白蛋白结合结构域融合蛋白的制作方法

文档序号:19156738发布日期:2019-11-16 00:54阅读:来源:国知局

技术特征:

1.一种包括白蛋白结合结构域(abd)的组合物,所述abd包括:

a)可变重链,所述可变重链包括图2中所描绘的可变重链中的任一个的vhcdr1、vhcdr2和vhcdr3;以及

b)可变轻链,所述可变轻链包括图2中所描绘的可变轻链中的任一个的vlcdr1、vlcdr2和vlcdr3。

2.根据权利要求2所述的包括白蛋白结合结构域的组合物,其中所述vhcdr1包括根据图2中所描绘的所述vhcdr1、vhcdr2和vhcdr3序列中的任一个的vhcdr1序列,所述vhcdr2包括根据其中任一个的vhcdr2序列,并且所述vhcdr3包括根据其中任一个的vhcdr3序列。

3.根据权利要求1所述的组合物,其中所述可变重链包括图2中所描绘的所述可变重链中的任一个的序列。

4.根据前述权利要求中任一项所述的组合物,其中所述

所述vlcdr1包括根据图2中所描绘的所述vlcdr1、vlcdr2和vhcdr3序列中的任一个的vlcdr1序列,所述vlcdr2包括根据其中任一个的vlcdr2序列,并且所述vlcdr3包括根据其中任一个的vlcdr3序列。

5.根据权利要求4所述的组合物,其中所述可变轻链包括图2中所描绘的所述可变轻链中的任一个的序列。

6.根据权利要求1所述的组合物,其中所述白蛋白结合结构域包括a10m3的可变重链和可变轻链(图2d)。

7.一种包括变体il-15的组合物,如与亲本il-15相比,所述变体il-15包括选自由以下组成的组的一个或多个氨基酸取代:k86a、k86r、n112a、n112s、n112q、k86a/n112a、k86r/n112a、k86a/n112s、k86r/n112s、k86a/n112q、k86r/n112q、k86a/n112a/n79a、k86r/n112a/n79a、k86a/n112a/n79d、k86r/n112a/n79d、k86a/n112a/n79q、k86r/n112a/n79q、k86a/n112a/n71d、k86r/n112a/n71d、k86a/n112a/n71q、k86r/n112a/n71q、k86a/n112a/n71d/n79a、k86a/n112a/n71d/n79d、k86a/n112a/n71q/n79a、k86a/n112a/n71q/n79d、k86r/n112a/n71d/n79a、k86r/n112a/n71d/n79d、k86r/n112a/n71d/n79q、k86r/n112a/n71q/n79a、k86r/n112a/n71q/n79d以及k86r/n112a/n71q/n79q。

8.根据权利要求7所述的包括变体il-15的组合物,其中所述变体il-15包括图3中所描绘的变体il-15中的任一个的氨基酸序列。

9.根据权利要求7或8所述的包括变体il-15的组合物,其进一步包括连接到所述il-15的il-15受体α(il-15rα)。

10.一种包括连接到融合配偶体的abd的白蛋白结合结构域(abd)融合蛋白,其中所述abd包括可变重链和可变轻链,所述可变重链包括图2中所描绘的可变重链中的任一个的vhcdr1、vhcdr2和vhcdr3,所述可变轻链包括图2中所描绘的可变轻链中的任一个的vlcdr1、vlcdr2和vlcdr3。

11.根据权利要求10所述的abd融合蛋白,其中所述vhcdr1包括根据图2中所描绘的所述vhcdr1、vhcdr2和vhcdr3序列中的任一个的vhcdr1序列,所述vhcdr2包括根据其中任一个的vhcdr2序列,并且所述vhcdr3包括根据其中任一个的vhcdr3序列。

12.根据权利要求11所述的abd融合蛋白,其中所述可变重链包括图2中所描绘的所述可变重链序列中的任一个的序列。

13.根据权利要求10到12中任一项所述的abd融合蛋白,其中所述vlcdr1包括根据图2中所描绘的所述vlcdr1、vlcdr2和vhcdr3序列中的任一个的vlcdr1序列,所述vlcdr2包括根据其中任一个的vlcdr2序列,并且所述vlcdr3包括根据其中任一个的vlcdr3序列。

