胃癌病理演变前期AE1基因mRNA水平的原位杂交检测试剂盒及检测方法和应用的制作方法

胃癌病理演变前期AE1基因mRNA水平的原位杂交检测试剂盒及检测方法和应用的制作方法
【专利摘要】本发明公开一种原位杂交检测试剂盒，包括杂交探针和标记物，还公开了使用本试剂盒原位杂交检测与胃癌癌变前期病理演变有密切相关的AE1(ASYMMETRIC?LEAVES1/2ENHANCER1)基因mRNA表达变化的方法，包括以下步骤：(1)在杂交探针与靶序列可形成稳定杂交复合体的条件下，将底物中待测RNA与杂交探针接触，形成杂交复合体；和(2)检测所述杂交复合体。本发明的试剂盒和检测方法可在RNA水平上检测AE1基因的表达量，比影像医学和现有的临床生化检测指标更早期，能实现真正的癌变前期RNA水平筛查，同时，本发明的检测方法简单方便，成本低，便于县区级医院推广应用。
【专利说明】胃癌病理演变前期AE1基因 mRNA水平的原位杂交检测试剂 盒及检测方法和应用

【技术领域】
[0001] 本发明涉及生物检测领域，更具体地说，是涉及与胃癌病理演变RNA表达改变（病 理演变过程）的相关检测技术。

【背景技术】
[0002] 根据国内外权威机构提供的资料，我国每年癌症的新增人数已达到312万，死亡 人数近260万，患者超过700万，全球每年新增癌症患者800万，死亡人数接近800万，患者 约有8400多万人，到2020年以上人数将翻一番，这是一组可怕的数字。癌症诊治成本越来 越高，按癌症患者的年治疗费用20万（贫穷地区可能偏高，发达地区可能远远高出20万）， 700多万患者，每年的花费是1. 4万亿人民币，扣除成本35 %约4千亿，每年约有1万亿人 民币白白消耗了。而且，癌症患者大部分会在治疗后不久死亡。因此，现有的临床癌症诊治 模式一定要改变，本发明的创新点是提前做到预防性筛查，然后及时介入预防性调控和预 防性治疗，做到基因水平癌症的治未病。
[0003] 2005年美国卫生研究院、癌症研究院、疾控中心等八家单位做了抗癌大战中是失 败，结论是癌症死亡率没有降低，其列举出造成抗癌大战失败的几个因素是：1.肿瘤细胞 异质性（多态性）；2.肿瘤细胞耐药性；3.抗癌药物设计思路不完善（动物模型设计不科 学）等。同时，该报告中亦提出应重新审视现有诊治癌症的措施。
[0004] 本发明人在长期研究中发现，导致癌症死亡率不降的重要原因是不能做到真正的 早期诊断。依照现有的临床医学影像（B超、CT、核磁共振成像等）及和其它生化（癌抗原、 癌胚抗原、糖类激素、细胞膜因子、细胞核因子、细胞流式技术）指标来诊断癌症，都是肿瘤 形成后诊断，前者要有组织学变化或已有占位性病变，后者大部分是肿瘤形成后所分泌、释 放、或肿瘤的标记物。传统临床观念认为占位性癌块在2公分下是属于早期癌症的诊断，这 一概念值得认真讨论，2公分以下癌块属早期这一界定科学性是不够严谨的，从细胞学角 度来分析，1公分的肿块约有一亿个肿瘤细胞，2公分的肿块其三维空间的细胞叠加数远不 止2亿个肿瘤细胞，从癌变前期到单克隆癌细胞产生及形成2公分的癌块，其病理演变过程 相当长，可能是5年或10年、甚至是10年以上（特殊病例除外），很难证实的是在这个病理 演变过程中，肿块是癌症唯一的发生地和单独的病灶，可能癌细胞早已迁移到其它组织或 器官生长。临床研究早已证实，一旦形成肿块的同时，其它癌细胞通过不同途径迁移到其它 部位克隆生长，一旦切除原发灶后，其它器官复发灶或多发癌块灶先后形成。因此，在临床 上以2公分以下的癌肿块大小来界定早期与否，不够严谨（有些病例，在发现原发病灶时， 同时发现转移病灶，不在我们表述的内容中），其实这时已经是晚期诊断和晚期治疗，这是 导致癌症死亡率不降的真正原因。
