一种酶法生产5‑甲基吡嗪‑2‑羧酸的制作方法

文档序号:12857994阅读:494来源:国知局
一种酶法生产5‑甲基吡嗪‑2‑羧酸的制作方法与工艺

本发明涉及生物技术领域,具体涉及一种酶法生产5-甲基吡嗪-2-羧酸。



背景技术:

5-甲基吡嗪-2-羧酸(5-methylpyrazine-2-carboxylicacid)是一种重要的药物中间体,主要用于合成第二代磺脲类降血糖药格列吡嗪(glipizide),新一代长效降血脂药阿昔莫司(acipimox)和治疗结核病的有效药物(pae)。

现有5-甲基吡嗪-2-羧酸的制备方法包括化学合成法、电化学合成法和生物合成法,其中化学合成法已实现工业化。

现行的化学合成法较多的是采用2,5-二甲基吡嗪为原料,经双氧水氧化得到n-氧代-2,5-二甲基吡嗪后与乙酸酐反应生成2-乙酰氧甲基-5-甲基吡嗪,然后碱水解得到2-羟甲基-5-甲基吡嗪,最后通过高锰酸钾氧化得到目标产物。该方法收率较低且操作安全性低。

cn1141299c《用kmno4一步氧化制备5-甲基吡嗪-2-羧酸的方法》公开了一种用kmno4一步氧化制备5-甲基吡嗪-2-羧酸的方法。该方法以2.5-二甲基吡嗪为原料,在抑制剂的存在下,加入kmno4溶液反应,热过滤除去mno2的滤液经浓缩,酸析,过滤得到部分5-甲基吡嗪-2-羧酸。这种方法由于制备过程中使用大量的高价金属盐,容易生成大量废水,不符合现代化工的环保要求。

本领域迫切需要开发新的高效生产5-甲基吡嗪-2-羧酸的方法。



技术实现要素:

本发明的目的是提供一种酶法生产5-甲基吡嗪-2-羧酸。

本发明首先保护特定蛋白质在制备5-甲基吡嗪-2-羧酸中的应用;

所述特定蛋白质为如下(a1)或(a2):

(a1)醛脱氢酶;

(a2)在(a1)的n端或/和c端连接标签得到的融合蛋白质。

所述标签见表1。

表1标签的序列

本发明还保护特定蛋白质在以5-甲基-2-吡嗪醛为原料制备5-甲基吡嗪-2-羧酸中的应用;

所述特定蛋白质为如下(a1)或(a2):

(a1)醛脱氢酶;

(a2)在(a1)的n端或/和c端连接标签得到的融合蛋白质。

以上任一所述醛脱氢酶是如下(b1)或(b2):

(b1)由序列表中序列2所示的氨基酸序列组成的蛋白质;

(b2)将序列2的氨基酸序列经过一个或几个氨基酸残基的取代和/或缺失和/或添加且与具有相同功能的由序列2衍生的蛋白质。

本发明还保护一种5-甲基吡嗪-2-羧酸的制备方法,包括如下步骤:采用所述特定蛋白质催化5-甲基-2-吡嗪醛转化为5-甲基吡嗪-2-羧酸。

所述催化反应体系由缓冲液、底物、特定蛋白质和nad+组成。

所述缓冲液为0.5mtris-hcl(ph为8.0)。

所述底物为5-甲基-2-吡嗪醛,5-甲基-2-吡嗪醛在反应体系中的浓度为20mm。

所述特定蛋白质在反应体系中的浓度为1000u/l。

所述nad+在反应体系中的浓度为20mm。

所述催化反应条件为30℃、200rpm反应12h。

本发明还保护一种5-甲基吡嗪-2-羧酸的制备方法,包括如下步骤:

(1)将重组菌进行诱导表达,然后收集菌体并进行菌体破碎,然后收集上清液;所述重组菌为具有编码所述特定蛋白质的基因的重组菌;

(2)从步骤(1)得到的上清液中纯化所述特定蛋白质;

(3)采用步骤(2)得到的特定蛋白质催化5-甲基-2-吡嗪醛转化为5-甲基吡嗪-2-羧酸。

所述“编码所述特定蛋白质的基因”为如下(c1)-(c3)中任一所述的dna分子:

(c1)编码区如序列表中序列1所示的dna分子;

(c2)在严格条件下与(c1)限定的dna序列杂交且编码权醛脱氢酶的dna分子;

