虚拟细胞染色的制作方法

文档序号:6484515阅读:343来源:国知局
虚拟细胞染色的制作方法
【专利摘要】本发明公开了使用系统和方法来显示生物细胞的细胞结构。存储生物细胞的多个细胞结构,并存储多个细胞结构中的每个细胞结构的一种或多种染色颜色。从输入装置接收选定的细胞结构。检索选定的细胞结构的一种或多种染色颜色。显示所述选定的细胞结构的一种或多种染色颜色。从输入装置接收选定的染色颜色。将选定的细胞结构以选定的染色颜色显示在示例性细胞图像中。此外,存储生物细胞的三维图像。将所述三维图像显示在包括触摸屏的显示器上。从触摸屏接收移动选择。根据移动选择在显示器上显示三维图像。
【专利说明】虚拟细胞染色
[0001]相关申请
[0002]本申请要求2010年12月7日提交的美国临时申请系列号61/420,708,2011年3月8日提交的美国临时申请系列号61/450,519和2011年9月30日提交的美国临时申请系列号61/541,375在35U.S.C.§ 119(e)下的权益。上述申请的公开内容通过引用并入本文,如同完整地阐述。
【技术领域】
[0003]本公开内容一般地涉及生物学材料的成像,更具体地涉及用于细胞和有关结构的虚拟染色的系统、方法、软件和计算机可用介质。
【背景技术】
[0004]在成像实验中,使用染料或染色剂来标记生物细胞的不同细胞器或结构。例如,将细胞的这些结构染色,以分析或研究细胞。经常同时将细胞的2个或更多个结构染色。这被称作多路染色。串扰是从多路染色发射的颜色的重叠或混合。如果在从多路染色发射的颜色中存在过多的串扰,那么不可能区分各个结构。所以,也就不可能鉴别或分析细胞的特定结构用于实验。
[0005]传统地,在包括多路染色的成像实验中,通过试验和误差已经很大程度上实现了串扰防止。通常,购买试剂,执行方案,将细胞染色,并使用适合的显微镜来确定串扰是否明显。然后反复地执行这些步骤,直到发现不会产生串扰的染色剂组合。这样的方案经常需要购买和使用超过必要的试剂,且也可以显著增加执行成像实验所需的总时间。

【发明内容】

[0006]提供了用于建立虚拟细胞染色的系统和方法。具体地,提供了用于使在多路染色应用中使用的试剂之间的颜色串扰最小化的技术。
[0007]在一个方面,提供了用于显示生物细胞的一种或多种细胞结构的系统。所述系统包括存储器、输入装置、显示器和处理器。所述存储器被构造成存储生物细胞的多个细胞结构以及每个细胞结构的一种或多种染色颜色。所述处理器与所述存储器、所述输入装置和所述显示器通信。所述处理器进一步被构造成:从输入装置接收选定的细胞结构,从所述存储器检索所述选定的细胞结构的一种或多种染色颜色,将所述选定的细胞结构的一种或多种染色颜色显示在所述显示器上,从输入装置接收选定的染色颜色,并将具有选定的染色颜色的选定的细胞结构显示在所述显示器上的示例性细胞图像中,所述示例性细胞图像代表具有选定的染色颜色的选定的细胞结构的染色。
[0008]在一个方面,提供了一种用于显示生物细胞的细胞结构的方法。使用存储器存储生物细胞的多个细胞结构和每个细胞结构的一种或多种染色颜色。使用处理器,从输入装置接收选定的细胞结构。使用处理器,从所述存储器检索选定的细胞结构的一种或多种染色颜色。使用处理器,将所述选定的细胞结构的一种或多种染色颜色显示在显示器上。使用处理器,从输入装置接收选定的染色颜色。使用处理器,将所述选定的细胞结构以所述选定的染色颜色显示在显示器上的示例性细胞图像中,所述示例性细胞图像代表具有选定的染色颜色的选定的细胞结构的染色。
[0009]在一个方面,提供了一种计算机程序产品,其包括非暂时的和实体的计算机可读的存储介质,所述存储介质的内容包括具有指令的程序,所述指令在处理器上执行,从而实现用于显示生物细胞的细胞结构的方法。提供了一种系统,其中所述系统包括一个或多个不同的软件模块,且其中所述不同的软件模块包括存储模块和染色模块。使用存储模块,在存储器中存储生物细胞的多个细胞结构和每个细胞结构的一种或多种染色颜色。使用染色模块,从输入装置接收选定的细胞结构。使用存储模块,从存储器检索选定的细胞结构的一种或多种染色颜色。使用染色模块,在显示器上显示选定的细胞结构的一种或多种染色颜色。使用染色模块,从输入装置接收选定的染色颜色。使用染色模块,将选定的细胞结构以选定的染色颜色显示在显示器上的示例性细胞图像中,所述示例性细胞图像代表具有选定的染色颜色的选定的细胞结构的染色。
