一种质粒dna规模化纯化方法_3

文档序号:9447735阅读:来源:国知局
质粒DNA浓缩纯化
[0101]浓缩系统处理完毕后,将混合液注入浓缩系统的进料罐,开启循环栗,400rpm循环30min,经300KD中空纤维超滤柱进行纯化处理,弃去透过液,进料罐中剩余截留液2L,记为初级质粒DNA浓缩液。
[0102]2.3.1浓缩液的洗滤
[0103]第一次洗滤:
[0104]将4L 0.0lM PBS注入进料罐中的初级浓缩液中,重悬,开启循环栗,400rpm循环30min,弃去透过液4,进料罐中剩余截留液2L,记为二级质粒DNA浓缩液。
[0105]第二次洗滤:
[0106]将4L 0.0lM PBS注入进料罐中的二级浓缩液,重悬,开启循环栗,400rpm循环30min,弃去洗滤液4L,进料罐中剩余截留液2L,记为三级质粒DNA浓缩液。
[0107]第三次洗滤:
[0108]将4L 0.0lM PBS注入进料罐中的三级浓缩液,重悬,开启循环栗,400rpm循环30min,弃去洗滤液4L,进料罐中剩余截留液2L,即为质粒DNA裂解液最终浓缩液。
[0109]2.4第三步精细纯化
[0110]将质粒DNA裂解液浓缩液中加入Triton X_11430g使终浓度为1.5% (W/V),涡旋振荡后置于冰浴中30min,期间多次混匀样品。
[0111]澄清系统处理完毕后,弃尽系统内的PBS溶液,将振荡处理后的质粒DNA裂解液,注入澄清纯化系统的进料罐中,开启循环栗,400rpm循环30min,经0.22 μπι中空纤维微滤柱进行纯化处理,收集透过液。
[0112]浓缩系统处理完毕后,将透过液注入浓缩系统的进料罐,并注入0.0lM PBS8L,开启循环栗,400rpm循环30min,经300KD中空纤维超滤柱进行纯化处理,弃去透过液,进料罐中剩余截留液2L,记为初级质粒DNA纯化液。
[0113]第一次洗滤:
[0114]将4L 0.0lM PBS注入进料罐中的初级浓缩液中,重悬,开启循环栗,400rpm循环30min,弃去透过液4L,进料罐中剩余截留液2L,记为二级质粒DNA纯化液。
[0115]第二次洗滤:
[0116]将4L 0.0lM PBS注入进料罐中的二级浓缩液,重悬,开启循环栗,400rpm循环30min,弃去洗滤液4L,进料罐中剩余截留液2L,记为三级质粒DNA纯化液。
[0117]第三次洗滤:
[0118]将4L 0.0lM PBS注入进料罐中的三级浓缩液,重悬,开启循环栗,400rpm循环30min,弃去洗滤液4L,进料罐中剩余截留液2L,即为质粒DNA纯化液。
[0119]2.4除菌过滤
[0120]将得到质粒DNA纯化液,用0.22 μπι囊式滤器过滤除菌,得到纯化的质粒DNA成品O
[0121]将经过上述处理后的得到的质粒DNA成品保存于4°C。
[0122]3质粒DNA回收率测定
[0123]将裂解液和已知定量质粒使用凝胶核酸电泳,跑胶检测,电泳图像用凝胶成像仪显现并得到,再以伯乐公司ImageLab凝胶成像系统计算出裂解液中质粒含量。通过计算本发明的质粒DNA回收率高于80%。
[0124]4质粒DNA质量检测
[0125]对纯化的质粒DNA样品进彳丁质粒DNA含量,纯度,超螺旋比例,蛋白污染,宿主基因组DNA及RNA进行检测,以分析纯化工艺的有效性。
[0126]3.1质粒DNA含量的检测:
[0127]用紫外分光光度计测其在波长260nm时的吸收值,测量3次,取平均值,每毫升质粒含量应不低于lmg。
[0128]3.2质粒DNA纯度检测:
[0129]用紫外分光光度计测其在波长260nm和280nm时测定吸收值,其260nm/280nm比值应在1.8?2.0之间。
[0130]3.3蛋白污染检测。
[0131]使用BCA蛋白浓度检测试剂盒进行。蛋白质含量低于10 μ g/mL。
[0132]3.4基因组DNA和RNA污染物检测
[0133]使用琼脂糖核酸电泳跑胶检测,电泳图像用凝胶成像仪显现并得到,应检测不到相应条带。
