一种基于三链连环DNA的电化学生物传感器及制备方法与流程

文档序号:15228640发布日期:2018-08-21 19:04阅读:229来源:国知局

本发明属于电化学生物传感检测技术领域,具体涉及一种基于三链连环dna的电化学生物传感器及制备方法。



背景技术:

微小rna(mirna)是一类小的内源性非编码rna,其大约由22-25个核苷酸组成,能够通过翻译抑制,mrna降解和蛋白质合成抑制等负调节基因表达。研究表明,mirna在多种生物过程中起着重要的调节作用,如过敏性疾病,造血分化,心血管疾病和癌症。此外,已经证明,mirna可被释放到体液内的循环中,可以以非常稳定的形式在血清或血浆中检测到。mirna-21在宫颈癌,结肠癌,非小细胞肺癌,化脓性汗腺炎和卵巢癌中显着上调,因此开发一种简单可靠,灵敏检测mirna的方法对临床癌症的诊断,治疗和预后非常有意义。

基于mirna在疾病诊断和预后中的重要性,迫切需要找到灵敏可靠的检测mirna的方法。为了实现对mirna高灵敏检测,许多课题组已经做了大量的工作,包括基于微阵列的技术,荧光,northern印迹和定量逆转录聚合酶链式反应(rtpcr)等。尽管这些方法实现了对mirna准确可靠的检测,但这些方法也有一定的缺陷,如重复性差,耗时,成本高且需要专业实验技能。电化学传感器因为其检测限低,特异性强,便携等特点,被广泛应用于各种生物标志物的检测,如用电化学传感器检测三磷酸腺苷,mirna,双链dna和肿瘤外泌体。

众所周知,ph在调节生命活动和许多生物进程(如细胞凋亡,酶催化和肿瘤生长)中起着至关重要的作用。由于这些原因,开发ph敏感的传感器或纳米材料对于疾病诊断,预后和药物释放尤为重要。三链连环dna是基于watson-crick和hoogsteen碱基对形成的,除正常的嘌呤和嘧啶配对外,还包含碱基三联体c-g•c+和t-a•t。第三链中胞嘧啶n3的质子化需要酸环境,而t-a•t结构需要中性条件。当三联体dna片段等量分布于tat和cgc时,微酸性ph值是形成三链连环dna的最佳条件。



技术实现要素:

本发明的目的是提供一种基于三链连环dna的超灵敏检测mirna的电化学生物传感器及制备方法和应用。

为实现上述目的,采用以下技术方案:

一种基于三链连环dna的超灵敏检测mirna的电化学生物传感器的制备方法,包括以下步骤:

(1)将直径为2mm的金电极用al2o3抛光粉打磨,超纯水冲洗干净;

(2)取10µl、1µm的捕获探针固定液滴加到电极表面,加盖,室温孵育180min,缓冲液冲洗电极表面,n2吹干;

(3)取10µl、2mm的巯基己醇溶液滴加到步骤(2)所得电极表面,加盖,室温孵育90min,封闭电极表面的非特异性活性位点,缓冲液冲洗电极表面,n2吹干;

(4)取10µl含目标探针mirna-21的杂交缓冲液滴加在步骤(3)所得电极上,加盖,室温孵育60min,缓冲液冲洗电极表面,n2吹干;

(5)取10µl、1µm的连接探针缓冲液滴加到步骤(4)所得电极表面,加盖,室温孵育60min,缓冲液冲洗电极表面,n2吹干;

(6)取10µl各含2µm的内环探针与外环探针的杂交缓冲液滴加到步骤(5)所得电极表面,加盖,室温孵育60min,缓冲液冲洗电极表面,n2吹干;

(7)将含有50µm六氨合钌的电化学检测液通n2,15min;

(8)步骤(6)所得电极置于步骤(7)所得电化学检测液中,电化学工作站在-0.6~0.2电势范围内用差分脉冲伏安法扫描。

步骤(1)的具体方法为:将直径为2mm的金电极在新鲜配制的piranha溶液(浓h2so4:30%h2o2=3:1v:v)中浸泡20min,然后依次用1、0.3、0.5µm的al2o3抛光粉打磨,超纯水冲洗干净,然后分别在乙醇和超纯水中超声清洗5min,超纯水清洗,然后将电极置于0.5m的h2so4溶液中,在-0.35-1.6v电位下扫描,在0.95v出现一个尖锐的还原峰,在1.2~1.4v范围内出现三个小的,连续的氧化峰。

dna的预处理:将装有dna序列的ep管在离心机中5000rpm,离心5min,加入适量默克水,得到浓度为100µm的dna溶液,然后用含有500mmnacl,1mmedta的ph7.4的10mmtris-hcl稀释至10µm,实验过程所有用到的dna均按此进行预处理;