[0005] 随着分子生物技术日益完善，功能基因组学，癌症基因组学等研究的深入展开，为 了寻求更早期的诊断癌症、治疗癌症、以及预防癌症，已取得长足进步。至今，我们已有可能 在基因的一级转录功能产物（mRNA水平或microRNA)上做更精确的早期筛查和诊断，在癌 变前期或癌细胞形成（单克隆）前，就可以做到早期预测和筛查。
[0006] 在大通量筛查中发现AE1基因 mRNA在胃癌患者中大量表达，AE1基因在胃癌细胞 中高表达可以起到原癌基因作用，促进癌症细胞生长和分裂。实验研究进一步发现，降低 AE1的表达则可使药物诱发的小鼠胃癌发生率明显降低。而且，AE1基因 mRNA在各种人种 (白人、黑人、黄种人）胃癌患者外周血白细胞中都高表达。
[0007] 本发明选择多组临床标本（胃癌病人、高危人群、正常对照）采用核酸原位杂交技 术和免疫组化方法对AE1基因 mRNA与胃癌的早期预警进行检测分析。本发明人在研究中 发现AE1基因 mRNA在胃癌患者、癌症高危人群（慢性萎缩性胃炎和胃部有钩端螺旋体）、正 常对照人有明显的表达量变化，将AE1基因 mRNA作为早期筛查胃癌病理变化前期有非常重 要的临床诊断意义。作于胃癌癌变前期筛查、及胃癌治疗后的复发、转移预警也有非常重要 的临床意义。
[0008] 发明人在长期的研究中，得出了一种新理念，癌症和其它临床的重大疾病的临床 诊治模式一定要改变，不能只停留现在治已病（发病后诊治），要做到预防性诊治，做到治 未病，只有这样才能降低重大疾病的发病率和死亡率，降低社会成本和医疗成本。因此，发 明人在开发和生产重大疾病的RNA水平筛查试剂盒及治疗药物中，在理论和技术上都做了 创新。特别是筛选临床标本（正常人群、癌症高危人群、肿瘤患者），突破了正常组织与肿瘤 组织比较的一贯性研发思路，来寻找和开发癌前变的RNA水平，与癌症早期基因病理生理 学演变密切相关，而且临床意义非常重要靶标（疾病基因），将临床上肿瘤形成后诊治模式 变成肿瘤的预防性诊治，争取了肿瘤诊治的时间和空间，达到预防癌症。
[0009] 目前，AE1基因表达谱检测方法用Northern杂交、表达芯片、实时荧光定量PCR和 Solexa测序等分析技术，而这些方法多用于科研方面，不适应临床应用，而检测RNA比基因 分析更科学（DNA分析大部分在易感性的表象上，RNA是功能性体现），比蛋白分析更可靠 (发明人在采用双标记技术研究中发现mRNA与蛋白转录和表达时空上，有时候不同步）。根 据现有的文献资料采用原位杂交技术和组化免疫方法检测AE1基因 mRNA水平表达量的检 测技术及试剂盒未见报道。
[0010] 本发明人在针对创新性发明的要求，设计了（胃癌患者、高危人群、正常对照）不 同数据例组，用原位杂交技术进行检测，结果表明以上胃癌病人AE1基因 mRNA高表达，高危 人群有不同程度表达10-20%，正常对照都是零表达。表明AE1基因 mRNA是胃癌癌变前期 筛查的重要标志物。
[0011] 原位杂交技术（in situ hybridization)是将分子生物学与细胞化学技术结合起 来，以标记的核酸分子为探针，在组织细胞原位检测特异性核酸分子的技术。其原理是使含 有特异序列、经过标记的核酸单链（即探针），在适宜条件下与组织细胞中的互补核酸单链 即靶核酸发生杂交，再以放射自显影或免疫细胞化学方法对标记探针进行探测，从而在细 胞原位显示特异的DNA或RNA分子。
