用于测定受试者中结肠直肠癌的概率的方法和装置的制作方法

文档序号:3566452阅读:278来源:国知局
专利名称:用于测定受试者中结肠直肠癌的概率的方法和装置的制作方法
技术领域
本公开内容涉及用于测定测试受试者中结肠直肠癌的概率的装置、试剂盒和方 法。更具体地,本公开内容涉及通过测量测试受试者的血液中一种或更多种基因产物的水 平来用于诊断测试受试者中的结肠直肠癌的装置、试剂盒和方法。
背景技术
结肠直肠癌在世界范围内每年导致655,000例死亡,使得它成为癌症相关的死 亡的第二大主要原因。在美国它是在男性和女性中第三大最频繁地诊断出的癌症,带有 6% 的总体群体终生风险(American Cancer Society. Cancer Facts and Figures. 2008. Atlanta American Cancer Society. )。,ISl^iSfl (American Cancer Society)
在2008年将诊断出结肠癌的约108,070例新病例(男性53,760例和女性54,310例)以 及直肠癌的40,740例新病例(男性23,490例和女性17,250例)。在被诊断出的那些病 例中,几乎一半预计在五年内死亡。在美国,估计在2008年50,000名男性和女性将死于 结肠和直肠的癌症(美国癌症学会2008)。这种高死亡率至少部分由于以下事实大部分 的癌症在相对晚期被检出,例如,在明显的症状发作之后,此时癌症更难以治疗。此外,在 晚期的结肠直肠癌鉴定伴随着需要严苛的处置,例如,根治性结肠造口术。已经显示了,在 更早的阶段鉴定和处置结肠直肠癌显著地降低了发生更为进展的疾病的风险,因此降低因 疾病死亡的风险。检出的阶段与患者存活率重要地相关。局部的癌症(Dukes' s A或B 期)具有在五年时82%-93%的极好的预后。区域性的(Dukes' s C期)患者具有55% 到60%的五年存活率;患有晚期癌症的患者仅5%到8%存活过五年时间(0' Connell JB, Maggard M, Ko CY. Colon cancer survival rates with the new American Joint Committee on cancer sixth edition staging· JNCI· 2004 ;96 :1420—1425·) 。 @胃,_ 选结肠直肠癌以容许更早的处置的测试应当能显著地降低进展阶段结肠直肠癌的发生 率(Ransohoff DF. Colorectal cancer screening in 2005 status and challenges. Gastroenterology. 2005 May ; 128 (6) :1685-95),并降低医疗系统的日常开支。因而,美 国癌症学会建议,所有年龄50岁或更大的美国人经常地筛查结肠直肠癌。令人遗憾地,仅 ^^^^ΤΜΡκΦ(Mitka Μ. Colorectal cancer screening rates
still fall far short of recommended levels. JAMA. 2008 Feb 13 ;299 (6) :622),当前可 用的筛查方法需要不易获得的和/或昂贵的资源,与不可接受的低患者依从性相关,和/或 与显著的健康风险相关。测试结肠直肠癌的当前使用的筛查技术包括粪潜隐血测试(FOBT)、柔性乙状结肠镜检查、钡剂灌肠双重造影(DCBE)和结肠镜检查。在被认为是平均风险群体部分的超过50 岁的个体中,用于结肠直肠癌筛查的当前推荐的标准包括每年的F0BT、每五年的乙状结 肠镜检查、每十年的结肠镜检查和每五年的DCBE。对于一个或更多个家族成员患有结肠直 肠癌的高风险群体,建议每两年的结肠镜检查,作为FOBT或乙状结肠镜检查的跟踪。这些 测试的每一种都受困于显著的缺点。粪潜隐血测试受困于低灵敏性,需要在测试之前显著 的饮食和其他限制,并且与不良的患者依从性相关。乙状结肠镜检查和结肠镜检查比其他 标准方法更为敏感,因为它们涉及结肠的腔的直接可视化,然而这些方法也与各种显著的 缺点相关。乙状结肠镜检查和结肠镜检查都是高度侵入性的操作,其导致显著水平的不适, 导致许多个体选择不参加这些推荐的筛查过程。乙状结肠镜检查仅仅容许结肠的远端部分 的可视化,因此不能检测癌症的相对大的部分,结肠镜检查尽管容许基本上沿着结肠的完 整长度的检查,但是与结肠直肠癌检出的显著的失败率相关。此外,乙状结肠镜检查和结肠 镜检查是昂贵的,是不易获得的,可能引起潜在的致死性并发症,例如偶然的肠穿孔。在现有技术已经提出了利用血液中这些疾病的标志物的鉴定和分析的、用于结肠 直肠癌测试的各种方法(综述见 Hundt S.et al. Blood markers for early detection of colorectal cancer :a systematic review. Cancer Epidemiol Biomarkers Prev.2007 Oct ;16(10) :1935-53)。这些方法如果成功,其凭借着,例如,相对非侵入性、最小麻烦、基 本上无风险,将具有绕过标准的现有技术方法的主要缺点的优势,因此可能与提高的患者 筛查依从性比率相关。然而,这些方法都没有展现诊断结肠直肠癌的最佳能力。因此,对于 根据血液标志物的分析测定受试者中结肠直肠癌的概率的改进的方法,存在着长期的和急 迫的需求。

发明内容
本发明公开了根据结肠直肠癌的新的血液标志物、用于测定受试者中结肠直肠癌 的概率的新的方法、装置和试剂盒。这种运用在将在本文中进一步描述的和例示的多种方 法中是有效地。根据本发明的一个方面,提供了测定人类测试受试者中与不患有结肠直肠癌相 对的、患有结肠直肠癌的概率的方法,所述方法包括,对于选自由ANXA3、CLEC4D、IL2RB、 LMNBUPRRG4.TNFAIP6和VNNl组成的组的一组一个或更多个基因的每一个基因(a)测定 所述测试受试者的血液中所述基因编码的RNA的水平,从而产生测试数据;(b)提供表示患 有结肠直肠癌的人类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的阳性对照数据,和提 供表示不患有结肠直肠癌的人类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的阴性对 照数据;和(c)测定所述测试数据相应于所述阳性对照数据以及不相应于所述阴性对照数 据的概率,其中所述测试数据相应于所述阳性对照数据以及不相应于所述阴性对照数据的 概率表示所述测试受试者中与不患有结肠直肠癌相对的、患有结肠直肠癌的概率。根据本发明的另一个方面,提供了测定人类测试受试者中与不患有结肠直肠癌 相对的、患有结肠直肠癌的概率的方法,所述方法包括(a)测定所述测试受试者的血液中 ANXA3基因编码的RNA的水平,从而产生测试数据;(b)提供表示患有结肠直肠癌的人类对 照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的阳性对照数据,和提供表示不患有结肠直肠 癌的人类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的阴性对照数据;和(c)测定所述测试数据相应于所述阳性对照数据以及不相应于所述阴性对照数据的概率,其中所述测试 数据相应于所述阳性对照数据以及不相应于所述阴性对照数据的概率表示所述测试受试 者中与不患有结肠直肠癌相对的、患有结肠直肠癌的概率。根据本发明的又一个方面,提供了测定人类测试受试者中与不患有结肠直肠癌 相对的、患有结肠直肠癌的概率的方法,所述方法包括(a)测定所述测试受试者的血液中 CLEC4D基因编码的RNA的水平,从而产生测试数据;(b)提供表示患有结肠直肠癌的人类对 照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的阳性对照数据,和提供表示不患有结肠直肠 癌的人类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的阴性对照数据;和(c)测定所述 测试数据相应于所述阳性对照数据以及不相应于所述阴性对照数据的概率,其中所述测试 数据相应于所述阳性对照数据以及不相应于所述阴性对照数据的概率表示所述测试受试 者中与不患有结肠直肠癌相对的、患有结肠直肠癌的概率。根据本发明的一个方面,提供了测定人类测试受试者中与不患有结肠直肠癌相 对的、患有结肠直肠癌的概率的方法,所述方法包括(a)测定所述测试受试者的血液中 IL2RB基因编码的RNA的水平,从而产生测试数据;(b)提供表示患有结肠直肠癌的人类对 照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的阳性对照数据,和提供表示不患有结肠直肠 癌的人类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的阴性对照数据;和(c)测定所述 测试数据相应于所述阳性对照数据以及不相应于所述阴性对照数据的概率,其中所述测试 数据相应于所述阳性对照数据以及不相应于所述阴性对照数据的概率表示所述测试受试 者中与不患有结肠直肠癌相对的、患有结肠直肠癌的概率。根据本发明的再另一个方面,提供了测定人类测试受试者中与不患有结肠直肠癌 相对的、患有结肠直肠癌的概率的方法,所述方法包括(a)测定所述测试受试者的血液中 LMNBl基因编码的RNA水平,从而产生测试数据;(b)提供表示患有结肠直肠癌的人类对照 受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的阳性对照数据,和提供表示不患有结肠直肠癌 的人类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的阴性对照数据;和(c)测定所述测 试数据相应于所述阳性对照数据以及不相应于所述阴性对照数据的概率,其中所述测试数 据相应于所述阳性对照数据以及不相应于所述阴性对照数据的概率表示所述测试受试者 中与不患有结肠直肠癌相对的、患有结肠直肠癌的概率。根据本发明的进一步的方面,提供了测定人类测试受试者中与不患有结肠直肠癌 相对的、患有结肠直肠癌的概率的方法,所述方法包括(a)测定所述测试受试者的血液中 PRRG4基因编码的RNA水平,从而产生测试数据;(b)提供表示患有结肠直肠癌的人类对照 受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的阳性对照数据,和提供表示不患有结肠直肠癌 的人类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的阴性对照数据;和(c)测定所述测 试数据相应于所述阳性对照数据以及不相应于所述阴性对照数据的概率,其中所述测试数 据相应于所述阳性对照数据以及不相应于所述阴性对照数据的概率表示所述测试受试者 中与不患有结肠直肠癌相对的、患有结肠直肠癌的概率。根据本发明的又进一步的方面,提供了测定人类测试受试者中与不患有结肠直肠 癌相对的、患有结肠直肠癌的概率的方法,所述方法包括(a)测定所述测试受试者的血液 中TNFAIP6基因编码的RNA水平,从而产生测试数据;(b)提供表示患有结肠直肠癌的人类 对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的阳性对照数据,和提供表示不患有结肠直肠癌的人类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的阴性对照数据;和(C)测定所 述测试数据相应于所述阳性对照数据以及不相应于所述阴性对照数据的概率,其中所述测 试数据相应于所述阳性对照数据以及不相应于所述阴性对照数据的概率表示所述测试受 试者中与不患有结肠直肠癌相对的、患有结肠直肠癌的概率。根据本发明的再进一步的方面,提供了测定人类测试受试者中与不患有结肠直肠 癌相对的、患有结肠直肠癌的概率的方法,所述方法包括(a)测定所述测试受试者的血液 中VNNl基因编码的RNA水平,从而产生测试数据;(b)提供表示患有结肠直肠癌的人类对 照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的阳性对照数据,和提供表示不患有结肠直肠 癌的人类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的阴性对照数据;和(c)测定所述 测试数据相应于所述阳性对照数据以及不相应于所述阴性对照数据的概率,其中所述测试 数据相应于所述阳性对照数据以及不相应于所述阴性对照数据的概率表示所述测试受试 者中与不患有结肠直肠癌相对的、患有结肠直肠癌的概率。根据以下描述的本发明的进一步的特征,所述测试受试者的血液中所述基因编码 的RNA水平的测定是通过测定分离自所述测试受试者的血液样品中所述基因编码的RNA水 平来进行的。根据以下描述的本发明的进一步的特征,测定所述人类测试受试者中与不患有结 肠直肠癌相对的、患有结肠直肠癌的概率的方法进一步包括,测定患有结肠直肠癌的人类 受试者的群体的血液中所述基因编码的RNA水平,从而提供表示患有结肠直肠癌的人类对 照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的阳性对照数据,和测定不患有结肠直肠癌的 人类受试者的群体的血液中所述基因编码的RNA水平,从而提供表示不患有结肠直肠癌的 人类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的阴性对照数据。根据以下描述的本发明的进一步的特征,所述测试数据相应于所述阳性对照数据 以及不相应于所述阴性对照数据的概率的测定是通过向所述测试数据应用从所述阳性对 照数据和从所述阴性对照数据得出的数学模型来进行的,其中所述数学模型被用于测定表 示所述基因编码的RNA水平的数据相应于阳性对照数据以及不相应于阴性对照数据的概 率。根据本发明的另一个方面,提供了根据表示所述测试受试者的血液中ANXA3基因 编码的RNA水平的测试数据来测定人类测试受试者中与不患有结肠直肠癌相对的、患有结 肠直肠癌的概率的基于计算机的方法,所述方法包括,对于选自由ANXA3、CLEC4D、IL2RB、 LMNBUPRRG4.TNFAIP6和VNNl组成的组的一组一个或更多个基因的每一个基因,计算机实 现的步骤(a)向所述测试数据应用数学模型,所述数学模型是从表示患有结肠直肠癌的 人类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的阳性对照数据、以及从表示不患有结 肠直肠癌的人类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的阴性对照数据得出的,其 中所述数学模型被用于测定表示所述基因编码的RNA水平的数据相应于所述阳性对照数 据以及不相应于所述阴性对照数据的概率;和(b)输出所述表示所述基因编码的RNA水平 的数据相应于所述阳性对照数据以及不相应于所述阴性对照数据的概率,其中所述测试数 据相应于所述阳性对照数据以及不相应于所述阴性对照数据的概率表示所述测试受试者 中与不患有结肠直肠癌相对的、患有结肠直肠癌的概率。根据本发明的另一个方面,提供了根据表示所述测试受试者的血液中ANXA3基因编码的RNA水平的测试数据来测定人类测试受试者中与不患有结肠直肠癌相对的、患有结 肠直肠癌的概率的基于计算机的方法,所述方法包括计算机实现的步骤(a)向所述测试 数据应用数学模型,所述数学模型是从表示患有结肠直肠癌的人类对照受试者的血液中所 述基因编码的RNA水平的阳性对照数据、以及从表示不患有结肠直肠癌的人类对照受试者 的血液中所述基因编码的RNA水平的阴性对照数据得出的,其中所述数学模型被用于测定 表示所述基因编码的RNA水平的数据相应于所述阳性对照数据以及不相应于所述阴性对 照数据的概率;和(b)输出所述表示所述基因编码的RNA水平的数据相应于所述阳性对照 数据以及不相应于所述阴性对照数据的概率,其中所述测试数据相应于所述阳性对照数据 以及不相应于所述阴性对照数据的概率表示所述测试受试者中与不患有结肠直肠癌相对 的、患有结肠直肠癌的概率。根据本发明的另一个方面,提供了根据表示所述测试受试者的血液中ANXA3基因 编码的RNA水平的测试数据来测定人类测试受试者中与不患有结肠直肠癌相对的、患有结 肠直肠癌的概率的基于计算机的方法,所述方法包括计算机实现的步骤(a)向所述测试 数据应用数学模型,所述数学模型是从表示患有结肠直肠癌的人类对照受试者的血液中所 述基因编码的RNA水平的阳性对照数据、以及从表示不患有结肠直肠癌的人类对照受试者 的血液中所述基因编码的RNA水平的阴性对照数据得出的,其中所述数学模型被用于测定 表示所述基因编码的RNA水平的数据相应于所述阳性对照数据以及不相应于所述阴性对 照数据的概率;和(b)输出所述表示所述基因编码的RNA水平的数据相应于所述阳性对照 数据以及不相应于所述阴性对照数据的概率,其中所述测试数据相应于所述阳性对照数据 以及不相应于所述阴性对照数据的概率表示所述测试受试者中与不患有结肠直肠癌相对 的、患有结肠直肠癌的概率。根据本发明的另一个方面,提供了根据表示所述测试受试者的血液中ANXA3基因 编码的RNA水平的测试数据来测定人类测试受试者中与不患有结肠直肠癌相对的、患有结 肠直肠癌的概率的基于计算机的方法,所述方法包括计算机实现的步骤(a)向所述测试 数据应用数学模型,所述数学模型是从表示患有结肠直肠癌的人类对照受试者的血液中所 述基因编码的RNA水平的阳性对照数据、以及从表示不患有结肠直肠癌的人类对照受试者 的血液中所述基因编码的RNA水平的阴性对照数据得出的,其中所述数学模型被用于测定 表示所述基因编码的RNA水平的数据相应于所述阳性对照数据以及不相应于所述阴性对 照数据的概率;和(b)输出所述表示所述基因编码的RNA水平的数据相应于所述阳性对照 数据以及不相应于所述阴性对照数据的概率,其中所述测试数据相应于所述阳性对照数据 以及不相应于所述阴性对照数据的概率表示所述测试受试者中与不患有结肠直肠癌相对 的、患有结肠直肠癌的概率。根据本发明的另一个方面,提供了根据表示所述测试受试者的血液中ANXA3基因 编码的RNA水平的测试数据来测定人类测试受试者中与不患有结肠直肠癌相对的、患有结 肠直肠癌的概率的基于计算机的方法,所述方法包括计算机实现的步骤(a)向所述测试 数据应用数学模型,所述数学模型是从表示患有结肠直肠癌的人类对照受试者的血液中所 述基因编码的RNA水平的阳性对照数据、以及从表示不患有结肠直肠癌的人类对照受试者 的血液中所述基因编码的RNA水平的阴性对照数据得出的,其中所述数学模型被用于测定 表示所述基因编码的RNA水平的数据相应于所述阳性对照数据以及不相应于所述阴性对照数据的概率;和(b)输出所述表示所述基因编码的RNA水平的数据相应于所述阳性对照 数据以及不相应于所述阴性对照数据的概率,其中所述测试数据相应于所述阳性对照数据 以及不相应于所述阴性对照数据的概率表示所述测试受试者中与不患有结肠直肠癌相对 的、患有结肠直肠癌的概率。根据本发明的另一个方面,提供了根据表示所述测试受试者的血液中ANXA3基因 编码的RNA水平的测试数据来测定人类测试受试者中与不患有结肠直肠癌相对的、患有结 肠直肠癌的概率的基于计算机的方法,所述方法包括计算机实现的步骤(a)向所述测试 数据应用数学模型,所述数学模型是从表示患有结肠直肠癌的人类对照受试者的血液中所 述基因编码的RNA水平的阳性对照数据、以及从表示不患有结肠直肠癌的人类对照受试者 的血液中所述基因编码的RNA水平的阴性对照数据得出的,其中所述数学模型被用于测定 表示所述基因编码的RNA水平的数据相应于所述阳性对照数据以及不相应于所述阴性对 照数据的概率;和(b)输出所述表示所述基因编码的RNA水平的数据相应于所述阳性对照 数据以及不相应于所述阴性对照数据的概率,其中所述测试数据相应于所述阳性对照数据 以及不相应于所述阴性对照数据的概率表示所述测试受试者中与不患有结肠直肠癌相对 的、患有结肠直肠癌的概率。根据本发明的另一个方面,提供了根据表示所述测试受试者的血液中ANXA3基因 编码的RNA水平的测试数据来测定人类测试受试者中与不患有结肠直肠癌相对的、患有结 肠直肠癌的概率的基于计算机的方法,所述方法包括计算机实现的步骤(a)向所述测试 数据应用数学模型,所述数学模型是从表示患有结肠直肠癌的人类对照受试者的血液中所 述基因编码的RNA水平的阳性对照数据、以及从表示不患有结肠直肠癌的人类对照受试者 的血液中所述基因编码的RNA水平的阴性对照数据得出的,其中所述数学模型被用于测定 表示所述基因编码的RNA水平的数据相应于所述阳性对照数据以及不相应于所述阴性对 照数据的概率;和(b)输出所述表示所述基因编码的RNA水平的数据相应于所述阳性对照 数据以及不相应于所述阴性对照数据的概率,其中所述测试数据相应于所述阳性对照数据 以及不相应于所述阴性对照数据的概率表示所述测试受试者中与不患有结肠直肠癌相对 的、患有结肠直肠癌的概率。根据本发明的另一个方面,提供了根据表示所述测试受试者的血液中ANXA3基因 编码的RNA水平的测试数据来测定人类测试受试者中与不患有结肠直肠癌相对的、患有结 肠直肠癌的概率的基于计算机的方法,所述方法包括计算机实现的步骤向所述测试数据 应用数学模型,所述数学模型是从表示患有结肠直肠癌的人类对照受试者的血液中所述基 因编码的RNA水平的阳性对照数据、以及从表示不患有结肠直肠癌的人类对照受试者的血 液中所述基因编码的RNA水平的阴性对照数据得出的,其中所述数学模型被用于测定表示 所述基因编码的RNA水平的数据相应于所述阳性对照数据以及不相应于所述阴性对照数 据的概率;和(b)输出所述表示所述基因编码的RNA水平的数据相应于所述阳性对照数据 以及不相应于所述阴性对照数据的概率,其中所述测试数据相应于所述阳性对照数据以及 不相应于所述阴性对照数据的概率表示所述测试受试者中与不患有结肠直肠癌相对的、患 有结肠直肠癌的概率。根据本发明的另一个方面,提供了将人类测试受试者分类为相比不患有结肠直肠 癌更可能患有结肠直肠癌的方法,所述方法包括(a)测定所述测试受试者的血液中ANXA3基因编码的RNA的水平,从而产生测试数据;(b)提供表示不患有结肠直肠癌的人类对照受 试者的血液中所述基因编码的RNA水平的阴性对照数据;和(c)向所述测试数据和向所述 阴性对照数据应用数学公式用于产生一值,所述值指明所述测试受试者的血液中所述基因 编码的RNA水平是否高于不患有结肠直肠癌的人类对照受试者的血液中所述基因编码的 RNA水平,其中,所述测试受试者的血液中所述基因编码的RNA水平高于不患有结肠直肠癌 的人类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的所述值的指示,将所述测试受试者 分类为相比不患有结肠直肠癌更可能患有结肠直肠癌。