为对人和/或动物无害的细菌。
[0059] 在可测试的细菌中，可以提及例如双歧杆菌（Bifidobacterium)属的细菌，尤 其是动物双歧杆菌（Bifidobacterium animalis)、两歧双歧杆菌（Bifidobacterium bifidum)、婴儿双歧杆菌（Bifidobacterium infantis)、乳双歧杆菌（Bifidobacterium lactis)、长双歧杆菌（Bifidobacterium longum)、和短双歧杆菌（Bifidobacterium breve)种；乳杆菌（Lactobacillus)属的细菌，尤其是罗伊氏乳杆菌（Lactobacillus reuteri)、嗜酸乳杆菌（Lactobacillus acidophilus)、保加利亚乳杆菌（Lactobacillus bulgaricus)、短乳杆菌（Lactobacillus brevis)、干酪乳杆菌（Lactobacillus casei)、 瑞士乳杆菌（Lactobacillus helveticus)、约氏乳杆菌（Lactobacillus johnsonii)、植 物乳杆菌（Lactobacillus plantarum)、副干酷乳杆菌（Lactobacillus paracasei)、鼠李 糖乳杆菌（Lactobacillus rhamnosus)和唾液乳杆菌（Lactobacillus salivarius)种； 魏斯氏菌属（Weisella)的细菌，尤其是食窦魏斯氏菌（Weisella cibaria)、泡菜魏斯氏菌 (Weisella kimchii)、泰国魏斯氏菌（Weisella thailandensis)种；芽抱杆菌（Bacillus) 属的细菌，尤其是枯草芽孢杆菌（Bacillus subtilis)、凝结芽孢杆菌（Bacillus coagulans)、解淀粉芽抱杆菌（Bacillus amyloliquefaciens)、地衣芽抱杆菌（Bacillus licheniformis)、錯状芽抱杆菌（Bacillus cereus)和克劳氏芽抱杆菌（Bacillus clausii)种；乳球菌（Lactococcus)属的细菌，尤其是乳酸乳球菌（Lactococcuslactis) 种；肠球菌（Enterococcus)属的细菌，尤其是屎肠球菌（Enterococcus faecium)、类肠球 菌（Enterococcus fecalis)种；链球菌（Streptococcus)属的细菌，尤其是嗜热链球菌 (Streptococcus thermophilus)种；埃希氏杆菌（Escherichia)属的细菌，尤其是大肠杆 菌（Escherichia coli)种。
[0060] CFTR和/或NHE3的表达
[0061] 根据本发明的方法包含测量测试菌株对至少一种涉及结肠中水分吸收或分泌的 转运体的表达，尤其是对CFTR蛋白和/或NHE3蛋白的表达的影响。
[0062] 如在此所用，"CFTR蛋白"是指在人物种中由基因CFTR( 即"囊性纤维化跨膜转导 调节因子"）编码的蛋白质，该基因位于7号染色体长臂的q31. 2区中的位点7931. 2。CFTR 基因在物种中高度保守。在人中，该CFTR蛋白具有例如长度为1480个氨基酸的多肽序列， 其 GenBank 登录号为 NP_00483。
[0063] CFTR蛋白形成上皮细胞的氯离子及硫氰酸根离子可渗透通过的通道。
[0064] CFTR蛋白在胰腺和胆管、肠隐窝、气管-支气管树、肾小管、生殖系统、和汗腺中的 上皮细胞的顶极表达。