[0012] 原位杂交的探针是已知序列的分子或序列未知但分子已知的核酸分子（虽不明 确该分子全部序列，但已知其针对何靶分子），探针的种类按核酸性质不同又可分为DNA探 针、cDNA探针、cRNA探针和合成寡核苷酸探针。为了便于示踪，探针必须用一定的手段加以 标记，以利于以后的检测。常用的标记物包括放射性核素和非放射性标记物两大类。常用 的同位素标记物有 3H、35S、125I和32P。同位素标记物虽然有灵敏性高、背底较为清晰等优点， 但是由于放射性同位素对人和环境均会造成伤害，近来有被非同位素取代的趋势。非同位 素标记物中目前最常用的有生物素、地高辛和荧光素三种。检测这些标记物的方法都是极 其灵敏的。
[0013] 根据所用探针及所要检测核酸的不同又可分为DNA-DNA，RNA-DNA，RNA-RNA杂交。 但不论哪一种形式的杂交，都必须经过五大过程，即组织细胞的固定，预杂交、杂交、冲洗和 显示。本发明采用RNA-RNA的杂交方式，合成的探针（RNA)和检测的靶RNA是采用碱基互 补（杂交互补）的原理，同时经过长时间研究和观察，启动和中止处得残基对检测的结果没 有影响。
[0014] 鉴于目前临床上胃癌的诊断（胃镜、影像医学和生化指标物都是肿瘤形成后的诊 断）是晚期诊断，治疗也是晚期治疗，也是导致死亡率不降的医治模式。本发明的初衷是想 完善目前临床上重大疾病的诊治模式，从治已病变成预防性治未病，达到预防性诊治，将目 前影像医学手段和众多生化标记物无法检测到癌前变RNA水平量化改变技术，做了创新性 的技术突破，提供癌前变RNA水平筛查技术。使临床上有了一项新的癌前变RNA水平真正 早期筛查的技术，为临床胃癌的诊治争取时间和空间。
[0015] 综上所述，本发明的目的首先是提供一种原位杂交检测试剂盒，其包含原位杂交 检测探针和标记物。其次，本发明还要提供上述试剂盒用于胃癌病理演变前期筛查及治疗 后转移早期预警相关的原位杂交检测方法。


【发明内容】

[0016] 为实现本发明的目的，本发明的技术方案如下： 本发明首先提供一种原位杂交检测试剂盒，其包括杂交探针和标记物，其中，所述的杂 交探针分别具有序列表SEQ ID NO. 1所示序列号：S68680,核苷酸序列长度是462bp中⑶S 序列是 119. . . 462bp，全长 344bp。
[0017] 本发明试剂盒的一个优选方案是，所述的标记物选自放射性物质、化学发光或显 色物质、生物素、金属鲎、荧光素、酶及纳米材料。
[0018] 本发明试剂盒的一个优选方案是还包括杂交液。
[0019] 本发明试剂盒的一个优选方案是还包括增强剂。
[0020] 本发明试剂盒的一个优选方案是还包括显色剂。
[0021] 本发明的胃癌病理演变前期AE1基因 mRNA筛查试剂盒应用价值在于，对胃癌病理 演变前期筛查，及癌变后或治疗后复发、转移、扩散发生预警，进一步配合临床治疗。
[0022] 本发明还提供一种AE1原位杂交的检测方法，包括以下步骤： (1) 在上面所述的杂交探针与靶序列可形成稳定杂交复合体的条件下，将底物中待测 RNA与杂交探针接触，形成杂交复合体；和 (2) 检测所述杂交复合体。
[0023] 本发明所述的检测方法，其中优选地是，所述的可形成稳定杂交复合体的条件为： 核酸杂交的温度为42°C ;核酸杂交的时间为16-24小时。
