VOI (Volume of Interest,感兴趣区)区域内所有体素的 波谱构成的矩阵X上应用NMF,并令波源数量为2 ;波谱的初始值选用仿真的正常、肿瘤及 坏死组织分别对应的波谱;h-map的初始值为随机量;得到两个波源及其相应的空间分布 山""及^^。。》。1;比较两波谱的歴4/1198的比值,歴4/1198比值较大的波谱代表正常组织, 较小的为波谱代表非正常组织;
[0009] 第二步;第二级NMF ;由山。。""1确定非正常组织范围,H abMtmd的数值范围为 出;设定ti、t2两个参数,其中ti由小至IJ大取值,t2由大至IJ小取值,取值范围均为 出min, HmJ ;构造掩膜函数f a),对应不同的t值,HabMtmal中超过t值的数值对应的体素即代 表非正常组织,在由非正常组织波谱组成的矩阵上再次应用NMF算法,并令波源数目为2, 波谱的初始值选用仿真的正常、肿瘤及坏死组织分别对应的波谱;h-map的初始值为随机 量;由此得到两种波源啊",。",,。,(〇与Ki。,口限值的选取法则;
[0010] f (t) = corrl (t)+corr2 (t)+corr3 (t)
[0011] corr、(t) = corr(W,mn,,。;
[001 引 corr2(t) = corr(Wn0m,u,,W;l,0n"w(t))
[0013] c仍t3(〇 =厦奶6。。,,,,。/ 脚昭
[0014] 最佳口限值的选取规则如下:
[00巧]t = arg min (f (ti), f 扣))
[0016] 得到最佳口限值下的喊,,。,,,,。/(/)与取。;,,。。。。/(〇后,计算Cho/Lips的比值,Cho/Lips 比值较小的波谱对应为坏死组织即另一个对应为肿瘤组织即
[0017] 第立步:NNLS估计;由得到的;个波源胖。。"。1,及在第一步中VOI区 域上应用非负最小二乘,得到S个波源对应的准确的空间分布h-map。
[001引优选地,第一步中,NAA与Lips的值分别为2. Olppm及1.化pm附近区域的最大强 度值。
[0019] 优选地,第二步中,化0与Lips的值分别为3. 22ppm及1.化pm附近区域的最大强 度值。
[0020] 与现有技术相比,本发明的有益效果为:
[0021] 相比于现有技术的缺点和不足,本发明具有W下有益效果:
[0022] 1、采用口限最优化方法,能够准确分解出=种组织所对应的具有代表性波谱W及 其对应的空间分布。
[0023] 2、从口限值扩大和缩小两个方向求解最优口限值,能够更加准确确定最佳掩膜 值,避免因单方向所得掩膜不是最佳掩膜的问题。
【附图说明】
[0024] 图1为本发明方法的流程图。
【具体实施方式】
[0025] 为了使本发明实现的技术手段、创作特征、达成目的与功效易于明白了解,下面结 合附图和具体实例进一步阐述本发明。
[0026] 参照图1,一种基于非负矩阵分解的恶性胶质母细胞瘤组织分类方法,包括W下步 骤:
[0027] S1;第一级 NMF 分解。
[0028] 在VOI区域内所有体素的波谱构成的矩阵X上应用NMF,方法采用A. Cichocki 在文献《Hierarchical ALS Algorithms for nonnegative matrix and 3D tensor 化ctorization》中所述方法,并令波源数量为2,迭代分解初值选用仿真数据中正常、肿瘤 组织所对应的参考波
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