口腔菌群多样性的分析方法及与疾病相关的菌群标志物与流程

文档序号:11145884阅读:来源:国知局
技术总结
本发明提供了一种基于二代高通量测序技术的口腔菌群多样性的分析方法及与疾病相关的菌群标志物。其中,该方法包括如下步骤:1)提取待测唾液样本的DNA;2)配置PCR反应体系,进行细菌16S rDNA V1‑V2区的PCR扩增反应;上述PCR反应体系中包含PCR扩增模板、通用引物对等;3)将PCR产物进行目标片段的检测以及PCR产物的纯化;4)将纯化后的PCR产物进行二代高通量测序,检测唾液样本中的微生物的种类;5)利用Ion Torrent PGM测序系统进行测序;6)利用FLASH,QIIME,usearch61进行生物信息学分析。本方法通过二代高通量测序技术,对疾病患者口腔菌群多样性及差异性进行检测,与传统菌群检测方法相比,应用新一代高通量技术能够更详细、更深层地解析菌群的组成与功能。

技术研发人员:杨俊杰;张磊;姜梦菡
受保护的技术使用者:杨俊杰
文档号码:201710019638
技术研发日:2017.01.12
技术公布日:2017.05.10

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