自动生成基因检测报告的方法及装置的制造方法
【技术领域】
[0001] 本发明涉及一种自动生成基因检测报告的方法及装置。
【背景技术】
[0002] 基因检测是从染色体结构、DNA序列、DNA变异位点或基因表达程度，提供给受检 者与医疗研究人员评估一些与基因遗传有关的疾病、体质或个人特质的依据。
[0003] 基因检测报告是以可供受检者与临床研究人员看得懂的方式来展现基因检测结 果，它不仅包括基因检测的直接结果，还包括了对结果的解读。其中，对结果的解读可以提 供对患病风险的预测和预防建议，可供受检者和临床医生参考，具有很重要的实用价值。目 前，许多基因检测机构出具的基因检测报告几乎都是依靠手工录入的方式。
[0004] 但是，手工摘录需要耗费大量的时间，准确性不能得到保证。另外，如果有新的研 究发现，不能及时地更新报告。
【发明内容】
[0005] 本发明主要解决的技术问题是提供一种自动生成基因检测报告的方法及装置，能 够节约大量时间，保证准确性，及时使基因检测报告得到更新。
[0006] 为解决上述技术问题，本发明采用的一个技术方案是：提供一种自动生成基因检 测报告的方法，包括：获取受检对象的遗传信息和样本信息；通过所述遗传信息查询基因 数据库，获取与所述遗传信息对应的表征信息，所述基因数据库中保存有所述遗传信息与 表征信息之间的对应关系；调用基因检测报告的标准化模板，并将所述样本信息和与所述 遗传信息对应的表征信息导入所述标准化模板中，自动生成基因检测报告。
[0007] 其中，所述调用基因检测报告的标准化模板，并将所述样本信息和与所述遗传信 息对应的表征信息导入所述标准化模板中，自动生成基因检测报告的步骤之前，包括：确定 所述基因检测报告的标准化模板的格式；采用拉泰赫LaTeX源代码编写所述基因检测报告 的标准化模板。
[0008] 其中，所述遗传信息是基因分型结果，所述表征信息是疾病信息，所述基因数据库 是疾病基因数据库。
[0009] 其中，所述调用基因检测报告的标准化模板，并将所述样本信息和与所述遗传信 息对应的表征信息导入所述标准化模板中，自动生成基因检测报告的步骤，包括：调用所述 基因检测报告的标准化模板；将所述样本信息和与所述基因分型结果对应的疾病信息导入 所述标准化模板中；设置与疾病相关的筛选条件；根据所述与疾病相关的筛选条件，运行 所述生成基因检测报告的纯文本文件，获得基因检测报告的纯文本文件；将所述基因检测 报告的纯文本文件生成便携式文件格式TOF的基因检测报告。
[0010] 其中，所述通过所述遗传信息查询基因数据库，获取与所述遗传信息对应的表征 信息的步骤之前，包括：从文献资料或数据库中提取所需的与所述遗传信息相关的数据信 息；确定所述数据信息的数据格式；根据所述数据信息和所述数据格式建立所述基因数据 库。
[0011] 为解决上述技术问题，本发明采用的另一个技术方案是：提供一种自动生成基因 检测报告的装置，所述装置包括：第一获取模块，用于获取受检对象的遗传信息和样本信 息；第二获取模块，用于通过所述遗传信息查询基因数据库，获取与所述遗传信息对应的表 征信息，所述基因数据库中保存有所述遗传信息与表征信息之间的对应关系；报告生成模 块，用于调用基因检测报告的标准化模板，并将所述样本信息和与所述遗传信息对应的表 征信息导入所述标准化模板中，自动生成基因检测报告。
[0012] 其中，所述装置还包括：第一确定模块，用于确定所述基因检测报告的标准化模板 的格式；编写模块，用于采用拉泰赫LaTeX源代码编写所述基因检测报告的标准化模板。
[0013] 其中，所述遗传信息是基因分型结果，所述表征信息是疾病信息，所述基因数据库 是疾病基因数据库。
[0014] 其中，所述报告生成模块包括：调用单元，用于调用所述基因检测报告的标准化模 板；导入单元，用于将所述样本信息和与所述基因分型结果对应的疾病信息导入所述标准 化模板中；设置单元，用于设置与疾病相关的筛选条件；运行单元，用于根据所述与疾病相 关的筛选条件，运行所述生成基因检测报告的纯文本文件，获得基因检测报告的纯文本文 件；生成单元，用于将所述基因检测报告的纯文本文件生成便携式文件格式roF的基因检 测报告。
