经化学修饰的RNAi构建体及其用途的制作方法

文档序号:26003699发布日期:2021-07-23 21:21阅读:来源:国知局

技术特征:

1.一种抑制靶基因序列的表达的rnai构建体,该rnai构建体包含正义链和反义链,其中该反义链包含与该靶基因序列互补的序列并且该正义链包含与该反义链的该序列充分地互补以形成双链体区的序列,其中该rnai构建体包含由式(a)表示的结构:

其中:

按5′至3′方向列出的上链是该正义链并且按3′至5′方向列出的下链是该反义链;

每个nf代表2′-氟修饰的核苷酸;

每个nm独立地代表选自以下的经修饰的核苷酸:2′-氟修饰的核苷酸、2′-o-甲基修饰的核苷酸、2′-o-甲氧基乙基修饰的核苷酸、2′-o-烷基修饰的核苷酸、2′-o-烯丙基修饰的核苷酸、二环核酸(bna)和脱氧核糖核苷酸;

每个nl独立地代表选自以下的经修饰的核苷酸:2′-o-甲基修饰的核苷酸、2′-o-甲氧基乙基修饰的核苷酸、2′-o-烷基修饰的核苷酸、2′-o-烯丙基修饰的核苷酸、bna和脱氧核糖核苷酸;

nt代表选自以下的经修饰的核苷酸:无碱基核苷酸、反向无碱基核苷酸、反向脱氧核糖核苷酸、2′-o-甲基修饰的核苷酸、2′-o-甲氧基乙基修饰的核苷酸、2′-o-烷基修饰的核苷酸、2′-o-烯丙基修饰的核苷酸、bna和脱氧核糖核苷酸;

x是0至4的整数,条件是当x是1、2、3、或4时,这些na核苷酸中的一个或多个是独立地选自以下的经修饰的核苷酸:无碱基核苷酸、反向无碱基核苷酸、反向脱氧核糖核苷酸、2′-o-甲基修饰的核苷酸、2′-o-甲氧基乙基修饰的核苷酸、2′-o-烷基修饰的核苷酸、2′-o-烯丙基修饰的核苷酸、bna和脱氧核糖核苷酸,并且这些na核苷酸中的一个或多个可以与该反义链中的核苷酸互补;

y是0至4的整数,条件是当y是1、2、3、或4时,一个或多个n核苷酸是不与该反义链中的核苷酸发生碱基配对的经修饰的或未经修饰的突出端核苷酸;并且

z是0至4的整数,条件是当z是1、2、3、或4时,这些nb核苷酸中的一个或多个是独立地选自以下的经修饰的核苷酸:2′-o-甲基修饰的核苷酸、2′-o-甲氧基乙基修饰的核苷酸、2′-o-烷基修饰的核苷酸、2′-o-烯丙基修饰的核苷酸、bna和脱氧核糖核苷酸,并且当na核苷酸存在于该正义链中时,这些nb核苷酸中的一个或多个可以与na核苷酸互补,或者这些nb核苷酸中的一个或多个可以是不与该正义链中的核苷酸发生碱基配对的突出端核苷酸。