根据本发明的另一个方面,提供了将人类测试受试者分类为相比不患有结肠直 肠癌更可能患有结肠直肠癌的方法,所述方法包括(a)测定所述测试受试者的血液中 CLEC4D基因编码的RNA的水平,从而产生测试数据;(b)提供表示不患有结肠直肠癌的人类 对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的阴性对照数据;和(c)向所述测试数据和 向所述阴性对照数据应用数学公式用于产生一值,所述值指明所述测试受试者的血液中所 述基因编码的RNA水平是否高于不患有结肠直肠癌的人类对照受试者的血液中所述基因 编码的RNA水平,其中,所述测试受试者的血液中所述基因编码的RNA水平高于不患有结肠 直肠癌的人类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的所述值的指示,将所述测试 受试者分类为相比不患有结肠直肠癌更可能患有结肠直肠癌。根据本发明的又一个方面,提供了将人类测试受试者分类为相比不患有结肠直肠 癌更可能患有结肠直肠癌的方法,所述方法包括(a)测定所述测试受试者的血液中IL2RB 基因编码的RNA的水平,从而产生测试数据;(b)提供表示不患有结肠直肠癌的人类对照受 试者的血液中所述基因编码的RNA水平的阴性对照数据;和(c)向所述测试数据和向所述 阴性对照数据应用数学公式用于产生一值,所述值指明所述测试受试者的血液中所述基因 编码的RNA水平是否高于不患有结肠直肠癌的人类对照受试者的血液中所述基因编码的 RNA水平,其中,所述测试受试者的血液中所述基因编码的RNA水平低于不患有结肠直肠癌 的人类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的所述值的指示,将所述测试受试者 分类为相比不患有结肠直肠癌更可能患有结肠直肠癌。根据本发明的再另一个方面,提供了将人类测试受试者分类为相比不患有结肠 直肠癌更可能患有结肠直肠癌的方法,所述方法包括(a)测定所述测试受试者的血液中 LMNBl基因编码的RNA的水平,从而产生测试数据;(b)提供表示不患有结肠直肠癌的人类 对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的阴性对照数据;和(c)向所述测试数据和 向所述阴性对照数据应用数学公式用于产生一值,所述值指明所述测试受试者的血液中所 述基因编码的RNA水平是否高于不患有结肠直肠癌的人类对照受试者的血液中所述基因 编码的RNA水平,其中,所述测试受试者的血液中所述基因编码的RNA水平高于不患有结肠 直肠癌的人类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的所述值的指示,将所述测试 受试者分类为相比不患有结肠直肠癌更可能患有结肠直肠癌。根据本发明的进一步的方面,提供了将人类测试受试者分类为相比不患有结肠 直肠癌更可能患有结肠直肠癌的方法,所述方法包括(a)测定所述测试受试者的血液中 PRRG4基因编码的RNA的水平,从而产生测试数据;(b)提供表示不患有结肠直肠癌的人类 对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的阴性对照数据;和(c)向所述测试数据和 向所述阴性对照数据应用数学公式用于产生一值,所述值指明所述测试受试者的血液中所述基因编码的RNA水平是否高于不患有结肠直肠癌的人类对照受试者的血液中所述基因 编码的RNA水平,其中,所述测试受试者的血液中所述基因编码的RNA水平高于不患有结肠 直肠癌的人类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的所述值的指示,将所述测试 受试者分类为相比不患有结肠直肠癌更可能患有结肠直肠癌。根据本发明的又进一步的方面,提供了将人类测试受试者分类为相比不患有结肠 直肠癌更可能患有结肠直肠癌的方法,所述方法包括(a)测定所述测试受试者的血液中 TNFAIP6基因编码的RNA水平,从而产生测试数据;(b)提供表示不患有结肠直肠癌的人类 对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的阴性对照数据;和(c)向所述测试数据和 向所述阴性对照数据应用数学公式用于产生一值,所述值指明所述测试受试者的血液中所 述基因编码的RNA水平是否高于不患有结肠直肠癌的人类对照受试者的血液中所述基因 编码的RNA水平,其中,所述测试受试者的血液中所述基因编码的RNA水平高于不患有结肠 直肠癌的人类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的所述值的指示,将所述测试 受试者分类为相比不患有结肠直肠癌更可能患有结肠直肠癌。根据本发明的再进一步的方面,提供了将人类测试受试者分类为相比不患有结肠 直肠癌更可能患有结肠直肠癌的方法,所述方法包括(a)测定所述测试受试者的血液中 VNNl基因编码的RNA水平,从而产生测试数据;(b)提供表示不患有结肠直肠癌的人类对照 受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的阴性对照数据;和(c)向所述测试数据和向所 述阴性对照数据应用数学公式用于产生一值,所述值指明所述测试受试者的血液中所述基 因编码的RNA水平是否高于不患有结肠直肠癌的人类对照受试者的血液中所述基因编码 的RNA水平,其中,所述测试受试者的血液中所述基因编码的RNA水平高于不患有结肠直肠 癌的人类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的所述值的指示,将所述测试受试 者分类为相比不患有结肠直肠癌更可能患有结肠直肠癌。根据本发明的另外的方面,提供了将人类测试受试者分类为相比不患有结肠直肠 癌更可能患有结肠直肠癌的基于计算机的方法,所述方法包括计算机实现的步骤(a)向 表示所述测试受试者的血液中ANXA3基因编码的RNA水平的测试数据、以及向表示不患有 结肠直肠癌的人类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的阴性对照数据应用数 学公式用于产生一值,所述值指明所述测试受试者的血液中所述基因编码的RNA水平是否 高于不患有结肠直肠癌的人类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平;和(b)输出 所述值,其中,所述测试受试者的血液中所述基因编码的RNA水平高于不患有结肠直肠癌 的人类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的所述值的指示,将所述测试受试者 分类为相比不患有结肠直肠癌更可能患有结肠直肠癌。根据本发明的又另外的方面,提供了将人类测试受试者分类为相比不患有结肠直 肠癌更可能患有结肠直肠癌的基于计算机的方法,所述方法包括计算机实现的步骤(a) 向表示所述测试受试者的血液中CLEC4D基因编码的RNA水平的测试数据、以及向表示不患 有结肠直肠癌的人类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的阴性对照数据应用 数学公式用于产生一值,所述值指明所述测试受试者的血液中所述基因编码的RNA水平是 否高于不患有结肠直肠癌的人类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平;和(b)输 出所述值,其中,所述测试受试者的血液中所述基因编码的RNA水平高于不患有结肠直肠 癌的人类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的所述值的指示,将所述测试受试者分类为相比不患有结肠直肠癌更可能患有结肠直肠癌。根据本发明的再另外的方面,提供了将人类测试受试者分类为相比不患有结肠直 肠癌更可能患有结肠直肠癌的基于计算机的方法,所述方法包括计算机实现的步骤(a) 向表示所述测试受试者的血液中IL2RB基因编码的RNA水平的测试数据、以及向表示不患 有结肠直肠癌的人类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的阴性对照数据应用 数学公式用于产生一值,所述值指明所述测试受试者的血液中所述基因编码的RNA水平是 否低于不患有结肠直肠癌的人类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平;和(b)输 出所述值,其中,所述测试受试者的血液中所述基因编码的RNA水平低于不患有结肠直肠 癌的人类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的所述值的指示,将所述测试受试 者分类为相比不患有结肠直肠癌更可能患有结肠直肠癌。根据本发明的又再另外的方面,提供了将人类测试受试者分类为相比不患有结肠 直肠癌更可能患有结肠直肠癌的基于计算机的方法,所述方法包括计算机实现的步骤(a) 向表示所述测试受试者的血液中LMNBl基因编码的RNA水平的测试数据、以及向表示不患 有结肠直肠癌的人类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的阴性对照数据应用 数学公式用于产生一值,所述值指明所述测试受试者的血液中所述基因编码的RNA水平是 否高于不患有结肠直肠癌的人类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平;和(b)输 出所述值,其中,所述测试受试者的血液中所述基因编码的RNA水平高于不患有结肠直肠 癌的人类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的所述值的指示,将所述测试受试 者分类为相比不患有结肠直肠癌更可能患有结肠直肠癌。根据本发明的另一个方面,提供了将人类测试受试者分类为相比不患有结肠直肠 癌更可能患有结肠直肠癌的基于计算机的方法,所述方法包括计算机实现的步骤(a)向 表示所述测试受试者的血液中PRRG4基因编码的RNA水平的测试数据、以及向表示不患有 结肠直肠癌的人类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的阴性对照数据应用数 学公式用于产生一值,所述值指明所述测试受试者的血液中所述基因编码的RNA水平是否 高于不患有结肠直肠癌的人类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平;和(b)输出 所述值,其中,所述测试受试者的血液中所述基因编码的RNA水平高于不患有结肠直肠癌 的人类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的所述值的指示,将所述测试受试者 分类为相比不患有结肠直肠癌更可能患有结肠直肠癌。根据本发明的又一个方面,提供了将人类测试受试者分类为相比不患有结肠直肠 癌更可能患有结肠直肠癌的基于计算机的方法,所述方法包括计算机实现的步骤(a)向 表示所述测试受试者的血液中TNFAIP6基因编码的RNA水平的测试数据、以及向表示不患 有结肠直肠癌的人类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的阴性对照数据应用 数学公式用于产生一值,所述值指明所述测试受试者的血液中所述基因编码的RNA水平是 否高于不患有结肠直肠癌的人类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平;和(b)输 出所述值,其中,所述测试受试者的血液中所述基因编码的RNA水平高于不患有结肠直肠 癌的人类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的所述值的指示,将所述测试受试 者分类为相比不患有结肠直肠癌更可能患有结肠直肠癌。根据本发明的再另一个方面,提供了将人类测试受试者分类为相比不患有结肠直 肠癌更可能患有结肠直肠癌的基于计算机的方法,所述方法包括计算机实现的步骤(a)向表示所述测试受试者的血液中VNNl基因编码的RNA水平的测试数据、以及向表示不患有 结肠直肠癌的人类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的阴性对照数据应用数 学公式用于产生一值,所述值指明所述测试受试者的血液中所述基因编码的RNA水平是否 高于不患有结肠直肠癌的人类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平;和(b)输出 所述值,其中,所述测试受试者的血液中所述基因编码的RNA水平高于不患有结肠直肠癌 的人类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的所述值的指示,将所述测试受试者 分类为相比不患有结肠直肠癌更可能患有结肠直肠癌。根据本发明的进一步的方面,提供了将人类测试受试者分类为相比不患有结肠 直肠癌更可能患有结肠直肠癌的方法,所述方法包括,对于选自由ANXA3、CLEC4D、IL2RB、 LMNBUPRRG4.TNFAIP6和VNNl组成的组的一组一个或更多个基因的每一个基因(a)测定 所述测试受试者的血液中所述基因编码的RNA水平,从而产生测试数据;(b)提供表示不 患有结肠直肠癌的人类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的阴性对照数据;和 (c)向所述测试数据以及向所述阴性对照数据应用数学公式用于产生一值,所述值指明,对 于ANXA3、CLEC4D、LMNB1、PRRG4、TNFAIP6和VNN1,所述测试受试者的血液中所述基因编码 的RNA水平是否高于不患有结肠直肠癌的人类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水 平,以及指明,对于IL2RB,所述测试受试者的血液中所述基因编码的RNA水平是否低于不 患有结肠直肠癌的人类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平,其中,对于ANXA3、 CLEC4D、LMNB1、PRRG4、TNFAIP6和VNNl,所述测试受试者的血液中所述基因编码的RNA水平 高于不患有结肠直肠癌的人类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的所述值的 指示,将所述测试受试者分类为相比不患有结肠直肠癌更可能患有结肠直肠癌,以及其中, 对于IL2RB,所述测试受试者的血液中所述基因编码的RNA水平低于不患有结肠直肠癌的 人类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的所述值的指示,将所述测试受试者分 类为相比不患有结肠直肠癌更可能患有结肠直肠癌。根据本发明的又进一步的方面,提供了将人类测试受试者分类为相比不患有结 肠直肠癌更可能患有结肠直肠癌的基于计算机的方法,所述方法包括,对于选自由ANXA3、 CLEC4D,IL2RB,LMNB1,PRRG4,TNFAIP6和VNNl组成的组的一组一个或更多个基因的每一个 基因,计算机实现的步骤向表示所述测试受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的测 试数据、以及向表示不患有结肠直肠癌的人类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水 平的阴性对照数据应用公式用于计算一值,所述值指明,对于ANXA3、CLEC4D、LMNB1、PRRG4、 TNFAIP6和VNN1,所述测试受试者的血液中所述基因编码的RNA水平是否高于不患有结肠 直肠癌的人类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平,以及指明,对于IL2RB,所述 测试受试者的血液中所述基因编码的RNA水平是否低于不患有结肠直肠癌的人类对照受 试者的血液中所述基因编码的RNA水平,其中,对于ANXA3、CLEC4D、LMNB1、PRRG4、TNFAIP6 和VNN1,所述测试受试者的血液中所述基因编码的RNA水平高于不患有结肠直肠癌的人类 对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的所述值的指示,将所述测试受试者分类为 相比不患有结肠直肠癌更可能患有结肠直肠癌,和其中,对于IL2RB,所述测试受试者的血 液中所述基因编码的RNA水平低于不患有结肠直肠癌的人类对照受试者的血液中所述基 因编码的RNA水平的所述值的指示,将所述测试受试者分类为相比不患有结肠直肠癌更可 能患有结肠直肠癌。
根据本发明的一个方面,提供了在测试受试者中诊断结肠直肠癌的方法,所述方 法包括,对于选自由ANXA3、CLEC4D、IL2RB、LMNBl、raRG4、TNFAIP6和VNNl组成的组的一组 一个或更多个基因的每一个基因(a)测定所述测试受试者的血液中所述基因编码的RNA 水平,从而产生测试数据;(b)提供表示患有结肠直肠癌的人类对照受试者的血液中所述 基因编码的RNA水平的阳性对照数据,和提供表示不患有结肠直肠癌的人类对照受试者的 血液中所述基因编码的RNA水平的阴性对照数据;(c)测定所述测试数据相应于所述阳性 对照数据以及不相应于所述阴性对照数据的概率,其中所述测试数据相应于所述阳性对照 数据以及不相应于所述阴性对照数据的确定提供了所述测试受试者中结肠直肠癌的指示。根据本发明的进一步的方面,提供了在测试受试者中诊断结肠直肠癌的方法,所 述方法包括,对于选自由ANXA3、CLEC4D、IL2RB、LMNB1、PRRG4、TNFAIP6和VNNl组成的组的 一组一个或更多个基因的每一个基因(a)测定所述测试受试者的血液中所述基因编码的 RNA水平,从而产生测试数据;(b)提供表示不患有结肠直肠癌的人类对照受试者的血液中 所述基因编码的RNA水平的阴性对照数据;和(c)向所述测试数据、以及向所述阴性对照数 据应用数学公式用于产生一值,所述值指明,对于ANXA3、CLEC4D、LMNBl、PRRG4、TNFAIP6和 VNN1,所述测试受试者的血液中所述基因编码的RNA水平是否高于不患有结肠直肠癌的人 类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平,以及指明,对于IL2RB,所述测试受试者 的血液中所述基因编码的RNA水平是否低于不患有结肠直肠癌的人类对照受试者的血液 中所述基因编码的RNA水平,其中,对于ANXA3、CLEC4D、LMNBU PRRG4, TNFAIP6和VNNlJjf 述测试受试者的血液中所述基因编码的RNA水平高于不患有结肠直肠癌的人类对照受试 者的血液中所述基因编码的RNA水平的所述值的指示,提供了所述测试受试者中结肠直肠 癌的指示,以及其中,对于IL2RB,所述测试受试者的血液中所述基因编码的RNA水平低于 不患有结肠直肠癌的人类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的所述值的指示, 提供了所述测试受试者中结肠直肠癌的指示。根据本发明的另一个方面,提供了测定相对于一般群体、测试受试者是否处于患 有结肠直肠癌的提高的风险中的方法,包括a)从所述受试者获得血液测试样品;和i)测 定所述血液测试样品中膜联蛋白A3(annexin A3) (ANXA3)基因编码的RNA水平,ii)与对 照血液样品中所述基因编码的RNA水平比较步骤(i)中测定的所述基因编码的RNA水平; 和b)如果所述血液测试样品中所述基因编码的RNA水平高于对照血液样品中的,则断定相 对于一般群体所述受试者处于患有结肠直肠癌的提高的风险中。根据本发明的又一个方面,提供了测定相对于一般群体、测试受试者是否处于患 有结肠直肠癌的提高的风险中的方法,包括a)从所述受试者获得血液测试样品;和i)测 定所述血液测试样品中C-型凝集素结构域家族4、成员D(CLEC4D)基因编码的RNA水平, )与对照血液样品中所述基因编码的RNA水平比较步骤(i)中测定的所述基因编码的 RNA水平;和b)如果所述血液测试样品中所述基因编码的RNA水平高于对照血液样品中 的,则断定相对于一般群体所述受试者处于患有结肠直肠癌的提高的风险中。根据本发明的再另一个方面,提供了测定相对于一般群体、测试受试者是否处于 患有结肠直肠癌的提高的风险中的方法,包括a)从所述受试者获得血液测试样品;和i) 测定所述血液测试样品中白细胞介素2受体、β (IL2RB)基因编码的RNA水平,ii)与对照 血液样品中所述基因编码的RNA水平比较步骤(i)中测定的所述基因编码的RNA水平;和b)如果所述血液测试样品中所述基因编码的RNA水平低于对照血液样品中的,则断定相对 于一般群体所述受试者处于患有结肠直肠癌的提高的风险中。根据本发明的进一步的方面,提供了测定相对于一般群体、测试受试者是否处于 患有结肠直肠癌的提高的风险中的方法,包括a)从所述受试者获得血液测试样品;和i) 测定所述血液测试样品中核纤层蛋白Bl (lamin Bi) (LMNBl)基因编码的RNA水平,ii)与对 照血液样品中所述基因编码的RNA水平比较步骤(i)中测定的所述基因编码的RNA水平; 和b)如果所述血液测试样品中所述基因编码的RNA水平高于对照血液样品中的,则断定相 对于一般群体所述受试者处于患有结肠直肠癌的提高的风险中。根据本发明的又进一步的方面,提供了测定相对于一般群体、测试受试者是否处 于患有结肠直肠癌的提高的风险中的方法,包括a)从所述受试者获得血液测试样品;和 i)测定所述血液测试样品中脯氨酸富含Gla(G羧基谷氨酸)4(跨膜)(PRRG4)基因编码的 RNA水平,ii)与对照血液样品中所述基因编码的RNA水平比较步骤⑴中测定的所述基因 编码的RNA水平;和b)如果所述血液测试样品中所述基因编码的RNA水平高于对照血液样 品中的,则断定相对于一般群体所述受试者处于患有结肠直肠癌的提高的风险中。根据本发明的再进一步的方面,提供了测定相对于一般群体、测试受试者是否处 于患有结肠直肠癌的提高的风险中的方法,包括a)从所述受试者获得血液测试样品;和
i)测定所述血液测试样品中肿瘤坏死因子、α诱导蛋白6(TNFAIP6)基因编码的RNA水平,
