专利名称：复合多聚酶链-酶联免疫反应检测对虾病毒的方法
技术领域：
本发明属于虾类病害检测技术领域，更具体涉及一种复合多聚酶链-酶联免疫反应检测对虾病毒的方法，适用于对虾白斑综合征病毒、桃拉综合症病毒和肝胰腺细小病毒病原的诊断。
背景技术：
对虾白斑综合征病毒(White Spot Syndrome Virus，WSSV)是90年代初引起东南亚对虾养殖暴发性死亡的主要病毒病原，能感染绝大多数对虾品种，致死率高达90-100％。主要症状为对虾体色发红，皮下、甲壳及附肢出现白色斑点。还能感染淡水和海水其它甲壳动物(张建红等1994；Takahashi et al.，1994；Lo et al.，1996；Wang et al.，1995；Corbel et al.，2001)。桃拉综合症病毒(Taura Syndrome Virus，TSV)于1992年首先在南美白对虾(Penaeusvannamei)体内发现，目前为我国南美白对虾养殖的主要病害。桃拉综合症病毒感染对虾仔虾、稚虾和幼虾，引起的累积死亡率在40-90％。发病对虾尾部和附肢发红、甲壳软化、表皮角质层出现黑色斑点等特征，病理症状表现为病虾鳃、附肢、体表、后肠胃等部位表皮角质层、皮下组织坏死，细胞核固缩化(Hasson etal.，1999)。对虾肝胰腺细小病毒(Hepatopancreatic parvovirus，HPV)最早在中国发现，但其传播范围很广，近年来，在亚洲、非洲、澳大利亚、南美洲和北美洲都有相关的报道。该病毒侵染的靶组织是对虾肝胰腺和中肠后段上皮细胞，被病毒感染的对虾生长变缓，并导致一定的累计死亡率(Bonami et al.，1995，肖连春等，1995)。这三种病原均被列为需向OIE申报的疾病。从目前的文献和专利查询结果知道，只有单一病毒或两种病毒复合多聚酶链反应检测技术的报道(Durand et al.，1996，Hasson et al.，1997，Lightner，1996，Lightner etal.，1993，Nadala Jr.& Loh，2000，Tsai et al.，2002)，没有关于对虾白斑综合征病毒、桃拉综合症病毒和肝胰腺细小病毒复合检测技术的有关报道。
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发明内容
本发明的目的在于提供了一种复合多聚酶链-酶联免疫反应检测对虾病毒的方法。以提取组织的总核酸粗制品为模板，通过生物素-链亲和素桥固定在96微孔板上的寡核苷酸作捕获探针，与经多聚酶链反应后标记的地高辛检测探针杂交，结合抗地高辛抗体和酶联免疫反应来达到检测病毒核酸的目的，该方法操作简便，灵敏度高，适合于对虾病毒病原的诊断以及亲虾、幼苗和成虾的健康状况监测。
为了达到以上目的，本发明采取以下技术方案(1)特异性寡核苷酸捕获探针和扩增引物的设计筛选。
根据对虾白斑综合征病毒、桃拉综合症病毒和肝胰腺细小病毒的全基因组序列，设计筛选病毒特异性的寡核苷酸探针和病毒核酸扩增引物(见序列表)。对虾白斑综合征病毒、桃拉综合症病毒和肝胰腺细小病毒末端标记生物素的捕获探针长度为15碱基对，序列分别与对虾白斑综合征病毒、桃拉综合症病毒和肝胰腺细小病毒的正链互补，定位于检测探针的中间。检测白斑综合征病毒、肝胰腺细小病毒、桃拉综合症病毒的扩增产物探针长度分别为331碱基对、194碱基对和236碱基对。所有引物根据对虾白斑综合征病毒、桃拉综合症病毒和肝胰腺细小病毒特有基因组序列设计，由专业生物公司合成。
(2)逆转录体系以提取组织总核酸为模板，取2μg的总核酸粗制品，加入1μg的桃拉综合症病毒下游引物TTTTCGATGCAGATGGGTAAC，70℃温浴5min，立即冰浴5min后依次加入5μl的反转录缓冲液、5μldNTP(10mM)、25单位RNA酶抑制剂和200单位反转录酶，补充焦碳酸四乙酯处理的双蒸水至总体积为25μl，42℃温浴1h。
(3)复合多聚酶链反应标记反应体系的建立。
白斑综合征病毒、肝胰腺细小病毒的DNA和经反转录的桃拉综合症病毒核酸在扩增过程中标记上地高辛。整个标记扩增体系在50μl反应体系内进行，含有2μl的逆转录产物作模板，一倍的多聚酶链反应缓冲液，一倍的地高辛标记dNTP混合物，按1∶2∶2的比例混合对虾白斑综合征病毒、桃拉综合症病毒和肝胰腺细小病毒特异性的扩增引物(30pmol的白斑综合征病毒上下游扩增引物TGATTTGTTGTGCCCTTTTG，ACGTAGGGTCGATGTTGGTG、60pmol的肝胰腺细小病毒上下游扩增引物ACACAGCAATATGATCAAGAGAAA，GCACTGGCCATCGTATCTT和60pmol的桃拉综合症病毒上下游扩增引物TCGCTGCATGAGAAGGGTTAT，TTTTCGATGCAGATGGGTAAC)，2单位的Taq酶。反应循环为94℃ 30s、53℃ 30s，72℃1min，共进行30个循环。最后72℃延伸10min。
