一种选择性富集和鉴定N-连接糖肽的方法与流程

文档序号:12174279阅读:来源:国知局

技术特征:

1.一种选择性富集和鉴定N-连接糖肽的方法,其特征在于:首先,取生物样品,用胰蛋白酶Trypsin酶解,并用甲醛封闭肽段的末端氨基和侧链氨基,然后用高碘酸钠溶液氧化糖肽上的糖链生成醛基,之后利用氨基微球富集氧化后的糖肽并用肽糖苷酶PNGase F处理,最后对释放的N-糖肽进行质谱分析,以得到样品中的N-糖基化位点,N-糖肽,及对应的糖蛋白信息。

2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于:具体包含以下步骤,

1)取生物样品,溶解在含6-8M Urea和50-100mM TEAB的缓冲溶液中,加入终浓度为10-20mM DTT,37-60℃水浴中1-2h,然后加入终浓度为20-40mM IAA,20-25℃避光反应40-60min;生物样品在缓冲溶液的浓度为1-10mg/mL;

2)步骤1)结束后得到的样品,用含50-100mM TEAB的水溶液按将Urea浓度稀释至0.5-1M的比例稀释,然后加入与全蛋白质量比为1/50-1/25的胰蛋白酶Trypsin,37℃水浴中酶解12-16h,得到肽段溶液;

3)向步骤2)结束后得到的肽段溶液依次加入与肽段质量比为1/100-1/200的4-8wt%CH2O/H2O和与肽段质量比为5/1-10/1的新鲜配制的0.6-1.2M NaBH3CN水溶液,25℃反应1-2h;

4)向步骤3)得到的肽段溶液中加入与体系总体积的体积比为1/50-1/100的8-16wt%氨水,再加入甲酸调pH至2-3,然后用C18固相萃取柱除去溶液中的小分子,将得到的肽段洗脱液冷冻干燥;

5)将步骤4)得到的肽段溶解在含10-15mM高碘酸钠(氧化剂)、80-100mM NaAC和130-150mM NaCl的缓冲溶液中,使肽段在溶液中的浓度为0.5-1mg/mL;20-25℃避光氧化1-1.5h;然后加入Na2S2O3以终止氧化,使Na2S2O3在体系中的终浓度为20-30mM;20-25℃反应15-30min;

6)取氨基微球(SiO2@NH2),以含80-100mM NaAC和130-150mM NaCl的缓冲溶液洗离2-3次,然后加入步骤5)得到的肽段溶液中,加入的氨基微球自身体积与溶液的体积比为1:5-1:6,20-25℃震荡10-20min后,再加入NaBH3CN至NaBH3CN在体系中的终浓度为0.1-0.2M,然后置于20-25℃摇床内富集10-12h;

7)步骤6)得到的产物以14000-15000g离心3-5min,弃去上清液;得到的氨基微球依次以1.0-1.5M NaCl溶液、80-90%ACN/H2O(v/v)、50-100mM NH4HCO3溶液和水各洗离3-4次,以洗去非特异性吸附的肽段,并分散在10-20mM的TEAB缓冲溶液中,氨基微球自身所占体积与TEAB溶液的体积比为1:4-1:5,再加入与肽段质量比为500Unites/mg-1000Unites/mg的PNGase F,,然后置于37℃摇床内酶切10-12h;

8)步骤7)得到的混合液以14000-15000g离心3-5min,取上清,即得到富集的N-糖肽样品,然后直接以MALDI-TOF/TOF MS或LC-MS/MS分析,得到 样品中的N-糖基化位点、N-糖肽及对应的糖蛋白信息。

3.根据权利要求1或2所述的方法,其特征在于:步骤1)所述的含6-8M Urea和50-100mM TEAB的缓冲溶液的pH为7.5-8.0;步骤2)所述的含50-100mM TEAB的水溶液的pH为7.5-8.0;步骤7)所述的10-20mM TEAB溶液的pH为7.5-8.0。

4.根据权利要求1或2所述的方法,其特征在于:步骤5)所述的含10-15mM高碘酸钠、80-100mM NaAC和130-150mM NaCl的缓冲溶液的pH为5.3-5.5。

5.根据权利要求1或2所述的方法,其特征在于:步骤4)所述的用C18固相萃取柱除去溶液中的小分子,具体操作为:(1)0.1%TFA淋洗,洗去Urea、TEAB、CH2O、NaBH3CN和甲酸铵等小分子;(2)80%ACN,0.1%TFA/H2O(v/v)洗脱肽段,冷冻干燥后备用。

6.根据权利要求1所述的方法,其特征在于:该方法能同时获取相应的糖蛋白、糖肽和糖基化位点的鉴定结果,可以用于糖基化修饰的蛋白质组学分析。

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