肠道菌群的检测系统及其方法和动态式数据库的制作方法_4

文档序号:9327177阅读:来源:国知局
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[0187] 2、使用者握住手持部,将取样部靠近粪便取样处,插入粪便的深度为取样部长度 的一半,取样时也可以转动一下取样棒(即取样部件);
[0188] 3、使用者握住手持部,将取样棒的取样部穿过固定座的中空腔,置于收集容器内, 并将取样棒旋紧于固定座上;
[0189] 4、进入检验工作程序时,为了便于标签和检验时操作,将收集容器从固定座拆下 来,在其开口处塞入一瓶塞。
[0190] 于其它实施例中,固定座与收集容器的可拆式联接也可以采用卡扣式联接;固定 座与取样部件的可拆式联接也可以采用卡扣联接。也可以在取样部与手持部之间不设有过 渡部,可以减少整个装置所占用的空间,也非常适合用于非粪便类的膏状物的取样。收集容 器也可以是其它形状,比如带有平底部的管状体。该取样装置可以增大各部件的尺寸,从而 使用户取粪便时身体和标本达到心理上的安全距离,增强舒适感。另外中空腔的口径可以 加大使标本(即取样部)顺利放入收集管,不会粘挂在中空腔的管壁上,整个过程流畅顺 利。后期的标本处理可直接将收集管(即收集容器)取出做进一步的实验处理,无需倒出 标本,更加简便易操作。
[0191] 综上所述,本发明采用基因检测技术,结合大数据分析。通过这样的肠道菌群的检 测,受检者能够了解自身肠道健康状况组成,并以此了解自己与健康人群的差异值,以此调 节自己的饮食,运动,生活习惯等方面,进而改善肠道菌群状况,并以此改善身体健康状况。 其中的动态数据库采用实时或定时更新的方式,将采集端的每次采集数据汇入服务器的总 数据库中,以此实时扩充数据库的容量,获得最新时期的各类人群的排泄物的检测参数,动 态变化的数据库,相对于陈年老旧的数据库,更具有可利用的价值。
[0192] 上述仅以实施例来进一步说明本发明的技术内容,以便于读者更容易理解,但不 代表本发明的实施方式仅限于此,任何依本发明所做的技术延伸或再创造,均受本发明的 保护。本发明的保护范围以权利要求书为准。
【主权项】
1. 肠道菌群的检测系统,其特征在于包括: 用于采集肠道菌群信息的采集装置; 对采集到的肠道菌群信息进行放大处理以获得每次个体检测时的肠道菌群数据的分 析处理装置; 用于存储肠道菌群数据的存储装置; 用于将每次采集个体的肠道菌群数据与存储装置中的肠道菌群总数据进行比较的数 据处理装置; 其中,所述的采集装置设有输出端与分析处理装置连接并将采集结果传输至分析处 理装置,所述的分析处理装置设有输出端与存储装置连接并将处理结果发送至存储装置, 所述数据处理装置分别与分析处理装置、存储装置连接并对二者的相关联数据进行比较判 断。2. 根据权利要求1所述的肠道菌群的检测系统,其特征在于还包括用于收集含有肠道 菌群的样本的取样装置和用于将数据处理装置的比较结果进行显示或打印的输出装置。3. 根据权利要求2所述的肠道菌群的检测系统,其特征在于所述的采集装置包括标本 采集装置。4. 肠道菌群的检测方法,包括以下步骤: 用于采集肠道菌群信息的采集步骤; 对采集到的肠道菌群信息进行放大处理以获得每次个体检测时的肠道菌群数据的分 析处理步骤; 用于存储肠道菌群数据的存储步骤; 用于将每次采集个体的肠道菌群数据与存储装置中的肠道菌群总数据进行比较的数 据处理步骤。5. 根据权利要求4所述的肠道菌群的检测方法,其特征在于所述的分析处理步骤是利 用基因检测平台,对肠道样品进行核酸提取检测的数据产出步骤,以获得供生物信息学分 析的核酸信息。6. 根据权利要求5所述的肠道菌群的检测方法,其特征在于所述的数据产出步骤进行 核酸信息的预处理,包括以下的相似性聚类法和/或序列拼接法: 相似性聚类法,将相似度为85% -99%的多条核酸序列挑选出来作为一个类群,并选 择一条核酸序列代表该类群,其序列的丰度就是该类群中的全部核酸序列数目; 序列拼接法,根据序列字符串的相似性,依次将首尾相连的任意两条序列连接起来,直 至成为无法延伸的长片段,构成这条长片段的所有原始序列全长除以长片段的长度就可以 得到该字符片段在样品中的丰度。7. 根据权利要求6所述的肠道菌群的检测方法,其特征在于根据所述的预处理获得可 供在数据库进行检索的各种变量,这些变量包括以下三类: 一、微生物物种的相对丰度:根据序列或长片段所对应的丰度信息和微生物物种信息,丰度;8;表不第i个物种的丰度,a15是对应同一个物种的多条序列或长片段丰度之和;n表 示全部物种数目为n; 二、 微生物功能的相对丰度:利用生物信息学算法,可将序列或长片段上的基因序列或 不完整的基因序列预测出来,再将这些基因序列和已知的生物学基因功能数据库进行同源 性比对,可以得到每个基因序列对应的微生物功能,类似于微生物相对丰度的计算方法,得 到微生物功能的相对丰度; 三、 微生物多样性:根据微生物物种的相对丰度或微生物功能的相对丰度,计算生态学 中常用的Ct多样性和多样性。