14.根据权利要求13所述的abd融合蛋白,其中所述可变轻链包括图2中所描绘的所述可变轻链序列中的任一个的序列。

15.根据权利要求10所述的abd融合蛋白,其中所述可变重链和所述可变轻链分别包括a10m3的可变重链和可变轻链(图2d)。

16.根据权利要求10所述的abd融合蛋白,其中所述融合配偶体是细胞因子。

17.根据权利要求16所述的abd融合蛋白,其中所述细胞因子选自由以下组成的组:il-2、il-7、il-12、il-15、il-18、il-21、gm-csf和ifn-α。

18.根据权利要求10所述的abd融合蛋白,其中所述融合配偶体是结合部分。

19.根据权利要求18所述的abd融合蛋白,其中所述结合部分是包括scfv可变重链和scfv可变轻链的scfv。

20.根据权利要求19所述的abd融合蛋白,其中所述scfv选自由以下组成的组:抗tgfβscfv、抗pd-l1scfv、抗tnfscfv、抗il-1scfv、抗il-6scfv、抗il-8scfv、抗il-17(a-f)scfv以及抗il-23scfv。

21.根据权利要求10到20中任一项所述的abd融合蛋白,其中所述abd通过连接子连接到所述融合配偶体。

22.根据权利要求21所述的abd融合蛋白,其中所述连接子是(ggggs)x,其中x是1到10的整数。

23.一种根据式(il-15)-l-(abd)的il15-白蛋白结合结构域(abd)融合蛋白,

其中所述abd包括可变重链和可变轻链,所述可变重链包括图2中所描绘的可变重链中的任一个的vhcdr1、vhcdr2和vhcdr3,所述可变轻链包括图2中所描绘的可变轻链中的任一个的vlcdr1、vlcdr2和vlcdr3,并且

其中所述l是连接子。

24.根据权利要求23所述的il15-abd融合蛋白,其中所述vhcdr1包括根据图2中所描绘的所述vhcdr1、vhcdr2和vhcdr3序列中的任一个的vhcdr1序列,所述vhcdr2包括根据其中任一个的vhcdr2序列,并且所述vhcdr3包括根据其中任一个的vhcdr3序列。

25.根据权利要求24所述的il15-abd融合蛋白,其中所述可变重链包括图2中所描绘的所述可变重链序列中的任一个的序列。

26.根据权利要求23到25中任一项所述的il15-abd融合蛋白,其中所述vlcdr1包括根据图2中所描绘的所述vlcdr1、vlcdr2和vhcdr3序列中的任一个的vlcdr1序列,所述vlcdr2包括根据其中任一个的vlcdr2序列,并且所述vlcdr3包括根据其中任一个的vlcdr3序列。

27.根据权利要求26所述的il15-abd融合蛋白,其中所述可变轻链包括图2中所描绘的所述可变轻链序列中的任一个的序列。

28.根据权利要求23所述的il15-abd融合蛋白,其中所述可变重链和所述可变轻链分别包括a10m3的可变重链和可变轻链(图2d)。

29.根据权利要求23到28中任一项所述的il15-abd融合蛋白,其中所述il-15是变体il-15,如与亲本il-15相比,所述变体il-15包括选自由以下组成的组的一个或多个氨基酸取代:k86a、k86r、n112a、n112s、n112q、k86a/n112a、k86r/n112a、k86a/n112s、k86r/n112s、k86a/n112q、k86r/n112q、k86a/n112a/n79a、k86r/n112a/n79a、k86a/n112a/n79d、k86r/n112a/n79d、k86a/n112a/n79q、k86r/n112a/n79q、k86a/n112a/n71d、k86r/n112a/n71d、k86a/n112a/n71q、k86r/n112a/n71q、k86a/n112a/n71d/n79a、k86a/n112a/n71d/n79d、k86a/n112a/n71q/n79a、k86a/n112a/n71q/n79d、k86r/n112a/n71d/n79a、k86r/n112a/n71d/n79d、k86r/n112a/n71d/n79q、k86r/n112a/n71q/n79a、k86r/n112a/n71q/n79d以及k86r/n112a/n71q/n79q。

