本发明涉及分子生物技术领域,具体是指一种多酚多糖植物rna的提取方法。
背景技术:
rna的提取是分子生物学的基本内容之一,高质量的rna是进行基因克隆、基因表达、基因功能分析等研究的必要前提。rt-pcr、northern、real-timepcr、cdna文库构建等分子生物学研究的展开首先必须获得纯度高、完整性好的总rna。植物组织特别是高等植物组织细胞内外组成成分的复杂多样性,使得植物组织rna的提取比其他生物材料更加困难。对于梨属、柑橘属、中草药的多种植物而言,分离纯化组织中的rna难度较大,因此严重阻碍了其分子生物学研究的进展。而富含酚类化合物和多糖类物质、含有大量已知和尚未确定的次生代谢产物以及内源rnase含量较高是这些植物rna提取的主要障碍。许多含有大量多酚和多糖的植物,在匀浆时酚类化合物极易氧化成醌类物质,与rna不可逆的结合,从而影响rna的分离纯化。多糖的许多理化性质与rna相似,在提取过程中与rna共沉淀,也使其难以分离。
目前,已经发展了许多rna提取的方法,如胍盐法、sds法、苯酚法和十六烷基三甲基溴化胺法等。这些方法的核心试剂为异硫氰酸胍、sds、ctab等。异硫氰酸胍能迅速破碎细胞,作为强变性剂使核酸-蛋白结构发生变化,并有效解离蛋白和核酸的复合体,最终释放出核酸。sds是一种离子去污剂,能从低离子强度溶液中沉淀核酸与酸性多聚糖。ctab作为离子型表面活性剂,能溶解细胞膜和核膜蛋白,使核蛋白解聚,从而使rna游离出来。各种提取rna的方法相似,首先彻底破碎植物细胞的细胞壁,接着使核蛋白复合体中的蛋白质充分变性,实现核蛋白与核酸的分离;同时抑制内源和外源rna酶的活性,防止rna受污染而降解,然后将rna与dna、蛋白质、多酚、多糖等物质分离,最后检测rna的质量。因此,能否有效去除多糖、酚类化合物的干扰是提取高质量植物rna成败的关键。
但是,上述的各项提取方法所需的操作都较为繁琐,提取的时间长,且提取的rna的完整性不高;同时,上述的各项方法采用了酚、氯仿等有毒刺激性试剂,对操作人员的操作安全存在这隐患,不利于保护操作人员的人身安全。
技术实现要素:
本发明的目的在于克服上述问题,提供了一种多酚多糖植物rna的提取方法,不需使用酚、氯仿等有毒的刺激性试剂,更好的保护了操作人员的安全,而且操作简单,提取时间短,提取的rna完整性好,大大提高了rna的提取速度与提取质量。
本发明的目的通过下述技术方案实现:
一种多酚多糖植物rna的提取方法,包括以下步骤:
(1)将植物组织碾磨后放入离心管中,向离心管加入buffera进行匀浆处理,得到匀浆液;
(2)向匀浆液中加入bufferb,并颠倒混匀后对其进行离心;
(3)将步骤(2)中的上清液取出并加入新的离心管中,并缓慢加入0.3-0.7倍无水乙醇,轻柔混匀后将得到的溶液和沉淀一起转入吸附柱中进行离心,倒掉与该吸附柱配套的收集管中的废液;
(4)向吸附柱中加入bufferc,并在离心后取出吸附柱,倒掉与该吸附柱匹配的收集管中的废液,再将吸附柱放回收集管中;
(5)向吸附柱中央加入dnasei工作液,并在室温中静置;
(6)再重复步骤(4)一次后进行步骤(7);
(7)向吸附柱中加入bufferd,并在离心后取出吸附柱,倒掉与该吸附柱匹配的收集管中的废液,再将吸附柱放回收集管中;
(8)重复步骤(7)一次,接着将吸附柱放置在室温下静置,直至无水乙醇完全挥发;
(9)向吸附柱中吸附膜的中间部位悬空滴加rnase-freeddh2o,在室温中静置后进行离心,即得到rna溶液。
作为优选,步骤(1)中植物组织的重量为50-100mg,该植物组织取出后需要放入液氮中迅速进行碾磨得到植物组织粉末,接着将植物组织粉末放入离心管中并加入500-1000μlbuffera,通过涡旋振荡器进行剧烈振荡以使其混合均匀,最终将混合物在室温中静置10min得到匀浆液;所述buffera的组分包括ph值为8.0的tris-hcl、ph值为8.0的edta、nacl、sds、pvp以及β-巯基乙醇,其中ph值为8.0的tris-hcl的浓度为100mm,ph值为8.0的edta的浓度为50mm,nacl的浓度为500mm,每100ml的buffera中还含有1克sds、2克pvp以及2mlβ-巯基乙醇;所述β-巯基乙醇在buffera使用前加入。