[0010]在一个方面,提供了用于显示生物细胞的一种或多种细胞结构的系统。所述系统包括存储器和处理器。所述存储器被构造成存储生物细胞的多个细胞结构和每个细胞结构的一种或多种染色颜色。所述处理器与所述存储器和客户端装置通信。所述处理器进一步被构造成:从所述客户端装置接收选定的细胞结构,从所述存储器检索所述选定的细胞结构的一种或多种染色颜色,将所述选定的细胞结构的一种或多种染色颜色传送并显示在所述客户端装置上,从输入装置接收选定的染色颜色,和将具有选定的染色颜色的选定的细胞结构传送并显示在所述客户端装置上的示例性细胞图像中,所述示例性细胞图像代表具有选定的染色颜色的选定的细胞结构的染色。
[0011]在一个方面,提供了一种允许用户定购试剂产品的方法。提供了一种计算机程序产品,其包括处理器,所述处理器允许用户在装置中执行涉及试剂产品的模拟。利用所述计算机程序产品和在所述装置上显示与试剂产品相对应的可选项,其中当被用户选择时,所述处理器被构造成触发所述试剂产品的定购。使用处理器处理触发的试剂产品定购。
[0012]本文提供了这些和其它特征。
【专利附图】

【附图说明】
[0013]技术人员会理解,下面描述的附图仅仅用于解释目的。所述附图无意以任何方式限制本教导的范围。
[0014]图1的框图解释了可以在其上面实现本教导的实施方案的系统。
[0015]图2是根据不同的实施方案,用于显示生物细胞结构的系统的示例性初始屏幕。
[0016]图3是根据不同的实施方案,在用于显示生物细胞结构的系统中选择NUCLEUS (细胞核)细胞结构以后所显示的示例性屏幕。
[0017]图4是根据不同的实施方案,在用于显示生物细胞结构的系统中选择NUCLEUS (细胞核)细胞结构和GREEN(绿色)染色颜色以后所显示的示例性屏幕。
[0018]图5是根据不同的实施方案,在用于显示生物细胞结构的系统中为NUCLEUS(细胞核)细胞结构和GREEN(绿色)染色颜色选择试剂产品以后所显示的示例性屏幕。
[0019]图6是根据不同的实施方案,在用于显示生物细胞结构的系统中为NUCLEUS(细胞核)和PLASMA MEMBRANE(质膜)细胞结构选择试剂产品以后所显示的示例性屏幕。
[0020]图7是根据不同的实施方案,在用于显示生物细胞结构的系统中为MITOCHONDRIA (线粒体)细胞结构和GREEN (绿色)染色颜色选择试剂产品以后所显示的示例性屏幕。
[0021]图8是根据不同的实施方案,在用于显示生物细胞结构的系统中为LYS0S0MES(溶酶体)细胞结构和GREEN(绿色)染色颜色选择试剂产品以后所显示的示例性屏幕。
[0022]图9是根据不同的实施方案,在用于显示生物细胞结构的系统中为MITOCHONDRIA (线粒体)和LYS0S0MES (溶酶体)细胞结构选择试剂产品以后所显示的示例
性屏幕。
[0023]图10是根据不同的实施方案,用于显示生物细胞的三维(3-D)细胞结构的系统的示例性初始屏幕。
[0024]图11是根据不同的实施方案,用于显示生物细胞的3-D细胞结构的系统的示例性屏幕,其表明可以倾斜3-D细胞图像。
[0025]图12是根据不同的实施方案,用于显示生物细胞的3-D细胞结构的系统的示例性屏幕,其表明可以倾斜、平移和缩放3-D细胞图像。
[0026]图13是根据不同的实施方案,用于显示生物细胞的3-D细胞结构的系统的示例性屏幕,其显示了关于细胞结构的信息。
[0027]图14是根据不同的实施方案,显示了用于显示生物细胞的细胞结构的方法的示例性流程图。
[0028]图15是根据不同的实施方案,一个系统的示意图,所述系统包括一个或多个不同的软件模块,所述软件模块执行用于显示生物细胞的细胞结构的方法。
[0029]图16是根据不同的实施方案,显示了用于显示生物细胞的三维细胞结构的方法的示例性流程图。
[0030]图17是根据不同的实施方案,一个系统的示意图,所述系统包括一个或多个不同的软件模块,所述软件模块执行用于显示生物细胞的三维细胞结构的方法。
[0031]图18的示例性流程图显示了用于获得关于在模拟环境中使用的试剂产品的信息的方法。
[0032]图19的示例性流程图显示了用于允许用户定购试剂产品的方法。
[0033]在详细描述本教导的一个或多个实施方案之前,本领域技术人员会明白,本教导的应用不限于在下述详细描述中阐述的或在附图中图解的构造细节、组件排列和步骤排列。并且,应当理解,在本文中使用的短语和术语是用于描述目的,不应视作限制性的。
【具体实施方式】
[0034]系统