30.根据权利要求29所述的il15-abd融合蛋白,其中所述变体il-15包括图3中所描绘的变体il-15中的任一个的氨基酸序列。

31.根据权利要求30所述的il15-abd融合蛋白,其中所述变体il-15包括il15k86r/n112a的所述氨基酸取代。

32.根据权利要求23到28中任一项所述的il15-abd融合蛋白,其中所述il-15是野生型il-15。

33.根据权利要求23到28所述的il15-abd融合蛋白,其中所述il-15包括连接到il-15受体a(il-15rα)的野生型il-15。

34.根据权利要求23到33中任一项所述的il15-abd融合蛋白,其中所述连接子是选自图48中所描绘的连接子中的任一个。

35.根据权利要求34所述的il15-abd融合蛋白,其中所述连接子是(ggggs)x,其中x是1-10的整数。

36.根据权利要求23所述的il15-abd融合蛋白,其中所述il15-abd融合蛋白具有根据图4中所描绘的氨基酸序列中的任一个的氨基酸序列。

37.一种根据式(il-12)-l-(abd)的il12-白蛋白结合结构域(abd)融合蛋白,

其中所述abd包括可变重链和可变轻链,所述可变重链包括图2中所描绘的可变重链中的任一个的vhcdr1、vhcdr2和vhcdr3,所述可变轻链包括图2中所描绘的可变轻链中的任一个的vlcdr1、vlcdr2和vlcdr3,并且

其中所述l是连接子。

38.根据权利要求37所述的il12-abd融合蛋白,其中所述vhcdr1包括根据图2中所描绘的所述vhcdr1、vhcdr2和vhcdr3序列中的任一个的vhcdr1序列,所述vhcdr2包括根据其中任一个的vhcdr2序列,并且所述vhcdr3包括根据其中任一个的vhcdr3序列。

39.根据权利要求38所述的il12-abd融合蛋白,其中所述可变重链包括图2中所描绘的所述可变重链序列中的任一个的序列。

40.根据权利要求37到39中任一项所述的il12-abd融合蛋白,其中所述

所述vlcdr1包括根据图2中所描绘的所述vlcdr1、vlcdr2和vhcdr3序列中的任一个的vlcdr1序列,所述vlcdr2包括根据其中任一个的vlcdr2序列,并且所述vlcdr3包括根据其中任一个的vlcdr3序列。

41.根据权利要求40所述的il12-abd融合蛋白,其中所述可变轻链包括图2中所描绘的所述可变轻链序列中的任一个的序列。

42.根据权利要求37所述的il12-abd融合蛋白,其中所述可变重链和所述可变轻链分别包括a10m3的可变重链和可变轻链(图2d)。

43.根据权利要求37到42中任一项所述的il12-abd融合蛋白,其中所述il-12是单链il-12,所述单链il-12包括p35亚基、p40亚基和il-12连接子,并且其中所述il-12连接子共价地将所述p35亚基连接到所述p40亚基。

44.根据权利要求37到41中任一项所述的il12-abd融合蛋白,其中所述连接子是选自图48中所描绘的连接子中的任一个。

45.根据权利要求44所述的il12-abd融合蛋白,其中所述连接子是(ggggs)x,其中x是1-10的整数。

46.根据权利要求37所述的il12-abd融合蛋白,其中所述il12-abd融合蛋白包括根据图20的氨基酸序列中的任一个的氨基酸序列。

47.一种白蛋白结合结构域(abd)融合蛋白,其从n端到c端具有选自由以下组成的组的式:

a)(il-12)-l1-(abd)-l2-(il-15);以及

b)(il-15)-l1-(abd)-l2-(il-12),

其中abd是白蛋白结合结构域,所述白蛋白结合结构域包括可变重链和可变轻链,所述可变重链包括图2中所描绘的可变重链中的任一个的vhcdr1、vhcdr2和vhcdr3,所述可变轻链包括图2中所描绘的可变轻链中的任一个的vlcdr1、vlcdr2和vlcdr3,并且