作为优选,步骤(2)中所述的bufferb的添加量为500-1000μl,且该bufferb由0.75m的醋酸钾和4m的盐酸胍溶液以3:1的比例调配而成;所述颠倒混匀的次数为8-10次,且离心的转速为10000-12000rpm,离心时间为6-10min。
作为优选,步骤(3)中的离心的转速为10000-12000rpm,离心时间为1min。
作为优选,步骤(4)中加入的bufferc的量为200-400μl,该bufferc主要由3m盐酸胍和60%的无水乙醇组成;所述离心的转速为10000-12000rpm,离心时间为0.5-1min。
作为优选,步骤(5)中的dnasei工作液的加入量为80μl,且该dnasei工作液的配制过程为:首先,向新的离心管中分别加入20μldnasei、8μl10×dnaseibuffer以及52μlrnase-freeddh2o,接着将其轻柔混匀即可;所述的静置时间为15min。
作为优选,步骤(7)中bufferd的添加量为500-700μl,该bufferd为80%的无水乙醇;所述离心的转速为10000-12000rpm,离心时间为0.5-1min。
作为优选,步骤(9)中滴入的rnase-freeddh2o量为30-50μl;所述静置的时间为2min;所述离心的转速为10000-12000rpm,离心时间为2min。
本发明与现有技术相比,具有以下优点及有益效果:
本发明不需使用酚、氯仿等有毒的刺激性试剂,更好的保护了操作人员的安全,而且操作简单,提取时间短,提取的rna完整性好,大大提高了rna的提取速度与提取质量。
附图说明
图1为本发明所提取红叶李花药的rna的电泳条带图。
图2为本发明所提取樟树叶的rna的电泳条带图。
具体实施方式
下面结合实施例对本发明作进一步的详细说明,但本发明的实施方式不限于此。
实施例1
一种多酚多糖植物rna的提取方法,包括以下步骤:
(1)将植物组织碾磨后放入离心管中,向离心管加入buffera进行匀浆处理,得到匀浆液;
植物组织的重量为50mg,该植物组织取出后需要放入液氮中迅速进行碾磨得到植物组织粉末,接着将植物组织粉末放入离心管中并加入500μlbuffera,通过涡旋振荡器进行剧烈振荡以使其混合均匀,最终将混合物在室温中静置10min得到匀浆液;所述buffera的组分包括ph值为8.0的tris-hcl、ph值为8.0的edta、nacl、sds、pvp以及β-巯基乙醇,其中ph值为8.0的tris-hcl的浓度为100mm,ph值为8.0的edta的浓度为50mm,nacl的浓度为500mm,每100ml的buffera中还含有1克sds、2克pvp以及2mlβ-巯基乙醇;所述β-巯基乙醇在buffera使用前加入。
(2)向匀浆液中加入bufferb,并颠倒混匀后对其进行离心;
所述的bufferb的添加量为500μl,且该bufferb由0.75m的醋酸钾和4m的盐酸胍溶液以3:1的比例调配而成;所述颠倒混匀的次数为8次,且离心的转速为10000rpm,离心时间为6min。
(3)将步骤(2)中的上清液取出并加入新的离心管中,并缓慢加入0.3倍无水乙醇,轻柔混匀后将得到的溶液和沉淀一起转入吸附柱中进行离心,倒掉与该吸附柱配套的收集管中的废液;
离心的转速为10000rpm,离心时间为1min。
(4)向吸附柱中加入bufferc,并在离心后取出吸附柱,倒掉与该吸附柱匹配的收集管中的废液,再将吸附柱放回收集管中;
加入的bufferc的量为200μl,该bufferc主要由3m盐酸胍和60%的无水乙醇组成;所述离心的转速为10000rpm,离心时间为0.5min。
(5)向吸附柱中央加入dnasei工作液,并在室温中静置;
dnasei工作液的加入量为80μl,且该dnasei工作液的配制过程为:首先,向新的离心管中分别加入20μldnasei、8μl10×dnaseibuffer以及52μlrnase-freeddh2o,接着将其轻柔混匀即可;所述的静置时间为15min。
(6)再重复步骤(4)一次后进行步骤(7);
(7)向吸附柱中加入bufferd,并在离心后取出吸附柱,倒掉与该吸附柱匹配的收集管中的废液,再将吸附柱放回收集管中;
bufferd的添加量为500μl,该bufferd为80%的无水乙醇;所述离心的转速为10000rpm,离心时间为0.5min。