[0035]图1是解释系统100的框图,在所述系统100上可以实现本教导的实施方案。系统100可以是,但不限于,计算机、移动电话、小片装置、游戏装置、音乐播放器、视频播放器或实验室仪器。计算机可以包括能够计算的任意装置,且可以包括例如工作站、台式计算机、膝上型计算机。在不同的实施方案中,系统100可以是网络或应用服务器,其可以被构造成通过网络(例如,LAN、WAN、因特网等)连接(例如,硬线或无线)与一个或多个客户端装置通信。例如,系统100可以经由例如第6类(Category6,CAT6)、光纤、W1-Fi, WLAN等与开关、路由器和/或万维网服务器(未显示)通信连接,所述开关、路由器和/或万维网服务器通过因特网与一个或多个客户端装置(未显示)通信连接。
[0036]小片装置可以包括基本上成形为小片的任何电子器件,且可以包括例如iPadK、基于Windows的小片装置或基于Android+的小片装置。移动电话装置可以包括可被用户携带且能够允许用户进行电话会话的任意装置,且可以包括例如iPhoneK、基于WindowsPhone?的移动电话、基于WebOS?的移动电话或基于Android的移动电话。游戏装置可以包括能够允许用户玩视频游戏和访问因特网的任意装置,且可以包括例如Playstationk装置或装置。音乐播放器和视频播放器可以包括分别能够播放音乐和视频的任意装置。实验室仪器可以包括适合在实验室中使用的任意仪器,且可以包括例如遗传分析仪、核酸测序仪、核酸合成仪、核酸纯化仪、流式细胞计、基因表达分析仪、基因图谱仪、细胞分析仪、细胞计数器、数字显微镜等。
[0037]在不同的实施方案中,系统100可以包括总线102或用于传递信息的其它通信机构、以及用于处理信息的与总线102联接的处理器104。系统100还可以包括存储器106和要由处理器104执行的指令,所述存储器106可以是随机存取存储器(RAM)或其它动态存储设备,其与总线102联接用于确定基础调用。存储器106也可以用于在执行要由处理器104执行的指令的过程中存储临时变量或其它中间信息。系统100可以进一步包括只读存储器(ROM) 108或其它静态存储设备,其与总线102联接,用于存储处理器104的静态信息和指令。可以提供存储设备110 (诸如磁盘或光盘)并与总线102联接,用于存储信息和指令。
[0038]系统100可以经由总线102联接至显示器112,诸如阴极射线管(CRT)或液晶显示器(LCD),用于给用户显示信息。输入装置114(其可以包括字母数字和其它键)可以联接至总线102,用于将信息和命令选择传递给处理器104。另一类用户输入装置是光标控制116,诸如鼠标、跟踪球或光标方向键或触敏垫或屏,用于将方向信息和命令选择传递给处理器104,并用于控制显示器112上的光标移动。该输入装置通常具有在2个轴线中的2个自由度:第一轴线(即,x)和第二轴线(即,y),从而允许所述装置指定平面中的位置。
[0039]系统100可以执行本教导。与本教导的某些实现相一致,响应于处理器104执行在存储器106中含有的一个或多个指令的一个或多个序列,由系统100提供结果。这样的指令可以从其它计算机可读介质(诸如存储设备110)读入存储器106。在存储器106中含有的指令序列的执行,可以造成处理器104执行本文所述的过程。可替换地,可以使用硬线电路替代软件指令或与软件指令相组合以实现本教导。因而,本教导的实现不限于硬件电路和软件的任何特定组合。
[0040]本文使用的术语“计算机可读介质”表示,参与将指令提供给处理器104用于执行的任何实体的且非暂时的介质。这样的介质可以呈许多形式,包括、但不限于,非易失性介质、易失性介质和传输介质。非易失性介质包括,例如,光盘或磁盘,诸如存储设备110。易失性介质包括动态存储器,诸如存储器106。传输介质包括同轴电缆、铜线和光纤,包括构成总线102的线。
[0041]计算机可读介质的常见形式包括,例如,软盘、软磁盘、硬盘、磁带或任意其它磁性介质、CD-ROM、任意其它光学介质、穿孔卡片、纸带、具有孔图案的任意其它物理介质、RAM、PROM、EPROM、FLASH-EPROM、任意其它存储芯片或筒、或计算机可以从其读出的任意其它实体的和非暂时的介质。