ii)与对照血液样品中所述基因编码的RNA水平比较步骤(i)中测定的所述基因编码的 RNA水平;和b)如果所述血液测试样品所述基因编码的RNA水平高于对照血液样品中的, 则断定相对于一般群体所述受试者处于患有结肠直肠癌的提高的风险中。根据本发明的再进一步的方面,提供了测定相对于一般群体、测试受试者是否处 于患有结肠直肠癌的提高的风险中的方法,包括a)从所述受试者获得血液测试样品;和 i)测定所述血液测试样品中血管非炎性蛋白(vanin 1) (VNNl)基因编码的RNA水平,ii) 与对照血液样品中所述基因编码的RNA水平比较步骤(i)中测定的所述基因编码的RNA水 平;和b)如果所述血液测试样品中所述基因编码的RNA水平高于对照血液样品中的,则断 定相对于一般群体所述受试者处于患有结肠直肠癌的提高的风险中。根据本发明的另外的方面,提供了测定相对于一般群体、测试受试者是否处于患 有结肠直肠癌的提高的风险中的方法,包括a)从所述受试者获得血液测试样品;对于选 自由ANXA3、CLEC4D、IL2RB、LMNBU PRRG4, TNFAIP6和VNNl组成的组的一组基因的每个基 因,i)测定所述血液测试样品中所述基因编码的RNA水平,ii)与一个或更多个对照血液 样品中所述基因编码的RNA水平比较步骤(i)中测定的所述组的所述基因编码的RNA水 平;和b)如果,对于ANXA3、CLEC4D、LMNBl、PRRG4、TNFAIP6和VNNl,所述血液测试样品中 所述基因编码的RNA水平高于所述对照血液样品的,则断定相对于一般群体所述受试者处 于患有结肠直肠癌的提高的风险中,如果,对于IL2RB,所述血液测试样品中所述基因编码 的RNA水平低于所述对照血液样品的,则断定相对于一般群体所述受试者处于患有结肠直 肠癌的提高的风险中。根据本发明的另外的方面,提供了在测试受试者中诊断结肠直肠癌的方法,包括 a)从所述受试者获得血液测试样品;以及对于选自由ANXA3、CLEC4D、IL2RB、LMNB1、PRRG4、 TNFAIP6和VNm组成的组的一组基因的每一个基因,i)测定所述血液测试样品中所述基因编码的RNA水平,和ii)向步骤(i)中测定的所述组的所述基因编码的RNA水平、以及向 一个或更多个对照血液样品中所述基因编码的RNA水平应用数学公式用于产生一值,所述 值指明,对于ANXA3、CLEC4D、LMNB1、PRRG4、TNFAIP6和VNNl,所述血液测试样品中所述基 因编码的RNA水平是否高于所述对照血液样品的,以及,对于IL2RB,所述血液测试样品中 所述基因编码的RNA水平是否低于所述对照血液样品的;和b)如果,对于ANXA3、CLEC4D、 LMNBU PRRG4、TNFAIP6和VNN1,所述值指明所述血液测试样品中所述基因编码的RNA水 平高于所述对照血液样品的,则断定所述测试受试者中存在结肠直肠癌的指示,如果,对于 IL2RB,所述值指明所述血液测试样品中所述基因编码的RNA水平低于所述对照血液样品 的,则断定所述测试受试者中存在结肠直肠癌的指示。根据以下描述的本发明的进一步的特征,所述对照样品来自已经被诊断为不患有 结肠直肠癌的个体。根据本发明的再另一个方面,提供了试剂盒,其包含包装物并且,对于选自由 ACTB、ANXA3、CLEC4D、IL2RB、LMNBl、PRRG4、TNFAIP6 和 VNNl 组成的组的一组两种或更多种 基因的每个基因,含有能够产生多核苷酸的扩增产物的引物组,所述多核苷酸与所述人类 受试者中仅由所述基因编码的RNA互补。根据以下描述的本发明的进一步的特征,所述试剂盒进一步含有选自由热稳定聚 合酶、逆转录酶、脱氧核苷三磷酸、核苷三磷酸和酶缓冲液组成的组的两种或更多种成分。根据以下描述的本发明的进一步的特征,所述试剂盒进一步含有至少一种标记的 探针,所述探针能够选择性地杂交所述扩增产物的有义链或反义链。根据以下描述的本发明的进一步的特征,所述试剂盒进一步含有具有保存在其上 的指令的计算机可读介质,所述指令当被计算机执行时是可操作的,用于向表示人类测试 受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的测试数据应用数学模型,其中所述数学模型从 表示患有结肠直肠癌的人类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的阳性对照数 据、以及从表示不患有结肠直肠癌的人类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的 阴性对照数据得出,其中所述数学模型被用于测定表示所述基因编码的RNA水平的数据相 应于所述阳性对照数据以及不相应于所述阴性对照数据的概率,其中所述测试数据相应于 所述阳性对照数据以及不相应于所述阴性对照数据的概率表示所述测试受试者中与不患 有结肠直肠癌相对的、患有结肠直肠癌的概率。根据以下描述的本发明的进一步的特征,所述试剂盒进一步含有具有保存在其上 的指令的计算机可读介质,所述指令当被计算机执行时是可操作的,用于向表示人类测试 受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的测试数据、以及向表示不患有结肠直肠癌的人 类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的阴性对照数据应用数学公式用于产生 一值,所述值指明,对于ANXA3、CLEC4D、LMNBl、PRRG4、TNFAIP6和VNNl,所述测试受试者的 血液中所述基因编码的RNA水平是否高于不患有结肠直肠癌的人类对照受试者的血液中 所述基因编码的RNA水平,和,对于IL2RB,所述测试受试者的血液中所述基因编码的RNA 水平是否低于不患有结肠直肠癌的人类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平,其 中,对于ANXA3、CLEC4D、LMNBl、raRG4、TNFAIP6和VNN1,所述测试受试者的血液中所述基因 编码的RNA水平高于不患有结肠直肠癌的人类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水 平的所述值的指示,将所述测试受试者分类为相比不患有结肠直肠癌更可能患有结肠直肠癌,和其中,对于IL2RB,所述测试受试者的血液中所述基因编码的RNA水平低于不患有结 肠直肠癌的人类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的所述值的指示,将所述测 试受试者分类为相比不患有结肠直肠癌更可能患有结肠直肠癌。根据以下描述的本发明的进一步的特征,所述一个或更多个基因的组由ACTB与 选自由ANXA3、CLEC4D、IL2RB、LMNBU PRRG4, TNFAIP6和VNNl组成的组的一个或更多个基 因组成。根据以下描述的本发明的进一步的特征,所述一个或更多个基因的组由ACTB和 ANXA3组成。根据以下描述的本发明的进一步的特征,所述一个或更多个基因的组由ACTB和 CLEC4D 组成。根据以下描述的本发明的进一步的特征,所述一个或更多个基因的组由ACTB和 IL2RB组成。根据以下描述的本发明的进一步的特征,所述一个或更多个基因的组由ACTB和 LMNBl组成。根据以下描述的本发明的进一步的特征,所述一个或更多个基因的组由ACTB和 raRG4组成。根据以下描述的本发明的进一步的特征,所述一个或更多个基因的组由TNFAIP6 和HMM组成。根据以下描述的本发明的进一步的特征,所述一个或更多个基因的组由ACTB和 VNNl组成。根据以下描述的本发明的进一步的特征,所述测试受试者的血液中所述基因编码 的RNA水平通过定量的逆转录酶-聚合酶链式反应分析来测定。根据以下描述的本发明的进一步的特征,所述测试受试者的血液中所述基因编码 的RNA水平和所述对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平通过相同的方法测定。根据以下描述的本发明的进一步的特征,所述一个或更多个基因的组是选自由 ANXA3、CLEC4D、IL2RB、LMNBl、PRRG4、TNFAIP6 和 VNNl 组成的组的一组一个或更多个基因 的组,其中所述测试受试者的血液中所述基因编码的RNA水平被测定为与所述测试受试者 的血液中ACTB编码的RNA水平的比例。根据以下描述的本发明的进一步的特征,所述测试受试者的血液中所述基因编码 的RNA水平和所述测试受试者的血液中ACTB编码的RNA水平通过所述基因编码的RNA和 ACTB编码的RNA的双重定量逆转录酶-聚合酶链式反应分析来测定。根据以下描述的本发明的进一步的特征,所述一个或更多个基因的组由IL2RB与 选自由ANXA3、CLEC4D、LMNBl、PRRG4、TNFAIP6和VNNl组成的组的一个或更多个基因组成。根据以下描述的本发明的进一步的特征,所述一个或更多个基因的组是选自由 ANXA3、CLEC4D、LMNBl、PRRG4、TNFAIP6和VNNl组成的组的一组一个或更多个基因的组,和 其中所述测试受试者的血液中所述基因编码的RNA水平被测定为与所述测试受试者的血 液中IL2RB编码的RNA水平的比例。根据以下描述的本发明的进一步的特征,所述测试受试者的血液中所述基因编码 的RNA水平和所述测试受试者的血液中IL2RB编码的RNA水平通过所述基因编码的RNA和IL2RB编码的RNA的双重定量逆转录酶-聚合酶链式反应分析来测定。根据以下描述的本发明的进一步的特征,所述一个或更多个基因的组由ANXA3组 成。根据以下描述的本发明的进一步的特征,所述一个或更多个基因的组由CLEC4D 组成。根据以下描述的本发明的进一步的特征,所述一个或更多个基因的组由IL2RB组 成。根据以下描述的本发明的进一步的特征,所述一个或更多个基因的组由LMNBl组 成。根据以下描述的本发明的进一步的特征,所述一个或更多个基因的组由PRRG4组 成。根据以下描述的本发明的进一步的特征,所述一个或更多个基因的组由TNFAIP6 组成。根据以下描述的本发明的进一步的特征,所述一个或更多个基因的组由VNNl组 成。根据以下描述的本发明的进一步的特征,所述一个或更多个基因的组由IL2RB和 ANXA3组成。根据以下描述的本发明的进一步的特征,所述一个或更多个基因的组由IL2RB和 CLEC4D 组成。根据以下描述的本发明的进一步的特征,所述一个或更多个基因的组由IL2RB和 LMNBl组成。根据以下描述的本发明的进一步的特征,所述一个或更多个基因的组由IL2RB和 raRG4组成。根据以下描述的本发明的进一步的特征,所述一个或更多个基因的组由IL2RB和 TNFAIP6 组成。根据以下描述的本发明的进一步的特征,所述一个或更多个基因的组由IL2RB和 VNNl组成。定义将变得明显的是,本发明的一个方面的优选的特征和特点适合于本发明的任何其 他方面。要注意的是,如在此使用的,单数形式“一”、“一个”和“该”包括复数的指代,除非 上下文明显地另外指示了。“编码”多核苷酸,包括基因,是说“编码” RNA和/或多肽,如果在它的天然状态下 或当通过本领域技术人员公知的方法操作时,它可以被转录或翻译以产生mRNA和/或多肽 或其片段。反义链是这样的核酸的互补物,可以从中推断编码序列。术语“标记物”是指能够产生分析样品中目标多核苷酸的存在的可检测信号指示 的成分。适合的标记物包括放射性同位素、核苷酸发色团、酶、底物、荧光分子、化学发光部 分、磁性颗粒、生物发光部分,等等。因而,标记物是可由光谱学的、光化学的、生物化学的、 免疫化学的、电学的、光学的或化学的方法检测的任何成分。如在此使用的,“样品”是指分离自个体的组织或流体的样品,包括但不限于,例如,血液、血浆、血清、肿瘤活检物、尿液、大便、痰、脊液、胸膜液、乳头吸出物、淋巴液、皮肤、 呼吸系统、肠和泌尿生殖道的外部部分、泪液、唾液、奶、细胞(包括但不限于血细胞)、器 官,还有体外细胞培养物组分的样品。扩增技术的实例包括链置换扩增,如在美国专利No. 5,744,311中公开的;无转录 等温扩增,如在美国专利NO. 6,033,881中公开的;修复链式反应扩增,如在WO 90/01069中 公开的;连接酶链式反应扩增,如在欧洲专利申请320308中公开的;间隙填充连接酶链式 反应扩增,如在美国专利NO. 5,427,930中公开的;和无RNA转录作用扩增,如在美国专利 NO. 6,025, 134 中公开的。本发明的引物的实例包括,当置于一定条件下时,在所述条件下与多核苷酸互补 的引物延伸产物的合成被催化,能够作为沿着互补链的多核苷酸合成的起始点的寡核苷 酸。这样的条件包括,四种不同的核苷酸三磷酸盐或核苷类似物、用于聚合的一种或更多种 试剂,例如DNA聚合酶和/或逆转录酶在合适的缓冲液(“缓冲液”包括作为辅助因子的、 或影响PH值、离子强度等等的代替物)中的存在,以及处在合适的温度下。引物必需足够 长以在存在聚合酶试剂的情况下启动延伸产物的合成。典型的引物在序列的长度上含有与 目标序列基本上互补的至少约5个核苷酸,但是稍微更长的引物是优选的。术语“互补的”或“其互补物”,如在此使用的,是指多核苷酸的序列,其能够在互补 区域的整个上与另一个特定的多核苷酸形成沃森&克里克碱基配对。这个术语被用于完全 基于它们的序列的多核苷酸的对,不是指两个多核苷酸将实际地结合的任何具体条件。引物将总是含有与目标序列基本上互补的序列,目标序列是要被扩增的特定序 列,引物可以与之退火。在本发明的上下文中,术语“探针”是指一种分子,其可以可检测地区分在结构上 不同的目标分子如等位变体。检测可以以各种不同的方式实现,但是优选的基于特异性结 合的检测。这样的特异性结合的实例包括抗体结合和核酸探针杂交。在此使用的术语“基因”是多核苷酸,其可以包括编码序列、间插序列和控制转录 和/或翻译的调节元件。本发明的基因包括编码多态性的基因的正常的等位基因,包括对 基因编码的多肽的氨基酸序列没有影响的沉默等位基因,以及导致实质上不影响其功能的 编码的多肽的氨基酸序列变体的等位基因。这些术语还可以任选地包括具有一个或更多个 突变的等位基因,所述突变影响编码的多肽的功能。本发明的多核苷酸组合物,例如本发明的引物,包括与本发明的目标cDNA或其部 分互补的RNA、cDNA、DNA,基因组DNA、未剪接的RNA、剪接的RNA、间隔地剪接的RNA、合成的 形式和混合的聚合物,包括有义链和反义链两者,可以被化学地或生物化学地修饰,或可以 含有非天然的或衍生的核苷酸碱基,这将是本领域技术人员容易理解的。当根据本发明的核酸包括RNA时,对于显示的序列应当被看作是与RNA对应的,用 U替代T。术语本发明的基因、优选的此处描述的结肠直肠癌生物标记物基因、或持家基因 编码的RNA的“数量”或“水平”,涵盖RNA的绝对数量,RNA的相对数量或浓度,以及与之相 关的任何值或参数。核酸分离、扩增和分析的方法对于本领域技术人员是常规的,方案的实例 可以在例如 Molecular Cloning :A Laboratory Manual(3-Volume Set)Ed. JosephSambrook, David W. Russel, and Joe Sambrook, Cold Spring Harbor Laboratory ;3rd edition (Jan. 15,2001), ISBN :0879695773中找到。PCR扩增中使用的方法的特别有用的 方案来源是 PCR(Basics :From Background to Bench)by M.J.McPherson, S. G. Moller, R. Beynon, C. Howe,Springer Verlag ;1st edition (Oct. 15,2000),ISBN :0387916008。“试剂盒”是指物理元件的组合,例如,探针,无限制地包括特异性引物、标记的核 酸探针、抗体、蛋白质捕获试剂、试剂、说明页和对实践本发明、特别是对鉴定样品中特定 RNA分子的水平有用的其他元件。这些物理元件可以以适合于进行本发明的任何方式布置。 例如,探针和/或引物可以在一个或更多个容器中、或在阵列或微阵列设备中提供。结肠直肠癌,也称为结肠癌或直肠癌或结肠直肠癌,是在结肠或直肠中形成的癌 症。本发明在检测感兴趣的基因、特别是本发明的结肠直肠的生物标记物的RNA水平 的诊断产品或方法中是有用的。因此,本发明涵盖基于多种方法的诊断试剂盒的用途,例 如,PCR、逆转录酶-PCR、定量PCR、微阵列、芯片、质谱学,它们能够检测样品中的RNA水平。 本发明还提供了制造的物品,其包含包装材料和所述包装材料内含有的分析试剂,其中所 述分析试剂可以用于测定和/或比较本发明的一个或更多个目标基因编码的RNA的水平, 和其中所述包装材料包括标签或包装插入物,其标明所述分析试剂可以用于鉴定RNA的水 平,所述RNA的水平相应于测试受试者患有结肠直肠癌的概率,例如,所述测试受试者中与 不患有结肠直肠癌相对的、患有结肠直肠癌的概率。因此本发明提供了试剂盒,其包含简并引物和说明书,所述简并引物用于扩增本 发明的目标基因的多态性等位基因或变体,所述说明书包含扩增方案和结果的分析。做为 选择所述试剂盒还可以包含用于进行扩增和扩增产物的分析的缓冲液、酶和容器。所述试 剂盒还可以是包含其他工具,例如DNA微阵列的筛查或预测试剂盒的成分。所述试剂盒还 可以提供一个或更多个对照模板,例如,分离自没有结肠直肠癌的患者的样品的核酸,和/ 或分离自患有结肠直肠癌的患者的样品的核酸。所述试剂盒还可以包括使用该试剂盒来在固相支持物扩增具体目标的说明书。当 所述试剂盒含有准备的固相支持物时,所述固相支持物已经具有一组引物固定在所述固相 支持物上,例如,用于扩增目标多核苷酸的特定的组,所述试剂盒还包括在固相支持物上进 行PCR所需的试剂,例如,使用原位型或固相型PCR操作,其中所述支持物能够利用原位型 PCR仪器进行PCR扩增。包括在所述试剂盒内的PCR试剂,包括普通的PCR缓冲液、热稳定 聚合酶(例如,Taq DNA聚合酶)、核苷酸(例如,dNTPs)和其他成分和标记分子(例如,用 于直接或间接标记)。所述试剂盒可以被组合,来支持利用单独的固定引物,或作为选择与 液相引物一起的PCR扩增方法的进行。在一个实施方式中,所述试剂盒提供了一个或更多个引物对,每个对能够扩增本 发明的目标基因编码的RNA,从而提供用于在一个反应或几个平行的反应中分析生物样品 中本发明的几种不同目标基因的RNA表达的试剂盒。试剂盒中的引物可以被标记,例如荧 光标记,以便于扩增产物的检测和后续RNA水平的分析。在一个实施方式中,超过一个目标基因编码的RNA的水平可以在一个分析中测 定。组合试剂盒因而可以包括能够扩增来自不同的目标基因编码的RNA的cDNA的引物。所 述引物可以被差异化标记,例如,使用不同的荧光标记物,以便区分来自不同的目标基因的RNA。多重,例如,双重实时RT-PCR允许在同一个反应中同时定量2个目标,其节省了 时间、降低成本并且节省样品。多通道实时RT-PCR的这些优点使得该技术非常适合于高 通量基因表达分析。实时形式的多通道qPCR试验便于定量测量,将假阴性结果的风险最 小化。关键的是,多通道PCR被优化从而所有样品的扩增子在PCR的平台下阶段比较。 Yun, Z. , I. Lewensohn-Fuchs, P. Ljungman, L. Ringholm, J. Jonsson, and J. Albert. 2003. A real-time TaqMan PCR for routine quantitation of cytomegalovirus DNA in crude leukocyte lysates from stem cell transplant patients. J. Virol. Methods 110:73-79. [PubMed].Yun, Ζ. , I.Lewensohn-Fuchs, P.Ljungman, and A. Vahlne. 2000. Real-time monitoring of cytomegalovirus infections after stem cell transplantation using the TaqMan polymerase chain reaction assays. Transplantation 69:1733-1736. [PubMed]。多达 2、3、4、5、6、7 和 8 或更多个目标的同时 定量可能是有用的。所述试剂盒内含有的引物和探针可以包括19中列出的那些,以及其各种组合。“对照群体”是指患有或不患有结肠直肠癌的个体或一组个体的限定的组,可以任 选地进一步通过,但不限于地理的、人种的、种族的、性别的、一种或更多种其他状况或疾病 和/或文化指标来鉴别。在大多数情况下,对照群体可以包含至少10、50、100、1000或更多 个个体。“阳性对照数据”涵盖表示本发明的患有结肠直肠癌的一个或更多个受试者的每 一个中、本发明的目标基因编码的RNA的水平的数据,并且涵盖本发明的患有结肠直肠癌 的多个受试者中本发明的目标基因编码的RNA的平均水平的单个数据点。“阴性对照数据”涵盖表示本发明的不患有结肠直肠癌的一个或更多个受试者的 每一个中、本发明的目标基因编码的RNA的水平的数据,并且涵盖本发明的患有结肠直肠 癌的多个受试者中本发明的目标基因编码的RNA的平均水平的单个数据点。本发明的测试数据“相应于”本发明的阳性对照数据或阴性对照数据的概率,分 别是指,与不具有任何结肠直肠病理的受试者中的相比,所述测试数据更可能表现出患有 结肠直肠癌的受试者中获得的数据的特征的概率,或者与患有结肠直肠癌的受试者中的相 比,更可能表现出不具有任何结肠直肠病理的受试者中获得的数据的特征的概率。“选择性杂交”目标多核苷酸的引物是一种引物,其能够仅与、或主要与多核苷酸 的混合物中单个目标多核苷酸杂交,所述多核苷酸的混合物由人类血液的RNA组成,或由 与人类血液的RNA互补的DNA组成。在包含、但优选的不限于ANXA3基因、CLEC4D基因、IL2RB基因、LMNB1基因、raRG4 基因、TNFAIP6基因和VNNl基因的一个或更多个基因的RNA水平上在血液中发现的,结肠 直肠癌的本发明的基因表达图谱可以利用许多技术来鉴定或测定,包括、但优选的不限于 PCR方法,对于在此处的工作实施例中进一步讨论的实例,Nothern分析和微阵列技术。这 种基因表达图谱可以在身体样品,例如,血液中利用微阵列技术来测量。在这种方法的实 施方式中,荧光标记的cDNA探针可以通过从血液提取的RNA的逆转录掺入荧光核苷酸来产 生。施用到芯片上的标记的cDNA探针特异性地与阵列上的每个DNA斑点杂交。每个阵列 单元的杂交的定量可供评定相应的mRNA丰度。例如,利用双色荧光,产生自两个RNA来源的被分别标记的cDNA探针成对地与阵列杂交。因而同时地测定来自相应于每个指定基因 的两个来源的转录产物的相对丰度。已经显示了这样的方法具有检测稀有的转录产物所 需的敏感性,所述稀有的转录产物以每个细胞几个拷贝来表达,以及可再现地检测表达水 平方面至少约两倍差异所需的敏感性(Schena et al. , Proc. Natl. Acad. Sci. USA 93(2) 106-149(1996))。可以通过商售的设备、按照厂家的说明书,例如通过利用Affymetrix GenChip技术或hcyte的微阵列技术来进行微阵列分析。根据以下的详细说明,本发明的其他特征和优点将变得更为显而易见。然而,应当 理解的是,说明本发明的优选实施方式的详细说明和特定的实施例,仅以说明性的方式给 出,因为根据该详细说明,对本领域技术人员来说,在本发明的精神和范围之内的各种变化 和修改将变得显而易见。


