一种用于对中国人群个体进行个体识别和亲子鉴定的方法和系统的制作方法_3

文档序号:9682311阅读:来源:国知局
度,峰的高度代表产物的丰度,峰的颜色为荧光经激发后产生的颜 色,其中,蓝色的峰代表经FAM染料标记的扩增产物,绿色的峰代表经HEX染料标记的扩增 产物,黑色的峰代表TAMRA染料标记的扩增产物,红色峰代表经R0X染料标记的扩增产物 (图3-图7B中,每幅图从上到下四行峰分别为蓝色、绿色、黑色、红色)。在不同的分析仪 中,荧光染料经激发后产生的光可能与其本身带有的颜色不同,这对本领域技术人员来说 是可以理解的。
[0076] 7.分型分析
[0077] 用片段分析软件GeneMapper分析上述步骤中遗传分析仪检测收集的数据,将样 品分析数据与等位基因分型标准物(Allelic Ladder)(见附图3)比较,得到实际样品的基 因分型数据。
[0078] 8.结果
[0079] 根据以上1-7的步骤对以下样品进行检测。
[0080] 1)取标准品9948,由定量PCR方法进行定量后,分别以2. 0、1. 0、0. 5、0. 25、0. 125、 0. 0625、0. 03125ng的模板量分别以30和32扩增循环数(模板量不同,循环数是可变的,本 领域技术人员可以根据需要对二者进行适当调整),并使用本申请的系统检验并重复1次。 经测试,本发明中25个基因座的荧光标记复合扩增检验系统在DNA模板量最低至0. 125ng, 扩增循环数为32下,可检出全部25个基因座。如图1所示,图4为标准品9948的已知分 型结果。
[0081] 2)使用本申请的系统检测黑猩猩、大猩猩、猴、羊、猪、狗、兔等各类物种DNA样本, 对本发明方法的种属特异性进行验证,经过多次重复试验,结果如图2所示,可以看出,使 用本发明系统的分型结果在分型区无25个基因座之外的扩增产物,说明本发明的方法和 系统具有高的种属特异性。
[0082] 3)使用本申请的系统检测两个无关个体DNA样品,结果见图5A-5B,分型结果支持 这两个个体为无关个体。
[0083] 4)使用本申请的系统检测已确定亲权关系的三联体实例样品,获得的分型结果见 图6A-图6C,其中6A是父亲的分型结果,6B是孩子的分型结果,6C是母亲的分型结果。
[0084] 对应于图6A-图6C的所述三联体实例样品父-孩子-母DNA样本的分型结果如 下:
[0085]
[0086] 由结果可以看出,本发明系统和方法的结果支持该三联体具有亲权关系。
[0087] 5)使用本申请的系统检测已确定亲权关系二联体实例(单亲)的DNA样本,最终 获得分型验证结果,见图7A-图7B。
[0088] 对应于图7A-图7B的得到二联体实例(单亲)的DNA样本的分型结果如下:
[0089]
[0090] 由结果可以看出,本发明系统和方法的结果支持该二联体具有亲权关系。说明本 申请的系统可以实现对单亲案件的亲权鉴定。
[0091] 实施例2
[0092] 根据在209例中国北方汉族人群无关个体中调查获得的数据,计算出荧光标记 STR复合扩增检验体系中国汉族人群中的等位基因频率、基因型频率、观察杂合度、个体识 别能力、多态性信息含量及非父排除率。本研究所构建的体系的全部23个非C0DIS系统 STR基因座累计匹配概率(PM)为8. 4528X 10 22,累计个体识别力(TDP)为0.999 999 999 999 999 999 999 154 72,累计非父排除概率(CEP)为0.999 999 672。所述各STR基因座 在中国汉族人群中具较高的多态性,可用于法医学个体识别和亲权鉴定。
【主权项】
1. 一种用于对中国人群个体进行个体识别和亲子鉴定的方法,其特征在于,所述方法 包括: 1) 获得待检测个体的DNA; 2) 获得所述DNA的23个常染色体STR基因座、性别决定基因座Amelogenin以及Y-STR 基因座DYS391的分型结果; 其中所述 23 个常染色体STR基因座为D1S1627、D3S4529、D2S441、D17S974、D6S1017、D4S2408、D9S2157、D17S1301、D1GATA113、D18S853、D20S482、D14S1434、D20S1082、D6S474、 D12ATA63、D22S1045、D10S1248、D1S1677、D11S4463、D9S1122、D2S1776、D5S2500 和D18S51; 3) 根据分型结果进行个体识别和亲子鉴定。2. 根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述基因座的分型结果通过测序获得。3. 