sCD14或它的片段或衍生物用于风险分级、诊断和预后的用图_3

文档序号:9382928阅读:来源:国知局
可以包含SEQ ID NO: 1的至少52个、68个或例如75个连续氨基酸。片段或衍生物也可 以包含SEQ ID NO: 1的至少90或100个连续氨基酸。
[0104] 在某些实施方案中,片段或衍生物包含SEQ ID NO: 1的N-端氨基酸或N-端5、6、 7、8、9、10、11或12 (优选地例如11)个氨基酸。片段或衍生物可以可替换地包含SEQ ID NO: 1的C-端或C-端5、6、7、8、9、10、11或12(优选地例如11)个氨基酸。在某些实施 方案中,片段或衍生物既不包含SEQ ID NO: 1的N-端,也不包含SEQ ID NO: 1的C-端。 在某些实施方案中,片段或衍生物的N-端位于SEQ ID NO: 1的N-端的10、20、30、40、50、 60、70、80、90、100、110、150或200个氨基酸内。在某些实施方案中,片段或衍生物的N-端 距离 SEQ ID NO: 1 的 N-端的至少 5、10、20、30、40、50、60、70、80、90、100、110、150或200 个氨基酸。在某些实施方案中,片段或衍生物的C-端位于SEQ ID NO: 1的C-端的10、20、 30、40、50、60、70、80、90、100、110、150或200个氨基酸内。在某些实施方案中,片段或衍生 物的 C-端距离 SEQ ID NO: 1 的 C-端至少 5、10、20、30、40、50、60、70、80、90、100、110、150 或200个氨基酸。
[0105] 在某些实施方案中,片段或衍生物可以例如包含SEQ ID NO: 1的至少10个连续 氨基酸,且它的N-端位于SEQ ID NO: 1的N-端的10、20或30个氨基酸内。
[0106] 在某些实施方案中,片段或衍生物可以例如包含SEQ ID NO: 1的至少20个连续 氨基酸,且它的N-端位于SEQ ID NO: 1的N-端的10、20或30个氨基酸内。
[0107] 在某些实施方案中,片段或衍生物可以例如包含SEQ ID NO: 1的至少40个连续 氨基酸,且它的N-端位于SEQ ID NO: 1的N-端的10、20或30个氨基酸内。
[0108] 在某些实施方案中,片段或衍生物可以例如包含SEQ ID NO: 1的至少60个连续 氨基酸,且它的N-端位于SEQ ID NO: 1的N-端的10、20或30个氨基酸内。
[0109] 在某些实施方案中,片段或衍生物可以例如包含SEQ ID NO: 1的至少100个连续 氨基酸,且它的N-端位于SEQ ID NO: 1的N-端的10、20或30个氨基酸内。
[0110] 在其它实施方案中,所述片段或衍生物可以例如包含SEQ ID NO: 1的至少10个 连续氨基酸,且它的C-端位于SEQ ID NO: 1的C-端的10、20或30个氨基酸内。
[0111] 在其它实施方案中,片段或衍生物可以例如包含SEQ ID NO: 1的至少20个连续 氨基酸,且它的C-端位于SEQ ID NO: 1的C-端的10、20或30个氨基酸内。
[0112] 在其它实施方案中,片段或衍生物可以例如包含SEQ ID NO: 1的至少40个连续 氨基酸,且它的C-端位于SEQ ID NO: 1的C-端的10、20或30个氨基酸内。
[0113] 在其它实施方案中,片段或衍生物可以例如包含SEQ ID NO: 1的至少60个连续 氨基酸,且它的C-端位于SEQ ID NO: 1的C-端的10、20或30个氨基酸内。
[0114] 在其它实施方案中,片段或衍生物可以例如包含SEQ ID NO: 1的至少100个连续 氨基酸,且它的C-端位于SEQ ID NO: 1的C-端的10、20或30个氨基酸内。