现在将相对于附图来描述本发明,在附图中附图IA-H分别是描绘以下基因的核苷酸序列的序列图ACTB、ANXA3、CLEC4D、 IL2RB、LMNBl、PRRG4、TNFAIP6 和 VNNl。附图2是描绘用于实践此处描述的某些方法的示范性计算机系统的示意图。
具体实施例方式本发明是用于测定人类受试者患有结肠直肠癌的概率的方法、试剂盒、计算机系 统和计算机可读介质。特别地,本发明可以用于通过在此公开的血液中结肠直肠癌的新的 标志物的分析来测定这样的概率。在详细地解释本发明的至少一个实施方式之前,要理解的是,本发明不将它的应 用限于以下说明所阐述的或通过实施例所例示的细节。本发明能有其他的实施方式或者能 以各种方式实践和进行。并且,要理解的是在此采用的用语和术语是为了说明的目的而不 应认为是限制性的。通过血液标志物的分析测试结肠直肠癌的有效方法将克服现有技术的方法的主 要缺点,现有技术的方法是极度侵入性的、麻烦的、危险的、不可获得的和/或与低的患者 筛查依从性比率相关。虽然在现有技术中已经提出通过分析血液中这种疾病的标志物进行 结肠直肠癌测试的各种方法(综述见Hundt S. et al. Blood markers for early detection of colorectal cancer :a systematic review. Cancer Epidemiol Biomarkers Prev. 2007 Oct ;16(10) :1935-53),然而,这些方法都没有展现令人满意地允许测定测试受试者中与 不患有结肠直肠癌相对的、患有结肠直肠癌的概率的能力。因而,现有技术未能提供通过分析血液样品中一个或更多个基因ANXA3、CLEC4D、 LMNB1、PRRG4、TNFAIP6和VNNl血液标志物编码的RNA水平来测试受试者的结肠直肠癌的 有效方法。当将本发明实践时,令人惊讶地发现了,与不具有任何结肠直肠病理的受试者的 血液中的相比,ANXA3、CLEC4D、LMNBl、raRG4、TNFAIP6和VNNl基因编码的RNA水平在患有 结肠直肠癌的受试者的血液中显著更高,以及与不具有任何结肠直肠病理的受试者的血液 中的相比,IL2RB编码的RNA的水平在患有结肠直肠癌的受试者的血液中显著更低(实施例2)。当进一步实践本发明时,令人惊讶地发现了,基于测试受试者的血液中结肠直肠癌标 记物基因 ANXA3、CLEC4D、IL2RB、LMNBU PRRG4, TNFAIP6 和 VNNl 的 127 种可能的组合所编 码的RNA水平可以得出数学模型,其能够辨别患有结肠直肠癌的受试者和不具有任何结肠 直肠病理的受试者(实施例2)。当进一步实践本发明时,令人惊讶地发现了,基于测试受 试者的血液中结肠直肠癌标记物基因ANXA3、CLEC4D、LMNB1、PRRG4、TNFAIP6和VNNl的63 种可能的组合所编码的RNA水平,当针对IL2RB编码的RNA的水平标准化时,可以得出数学 模型,其能够辨别患有结肠直肠癌的受试者和不具有任何结肠直肠病理的受试者(实施例 3)。将理解的是,将这样的数学模型应用于表示前述的新结肠直肠癌标记物基因编码的RNA 的测试受试者中血液水平的测试数据,可以用于提供测试受试者中与不具有任何结肠直肠 病理相对的、患有结肠直肠癌的概率。当实践本发明时,令人惊讶地发现了,相对于不具有任何结肠直肠病理的受试者、 在患有结肠直肠癌的受试者中,ANXA3、CLEC4D、IL2RB、LMNBl、PRRG4、TNFAIP6和VNNl编码 的RNA血液水平的倍数变化,包括对IL2RB标准化的倍数变化(实施例2、3和6)。因而,根据本发明的一个方面,提供了测定人类测试受试者中与不患有结肠直肠 癌相对的、患有结肠直肠癌的概率的方法。在第一步骤中,通过对一组一个或更多个结肠直 肠癌标记物基因ANXA3、CLEC4D、IL2RB、LMNBl、raRG4、TNFAIP6和VNNl的每一个基因测定 所述测试受试者的血液中所述基因编码的RNA水平,从而产生测试数据来进行所述方法。 在第二步骤中,通过测定所述测试数据相应于表示患有结肠直肠癌的人类对照受试者的血 液中所述基因编码的RNA水平的阳性对照数据、以及不相应于表示不患有结肠直肠癌的人 类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的阴性对照数据的概率来进行所述方法。 所述测试数据相应于所述阳性对照数据以及不相应于所述阴性对照数据的概率表示所述 测试受试者中与不患有结肠直肠癌相对的、患有结肠直肠癌的概率。因而,根据本发明的方面,提供了将测试受试者分类为相比不患有结肠直肠癌更 可能患有结肠直肠癌的方法。通过如下方式进行分类方法测定所述测试受试者的血液中 由 ANXA3、CLEC4D、IL2RB、LMNBl、PRRG4、TNFAIP6 和 / 或 VNNl 组成的一个或更多个组所编 码的RNA水平,从而产生测试数据,并向所述测试数据、以及向表示不患有结肠直肠癌的人 类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的阴性对照数据应用数学公式用于产生 一值,所述值指明,对于ANXA3、CLEC4D、LMNBl、PRRG4、TNFAIP6和VNNl,所述测试受试者的 血液中所述基因编码的RNA水平是否高于不患有结肠直肠癌的人类对照受试者的血液中 所述基因编码的RNA水平,以及指明,对于IL2RB,所述测试受试者的血液中所述基因编码 的RNA水平是否低于不患有结肠直肠癌的人类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水 平。对于ANXA3、CLEC4D、LMNB1、PRRG4、TNFAIP6和VNNl,所述测试受试者的血液中所述基 因编码的RNA水平高于不患有结肠直肠癌的人类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA 水平的所述值的指示,将所述测试受试者分类为相比不患有结肠直肠癌更可能患有结肠直 肠癌;而对于IL2RB,所述测试受试者的血液中所述基因编码的RNA水平低于不患有结肠直 肠癌的人类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的所述值的指示,将所述测试受 试者分类为相比不患有结肠直肠癌更可能患有结肠直肠癌。测定所述测试受试者的血液中ANXA3、CLEC4D、LMNBl、raRG4、TNFAIP6或VNNl编码 的RNA水平是否高于不患有结肠直肠癌的对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平,可以通过测定是否存在着高于最小倍数变化的和/或处在倍数变化范围之内的,在所述测 试受试者和所述不患有结肠直肠癌的对照受试者之间水平方面的倍数变化来进行。测定所述测试受试者的血液中IL2RB编码的RNA水平是否低于不患有结肠直肠癌 的对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平,可以通过测定是否存在着低于最大值倍 数变化的和/或处在倍数变化范围之内的,在所述测试受试者和所述不患有结肠直肠癌的 对照受试者之间水平方面的倍数变化来进行。在下文的实施例2、实施例3和实施例6中提供了根据本发明用于分类测试受试者 的适合的倍数变化和倍数变化范围的实例,包括以下的这些。对于ANXA3编码的RNA水平,相对于不具有任何结肠直肠病理的受试者的血液中 持家基因编码的RNA的平均水平,适合的最小倍数变化是约1. 6倍,适合的倍数变化范围是 约1.6到约11. 5倍。对于CLEC4D编码的RNA水平,相对于不具有任何结肠直肠病理的受试者的血液中 持家基因编码的RNA的平均水平,适合的最小倍数变化是约1. 4倍,适合的倍数变化范围是 约1. 4到约15. 9倍。对于LMNBl编码的RNA水平,相对于不具有任何结肠直肠病理的受试者的血液中 持家基因编码的RNA的平均水平,适合的最小倍数变化是约1. 3倍,适合的倍数变化范围是 约1. 3到约7. 0倍。对于PRRG4编码的RNA水平,相对于不具有任何结肠直肠病理的受试者的血液中 持家基因编码的RNA的平均水平,适合的最小倍数变化是约1. 5倍,适合的倍数变化范围是 约1. 5到约6. 3倍。对于TNFAIP6编码的RNA水平,相对于不具有任何结肠直肠病理的受试者的血液 中持家基因编码的RNA的平均水平,适合的最小倍数变化是约1. 4倍,适合的倍数变化范围 是约1. 45到约16. 8倍。对于VNNl编码的RNA水平,相对于不具有任何结肠直肠病理的受试者的血液中持 家基因编码的RNA的平均水平,适合的最小倍数变化是约1. 5倍,适合的倍数变化范围是约 1. 45到约23. 6倍。对于IL2RB编码的RNA水平,相对于不具有任何结肠直肠病理的受试者的血液中 持家基因编码的RNA的平均水平,适合的最大倍数变化是约0. 8倍,适合的倍数变化范围是 约0. 8到约0. 1倍。对于针对IL2RB标准化的ANXA3编码的RNA水平,相对于不具有任何结肠直肠病 理的受试者的血液中IL2RB编码的RNA的平均水平,适合的最小倍数变化是约1. 7倍,适合 的倍数变化范围是约1. 7到约20. 7倍。对于针对IL2RB标准化的CLEC4D编码的RNA水平,相对于不具有任何结肠直肠病 理的受试者的血液中IL2RB编码的RNA的平均水平,适合的最小倍数变化是约1. 5倍,适合 的倍数变化范围是约1. 5到约12. 0倍。对于针对IL2RB标准化的LMNBl编码的RNA水平,相对于不具有任何结肠直肠病 理的受试者的血液中IL2RB编码的RNA的平均水平,适合的最小倍数变化是约1. 5倍,适合 的倍数变化范围是约1. 5到约10. 6倍。对于针对IL2RB标准化的PRRG4编码的RNA水平,相对于不具有任何结肠直肠病理的受试者的血液中IL2RB编码的RNA的平均水平,适合的最小倍数变化是约1. 3倍,适合 的倍数变化范围是约1. 3到约13. 1倍。对于针对IL2RB标准化的TNFAIP6编码的RNA水平,相对于不具有任何结肠直肠 病理的受试者的血液中IL2RB编码的RNA的平均水平,适合的最小倍数变化是约1. 5倍,适 合的倍数变化范围是约1. 5到约16. 4倍。对于针对IL2RB标准化的VNNl编码的RNA水平,相对于不具有任何结肠直肠病理 的受试者的血液中IL2RB编码的RNA的平均水平,适合的最小倍数变化是约1. 3倍,适合的 倍数变化范围是约1. 3到约11. 9倍。如在此使用的,术语“约”是指加或减百分之10的变异性。因而,对用于实践本发明的分类方法的本发明的标记物基因的特定组的每个标记 物基因,根据本发明的教导,如果相对于不具有任何结肠直肠癌病理的对照受试者的血液 的、所述测试受试者的血液中该基因编码的RNA水平的倍数变化将所述测试受试者分类为 相比不患有结肠直肠癌更可能患有结肠直肠癌,本发明的测试受试者被分类为相比不患有 结肠直肠癌更可能患有结肠直肠癌。反之,对用于实践本发明的分类方法的本发明的标记物基因的特定组的每个标记 物基因,根据本发明的教导,如果相对于不具有任何结肠直肠癌病理的对照受试者的血液 的、所述测试受试者的血液中该基因编码的RNA水平的倍数变化没有将所述测试受试者分 类为相比不患有结肠直肠癌更可能患有结肠直肠癌,本发明的测试受试者被分类为相比患 有结肠直肠癌更可能不患有结肠直肠癌。在本发明的一个方面,所述一个或更多个结肠直肠癌标记物基因的组可以由 ANXA3、CLEC4D、IL2RB、LMNBl、PRRG4、TNFAIP6 和 VNNl 的一个或更多个的任何一种可能的 组合组成(在表6中标明,其中每个逻辑回归模型基于一种特定的基因组合,该组合的每个 基因被指定逻辑回归系数值)。可以用于实践本发明的由ANXA3、CLEC4D、IL2RB、LMNBU PRRG4、TNFAIP6 和 VNNl 的一个或更多个组成的本发明的标记物基因的组可以包括ANXA3、CLEC4D、IL2RB、LMNBU PRRG4、TNFAIP6、VNNl ;ANXA3, CLEC4D、IL2RB、LMNBl、PRRG4、VNNl ;ANXA3, CLEC4D、IL2RB、 PRRG4 ;ANXA3、CLEC4D、IL2RB、LMNBl、PRRG4 ;ANXA3、CLEC4D、IL2RB、PRRG4、VNNl ;ANXA3、 IL2RB、LMNBl、PRRG4、VNNl ;ANXA3, CLEC4D、IL2RB、PRRG4、TNFAIP6 ;ANXA3, IL2RB、LMNBl、 PRRG4、TNFAIP6 ;ANXA3、CLEC4D、IL2RB、LMNBl、PRRG4、TNFAIP6 ;ANXA3、CLEC4D、IL2RB、 PRRG4、TNFAIP6、VNNl ;ANXA3、IL2RB、LMNBl、PRRG4、TNFAIP6、VNNl ;ANXA3、IL2RB、LMNBl、 PRRG4 ;IL2RB、PRRG4、VNNl ;ANXA3、IL2RB、PRRG4、VNNl ;CLEC4D、IL2RB、PRRG4、VNNl ; IL2RB、LMNBl、PRRG4、VNNl ;CLEC4D、IL2RB、LMNBl、PRRG4、VNNl ;ANXA3、IL2RB、PRRG4、 TNFAIP6 ;IL2RB、PRRG4、TNFAIP6、VNNl ;ANXA3、IL2RB、PRRG4、TNFAIP6、VNNl ;CLEC4D、 IL2RB、PRRG4、TNFAIP6、VNNl ; IL2RB、LMNBl、PRRG4、TNFAIP6、VNNl ;CLEC4D、IL2RB、LMNBl、 PRRG4、TNFAIP6、VNNl ; IL2RB、PRRG4 ;ANXA3、IL2RB、PRRG4 ;CLEC4D、IL2RB、PRRG4 ; IL2RB、 LMNBl、PRRG4 ;CLEC4D、IL2RB、LMNB1、PRRG4 ;IL2RB、PRRG4、TNFAIP6 ;CLEC4D、IL2RB、PRRG4、 TNFAIP6 ;IL2RB、LMNBl、PRRG4、TNFAIP6 ;CLEC4D、IL2RB、LMNBl、PRRG4、TNFAIP6 ;ANXA3、 IL2RB、VNNl ;ANXA3、CLEC4D、IL2RB、VNNl ;ANXA3、IL2RB、LMNBU VNNl ;ANXA3、CLEC4D、 IL2RB、LMNBl、VNNl ;ANXA3、CLEC4D、LMNBl、PRRG4、VNNl ;ANXA3、IL2RB、TNFAIP6、VNN 1 ;ANXA3、CLEC4D、IL2RB、TNFAIP6、VNNl ;ANXA3、IL2RB、LMNBl、TNFAIP6、VNNl ;ANXA3、CLEC4D、 IL2RB、LMNBl、TNFAIP6、VNNl ;ANXA3、CLEC4D、LMNBl、PRRG4、TNFAIP6、VNNl ;ANXA3、IL2RB ; ANXA3、CLEC4D、IL2RB ;ANXA3, IL2RB、LMNBl ;ANXA3、CLEC4D、IL2RB、LMNBl ;ANXA3、CLEC4D、 LMNBl、PRRG4 ;CLEC4D、IL2RB、LMNBl、VNNl ;ANXA3, IL2RB、TNFAIP6 ;ANXA3、CLEC4D、IL2RB、 TNFAIP6 ;ANXA3、IL2RB、LMNBl、TNFAIP6 ;ANXA3、CLEC4D、IL2RB、LMNBl、TNFAIP6 ;ANXA3、 CLEC4D、LMNBl、PRRG4、TNFAIP6 ;IL2RB、LMNBl、TNFAIP6、VNNl ;CLEC4D、IL2RB、LMNBl、 TNFAIP6、VNNl ;IL2RB、LMNBU VNNl ;ANXA3、LMNBU PRRG4、VNNl ;ANXA3、LMNBU PRRG4、 TNFAIP6、VNNl ;ANXA3、CLEC4D、PRRG4 ;ANXA3、LMNBl、PRRG4 ;CLEC4D、IL2RB、VNNl ;ANXA3、 CLEC4D、PRRG4、VNNl ;IL2RB、LMNBl、TNFAIP6 ;CLEC4D、IL2RB、LMNBl、TNFAIP6 ;ANXA3、 CLEC4D、PRRG4、TNFAIP6 ;ANXA3、LMNBl、PRRG4、TNFAIP6 ;IL2RB、TNFAIP6、VNNl ;CLEC4D、 IL2RB、TNFAIP6、VNN1 ;ANXA3、CLEC4D、PRRG4、TNFAIP6、VNN1 ;IL2RB、LMNB1 ; CLEC4D、IL2RB、 LMNBl ;IL2RB、VNNl ;ANXA3, CLEC4D、LMNBl、VNNl ;ANXA3, CLEC4D、LMNBl、TNFAIP6、VNNl ; ANXA3、CLEC4D、LMNBl ;ANXA3、PRRG4 ;ANXA3、CLEC4D、VNNl ;ANXA3、LMNB1、VNNl ;ANXA3、 PRRG4、VNNl ;ANXA3、CLEC4D、LMNBl、TNFAIP6 ;ANXA3、PRRG4、TNFAIP6 ;ANXA3、CLEC4D、 TNFAIP6、VNN1;ANXA3、LMNB1、TNFAIP6、VNNl ;ANXA3、PRRG4、TNFAIP6、VNNl ;ANXA3 ;ANXA3、 CLEC4D ;ANXA3、LMNBl ;ANXA3、VNNl ;ANXA3、TNFAIP6 ;ANXA3、CLEC4D、TNFAIP6 ;IL2RB、 TNFAIP6 ;CLEC4D、IL2RB、TNFAIP6 ;ANXA3、LMNB1、TNFAIP6 ;ANXA3、TNFAIP6、VNNl ;CLEC4D、 IL2RB ;PRRG4、VNNl ;CLEC4D、PRRG4、VNNl ;LMNBU PRRG4、VNNl ;CLEC4D、LMNBl、PRRG4、 VNNl ;PRRG4、TNFAIP6、VNN1 ;CLEC4D、PRRG4、TNFAIP6、VNNl ;LMNB1、PRRG4、TNFAIP6、VNN1 ; CLEC4D、LMNB 1、PRRG4、TNFAIP6、VNNl ;PRRG4 ;CLEC4D、PRRG4 ;LMNBUPRRG4 ;CLEC4D、LMNB1、 PRRG4 ;PRRG4、TNFAIP6 ;CLEC4D、PRRG4、TNFAIP6 ;LMNB 1、PRRG4、TNFAIP6 ;CLEC4D、LMNBl、 PRRG4、TNFAIP6 ;LMNBU TNFAIP6、VNNl ;CLEC4D、VNNl ;LMNBU VNNl ;CLEC4D、LMNBl、VNNl ; LMNBUTNFAIP6 ;LMNB U TNFAIP6 ;TNFAIP6、VNNl ;CLEC4D、TNFAIP6、VNNl ;CLEC4D、LMNB1、 TNFAIP6、VNN1;LMNBl ;CLEC4D、LMNB1 ;VNNl ;CLEC4D、TNFAIP6 ;TNFAIP6 ;CLEC4D ;和 IL2RB。根据本发明的方面,其中一个或更多个结肠直肠癌标记物基因的组由ANXA3、 CLEC4D、IL2RB、LMNBl、PRRG4、TNFAIP6和VNNl的127种可能的组合的任一种组成时,在本 发明的受试者的血液中本发明的基因编码的RNA水平可以被测定为相对所述受试者的血 液中持家基因编码的RNA水平的比例。要理解的是,在单个样品内相对于持家基因编码的 RNA水平、所述基因编码的RNA水平的这种测量可以用于控制样品与样品间的变异性。持家基因可以普通技术人员已知的在血液中表达的各种基因的任一种。在本发明 的一个方面,所述持家基因是ACTB。作为选择,所述持家基因可以编码18S rRNA。本发明的目标基因(ACTB、ANXA3、CLEC4D、IL2RB、LMNBl、PRRG4、TNFAIP6和 VNN1) 的核苷酸序列在附图IA-H和下文的表1中描述。在本发明的另一个方面,所述一个或更多个结肠直肠癌标记物基因的组可以由 ANXA3,CLEC4D,LMNB1,PRRG4,TNFAIP6和VNNl的一个或更多个的任何一种可能的组合组成 (在表5中标明,其中每个逻辑回归模型基于一种特定的基因组合,该组合的每个基因被指 定逻辑回归系数值)。可以用于实践本发明的ANXA3、CLEC4D、LMNBU PRRG4、TNFAIP6和VNNl的一个或 更多个的可能的组合包括ANXA3、CLEC4D、LMNBl、PRRG4、TNFAIP6 和 VNNl ;ANXA3、LMNBl、PRRG4、TNFAIP6 禾口 VNNl ;ANXA3、CLEC4D、LMNBl、PRRG4、TNFAIP6 ;ANXA3、CLEC4D、LMNBl、 PRRG4、TNFAIP6 和 VNNl;ANXA3、PRRG4、TNFAIP6 和 VNNl;CLEC4D、LMNB1、PRRG4、TNFAIP6 和 VNNl ;ANXA3、PRRG4 和 TNFAIP6 ;CLEC4D、LMNBl、PRRG4 和 TNFAIP6 ;ANXA3、CLEC4D、PRRG4、 TNFAIP6 和 VNNl ;ANXA3、CLEC4D、PRRG4 和 TNFAIP6 ;ANXA3、LMNBl、PRRG4 和 VNNl ;ANXA3、 LMNB1、PRRG4 禾口 TNFAIP6 ;CLEC4D、LMNB1、PRRG4 禾口 VNNl ;ANXA3、CLEC4D、LMNB1、PRRG4 ; ANXA3、CLEC4D、PRRG4 禾口 VNNl ;LMNBU PRRG4 禾口 VNNl ;LMNBU PRRG4、TNFAIP6 禾口 VNNl ; LMNBUPRRG4 和 TNFAIP6 ;ANXA3、CLEC4D 和 PRRG4 ;ANXA3、LMNB1 和 PRRG4 ;ANXA3 和 PRRG4 ; ANXA3、PRRG4 和 VNNl ;CLEC4D、LMNB1 和 PRRG4 ;LMNBl 和 PRRG4 ;CLEC4D、PRRG4、TNFAIP6 和 VNNl ;CLEC4D、PRRG4 和 TNFAIP6 ;CLEC4D、PRRG4 和 VNNl ;CLEC4D 和 PRRG4 ;PRRG4, TNFAIP6 和 VNNl ;PRRG4 和 VNNl ;PRRG4 和 TNFAIP6 ;PRRG4 ;TNFAIP6 和 VNNl ;VNNl ;ANXA3、TNFAIP6 和 VNNl ;ANXA3、LMNBl、TNFAIP6 禾口 VNNl ;LMNBU TNFAIP6 禾口 VNNl ;CLEC4D、TNFAIP6 和 VNNl ;ANXA3、CLEC4D、TNFAIP6 和 VNNl ;ANXA3、CLEC4D、LMNBl、TNFAIP6 和 VNNl ;CLEC4D、 LMNBl、TNFAIP6 和 VNNl ;ANXA3 和 VNNl ;ANXA3, CLEC4D、LMNBl 和 TNFAIP6 ;CLEC4D、LMNBl 禾口 TNFAIP6 ;CLEC4D 禾口 VNNl ;LMNBl 禾口 VNNl ;ANXA3.CLEC4D 禾口 VNNl ;ANXA3.LMNB1 禾口 VNNl ; ANXA3、LMNBl 和 TNFAIP6 ;LMNBl 和 TNFAIP6 ;CLEC4D、LMNBl 和 VNNl ;ANXA3、CLEC4D、LMNBl 和 VNNl ;ANXA3, CLEC4D 和 TNFAIP6 ;CLEC4D 和 TNFAIP6 ;CLEC4D、LMNBl ;ANXA3, CLEC4D 和 LMNBl ;LMNBl ;ANXA3 和 TNFAIP6 ;ANXA3 和 LMNBl ;TNFAIP6 ;ANXA3 和 CLEC4D ;CLEC4D ;以及 ANXA3。