生物样本分析测试系统的制作方法

文档序号:19152656发布日期:2019-11-16 00:16阅读:413来源:国知局

本发明涉及生物物质的分析方法,尤其是涉及生物样本例如血液样本的分析测试系统。



背景技术:

生物样本用于分析测试对象是否具有特定的性质,例如是否感染病毒或者是否具有诱发特定疾病的变异因子。测试对象在感染病毒或者具有变异因子时,其生物样本的检测结果为阳性,在没有感染病毒或者不具有变异因子时,其生物样本的检测结果为阴性。通常检测对象为阳性的几率是很小的,然而为了确定每个检测对象是否为阴性或者阳性,需要对所述检测对象的生物样品进行逐一检测,需要消耗大量的时间以及费用。

为了减小检测成本,一种方法是使用不同的比例将多个检测对象的进行合并,根据检测结果中特定性质信号强度确定各个检测对象的性质;然而,该方法需要大量的检测样本。为了减小检测次数以及减小检测样本数,三星生命公益财团在cn104569368a发明专利中提出一种生物样本分析系统和方法,其将检测对象划分为n×m矩阵,对于矩阵的每一行和每一列的样品分别合成一个样品池,根据矩阵的每一行和每一列的样品池的检测结果,确定矩阵中的疑似阳性样本,针对疑似阳性样本进行独立样本的追加检测,从而确定疑似阳性样本中的具体阳性样本中的数据。

cn104569368a发明专利通过合并样本进行检测能够减少检测次数,然而是对于每种样本需要准备三份,增加了样本的采样负担。同时,其在针对检测对象为阳性的几率很低的情况下能够减少检测次数,对于检测对象阳性几率较高时,其减少的检测次数不明显,还有可能需要增加检测次数。而在临床医疗实践中,通常医生针对患者具有临床症状时才会开出对应的检测项目,其检测结果为阳性的几率远大于在没有临床症状的普通人群中例如常规体检中的自然阳性的几率。因此,该发明的生物样本分析测试系统在临床使用中导致采样负担增加并且无法明显降低检测费用的结果,而现有技术中并没有解决该技术问题的方法。



技术实现要素:

本发明的目的在于提供一种生物样本分析测试系统,其能够解决现有技术的上述问题,从而降低采样负担以及检测费用。

本发明提供一种生物样本分析测试系统,包括:检测对象信息输入部,用于输入检测对象信息;采样部,其根据检测对象信息中反应检测对象阳性比例高低的属性确定生物样本的采样数量;检测部,其用于对单个生物样本或者多个生物样本合并的样品池进行单一检测项目的检测;控制部,其根据检测对象信息中反应检测对象阳性比例高低的属性确定检测部检测单个检测对象的生物样本还是多个生物样本合并的样品池。

优选的,所述检测对象信息输入部通过读取条码获得检测对象信息。

优选的,所述条码为二维码或者条形码。

优选的,所述检测对象信息中反应检测对象阳性比例高低的属性为检测对象的检测类型。

优选的,所述检测类型为体检或者门诊检测。

优选的,所述采样部对于检测对象的检测类型为体检时,对于检测对象生物样本的采样数量为两份;对于检测对象的检测类型为门诊时,对于检测对象生物样本的采样数量为一份。

优选的,所述控制部在检测样本的类型为门诊时,控制检测部对于单个检测对象的生物样本进行检测;在检测样本的类型为体检时,控制检测部对于多个检测对象的生物样本进行合并检测。

优选的,所述生物样本的检测值为等位基因的等位基因频率。

优选的,所述控制部对于多个检测对象的生物样本进行合并检测时,进行如下操作:将多个不同检测对象的生物样本划分成m×n的矩阵;从i等于1开始,(1)判断i是否小于m-1,如果是则将m×n的矩阵的第i行的样品合并到样品池,使用检测部进行检测,进入步骤(1.1);如果否则进入步骤(2);(1.1)如果其测量值为阴性,则回到步骤(1)中进行第i+1行的检测;(1.2)如果其测量值为阳性,则从第1列开始到第n列,将第i行的第j列的1份样本与第i+1行的第j列的两份样本合并到样品池,使用检测部检测合并后的样品池,从而确定第i行以及第i+1行中每个检测对象的生物样本的检测值;回到步骤(1)中进行第i+2行的检测;(2)如果i等于m-1,则进入步骤(2.1);如果i等于m则进入步骤(2.2);(2.1)将从第1列开始到第n列,将第m-1行的第j列的1份样本与第m行的第j列的两份样本合并到样品池,使用检测部检测合并后的样品池,从而确定第m-1行以及第m行中每个检测对象的生物样本的检测值;结束检测;(2.2)如果i等于m,则从第1列到第int(n/2)列,将m行的第j列的一份样本与m行的第2j列的两份样本合并到样品池,使用检测部检测合并后的样品池,从而确定第m行中每个检测对象的生物样本的检测值;结束检测。