[0115] 在其它实施方案中,例如片段或衍生物的N-端位于SEQ ID NO: 1的N-端的10 个氨基酸内,且所述片段或衍生物的C-端距离SEQ ID NO: 1的C-端至少30、50或100个 氨基酸。
[0116] 在其它实施方案中,例如片段或衍生物的N-端位于SEQ ID NO: 1的N-端30个 氨基酸内,且所述片段或衍生物的C-端距离SEQ ID NO: 1的C-端至少30、50或100个氨 基酸。
[0117] 在其它实施方案中,例如片段或衍生物的N-端距离SEQ ID NO: 1的N-端至少30 个氨基酸,且所述片段或衍生物的C-端距离SEQ ID NO: 1的C-端至少30、50或100个氨 基酸。
[0118] 在某些实施方案中,片段或衍生物可以包含SEQ ID NO: 1的氨基酸1-350、 5-356、1-10、1-11、1-15、1-16、1-17、1-20、1-26、1-30、1-40、1-50、1-52、1-53、1-60、1-68、 1-80、1-100、1-120、1-140、1-160、1-180、1-200、1-220、1-240、1-260、1-280、1-300、1-320、 1-340,和 / 或 1-356。
[0119] 在某些实施方案中,片段或衍生物可以包含SEQ ID NO: 1的氨基酸17-26和/或 53-68,或 SEQ ID NO: 1 的氨基酸 17-68。
[0120] 在本文中的某些实施方案中,片段或衍生物可以例如组合2种或更多种选自以下 的性能:- -具有13±2 kDa的分子量,如在非还原条件下通过电泳(例如SDS-PAGE)测得的; -包含SEQ ID NO: 1的位置1-11的氨基酸序列;和/或 -特异性地结合使用肽制备的抗体,所述肽由SEQ ID NO: 1的位置53-68的氨基酸序 列组成(和/或特异性地结合这样的抗体:所述抗体特异性地结合位于SEQ ID NO: 1的 氨基酸53-68内的表位;和/或特异性地结合这样的抗体:所述抗体特异性地结合肽,所述 肽的氨基酸序列包含SEQ ID NO: 1的氨基酸53-68或由SEQ ID NO: 1的氨基酸53-68组 成)。
[0121] 在其它实施方案中,片段或衍生物不具有一种或多种选自以下的性能:--具有13±2 kDa的分子量,如在非还原条件下通过电泳(例如SDS-PAGE)测得的; -包含SEQ ID NO: 1的位置1-11的氨基酸序列;和/或 特异性地结合使用肽制备的抗体,所述肽由SEQ ID NO: 1的位置53-68的氨基酸序列 组成(和/或特异性地结合这样的抗体:所述抗体特异性地结合位于SEQ ID NO: 1的氨基 酸53-68内的表位;和/或特异性地结合这样的抗体:所述抗体特异性地结合肽,所述肽的 氨基酸序列包含SEQ ID NO: 1的氨基酸53-68或由SEQ ID NO: 1的氨基酸53-68组成)。
[0122] SEQ ID NO: 1的356-氨基酸序列对应于根据例如Genbank登记号AAH10507. 1已 知的人CD14分子的序列的位置20-375。


[0123] 本文中使用的术语"s⑶14-ST"表示肽,其也被称作"可溶性的⑶14亚型"或"前 腐败素(presepsin)"。s⑶14-ST衍生自s⑶14 (可溶性的⑶14),其存在至少2种较高分 子量形式(49 kDa和55 kDa),且其中s⑶14-ST是片段。s⑶14的蛋白酶解导致s⑶14-ST 的产生。s⑶14-ST当在非还原条件下电泳时,具有13±2 kDa的表观分子量。可以得到特 异性地结合s⑶14-ST、而不结合s⑶14的抗体,从而允许区分s⑶14-ST和s⑶14。另一方 面,可以有益地排除可结合s⑶14、但是不识别s⑶14-ST的抗体。