捕获探针固定液的制备:在9µl,含有500mmnacl,1mmedta,10mmtcep的ph7.4的10mmtris-hcl缓冲液中加入1µl,10µm的捕获探针,95℃加热5min,然后置于暗处2h内冷却至室温,使捕获探针形成发夹结构;

巯基己醇溶液的制备:取适量巯基己醇加至超纯水中,制成2mm的巯基己醇封闭剂,冰箱4℃保存,备用;

杂交缓冲液的制备:在9µl,含有500mmnacl,1mmedta,1mmmgcl2的ph7.410mmtris-hcl的缓冲液中加入1µl待测浓度的目标探针,混匀;

连接探针缓冲液的制备:在9µl,含有500mmnacl,1mmedta,1mmmgcl2的ph7.410mmtris-hcl的缓冲液中加入1µl,10µm的连接探针,混匀;

irp与orp杂交缓冲液的制备:分别取5µl,4µm的irp与orp制成2µm的缓冲液,然后95℃加热5min,置于暗处冷却至室温,形成三链连环dna连接的由许多小环组成的长核酸链;

电化学检测液的制备:ph7.4的10mmtris-hcl中含有50µm的六氨合钌,混匀,冰箱4℃保存,备用;

电化学工作站为chi660c,采用三电极系统,工作电极是金电极,对电极是铂丝电极,参比电极是银/氯化银电极;

冲洗电极所用缓冲液为ph7.410mm的tris-hcl缓冲液。

该传感器组装中由表1所示的cp、lp、irp、orp4条ssdna单链和一条rna单链通过自组装形成。

表1.该传感器所用dna和rna序列

所述的制备方法制备的一种基于三链连环dna的超灵敏检测mirna的电化学生物传感器,用于mirna-21的检测,步骤如下:

(1)使用电化学工作站以三电极体系进行测试,所准备电极为工作电极,铂电极为对电极,银/氯化银为参比电极,在8ml、10mm的ph5.0~9.0的tris-hcl缓冲液中进行测试;

(2)用差分脉冲伏安法对mirna-21进行检测,电压范围-0.6-0.2v,振幅为0.05v,脉冲宽度为0.05s,脉冲周期为0.5s。

本发明所用试剂均市售可得;

本发明适用于所有肿瘤细胞中mirna-21表达上调的检测。

本发明的有益成果:

(1)构建了基于三链连环dna的信号放大型超灵敏检测方法,产生强电化学信号,构建过程简单快速,无需标记且不需要任何酶参与。

(2)该生物传感器属于信号增强型传感器,整个过程不会有电化学信号产生,在最后一步,电活性物质与连环dna结合,产生强烈电信号,背景信号低,减少了假阳性的概率。

(3)该生物传感器具有高度的通用性,可延伸于检测其他类型的dna或rna生物标志物,具有广阔的应用前景。

附图说明

图1为本发明的构建流程示意图。

图2为传感器在不同ph环境中的dpv响应。

图3a为实施例1中不同浓度目标物的电流响应。

图3b为实施例1中不同浓度目标物的电流响应标准曲线图。

图4a为本方法检测6例卵巢癌患者和6例正常人血清样本中mirna-21的结果。

图4b为本方法检测6例卵巢癌患者和6例正常人血清样本的平均mirna-21量。

具体实施方式:

现将本发明通过具体实施方式进一步说明,但不限于此。

实施例1,基于三链连环dna的超灵敏电化学生物传感器用于测定溶液中不同浓度的目标物mirna-21,得到传感器的电流响应标准工作曲线。

(1)将直径为2mm的金电极用al2o3抛光粉打磨,超纯水冲洗干净;

(2)取10µl,1µm的捕获探针固定液滴加到电极表面,加盖,室温孵育180min,缓冲液冲洗电极表面,n2吹干;

(3)取10µl,2mm的巯基己醇溶液滴加到步骤(2)所得电极表面,加盖,室温孵育90min,封闭电极表面的非特异性活性位点,缓冲液冲洗电极表面,n2吹干;