2.如权利要求1所述的rnai构建体,其中该正义链和该反义链的长度各自独立地为19至30个核苷酸。

3.如权利要求1所述的rnai构建体,其中该正义链和该反义链的长度各自独立地为19至25个核苷酸。

4.如权利要求1所述的rnai构建体,其中x是0,y是2,并且z是2。

5.如权利要求1所述的rnai构建体,其中x是1且na是反向无碱基核苷酸,y是2,并且z是2。

6.如权利要求1所述的rnai构建体,其中x是2,y是0,并且z是4。

7.如权利要求1所述的rnai构建体,其中x是2,y是0,并且z是2。

8.如权利要求1所述的rnai构建体,其中x是3且5′端的该na是反向无碱基核苷酸,y是0,并且z是4。

9.如权利要求1所述的rnai构建体,其中x是0,y是0,并且z是2。

10.如权利要求1所述的rnai构建体,其中x是1且na是反向无碱基核苷酸,y是0,并且z是2。

11.如权利要求1至10中任一项所述的rnai构建体,其中nt是反向无碱基核苷酸、反向脱氧核糖核苷酸或2′-o-甲基修饰的核苷酸。

12.如权利要求1至11中任一项所述的rnai构建体,其中该正义链和反义链两者中的每个nl均是2′-o-甲基修饰的核苷酸。

13.如权利要求1至12中任一项所述的rnai构建体,其中在从5′端开始计数的该反义链中的位置4和12处的该nm各自为2′-氟修饰的核苷酸。

14.如权利要求13所述的rnai构建体,其中在从5′端开始计数的该反义链中的位置6处的该nm是2′-氟修饰的核苷酸。

15.如权利要求14所述的rnai构建体,其中在从5′端开始计数的该反义链中的位置10处的该nm是2′-氟修饰的核苷酸。

16.如权利要求1至12中任一项所述的rnai构建体,其中在从5′端开始计数的该反义链中的位置10和12处的该nm各自为2′-氟修饰的核苷酸。

17.如权利要求16所述的rnai构建体,其中在从5′端开始计数的该反义链中的位置4处的该nm是2′-氟修饰的核苷酸。

18.如权利要求1至12中任一项所述的rnai构建体,其中在从5′端开始计数的该反义链中的位置4、6和10处的该nm是2′-o-甲基修饰的核苷酸,并且在从5′端开始计数的该反义链中的位置12处的该nm是2′-氟修饰的核苷酸。

19.如权利要求1至12中任一项所述的rnai构建体,其中该正义链和反义链两者中的每个nm均是2′-o-甲基修饰的核苷酸。

20.如权利要求1至18中任一项所述的rnai构建体,其中该正义链中的每个nm是2′-o-甲基修饰的核苷酸。

21.如权利要求1至18中任一项所述的rnai构建体,其中该正义链中的每个nm是2′-氟修饰的核苷酸。

22.一种抑制靶基因序列的表达的rnai构建体,该rnai构建体包含正义链和反义链,其中该反义链包含与该靶基因序列互补的序列并且该正义链包含与该反义链的该序列充分地互补以形成双链体区的序列,其中该rnai构建体包含由式(b)表示的结构:

其中:

按5′至3′方向列出的上链是该正义链并且按3′至5′方向列出的下链是该反义链;

每个nf代表2′-氟修饰的核苷酸;

每个nl独立地代表选自以下的经修饰的核苷酸:2′-o-甲基修饰的核苷酸、2′-o-甲氧基乙基修饰的核苷酸、2′-o-烷基修饰的核苷酸、2′-o-烯丙基修饰的核苷酸、bna和脱氧核糖核苷酸;

nt代表选自以下的经修饰的核苷酸:无碱基核苷酸、反向无碱基核苷酸、反向脱氧核糖核苷酸、2′-o-甲基修饰的核苷酸、2′-o-甲氧基乙基修饰的核苷酸、2′-o-烷基修饰的核苷酸、2′-o-烯丙基修饰的核苷酸、bna和脱氧核糖核苷酸;

x是0至4的整数,条件是当x是1、2、3、或4时,这些na核苷酸中的一个或多个是独立地选自以下的经修饰的核苷酸:无碱基核苷酸、反向无碱基核苷酸、反向脱氧核糖核苷酸、2′-o-甲基修饰的核苷酸、2′-o-甲氧基乙基修饰的核苷酸、2′-o-烷基修饰的核苷酸、2′-o-烯丙基修饰的核苷酸、bna和脱氧核糖核苷酸,并且这些na核苷酸中的一个或多个可以与该反义链中的核苷酸互补;

y是0至4的整数,条件是当y是1、2、3、或4时,一个或多个n核苷酸是不与该反义链中的核苷酸发生碱基配对的经修饰的或未经修饰的突出端核苷酸;并且

z是0至4的整数,条件是当z是1、2、3、或4时,这些nb核苷酸中的一个或多个是独立地选自以下的经修饰的核苷酸:2′-o-甲基修饰的核苷酸、2′-o-甲氧基乙基修饰的核苷酸、2′-o-烷基修饰的核苷酸、2′-o-烯丙基修饰的核苷酸、bna和脱氧核糖核苷酸,并且当na核苷酸存在于该正义链中时,这些nb核苷酸中的一个或多个可以与na核苷酸互补,或者这些nb核苷酸中的一个或多个可以是不与该正义链中的核苷酸发生碱基配对的突出端核苷酸。