根据本发明的方面,其中一个或更多个结肠直肠癌标记物基因的组由ANXA3、 CLEC4D、LMNB1、PRRG4、TNFAIP6和VNNl的63种可能的组合的任一种组成时,在本发明的受 试者的血液中本发明的基因编码的RNA水平可以被测定为相对所述受试者的血液中IL2RB 基因编码的RNA水平的比例。要理解的是,表示本发明的一组基因编码的RNA水平的数据可以与表示其他基因 的基因产物水平的数据组合,所述其他基因相对于不具有任何结肠直肠病理的受试者在患 有结肠直肠癌的受试者的血液中差异地表达,来测定测试受试者相对于不具有任何结肠直 肠病理、患有结肠直肠癌的概率。在另一个方面,所述方法进一步包括测定患有结肠直肠癌的对照人类受试者群体 的血液中、和/或不患有结肠直肠癌的人类对照受试者群体的血液中所述基因编码的RNA 水平,从而分别提供阳性对照数据和/或阴性对照数据。作为选择,设想的是,在本发明的 对照受试者中本发明的基因编码的RNA水平,可以通过相应于本发明的对照数据的现有技 术数据来提供。本发明的方法可以使用各种类型的对照受试者的任一种来实践。在本发明的方法的一个方面,不患有结肠癌的对照受试者是作为结肠镜检查的结 果被诊断为不具有任何结肠直肠病理的受试者。如在后续的实施例小节中描述的,本发明 的方法可以利用不具有任何结肠直肠病理的受试者作为所述不患有结肠直肠癌的对照受 试者来实践。在本发明的方法的一个方面,患有结肠直肠癌的对照受试者是作为结肠镜检查的 结果被诊断为患有结肠直肠癌的受试者。如在后续的实施例小节中描述的,本发明的方法 可以利用被诊断为不具有任何结肠直肠病理的受试者作为所述不患有结肠直肠癌的对照受试者来实践。本发明的方法此外可以使用各种数量的对照受试者的任一种来实践。本领域普通 技术人员将拥有必需的专门技能来选择充足数量的对照受试者以获得具有期望的统计显 著性的对照数据,用于以期望的可靠性水平实践本发明的方法。例如,本发明的方法可以利用10名或更多、20名或更多、30名或更多、40名或更 多、50名或更多、60名或更多、70名或更多、80名或更多、90名或更多、100名或更多、10名 或更多、20名或更多、30名或更多、40名或更多、50名或更多、60名或更多、70名或更多、80 名或更多、90名或更多、100名或更多、110名或更多、120名或更多、130名或更多、140名或 更多、150名或更多、160名或更多、170名或更多、180名或更多、190名或更多、或200或更 多的患有结肠直肠癌的对照受试者和/或不患有结肠直肠癌的对照受试者来进行。在本发明的一个方面,测试受试者的血液中本发明的基因编码的RNA水平和对照 受试者的血液中所述基因编码的RNA水平通过相同的方法测定。如在下文的实施例小节中 描述的,本发明的方法可以在所述测试受试者的血液中本发明的基因编码的RNA水平和所 述对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平通过相同的方法测定的情况下实践。作为 选择,设想的是,本发明的测试受试者的血液中以及本发明的对照受试者的血液中本发明 的基因的水平可以使用不同的方法测定。要理解的是,使用相同的方法来测定本发明的测 试受试者中和对照受试者中本发明的基因编码的RNA水平,可以用于避免方法与方法间的 校准,以最小化可能来自不同方法的使用的任何变异性。在所述方法的一个方面,测定本发明的受试者的血液中本发明的基因编码的RNA 水平通过测定分离自所述受试者的血液样品中所述基因编码的RNA水平来进行。作为选 择,设想的是,本发明的受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的测定可以通过利用为 此目的的适合的方法测定体内样品中所述基因编码的RNA水平来进行。在所述方法的一个方面,本发明的受试者的血液中本发明的基因编码的RNA水平 在分离自所述受试者的血液的RNA的样品中测定。作为选择,设想的是,本发明的受试者的 血液中本发明的基因的RNA水平可以利用为此目的的适合的方法在样品中测定,所述样品 包括所述受试者的血液的RNA,但是RNA没有从其中分离。本领域中从血液分离RNA的常规采用的各种方法的任一种可以用于从本发明的 受试者的血液分离RNA,以允许本发明的方法的实践。在所述方法的一个方面,本发明的受试者的血液中本发明的基因编码的RNA水平 在全血的样品的RNA中测定。本领域中从全血分离RNA的常规采用的各种方法的任一种可 以用于实践所述方法。作为选择,设想的是,本发明的受试者的血液中本发明的基因编码的RNA水平可 以在血液的部分的样品的RNA中测定,所述血液的部分的样品足够特异性地表达所述基 因,以允许所述方法。这样的血液部分的实例包括分离的白细胞类型的制品、分离的外周血 单核细胞的制品、分离的粒细胞的制品、分离的完整白细胞的制品、分离的特定类型白细胞 的制品、血浆耗尽的血液、分离的淋巴细胞的制品、以及血液的血浆部分。在所述方法的一个方面,从本发明的受试者的全血分离RNA通过利用PAXgene Blood RNA Tube (可从 PreAnalytiX 获得的)根据 PAXgene Blood RNA Kit 方案的说明书 来进行。如在下文的实施例小节中描述的,本发明的方法可以通过利用PAXgene Blood RNATubes测定从本发明的测试和对照受试者的血液分离的RNA中本发明的基因水平来实践。本发明的样品中本发明的基因编码的RNA水平的测定可以以本领域常规实践的 各种方式的任一种来进行。例如,本发明的样品中本发明的基因编码的RNA水平可以通过基于定量多核苷酸 扩增的各种方法的任一种来测定,所述各种方法是本领域中用于测定样品中基因编码的 RNA水平常规采用的。作为选择,本发明的基因编码的RNA水平可以通过基于与固定探针的定量多核苷 酸杂交的各种方法的任一种来测定,所述各种方法是本领域中用于测定样品中基因编码的 RNA水平常规采用的。在本发明的方法的一个方面,所述基于定量多核苷酸扩增的、用于测定本发明的 基因编码的RNA水平的方法是定量逆转录酶-聚合酶链式反应(PCR)分析。本领域中用来 测定样品中基因编码的RNA水平所常规采用的各种类型的定量逆转录酶-PCR分析的任一 种可以用于实践本发明。例如,各种引物组的任一种可以用于进行定量逆转录酶-PCR分 析,以实践本发明的方法。在本发明的方法的一个方面,用于测定本发明的基因编码的RNA水平的定量逆转 录酶-PCR分析是与所述基因编码的RNA互补的DNA的定量实时PCR分析,利用能够特异性 结合与所述基因编码的RNA互补的DNA的扩增产物的标记的探针。例如,定量实时PCR分 析可以利用包含多核苷酸的标记的探针进行,所述多核苷酸能够与DNA的扩增产物的有义 链或反义链选择性杂交,所述DNA与所述基因编码的RNA互补。包含多核苷酸的标记的探 针可以用于实践本发明的方法,所述多核苷酸具有能够与DNA的扩增产物特异性杂交的各 种核酸序列的任一种,所述DNA与所述基因编码的RNA互补。本发明的基因编码的RNA水平的定量实时PCR分析可以以本领域中常规采用的各 种方式的任一种来进行。在本发明的方法的一个方面,定量实时PCR分析通过利用QuantiTect Probe RT-PCR 系统(Qiagen, Valencia, CA ;产品号码 204345) JaciMan 双标记的探针和 Real-Time PCR System 7500仪器(Applied Biosystems),分析从本发明的受试者的血液的RNA制备 的互补DNA来进行。如在后续的实施例小节中描述的,这样的定量实时PCR分析可以用于 实践本发明的方法。如以上说明的,本发明的基因编码的RNA水平可以通过基于与固定探针的定量多 核苷酸杂交的方法来测定。在一个方面,通过基于定量多核苷酸杂交的方法测定本发明的基因编码的RNA水 平利用微阵列,例如,Affymetrix U133Plus 2.0 GeneChip 寡核苷酸阵列(Affymetrix ; Santa Clara, CA) JftSif0如以上说明的,本发明的样品中本发明的基因编码的RNA水平可以利用各种引物 组的任一种和标记的探针、通过定量逆转录酶-PCR分析来测定,来扩增和定量在这样的分 析期间产生的与本发明的标记物基因编码的RNA互补的DNA。在本发明的目标基因编码的 RNA水平的定量逆转录酶-PCR分析中使用的适合的引物的实例在表19中列出。这个表格 进一步列出了用于实践根据本发明的方法的定量实时PCR分析的、包含在标记的探针中的 适合的多核苷酸的实例。
表19.用于定量PCR分析的PCR引物和标记的探针的匹配多核苷酸
权利要求
1.一种测定人类测试受试者中与不患有结肠直肠癌相对的、患有结肠直肠癌的概率的 方法,所述方法包括(a)测定所述测试受试者的血液中ANXA3基因编码的RNA水平,从而产生测试数据;(b)提供表示患有结肠直肠癌的人类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的 阳性对照数据,和提供表示不患有结肠直肠癌的人类对照受试者的血液中所述基因编码的 RNA水平的阴性对照数据;以及(c)测定所述测试数据相应于所述阳性对照数据以及不相应于所述阴性对照数据的概率,其中,所述测试数据相应于所述阳性对照数据以及不相应于所述阴性对照数据的概率 表示所述测试受试者中与不患有结肠直肠癌相对的、患有结肠直肠癌的概率。
2.一种测定人类测试受试者中与不患有结肠直肠癌相对的、患有结肠直肠癌的概率的 方法,所述方法包括(a)测定所述测试受试者的血液中CLEC4D基因编码的RNA水平,从而产生测试数据;(b)提供表示患有结肠直肠癌的人类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的 阳性对照数据,和提供表示不患有结肠直肠癌的人类对照受试者的血液中所述基因编码的 RNA水平的阴性对照数据;以及(c)测定所述测试数据相应于所述阳性对照数据以及不相应于所述阴性对照数据的概率,其中,所述测试数据相应于所述阳性对照数据以及不相应于所述阴性对照数据的概率 表示所述测试受试者中与不患有结肠直肠癌相对的、患有结肠直肠癌的概率。
3.一种测定人类测试受试者中与不患有结肠直肠癌相对的、患有结肠直肠癌的概率的 方法,所述方法包括(a)测定所述测试受试者的血液中IL2RB基因编码的RNA水平,从而产生测试数据;(b)提供表示患有结肠直肠癌的人类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的 阳性对照数据,和提供表示不患有结肠直肠癌的人类对照受试者的血液中所述基因编码的 RNA水平的阴性对照数据;以及(c)测定所述测试数据相应于所述阳性对照数据以及不相应于所述阴性对照数据的概率,其中,所述测试数据相应于所述阳性对照数据以及不相应于所述阴性对照数据的概率 表示所述测试受试者中与不患有结肠直肠癌相对的、患有结肠直肠癌的概率。
4.一种测定人类测试受试者中与不患有结肠直肠癌相对的、患有结肠直肠癌的概率的 方法,所述方法包括(a)测定所述测试受试者的血液中LMNBl基因编码的RNA水平,从而产生测试数据;(b)提供表示患有结肠直肠癌的人类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的 阳性对照数据,和提供表示不患有结肠直肠癌的人类对照受试者的血液中所述基因编码的 RNA水平的阴性对照数据;以及(c)测定所述测试数据相应于所述阳性对照数据以及不相应于所述阴性对照数据的概率,其中,所述测试数据相应于所述阳性对照数据以及不相应于所述阴性对照数据的概率表示所述测试受试者中与不患有结肠直肠癌相对的、患有结肠直肠癌的概率。
5.一种测定人类测试受试者中与不患有结肠直肠癌相对的、患有结肠直肠癌的概率的 方法,所述方法包括(a)测定所述测试受试者的血液中PRRG4基因编码的RNA水平,从而产生测试数据;(b)提供表示患有结肠直肠癌的人类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的 阳性对照数据,和提供表示不患有结肠直肠癌的人类对照受试者的血液中所述基因编码的 RNA水平的阴性对照数据;以及(c)测定所述测试数据相应于所述阳性对照数据以及不相应于所述阴性对照数据的概率,其中,所述测试数据相应于所述阳性对照数据以及不相应于所述阴性对照数据的概率 表示所述测试受试者中与不患有结肠直肠癌相对的、患有结肠直肠癌的概率。
6.一种测定人类测试受试者中与不患有结肠直肠癌相对的、患有结肠直肠癌的概率的 方法,所述方法包括(a)测定所述测试受试者的血液中TNFAIP6基因编码的RNA水平,从而产生测试数据;(b)提供表示患有结肠直肠癌的人类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的 阳性对照数据,和提供表示不患有结肠直肠癌的人类对照受试者的血液中所述基因编码的 RNA水平的阴性对照数据;以及(c)测定所述测试数据相应于所述阳性对照数据以及不相应于所述阴性对照数据的概率,其中,所述测试数据相应于所述阳性对照数据以及不相应于所述阴性对照数据的概率 表示所述测试受试者中与不患有结肠直肠癌相对的、患有结肠直肠癌的概率。
7.一种测定人类测试受试者中与不患有结肠直肠癌相对的、患有结肠直肠癌的概率的 方法,所述方法包括(a)测定所述测试受试者的血液中VNNl基因编码的RNA水平,从而产生测试数据;(b)提供表示患有结肠直肠癌的人类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的 阳性对照数据,和提供表示不患有结肠直肠癌的人类对照受试者的血液中所述基因编码的 RNA水平的阴性对照数据;以及(c)测定所述测试数据相应于所述阳性对照数据以及不相应于所述阴性对照数据的概率,其中,所述测试数据相应于所述阳性对照数据以及不相应于所述阴性对照数据的概率 表示所述测试受试者中与不患有结肠直肠癌相对的、患有结肠直肠癌的概率。
8.权利要求1、2、3、4、5、6或7的方法,其中,所述测试受试者的血液中所述基因编码的 RNA水平的测定通过测定分离自所述测试受试者的血液样品中所述基因编码的RNA水平来 进行。
9.权利要求1、2、3、4、5、6或7的方法,其进一步包括测定患有结肠直肠癌的人类受试 者群体的血液中所述基因编码的RNA水平,从而提供表示患有结肠直肠癌的人类对照受试 者的血液中所述基因编码的RNA水平的阳性对照数据,以及测定不患有结肠直肠癌的人类 受试者群体的血液中所述基因编码的RNA水平,从而提供表示不患有结肠直肠癌的人类对 照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的阴性对照数据。
10.权利要求1、2、3、4、5、6或7的方法,其中,所述测试受试者的血液中所述基因编码 的RNA水平通过定量逆转录酶-聚合酶链式反应分析来测定。
11.权利要求1、2、3、4、5、6或7的方法,其中,所述测试受试者的血液中所述基因编码 的RNA水平和所述对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平通过相同的方法测定。
12.权利要求1、2、3、4、5、6或7的方法,其中,测定所述测试数据相应于所述阳性对照 数据以及不相应于所述阴性对照数据的概率通过向所述测试数据应用数学模型来进行,所 述数学模型从所述阳性对照数据以及从所述阴性对照数据得出,且其中所述数学模型被用 于测定表示所述基因编码的RNA水平的数据相应于所述阳性对照数据以及不相应于所述 阴性对照数据的概率。
13.权利要求1、2、3、4、5、6或7的方法,其中,所述测试受试者的血液中所述基因编码 的RNA水平作为与所述测试受试者的血液中ACTB编码的RNA水平的比例来测定。
14.权利要求13的方法,其中,所述测试受试者的血液中所述基因编码的RNA水平和所 述测试受试者的血液中ACTB编码的RNA水平通过所述基因编码的RNA和ACTB编码的RNA 的双重定量逆转录酶-聚合酶链式反应分析来测定。
15.权利要求1、2、4、5、6或7的方法,其中,所述测试受试者的血液中所述基因编码的 RNA水平作为与所述测试受试者的血液中IL2RB编码的RNA水平的比例来测定。
16.权利要求15的方法,其中,所述测试受试者的血液中所述基因编码的RNA水平和 所述测试受试者的血液中IL2RB编码的RNA水平通过所述基因编码的RNA和IL2RB编码的 RNA的双重定量逆转录酶-聚合酶链式反应分析来测定。
17.一种根据表示测试受试者的血液中ANXA3基因编码的RNA水平的测试数据来测定 人类测试受试者中与不患有结肠直肠癌相对的、患有结肠直肠癌的概率的基于计算机的方 法,所述方法包括计算机实现的步骤(a)向所述测试数据应用数学模型,所述数学模型是从表示患有结肠直肠癌的人类对 照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的阳性对照数据、以及从表示不患有结肠直肠 癌的人类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的阴性对照数据得出的,其中所述 数学模型被用于测定表示所述基因编码的RNA水平的数据相应于所述阳性对照数据以及 不相应于所述阴性对照数据的概率;和(b)输出表示所述基因编码的RNA水平的数据相应于所述阳性对照数据以及不相应于 所述阴性对照数据的概率,其中,所述测试数据相应于所述阳性对照数据以及不相应于所述阴性对照数据的概率 表示所述测试受试者中与不患有结肠直肠癌相对的、患有结肠直肠癌的概率。
18.一种根据表示测试受试者的血液中ANXA3基因编码的RNA水平的测试数据来测定 人类测试受试者中与不患有结肠直肠癌相对的、患有结肠直肠癌的概率的基于计算机的方 法,所述方法包括计算机实现的步骤向计算机输入表示所述测试受试者的血液中CLEC4D 基因编码的RNA水平的测试数据;和使得所述计算机向所述测试数据应用数学模型,所述数学模型从表示患有结肠直肠癌 的人类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的阳性对照数据、以及从表示不患有 结肠直肠癌的人类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的阴性对照数据得出,其 中所述数学模型被用于测定表示所述基因编码的RNA水平的数据相应于所述阳性对照数据以及不相应于所述阴性对照数据的概率;和(b)输出所述表示所述基因编码的RNA水平的数据相应于所述阳性对照数据以及不相 应于所述阴性对照数据的概率,其中,所述测试数据相应于所述阳性对照数据以及不相应于所述阴性对照数据的概率 表示所述测试受试者中与不患有结肠直肠癌相对的、患有结肠直肠癌的概率。
19.一种根据表示测试受试者的血液中ANXA3基因编码的RNA水平的测试数据来测定 人类测试受试者中与不患有结肠直肠癌相对的、患有结肠直肠癌的概率的基于计算机的方 法,所述方法包括计算机实现的步骤向计算机输入表示所述测试受试者的血液中IL2RB 基因编码的RNA水平的测试数据;和使得所述计算机向所述测试数据应用数学模型,所述数学模型从表示患有结肠直肠癌 的人类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的阳性对照数据、以及从表示不患有 结肠直肠癌的人类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的阴性对照数据得出,其 中所述数学模型被用于测定表示所述基因编码的RNA水平的数据相应于所述阳性对照数 据以及不相应于所述阴性对照数据的概率;和(b)输出所述表示所述基因编码的RNA水平的数据相应于所述阳性对照数据以及不相 应于所述阴性对照数据的概率,其中,所述测试数据相应于所述阳性对照数据以及不相应于所述阴性对照数据的概率 表示所述测试受试者中与不患有结肠直肠癌相对的、患有结肠直肠癌的概率。
20.一种根据表示测试受试者的血液中ANXA3基因编码的RNA水平的测试数据来测定 人类测试受试者中与不患有结肠直肠癌相对的、患有结肠直肠癌的概率的基于计算机的方 法,所述方法包括计算机实现的步骤(a)向所述测试数据应用数学模型,所述数学模型是从表示患有结肠直肠癌的人类对 照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的阳性对照数据、以及从表示不患有结肠直肠 癌的人类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的阴性对照数据得出的,其中所述 数学模型被用于测定表示所述基因编码的RNA水平的数据相应于所述阳性对照数据以及 不相应于所述阴性对照数据的概率;和(b)输出所述表示所述基因编码的RNA水平的数据相应于所述阳性对照数据以及不相 应于所述阴性对照数据的概率,其中,所述测试数据相应于所述阳性对照数据以及不相应于所述阴性对照数据的概率 表示所述测试受试者中与不患有结肠直肠癌相对的、患有结肠直肠癌的概率。