[0024] 本发明所述的检测方法，其中优选地是，所述的底物选用人的血液白细胞标本或 其它器官组织细胞标本。更优选地是，所述的血液标本或其它器官组织细胞标本来自胃癌 患者、胃癌的高危人群、健康正常人群。
[0025] 本发明的检测试剂盒是采用核酸杂交技术和组化免疫方法相结合，以ΑΕΙ基因 mRNA为检测对象，合成探针是ΑΕ1基因杂交互补序列，检测的底物是人体血液标本白细胞 或组织细胞的AE1基因 mRNA的表达量。原位杂交技术的显示方法能提供AE1基因 mRNA的 半定量或定量表达程度判定。根据杂交后免疫组化显色判定以上mRNA的表达量，正常人 AE1零表达，即不显色；高危人群低表达，少量细胞染色；胃癌病人高表达，大量细胞染色。
[0026] 本发明的诊断试剂盒的组份是由杂交探针，杂交液，显色剂，增效剂等组成。本试 剂盒的核酸杂交原理是分子生物学业内人士均熟知，具体操作步骤是标本处理、预杂交、杂 交、免疫组化染色、镜下进行定量分析、结果报告，其中杂交的具体步骤包括： 1) .将待测标本放入反应槽中； 2) .仪器自动弃去液体，自动加消化液； 3) .仪器自动弃去液体，自动后固定； 4) .仪器自动弃去液体，自动预杂交（42°C ); 5) .仪器自动弃去液体，自动清洗； 6) .仪器自动弃去液体，自动杂交（42°C ); 7) .仪器自动弃去液体，自动清洗； 8) ·仪器自动弃去液体，自动与DIG抗体培养（室温）； 9) .仪器自动弃去液体，自动清洗，显色； 10) .取出封片镜检。
[0027] 本发明的一个优选实施例的方案是：以AE1基因 mRNA合成的核酸探针用地高辛 标记（地高辛标记的cDNA、RNA和寡核苷酸探针，不但探针的具有生物素标记优点，还克服 了生物素标记的探针在原位杂交过程中受组织内源性生物素干忧等缺点），将该杂交探针 与人体血液白细胞的待测RNA核酸进行杂交，再用免疫组化的方法显色，在光镜下观察RNA 的存在和定位，根据染色的细胞数，判断目的RNA的表达量。
[0028] 本发明方法是目前常用的核酸原位杂交技术，该方法通过检测底物细胞中的AE1 基因 mRNA表达量，用来确定胃癌病理演变前期的RNA变化量，预警胃癌是否发生及胃癌患 者治疗后是否复发、转移的预测。因为AE1基因 mRNA在正常人中零表达，AE1基因有原癌 基因的致癌作用，如果表达量增高，说明有患胃癌的风险，说明胃癌变已发生，或胃癌病人 术后已经复发、转移，从而获得胃癌的诊断信息。
[0029] -个试剂盒可以多人份使用或一人份使用。
[0030] 本发明具有如下有益效果： 本发明的临床意义是更早期跟踪检测胃癌病理演变过程中AE1基因 mRNA表达量的变 化，预警胃癌发生、发展趋势。本发明的诊断试剂盒与临床上其它检测与癌症标志物，以及 影像医学检查有显着不同。本发明可以在RNA水平检测AE1基因的异常表达，在影像医学 检查未发现占位性癌病灶复发之前，癌症生化指标未产生异常之前，亦未形成肿瘤之前，能 及早做到AE1基因表达异常的信息采集，给临床胃癌患者一个真正的早期预警，这样才有 可能实施癌症的早期筛查、早期预防、早期治疗，有可能从源头上彻底根治胃癌恶疾。
[0031] 此外，本发明提供的试剂盒具有灵敏度高、特异性强的特点，同时，本发明的检测 方法操作方便、简单，能在区级以上医院普遍使用和推广。

【专利附图】

【附图说明】
[0032] 图1是本发明ΑΕΙ基因 mRNA原位杂交实施例图（核酸原位杂交技术流程图）；