[0042]多种形式的计算机可读介质可以参与将一个或多个指令的一个或多个序列传送至处理器104用于执行。例如,所述指令最初可以在远程计算机的磁盘上传送。所述远程计算机可以将所述指令加载进它的动态存储器中,并使用调制解调器电话线发送所述指令。在系统100局部的调制解调器可以接收在电话线上的数据,并使用红外变送器将所述数据变换成红外信号。联接至总线102的红外检测器可以接收在红外信号中传送的数据,并将所述数据放置在总线102上。总线102可以将所述数据传送至存储器106,处理器104从所述存储器106检索指令并执行所述指令。由存储器106接收的指令可以任选地在被处理器104执行之前或之后存储在存储设备110上。
[0043]根据不同的实施方案,在实体的和非暂时的计算机可读介质上存储被构造成由处理器执行以实现方法的指令。所述计算机可读介质可以是存储数字信息的装置。例如,计算机可读介质包括本领域已知的用于存储软件的光盘只读存储器(CD-ROM)。所述计算机可读介质可被处理器存取,所述处理器适用于执行构造成要执行的指令。
[0044]系统100还可以包括输入/输出端口 118。输入/输出端口 118可以用于连接至通信装置。通信装置可以包括有线或无线网络接口设备。有线或无线网络接口设备可以连接至私用或公用网络。一个示例性的公用网络是例如因特网。有线或无线网络接口设备可以通过一个或多个因特网服务提供者(ISP)的一个或多个计算机连接至因特网。系统100可以是特定系统的一部分,所述特定系统可以包括、但不限于,基于网的系统、云计算系统或软件服务系统(SAAS)。
[0045]为了解释和描述目的,已经提供本教导的不同实现的下述描述。所述描述不是穷尽性的,且不会将本教导限于公开的精确形式。考虑到上述教导,改变和变化是可能的,或者可以从本教导的实践中获取。另外,描述的实现包括软件,但是本教导可以实现为硬件和软件的组合或实现在单独的硬件中。本教导可以用面向对象的和非面向对象的编程系统实现。
[0046]数据处理系统和方法
[0047]如上所述,包含多路染色的成像实验在传统上已经需要试验和误差方案来防止发射的颜色之间的串扰。在该方案中,反复执行购买试剂、执行方案、对细胞染色和分析发射的颜色的步骤,以使串扰最小化或消除。该方案可以需要购买和使用超过必要的试剂,且可以增加执行成像实验所需的总时间。
[0048]在不同的实施方案中,使用系统和方法来建立虚拟细胞染色。该虚拟细胞染色可以用于防止在例如包含多路染色的成像实验中发射的颜色之间的串扰,或者使所述串扰最小化。虚拟细胞染色包括:将示例细胞的一个或多个结构显示在电子器件的显示器上,并允许用户改变所述细胞的一个或多个结构的个别颜色。可以将所述细胞的一个或多个结构的颜色改变成由已知的染色剂发射的颜色,所述已知的染色剂从所述一个或多个结构的已知试剂生产。该虚拟细胞染色允许用户施加多个多路染色组合,无需购买任何试剂,且无需执行任何实验室方案。
[0049]图2是根据不同的实施方案,用于显示生物细胞结构的系统的示例性初始屏幕200。屏幕200可以包括细胞图像区域210、细胞结构菜单220、提示230、全屏按钮240和反馈链接250。在屏幕200中,示例细胞图像显示在图像区域210中,所述图像区域210包括可用于染色的所有细胞结构的图像。这些细胞结构也作为细胞结构菜单220中的可选菜单项目被列出。在细胞图像区域210中显示并在细胞结构菜单220中列出的细胞结构可以包括、但不限于:自体吞噬体、细胞骨架-肌动蛋白、细胞骨架-微管蛋白、内质网、核内体、高尔基体、溶酶体、线粒体、细胞核、过氧化物酶体和质膜。
[0050]在图像区域210中显示的示例性细胞图像可以是,例如,得自一个或多个分层细胞的细胞结构的2个或更多个图像的编绘图。细胞结构的2个或更多个图像可以从例如真实细胞图像或人工建立的图像产生。在图像区域210中的示例性细胞图像被设计成描绘/显示细胞结构和当施加选择的试剂来将结构染色进行观察时它们所呈现的样子。在图像区域210中的示例性细胞图像的细胞结构可以以相同的颜色显示,且优选地以没有用于染色的颜色显示。例如,示例性细胞图像的细胞结构可以以在黑色背景上的白色来显示。为了例证目的,在图2的图像区域210中的示例性细胞图像的细胞结构以在白色背景上的黑色来显示。
[0051]在细胞结构菜单220中列出的每个细胞结构是可选择的。提示230会促进在细胞结构菜单220中列出的细胞结构的选择,以便选择染色剂和开始虚拟细胞染色。全屏按钮240和反馈链接250也是可选择的。例如,全屏按钮240可以使屏幕200或屏幕200的一部分占据显示器的整个屏幕。反馈链接250可以提供与虚拟细胞染色的开发者的通信。该通信可以包括、但不限于,电子邮件、聊天、文本或超链接。它还可以包括这样的电子邮件、聊天、文本或超链接:其含有关于该系统的任何特征或部件的信息,包括关于可使用该系统定购的产品或试剂的一个或多个特征的信息。