具体实施方式

为了更清楚地说明本发明的技术方案,下面将使用实施例对本发明进行简单地介绍,显而易见地,下面描述中的仅仅是本发明的一个实施例,对于本领域普通技术人员来讲,在不付出创造性劳动性的前提下,还可以根据这些实施例获取其他的技术方案,也属于本发明的公开范围。

本发明实施例的生物样本分析测试系统,通过生物样本例如血液样本的检测,分析测试对象是否具有特定的性质,其检测项目可以是例如特定疾病指标、特定的单核苷酸多态性、特定基因型,包括:检测对象信息输入部,采样部,检测部以及控制部。

检测对象信息输入部,用于输入检测对象信息,检测对象信息中包括检测对象类型为门诊或者体检,检测对象信息还可以其他信息,例如包括检测对象的性别,年龄,体重等。检测对象信息输入部可以读取条码例如条形码或者二维码获得检测对象信息。

采样部,其根据检测对象信息中反应检测对象阳性比例高低的属性确定生物样本的采样数量。具体的,采样部对于检测对象的检测类型为体检时,对于检测对象生物样本的采样数量为两份;对于检测对象的检测类型为门诊时,对于检测对象生物样本的采样数量为一份。

检测部,其用于对单个生物样本或者多个生物样本合并的样品池进行单一检测项目的检测。检测部可以例如使用ngs技术检测生物样本的等位基因频率。控制部,其根据检测对象信息中反应检测对象阳性比例高低的属性确定检测部检测单个检测对象的生物样本还是多个生物样本合并的样品池。具体的,所述控制部在检测样本的类型为门诊时,控制检测部对于单个检测对象的生物样本进行逐一检测;在检测样本的类型为体检时,控制检测部对于多个检测对象的生物样本进行合并检测。其中,控制部对于多个检测对象的生物样本进行合并检测时,进行如下操作:将多个不同检测对象的生物样本划分成m×n的矩阵;从i等于1开始,(1)判断i是否小于m-1,如果是则将m×n的矩阵的第i行的样品合并到样品池,使用检测部进行检测,进入步骤(1.1);如果否则进入步骤(2);(1.1)如果其测量值为阴性,则回到步骤(1)中进行第i+1行的检测;(1.2)如果其测量值为阳性,则从第1列开始到第n列,将第i行的第j列的1份样本与第i+1行的第j列的两份样本合并到样品池,使用检测部检测合并后的样品池,从而确定第i行以及第i+1行中每个检测对象的生物样本的检测值;回到步骤(1)中进行第i+2行的检测;(2)如果i等于m-1,则进入步骤(2.1);如果i等于m则进入步骤(2.2);(2.1)将从第1列开始到第n列,将第m-1行的第j列的1份样本与第m行的第j列的两份样本合并到样品池,使用检测部检测合并后的样品池,从而确定第m-1行以及第m行中每个检测对象的生物样本的检测值;结束检测;(2.2)如果i等于m,则从第1列到第int(n/2)列,将m行的第j列的一份样本与m行的第2j列的两份样本合并到样品池,使用检测部检测合并后的样品池,从而确定第m行中每个检测对象的生物样本的检测值;结束检测。

通过以上的实施方式的描述可知,本领域的技术人员可以清楚地了解到本发明可借助软件加必需的通用硬件平台的方式来实现。基于这样的理解,本发明的技术方案本质上或者说对现有技术做出贡献的部分可以以软件产品的形式体现出来,该计算机软件产品可以存储在存储介质中,如rom/ram、磁碟、光盘等,包括若干指令用以使得一台计算机设备(可以是个人计算机,服务器,或者网络设备等)执行本发明各个实施例或者实施例的某些部分所述的方法。

在本发明提及的所有文献都在本申请中引用参考,就如同每一篇文献被单独引用作为参考那样。此外应理解,在阅读了本发明的上述公开内容之后,本发明的保护范围并不仅局限于上述实施例,本领域技术人员可以对本发明作各种改动或修改,在不脱离本发明原理前提下,这些等价形式同样落于本申请所附权利要求书所限定的范围。

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