[0065] 现已表明，CFTR的抑制剂，例如噻唑烷酮被发现可用于治疗和/或预防腹泻 (Verkman 等，Curr. Pharm. Des.，2006, 12:2235-2247) 〇
[0066] 因此，在根据本发明的选择方法中，引起CFTR蛋白表达减少的测试菌株可用于治 疗和/或预防腹泻。
[0067] 如在此所用，"NHE3蛋白"是指在人物种中由NHE3基因（即"钠-氢交换体3"， 也称为SLC9A3(指"溶质载体家族9成员3"））编码的蛋白质，该NHE3基因位于13号染色 体。在人中，该NHE3蛋白具有例如长度为834个氨基酸的多肽序列，其GenBank登录号为 NP_004165〇
[0068] NHE3蛋白在肾脏的肾单位和肠内皮细胞的顶膜中表达，其主要负责维持钠平衡。
[0069] 经基因改造以使NHE3基因失活的小鼠已被证明出现腹泻（Schultheis 等，1998, Nat. Genet 19:282-285)。
[0070] 因此，在根据本发明的选择方法中，引起NHE3蛋白表达增加的测试菌株可用于治 疗和/或预防腹泻。
[0071] 在本发明的全文中，测量测试菌株对涉及结肠中水分吸收或分泌的转运体的表达 的影响，尤其是对CFTR蛋白和/或NHE3蛋白表达的影响，可使用本领域技术人员已知的任 何方法进行（参见，例如 Harlow 和 Lane "Antibodies:A Laboratory Manual"，1988 年， 钮约冷泉港，冷泉港实验室），因为所使用的方法其性质并非关键或限制要素。
[0072] 总体上，蛋白质的表达水平可通过直接方法测定，例如通过电泳法、蛋白质印迹 法、免疫分析法、免疫组织化学法、免疫细胞化学法、或质谱法。
[0073] 另外，也可以通过间接方法测定蛋白质的表达水平。
[0074] 间接方法可以由测量对应基因的转录水平组成，例如通过RT_PCR(逆转录，随后 进行聚合酶链反应）测量，优选通过定量RT-PCR、或通过RNA印迹法测量。
[0075] 间接方法的另一实例为测量蛋白质活性的方法，该蛋白质的活性与功能性蛋白的 存在量相关。
[0076] 在某些优选的实施方案中，转运体，尤其是CFTR蛋白和/或NHE3蛋白的表达水平 通过电泳法测定。
[0077] 电泳可将蛋白质根据其分子量分开。通常使用在含有月桂基硫酸钠的聚丙烯酰胺 凝胶上的电泳（称为SDS-PAGE，指硫酸月桂酯钠聚丙烯酰胺凝胶电泳）。也称为二维电泳， 例如可根据其分子量及其等电点将蛋白质分开的等电聚焦法。
[0078] 在本发明的某些实施方案中，通过蛋白质印迹法测定转运体，尤其是CFTR蛋白和 /或NHE3蛋白的表达水平。
[0079] 蛋白质印迹法，也称为西方技术，通过聚丙烯酰胺凝胶电泳分离蛋白质，然后将该 蛋白质从聚丙烯酰胺凝胶转移至支撑膜，在该支撑膜上使用对所述蛋白质具特异性的标记 抗体检测目标蛋白质。
[0080] 在某些优选的实施方案中，通过免疫分析法测定转运体，尤其是CFTR蛋白和/或 NHE3蛋白的表达水平。如在此所用，"免疫分析法"是指使用抗原-抗体反应检测及定量抗 原、抗体或类似物质的任何技术。抗体_抗原复合物可以数种方式被可视化。在大多数情 况下，将抗体与可催化产色反应的酶（例如过氧化物酶）共辄结合（例如免疫过氧化物酶 染色）。或者，可以用荧光团（例如FITC、罗丹明、德州红或Alexa Fluor)标记抗体，然后 通过免疫荧光法检测所述抗体-抗原复合物。
[0081] 对人CFTR蛋白及人NHE3蛋白具有特异性的单克隆抗体在本领域是已知的且可从 市场上购得。