其中l1和l2分别是第一连接子和第二连接子。

48.根据权利要求47所述的abd融合蛋白,其中所述vhcdr1包括根据图2中所描绘的所述vhcdr1、vhcdr2和vhcdr3序列中的任一个的vhcdr1序列,所述vhcdr2包括根据其中任一个的vhcdr2序列,并且所述vhcdr3包括根据其中任一个的vhcdr3序列。

49.根据权利要求48所述的abd融合蛋白,其中所述可变重链包括图2中所描绘的所述可变重链序列中的任一个的序列。

50.根据权利要求47到49中任一项所述的abd融合蛋白,其中所述vlcdr1包括根据图2中所描绘的所述vlcdr1、vlcdr2和vhcdr3序列中的任一个的vlcdr1序列,所述vlcdr2包括根据其中任一个的vlcdr2序列,并且所述vlcdr3包括根据其中任一个的vlcdr3序列。

51.根据权利要求50所述的abd融合蛋白,其中所述可变轻链包括图2中所描绘的所述可变轻链序列中的任一个的序列。

52.根据权利要求47所述的abd融合蛋白,其中所述abd融合蛋白从n端到c端是根据所述式(il-12)-l1-(abd)-l2-(il-15)。

53.根据权利要求47所述的abd融合蛋白,其中所述abd融合蛋白从n端到c端是根据所述式(il-15)-l1-(abd)-l2-(il-12)。

54.根据权利要求47所述的abd融合蛋白,其中所述可变重链和可变轻链分别包括a10m3的可变重链和可变轻链(图2d)。

55.根据权利要求47到54中任一项所述的abd融合蛋白,其中所述il-15包括野生型il-15多肽。

56.根据权利要求47到54中任一项所述的abd融合蛋白,其中所述il-15包括连接到il-15受体a(il-15rα)的野生型il-15。

57.根据权利要求47到54中任一项所述的abd融合蛋白,其中所述il-15是变体il-15,如与亲本il-15相比,所述变体il-15包括选自由以下组成的组的一个或多个氨基酸取代:k86a、k86r、n112a、n112s、n112q、k86a/n112a、k86r/n112a、k86a/n112s、k86r/n112s、k86a/n112q、k86r/n112q、k86a/n112a/n79a、k86r/n112a/n79a、k86a/n112a/n79d、k86r/n112a/n79d、k86a/n112a/n79q、k86r/n112a/n79q、k86a/n112a/n71d、k86r/n112a/n71d、k86a/n112a/n71q、k86r/n112a/n71q、k86a/n112a/n71d/n79a、k86a/n112a/n71d/n79d、k86a/n112a/n71q/n79a、k86a/n112a/n71q/n79d、k86r/n112a/n71d/n79a、k86r/n112a/n71d/n79d、k86r/n112a/n71d/n79q、k86r/n112a/n71q/n79a、k86r/n112a/n71q/n79d以及k86r/n112a/n71q/n79q。

58.根据权利要求47到54中任一项所述的abd融合蛋白,其中所述il-15包括根据图3中所描绘的氨基酸序列中的任一个的氨基酸序列。

59.根据权利要求47到58中任一项所述的abd融合蛋白,其中所述il-12是单链il-12,所述单链il-12包括p35亚基、p40亚基和il-12连接子,并且其中所述il-12连接子将所述p35亚基连接到所述p40亚基。

60.根据权利要求47到59中任一项所述的abd融合蛋白,其中所述第一连接子和第二连接子各自独立地选自图48中所描绘的连接子中的任一个。

61.根据权利要求60所述的abd融合蛋白,其中所述连接子是(ggggs)x,其中x是1-10的整数。

62.一种abd融合蛋白,其根据式(细胞因子)-l-(abd)包括白蛋白结合结构域(abd)、细胞因子和连接子(l),

其中所述abd包括可变重链和可变轻链,所述可变重链包括图2中所描绘的可变重链中的任一个的vhcdr1、vhcdr2和vhcdr3,所述可变轻链包括图2中所描绘的可变轻链中的任一个的vlcdr1、vlcdr2和vlcdr3,并且