(4)杂交检测体系的建立。
杂交体系选择的缓冲液为5x SSC，5x Denhardt，0.1％月桂酰肌氨酸钠，0.02％十二烷基硫酸钠。根据寡核苷酸探针和杂交链的特性筛选25℃作为杂交温度。酶联免疫反应检测体系选择磷酸缓冲液。
本发明与现有技术相比有以下优点在同一体系内能同时检测对虾白斑综合征病毒、桃拉综合症病毒和肝胰腺细小病毒；工艺简便，操作方便，灵敏度高，能检测出少于0.01pg的病毒核酸。适合多种病毒的病原诊断以及亲虾、幼苗和成虾的健康状况监测。
具体实施例方式
具体步骤如下(1)特异性寡核苷酸探针和扩增引物的设计和筛选根据病毒基因组序列设计，对虾白斑综合征病毒、桃拉综合症病毒和肝胰腺细小病毒末端标记生物素的捕获探针序列为生物素-ACTGTCACTGTTGCT；生物素-AGTTAGAACGGATAG；生物素-AGCAAGGTAGAGCTG，扩增白斑综合征病毒的上下游引物序列为TGATTTGTTGTGCCCTTTTGACGTAGGGTCGATGTTGGTG；扩增肝胰腺细小病毒的上下游序列为ACACAGCAATATGATCAAGAGAAA，GCACTGGCCATCGTATCTT；扩增桃拉综合症病毒的上下游引物序列为TCGCTGCATGAGAAGGGTTAT，TTTTCGATGCAGATGGGTAAC。检测白斑综合征病毒、肝胰腺细小病毒、桃拉综合症病毒的扩增产物探针长度分别为331碱基对、194碱基对和236碱基对(序列表)。所有引物由专业生物技术公司合成。
(2)组织总核酸提取总核酸提取方法取感染白斑综合征病毒，肝胰腺细小病毒和桃拉综合症病毒的组织(鳃和肝胰腺)15-20mg，幼苗则取去眼球的个体，匀浆后加裂解液600μl(100mM氯化钠，10mM乙二胺四乙酸，50mMTris碱，0.5％十二烷基硫酸钠)和15μl蛋白酶K(20mg/μl)，55℃温浴1h，间隔10min摇动一次，冰浴3-5min后以12000g离心10min，取上清加0.5-1倍体积预冷的异丙醇，-20℃放置30rmin后以12000g离心15min，70％乙醇洗涤沉淀，干燥后以焦碳酸四乙酯处理的双蒸水重悬沉淀。所得即为含有对虾白斑综合征病毒、桃拉综合症病毒和肝胰腺细小病毒核酸(DNA和RNA)的粗制品。
(3)复合多聚酶链反应标记地高辛取对虾病毒的总核酸粗制品，加入1μl的桃拉综合症病毒下游引物TTTTCGATGCAGATGGGTAAC，70℃温浴5min，立即冰浴5min后依次加入5μl的反转录缓冲液、5μl dNTP(10mM、25单位RNA酶抑制剂和200单位反转录酶，补充焦碳酸四乙酯处理的双蒸水至总体积为25μl，42℃温浴1h，产物可以不作任何处理直接用作多聚酶链反应扩增的模板。白斑综合征病毒、肝胰腺细小病毒的DNA和经反转录的桃拉综合症病毒即为对虾病毒核酸在扩增过程中标记上地高辛。整个标记扩增体系在50μl反应体系内进行，含有2μl的反转录产物作模板，一倍的多聚酶链反应缓冲液，一倍的地高辛标记dNTP混合物，对虾白斑综合征病毒、桃拉综合症病毒和肝胰腺细小病毒特异性的扩增引物混合物(30pmol的白斑综合征病毒上下游扩增引物(TGATTTGTTGTGCCCTTTTG，ACGTAGGGTCGATGTTGGTG)，60pmol的肝胰腺细小病毒上下游扩增引物(ACACAGCAATATGATCAAGAGAAA，GCACTGGCCATCGTATCTT)和60pmol的桃拉综合症病毒上下游扩增引物(TCGCTGCATGAGAAGGGTTAT，TTTTCGATGCAGATGGGTAAC)，2单位的Taq酶。反应循环为94℃ 30S、53℃30S，72℃1min，共进行30个循环。最后72℃延伸10min。
(4)寡核苷酸探针的固相化固相杂交反应用包被好链亲和素的96孔微孔反应板，末端标记上生物素的捕获探针经生物素—链亲和素桥锚定在微孔板上。将对对虾白斑综合征病毒、桃拉综合症病毒和肝胰腺细小病毒核酸的捕获探针以含0.1％牛血清白蛋白的磷酸缓冲液(pH7.4)稀释(终浓度为10pmol/ml)，以100μl每孔加到反应孔中，22-25℃温浴30-60min，以含0.1％牛血清白蛋白的磷酸缓冲液(pH7.4)250μl浸泡洗板5次，每次维持1min。包被好捕获探针的96孔微孔反应板在4℃保存备用。