21.一种根据表示测试受试者的血液中ANXA3基因编码的RNA水平的测试数据来测定 人类测试受试者中与不患有结肠直肠癌相对的、患有结肠直肠癌的概率的基于计算机的方 法,所述方法包括计算机实现的步骤(a)向所述测试数据应用数学模型,所述数学模型是从表示患有结肠直肠癌的人类对 照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的阳性对照数据、以及从表示不患有结肠直肠 癌的人类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的阴性对照数据得出的,其中所述 数学模型被用于测定表示所述基因编码的RNA水平的数据相应于所述阳性对照数据以及 不相应于所述阴性对照数据的概率;和(b)输出所述表示所述基因编码的RNA水平的数据相应于所述阳性对照数据以及不相应于所述阴性对照数据的概率,其中,所述测试数据相应于所述阳性对照数据以及不相应于所述阴性对照数据的概率 表示所述测试受试者中与不患有结肠直肠癌相对的、患有结肠直肠癌的概率。
22.一种根据表示测试受试者的血液中ANXA3基因编码的RNA水平的测试数据来测定 人类测试受试者中与不患有结肠直肠癌相对的、患有结肠直肠癌的概率的基于计算机的方 法,所述方法包括计算机实现的步骤(a)向所述测试数据应用数学模型,所述数学模型是从表示患有结肠直肠癌的人类对 照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的阳性对照数据、以及从表示不患有结肠直肠 癌的人类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的阴性对照数据得出的,其中所述 数学模型被用于测定表示所述基因编码的RNA水平的数据相应于所述阳性对照数据以及 不相应于所述阴性对照数据的概率;和(b)输出所述表示所述基因编码的RNA水平的数据相应于所述阳性对照数据以及不相 应于所述阴性对照数据的概率,其中,所述测试数据相应于所述阳性对照数据以及不相应于所述阴性对照数据的概率 表示所述测试受试者中与不患有结肠直肠癌相对的、患有结肠直肠癌的概率。
23.一种根据表示测试受试者的血液中ANXA3基因编码的RNA水平的测试数据来测定 人类测试受试者中与不患有结肠直肠癌相对的、患有结肠直肠癌的概率的基于计算机的方 法,所述方法包括计算机实现的步骤(a)向所述测试数据应用数学模型,所述数学模型是从表示患有结肠直肠癌的人类对 照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的阳性对照数据、以及从表示不患有结肠直肠 癌的人类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的阴性对照数据得出的,其中所述 数学模型被用于测定表示所述基因编码的RNA水平的数据相应于所述阳性对照数据以及 不相应于所述阴性对照数据的概率;和(b)输出所述表示所述基因编码的RNA水平的数据相应于所述阳性对照数据以及不相 应于所述阴性对照数据的概率,其中,所述测试数据相应于所述阳性对照数据以及不相应于所述阴性对照数据的概率 表示所述测试受试者中与不患有结肠直肠癌相对的、患有结肠直肠癌的概率。
24.权利要求17、18、19、20、21、22或23的方法,其中,所述测试受试者的血液中所述基 因编码的RNA水平通过定量逆转录酶-聚合酶链式反应分析来测定。
25.权利要求17、18、19、20、21、22或23的方法,其中,所述测试受试者的血液中所述基 因编码的RNA水平和所述对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平通过相同的方法测 定。
26.权利要求17、18、19、20、21、22或23的方法,其中,所述测试受试者的血液中所述基 因编码的RNA水平作为与所述测试受试者的血液中ACTB编码的RNA水平的比例来测定。
27.权利要求沈的方法,其中,所述测试受试者的血液中所述基因编码的RNA水平和所 述测试受试者的血液中ACTB编码的RNA水平通过所述基因编码的RNA和ACTB编码的RNA 的双重定量逆转录酶-聚合酶链式反应分析来测定。
28.权利要求17、18、20、21、22或23的方法,其中,所述测试受试者的血液中所述基因 编码的RNA水平作为与所述测试受试者的血液中IL2RB编码的RNA水平的比例来测定。
29.权利要求观的方法,其中,所述测试受试者的血液中所述基因编码的RNA水平和 所述测试受试者的血液中IL2RB编码的RNA水平通过所述基因编码的RNA和IL2RB编码的 RNA的双重定量逆转录酶-聚合酶链式反应分析来测定。
30.一种测定人类测试受试者中与不患有结肠直肠癌相对的、患有结肠直肠癌的概率 的方法,所述方法包括,对于选自由ANXA3、CLEC4D、IL2RB、LMNBU PRRG4、TNFAIP6和VNNl 组成的组的一组一个或更多个基因的每一个基因(a)测定所述测试受试者的血液中所述基因编码的RNA水平,从而产生测试数据;(b)提供表示患有结肠直肠癌的人类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的 阳性对照数据,和提供表示不患有结肠直肠癌的人类对照受试者的血液中所述基因编码的 RNA水平的阴性对照数据;(c)测定所述测试数据相应于所述阳性对照数据以及不相应于所述阴性对照数据的概率,其中,所述测试数据相应于所述阳性对照数据以及不相应于所述阴性对照数据的概率 表示所述测试受试者中与不患有结肠直肠癌相对的、患有结肠直肠癌的概率。
31.权利要求30的方法,其中,所述测试受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的测 定通过测定分离自所述测试受试者的血液样品中所述基因编码的RNA水平来进行。
32.权利要求30的方法,其进一步包括测定患有结肠直肠癌的人类受试者群体的血液 中所述基因编码的RNA水平,从而提供表示患有结肠直肠癌的人类对照受试者的血液中所 述基因编码的RNA水平的阳性对照数据,和测定不患有结肠直肠癌的人类受试者群体的血 液中所述基因编码的RNA水平,从而提供表示不患有结肠直肠癌的人类对照受试者的血液 中所述基因编码的RNA水平的阴性对照数据。
33.权利要求30的方法,其中,所述测试受试者的血液中所述基因编码的RNA水平通过 定量逆转录酶-聚合酶链式反应分析来测定。
34.权利要求30的方法,其中,所述测试受试者的血液中所述基因编码的RNA水平和所 述对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平通过相同的方法测定。
35.权利要求30的方法,其中,测定所述测试数据相应于所述阳性对照数据以及不相 应于所述阴性对照数据的概率通过向所述测试数据应用数学模型来进行,所述数学模型从 所述阳性对照数据以及从所述阴性对照数据得出,且其中所述数学模型被用于测定表示所 述基因编码的RNA水平的数据相应于所述阳性对照数据以及不相应于所述阴性对照数据 的概率。
36.权利要求30的方法,其中,所述测试受试者的血液中所述基因编码的RNA水平作为 与所述测试受试者的血液中ACTB编码的RNA水平的比例来测定。
37.权利要求36的方法,其中,所述测试受试者的血液中所述基因编码的RNA水平和所 述测试受试者的血液中ACTB编码的RNA水平通过所述基因编码的RNA和ACTB编码的RNA 的双重定量逆转录酶-聚合酶链式反应分析来测定。
38.权利要求30的方法,其中,一种或更多种基因的组是选自由ANXA3、CLEC4D、LMNB1、 PRRG4、TNFAIP6和VNNl组成的组的一个或更多个基因的组,并且其中所述测试受试者的血 液中所述基因编码的RNA水平作为与所述测试受试者的血液中IL2RB编码的RNA水平的比 例来测定。
39.权利要求38的方法,其中,所述测试受试者的血液中所述基因编码的RNA水平和 所述测试受试者的血液中IL2RB编码的RNA水平通过所述基因编码的RNA和IL2RB编码的 RNA的双重定量逆转录酶-聚合酶链式反应分析来测定。
40.一种根据表示测试受试者的血液中基因编码的RNA水平的测试数据来测定人类测 试受试者中与不患有结肠直肠癌相对的、患有结肠直肠癌的概率的基于计算机的方法,所 述方法包括,对于选自由ANXA3、CLEC4D、IL2RB、LMNBl、raRG4、TNFAIP6和VNNl组成的组的 一组一个或更多个基因的每一个基因,计算机实现的步骤(a)向所述测试数据应用数学模型,所述数学模型是从表示患有结肠直肠癌的人类对 照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的阳性对照数据、以及从表示不患有结肠直肠 癌的人类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的阴性对照数据得出的,其中所述 数学模型被用于测定表示所述基因编码的RNA水平的数据相应于所述阳性对照数据以及 不相应于所述阴性对照数据的概率;和(b)输出所述表示所述基因编码的RNA水平的数据相应于所述阳性对照数据以及不相 应于所述阴性对照数据的概率,其中,所述测试数据相应于所述阳性对照数据以及不相应于所述阴性对照数据的概率 表示所述测试受试者中与不患有结肠直肠癌相对的、患有结肠直肠癌的概率。
41.权利要求40的方法,其中,所述测试受试者的血液中所述基因编码的RNA水平通过 定量逆转录酶-聚合酶链式反应分析来测定。
42.权利要求40的方法,其中,所述测试受试者的血液中所述基因编码的RNA水平和所 述对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平通过相同的方法测定。
43.权利要求40的方法,其中,所述测试受试者的血液中所述基因编码的RNA水平作为 与所述测试受试者的血液中ACTB编码的RNA水平的比例来测定。
44.权利要求43的方法,其中,所述测试受试者的血液中所述基因编码的RNA水平和所 述测试受试者的血液中ACTB编码的RNA水平通过所述基因编码的RNA和ACTB编码的RNA 的双重定量逆转录酶-聚合酶链式反应分析来测定。
45.权利要求40的方法,其中,一种或更多种基因的组是选自由4似々3、0^(40、01他1、 PRRG4、TNFAIP6和VNNl组成的组的一个或更多个基因的组,并且其中所述测试受试者的血 液中所述基因编码的RNA水平作为与所述测试受试者的血液中IL2RB编码的RNA水平的比 例来测定。
46.权利要求45的方法,其中,所述测试受试者的血液中所述基因编码的RNA水平和 所述测试受试者的血液中IL2RB编码的RNA水平通过所述基因编码的RNA和IL2RB编码的 RNA的双重定量逆转录酶-聚合酶链式反应分析来测定。
47.权利要求40的方法,其中,所述一种或更多种基因的组由PRRG4组成。
48.权利要求40的方法,其中,所述一种或更多种基因的组由IL2RB和PRRG4组成。
49.一种试剂盒,其包含包装物并且,对于选自由ACTB、ANXA3、CLEC4D、IL2RB、LMNBl、 PRRG4、TNFAIP6和VNNl组成的组的一组两种或更多种基因的每个基因,含有能够产生DNA 的扩增产物的引物组,所述DNA与所述人类受试者中仅由所述基因编码的RNA互补。
50.权利要求49的试剂盒,其进一步含有选自由热稳定聚合酶、逆转录酶、脱氧核苷三 磷酸、核苷三磷酸和酶缓冲液组成的组的两种或更多种成分。
51.权利要求49的试剂盒,其进一步含有至少一种标记的探针,所述探针能够选择性 地杂交所述扩增产物的有义链或反义链。
52.权利要求49的试剂盒,其进一步含有具有保存在其上的指令的计算机可读媒介, 所述指令当被计算机执行时是可操作的,用于向表示人类测试受试者的血液中所述基因编 码的RNA水平的测试数据应用数学模型,其中所述数学模型从表示患有结肠直肠癌的人类 对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的阳性对照数据、以及从表示不患有结肠直 肠癌的人类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的阴性对照数据得出,其中所述 数学模型被用于测定表示所述基因编码的RNA水平的数据相应于所述阳性对照数据以及 不相应于所述阴性对照数据的概率,并且其中所述测试数据相应于所述阳性对照数据以及 不相应于所述阴性对照数据的概率表示所述测试受试者中与不患有结肠直肠癌相对的、患 有结肠直肠癌的概率。
53.权利要求49的试剂盒,其中,所述一种或更多种基因的组由ACTB和选自由ANXA3、 CLEC4D、IL2RB、LMNB1、PRRG4、TNFAIP6和VNNl组成的组的一种或更多种基因组成。
54.权利要求49的试剂盒,其中,所述一个或更多个基因的组由ACTB和ANXA3组成。
55.权利要求49的试剂盒,其中,所述一个或更多个基因的组由ACTB和CLEC4D组成。
56.权利要求49的试剂盒,其中,所述一个或更多个基因的组由ACTB和IL2RB组成。
57.权利要求49的试剂盒,其中,所述一个或更多个基因的组由ACTB和LMNBl组成。
58.权利要求49的试剂盒,其中,所述一个或更多个基因的组由ACTB和PRRG4组成。
59.权利要求49的试剂盒,其中,所述一个或更多个基因的组由ACTB和TNFAIP6组成。
60.权利要求49的试剂盒,其中,所述一个或更多个基因的组由ACTB和VNNl组成。
61.权利要求49的试剂盒,其中,所述一种或更多种基因的组由IL2RB和选自由 ANXA3、CLEC4D、LMNB1、PRRG4、TNFAIP6和VNNl组成的组的一种或更多种基因组成。
62.权利要求49的试剂盒,其中,所述一个或更多个基因的组由IL2RB和ANXA3组成。
63.权利要求49的试剂盒,其中,所述一个或更多个基因的组由IL2RB和CLEC4D组成。
64.权利要求49的试剂盒,其中,所述一个或更多个基因的组由IL2RB和LMNBl组成。
65.权利要求49的试剂盒,其中,所述一个或更多个基因的组由IL2RB和PRRG4组成。
66.权利要求49的试剂盒,其中,所述一个或更多个基因的组由IL2RB和TNFAIP6组成。
67.权利要求49的试剂盒,其中,所述一个或更多个基因的组由IL2RB和VNNl组成。
68.一种将人类测试受试者分类为相比不患有结肠直肠癌更可能患有结肠直肠癌的方 法,所述方法包括(a)测定所述测试受试者的血液中ANXA3基因编码的RNA水平,从而产生测试数据;(b)提供表示不患有结肠直肠癌的人类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平 的阴性对照数据;和(c)向所述测试数据和向所述阴性对照数据应用数学公式用于产生一值,所述值指明 所述测试受试者的血液中所述基因编码的RNA水平是否高于不患有结肠直肠癌的人类对 照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平,其中,所述测试受试者的血液中所述基因编码的RNA水平高于不患有结肠直肠癌的人 类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的所述值的指示,将所述测试受试者分类为相比不患有结肠直肠癌更可能患有结肠直肠癌。
69.一种将人类测试受试者分类为相比不患有结肠直肠癌更可能患有结肠直肠癌的方 法,所述方法包括(a)测定所述测试受试者的血液中CLEC4D基因编码的RNA水平,从而产生测试数据;(b)提供表示不患有结肠直肠癌的人类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平 的阴性对照数据;和(c)向所述测试数据和向所述阴性对照数据应用数学公式用于产生一值,所述值指明 所述测试受试者的血液中所述基因编码的RNA水平是否高于不患有结肠直肠癌的人类对 照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平,其中,所述测试受试者的血液中所述基因编码的RNA水平高于不患有结肠直肠癌的人 类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的所述值的指示,将所述测试受试者分类 为相比不患有结肠直肠癌更可能患有结肠直肠癌。
70.一种将人类测试受试者分类为相比不患有结肠直肠癌更可能患有结肠直肠癌的方 法,所述方法包括(a)测定所述测试受试者的血液中IL2RB基因编码的RNA水平,从而产生测试数据;(b)提供表示不患有结肠直肠癌的人类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平 的阴性对照数据;和(c)向所述测试数据和向所述阴性对照数据应用数学公式用于产生一值,所述值指明 所述测试受试者的血液中所述基因编码的RNA水平是否低于不患有结肠直肠癌的人类对 照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平,其中,所述测试受试者的血液中所述基因编码的RNA水平低于不患有结肠直肠癌的人 类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的所述值的指示,将所述测试受试者分类 为相比不患有结肠直肠癌更可能患有结肠直肠癌。
71.一种将人类测试受试者分类为相比不患有结肠直肠癌更可能患有结肠直肠癌的方 法,所述方法包括(a)测定所述测试受试者的血液中LMNBl基因编码的RNA水平,从而产生测试数据;(b)提供表示不患有结肠直肠癌的人类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平 的阴性对照数据;和(c)向所述测试数据和向所述阴性对照数据应用数学公式用于产生一值,所述值指明 所述测试受试者的血液中所述基因编码的RNA水平是否高于不患有结肠直肠癌的人类对 照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平,其中,所述测试受试者的血液中所述基因编码的RNA水平高于不患有结肠直肠癌的人 类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的所述值的指示,将所述测试受试者分类 为相比不患有结肠直肠癌更可能患有结肠直肠癌。
72.—种将人类测试受试者分类为相比不患有结肠直肠癌更可能患有结肠直肠癌的方 法,所述方法包括(a)测定所述测试受试者的血液中PRRG4基因编码的RNA水平,从而产生测试数据;(b)提供表示不患有结肠直肠癌的人类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平 的阴性对照数据;和(C)向所述测试数据和向所述阴性对照数据应用数学公式用于产生一值,所述值指明 所述测试受试者的血液中所述基因编码的RNA水平是否高于不患有结肠直肠癌的人类对 照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平,其中,所述测试受试者的血液中所述基因编码的RNA水平高于不患有结肠直肠癌的人 类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的所述值的指示,将所述测试受试者分类 为相比不患有结肠直肠癌更可能患有结肠直肠癌。
73.一种将人类测试受试者分类为相比不患有结肠直肠癌更可能患有结肠直肠癌的方 法,所述方法包括(a)测定所述测试受试者的血液中TNFAIP6基因编码的RNA水平,从而产生测试数据;(b)提供表示不患有结肠直肠癌的人类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平 的阴性对照数据;和(c)向所述测试数据和向所述阴性对照数据应用数学公式用于产生一值,所述值指明 所述测试受试者的血液中所述基因编码的RNA水平是否高于不患有结肠直肠癌的人类对 照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平,其中,所述测试受试者的血液中所述基因编码的RNA水平高于不患有结肠直肠癌的人 类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的所述值的指示,将所述测试受试者分类 为相比不患有结肠直肠癌更可能患有结肠直肠癌。
74.一种将人类测试受试者分类为相比不患有结肠直肠癌更可能患有结肠直肠癌的方 法,所述方法包括(a)测定所述测试受试者的血液中VNNl基因编码的RNA水平,从而产生测试数据;(b)提供表示不患有结肠直肠癌的人类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平 的阴性对照数据;和(c)向所述测试数据和向所述阴性对照数据应用数学公式用于产生一值,所述值指明 所述测试受试者的血液中所述基因编码的RNA水平是否高于不患有结肠直肠癌的人类对 照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平,其中,所述测试受试者的血液中所述基因编码的RNA水平高于不患有结肠直肠癌的人 类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的所述值的指示,将所述测试受试者分类 为相比不患有结肠直肠癌更可能患有结肠直肠癌。
75.权利要求68、69、70、71、72、73或74的方法,其中,所述测试受试者的血液中所述基 因编码的RNA水平的测定通过测定分离自所述测试受试者的血液样品中所述基因编码的 RNA水平来进行。
76.权利要求68、69、70、71、72、73或74的方法,其进一步包括测定不患有结肠直肠癌 的人类受试者群体的血液中所述基因编码的RNA水平,从而提供表示不患有结肠直肠癌的 人类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的阴性对照数据。
77.权利要求68、69、70、71、72、73或74的方法,其中,所述测试受试者的血液中所述基 因编码的RNA水平通过定量逆转录酶-聚合酶链式反应分析来测定。
78.权利要求68、69、70、71、72、73或74的方法,其中,所述测试受试者的血液中所述基 因编码的RNA水平和所述对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平通过相同的方法测 定。
79.权利要求68、69、70、71、72、73或74的方法,其中,所述测试受试者的血液中所述基 因编码的RNA水平作为与所述测试受试者的血液中ACTB编码的RNA水平的比例来测定。
80.权利要求79的方法,其中,所述测试受试者的血液中所述基因编码的RNA水平和所 述测试受试者的血液中ACTB编码的RNA水平通过所述基因编码的RNA和ACTB编码的RNA 的双重定量逆转录酶-聚合酶链式反应分析来测定。