[0124] 本文中使用的术语"肽或多肽"或"标志物"是指选自s⑶14、s⑶14-ST或除了 s⑶14-ST以外的s⑶14的片段或衍生物的化合物或本文描述的其它合适的预测标志物(尽 管最优选sCD14_ST),其中根据一个特定实施方案,确定标志物的组合,包括、但不限于如上 面分别解释的神经激素标志物、缺血性心脏标志物、转化生长因子_β细胞因子超家族的标 志物、白介素受体家族的标志物(例如白介素1受体-样1,也被称作ILlRLl和ST2)或嗜 中性粒细胞明胶酶-相关的脂质运载蛋白(NGAL)和/或炎症标志物。术语"肽或多肽"或 "标志物"可以另外是指本领域已知作为风险标志物的另一种肽。
[0125] 已经发现,神经激素标志物、作为水平衡调节剂的标志物、缺血性心脏标志物、 转化生长因子-β细胞因子超家族的标志物、白介素受体家族的标志物(例如白介素1受 体-样1,也被称作ILlRLl和ST2)或嗜中性粒细胞明胶酶-相关的脂质运载蛋白(NGAL) 和炎症标志物代表独立风险指示剂的集合。因而,选自s⑶14、s⑶14-ST或除了 s⑶14-ST 以外的sCD14的片段或衍生物的化合物(作为新心血管标志物)与本发明提供的所述标志物 集合的标志物的组合,会产生进一步增加的灵敏度和特异性,且因此在诊断心血管疾病或 病症或动脉粥样硬化中或在评价受试者的发展心血管疾病或病症或动脉粥样硬化的风险 中或在评价受试者的死亡风险中产生更高准确度。还可能以增加的准确度鉴别将从某种治 疗受益的受试者。所述增加的准确度也允许区分各种心血管疾病或病症,诸如区分慢性心 力衰竭和急性心力衰竭。另外,根据本发明的方法的准确度会提供将需要住院治疗的受试 者与可以出院的受试者区分开的工具。在本发明的一个优选实施方案中,所述增加的准确 度允许鉴别具有心肌梗塞的受试者(收进)和没有遭受心肌梗塞的受试者(排除)。
[0126] 根据该优选实施方案的根据本发明的方法包括,确定选自s⑶14、s⑶14-ST或除 了 SCD14-ST以外的sCD14的片段或衍生物的化合物,其中在得自相同受试者的相同或不 同样品中,确定所述化合物的量以及神经激素标志物、水平衡调节剂、缺血性心脏标志物、 转化生长因子-β细胞因子超家族的标志物、白介素受体家族的标志物(例如白介素1受 体-样1,也被称作ILlRLl和ST2)或嗜中性粒细胞明胶酶-相关的脂质运载蛋白(NGAL) 和/或一种炎症标志物的量。
[0127] 所述神经激素标志物可以选自,例如,心房利钠肽(ANP)、脑(Β-型)利钠肽(BNP) 或各种前肽NT-proANP、proANP和NT-proBNP的N-端片段,NT-proBNP作为神经激素标志 物是优选的。水平衡的标志物可以选自,例如,从前-加压素原(pre-provasopressin)衍 生出的肽,优选肽素。肽素是前-加压素原的C-端部分。
[0128] 例如,可以将cTn确定为缺血性心脏标志物,优选地作为心肌梗塞的标志物。在多 标志物方案中,缺血性心脏标志物优选地是cTnT或cTnl,且更优选高灵敏度cTnT (hsTnT) 或高灵敏度cTnl,且缺血性心脏标志物的参比量优选地是约8 pg/ml。
[0129] 所述炎症标志物可以选自,例如,C-反应蛋白(CRP)、白介素尤其是IL-6和粘附分 子诸如VCAM和ICAM。优选地将CRP或IL-6确定为炎症标志物。
[0130] 关于根据一个特定实施方案炎症标志物的应用,除了确定选自s⑶14、s⑶14-ST 或除了 SCD14-ST以外的sCD14的片段或衍生物的化合物的量以外,在受试者的相同或不 同样品中确定C-反应蛋白(CRP)、尤其是高灵敏度C-反应蛋白(hs-CRP)的量,所述优选 实施方案会提供确定结果的极大增强的灵敏度和区分以下受试者的特异性:要收入医院并 最终进行干预的受试者或处于死亡风险的受试者,和不考虑进一步临床或医学治疗的受试 者。