(8)重复步骤(7)一次,接着将吸附柱放置在室温下静置,直至无水乙醇完全挥发;
(9)向吸附柱中吸附膜的中间部位悬空滴加rnase-freeddh2o,在室温中静置后进行离心,即得到rna溶液。
滴入的rnase-freeddh2o量为30μl;所述静置的时间为2min;所述离心的转速为10000rpm,离心时间为2min。
通过上述方法得到的rna溶液,需要在-20℃的温度环境下进行保存备用。
实施例2
一种多酚多糖植物rna的提取方法,包括以下步骤:
(1)将植物组织碾磨后放入离心管中,向离心管加入buffera进行匀浆处理,得到匀浆液;
植物组织的重量为100mg,该植物组织取出后需要放入液氮中迅速进行碾磨得到植物组织粉末,接着将植物组织粉末放入离心管中并加入1000μlbuffera,通过涡旋振荡器进行剧烈振荡以使其混合均匀,最终将混合物在室温中静置10min得到匀浆液;所述buffera的组分包括ph值为8.0的tris-hcl、ph值为8.0的edta、nacl、sds、pvp以及β-巯基乙醇,其中ph值为8.0的tris-hcl的浓度为100mm,ph值为8.0的edta的浓度为50mm,nacl的浓度为500mm,每100ml的buffera中还含有1克sds、2克pvp以及2mlβ-巯基乙醇;所述β-巯基乙醇在buffera使用前加入。
(2)向匀浆液中加入bufferb,并颠倒混匀后对其进行离心;
所述的bufferb的添加量为1000μl,且该bufferb由0.75m的醋酸钾和4m的盐酸胍溶液以3:1的比例调配而成;所述颠倒混匀的次数为10次,且离心的转速为12000rpm,离心时间为6-10min。
(3)将步骤(2)中的上清液取出并加入新的离心管中,并缓慢加入0.7倍无水乙醇,轻柔混匀后将得到的溶液和沉淀一起转入吸附柱中进行离心,倒掉与该吸附柱配套的收集管中的废液;
离心的转速为12000rpm,离心时间为1min。
(4)向吸附柱中加入bufferc,并在离心后取出吸附柱,倒掉与该吸附柱匹配的收集管中的废液,再将吸附柱放回收集管中;
加入的bufferc的量为400μl,该bufferc主要由3m盐酸胍和60%的无水乙醇组成;所述离心的转速为12000rpm,离心时间为0.5-1min。
(5)向吸附柱中央加入dnasei工作液,并在室温中静置;
dnasei工作液的加入量为80μl,且该dnasei工作液的配制过程为:首先,向新的离心管中分别加入20μldnasei、8μl10×dnaseibuffer以及52μlrnase-freeddh2o,接着将其轻柔混匀即可;所述的静置时间为15min。
(6)再重复步骤(4)一次后进行步骤(7);
(7)向吸附柱中加入bufferd,并在离心后取出吸附柱,倒掉与该吸附柱匹配的收集管中的废液,再将吸附柱放回收集管中;
bufferd的添加量为700μl,该bufferd为80%的无水乙醇;所述离心的转速为12000rpm,离心时间为1min。
(8)重复步骤(7)一次,接着将吸附柱放置在室温下静置,直至无水乙醇完全挥发;
(9)向吸附柱中吸附膜的中间部位悬空滴加rnase-freeddh2o,在室温中静置后进行离心,即得到rna溶液。
滴入的rnase-freeddh2o量为50μl;所述静置的时间为2min;所述离心的转速为10000-12000rpm,离心时间为2min。
通过上述方法得到的rna溶液,需要在-20℃的温度环境下进行保存备用。
实施例3
一种多酚多糖植物rna的提取方法,包括以下步骤:
(1)将植物组织碾磨后放入离心管中,向离心管加入buffera进行匀浆处理,得到匀浆液;
植物组织的重量为50-100mg,该植物组织取出后需要放入液氮中迅速进行碾磨得到植物组织粉末,接着将植物组织粉末放入离心管中并加入500-1000μlbuffera,通过涡旋振荡器进行剧烈振荡以使其混合均匀,最终将混合物在室温中静置10min得到匀浆液;所述buffera的组分包括ph值为8.0的tris-hcl、ph值为8.0的edta、nacl、sds、pvp以及β-巯基乙醇,其中ph值为8.0的tris-hcl的浓度为100mm,ph值为8.0的edta的浓度为50mm,nacl的浓度为500mm,每100ml的buffera中还含有1克sds、2克pvp以及2mlβ-巯基乙醇;所述β-巯基乙醇在buffera使用前加入。