(c3)与(c1)或(c2)限定的dna序列具有90%以上同源性且编码醛脱氢酶的dna分子。

所述重组菌是将重组质粒导入出发菌株得到的;所述重组质粒为将pet21a(+)载体的ndei和xhoi酶切位点间的小片段替换为了序列表的序列1所示的双链dna分子得到的重组质粒;所述出发菌为大肠杆菌。所述出发菌具体可为大肠杆菌bl21(de3)。

所述步骤(1)中,所述“将重组菌进行诱导表达”具体为:将所述重组菌在含氨苄青霉素的lb液体培养基中培养至菌液od600nm=1-2;向培养体系中加入iptg进行诱导。所述lb液体培养基中,氨苄青霉素的浓度为50μg/ml。所述培养条件为37℃、220rpm培养。所述iptg的浓度为30ppm。所述诱导的条件为30℃、220rpm诱导16h。

所述步骤(1)中,所述“收集菌体并进行菌体破碎,然后收集上清液”具体为:收集菌体,用磷酸缓冲液重悬所述重组菌菌体后超声,将超声破碎产物离心后收集上清液。所述磷酸缓冲液为20mm(ph7.5)磷酸缓冲液。所述超声的功率为250w,超声时间为20min(超声5s,停10s)。所述离心的条件为4℃、12000×g离心1h。

所述步骤(2)中,纯化采用镍柱(gehealthcarebio-scienceab,货号:17-5248-01)和脱盐柱(gehealthcarebio-scienceab,货号:17-1408-01)实现。

所述步骤(3)中,所述催化反应体系由缓冲液、底物、特定蛋白质和nad+组成。

所述缓冲液为0.5mtris-hcl(ph为8.0)。

所述底物为5-甲基-2-吡嗪醛,5-甲基-2-吡嗪醛在反应体系中的浓度为20mm。

所述特定蛋白质在反应体系中的浓度为1000u/l。

所述nad+在反应体系中的浓度为20mm。

所述催化反应条件为30℃、200rpm反应12h。

本发明还保护一种试剂盒,包括以上任一所述特定蛋白质和5-甲基-2-吡嗪醛;所述试剂盒的用途为制备5-甲基吡嗪-2-羧酸。所述试剂盒中还包括0.5mtris-hcl(ph为8.0)。所述试剂盒中还包括nad+。

本发明还保护一种试剂盒,包括以上任一所述重组菌和5-甲基-2-吡嗪醛;所述试剂盒的用途为制备5-甲基吡嗪-2-羧酸。所述试剂盒中还包括0.5mtris-hcl(ph为8.0)。所述试剂盒中还包括nad+。

本发明首次利用特定的酶高效地实现了5-甲基吡嗪-2-羧酸的一步化生产。本发明工艺简单,所有原料和酶在一个反应器内一步反应即可制备5-甲基-2-吡嗪酸,不涉及中间步骤和反应,极大地简化了工艺流程,催化氧化反应基本上不受产物5-甲基-2-吡嗪酸的抑制,高浓度的转化可以获得高收率,简化了提取工艺,有利于大规模工业化生产。

附图说明

图1为pet21a-xylc质粒图谱。

图2为5-甲基-2-吡嗪羧酸标准品液相色谱图。

图3为5-甲基-2-吡嗪羧酸标准曲线。

图4为核磁共振碳谱(cnmr)图。

图5为核磁共振氢谱(hnmr)图。

图6为产物5-甲基-2-吡嗪羧酸结构式。

具体实施方式

以下的实施例便于更好地理解本发明,但并不限定本发明。下述实施例中的实验方法,如无特殊说明,均为常规方法。下述实施例中所用的试验材料,如无特殊说明,均为自常规生化试剂商店购买得到的。以下实施例中的定量试验,均设置三次重复实验,结果取平均值。

假单胞菌pseudomonasputida来源的xylc基因如序列表的序列1所示。假单胞菌pseudomonasputida来源的醛脱氢酶蛋白如序列表的序列2所示。序列1所示的基因编码序列2所述的蛋白质。

5-甲基-2-吡嗪醛:北京伊诺凯科技有限公司,cas:50866-30-3。

pet21a(+)质粒:novagen,产品目录编号:69740-3cn。

大肠杆菌bl21(de3):天根生化科技(北京)有限公司,货号:cb105-02。

实施例1、高表达假单胞菌pseudomonasputida来源xylc基因的重组表达载体

采用序列表的序列1所示的双链dna分子取代pet21a(+)质粒的ndei和xhoi酶切位点间的小片段,得到重组表达载体pet21a-xylc(质粒图谱见图1)。