[0033] 图2是本发明实施例中胃癌病人AE1基因 mRNA表达图片；
[0034] 图3是高危人群AE1基因 mRNA表达图片；
[0035] 图4是本发明实施例中正常人AE1基因 mRNA表达图片。

【具体实施方式】：
[0036] 下面结合实施例，更具体地说明本发明的内容。应该理解，下面的实施例用于说明 而非限定本
【发明内容】
，任何形式上的改变或变通将落入本发明的保护范围。
[0037] 实施例1 按照常规方法制备本实施例的原位杂交试剂盒，该试剂盒包括以AE1基因 mRNA设计的 杂交探针、标记物、说明书，其中： 本实施例的探针标记物选用地高辛。
[0038] 试剂盒杂交液组成： 消化液 lOOuL/管 1管/盒 无色透明液体 保护液 100μ?7管 1管/盒 无色透明液体 预杂交液 1300 μ L/管 2管/盒 无色透明液体 正义杂交液 10yL/管 1管/盒 无色透明液体 反义杂交液 10wL/管 1管/盒 无色透明液体 封闭液 1000 μ L/管 1管/盒 无色透明液体 碱性磷酸酶抗体1 μ L/管 1管/盒 无色透明液体 显色剂A 175 μ L/管 1管/盒 黄色液体 显色剂Β 320 μι/管 1管/盒 无色透明液体 浅黄色或无色透明液 缓冲液I 90mL/瓶 1瓶/盒 体 浅黄色或无色透明液 缓冲液II 80mL/瓶 1瓶/盒 体 浅黄色或无色透明液 缓冲液III 20mL/瓶 3瓶/盒 体 浅黄色或无色透明液 缓冲液IV 90mL/瓶 1瓶/盒 体 固定液 90mL/瓶 1瓶/盒 无色透明液体 阳性对照标本 6片/盒 配制试剂使用浓度 1) .将10X缓冲液I用三蒸水按1 : 10稀释成IX缓冲液I ; 2) .将20X缓冲液II用三蒸水按1 : 10稀释成2X缓冲液II ; 按1 : 100稀释成0.2X缓冲液II;按1 : 200稀释成0.1 X缓冲液II; 3) .将10X缓冲液III用三蒸水按1 : 10稀释成IX缓冲液III ; 4) . 10 X缓冲液IV用三蒸水按1 : 10稀释成X缓冲液IV (取1#，2#，3#各10mL，力口 水至100mL既可）。
[0039] 实施例2 应用核酸原位杂交检测方法对各组血液标本AE1基因 mRNA表达量的实施过程： 1) .取待测标本两张； 2) .在玻璃缸里加入消化液（消化液100yL加 IX缓冲液199.9ml，即为使用浓 度）50ml，37°C水浴预热10min，放进16张玻片，37°C处理12min，再用1 X缓冲液I洗5min ; 3) .用0. 2%的保护液（保护液lml加1 X缓冲液I，99ml即为使用浓度）洗10min，三 蒸水洗5min (以上过程都在玻璃缸进行），取出玻片，让其自然干燥； 4) .将玻片放入保湿盒内，加预杂交液25 μ L/片（加在有细胞的地方），盖上盖玻片， 盖紧保湿盒，放在42°C恒温水浴箱中3h以上； 5) .取出玻片，弃去盖玻片，将玻片放入玻璃缸内，用70^^90^^95 %的乙醇各洗 2min，取出，自然干燥； 6) .将玻片放入保湿盒内，一张加正义杂交液25 μ L/片，另一张加反义杂交液25 μ L/ 片，盖上盖玻片，盖紧保湿盒，放在42°C恒温水浴箱中16-24h ; 7) .取出玻片，弃去盖玻片，将玻片放入玻璃缸内： 在42°C恒温水浴箱中用2X缓冲液II洗两次，每次15min ; 在42°C恒温水浴箱中用0. 2X缓冲液II洗一次，每次15min ; 在42°C恒温水浴箱中用0. 