[0052]图3是根据不同的实施方案,在用于显示生物细胞结构的系统中选择NUCLEUS(细胞核)细胞结构以后所显示的示例性屏幕300。在屏幕300中,可用于将选定的细胞结构染色的染色颜色显示在染色颜色菜单310中。染色颜色是例如,在已经执行细胞染色方案以后从细胞结构发射的光的发射频率或波长。
[0053]可用于将选定的细胞结构染色的染色颜色取决于例如可从一个或多个试剂供应商得到的试剂。可用于将选定的细胞结构染色的染色颜色还可以取决于已知细胞结构能够发射的染色颜色的光谱。例如,如本文证实的,细胞结构“NUCLEUS (细胞核)”在细胞结构菜单220中突出显示(粗体),从而表明细胞结构“NUCLEUS (细胞核)”被选定。可用于NUCLEUS(细胞核)细胞结构的染色颜色可以包括、但不限于:蓝色、绿色、橙红色或远红外。
[0054]用户可以选择在染色颜色菜单310中列出的每种染色颜色。选择染色颜色菜单310中的染色颜色会继续虚拟细胞染色过程。因为从图2所示的初始屏幕200中选择细胞结构“NUCLEUS (细胞核)”,图3的图像区域210仍然描绘了该示例性细胞图像。在不同的实施方案中,图3的图像区域210可以以除了染色颜色以外的颜色显示选定的细胞结构的示例性图像。
[0055]图4是根据不同的实施方案,在用于显示生物细胞结构的系统中选择NUCLEUS (细胞核)细胞结构和GREEN(绿色)染色颜色以后所显示的示例性屏幕400。在屏幕400中,可用于将选定的细胞结构染色以得到期望的染色颜色的试剂染色剂产品显示在产品菜单410中。在产品菜单410中显示的产品取决于选择的细胞结构和选择的染色颜色的组合。[0056]在产品菜单410中,显示了每个产品的名称。产品可以用于一类或多类成像实验。所以,在产品菜单410中显示的每个产品还可以包括一个或多个指示符,所述指示符指定用该产品可以实现的一类或多类实验。用染色剂产品可以实现的实验的类型可以包括、但不限于:活细胞应用、固定细胞应用、或在固定后保留活细胞的应用。
[0057]在产品菜单410中列出的每个产品名称可以是可选择的。选择产品菜单410中的产品名称会继续虚拟细胞染色过程。还可以通过按下APPLY STAIN(应用染色剂)按钮420的邻近APPLY STAIN(应用染色剂)按钮来选择产品。如本文所描描述的,细胞结构“NUCLEUS(细胞核)”在细胞结构菜单220中突出显示,且染色颜色“GREEN(绿色)”在染色颜色菜单310中突出显示,从而表明在产品菜单410中的产品可用于NUCLEUS (细胞核)细胞结构和GREEN(绿色)染色颜色的组合。在图像区域210中还显示了示例细胞图像。在不同的实施方案中和如上所述,图像区域210还可以以除了选定的染色颜色以外的颜色显示选定的细胞结构的示例性图像。
[0058]图5是根据不同的实施方案,在用于显示生物细胞结构的系统中为NUCLEUS(细胞核)细胞结构和GREEN (绿色)染色颜色选择试剂产品以后所显示的示例性屏幕500。在屏幕500中,在APPLIED STAINS (应用的染色剂)菜单510中列出选择的试剂产品。然后在图像区域210中显示以选择的试剂产品的染色颜色染色的选定的细胞结构的图像。最后,除去邻近在产品菜单410中的选择的产品的APPLY STAIN(应用染色剂)按钮,以进一步显示选择的试剂产品。也使得在产品菜单410中的产品名称不再是可选择的。
[0059]在APPLIED STAINS (应用的染色剂)菜单510中,显示选择的产品的名称,并指示由选择的产品可实现的实验的类型。另外,从选择的试剂产品的至少一个供应商可得到目录编号。例如,所述目录编号是可选择的。在不同的实施方案中,选择目录编号会提供与选择的产品的供应商的通信,从而可以得到关于特定产品的更多信息。在APPLIED STAINS (应用的染色剂)菜单510中选择产品名称可以可替换地或额外地提供相同的通信。该通信可以包括、但不限于,电子邮件、文本、聊天或超链接。
[0060]取消选择按钮520在APPLIED STAINS (应用的染色剂)菜单510中的选择的产品附近。可以使用取消选择按钮520来除去应用的染色剂。选定取消选择按钮会从APPLIEDSTAINS(应用的染色剂)菜单510中除去选择的产品。然后可以将前一图像恢复至图像区域210,并可以使APPLY STAIN(应用染色剂)按钮返回取消选择的产品附近。换而言之,选定取消选择按钮520会导致例如返回图4的屏幕400。