其中所述细胞因子选自由以下组成的组:il-2、il-7、il-12、il-15、il-18、il-21、gm-csf以及ifn-α。

63.根据权利要求62所述的abd融合蛋白,其中所述vhcdr1包括根据图2中所描绘的所述vhcdr1、vhcdr2和vhcdr3序列中的任一个的vhcdr1序列,所述vhcdr2包括根据其中任一个的vhcdr2序列,并且所述vhcdr3包括根据其中任一个的vhcdr3序列。

64.根据权利要求63所述的abd融合蛋白,其中所述可变重链包括图2中所描绘的所述可变重链序列中的任一个的序列。

65.根据权利要求62到64中任一项所述的abd融合蛋白,其中

所述vlcdr1包括根据图2中所描绘的所述vlcdr1、vlcdr2和vhcdr3序列中的任一个的vlcdr1序列,所述vlcdr2包括根据其中任一个的vlcdr2序列,并且所述vlcdr3包括根据其中任一个的vlcdr3序列。

66.根据权利要求65所述的abd融合蛋白,其中所述可变轻链包括图2中所描绘的所述可变轻链序列中的任一个的序列。

67.根据权利要求62到66中任一项所述的abd融合蛋白,其中所述连接子是选自图48中所描绘的连接子中的任一个。

68.根据权利要求67所述的abd融合蛋白,其中所述连接子是(ggggs)x,其中x是1-10的整数。

69.一种根据以下式的abd融合蛋白:(fp1)-l1-(abd)-l2-(fp2),

其中abd是包括可变重链和可变轻链的白蛋白结合结构域;

其中fp1和fp2分别是第一融合蛋白和第二融合蛋白;

其中l1和l2分别是第一连接子和第二连接子;

其中所述abd的所述可变重链包括图2中所描绘的可变重链中的任一个的vhcdr1、vhcdr2和vhcdr3;并且

其中所述abd的所述可变轻链包括图2中所描绘的可变轻链中的任一个的vlcdr1、vlcdr2和vlcdr3。

70.根据权利要求69所述的abd融合蛋白,其中所述vhcdr1包括根据图2中所描绘的所述vhcdr1、vhcdr2和vhcdr3序列中的任一个的vhcdr1序列,所述vhcdr2包括根据其中任一个的vhcdr2序列,并且所述vhcdr3包括根据其中任一个的vhcdr3序列。

71.根据权利要求70所述的abd融合蛋白,其中所述可变重链包括图2中所描绘的所述可变重链序列中的任一个的序列。

72.根据权利要求69到71中任一项所述的abd融合蛋白,其中所述vlcdr1包括根据图2中所描绘的所述vlcdr1、vlcdr2和vhcdr3序列中的任一个的vlcdr1序列,所述vlcdr2包括根据其中任一个的vlcdr2序列,并且所述vlcdr3包括根据其中任一个的vlcdr3序列。

73.根据权利要求72所述的abd融合蛋白,其中所述可变轻链包括图2中所描绘的所述可变轻链序列中的任一个的序列。

74.根据权利要求69所述的abd融合蛋白,其中所述可变重链和所述可变轻链分别包括a10m3的可变重链和可变轻链(图2d)。

75.根据权利要求69所述的abd融合蛋白,其中fp1和fp2分别是第一细胞因子和第二细胞因子。

76.根据权利要求69所述的abd融合蛋白,其中所述第一细胞因子和所述第二细胞因子选自由以下组成的组:

il-2和il-12;il-7和il-15;il-15和il-12;il-18和gm-csf;il-21和il-15;gm-csf和il-12;gm-csf和il-21;以及ifn-α和il-15。

77.根据权利要求69所述的abd融合蛋白,其中fp1和fp2分别是第一结合部分和第二结合部分。

78.根据权利要求77所述的abd融合蛋白,其中所述第一结合部分和所述第二结合部分各自是scfv。

79.根据权利要求77所述的abd融合蛋白,其中所述第一结合部分和所述第二结合部分选自由以下组成的组:tnfscfv和il-1scfv;tnfscfv和il-6scfv;tnfscfv和il-8scfv;tnfscfv和il-17(同种型a-f)scfv;tnfscfv和il-23scfv;第一tnfscfv和第二tnfscfv;抗pd-l1scfv和il-12;抗pd-l1scfv和il-15;抗pd-l1scfv和抗tgfβscfv;第一抗pd-l1scfv和第二pd-l1scfv;抗tgfβscfv和il-12;抗tgfβscfv和il-15;抗tgfβscfv和pd-l1scfv;以及第一抗tgfβscfv和第二抗tgfβscfv。