根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述基因座的分型结果通过STR基因座复 合检测体系获得,所述STR基因座复合检测体系包括所述23个常染色体STR基因座、性别 决定基因座Amelogenin以及Y-STR基因座DYS391,还包括用于对所述23个常染色体STR 基因座、性别决定基因座Amelogenin以及Y-STR基因座DYS391进行扩增以获得扩增产物 的扩增引物。4. 根据权利要求3所述的方法,其特征在于, 所述23个常染色体STR基因座的扩增引物为序列表中SEQIDNo. 1至SEQIDNo. 46 的核苷酸序列; 所述性别决定基因座和Y-STR基因座的扩增引物为序列表中SEQIDN0.47至SEQID No. 50的核苷酸序列。5. -种STR基因座复合检测体系,其特征在于,所述STR基因座复合检测体系包括所 述23个常染色体STR基因座、性别决定基因座Amelogenin以及Y-STR基因座DYS391,还 包括用于对所述23个常染色体STR基因座、性别决定基因座Amelogenin以及Y-STR基因 座DYS391进行扩增以获得扩增产物的扩增引物,其中所述23个常染色体STR基因座为 D1S1627、D3S4529、D2S441、D17S974、D6S1017、D4S2408、D9S2157、D17S1301、D1GATA113、 D18S853、D20S482、D14S1434、D20S1082、D6S474、D12ATA63、D22S1045、D10S1248、D1S1677、 D11S4463、D9S1122、D2S1776、D5S2500 和D18S51。6. 根据权利要求5所述的STR基因座复合检测体系,所述23个常染色体STR基因座的 扩增引物为序列表中SEQIDNo. 1至SEQIDNo. 46的核苷酸序列; 所述性别决定基因座和Y-STR基因座的扩增引物为序列表中SEQIDN0.47至SEQID No. 50的核苷酸序列。7. -种用于对中国人群个体进行个体识别和亲子鉴定的系统,其特征在于,所述系统 包括DNA提取体系、STR基因座复合检测体系,和推断体系; 所述DNA提取体系用于获得待检测个体的DNA; 所述STR基因座复合检测体系用于获得所述DNA的23个常染色体STR基因座、性别决 定基因座Amelogenin以及Y-STR基因座DYS391的分型结果; 所述推断体系用于根据分型结果进行个体识别和亲子鉴定。8. 根据权利要求7所述的系统,其特征在于,所述STR基因座复合检测体系包括所述 23个常染色体STR基因座、性别决定基因座Amelogenin以及Y-STR基因座DYS391,还包 括用于对所述23个常染色体STR基因座、性别决定基因座Amelogenin以及Y-STR基因 座DYS391进行扩增以获得扩增产物的扩增引物,其中所述23个常染色体STR基因座为 D1S1627、D3S4529、D2S441、D17S974、D6S1017、D4S2408、D9S2157、D17S1301、D1GATA113、 D18S853、D20S482、D14S1434、D20S1082、D6S474、D12ATA63、D22S1045、D10S1248、D1S1677、 D11S4463、D9S1122、D2S1776、D5S2500 和D18S51。9.根据权利要求8所述的系统,其特征在于,所述常染色体STR基因座的扩增引物为序 列表中SEQIDNo. 1至SEQIDNo. 46的核苷酸序列; 所述性别决定基因座和Y-STR基因座的扩增引物为序列表中SEQIDN0.47至SEQID No. 50的核苷酸序列。
【专利摘要】本发明提供一种用于对中国人群个体进行个体识别和亲子鉴定的方法和系统,所述方法包括:获得待检测个体的DNA;获得所述DNA常染色体STR基因座、性别决定基因座Amelogenin以及Y-STR基因座DYS391的分型结果,根据分型结果进行个体识别和亲子鉴定。本发明还提供了一种用于对中国人群个体进行个体识别和亲子鉴定的系统。本发明的方案通过综合分析常染色体基因座和性别决定基因座分型结果能有效获得待检测个体的分型结果,进而为公安机关进行个体识别和亲子鉴定提供有力的技术支撑。
【IPC分类】C12Q1/68
【公开号】CN105441534
【申请号】CN201510303275
【发明人】白雪, 姚伊人, 赵兴春, 叶健, 王乐
【申请人】公安部物证鉴定中心
【公开日】2016年3月30日
【申请日】2015年6月5日
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