(2)向匀浆液中加入bufferb,并颠倒混匀后对其进行离心;
所述的bufferb的添加量为500-1000μl,且该bufferb由0.75m的醋酸钾和4m的盐酸胍溶液以3:1的比例调配而成;所述颠倒混匀的次数为8-10次,且离心的转速为10000-12000rpm,离心时间为6-10min。
(3)将步骤(2)中的上清液取出并加入新的离心管中,并缓慢加入0.3-0.7倍无水乙醇,轻柔混匀后将得到的溶液和沉淀一起转入吸附柱中进行离心,倒掉与该吸附柱配套的收集管中的废液;
离心的转速为11000rpm,离心时间为1min。
(4)向吸附柱中加入bufferc,并在离心后取出吸附柱,倒掉与该吸附柱匹配的收集管中的废液,再将吸附柱放回收集管中;
加入的bufferc的量为300μl,该bufferc主要由3m盐酸胍和60%的无水乙醇组成;所述离心的转速为11000rpm,离心时间为0.5-1min。
(5)向吸附柱中央加入dnasei工作液,并在室温中静置;
dnasei工作液的加入量为80μl,且该dnasei工作液的配制过程为:首先,向新的离心管中分别加入20μldnasei、8μl10×dnaseibuffer以及52μlrnase-freeddh2o,接着将其轻柔混匀即可;所述的静置时间为15min。
(6)再重复步骤(4)一次后进行步骤(7);
(7)向吸附柱中加入bufferd,并在离心后取出吸附柱,倒掉与该吸附柱匹配的收集管中的废液,再将吸附柱放回收集管中;
bufferd的添加量为600μl,该bufferd为80%的无水乙醇;所述离心的转速为11000rpm,离心时间为0.75min。
(8)重复步骤(7)一次,接着将吸附柱放置在室温下静置,直至无水乙醇完全挥发;
(9)向吸附柱中吸附膜的中间部位悬空滴加rnase-freeddh2o,在室温中静置后进行离心,即得到rna溶液。
滴入的rnase-freeddh2o量为40μl;所述静置的时间为2min;所述离心的转速为11000rpm,离心时间为2min。
通过上述方法得到的rna溶液,需要在-20℃的温度环境下进行保存备用。
实施例4
本实施例是对红叶李花药总rna的提取过程,包括以下步骤:
(1)将植物组织碾磨后放入离心管中,向离心管加入buffera进行匀浆处理,得到匀浆液;
植物组织的重量为50mg,该植物组织取出后需要放入液氮中迅速进行碾磨得到植物组织粉末,接着将植物组织粉末放入离心管中并加入500μlbuffera,通过涡旋振荡器进行剧烈振荡以使其混合均匀,最终将混合物在室温中静置5min得到匀浆液;所述buffera的组分包括ph值为8.0的tris-hcl、ph值为8.0的edta、nacl、sds、pvp以及β-巯基乙醇,其中ph值为8.0的tris-hcl的浓度为100mm,ph值为8.0的edta的浓度为50mm,nacl的浓度为500mm,每100ml的buffera中还含有1克sds、2克pvp以及2mlβ-巯基乙醇;所述β-巯基乙醇在buffera使用前加入。
(2)向匀浆液中加入bufferb,并颠倒混匀后对其进行离心;
所述的bufferb的添加量为500μl,且该bufferb由0.75m的醋酸钾和4m的盐酸胍溶液以3:1的比例调配而成;所述颠倒混匀的次数为8次,且离心的转速为12000rpm,离心时间为10min。
(3)将步骤(2)中的上清液取出并加入新的离心管中,并缓慢加入0.3倍无水乙醇,轻柔混匀后将得到的溶液和沉淀一起转入吸附柱中进行离心,倒掉与该吸附柱配套的收集管中的废液;
离心的转速为10000rpm,离心时间为1min。
(4)向吸附柱中加入bufferc,并在离心后取出吸附柱,倒掉与该吸附柱匹配的收集管中的废液,再将吸附柱放回收集管中;
加入的bufferc的量为200μl,该bufferc主要由3m盐酸胍和60%的无水乙醇组成;所述离心的转速为10000rpm,离心时间为0.5min。
(5)向吸附柱中央加入dnasei工作液,并在室温中静置;
dnasei工作液的加入量为80μl,且该dnasei工作液的配制过程为:首先,向新的离心管中分别加入20μldnasei、8μl10×dnaseibuffer以及52μlrnase-freeddh2o,接着将其轻柔混匀即可;所述的静置时间为15min。