81.权利要求68、69、71、72、73或74的方法,其中,所述测试受试者的血液中所述基因 编码的RNA水平作为与所述测试受试者的血液中IL2RB编码的RNA水平的比例来测定。
82.权利要求81的方法,其中,所述测试受试者的血液中所述基因编码的RNA水平和 所述测试受试者的血液中IL2RB编码的RNA水平通过所述基因编码的RNA和IL2RB编码的 RNA的双重定量逆转录酶-聚合酶链式反应分析来测定。
83.一种将人类测试受试者分类为相比不患有结肠直肠癌更可能患有结肠直肠癌的基 于计算机的方法,所述方法包括计算机实现的步骤(a)向表示所述测试受试者的血液中ANXA3基因编码的RNA水平的测试数据、以及向表 示不患有结肠直肠癌的人类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的阴性对照数 据应用数学公式用于产生一值,所述值指明所述测试受试者的血液中所述基因编码的RNA 水平是否高于不患有结肠直肠癌的人类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平;和(b)输出所述值,其中,所述测试受试者的血液中所述基因编码的RNA水平高于不患有结肠直肠癌的人 类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的所述值的指示,将所述测试受试者分类 为相比不患有结肠直肠癌更可能患有结肠直肠癌。
84.一种将人类测试受试者分类为相比不患有结肠直肠癌更可能患有结肠直肠癌的基 于计算机的方法,所述方法包括计算机实现的步骤(a)向表示所述测试受试者的血液中CLEC4D基因编码的RNA水平的测试数据、以及 向表示不患有结肠直肠癌的人类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的阴性对 照数据应用数学公式用于产生一值,所述值指明所述测试受试者的血液中所述基因编码的 RNA水平是否高于不患有结肠直肠癌的人类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水 平;和(b)输出所述值,其中,所述测试受试者的血液中所述基因编码的RNA水平高于不患有结肠直肠癌的人 类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的所述值的指示,将所述测试受试者分类 为相比不患有结肠直肠癌更可能患有结肠直肠癌。
85.一种将人类测试受试者分类为相比不患有结肠直肠癌更可能患有结肠直肠癌的基 于计算机的方法,所述方法包括计算机实现的步骤(a)向表示所述测试受试者的血液中IL2RB基因编码的RNA水平的测试数据、以及向表 示不患有结肠直肠癌的人类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的阴性对照数 据应用数学公式用于产生一值,所述值指明所述测试受试者的血液中所述基因编码的RNA 水平是否低于不患有结肠直肠癌的人类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平;和(b)输出所述值,其中,所述测试受试者的血液中所述基因编码的RNA水平低于不患有结肠直肠癌的人类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的所述值的指示,将所述测试受试者分类 为相比不患有结肠直肠癌更可能患有结肠直肠癌。
86.一种将人类测试受试者分类为相比不患有结肠直肠癌更可能患有结肠直肠癌的基 于计算机的方法,所述方法包括计算机实现的步骤(a)向表示所述测试受试者的血液中LMNBl基因编码的RNA水平的测试数据、以及向表 示不患有结肠直肠癌的人类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的阴性对照数 据应用数学公式用于产生一值,所述值指明所述测试受试者的血液中所述基因编码的RNA 水平是否高于不患有结肠直肠癌的人类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平;和(b)输出所述值,其中,所述测试受试者的血液中所述基因编码的RNA水平高于不患有结肠直肠癌的人 类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的所述值的指示,将所述测试受试者分类 为相比不患有结肠直肠癌更可能患有结肠直肠癌。
87.一种将人类测试受试者分类为相比不患有结肠直肠癌更可能患有结肠直肠癌的基 于计算机的方法,所述方法包括计算机实现的步骤(a)向表示所述测试受试者的血液中PRRG4基因编码的RNA水平的测试数据、以及向表 示不患有结肠直肠癌的人类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的阴性对照数 据应用数学公式用于产生一值,所述值指明所述测试受试者的血液中所述基因编码的RNA 水平是否高于不患有结肠直肠癌的人类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平;和(b)输出所述值,其中,所述测试受试者的血液中所述基因编码的RNA水平高于不患有结肠直肠癌的人 类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的所述值的指示,将所述测试受试者分类 为相比不患有结肠直肠癌更可能患有结肠直肠癌。
88.一种将人类测试受试者分类为相比不患有结肠直肠癌更可能患有结肠直肠癌的基 于计算机的方法,所述方法包括计算机实现的步骤(a)向表示所述测试受试者的血液中TNFAIP6基因编码的RNA水平的测试数据、以及 向表示不患有结肠直肠癌的人类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的阴性对 照数据应用数学公式用于产生一值,所述值指明所述测试受试者的血液中所述基因编码的 RNA水平是否高于不患有结肠直肠癌的人类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水 平;和(b)输出所述值,其中,所述测试受试者的血液中所述基因编码的RNA水平高于不患有结肠直肠癌的人 类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的所述值的指示,将所述测试受试者分类 为相比不患有结肠直肠癌更可能患有结肠直肠癌。
89.一种将人类测试受试者分类为相比不患有结肠直肠癌更可能患有结肠直肠癌的基 于计算机的方法,所述方法包括计算机实现的步骤(a)向表示所述测试受试者的血液中VNNl基因编码的RNA水平的测试数据、以及向表 示不患有结肠直肠癌的人类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的阴性对照数 据应用数学公式用于产生一值,所述值指明所述测试受试者的血液中所述基因编码的RNA 水平是否高于不患有结肠直肠癌的人类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平;和(b)输出所述值,其中,所述测试受试者的血液中所述基因编码的RNA水平高于不患有结肠直肠癌的人 类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的所述值的指示,将所述测试受试者分类 为相比不患有结肠直肠癌更可能患有结肠直肠癌。
90.权利要求83、84、85、86、87、88或89的方法,其中,所述测试受试者的血液中所述基 因编码的RNA水平通过定量逆转录酶-聚合酶链式反应分析来测定。
91.权利要求83、84、85、86、87、88或89的方法,其中,所述测试受试者的血液中所述基 因编码的RNA水平和所述对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平通过相同的方法测 定。
92.权利要求83、84、85、86、87、88或89的方法,其中,所述测试受试者的血液中所述基 因编码的RNA水平作为与所述测试受试者的血液中ACTB编码的RNA水平的比例来测定。
93.权利要求92的方法,其中,所述测试受试者的血液中所述基因编码的RNA水平和所 述测试受试者的血液中ACTB编码的RNA水平通过所述基因编码的RNA和ACTB编码的RNA 的双重定量逆转录酶-聚合酶链式反应分析来测定。
94.权利要求83、84、86、87、88或89的方法,其中,所述测试受试者的血液中所述基因 编码的RNA水平作为与所述测试受试者的血液中IL2RB编码的RNA水平的比例来测定。
95.权利要求94的方法,其中,所述测试受试者的血液中所述基因编码的RNA水平和 所述测试受试者的血液中IL2RB编码的RNA水平通过所述基因编码的RNA和IL2RB编码的 RNA的双重定量逆转录酶-聚合酶链式反应分析来测定。
96.一种将人类测试受试者分类为相比不患有结肠直肠癌更可能患有结肠直肠癌的方 法,所述方法包括,对于选自由ANXA3、CLEC4D、IL2RB、LMNBU PRRG4, TNFAIP6和VNNl组成 的组的一组一个或更多个基因的每一个基因(a)测定所述测试受试者的血液中所述基因编码的RNA水平,从而产生测试数据;(b)提供表示不患有结肠直肠癌的人类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平 的阴性对照数据;和(c)向所述测试数据、以及向所述阴性对照数据应用数学公式用于产生一值,所述值指 明,对于ANXA3、CLEC4D、LMNB1、PRRG4、TNFAIP6和VNNl,所述测试受试者的血液中所述基因 编码的RNA水平是否高于不患有结肠直肠癌的人类对照受试者的血液中所述基因编码的 RNA水平,以及指明,对于IL2RB,所述测试受试者的血液中所述基因编码的RNA水平是否低 于不患有结肠直肠癌的人类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平,其中,对于ANXA3、CLEC4D、LMNBl、raRG4、TNFAIP6和VNNl,所述测试受试者的血液中所 述基因编码的RNA水平高于不患有结肠直肠癌的人类对照受试者的血液中所述基因编码 的RNA水平的所述值的指示,将所述测试受试者分类为相比不患有结肠直肠癌更可能患有 结肠直肠癌,和其中,对于IL2RB,所述测试受试者的血液中所述基因编码的RNA水平低于 不患有结肠直肠癌的人类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的所述值的指示, 将所述测试受试者分类为相比不患有结肠直肠癌更可能患有结肠直肠癌。
97.权利要求96的方法,其中,所述测试受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的测 定通过测定分离自所述测试受试者的血液样品中所述基因编码的RNA水平来进行。
98.权利要求96的方法,其进一步包括测定患有结肠直肠癌的人类受试者群体的血液中所述基因编码的RNA水平,从而提供表示患有结肠直肠癌的人类对照受试者的血液中所 述基因编码的RNA水平的阳性对照数据,和测定不患有结肠直肠癌的人类受试者群体的血 液中所述基因编码的RNA水平,从而提供表示不患有结肠直肠癌的人类对照受试者的血液 中所述基因编码的RNA水平的阴性对照数据。
99.权利要求96的方法,其中,所述测试受试者的血液中所述基因编码的RNA水平通过 定量逆转录酶-聚合酶链式反应分析来测定。
100.权利要求96的方法,其中,所述测试受试者的血液中所述基因编码的RNA水平和 所述对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平通过相同的方法测定。
101.权利要求96的方法,其中,所述测试受试者的血液中所述基因编码的RNA水平作 为与所述测试受试者的血液中ACTB编码的RNA水平的比例来测定。
102.权利要求101的方法,其中,所述测试受试者的血液中所述基因编码的RNA水平 和所述测试受试者的血液中ACTB编码的RNA水平通过所述基因编码的RNA和ACTB编码的 RNA的双重定量逆转录酶-聚合酶链式反应分析来测定。
103.权利要求96的方法,其中,一种或更多种基因的组是选自由ANXA3、CLEC4D、 LMNBl、PRRG4、TNFAIP6和VNNl组成的组的一个或更多个基因的组,其中所述测试受试者的 血液中所述基因编码的RNA水平作为与所述测试受试者的血液中IL2RB编码的RNA水平的 比例来测定。
104.权利要求103的方法,其中,所述测试受试者的血液中所述基因编码的RNA水平和 所述测试受试者的血液中IL2RB编码的RNA水平通过所述基因编码的RNA和IL2RB编码的 RNA的双重定量逆转录酶-聚合酶链式反应分析来测定。
105.—种将人类测试受试者分类为相比不患有结肠直肠癌更可能患有结肠直肠癌 的基于计算机的方法,所述方法包括,对于选自由ANXA3、CLEC4D、IL2RB、LMNBl、PRRG4、 TNFAIP6和VNNl组成的组的一组一个或更多个基因的每一个基因,计算机实现的步骤(a)向表示所述测试受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的测试数据、以及向 表示不患有结肠直肠癌的人类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的阴性对照 数据应用公式用于计算一值,所述值指明,对于ANXA3、CLEC4D、LMNBU PRRG4、TNFAIP6和 VNN1,所述测试受试者的血液中所述基因编码的RNA水平是否高于不患有结肠直肠癌的人 类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平,以及指明,对于IL2RB,所述测试受试者 的血液中所述基因编码的RNA水平是否低于不患有结肠直肠癌的人类对照受试者的血液 中所述基因编码的RNA水平,和(b)输出所述值,其中,对于ANXA3、CLEC4D、LMNBl、raRG4、TNFAIP6和VNNl,所述测试受试者的血液中所 述基因编码的RNA水平高于不患有结肠直肠癌的人类对照受试者的血液中所述基因编码 的RNA水平的指示,将所述测试受试者分类为相比不患有结肠直肠癌更可能患有结肠直肠 癌,以及其中,对于IL2RB,所述测试受试者的血液中所述基因编码的RNA水平低于不患有 结肠直肠癌的人类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的指示,将所述测试受试 者分类为相比不患有结肠直肠癌更可能患有结肠直肠癌。
106.权利要求105的方法,其中,所述测试受试者的血液中所述基因编码的RNA水平通 过定量逆转录酶-聚合酶链式反应分析来测定。
107.权利要求105的方法,其中,所述测试受试者的血液中所述基因编码的RNA水平和 所述对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平通过相同的方法测定。
108.权利要求105的方法,其中,所述测试受试者的血液中所述基因编码的RNA水平作 为与所述测试受试者的血液中ACTB编码的RNA水平的比例来测定。
109.权利要求108的方法,其中,所述测试受试者的血液中所述基因编码的RNA水平 和所述测试受试者的血液中ACTB编码的RNA水平通过所述基因编码的RNA和ACTB编码的 RNA的双重定量逆转录酶-聚合酶链式反应分析来测定。
110.权利要求105的方法,其中,一种或更多种基因的组是选自由ANXA3、CLEC4D、 LMNBl、PRRG4、TNFAIP6和VNNl组成的组的一个或更多个基因的组,其中所述测试受试者的 血液中所述基因编码的RNA水平作为与所述测试受试者的血液中IL2RB编码的RNA水平的 比例来测定。
111.权利要求110的方法,其中,所述测试受试者的血液中所述基因编码的RNA水平和 所述测试受试者的血液中IL2RB编码的RNA水平通过所述基因编码的RNA和IL2RB编码的 RNA的双重定量逆转录酶-聚合酶链式反应分析来测定。
112.权利要求105的方法,其中,所述一种或更多种基因的组由PRRG4组成。
113.权利要求105的方法,其中,所述一种或更多种基因的组由IL2RB和PRRG4组成。
114.一种测定相对于一般群体、测试受试者是否处于患有结肠直肠癌的提高的风险中 的方法,包括(a)从所述受试者获得血液测试样品;和(i)测定所述血液测试样品中膜联蛋白A3(ANXA3)基因编码的RNA水平,(ii)与对照血液样品中所述基因编码的RNA水平比较步骤⑴中测定的ANXA3编码的 RNA水平;和(b)如果所述血液测试样品中所述基因编码的RNA水平高于对照血液样品中的,则断 定相对于一般群体所述受试者处于患有结肠直肠癌的提高的风险中。
115.一种测定相对于一般群体、测试受试者是否处于患有结肠直肠癌的提高的风险中 的方法,包括(a)从所述受试者获得血液测试样品;和(i)测定所述血液测试样品中C-型凝集素结构域家族4、成员D(CLEC4D)基因编码的 RNA水平,( )与对照血液样品中所述基因编码的RNA水平比较步骤⑴中测定的所述基因编码 的RNA水平;和(b)如果所述血液测试样品中所述基因编码的RNA水平高于对照血液样品中的,则断 定相对于一般群体所述受试者处于患有结肠直肠癌的提高的风险中。
116.一种测定相对于一般群体、测试受试者是否处于患有结肠直肠癌的提高的风险中 的方法,包括(a)从所述受试者获得血液测试样品;和(i)测定所述血液测试样品中白细胞介素2受体、β (IL2RB)基因编码的RNA水平,( )与对照血液样品中所述基因编码的RNA水平比较步骤(i)中测定的所述基因编码 的RNA水平;和(b)如果所述血液测试样品中所述基因编码的RNA水平低于对照血液样品中的,则断 定相对于一般群体所述受试者处于患有结肠直肠癌的提高的风险中。
117.一种测定相对于一般群体、测试受试者是否处于患有结肠直肠癌的提高的风险中 的方法,包括(a)从所述受试者获得血液测试样品;和(i)测定所述血液测试样品中核纤层蛋白Bl(LMNBl)基因编码的RNA水平,( )与对照血液样品中所述基因编码的RNA水平比较步骤(i)中测定的所述基因编码 的RNA水平;和(b)如果所述血液测试样品中所述基因编码的RNA水平高于对照血液样品中的,则断 定相对于一般群体所述受试者处于患有结肠直肠癌的提高的风险中。
118.一种测定相对于一般群体、测试受试者是否处于患有结肠直肠癌的提高的风险中 的方法,包括(a)从所述受试者获得血液测试样品;和(i)测定所述血液测试样品中脯氨酸富含Gla(G羧基谷氨酸)4(跨膜)(PRRG4)基因编 码的RNA水平,( )与对照血液样品中所述基因编码的RNA水平比较步骤(i)中测定的所述基因编码 的RNA水平;和(b)如果所述血液测试样品中所述基因编码的RNA水平高于对照血液样品中的,则断 定相对于一般群体所述受试者处于患有结肠直肠癌的提高的风险中。
119.一种测定相对于一般群体、测试受试者是否处于患有结肠直肠癌的提高的风险中 的方法,包括(a)从所述受试者获得血液测试样品;和(i)测定所述血液测试样品中肿瘤坏死因子、α诱导蛋白6(TNFAIP6)基因编码的RNA 水平,( )与对照血液样品中所述基因编码的RNA水平比较步骤(i)中测定的所述基因编码 的RNA水平;和(b)如果所述血液测试样品中所述基因编码的RNA水平高于对照血液样品中的,则断 定相对于一般群体所述受试者处于患有结肠直肠癌的提高的风险中。
120.一种测定相对于一般群体、测试受试者是否处于患有结肠直肠癌的提高的风险中 的方法,包括(a)从所述受试者获得血液测试样品;和(i)测定所述血液测试样品中血管非炎性蛋白I(VNNl)基因编码的RNA水平,( )与对照血液样品中所述基因编码的RNA水平比较步骤⑴中测定的所述基因编码 的RNA水平;和(b)如果所述血液测试样品中所述基因编码的RNA水平高于对照血液样品中的,则断 定相对于一般群体所述受试者处于患有结肠直肠癌的提高的风险中。
121.权利要求114、115、116、117、118、119或120的方法,其中,所述对照样品来自已经 被诊断为不患有结肠直肠癌的个体。
122.—种测定相对于一般群体、测试受试者是否处于患有结肠直肠癌的提高的风险中的方法,包括(a)从所述受试者获得血液测试样品;和对于选自由 ANXA3、CLEC4D、IL2RB、LMNBU PRRG4, TNFAIP6 和 VNNl 组成的组的一组基 因的每一个基因,(i)测定所述血液测试样品中所述基因编码的RNA水平,从而产生测试数据;和( )向所述测试数据、以及向表示一个或更多个对照血液样品中所述基因编码的RNA 水平的对照数据应用数学公式用于产生一值,所述值指明,对于ANXA3、CLEC4D、LMNBU PRRG4、TNFAIP6和VNNl,所述血液测试样品中所述基因编码的RNA水平是否高于对照血液 样品中的,以及,对于IL2RB,所述血液测试样品中所述基因编码的RNA水平是否低于对照 血液样品中的;和(b)如果,对于ANXA3、CLEC4D、LMNBl、raRG4、TNFAIP6和VNNl,所述值指明所述血液测 试样品中所述基因编码的RNA水平高于所述对照血液样品的,则断定相对于一般群体所述 受试者处于患有结肠直肠癌的提高的风险中,如果,对于IL2RB,所述值指明所述血液测试 样品中所述基因编码的RNA水平低于所述对照血液样品的,则断定相对于一般群体所述受 试者处于患有结肠直肠癌的提高的风险中。
123.—种分离的组合物,其包含来自测试受试者的血液样品和选自由ANXA3基因编码 的RNA、与所述RNA互补的cDNA、在严格条件下与所述cDNA或所述RNA特异性杂交的寡核 苷酸、能够产生与RNA互补的cDNA的扩增产物的引物组、以及所述cDNA的扩增产物组成的 组的一个或更多个的核酸分子。
124.—种分离的组合物,其包含来自测试受试者的血液样品和选自由CLEC4D基因编 码的RNA、与所述RNA互补的cDNA、在严格条件下与所述cDNA或所述RNA特异性杂交的寡 核苷酸、能够产生与RNA互补的cDNA的扩增产物的引物组、以及所述cDNA的扩增产物组成 的组的一个或更多个的核酸分子。
125.—种分离的组合物,其包含来自测试受试者的血液样品和选自由IL2RB基因编码 的RNA、与所述RNA互补的cDNA、在严格条件下与所述cDNA或所述RNA特异性杂交的寡核 苷酸、能够产生与RNA互补的cDNA的扩增产物的引物组、以及所述cDNA的扩增产物组成的 组的一个或更多个的核酸分子。