[0061]图5的屏幕500也在APPLIED STAINS (应用的染色剂)菜单510下面提供了许多按钮或可选项。这些按钮或可选项可以包括、但不限于:ADD TO CART(加入购物车)按钮530、EMAIL(电子邮件)选择540、PRINT(打印)选择550和HELP(帮助)选择560。ADDTO CART(加入购物车)按钮530允许将选择的产品加入电子商务购物车,从而可以购买选择的产品。所述购物车可以是用于显示生物细胞结构的系统的购物车或选择的产品的供应商的购物车。EMAIL (电子邮件)选择540允许例如发送关于选择的产品或来自屏幕500的任意其它信息的电子邮件。PRINT(打印)选择550允许例如打印选择的产品或来自屏幕500的任意其它信息。HELP(帮助)选择560会提供例如关于选择的产品或在屏幕500上的任意其它信息的帮助信息。
[0062]仅一种选择的产品会显示列出在APPLIED STAINS (应用的染色剂)菜单510中。APPLIED STAINS (应用的染色剂)菜单510可以包括2种或更多种选择的产品。在不同的实施方案中,用于显示生物细胞结构的系统可以具有对一次可以选择的产品的数目的限制。例如,所述系统可以将选择的产品的数目限制为4。在APPLIED STAINS (应用的染色剂)菜单510中的2种或更多种选择的产品可以选自在细胞结构菜单220中的细胞结构在染色颜色菜单310中的颜色的任意组合。例如,在APPLIED STAINS (应用的染色剂)菜单510中的2种或更多种选择的产品可以用于相同的细胞结构和相同的染色颜色、相同的细胞结构和不同的染色颜色、不同的细胞结构和相同的染色颜色、或不同的细胞结构和不同的染色颜色。
[0063]对于向/从APPLIED STAINS (应用的染色剂)菜单510添加/除去的每种选择的产品而言,可以用反映出细胞结构和保留的染色颜色的组合的图像更新图像区域210。2种或更多种细胞结构的图像可以在图像区域210中彼此叠加分层。在不同的实施方案中,将在APPLIED STAINS(应用的染色剂)菜单510中列出的产品的不同颜色混合为不同频率或波长的光,并以所述混合的频率或波长显示在图像区域210中。所以,具有2种不同染色颜色的2种产品的的叠加可以在图像区域210中产生例如具有第三种颜色的图像。换而言之,在图像区域210中显示的图像可以显示多路和多模态染色。所述图像是多路,因为它可以显示细胞结构的不同组合,所述图像是多模态的,因为它可以显示染色颜色的不同组合。
[0064]图6是根据不同的实施方案,在用于显示生物细胞结构的系统中为NUCLEUS(细胞核)和PLASMA MEMBRANE (质膜)细胞结构选择试剂产品以后所显示的示例性屏幕600。在屏幕600中,用于NUCLEUS (细胞核)和PLASMA MEMBRANE (质膜)细胞结构的产品显示列出在APPLIED STAINS (应用的染色剂)菜单510中。这2种产品都用于染色颜色绿色。细胞核和质膜细胞结构的分层染色图像可以显示在图像区域210中。在图像区域210中的染色的图像是多路染色的一个实施例。在该实施例中,从多路染色发射的颜色没有明显的“串扰”或重叠。2种细胞结构可容易地区分,所以没有必要为该细胞结构组合尝试不同的产品。
[0065]例如,通过在图5的细胞结构菜单220中选择“PLASMA MEMBRANE (质膜)”,可以使质膜细胞结构与细胞核细胞结构相组合。在选择绿色染色颜色和质膜试剂产品以后,产生图6的屏幕600。因此,在用于质膜的产品之前选择用于细胞核的产品,以产生图6的屏幕600。但是,通过在选择用于细胞核的产品之前选择用于质膜的产品,可以产生与屏幕600类似的屏幕。换而言之,在图像区域210中显示的图像独立于选择产品的次序。
[0066]图7是根据不同的实施方案,在用于显示生物细胞结构的系统中为MITOCHONDRIA(线粒体)细胞结构和GREEN(绿色)染色颜色选择试剂产品以后所显示的示例性屏幕700。在屏幕700中的APPLIED STAINS (应用的染色剂)菜单510可以包括为线粒体细胞结构和绿色染色颜色选择的产品。以选择的产品的绿色染色颜色,在图像区域210中显示了线粒体细胞结构的图像。