实施例2、醛脱氢酶的制备

1、将实施例1制备的重组表达载体pet21a-xylc转化大肠杆菌bl21(de3),得到重组菌。重组菌表达可以得到c端融合有his6标签的醛脱氢酶蛋白。

2、将步骤1得到的重组菌接种于含有50μg/ml氨苄青霉素的lb液体培养基中,37℃、220rpm培养至菌液od600nm=1-2,向培养体系中加入30ppmiptg,30℃、220rpm诱导16h。

3、完成步骤2后,将培养体系8000rpm离心,收集菌体沉淀。

4、完成步骤3后,采用20mm(ph7.5)磷酸缓冲液重悬菌体后超声,超声功率为250w,超声时间为20min(超声5s,停10s)。

5、完成步骤4后,将超声破碎产物4℃、12000×g离心1h后收集上清液。

6、对步骤5得到的上清采用镍柱(gehealthcarebio-scienceab,货号:17-5248-01)进行纯化,将上清液加载到镍柱,依次采用流动相a和流动相b洗脱,收集流动相b的洗脱液;再对洗脱液采用脱盐柱(gehealthcarebio-scienceab,货号:17-1408-01)进行脱盐处理,采用流动相c洗脱,最终得到纯化后的蛋白溶液。

流动相a:20mm(ph7.5)磷酸缓冲液(含20mm咪唑和0.5mnacl);流动相b:20mm(ph7.5)磷酸缓冲液(含200mm咪唑和0.5mnacl);流动相c:20mm(ph7.5)磷酸缓冲液。

7、对步骤6得到的纯化后的蛋白溶液进行蛋白定量,蛋白浓度为6.4mg/ml。

8、对步骤6得到的纯化后的蛋白溶液进行醛脱氢酶酶活力检测;反应体系中加入5-甲基-2-吡嗪醛、nad+和待测蛋白溶液1μl,h2o定容至1ml。5-甲基-2-吡嗪醛在反应体系中的浓度为10mm,nad+在反应体系中的浓度为5mm。

待测蛋白溶液:采用20mm(ph7.5)磷酸缓冲液将步骤6得到的蛋白溶液稀释至浓度为1mg/ml。

采用分光光度计(仪器型号:uv-1800pc型)在线监测5min后,根据nadh在340nm的消光系数(6.22cm-1·mmol-1)计算得到酶的比活力为5u/mg。

酶的比活力(u/mg)=(od340nm×1000)/(6.22cm-1·mmol-1×1cm×5min×1mg·ml-1×0.001ml)

实施例3、醛脱氢酶制备5-甲基-2-吡嗪羧酸

反应体系(1ml)由缓冲液、底物、醛脱氢酶和nad+组成;缓冲液:0.5mtris-hcl(ph为8.0);底物:5-甲基-2-吡嗪醛,5-甲基-2-吡嗪醛在反应体系中的浓度为20mm;醛脱氢酶:实施例2步骤6得到的醛脱氢酶蛋白溶液,醛脱氢酶在反应体系中的浓度为1000u/l;nad+在反应体系中的浓度为20mm。

反应条件:30℃、200rpm反应12h。

反应结束后将反应体系稀释10倍后hplc检测产物浓度。

hplc色谱条件:仪器型号:agilent1200series;色谱柱:nucleosil100c18,4.6×250mm,5μm;柱温:25℃;紫外检测波长:275nm;采集时间:10min;进样量:5μl;流速:1.00ml/min;流动相由a相和b相组成,a相为0.1%(体积百分含量)tfa水溶液,b相为乙腈,a相和b相的体积比为80:20。

采用5-甲基-2-吡嗪羧酸作为标准品(上海百舜生物科技有限公司,cas:5521-55-1)。

标准品色谱图见图2,5-甲基-2-吡嗪羧酸标准品的出峰时间为3.776min;在相同条件下出峰位置为±0.5min以内,可以认定为同一物质。

5-甲基-2-吡嗪羧酸标准曲线见图3。

收集5-甲基-2-吡嗪羧酸对应的洗脱峰,通过核磁一步验证产物表征。

核磁共振碳谱(cnmr)图见图4。核磁共振氢谱(hnmr)图见图5。

经过上述检测,结果表明,产物为5-甲基-2-吡嗪羧酸(结构式如图6所示);每个反应体系底物消耗量为88%(约17.60mm),得到产物5-甲基-2-吡嗪羧酸的量为17.02mm。

sequencelisting

<110>中国科学院微生物研究所

<120>一种酶法生产5-甲基吡嗪-2-羧酸

<160>2

<210>1

<211>1461

<212>dna

<213>假单胞菌(pseudomonasputida)

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<213>假单胞菌(pseudomonasputida)

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