126.—种分离的组合物,其包含来自测试受试者的血液样品和选自由LMNBl基因编码 的RNA、与所述RNA互补的cDNA、在严格条件下与所述cDNA或所述RNA特异性杂交的寡核 苷酸、能够产生与RNA互补的cDNA的扩增产物的引物组、以及所述cDNA的扩增产物组成的 组的一个或更多个的核酸分子。
127.—种分离的组合物,其包含来自测试受试者的血液样品和选自由PRRG4基因编码 的RNA、与所述RNA互补的cDNA、在严格条件下与所述cDNA或所述RNA特异性杂交的寡核 苷酸、能够产生与RNA互补的cDNA的扩增产物的引物组、以及所述cDNA的扩增产物组成的 组的一个或更多个的核酸分子。
128.—种分离的组合物,其包含来自测试受试者的血液样品和选自由TNFAIP6基因编 码的RNA、与所述RNA互补的cDNA、在严格条件下与所述cDNA或所述RNA特异性杂交的寡 核苷酸、能够产生与RNA互补的cDNA的扩增产物的引物组、以及所述cDNA的扩增产物组成 的组的一个或更多个的核酸分子。
129.—种分离的组合物,其包含来自测试受试者的血液样品和选自由VNNl基因编码 的RNA、与所述RNA互补的cDNA、在严格条件下与所述cDNA或所述RNA特异性杂交的寡核 苷酸、能够产生与RNA互补的cDNA的扩增产物的引物组、以及所述cDNA的扩增产物组成的 组的一个或更多个的核酸分子。
130.权利要求123的组合物,进一步包括核酸分子,其选自由选自由CLEC4D、IL2RB、 LMNBl、PRRG4、TNFAIP6和VNNl组成的基因的组的一个或更多个基因编码的RNA,与所述基 因的组的RNA互补的cDNA,在严格条件下与和所述基因的组的RNA互补的cDNA或与所述基 因的组的RNA特异性杂交的寡核苷酸,能够产生与所述基因的组的RNA互补的cDNA的扩增 产物的引物组,以及所述基因的组的RNA的cDNA的扩增产物组成的组的一个或更多个。
131.权利要求124的组合物,进一步包括核酸分子,其选自由选自由ANXA3、IL2RB、 LMNBl、PRRG4、TNFAIP6和VNNl组成的基因的组的一个或更多个基因编码的RNA,与所述基 因的组的RNA互补的cDNA,在严格条件下与和所述基因的组的RNA互补的cDNA或与所述基 因的组的RNA特异性杂交的寡核苷酸,能够产生与所述基因的组的RNA互补的cDNA的扩增 产物的引物组,以及所述基因的组的RNA的cDNA的扩增产物组成的组的一个或更多个。
132.权利要求125的组合物,进一步包括核酸分子,其选自由选自由ANXA3、CLEC4D、 LMNBl、PRRG4、TNFAIP6和VNNl组成的基因的组的一个或更多个基因编码的RNA,与所述基 因的组的RNA互补的cDNA,在严格条件下与和所述基因的组的RNA互补的cDNA或与所述基 因的组的RNA特异性杂交的寡核苷酸,能够产生与所述基因的组的RNA互补的cDNA的扩增 产物的引物组,以及所述基因的组的RNA的cDNA的扩增产物组成的组的一个或更多个。
133.权利要求126的组合物,进一步包括核酸分子,其选自由选自由ANXA3、CLEC4D、 IL2RB、PRRG4、TNFAIP6和VNNl组成的基因的组的一个或更多个基因编码的RNA,与所述基 因的组的RNA互补的cDNA,在严格条件下与和所述基因的组的RNA互补的cDNA或与所述基 因的组的RNA特异性杂交的寡核苷酸,能够产生与所述基因的组的RNA互补的cDNA的扩增 产物的引物组,以及所述基因的组的RNA的cDNA的扩增产物组成的组的一个或更多个。
134.权利要求127的组合物,进一步包括核酸分子,其选自由选自由ANXA3、CLEC4D、 IL2RB、LMNBl、TNFAIP6和VNNl组成的基因的组的一个或更多个基因编码的RNA,与所述基 因的组的RNA互补的cDNA,在严格条件下与和所述基因的组的RNA互补的cDNA或与所述基 因的组的RNA特异性杂交的寡核苷酸,能够产生与所述基因的组的RNA互补的cDNA的扩增 产物的引物组,以及所述基因的组的RNA的cDNA的扩增产物组成的组的一个或更多个。
135.权利要求128的组合物,进一步包括核酸分子,其选自由选自由ANXA3、CLEC4D、 IL2RB、LMNBU PRRG4和VNNl组成的基因的组的一个或更多个基因编码的RNA,与所述基因 的组的RNA互补的cDNA,在严格条件下与和所述基因的组的RNA互补的cDNA或与所述基因 的组的RNA特异性杂交的寡核苷酸,能够产生与所述基因的组的RNA互补的cDNA的扩增产 物的引物组,以及所述基因的组的RNA的cDNA的扩增产物组成的组的一个或更多个。
136.权利要求129的组合物,进一步包括核酸分子,其选自由选自由ANXA3、CLEC4D、 IL2RB.LMNBUPRRG4和TNFAIP6组成的基因的组的一个或更多个基因编码的RNA,与所述基 因的组的RNA互补的cDNA,在严格条件下与和所述基因的组的RNA互补的cDNA或与所述基 因的组的RNA特异性杂交的寡核苷酸,能够产生与所述基因的组的RNA互补的cDNA的扩增 产物的引物组,以及所述基因的组的RNA的cDNA的扩增产物组成的组的一个或更多个。
137.—种分离的组合物,其包含来自测试受试者的血液样品的分离的核酸分子,其中 所述核酸分子选自由ANXA3基因编码的RNA、与所述RNA互补的cDNA、在严格条件下与所述 cDNA或所述RNA特异性杂交的寡核苷酸、能够产生与RNA互补的cDNA的扩增产物的引物 组、以及所述cDNA的扩增产物组成的组的一个或更多个。
138.—种分离的组合物,其包含来自测试受试者的血液样品的分离的核酸分子,其中 所述核酸分子选自由CLEC4D基因编码的RNA、与所述RNA互补的cDNA、在严格条件下与所 述cDNA或所述RNA特异性杂交的寡核苷酸、能够产生与RNA互补的cDNA的扩增产物的引 物组、以及所述cDNA的扩增产物组成的组的一个或更多个。
139.—种分离的组合物,其包含来自测试受试者的血液样品的分离的核酸分子,其中 所述核酸分子选自由IL2RB基因编码的RNA、与所述RNA互补的cDNA、在严格条件下与所述 cDNA或所述RNA特异性杂交的寡核苷酸、能够产生与RNA互补的cDNA的扩增产物的引物 组、以及所述cDNA的扩增产物组成的组的一个或更多个。
140.一种分离的组合物,其包含来自测试受试者的血液样品的分离的核酸分子,其中 所述核酸分子选自由LMNBl基因编码的RNA、与所述RNA互补的cDNA、在严格条件下与所述 cDNA或所述RNA特异性杂交的寡核苷酸、能够产生与RNA互补的cDNA的扩增产物的引物 组、以及所述cDNA的扩增产物组成的组的一个或更多个。
141.一种分离的组合物,其包含来自测试受试者的血液样品的分离的核酸分子,其中 所述核酸分子选自由PRRG4基因编码的RNA、与所述RNA互补的cDNA、在严格条件下与所述 cDNA或所述RNA特异性杂交的寡核苷酸、能够产生与RNA互补的cDNA的扩增产物的引物 组、以及所述cDNA的扩增产物组成的组的一个或更多个。
142.—种分离的组合物,其包含来自测试受试者的血液样品的分离的核酸分子,其中 所述核酸分子选自由TNFAIP6基因编码的RNA、与所述RNA互补的cDNA、在严格条件下与所 述cDNA或所述RNA特异性杂交的寡核苷酸、能够产生与RNA互补的cDNA的扩增产物的引 物组、以及所述cDNA的扩增产物组成的组的一个或更多个。
143.一种分离的组合物,其包含来自测试受试者的血液样品和选自由VNNl基因编码 的RNA、与所述RNA互补的cDNA、在严格条件下与所述cDNA或所述RNA特异性杂交的寡核 苷酸、能够产生与RNA互补的cDNA的扩增产物的引物组、以及所述cDNA的扩增产物组成的 组的一个或更多个核酸分子。
144.权利要求137的组合物,进一步包括核酸分子,其选自由选自由CLEC4D、IL2RB、 LMNBl、PRRG4、TNFAIP6和VNNl组成的基因的组的一个或更多个基因编码的RNA,与所述基 因的组的RNA互补的cDNA或其互补物,在严格条件下与和所述基因的组的RNA互补的cDNA 或与所述基因的组的RNA特异性杂交的寡核苷酸,能够产生与所述基因的组的RNA互补的 cDNA的扩增产物的引物组,以及所述基因的组的RNA的cDNA的扩增产物组成的组的一个或 更多个。
145.权利要求138的组合物,进一步包括核酸分子,其选自由选自由ANXA3、IL2RB、 LMNBl、PRRG4、TNFAIP6和VNNl组成的基因的组的一个或更多个基因编码的RNA,与所述基 因的组的RNA互补的cDNA或其互补物,在严格条件下与和所述基因的组的RNA互补的cDNA 或与所述基因的组的RNA特异性杂交的寡核苷酸,能够产生与所述基因的组的RNA互补的 cDNA的扩增产物的引物组,以及所述基因的组的RNA的cDNA的扩增产物组成的组的一个或更多个。
146.权利要求139的组合物,进一步包括核酸分子,其选自由选自由ANXA3、CLEC4D、 LMNBl、PRRG4、TNFAIP6和VNNl组成的基因的组的一个或更多个基因编码的RNA,与所述基 因的组的RNA互补的cDNA或其互补物,在严格条件下与和所述基因的组的RNA互补的cDNA 或与所述基因的组的RNA特异性杂交的寡核苷酸,能够产生与所述基因的组的RNA互补的 cDNA的扩增产物的引物组,以及所述基因的组的RNA的cDNA的扩增产物组成的组的一个或 更多个。
147.权利要求140的组合物,进一步包括核酸分子,其选自由选自由ANXA3、CLEC4D、 IL2RB、PRRG4、TNFAIP6和VNNl组成的基因的组的一个或更多个基因编码的RNA,与所述基 因的组的RNA互补的cDNA或其互补物,在严格条件下与和所述基因的组的RNA互补的cDNA 或与所述基因的组的RNA特异性杂交的寡核苷酸,能够产生与所述基因的组的RNA互补的 cDNA的扩增产物的引物组,以及所述基因的组的RNA的cDNA的扩增产物组成的组的一个或 更多个。
148.权利要求141的组合物,进一步包括核酸分子,其选自由选自由ANXA3、CLEC4D、 IL2RB、LMNBl、TNFAIP6和VNNl组成的基因的组的一个或更多个基因编码的RNA,与所述基 因的组的RNA互补的cDNA或其互补物,在严格条件下与和所述基因的组的RNA互补的cDNA 或与所述基因的组的RNA特异性杂交的寡核苷酸,能够产生与所述基因的组的RNA互补的 cDNA的扩增产物的引物组,以及所述基因的组的RNA的cDNA的扩增产物组成的组的一个或 更多个。
149.权利要求142的组合物,进一步包括核酸分子,其选自由选自由ANXA3、CLEC4D、 IL2RB、LMNBl、PRRG4和VNNl组成的基因的组的一个或更多个基因编码的RNA,与所述基因 的组的RNA互补的cDNA或其互补物,在严格条件下与和所述基因的组的RNA互补的cDNA 或与所述基因的组的RNA特异性杂交的寡核苷酸,能够产生与所述基因的组的RNA互补的 cDNA的扩增产物的引物组,以及所述基因的组的RNA的cDNA的扩增产物组成的组的一个或 更多个。
150.权利要求143的组合物,进一步包括核酸分子,其选自由选自由ANXA3、CLEC4D、 IL2RB.LMNBUPRRG4和TNFAIP6组成的基因的组的一个或更多个基因编码的RNA,与所述基 因的组的RNA互补的cDNA或其互补物,在严格条件下与和所述基因的组的RNA互补的cDNA 或与所述基因的组的RNA特异性杂交的寡核苷酸,能够产生与所述基因的组的RNA互补的 cDNA的扩增产物的引物组,以及所述基因的组的RNA的cDNA的扩增产物组成的组的一个或 更多个。
151.一种引物组,其包含第一引物和第二引物或其组合,其中所述第一引物是能够产 生与ANXA3基因编码的RNA互补的cDNA的扩增产物的一组引物之一,其中所述第二引物是 能够产生与VNNl基因编码的RNA互补的cDNA的扩增产物的一组引物之一。
152.一种引物组,其包含第一引物和第二引物或其组合,其中所述第一引物是能够产 生与ANXA3基因编码的RNA互补的cDNA的扩增产物的一组引物之一,其中所述第二引物是 能够产生与TNFAIP6基因编码的RNA互补的cDNA的扩增产物的一组引物之一。
153.一种引物组,其包含第一引物和第二引物或其组合,其中所述第一引物是能够产 生与ANXA3基因编码的RNA互补的cDNA的扩增产物的一组引物之一,其中所述第二引物是能够产生与PRRG4基因编码的RNA互补的cDNA的扩增产物的一组引物之一。
154.一种引物组,其包含第一引物和第二引物或其组合,其中所述第一引物是能够产 生与ANXA3基因编码的RNA互补的cDNA的扩增产物的一组引物之一,其中所述第二引物是 能够产生与PRRG4基因编码的RNA互补的cDNA的扩增产物的一组引物之一。
155.一种引物组,其包含第一引物和第二引物或其组合,其中所述第一引物是能够产 生与ANXA3基因编码的RNA互补的cDNA的扩增产物的一组引物之一,其中所述第二引物是 能够产生与LMNBl基因编码的RNA互补的cDNA的扩增产物的一组引物之一。
156.一种引物组,其包含第一引物和第二引物或其组合,其中所述第一引物是能够产 生与ANXA3基因编码的RNA互补的cDNA的扩增产物的一组引物之一,其中所述第二引物是 能够产生与IL2RB基因编码的RNA互补的cDNA的扩增产物的一组引物之一。
157.一种引物组,其包含第一引物和第二引物或其组合,其中所述第一引物是能够产 生与ANXA3基因编码的RNA互补的cDNA的扩增产物的一组引物之一,其中所述第二引物是 能够产生与CLEC4D基因编码的RNA互补的cDNA的扩增产物的一组引物之一。
158.一种引物组,其包含第一引物和第二引物或其组合,其中所述第一引物是能够产 生与CLEC4D基因编码的RNA互补的cDNA的扩增产物的一组引物之一,其中所述第二引物 是能够产生与VNNl基因编码的RNA互补的cDNA的扩增产物的一组引物之一。
159.一种引物组,其包含第一引物和第二引物或其组合,其中所述第一引物是能够产 生与CLEC4D基因编码的RNA互补的cDNA的扩增产物的一组引物之一,其中所述第二引物 是能够产生与TNFAIP6基因编码的RNA互补的cDNA的扩增产物的一组引物之一。
160.一种引物组,其包含第一引物和第二引物或其组合,其中所述第一引物是能够产 生与CLEC4D基因编码的RNA互补的cDNA的扩增产物的一组引物之一,其中所述第二引物 是能够产生与PRRG4基因编码的RNA互补的cDNA的扩增产物的一组引物之一。
161.一种引物组,其包含第一引物和第二引物或其组合,其中所述第一引物是能够产 生与CLEC4D基因编码的RNA互补的cDNA的扩增产物的一组引物之一,其中所述第二引物 是能够产生与PRRG4基因编码的RNA互补的cDNA的扩增产物的一组引物之一。
162.一种引物组,其包含第一引物和第二引物或其组合,其中所述第一引物是能够产 生与CLEC4D基因编码的RNA互补的cDNA的扩增产物的一组引物之一,其中所述第二引物 是能够产生与LMNBl基因编码的RNA互补的cDNA的扩增产物的一组引物之一。
163.一种引物组,其包含第一引物和第二引物或其组合,其中所述第一引物是能够产 生与CLEC4D基因编码的RNA互补的cDNA的扩增产物的一组引物之一,其中所述第二引物 是能够产生与IL2RB基因编码的RNA互补的cDNA的扩增产物的一组引物之一。
164.一种引物组,其包含第一引物和第二引物或其组合,其中所述第一引物是能够产 生与IL2RB基因编码的RNA互补的cDNA的扩增产物的一组引物之一,其中所述第二引物是 能够产生与TNFAIP6基因编码的RNA互补的cDNA的扩增产物的一组引物之一。
165.一种引物组,其包含第一引物和第二引物或其组合,其中所述第一引物是能够产 生与IL2RB基因编码的RNA互补的cDNA的扩增产物的一组引物之一,其中所述第二引物是 能够产生与PRRG4基因编码的RNA互补的cDNA的扩增产物的一组引物之一。
166.—种引物组,其包含第一引物和第二引物或其组合,其中所述第一引物是能够产 生与IL2RB基因编码的RNA互补的cDNA的扩增产物的一组引物之一,其中所述第二引物是能够产生与LMNBl基因编码的RNA互补的cDNA的扩增产物的一组引物之一。
167.一种引物组,其包含第一引物和第二引物或其组合,其中所述第一引物是能够产 生与IL2RB基因编码的RNA互补的cDNA的扩增产物的一组引物之一,其中所述第二引物是 能够产生与VNNl基因编码的RNA互补的cDNA的扩增产物的一组引物之一。
168.一种引物组,其包含第一引物和第二引物或其组合,其中所述第一引物是能够产 生与LMNBl基因编码的RNA互补的cDNA的扩增产物的一组引物之一,其中所述第二引物是 能够产生与PRRG4基因编码的RNA互补的cDNA的扩增产物的一组引物之一。
169.一种引物组,其包含第一引物和第二引物或其组合,其中所述第一引物是能够产 生与LMNBl基因编码的RNA互补的cDNA的扩增产物的一组引物之一,其中所述第二引物是 能够产生与TNFAIP6基因编码的RNA互补的cDNA的扩增产物的一组引物之一。
170.一种引物组,其包含第一引物和第二引物或其组合,其中所述第一引物是能够产 生与LMNBl基因编码的RNA互补的cDNA的扩增产物的一组引物之一,其中所述第二引物是 能够产生与VNNl基因编码的RNA互补的cDNA的扩增产物的一组引物之一。
171.一种引物组,其包含第一引物和第二引物或其组合,其中所述第一引物是能够产 生与PRRG4基因编码的RNA互补的cDNA的扩增产物的一组引物之一,其中所述第二引物是 能够产生与VNNl基因编码的RNA互补的cDNA的扩增产物的一组引物之一。
172.—种引物组,其包含第一引物和第二引物或其组合,其中所述第一引物是能够产 生与PRRG4基因编码的RNA互补的cDNA的扩增产物的一组引物之一,其中所述第二引物是 能够产生与TNFAIP6基因编码的RNA互补的cDNA的扩增产物的一组引物之一。
173.一种引物组,其包含第一引物和第二引物或其组合,其中所述第一引物是能够产 生与VNNl基因编码的RNA互补的cDNA的扩增产物的一组引物之一,其中所述第二引物是 能够产生与TNFAIP6基因编码的RNA互补的cDNA的扩增产物的一组引物之一。
174.—种测试系统,其包括a)两个或更多个血液样品,其中每个血液样品来自不同的测试受试者,和b)来自所述测试受试者的每个所述血液样品的分离的核酸分子,其中所述核酸分子选 自由ANXA3基因编码的RNA、与所述RNA互补的cDNA、在严格条件下与所述cDNA或其互补 物或所述RNA特异性杂交的寡核苷酸、能够产生与RNA互补的cDNA的扩增产物的引物组以 及所述cDNA的扩增产物组成的组的一个或更多个。
175.一种测试系统,其包括a)两个或更多个血液样品,其中每个血液样品来自不同的测试受试者,和b)来自所述测试受试者的每个所述血液样品的分离的核酸分子,其中所述核酸分子选 自由CLEC4D基因编码的RNA、与所述RNA互补的cDNA、在严格条件下与所述cDNA或其互 补物或所述RNA特异性杂交的寡核苷酸、能够产生与RNA互补的cDNA的扩增产物的引物组 以及所述cDNA的扩增产物组成的组的一个或更多个。
176.一种测试系统,其包括a)两个或更多个血液样品,其中每个血液样品来自不同的测试受试者,和b)来自所述测试受试者的每个所述血液样品的分离的核酸分子,其中所述核酸分子选 自由IL2RB基因编码的RNA、与所述RNA互补的cDNA、在严格条件下与所述cDNA或其互补 物或所述RNA特异性杂交的寡核苷酸、能够产生与RNA互补的cDNA的扩增产物的引物组以及所述cDNA的扩增产物组成的组的一个或更多个。
177.一种测试系统,其包括a)两个或更多个血液样品,其中每个血液样品来自不同的测试受试者,和b)来自所述测试受试者的每个所述血液样品的分离的核酸分子,其中所述核酸分子选 自由LMNB1基因编码的RNA、与所述RNA互补的cDNA、在严格条件下与所述cDNA或其互补 物或所述RNA特异性杂交的寡核苷酸、能够产生与RNA互补的cDNA的扩增产物的引物组以 及所述cDNA的扩增产物组成的组的一个或更多个。
178.一种测试系统,其包括a)两个或更多个血液样品,其中每个血液样品来自不同的测试受试者,和b)来自所述测试受试者的每个所述血液样品的分离的核酸分子,其中所述核酸分子选 自由PRRG4基因编码的RNA、与所述RNA互补的cDNA、在严格条件下与所述cDNA或其互补 物或所述RNA特异性杂交的寡核苷酸、能够产生与RNA互补的cDNA的扩增产物的引物组以 及所述cDNA的扩增产物组成的组的一个或更多个。
179.一种测试系统,其包括a)两个或更多个血液样品,其中每个血液样品来自不同的测试受试者,和b)来自所述测试受试者的每个所述血液样品的分离的核酸分子,其中所述核酸分子选 自由TNFAIP6基因编码的RNA、与所述RNA互补的cDNA、在严格条件下与所述cDNA或其互 补物或所述RNA特异性杂交的寡核苷酸、能够产生与RNA互补的cDNA的扩增产物的引物组 以及所述cDNA的扩增产物组成的组的一个或更多个。
180.—种测试系统,其包括a)两个或更多个血液样品,其中每个血液样品来自不同的测试受试者,和b)来自所述测试受试者的每个所述血液样品的分离的核酸分子,其中所述核酸分子选 自由VNN1基因编码的RNA、与所述RNA互补的cDNA、在严格条件下与所述cDNA或其互补 物或所述RNA特异性杂交的寡核苷酸、能够产生与RNA互补的cDNA的扩增产物的引物组以 及所述cDNA的扩增产物组成的组的一个或更多个。
181.权利要求173到180中任一项的测试系统,其中,所述测试受试者被筛查结肠直肠
全文摘要
本发明公开了测定人类测试受试者中与不患有结肠直肠癌相对的、患有结肠直肠癌的概率的方法。所述方法包括,对于选自由ANXA3、CLEC4D、IL2RB、LMNB1、PRRG4、TNFAIP6和VNN1组成的组的一组一个或更多个基因的每一个基因测定所述测试受试者的血液中所述基因编码的RNA水平,从而产生测试数据;提供表示患有结肠直肠癌的人类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的阳性对照数据,和提供表示不患有结肠直肠癌的人类对照受试者的血液中所述基因编码的RNA水平的阴性对照数据;以及测定所述测试数据相应于所述阳性对照数据以及不相应于所述阴性对照数据的概率,其中所述测试数据相应于所述阳性对照数据以及不相应于所述阴性对照数据的概率表示所述测试受试者中与不患有结肠直肠癌相对的、患有结肠直肠癌的概率。
文档编号C07H21/00GK102089443SQ200980121829
公开日2011年6月8日 申请日期2009年4月10日 优先权日2008年4月10日
发明者塞缪尔·赵, 松钦·刘 申请人:基因信息公司
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