(4)取10µl含不同浓度目标探针mirna-21(浓度分别为:0m、1fm、10fm、100fm、1pm、10pm、100pm、1nm、10nm)的杂交缓冲液滴加在步骤(3)所得电极上,加盖,室温孵育60min,缓冲液冲洗电极表面,n2吹干;

(5)取10µl,1µm的连接探针缓冲液滴加到步骤(4)所得电极表面,加盖,室温孵育60min,缓冲液冲洗电极表面,n2吹干;

(6)取10µl含有内环探针与外环探针各2µm的杂交缓冲液滴加到步骤(5)所得电极表面,加盖,室温孵育60min,缓冲液冲洗电极表面,n2吹干;

(7)将含有50µm六氨合钌的电化学检测液通n2,15min;

(8)步骤6所得电极置于步骤7所得电化学检测液中,电化学工作站在-0.6~0.2电势范围内用差分脉冲伏安法扫描。

(9)测定结果如图3a所示,在1fm-10nm范围内,随着目标物浓度的增大,电化学信号增强,电流响应值增大。图3b为本实施例的电流响应标准工作曲线。

步骤(1)的具体方法为:将直径为2mm的金电极在新鲜配制的piranha溶液(浓h2so4:30%h2o2=3:1v:v)中浸泡20min,然后依次用1、0.3、0.5µm的al2o3抛光粉打磨,超纯水冲洗干净,然后分别在乙醇和超纯水中超声清洗5min,超纯水清洗,然后将电极置于0.5m的h2so4溶液中,在-0.35-1.6v电位下扫描,在0.95v出现一个尖锐的还原峰,在1.2~1.4v范围内出现三个小的,连续的氧化峰。

dna的预处理:将装有dna序列的ep管在离心机中5000rpm,离心5min,加入适量默克水,得到浓度为100µm的dna溶液,然后用含有500mmnacl,1mmedta的ph7.4的10mmtris-hcl稀释至10µm,实验过程所有用到的dna和rna均按此进行预处理;

捕获探针cp固定液的制备:在9µl,含有500mmnacl,1mmedta,10mmtcep的ph7.4的10mmtris-hcl缓冲液中加入1µl,10µm的捕获探针,95℃加热5min,然后置于暗处2h内冷却至室温,使捕获探针形成发夹结构;

巯基己醇溶液的制备:取适量巯基己醇加至超纯水中,制成2mm的巯基己醇封闭剂,冰箱4℃保存,备用;

杂交缓冲液的制备:在9µl,含有500mmnacl,1mmedta,1mmmgcl2的ph7.410mmtris-hcl的缓冲液中加入1µl待测浓度的目标物mirna-21(tp),混匀;

连接探针lp缓冲液的制备:在9µl,含有500mmnacl,1mmedta,1mmmgcl2的ph7.410mmtris-hcl的缓冲液中加入1µl,10µm的连接探针,混匀;

irp与orp杂交缓冲液的制备:分别取5µl,4µm的irp与orp制成2µm的缓冲液,然后95℃加热5min,置于暗处冷却至室温,形成三链连环dna连接的由许多小环组成的长核酸链;

电化学检测液的制备:ph7.4的10mmtris-hcl中含有50µm的六氨合钌,混匀,冰箱4℃保存,备用;

电化学工作站为chi660c,采用三电极系统,工作电极是金电极,对电极是铂丝电极,参比电极是银/氯化银电极;

冲洗电极所用缓冲液为ph7.410mm的tris-hcl缓冲液。

该传感器组装中由表1所示的cp、lp、irp、orp4条ssdna单链和一条rna单链通过自组装形成。

表1.该传感器所用dna和rna序列

实施例2,基于三链连环dna的超灵敏电化学生物传感器应用于实际血清样品中的mirna-21含量检测

(1)按本发明所述制备方法构建电化学生物传感器,使用电化学工作站三电极体系进行测试,银/氯化银为参比电极,铂丝电极为对电极,所制备的传感器为工作电极,在8ml、10mm的ph6的电化学检测液(内含血清样品,血清样品与10mm电化学检测液体积比为1:1)中进行测试;

(2)用差分脉冲伏安法对上述电化学检测液进行检测,电势范围-0.6~0.2,振幅为0.05v,脉冲宽度为0.05s,脉冲周期为0.5s;

(3)测定结果如图4所示,患病者血清中mirna-21的表达明显高于正常人,卵巢癌患者中mirna-21的表达量约是正常人血清中mirna-21的2.2倍。

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<110>福州大学

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