(6)再重复步骤(4)一次后进行步骤(7);
(7)向吸附柱中加入bufferd,并在离心后取出吸附柱,倒掉与该吸附柱匹配的收集管中的废液,再将吸附柱放回收集管中;
bufferd的添加量为500μl,该bufferd为80%的无水乙醇;所述离心的转速为10000rpm,离心时间为0.5min。
(8)重复步骤(7)一次,接着将吸附柱放置在室温下静置,直至无水乙醇完全挥发;
(9)向吸附柱中吸附膜的中间部位悬空滴加rnase-freeddh2o,在室温中静置后进行离心,即得到rna溶液。
滴入的rnase-freeddh2o量为30μl;所述静置的时间为2min;所述离心的转速为10000rpm,离心时间为2min。
通过上述方法得到的rna溶液,需要在-20℃的温度环境下进行保存备用。
吸取4μlrna溶液进行电泳,结果如图1所示。从图1中可以看出采用本发明所提取的rna电泳条带明亮、清晰,没有因为rna降解而形成的弥散条带。
实施例5
本实施例是对樟树叶片总rna的提取过程,包括以下步骤:
(1)将植物组织碾磨后放入离心管中,向离心管加入buffera进行匀浆处理,得到匀浆液;
植物组织的重量为50mg,该植物组织取出后需要放入液氮中迅速进行碾磨得到植物组织粉末,接着将植物组织粉末放入离心管中并加入700μlbuffera,通过涡旋振荡器进行剧烈振荡以使其混合均匀,最终将混合物在室温中静置5min得到匀浆液;所述buffera的组分包括ph值为8.0的tris-hcl、ph值为8.0的edta、nacl、sds、pvp以及β-巯基乙醇,其中ph值为8.0的tris-hcl的浓度为100mm,ph值为8.0的edta的浓度为50mm,nacl的浓度为500mm,每100ml的buffera中还含有1克sds、2克pvp以及2mlβ-巯基乙醇;所述β-巯基乙醇在buffera使用前加入。
(2)向匀浆液中加入bufferb,并颠倒混匀后对其进行离心;
所述的bufferb的添加量为500μl,且该bufferb由0.75m的醋酸钾和4m的盐酸胍溶液以3:1的比例调配而成;所述颠倒混匀的次数为8次,且离心的转速为12000rpm,离心时间为10min。
(3)将步骤(2)中的上清液取出并加入新的离心管中,并缓慢加入0.3倍无水乙醇,轻柔混匀后将得到的溶液和沉淀一起转入吸附柱中进行离心,倒掉与该吸附柱配套的收集管中的废液;
离心的转速为12000rpm,离心时间为1min。
(4)向吸附柱中加入bufferc,并在离心后取出吸附柱,倒掉与该吸附柱匹配的收集管中的废液,再将吸附柱放回收集管中;
加入的bufferc的量为200μl,该bufferc主要由3m盐酸胍和60%的无水乙醇组成;所述离心的转速为10000rpm,离心时间为0.5min。
(5)向吸附柱中央加入dnasei工作液,并在室温中静置;
dnasei工作液的加入量为80μl,且该dnasei工作液的配制过程为:首先,向新的离心管中分别加入20μldnasei、8μl10×dnaseibuffer以及52μlrnase-freeddh2o,接着将其轻柔混匀即可;所述的静置时间为15min。
(6)再重复步骤(4)一次后进行步骤(7);
(7)向吸附柱中加入bufferd,并在离心后取出吸附柱,倒掉与该吸附柱匹配的收集管中的废液,再将吸附柱放回收集管中;
bufferd的添加量为500μl,该bufferd为80%的无水乙醇;所述离心的转速为10000rpm,离心时间为0.5min。
(8)重复步骤(7)一次,接着将吸附柱放置在室温下静置,直至无水乙醇完全挥发;
(9)向吸附柱中吸附膜的中间部位悬空滴加rnase-freeddh2o,在室温中静置后进行离心,即得到rna溶液。
滴入的rnase-freeddh2o量为30μl;所述静置的时间为2min;所述离心的转速为10000rpm,离心时间为2min。
通过上述方法得到的rna溶液,需要在-20℃的温度环境下进行保存备用。
吸取4μlrna溶液进行电泳,结果如图2所示。从图2中可以看出采用本发明所提取的rna电泳条带明亮、清晰,没有因为rna降解而形成的弥散条带。
以上对本发明的具体实施案例进行了描述。需要理解的是,本发明并不局限于上述特定的实施方式,本领域技术人员可以在权利要求的范围内做出各种变形或修改,这并不影响本发明的实质内容。