[0015] 其中，所述装置还包括：提取模块，用于从文献资料或数据库中提取所需的与所述 遗传信息相关的数据信息；第二确定模块，用于确定所述数据信息的数据格式；建立模块， 用于根据所述数据信息和所述数据格式建立所述基因数据库。
[0016] 本发明的有益效果是：区别于现有技术的情况，本发明获取受检对象的遗传信息 和样本信息；通过遗传信息查询基因数据库，获取与遗传信息对应的表征信息；调用基因 检测报告的标准化模板，并将样本信息和与遗传信息对应的表征信息导入标准化模板中， 自动生成基因检测报告。由于通过遗传信息获取到表征信息后，调用标准模板，将样本信息 和表征信息导入标准模板后，即可自动生成基因检测报告，因而不用手工录入，能够节约大 量时间，避免人为误差，可以保证准确性，而且基因数据库可以根据新的研究发现及时更新 相应信息，从而能够及时使基因检测报告得到更新。
【附图说明】
[0017] 图1是本发明自动生成基因检测报告的方法一实施方式的流程图；
[0018] 图2是本发明自动生成基因检测报告的方法另一实施方式的流程图；
[0019] 图3是本发明自动生成基因检测报告的方法又一实施方式的流程图；
[0020] 图4是本发明自动生成基因检测报告的方法又一实施方式的流程图；
[0021] 图5是本发明自动生成基因检测报告的装置一实施方式的结构示意图；
[0022] 图6是本发明自动生成基因检测报告的装置另一实施方式的结构示意图；
[0023] 图7是本发明自动生成基因检测报告的装置又一实施方式的结构示意图；
[0024] 图8是本发明自动生成基因检测报告的装置又一实施方式的结构示意图。
【具体实施方式】
[0025] 参阅图1，图1是本发明自动生成基因检测报告的方法一实施方式的流程图，包 括：
[0026] 步骤S101 :获取受检对象的遗传信息和样本信息。
[0027] 遗传信息是指生物为复制与自己相同的东西，由亲代传递给子代、或各细胞每次 分裂时由细胞传递给细胞的信息，即碱基对的排列顺序（或指DNA分子的脱氧核苷酸的排 列顺序）。此处的遗传信息可以是代表个体差异性的遗传信息、DNA突变的遗传信息、或者 与基因遗传疾病相关的遗传信息等等。样本信息主要是受检对象的基本情况信息，如姓名、 性别、年龄、样本类型、检测日期、检测单位等等。
[0028] 步骤S102 :通过遗传信息查询基因数据库，获取与遗传信息对应的表征信息，基 因数据库中保存有遗传信息与表征信息之间的对应关系。
[0029] 表征信息是指根据遗传信息可以表征在生物体表面、可以观察到的个体差异性的 性状表现，包括但不限于长相、身高、体重、肤色、性格等。
[0030] 由于基因数据库中保存有遗传信息与表征信息之间的对应关系，因此，通过遗传 信息查询基因数据库，可以获取与遗传信息对应的表征信息。
[0031] 步骤S103 :调用基因检测报告的标准化模板，并将样本信息和与遗传信息对应的 表征信息导入标准化模板中，自动生成基因检测报告。
[0032] 基因检测报告的标准化模板是按照预设要求创建完毕的，在获得样本信息和表征 信息后，调用标准化模板，即可自动生成基因检测报告。
[0033] 本发明实施方式获取受检对象的遗传信息和样本信息；通过遗传信息查询基因数 据库，获取与遗传信息对应的表征信息；调用基因检测报告的标准化模板，并将样本信息和 与遗传信息对应的表征信息导入标准化模板中，自动生成基因检测报告。由于通过遗传信 息获取到表征信息后，调用标准模板，将样本信息和表征信息导入标准模板后，即可自动生 成基因检测报告，因而不用手工录入，能够节约大量时间，避免人为误差，可以保证准确性， 而且基因数据库可以根据新的研究发现及时更新相应信息，从而能够及时使基因检测报告 得到更新。
[0034] 参阅图2,如果基因检测报告的标准化模板事先没有创建好，那么在步骤S103之 前，还包括如下内容：
[0035] 步骤S201 :确定基因检测报告的标准化模板的格式。
[0036] 步骤S202 :采用拉泰赫LaTeX源