23.如权利要求22所述的rnai构建体,其中x是0,y是2,并且z是2。

24.如权利要求22所述的rnai构建体,其中x是0,y是0,并且z是2。

25.如权利要求22所述的rnai构建体,其中x是1且na是反向无碱基核苷酸,y是2,并且z是2。

26.如权利要求22所述的rnai构建体,其中x是2,y是0,并且z是4。

27.如权利要求22所述的rnai构建体,其中x是3且5′端的该na是反向无碱基核苷酸,y是0,并且z是4。

28.如权利要求22至27中任一项所述的rnai构建体,其中nt是反向无碱基核苷酸、反向脱氧核糖核苷酸或2′-o-甲基修饰的核苷酸。

29.如权利要求22至28中任一项所述的rnai构建体,其中该正义链和反义链两者中的每个nl均是2′-o-甲基修饰的核苷酸。

30.一种抑制靶基因序列的表达的rnai构建体,该rnai构建体包含正义链和反义链,其中该反义链包含与该靶基因序列互补的序列并且该正义链包含与该反义链的该序列充分地互补以形成双链体区的序列,其中该rnai构建体包含由式(c)表示的结构:

其中:

按5′至3′方向列出的上链是该正义链并且按3′至5′方向列出的下链是该反义链;

每个nf代表2′-氟修饰的核苷酸;

每个nl独立地代表选自以下的经修饰的核苷酸:2′-o-甲基修饰的核苷酸、2′-o-甲氧基乙基修饰的核苷酸、2′-o-烷基修饰的核苷酸、2′-o-烯丙基修饰的核苷酸、bna和脱氧核糖核苷酸;

每个nm独立地代表选自以下的经修饰的核苷酸:2′-氟修饰的核苷酸、2′-o-甲基修饰的核苷酸、2′-o-甲氧基乙基修饰的核苷酸、2′-o-烷基修饰的核苷酸、2′-o-烯丙基修饰的核苷酸、bna和脱氧核糖核苷酸;

nt代表选自以下的经修饰的核苷酸:无碱基核苷酸、反向无碱基核苷酸、反向脱氧核糖核苷酸、2′-o-甲基修饰的核苷酸、2′-o-甲氧基乙基修饰的核苷酸、2′-o-烷基修饰的核苷酸、2′-o-烯丙基修饰的核苷酸、bna和脱氧核糖核苷酸;并且

x是0或1且ab是反向无碱基核苷酸。

31.如权利要求30所述的rnai构建体,其中该正义链和反义链两者中的每个nm均是2′-o-甲基修饰的核苷酸。

32.如权利要求31所述的rnai构建体,其中nt是反向无碱基核苷酸或反向脱氧核糖核苷酸并且x是0。

33.如权利要求31所述的rnai构建体,其中nt是2′-o-甲基修饰的核苷酸并且x是1。

34.如权利要求30所述的rnai构建体,其中该反义链中的该nm是2′-氟修饰的核苷酸。

35.如权利要求34所述的rnai构建体,其中该正义链中的每个nm是2′-o-甲基修饰的核苷酸。

36.如权利要求34所述的rnai构建体,其中该正义链中的每个nm是2′-氟修饰的核苷酸。

37.如权利要求34至36中任一项所述的rnai构建体,其中nt是反向无碱基核苷酸或反向脱氧核糖核苷酸并且x是0。

38.如权利要求30至37中任一项所述的rnai构建体,其中该正义链和反义链两者中的每个nl均是2′-o-甲基修饰的核苷酸。

39.一种抑制靶基因序列的表达的rnai构建体,该rnai构建体包含正义链和反义链,其中该反义链包含与该靶基因序列互补的序列并且该正义链包含与该反义链的该序列充分地互补以形成双链体区的序列,其中该rnai构建体包含由式(d)表示的结构:

其中:

按5′至3′方向列出的上链是该正义链并且按3′至5′方向列出的下链是该反义链;

每个nf代表2′-氟修饰的核苷酸;

每个nm独立地代表选自以下的经修饰的核苷酸:2′-氟修饰的核苷酸、2′-o-甲基修饰的核苷酸、2′-o-甲氧基乙基修饰的核苷酸、2′-o-烷基修饰的核苷酸、2′-o-烯丙基修饰的核苷酸、二环核酸(bna)和脱氧核糖核苷酸;

每个nl独立地代表选自以下的经修饰的核苷酸:2′-o-甲基修饰的核苷酸、2′-o-甲氧基乙基修饰的核苷酸、2′-o-烷基修饰的核苷酸、2′-o-烯丙基修饰的核苷酸、bna和脱氧核糖核苷酸;

nt代表选自以下的经修饰的核苷酸:无碱基核苷酸、反向无碱基核苷酸、反向脱氧核糖核苷酸、2′-o-甲基修饰的核苷酸、2′-o-甲氧基乙基修饰的核苷酸、2′-o-烷基修饰的核苷酸、2′-o-烯丙基修饰的核苷酸、bna和脱氧核糖核苷酸;

x是0至4的整数,条件是当x是1、2、3、或4时,这些na核苷酸中的一个或多个是独立地选自以下的经修饰的核苷酸:无碱基核苷酸、反向无碱基核苷酸、反向脱氧核糖核苷酸、2′-o-甲基修饰的核苷酸、2′-o-甲氧基乙基修饰的核苷酸、2′-o-烷基修饰的核苷酸、2′-o-烯丙基修饰的核苷酸、bna和脱氧核糖核苷酸,并且这些na核苷酸中的一个或多个可以与该反义链中的核苷酸互补;

y是0至4的整数,条件是当y是1、2、3、或4时,一个或多个n核苷酸是不与该反义链中的核苷酸发生碱基配对的经修饰的或未经修饰的突出端核苷酸;并且

z是0至4的整数,条件是当z是1、2、3、或4时,这些nb核苷酸中的一个或多个是独立地选自以下的经修饰的核苷酸:2′-o-甲基修饰的核苷酸、2′-o-甲氧基乙基修饰的核苷酸、2′-o-烷基修饰的核苷酸、2′-o-烯丙基修饰的核苷酸、bna和脱氧核糖核苷酸,并且当na核苷酸存在于该正义链中时,这些nb核苷酸中的一个或多个可以与na核苷酸互补,或者这些nb核苷酸中的一个或多个可以是不与该正义链中的核苷酸发生碱基配对的突出端核苷酸。

40.如权利要求39所述的rnai构建体,其中该正义链和该反义链的长度各自独立地为19至30个核苷酸。

41.如权利要求39所述的rnai构建体,其中该正义链和该反义链的长度各自独立地为19至25个核苷酸。

42.如权利要求39所述的rnai构建体,其中x是2,y是0,并且z是4。

43.如权利要求39所述的rnai构建体,其中x是1且na是反向无碱基核苷酸,y是2,并且z是2。

44.如权利要求39所述的rnai构建体,其中x是1且na是反向无碱基核苷酸,y是0,并且z是2。

45.如权利要求39所述的rnai构建体,其中x是0,y是0,并且z是2。

46.如权利要求39所述的rnai构建体,其中x是2,y是0,并且z是2。

47.如权利要求39至46中任一项所述的rnai构建体,其中nt是反向无碱基核苷酸、反向脱氧核糖核苷酸或2′-o-甲基修饰的核苷酸。

48.如权利要求39至47中任一项所述的rnai构建体,其中该正义链和反义链两者中的每个nl均是2′-o-甲基修饰的核苷酸。

49.如权利要求39至48中任一项所述的rnai构建体,其中在从5′端开始计数的该反义链中的位置4、6、8、9和16处的该nm各自为2′-氟修饰的核苷酸并且在从5′端开始计数的该反义链中的位置7和12处的nm各自为2′-o-甲基修饰的核苷酸。