8. 根据权利要求7所述的肠道菌群的检测方法,其特征在于根据所述的肠道菌群总数 据包括有微生物数据和宿主表型数据: 微生物数据:将每个样品进行微生物数据采集和数据预处理,从而得到微生物物种的 相对丰度、微生物功能的相对丰度的变量,这些变量构成了数据库中的微生物数据部分; 宿主表型数据:将与肠道相关的人体健康状态分成几大系统进行分别表征,包括肠道 系统、营养系统、代谢系统和免疫系统,每种系统的健康检查数据将被直接收录成宿主表型 数据; 为了从微生物角度去描述宿主的健康状况,还将以特定的宿主表型作为因变量,前述 的微生物数据作为自变量,来进行关联分析或回归分析,以此找到与特定宿主表型有关联 的微生物数据; 以上的宿主表型数据和微生物数据,都在数据库中进行人群统计分析,从而得到这些 数据指标在数据库人群中的分布范围,人群是指健康人群和某类患病人群。9. 肠道菌群的检测方法,采用这样的步骤来实现,它包括:1)标本采集运输;2)标本提 取和质控;3)标本检测;4)数据分析;5)报告出具;以下是具体步骤的内容: 一、 标本米集运输 1) 使用无菌容器采集被检测个体的新鲜粪便标本; 2) 标本冷藏或者稳定剂保存,使得菌群稳定,不发生改变; 3) 冷藏的标本在24小时内送至标本收集处,稳定剂保存的标本3天内送达标本收集 处; 二、 标本提取和质控; 二、标本检测米用以下二种方法: 方法一,16S测序: 1) 提取的核酸标本稀释至等浓度; 2) 以适量核酸为模板,用微生物保守区域设计引物进行PCR扩增; 3) 对PCR产物进行浓度测定,电泳检测目标条带; 4) 将以上PCR产物进行纯化; 5) 根据仪器的使用说明,进行标本的测序,产出数据; 方法二,PCR检测: 1) 提取的核酸标本稀释至等浓度; 2) 以各种微生物特异性区域设计引物进行PCR扩增,采用荧光定量的方法检测其中核 酸标本中微生物的分类组成; 方法三,全基因组测序: 1)提取的核酸标本,按照测序文库试剂盒的操作要求完成文库构建; 2)根据仪器的使用说明,进行标本的测序,产出数据; 四、 数据分析 1) 数据预处理,包括过滤低质量数据、去除引物; 2) 序列通过相似度进行聚类,并计算各种微生物的丰度计算; 3) 物种分类谱及功能分类谱分析; 4) 肠道菌群结构分析,包括微生物组成、肠型、多样性指数; 5) 肠道健康指标分析,包括健康指数、代谢水平、生物合成和肠道环境应激; 6) 致病菌检测,包括食源性致病菌、机会致病菌和其他致病菌; 7) 疾病风险评估,包括肥胖、糖尿病、炎症性肠炎和结肠癌; 8) 肠道菌群状态评估; 五、 出具报告 报告主要包括肠道菌群组成,多样性指数,健康指数,致病菌含量及疾病风险; 报告具有纸质版,电子版两种,电子版本可以登录网站或者下载手机app获取。10. -种动态数据库,是一种能动态更新数据内容的人体排泄物采集数据库,该数据库 采用若干个采集端与服务器连接的数据系统,将每个采集端的采集数据与存储于服务器的 采集总数据进行检索或比较分析,并且将该采集端的采集数据存储于服务器中,服务器实 时更新或定期更新采集总数据,以供与其连接的各采集端或各客户端访问或下载;其中每 个采集数据包括核酸信息,还包含有采集时间、年龄、性别、体重指数、血液指标、疾病状态、 身体状况、生活习惯关键词;所述的人体排泄物是指大便、小便、汗液、痰、二氧化碳、油脂、 皮肩、头肩和/或毛发。
【专利摘要】本发明公开了一种肠道菌群的检测系统及其方法和动态式数据库;肠道菌群的检测系统包括:用于采集肠道菌群信息的采集装置;对采集到的肠道菌群信息进行放大处理以获得每次个体检测时的肠道菌群数据的分析处理装置;用于存储肠道菌群数据的存储装置;用于将每次采集个体的肠道菌群数据与存储装置中的肠道菌群总数据进行比较的数据处理装置。本发明通过肠道菌群的检测,受检者能够了解自身肠道健康状况组成,并以此了解自己与健康人群的差异值,以此调节自己的饮食,运动,生活习惯等方面,进而改善肠道菌群状况,并以此改善身体健康状况。其中的动态数据库实时扩充数据库的容量,获得最新时期的各类人群的排泄物的检测参数。
【IPC分类】C12Q1/68, G06F19/00, C12Q1/04
【公开号】CN105046094
【申请号】CN201510532559
【发明人】覃俊杰
【申请人】深圳谱元科技有限公司
【公开日】2015年11月11日
【申请日】2015年8月26日
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