口腔菌群多样性的分析方法及与疾病相关的菌群标志物与流程

文档序号:11145884阅读:来源:国知局

技术特征:

1.一种对于检测待测样品中微生物种类的16S rDNA V1-V2区特异性引物对,其特征在于,所述引物对是能够特异性扩增所有需要检验的微生物来源的引物对。

2.根据权利要求1所述的引物对,其特征在于所述引物对是由两条单链DNA分子序列组成的引物对。

3.根据权利要求1所述的引物对,其特征在于所述引物对的

上游引物为:5’-AGAGTTTGATCMTGGCTCAG-3’;

下游引物为:5’-GCTGCCTCCCGTAGGAGT-3’。

4.权利要求1-3中任一权利要求所述的引物对,其特征在于所述引物对用于生物技术检测领域,通过二代高通量测序技术,精准检测疾病患者口腔样本中微生物的种类。

5.一种口腔菌群多样性的分析方法,其特征在于包括以下步骤,

(1)提供一待测口腔样品;

(2)从所述口腔样品中,提取其样本DNA;

(3)配置PCR反应体系,进行PCR反应;

(4)对于PCR反应产物进行目标片段的检测;

(5)对于有目的片段的PCR产物进行PCR产物纯化;

(6)以步骤(5)中PCR产物为检测对象,用二代高通量测序技术进行口腔样本中的微生物种类的检测;

(7)对于二代测序结果进行数据分析及处理。

6.根据权利要求5所述的方法,其特征在于,所述的步骤(3)中的PCR扩增反应为单重PCR反应,反应体系包含:

10×buffer,正向引物和反向引物,DNA模板,dNTP,Taq酶,灭菌蒸馏水。

7.根据权利要求6所述的方法,其特征在于,所述反应体系为50微升反应体系,包含:

0.8微升的Taq酶,各0.5微升的正向引物和反向引物,2微升DNA模板,5微升10×buffer溶液,4微升的dNTP溶液,37.2微升的灭菌蒸馏水。

8.根据权利要求5-7中任一权利要求所述的方法,其特征在于,所述的PCR扩增反应条件为:

95℃预热10分钟;

6个PCR反应循环:92℃45秒,50℃30秒,72℃30秒;

30个PCR反应循环:92℃45秒,68℃30秒,72℃30秒;

72℃延伸9分钟;

4℃保温保存。

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