通过已知方法(Roberts 等人,Clin Chem 2001,47: 418-425 [Erratum, Clin Chem 2001;47:980.]),例如通过比率浊度法或通过单克隆抗体、固相、夹心型酶免疫测定(例如 IMx, Abbott Laboratories, North Chicago),用世界卫生组织的关于CRP免疫测定的国 际参比标准(85/506)校准(WHO Expert Committee on Biological Standardization. Thirty-seventh report. World Health Organ Tech Rep Ser 1987; 760:21-22),可以测 定C-反应蛋白。通过测定检测的值的范围通常是0.05-30 ygVl。C-反应蛋白的中位正 常值通常是〇. 8 μg/ml,正常值的90%〈3 μg/ml且99%〈10. 0 μg/ml。参比量(即彡4 yg/ ml的C-反应蛋白水平,和特别是>10 μ g/ml的C-反应蛋白水平)应当优选地是收入医院 的阈值。
[0131 ] 在多标志物方案中,所述炎症标志物优选地是原降钙素(PCT),且PCT的参比量优 选地是约 〇· 5 ng/ml、2. 0 ng/ml 和 10 ng/ml。
[0132] 转化生长因子_β细胞因子超家族的标志物可以选自例如TGF-β亚型,优选地可以 确定MIC-I或⑶F-15 ;转化生长因子-β细胞因子超家族的标志物的参比量优选地是约1. 0 ng/ml〇
[0133] 作为白介素受体家族的标志物,优选地可以选择IL1RL1/ST2。
[0134] 水平衡的标志物可以选自,例如,前-加压素原衍生的肽,优选肽素。肽素的参比 量优选地是11. 25 pmol/L〇
[0135] 作为肾损伤的标志物,优选地可以选择嗜中性粒细胞明胶酶-相关的脂质运载蛋 白(NGAL) 0
[0136] 在某些实施方案中,除了选自神经激素标志物(例如NT-proBNP)、缺血性心脏 标志物(例如hsTnT)、炎症标志物(例如C-反应蛋白,CRP)和白介素-1受体家族的标 志物(例如IL1RL1/ST2)的至少一种额外标志物的量以外,确定s⑶14、s⑶14-ST或除了 SCD14-ST以外的sCD14的片段或衍生物的量。在这样的实施方案中,所述疾病或病症是在 本发明的含义内的疾病或病症,即心血管疾病或病症或动脉粥样硬化。它可以是或包括例 如急性心力衰竭。例如,所述疾病或病症也可以选自急性冠状动脉综合征、急性心力衰竭、 慢性心力衰竭、冠状动脉疾病、心绞痛、心肌梗塞、缺血性中风、出血性中风,和/或短暂脑 缺血发作。
[0137] 优选地,根据本发明的受试者被送至急诊科,优选地在医院中,甚至更优选医学急 诊科。
[0138] 在本发明的上下文中,术语"急诊科"表示,感觉不适的受试者或寻求评价他们的 发展某种某种疾病的个体风险的受试者所在的任何地方,以便咨询具有医学背景的人,优 选医师,以得到他们的生理学状态和/或引起他们的不适的原因的分析。典型例子是医院 的急诊科或急诊室、救护车、医生的诊所或医生的办公室和适合于诊断和/或治疗受试者 的其它机构。
[0139] 本发明的方法优选地是体//方法。此外,它可以包括除了上面明确地提及的那些 以外的步骤。例如,其它步骤可以涉及样品预处理或通过所述方法得到的结果的评价。所 述方法可以手工地进行或通过自动化来辅助。优选地,步骤(a)和/或(b)可以完全地或 部分地通过自动化来辅助,例如,通过合适的机器人和感觉设备,以实现在步骤(a)中的确 定或在步骤(b)中的计算机执行的对比。
[0140] 本文中使用的术语"评价"是指,评估受试者是否处于发展心血管病症或疾病的高 风险,受试者是否需要住院治疗,或受试者是否将受益于特定治疗。本领域技术人员会理 解,这样的评估经常无意对于所有(即100%)要鉴别的受试者而言都是正确的。但是,该术 语要求,可以鉴别出统计上显著部分的受试者(例如在组群研究中的组群)。本领域技术人 员使用各种众所周知的统计评价工具,例如,置信区间的确定、p-值确定、student氏t-检 验、Mann-Whitney检验等,可以不费周折地确定一个部分是否是统计上显著的。细节参见 Dowdy和 Wearden, Statistics for Research, John Wiley & Sons, New York 1983。优 选的置信区间是至少90%、至少95%、至少97%、至少98%或至少99%。p-值优选地是0. 1、 0. 05、0. 01、0. 005或0. 0001。更优选地,通过本发明的方法可以适当地鉴别出群体中的至 少60%、至少70%、至少80%或至少90%的受试者。
