技术特征：
1.一种抗青光眼中药数据库的构建方法，其特征在于，包括：步骤一：通过geo数据库，获得数据集gse27276；步骤二：将数据集gse27276中的探针名转换为基因名，删除无基因名的基因，对于映射到同一基因名的不同探针，选取不同探针均值或最大值作为该同一基因名的表达值，对所述表达值进行log2转换；运行r语言limmar程序包对所述数据集gse27276中的青光眼样本和对照组样本数据进行检验得到校正后的p值，以log2转换后的值的绝对值＞1.0和校正后的p＜0.05为筛选标准，获得差异表达基因；步骤三：将所述差异表达基因中的表达上调差异基因和表达下调差异基因分别通过string数据库进行蛋白质-蛋白质相互作用分析，通过cytoscape软件对所述蛋白质-蛋白质相互作用分析的结果进行分析，以得到核心差异基因；步骤四：根据所述核心差异基因在tcmsp数据库内抓取化合物，对抓取得到的化合物进行降重处理；步骤五：在tcmsp数据库内抓取与处理后的化合物对应的中药名，并对抓取的中药名进行降重处理，根据处理后的中药名构建抗青光眼中药数据库。2.根据权利要求1所述的构建方法，其特征在于，所述步骤二包括：通过gpl2507平台的注释文件将数据集gse27276中的探针名转换为基因名。3.根据权利要求1或2所述的构建方法，其特征在于，所述步骤二包括：运行r语言limmar程序包对所述数据集gse27276中的青光眼样本和对照组样本数据进行t检验和贝叶斯检验得到校正后的p值。4.根据权利要求1所述的构建方法，其特征在于，所述步骤三包括：通过cytoscape软件的cytohubba插件分析所述蛋白质-蛋白质相互作用分析的结果，再通过cytoscape软件的mcode插件分析所述cytohubba插件的结果，以得到核心差异基因。5.根据权利要求1所述的构建方法，其特征在于，所述步骤四包括：以所述核心差异基因作为关键字在tcmsp数据库内抓取化合物。6.根据权利要求5所述的构建方法，其特征在于，所述步骤四包括：利用python语言以所述核心差异基因作为关键字，在tcmsp数据库内抓取化合物。7.根据权利要求1所述的构建方法，其特征在于，所述步骤五包括：采用python语言在tcmsp数据库内抓取与处理后的化合物对应的中药名。8.基于权利要求1至7任一项构建方法得到的抗青光眼中药数据库，设计的抗青光眼中药数据库查询系统，包括：抗青光眼中药数据库、页面生成模块、基因名称查询模块、uniprot名称查询模块、靶点名称查询模块、相关化合物名称查询模块及中药名称查询模块。
技术总结
本发明提供一种抗青光眼中药数据库的构建方法和应用，所述构建方法包括：通过GEO数据库，获得数据集GSE27276；将数据集GSE27276中的探针名转换为基因名，确定同一基因名的表达值以及确定校正后的P值，筛选获得差异表达基因，并对其进行蛋白质-蛋白质相互作用分析、Cytoscape软件分析之后得到核心差异基因；在TCMSP数据库内抓取化合物并进行降重处理；在TCMSP数据库内抓取相应的中药名并进行降重处理，根据中药名构建抗青光眼中药数据库。基于该数据库设计出的抗青光眼中药数据库查询系统，可便捷快速高效的开展抗青光眼中药及组方的筛选工作，节约药物研发成本与时间，加快青光眼治疗药物的上市进程。光眼治疗药物的上市进程。光眼治疗药物的上市进程。
技术研发人员：滕丹 曹晶 李乐 李礼 桓晓龙
受保护的技术使用者：沈阳眼产业技术研究院有限公司
技术研发日：2021.09.26
技术公布日：2023/3/30