一种用于白菜类作物抽薹开花鉴定的SNP标记的制作方法

技术特征：

1.一种用于白菜类作物抽薹开花鉴定的SNP标记，所述SNP标记是位于白菜类作物A03染色体上BrFLC5基因的外显子3的Pi3+1位的核苷酸，其为A或G。

2.根据权利要求1所述的SNP标记，其特征在于，SNP的位置是基于1.5版本的白菜基因组序列而确定的。

3.根据权利要求1或2所述的SNP标记，其特征在于，所述SNP标记的GG基因型个体的抽薹开花时间晚于GA和AA基因型的个体。

4.一种用于PCR扩增权利要求1-3任一项所述SNP标记的引物，其序列信息为：

正向FAM荧光引物：5'-GAAGGTGACCAAGTTCATGCTTGAGCTACTAG AACTTGTGGAAAGG-3'；

正向VIC荧光引物：5'-GAAGGTCGGAGTCAACGGATTCATGAGCTACTA GAACTTGTGGAAAGA-3'；

反向引物：5'-GGAGGAGAGCAAAAATAGTCTCAG-3'。

5.一种权利要求1-3任一项所述SNP标记在白菜类作物抽薹开花鉴定中的应用。

6.根据权利要求5所述的应用，其特征在于，所述SNP标记的GG基因型个体的抽薹开花时间晚于GA和AA基因型的个体。

7.根据权利要求5或6所述的应用，其特征在于，包括以下步骤：

A，提取待测白菜类作物的DNA，获得DNA模板；

B，向步骤A提取的DNA模板中加入特异的KASP Primer mix和通用的KASP Mastermix，进行PCR扩增，获得PCR产物；

C，对PCR产物进行荧光检测分析，根据PCR产物发出的荧光对白菜类作物的抽薹开花进行鉴定；

所述KASP Primer mix含有三种特异性的引物，分别为：

正向FAM荧光引物：5'-GAAGGTGACCAAGTTCATGCTTGAGCTACTAGAACTTGTGGAAAGG-3'；

正向VIC荧光引物：5'-GAAGGTCGGAGTCAACGGATTCATGAGCTACTAGAACTTGTGGAAAGA-3'；

反向引物；5'-GGAGGAGAGCAAAAATAGTCTCAG-3'；

所述KASP Master mix包含如下各组分：通用的TRET cassette荧光引物，ROX内参染料，KlearTaq DNA聚合酶和dNTP。

8.根据权利要求7所述的应用，其特征在于，若PCR产物发出的荧光为FAM荧光，则待测白菜类作物为SNP标记的GG基因型个体；

若PCR产物发出的荧光为VIC荧光，则待测白菜类作物为SNP标记的AA基因型个体；

若PCR产物发出的荧光为FAM和VIC的混合荧光，则待测白菜类作物为SNP标记的GA基因型个体。

9.根据权利要求5-8任一项所述的应用，其特征在于，所述PCR扩增的反应体系为：

所述PCR扩增的步骤为：

10.根据权利要求9所述的应用，其特征在于，所述PCR扩增还包括以下步骤：