[0067]图8是根据不同的实施方案,在用于显示生物细胞结构的系统中为LYS0S0MES(溶酶体)细胞结构和GREEN (绿色)染色颜色选择试剂产品以后所显示的示例性屏幕800。在屏幕800中的APPLIED STAINS (应用的染色剂)菜单510可以包括为溶酶体细胞结构和绿色染色颜色选择的产品。以选择的产品的绿色染色颜色,在图像区域210中显示了溶酶体细胞结构的图像。
[0068]图9是根据不同的实施方案,在用于显示生物细胞结构的系统中为MITOCHONDRIA(线粒体)和LYS0S0MES(溶酶体)细胞结构选择试剂产品以后所显示的示例性屏幕900。在屏幕900中,用于线粒体和溶酶体细胞结构的产品显示列出在APPLIEDSTAINS(应用的染色剂)菜单510中。这2种试剂产品都用于染色颜色绿色。还可以在图像区域210中显示线粒体和溶酶体细胞结构的分层染色图像。在图像区域210中的染色图像也是多路染色的一个实施例。但是,在该实施例中,在从多路染色发射的颜色之间存在显著的串扰。因此,不可能区分图像区域210中的线粒体和溶酶体细胞结构。
[0069]但是,屏幕900可以用于发现会消除该串扰的染色颜色组合。例如,可以取消选择在APPLIED STAINS(应用的染色剂)菜单510中列出的任一种产品。使用细胞结构菜单220、染色颜色菜单310和产品菜单410,可以选择具有替代颜色的产品染色剂。可以重复该过程,直到发现会减少或消除从多路染色发射的颜色之间的串扰的颜色组合。可以在没有定购试剂和运行实验室方案的情况下完成该过程。还可以象可以选择不同的产品组合那样快速地完成该过程。所以,虚拟细胞染色可以减少建立成像实验的成本和时间。
[0070]屏幕900可以包括用于观察细胞结构的染色图像的图像区域210。例如,可以同时显示2个或更多个屏幕如屏幕900,以对比用不同的染色颜色染色的一种或多种细胞结构。在不同的实施方案中,屏幕900可以包括2个或更多个图像区域,用于对比用不同的染色颜色染色的2个或更多个染色图像。
[0071]在图2-9中描绘的虚拟细胞染色可以用于分析和研究生物细胞。可以观察分离的细胞结构,或者与其它细胞结构一起观察。可以探究细胞结构之间的空间联系。虚拟细胞染色也会显示将试剂产品应用于细胞结构的结果,且可以产生许多染色颜色组合。另外,它会揭示产品的能力和限制。
[0072]在不同的实施方案中,可以将细胞及其结构的三维(3-D)图像与虚拟细胞染色联系,以进一步辅助分析和研究细胞。如上所述,在图2-9中显示的图像是2-D图像的2个或更多个层的编绘图。在这些2-D图像中紧密接近地显示的细胞结构实际上在三维图像中可以分离。因此,3-D图像可以通过给出这些层的第三维而提供对细胞结构的邻近的洞察。
[0073]图10是根据不同的实施方案,用于显示生物细胞的3-D细胞结构的系统的示例性初始屏幕1000。屏幕1000可以包括3-D细胞图像1010、FEED BACK (反馈)选择1020、BACKTO STAIN YOUR OWN CELL (返回对你自己的细胞染色)选择1030和细胞结构菜单1040。3-D细胞图像1010可以提供细胞及其内部细胞结构的3-D视图。使用颜色来进一步区分内部细胞结构。3-D细胞图像1010可以是可移动的。例如,可以将其平移、缩放、倾斜或旋转。例如,通过通过用一个或多个手指或用光标触摸图像,可以在电子器件的显示器上移动3-D细胞图像1010。
[0074]图11是根据不同的实施方案,用于显示生物细胞的3-D细胞结构的系统的示例性屏幕1100,其表明可以倾斜3-D细胞图像1010。
[0075]图12是根据不同的实施方案,用于显示生物细胞的3-D细胞结构的系统的示例性屏幕1200,其表明可以倾斜、平移和缩放3-D细胞图像1010。
[0076]返回图10,FEED BACK(反馈)选择1020提供了与用于显示生物细胞的3_D细胞结构的系统的开发者的通信。该通信可以包括、但不限于,电子邮件、聊天、文本或超链接。BACK TO STAIN YOUR OWN CELL (返回对你自己的细胞染色)选择1030会激活虚拟细胞染色。例如,在选择BACK TO STAIN YOUR OWN CELL(返回对你自己的细胞染色)选择1030以后,会显示图2中的屏幕200。例如,在图2的屏幕200中,可以选择在图10的细胞结构菜单1040中选定的相同细胞结构。