[0134]3.5超螺旋含量检测方法
[0135]使用琼脂糖核酸电泳跑胶检测,电泳图像用凝胶成像仪显现并得到,再以伯乐公司ImageLab凝胶成像系统计算出超螺旋体DNA质粒及各类质粒构型的图像映像点,从而计算出超螺旋体DNA质粒在总DNA质粒量的百分比。超螺旋体DNA质粒占总质粒量的比例不少于90%。
[0136]综上所述,利用本发明纯化得到的质粒DNA。
[0137]实施例2
[0138]澄清系统处理完毕后,弃尽系统内的PBS溶液,将振荡处理后的质粒DNA裂解液,注入澄清纯化系统的进料罐中,开启循环栗,400rpm循环30min,经0.22 μπι中空纤维微滤柱进行纯化处理,收集透过液90L,进料罐内存留截留液10L。
[0139]I截留液的洗滤
[0140]第一次洗滤:
[0141]将1L无菌的0.01Μ PBS加入进料罐中的截留液中,重悬,开启循环栗400rpm循环30min,收集透过液10L。
[0142]第二次洗滤:
[0143]将1L无菌的0.01M PBS加入进料罐中的截留液中,重悬,开启循环栗400rpm循环30min,收集透过液10L。
[0144]第三次洗滤:
[0145]将1L无菌的0.01M PBS加入进料罐中的截留液中,重悬,开启循环栗400rpm循环30min,收集透过液10L。
[0146]质粒DNA裂解液的收集
[0147]将上述澄清纯化过程所收集的透过液及三次洗滤液混合均匀,得到混合液120L。
[0148]2质粒DNA浓缩纯化
[0149]浓缩系统处理完毕后,将混合液注入浓缩系统的进料罐,开启循环栗,400rpm循环30min,经100KD中空纤维超滤柱进行纯化处理,弃去透过液,进料罐中剩余截留液2L,记为初级质粒DNA浓缩液。
[0150]2.1浓缩液的洗滤
[0151]第一次洗滤:
[0152]将4L 0.0lM PBS注入进料罐中的初级浓缩液中,重悬,开启循环栗,400rpm循环30min,弃去透过液4,进料罐中剩余截留液2L,记为二级质粒DNA浓缩液。
[0153]第二次洗滤:
[0154]将4L 0.0lM PBS注入进料罐中的二级浓缩液,重悬,开启循环栗,400rpm循环30min,弃去洗滤液4L,进料罐中剩余截留液2L,记为三级质粒DNA浓缩液。
[0155]第三次洗滤:
[0156]将4L 0.0lM PBS注入进料罐中的三级浓缩液,重悬,开启循环栗,400rpm循环30min,弃去洗滤液4L,进料罐中剩余截留液2L,即为质粒DNA裂解液最终浓缩液。
[0157]实施例3
[0158]澄清系统处理完毕后,弃尽系统内的PBS溶液,将振荡处理后的质粒DNA裂解液,注入澄清纯化系统的进料罐中,开启循环栗,400rpm循环30min,经0.45 μπι中空纤维微滤柱进行纯化处理,收集透过液90L,进料罐内存留截留液10L。
[0159]I截留液的洗滤
[0160]第一次洗滤:
[0161]将1L无菌的0.01Μ PBS加入进料罐中的截留液中,重悬,开启循环栗400rpm循环30min,收集透过液10L。
[0162]第二次洗滤:
[0163]将1L无菌的0.01M PBS加入进料罐中的截留液中,重悬,开启循环栗400rpm循环30min,收集透过液10L。
[0164]第三次洗滤:
[0165]将1L无菌的0.01M PBS加入进料罐中的截留液中,重悬,开启循环栗400rpm循环30min,收集透过液10L。
[0166]质粒DNA裂解液的收集
[0167]将上述澄清纯化过程所收集的透过液及三次洗滤液混合均匀,得到混合液120L。
[0168]2质粒DNA浓缩纯化
[0169]浓缩系统处理完毕后,将混合液注入浓缩系统的进料罐,开启循环栗,400rpm循环30min,经100KD中空纤维超滤柱进行纯化处理,弃去透过液,进料罐中剩
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