80.根据权利要求69到79中任一项所述的abd融合蛋白,其中所述第一连接子和第二连接子各自独立地选自图48中所描绘的连接子中的任一个。

81.根据权利要求80所述的abd融合蛋白,其中所述第一连接子和第二连接子各自独立地是(ggggs)x,其中x是1-10的整数。

82.一种白蛋白结合结构域(abd)融合蛋白,其包括tgfβ结合结构域和白蛋白结合结构域,

其中所述白蛋白结合结构域包括具有图2中可变重链和可变轻链中的任一个的氨基酸序列的abd可变重链和abd可变轻链。

83.根据权利要求82所述的abd融合蛋白,其中所述abd可变重链和所述abd可变轻链分别包括a10m3的可变重链和可变轻链的氨基酸序列(图2d)。

84.根据权利要求82所述的abd融合蛋白,其中所述tgfβ结合结构域是包括4d9的可变重链和可变轻链的scfv(图40b)。

85.根据权利要求82到84中任一项所述的abd融合蛋白,其中所述abd进一步包括il-12、il-15、pd-l1结合结构域或第二tgfβ结合结构域。

86.一种白蛋白结合结构域(abd)融合蛋白,其包括pd-l1结合结构域和白蛋白结合结构域,

其中所述白蛋白结合结构域包括具有图2中可变重链和可变轻链中的任一个的氨基酸序列的abd可变重链和abd可变轻链。

87.根据权利要求86所述的abd融合蛋白,其中所述abd可变重链和所述abd可变轻链分别包括a10m3的可变重链和可变轻链的氨基酸序列(图2d)。

88.根据权利要求86所述的abd融合蛋白,其中所述pd-l1结合结构域是包括10d12的可变重链和可变轻链的scfv(图50)。

89.根据权利要求86到88中任一项所述的abd融合蛋白,其中所述abd进一步包括il-12、il-15、tgfβ结合结构域或第二pd-l1结合结构域。

90.一种核酸,其编码根据权利要求1到6中任一项所述的白蛋白结合结构域。

91.一种核酸,其编码根据权利要求6到9中任一项所述的变体il-15。

92.一种核酸,其编码根据权利要求10到89中任一项所述的abd融合蛋白。

93.一种宿主细胞,其包括根据权利要求90所述的核酸。

94.一种制备根据权利要求1到6中任一项所述的白蛋白结合结构域的方法,其包括在产生所述白蛋白结合结构域的条件下培养根据权利要求93所述的宿主细胞,和回收所述白蛋白结合结构域。

95.一种宿主细胞,其包括根据权利要求91所述的核酸。

96.一种制备根据权利要求6到9中任一项所述的变体il-15的方法,其包括在产生所述变体il-15的条件下培养根据权利要求95所述的宿主细胞,和回收变体il-15。

97.一种宿主细胞,其包括根据权利要求92所述的核酸。

98.一种制备根据权利要求10到89中任一项所述的abd融合蛋白的方法,其包括在产生所述abd融合蛋白的条件下培养根据权利要求97所述的宿主细胞,和回收所述abd融合蛋白。

99.一种抑制或减少有需要的受试者中的肿瘤的方法,所述方法包括向所述受试者施用根据权利要求10到89中任一项所述的abd融合蛋白。


技术总结
提供了包含白蛋白结合结构域和融合配偶体(例如,细胞因子或结合部分)的组合物。此类治疗剂已经增加了血清半衰期,并且在例如,肿瘤学应用等需要一种或多种此类治疗剂的应用中得到应用。

技术研发人员:J·K·塞尼;H·M·黄
受保护的技术使用者:索纳特生物疗法公司
技术研发日:2018.02.20
技术公布日:2019.11.15
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