50.如权利要求39至48中任一项所述的rnai构建体,其中在从5′端开始计数的该反义链中的位置4、6、8、9和16处的该nm各自为2′-o-甲基修饰的核苷酸并且在从5′端开始计数的该反义链中的位置7和12处的nm各自为2′-氟修饰的核苷酸。

51.如权利要求39至48中任一项所述的rnai构建体,其中在从5′端开始计数的该反义链中的位置4、6、8、9和12处的该nm各自为2′-o-甲基修饰的核苷酸并且在从5′端开始计数的该反义链中的位置7和16处的nm各自为2′-氟修饰的核苷酸。

52.如权利要求39至48中任一项所述的rnai构建体,其中在从5′端开始计数的该反义链中的位置7、8、9和12处的该nm各自为2′-o-甲基修饰的核苷酸并且在从5′端开始计数的该反义链中的位置4、6和16处的nm各自为2′-氟修饰的核苷酸。

53.如权利要求39至52中任一项所述的rnai构建体,其中该正义链中的该nm是2′-氟修饰的核苷酸。

54.如权利要求39至52中任一项所述的rnai构建体,其中该正义链中的该nm是2′-o-甲基修饰的核苷酸。

55.如权利要求1至54中任一项所述的rnai构建体,其中该正义链、该反义链或该正义链和反义链两者包含一个或多个硫代磷酸酯核苷酸间键。

56.如权利要求55所述的rnai构建体,其中该反义链在3′端和5′端两者的末端核苷酸之间包含两个连续的硫代磷酸酯核苷酸间键。

57.如权利要求55或56所述的rnai构建体,其中该正义链在3′端的末端核苷酸之间包含单个硫代磷酸酯核苷酸间键。

58.如权利要求55或56所述的rnai构建体,其中该正义链在3′端的末端核苷酸之间包含两个连续的硫代磷酸酯核苷酸间键。

59.如权利要求1至58中任一项所述的rnai构建体,其中该rnai构建体进一步包含配体。

60.如权利要求59所述的rnai构建体,其中该配体包含胆固醇部分、维生素、类固醇、胆汁酸、叶酸部分、脂肪酸、碳水化合物、糖苷、抗体或其抗原结合片段。

61.如权利要求59所述的rnai构建体,其中该配体靶向rnai构建体向肝细胞的递送。

62.如权利要求59所述的rnai构建体,其中该配体包含半乳糖、半乳糖胺、或n-乙酰基-半乳糖胺。

63.如权利要求62所述的rnai构建体,其中该配体包含多价半乳糖部分或多价n-乙酰基-半乳糖胺部分。

64.如权利要求63所述的rnai构建体,其中该多价半乳糖部分或多价n-乙酰基-半乳糖胺部分是三价或四价的。

65.如权利要求59至64中任一项所述的rnai构建体,其中该配体任选地通过接头共价附接至该正义链。

66.如权利要求65所述的rnai构建体,其中将该配体共价附接至该正义链的5′端。

67.一种药物组合物,该药物组合物包含如权利要求1至66中任一项所述的rnai构建体,和药学上可接受的载剂或赋形剂。

68.一种用于在细胞中抑制靶基因的表达的方法,该方法包括使该细胞与如权利要求1至66中任一项所述的rnai构建体接触。

69.如权利要求68所述的方法,其中该细胞是体内的。

70.一种用于在受试者中抑制靶基因的表达的方法,该方法包括向该受试者施用如权利要求1至66中任一项所述的rnai构建体。

71.如权利要求70所述的方法,其中该rnai构建体经由肠胃外施用途径施用至该受试者。


技术总结
本发明涉及用于降低靶基因的表达的经化学修饰的RNAi构建体。特别地,本发明涉及并入RNAi构建体以改善体内稳定性和有效性的经修饰的核苷酸的特定模式。还描述了包含该经化学修饰的RNAi构建体的药物组合物和通过施用该经化学修饰的RNAi构建体来抑制体内靶基因表达,例如,以治疗或减轻多种疾病病症的方法。

技术研发人员:J·K·默里;B·吴;Y·程;B·J·赫伯瑞奇
受保护的技术使用者:美国安进公司
技术研发日:2019.12.09
技术公布日:2021.07.23
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