高纯度虾夷扇贝的DNA提取方法与流程

文档序号:12712446阅读:512来源:国知局

本发明涉及一种高纯度虾夷扇贝的DNA提取方法。



背景技术:

虾夷扇贝属滤食性双壳贝类,贝壳扇形,右壳较突出,黄白色,左壳稍平,较右壳稍小,呈紫褐色。原产于日本、俄罗斯千岛群岛南部水域、日本北海道及本州北部,为大型冷水性贝类。是近些年来贝类水产品的重要品种,其闭壳肌蛋白质构成特殊,据分析每百克含有63.7克蛋白质、3克脂肪、醣类15克、钙47毫克、磷886毫克、铁2.9毫克。虾夷扇贝含有丰富的不饱和脂肪酸EPA和DHA。

分子生物学是生物学研究的一项重要分支,而DNA的提取则是分子生物学研究的重要基础,DNA纯度的纯度及质量对后续的研究工作具有极为重要的影响。每一物种由于其自身各成分的含量不同(比如有的物种蛋白含量高、有的物种糖分含量高),会对DNA的纯度和质量产生较大影响。因此,需要针对不同的物种开发出适宜的有针对性的提取方法。



技术实现要素:

针对上述问题,本发明旨在提供一种适于虾夷扇贝的高质量、高纯度的DNA提取方法。

一种高纯度虾夷扇贝的DNA提取方法,步骤如下:

(1)取扇贝肌肉组织3-8克,用液氮研磨后,将粉末平均加入到10-15管装有500μL STE(100mM NaCl;10mM Tris-Cl,pH8.0;1mM EDTA,pH8.0)及50μL 10% SDS裂解缓冲液的1.5mL离心管中,随即每管加入5μL 浓度为20mg/mL的蛋白酶K,55-57℃水浴10-60 min,至溶液澄清;

(2)每管加入250μL饱和酚、250μL氯仿/异戊醇(24:1),轻柔晃动5-15min,室温10000-12000 rpm离心8-15min;

(3)离心后有机相位于下层,中间层为蛋白层,上层为溶有DNA的水相,吸取上清液至新离心管中,重复步骤(2),至水相和有机相之间无蛋白层残留;

(4)吸取上清液至新离心管中,加入500μL氯仿/异戊醇,轻柔晃动5-15min,室温10000-12000 rpm离心8-15min;

(5)吸取上清液,加入50μL 3M NaAc,缓慢轻柔摇匀,添加1mL在-20℃预冷的无水乙醇,放置于-20℃冰箱 20-50min,10000-15000rpm 离心8-15min,得到DNA沉淀;

(6)用预冷的 70%乙醇洗涤沉淀1-3次;

(7)沉淀干燥,根据沉淀量多少加入不同量的无菌超纯水及终浓度为0.05mg/mL的RNase A,37℃水浴15-40min,直至RNA全部溶解;

(8)用分光光度计测定DNA的浓度,同时进行琼脂糖电泳检测。

本发明的方法针对性强,特别适于虾夷扇贝DNA的提取,提取的DNA浓度、纯度非常高,非常适于文库构建、PCR等后续研究。

附图说明

图1 本发明方法提取的虾夷扇贝DNA的电泳图。

具体实施方式

下面结合具体实施例对本发明做进一步详细说明。

从市场购买的虾夷扇贝在实验室用无菌海水暂养3-5天后,开始DNA的提取工作,步骤如下:

(1)取扇贝肌肉组织3-8克,用液氮研磨后,将粉末平均加入到10-15管装有500μL STE(100mM NaCl;10mM Tris-Cl,pH8.0;1mM EDTA,pH8.0)及50μL 10% SDS裂解缓冲液的1.5mL离心管中,随即每管加入5μL 浓度为20mg/mL的蛋白酶K,55-57℃水浴10-60 min,至溶液澄清;

(2)每管加入250μL饱和酚、250μL氯仿/异戊醇(24:1),轻柔晃动5-15min,室温10000-12000 rpm离心8-15min;

(3)离心后有机相位于下层,中间层为蛋白层,上层为溶有DNA的水相,吸取上清液至新离心管中,重复步骤(2),至水相和有机相之间无蛋白层残留;

(4)吸取上清液至新离心管中,加入500μL氯仿/异戊醇,轻柔晃动5-15min,室温10000-12000 rpm离心8-15min;

(5)吸取上清液,加入50μL 3M NaAc,缓慢轻柔摇匀,添加1mL在-20℃预冷的无水乙醇,放置于-20℃冰箱 20-50min,10000-15000rpm 离心8-15min,得到DNA沉淀;

(6)用预冷的 70%乙醇洗涤沉淀1-3次;

(7)沉淀干燥,根据沉淀量多少加入不同量的无菌超纯水及终浓度为0.05mg/mL的RNase A,37℃水浴15-40min,直至RNA全部溶解;

(8)用分光光度计测定DNA的浓度,同时进行琼脂糖电泳检测。

经检测,DNA的浓度为927 ng/uL,A260/A280=1.82。电泳结果如图1所示,可见DNA的浓度及纯度都非常高。

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