(5)固相杂交取扩增产物10μl热变性10min，立即冰浴3-5min，加至结合有特异性寡核苷酸捕获探针的微孔反应板中，并加杂交缓冲液(5x SSC，5xDenhardt，0.1％月桂酰肌氨酸钠，0.02％十二烷基硫酸钠)至100μl，充分混匀后于25℃温浴1-2h。，用含0.1％吐温-20的磷酸缓冲液250μl洗板5次，每次1min，以无纤维的吸水纸吸干。
(6)酶联显色杂交后，以含0.1％牛血清白蛋白的磷酸缓冲液(pH7.4)稀释(1∶5000)耦连有碱性磷酸酶的抗地高辛抗体，100μl加至各反应孔中。37℃温浴30-60min后以含0.1％吐温-20的磷酸缓冲液250μl洗板5次，每次1min。以对硝基苯磷酸酯(p-nitrophenyl phosphate，p-NPP)作为底物，以Tris盐酸缓冲液(pH9.6)稀释至1mg/ml，100μl加至各反应孔中，避光显色30-60min，以40μl氢氧化钠(2M)终止反应。以肉眼观察作定性判断或以酶标仪读取405nm吸光度(A405nm值)作半定量判断。
(7)结果判定肉眼观察，显色黄色为阳性；或以标本/阴性对照比值这种判断法作为阳性判断标准，在得出标本(S)和阴性对照(N)的A405nm值后，计算S/N值，大于1.0作为阳性。
序列表<110>中国科学院武汉病毒研究所<120>复合多聚酶链-酶联免疫反应检测对虾病毒的方法<160>12<170>PatentIn 3.1<210>1<211>331<212>DNA<213>白斑综合征病毒(White spot syndrome virus)<400>1tgatttgttg tgcccttttg caaggcatag gattgtacat ttcttataaa aaataaaaca 60atatataaaa ttcagttgta tttttattgc tcaaataagt tactacaccc aattctcccc 120cctctctagt gagagatccc aatcactttc tactgtcact gttgctgctg tttgttgttc 180ctcttcttcc tcctcttctt cctcttcatc ttcatcttct ttagttcgtt cttcattata 240tgctttaatt atcctcaata catttaaaat ggtgcgctct tctcggttaa acttctgatt 300ctttccctca ccaccaacat cgaccctacg t 331<210>2<211>236<212>DNA<213>桃拉综合症病毒(Taura syndrome virus)<400>1tcgctgcatg agaagggtta tttcttaatg ttctgcgatg tcattaagat agcgtgtagg 60aacgcagggt acaaggaagc atgtttacat gagttggatt gtaagagctt ccttttggcc 120cagcaaggta gagctggagc tcatgatagt gagttcctaa gtcagctatt ggacttaaac 180taatagcacc acccgatcgt aaactccatg tattggttac ccatctgcat cgaaaa 236<210>3<211>194<212>DNA<213>肝胰腺细小病毒(Hepatopancreatic parvovirus)<400>1acacagcaat atgatcaaga gaaaactcca gcagtcaaaa gagctctaga actaactcaa 60gaagaagaac agttagaacg gatagaaaac gctaagaaat atattgagga agttatagag 120gagacaaaca gagaatttga aagtgaagta agacaagaga caagtgcgga ggcggaagat 180acgatggcca gtgc194<210>4<211>20<212>DNA<213>白斑综合征病毒(White spot syndrome virus)<400>1tgatttgttg tgcccttttg 20<210>5<211>20<212>DNA<213>白斑综合征病毒(White spot syndrome virus)<400>1acgtagggtc gatgttggtg 20<210>6<211>21<212>DNA<213>桃拉综合症病毒(Taura syndrome virus)<400>1tcgctgcatg agaagggtta t 