1 X缓冲液II洗两次，每次15min ; 8) .用IX缓冲液III洗30s，取出玻片，自然干燥； 9) .将玻片放入保湿盒内，加0. 5%封闭液（1ml封闭液加5mllX缓冲液III) 100 μ L/ 片，盖紧保湿盒，在室温下作用30min。（此步骤不需加盖玻片）； 10) .取出玻片，用IX缓冲液ΠΙ洗30s，自然干燥； 11) .将玻片放入保湿盒内，加 X-AP抗体（取一管碱性磷酸酶抗体，向其中加入 1.811111\缓冲液111)10(^17片，盖紧保湿盒在室温下作用3〇1^11，时间不能过长，否则会 产生假阳性（此步骤不需加盖玻片）； 12) .取出玻片，用IX缓冲液III洗3次，每次15min; 13) .用1 X缓冲液IV洗2min，加显色剂（显色剂A73. 3 μ L，显色剂B157. 5 μ L加到 30mLl X缓冲液IV中，混匀），室温避光16h到18h以上； 14) .用三蒸水洗5min，自然干燥，（用甘油加10%的IX缓冲液I混匀）封片镜检。
[0040] 本发明的核酸原位杂交检测方法将目的基因用地高辛标记，成为RNA核酸探针， 将探针与人体白细胞的待测RNA核酸进行杂交，再用免疫组化的方法显色，因此在光镜下 观察RNA的存在和定位，根据染色的细胞数，判断目的RNA的表达量。
[0041] 胃癌病人20名，高危人群（慢性萎缩性胃炎和胃部有钩端螺旋体感染）20名，正 常对照组20名。抽所有待检人的外周血3-5毫升（分离白细胞）做原位杂交。结果表示， 所有胃癌患者AE1基因 mRNA表达量很高，细胞染色深；高危人群表达稍降低，小数染色；正 常对照组AE1基因 mRNA零表达，细胞不染色，具体结果见图2、图3、图4。

【权利要求】
1. 一种原位杂交检测试剂盒，包括杂交探针和标记物，其特征在于，所述的杂交探针 分别具有序列表SEQ ID NO. S68680所示的序列中的CDS片段，从119. . . 462bp，序列全长 344bp〇
2. 如权利要求1所述的试剂盒，其特征在于，所述的标记物选自放射性物质、化学发光 或显色物质、生物素、金属鲎、荧光素、酶及纳米材料。
3. 如权利要求1所述的试剂盒，其特征在于，该试剂盒还包括杂交液。
4. 如权利要求1所述的试剂盒，其特征在于，该试剂盒还包括增效剂。
5. 如权利要求1所述的试剂盒，其特征在于，该试剂盒还包括显色剂。
6. -种AE1基因原位杂交检测方法，其特征在于，该方法包括以下步骤： (1) 在权利要求1所述的杂交探针与靶序列可形成稳定杂交复合体的条件下，将底物 中待测RNA与杂交探针接触，形成杂交复合体；和 (2) 检测所述杂交复合体。
7. 如权利要求6所述的检测方法，其特征在于，所述的可形成稳定杂交复合体的条件 为：核酸杂交的温度为42°C ;核酸杂交的时间为16-24小时。
8. 如权利要求6所述的检测方法，其特征在于，所述的底物选是人体外周血液白细胞 标本。
9. 如权利要求6所述的检测方法，其特征在于，所述的血液标本（癌症、高危人群、正常 人标本）。
10. 如权利要求9所述的检测方法，其特征在于，所述包括临床上的高危人群胃癌前期 病理演变过程，以及胃癌经治疗后的复发和转移病理演变过程。
【文档编号】C12Q1/68GK104140999SQ201310167922
【公开日】2014年11月12日 申请日期:2013年5月9日 优先权日:2013年5月9日
【发明者】张云福, 裘建英, 裘霖, 张玉丽 申请人:嘉兴瑞康生物科技有限公司