[0082] 在本发明的某些实施方案中，通过免疫组织化学法测定转运体，尤其是CFTR蛋白 和/或NHE3蛋白的表达水平。术语"免疫组织化学法"是指基于使用用于定位组织中蛋白 质的抗体的方法。通常将组织固定、洗涤，再可渗透化。然后，将该组织与特异性识别目标 蛋白（此处为，例如CFTR蛋白或NHE3蛋白）的初级抗体一起孵育。添加与检测系统偶联 的二级抗体。该检测系统为，例如荧光染料或酶，当将其置于存有底物的环境中会导致产色 反应。该二级抗体识别初级抗体的恒定部分Fc且必须源自与初级抗体物种不同的其他物 种。封固在保护该样本荧光的基质中（若检测系统为一种荧光染料）后，或置于底物存在 下（若检测系统为一种酶）后，使用荧光或共聚焦显微镜分析组织。然后，可通过密度测定 法、通过测量荧光强度或通过分光亮度法来测定目标蛋白质的表达水平。
[0083] 在本发明的某些实施方案中，通过免疫细胞化学法测定转运体，尤其是CFTR蛋白 和/或NHE3蛋白的表达水平。
[0084] 免疫细胞化学法是类似于免疫组织化学法的技术，不同之处在于其起始样本为细 胞学制备物，而非组织。
[0085] 在本发明的某些实施方案中，通过质谱法测定转运体，尤其是CFTR蛋白和/或 NHE3蛋白的表达水平。
[0086] 在本发明的某些实施方案中，通过RT-PCR测定转运体，尤其是CFTR蛋白和/或 NHE3蛋白的表达水平。
[0087] RT-PCR法是将RNA逆转录成cDNA，随后进行聚合酶链反应（PCR)。优选地，RT-PCR 为定量RT-PCR，其能够定量对应于目标蛋白质的初始RNA。
[0088] 在本发明的某些实施方案中，通过RNA印迹法测定转运体，尤其是CFTR蛋白和/ 或NHE3蛋白的表达水平。
[0089] RNA印迹法，也称为北方转移，是根据RNA尺寸通过凝胶电泳法分离RNA，然后将 RNA从凝胶转移至膜上的技术，在该膜上可以用对待定量蛋白质的RNA具有特异性的标记 杂交探针检测所述RNA。
[0090] 生物样本
[0091] 根据本发明的一种方法包含测量测试菌株对生物样本中至少一种涉及结肠中水 分吸收或分泌的转运体的表达，尤其是CFTR蛋白和/或NHE3蛋白的表达的影响。
[0092] 如在此所用，术语"生物样本"以其最广泛的意义使用。生物样本可为其中表达目 标蛋白质，尤其是CFTR蛋白或NHE3蛋白，且因此可以被检测及定量的任何生物组织。
[0093] 当应用根据本发明的选择方法时可以使用的生物样本可为，例如来自肠、胰管、胆 管、肾小管、气管-支气管树、生殖系统、汗腺及肾脏的肾单位的样本。
[0094] 在某些优选的实施方案中，生物样本是来自肠的样本，优选来自结肠的样本。
[0095] 优选地，组织样本通过例如活组织检查取自模式动物。优选地，所述模式动物为哺 乳动物，例如小鼠、大鼠、兔子、猪、鸡、猴子。所述模式动物可为转基因动物。
[0096] 根据本发明的优选的生物样本是包含结肠细胞，即来自结肠黏膜的细胞的组织样 本。
[0097] 生物样本也可以是衍生自表达目标蛋白质的组织的生物材料。
[0098] 所述衍生的生物材料是，例如选自从组织样本分离出的细胞或选自从组织样本分 离出的细胞中提取的蛋白质。
[0099] 术语"生物样本"还包括已知可表达目标蛋白质，尤其是CFTR蛋白和/或NHE3蛋 白的细胞系的细胞。
[0100] 表达CFTR蛋白的细胞系的实例包括从结肠分离的Caco-2细胞、从结肠分离的 HT-29细胞或从结肠分离的T84细胞。
[0101] 表达NHE3蛋白的细胞系的实例包括从结肠分离的Caco-2细胞、从结肠分离的 HT-29细胞