21<210>7<21l>21<212>DNA<213>桃拉综合症病毒(Taura syndrome virus)<400>1ttttcgatgc agatgggtaa c 21<210>8<211>24<212>DNA<213>肝胰腺细小病毒(Hepatopancreatic parvovirus)<400>1acacagcaat atgatcaaga gaaa 24<210>9<211>19<212>DNA<213>肝胰腺细小病毒(Hepatopancreatic parvovirus)<400>1gcactggcca tcgtatctt 19<210>10<211>15<212>DNA<213>白斑综合征病毒(White spot syndrome virus)<400>1actgtcactg ttgct15<210>11<211>15<212>DNA<213>桃拉综合症病毒(Taura syndrome virus)<400>1agcaaggtag agctg15<210>12<211>15<212>DNA<213>肝胰腺细小病毒(Hepatopancreatic parvovirus)<400>1agttagaacg gatag 1权利要求
1.一种复合多聚酶链-酶联免疫反应检测对虾病毒的方法，包括下列步骤(1)特异性寡核苷酸探针和扩增引物的设计和筛选根据病毒基因组序列设计，对虾白斑综合征病毒、桃拉综合症病毒和肝胰腺细小病毒末端标记生物素的捕获探针序列为生物素-ACTGTCACTGTTGCT；生物素-AGTTAGAACGGATAG；生物素-AGCAAGGTAGAGCTG，扩增白斑综合征病毒的上下游引物序列为TGATTTGTTGTGCCCTTTTG，ACGTAGGGTCGATGTTGGTG；扩增肝胰腺细小病毒的上下游序列为ACACAGCAATATGATCAAGAGAAA，GCACTGGCCATCGTATCTT；扩增桃拉综合症病毒的上下游引物序列为TCGCTGCATGAGAAGGGTTAT，TTTTCGATGCAGATGGGTAAC；(2)组织总核酸提取取感染对虾组织，匀浆后加裂解液和蛋白酶K，55℃温浴1h，间隔10min摇动一次，冰浴3-5min后以12000g离心10min，取上清加预冷的异丙醇，-20℃放置30min后以12000g离心15min，70％乙醇洗涤沉淀，干燥后以焦碳酸四乙酯处理的双蒸水重悬沉淀；(3)复合多聚酶链反应标记地高辛取对虾病毒总核酸粗制品，加入桃拉综合症病毒下游引物TTTTCGATGCAGATGGGTAAC，70℃温浴5min，冰浴5min后依次加入反转录缓冲液、dNTP、RNA酶抑制剂和反转录酶，补充焦碳酸四乙酯处理的双蒸水至总体积为25μl，42℃温浴1h，对虾病毒核酸在扩增过程中标记上地高辛，整个标记扩增体系在50μl反应体系内进行，含有反转录产物作模板，一倍的多聚酶链反应缓冲液，一倍的地高辛标记dNTP混合物，对虾病毒特异性的扩增引物混合物和Taq酶，反应循环为94℃ 30S、53℃ 30S，72℃1min，共进行30个循环，最后72℃延伸10min；(4)寡核苷酸探针的固相化固相杂交反应用包被好链亲和素的96孔微孔反应板，末端标记上生物素的捕获探针经生物素-链亲和素桥锚定在微孔板上，对虾病毒的捕获探针以含牛血清白蛋白的磷酸缓冲液稀释，22-25℃温浴30-60min，以含牛血清白蛋白的磷酸缓冲液浸泡洗板，4℃保存备用；(5)固相杂交取扩增产物热变性10min，冰浴3-5min，加至结合有特异性寡核苷酸捕获探针的微孔反应板中，并加杂交缓冲液，混匀后于25℃温浴1-2h，用含吐温-20的磷酸缓冲液洗板；(6)酶联显色杂交后，以牛血清白蛋白的磷酸缓冲液稀释耦连有碱性磷酸酶的抗地高辛抗体，加至各反应孔中，37℃温浴30-60min后以含吐温-20的磷酸缓冲液洗板，以对硝基苯磷酸酯作为底物，以Tris盐酸缓冲液稀释，避光显色30-60min，以氢氧化钠终止反应；(7)结果判定肉眼观察，显色黄色为阳性。
全文摘要
本发明公开了一种复合多聚酶链－酶联免疫反应检测对虾病毒的方法。其步骤首先是捕获探针和扩增引物的设计与合成；其次是组织总核酸提取；三是复合多聚酶链反应标记地高辛；四是固相杂交；五是酶联显色。本发明具有高度的特异性和灵敏性，操作简单，可批量检测样品，适合于对虾白斑综合征病毒、桃拉综合症病毒和肝胰腺细小病毒的诊断以及亲虾、幼苗和成虾的健康状态监测。
文档编号G01N33/53GK1484029SQ0312520
公开日2004年3月24日 申请日期2003年7月30日 优先权日2003年7月30日
发明者石正丽, 袁军法 申请人:中国科学院武汉病毒研究所