[0141] 本文中使用的术语"预测"表示评估可能性,根据该可能性,受试者将在将来在确 定的时间窗(预测窗)内死亡。所述预测窗是受试者根据预测的可能性将在其中死亡的区 间。所述预测窗可以是通过本发明的方法分析以后受试者的整个剩余寿命。但是,优选地, 所述预测窗是心血管并发症出现以后(更优选地和精确地,已经得到要通过本发明的方法 分析的样品以后)1个月、6个月或1、2、3、4、5或10年的区间。本领域技术人员会理解, 这样的评估经常无意针对100%的要分析的受试者都是正确的。但是,该术语要求,评估对 于要分析的受试者的统计上显著的部分而言是有效的。本领域技术人员使用各种众所周 知的统计评价工具,例如,置信区间的确定、P-值确定、Student氏t-检验、Mann-Whitney 检验等,可以不费周折地确定一个部分是否是统计上显著的。细节参见Dowdy和Wearden, Statistics for Research, John Wiley & Sons, New York 1983。优选的置信区间是至 少90%、至少95%、至少97%、至少98%或至少99%。p-值优选地是0.1 、0. 05、0. ΟΚΟ. 005或 0. 0001。优选地,通过本发明预见到的可能性允许,所述预测对于给定组群的至少60%、至少 70%、至少80%或至少90%的受试者而言是正确的。
[0142] 本文中使用的术语"死亡率"是指由心血管并发症、肺疾病、肺栓塞、血栓形成、血 栓栓塞性并发症、中风、肿瘤和恶性疾病、脓毒症、脓毒性休克、出血障碍、器官衰竭、急性肾 脏疾病、感染性疾病、胃肠的并发症、胰腺病(pancreatits)、风湿病和其它病症造成的死亡 率。
[0143] 本文中使用的表述"评价死亡风险"是指,要通过本发明的方法分析的受试者被分 配进具有正常(即未升高的)死亡风险的群体的受试者组中,或被分配进具有显著高风险的 受试者组中。根据本发明提及的高风险是指,受试者在预定预测窗内的死亡风险与受试者 群体中的平均死亡风险相比显著升高。优选地,对于1年的预测窗,平均风险是〇. 5-3. 0% 的范围内,优选1. 5%。就1年的预测窗而言,本文中使用的高风险优选地是指超过3. 0%的 风险,优选地超过5. 0%,且最优选地在3. 0%至8. 0%内。这样的风险分级可以应用的时间 范围(也就是说,可以预测其预后风险的阶段)可以是1天至5年,更优选1周至2年,和 1个月至1年。
[0144] 一般而言,在健康的参比群体中和在遭受心血管疾病或病症或动脉粥样硬化的受 试者中确定选自s⑶14、s⑶14-ST或除了 s⑶14-ST以外的s⑶14的片段或衍生物的化合物 或至少一种额外标志物的量,以便分别确定与某种生理学状态有关的各种标志物的参考值 和阈值。通过技术人员已知的统计方法,诸如ROC (受试者操作特征)分析,分析测量的结 果。为特定心血管疾病或病症或动脉粥样硬化或为受试者的某种风险状态确定阈值,其中 以这样的方式选择所述阈值,从而得到适合于特定用途的测定特异性和/或灵敏度。
[0145] 在一个优选的实施方案中,考虑到所述值在群体中的分布来选择所述阈值。可能 有用的是,例如,选择健康组和/或非健康组的中位值、60%、70%、80%、90%、95%、98%或99%
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