[0077]细胞结构作为图10的细胞结构菜单1040中的可选菜单项目被列出。在细胞结构菜单1040中显示的细胞结构可以包括、但不限于:自体吞噬体、细胞骨架-肌动蛋白、细胞骨架-微管蛋白、内质网、高尔基体、溶酶体、线粒体、细胞核、过氧化物酶体和质膜。在细胞结构菜单1040中选择细胞结构可以造成该结构在3-D细胞图像1010中突出显示。例如,可以选择细胞结构“NUCLEUS (细胞核)”,并使其在细胞结构菜单1040中突出显示。这又可以造成细胞核细胞结构1050在3-D细胞图像1010中突出显示。
[0078]因此,使用细胞结构菜单1040,可以在3-D细胞图像1010中突出显示细胞结构。如上所述,通过选择图像,可以移动3-D细胞图像1010。在不同的实施方案中和可替换地,通过选择图像中的结构,可以在3-D细胞图像1010中突出显示细胞结构,且通过从菜单中选择移动功能,可以移动3-D细胞图像1010。
[0079]在不同的实施方案中和可替换地,可以使用细胞结构菜单1040来提供关于选定的细胞结构的更多信息。该信息可以包括细胞结构的示例性的染色的2-D图像、细胞结构的描述、和可以用于将细胞染色以观察细胞结构的试剂产品列表。在观察选定的细胞结构的染色的3-D图像以后立即观察相同细胞结构的染色的2-D图像,会帮助理解染色的2-D图像。
[0080]图13是根据不同的实施方案,用于显示生物细胞的3-D细胞结构的系统的示例性屏幕1300,其显示了关于细胞结构的信息。屏幕1300可以包括2-D细胞结构图像1310、FEED BACK (反馈)选择1020、BACK TO STAIN YOUR OWN CELL (返回对你自己的细胞染色)选择1030、细胞结构描述1340和试剂产品菜单1350。2-D细胞结构图像1310是选定的细胞结构的示例性2-D染色图像。2-D细胞结构图像1310显示为细胞核1360的线形式图形。在不同的实施方案中,用在黑色背景上的示例性颜色染色来显示细胞核1360的特征。
[0081]如上所述,FEED BACK(反馈)选择1020可以提供与用于显示生物细胞的3-D细胞结构的系统的开发者的通信。BACK TO STAIN YOUR OWN CELL (返回对你自己的细胞染色)选择1030会激活虚拟细胞染色。细胞结构描述1340可以是选定的细胞结构的文字描述。
[0082]试剂产品菜单1350可以是可从一个或多个供应商得到用于对选定的细胞结构染色的试剂产品的列表。试剂产品菜单1350包括产品名称和目录编号。选择产品名称或目录编号可以提供关于该产品的更多信息。例如,该信息可以来自用于显示生物细胞的3-D细胞结构的系统或产品供应商。
[0083]在图2-9中显示的虚拟细胞染色和用于显示3-D细胞结构的系统和方法,是用于分析和研究细胞和细胞结构的有用工具。这些工具对于许多用户而言是有用的,所述用户包括、但不限于研究人员、试剂产品供应商、保健提供者、学生和教育人员。此外,将这些工具放在移动式电子器件上会增加它们的有用性。可显示这些工具的移动式装置可以包括、但不限于:小片装置、便携式电话、音乐播放器、游戏装置或移动式计算机。例如,使用触摸屏、点击设备或这些移动式装置的键盘,可以做出选择和操纵图像。
[0084]虚拟细胞染色系统
[0085]图1的框图解释了可以在其上面实现本教导的实施方案的系统100。用于显示生物细胞的细胞结构的系统可以包括存储器、输入装置、显示器和处理器。所述系统可以是,例如,计算机、小片装置或移动电话。所述系统可以连接至网络,或者可以没有连接地运行。所述存储器可以包括、但不限于,RAM106、R0M108、或系统100的磁盘存储器110。所述输入装置可以包括、但不限于,输入装置114或与输入/输出端口 118连接的其它装置。所述输入装置是,例如,点击设备或显示器的触摸屏。所述显示器可以包括、但不限于,显示器112。所述显示器是,例如,电子显示器。所述处理器可以是,但不限于,处理器104。所述处理器是,例如,微处理器、信号处理器、专用集成电路或现场可编程门阵列。
[0086]所述存储器可以存储生物细胞的多个细胞结构。它还可以存储所述多个细胞结构中的每个细胞结构的一种或多种染色颜色。
[0087]所述处理器可以与所述存储器、所述输入装置和所述显示器通信。所述处理器可以从输入装置接收选定的细胞结构。所述输入装置可以是,例如,显示器的触摸屏。所述处理器可以从所述存储器检索所述选定的细胞结构的一种或多种染色颜色。所述处理器可以将所述选定的细胞结构的一种或多种染色颜色显示在所述显示器上。所述处理器可以从输入装置接收选定的染色颜色。最后,所述处理器可以将具有选定的染色颜色的选定的细胞结构显示在显示器上的示例性细胞图像中,其代表在成像实验中具有选定的染色颜色的选定的细胞结构的染色。所述示例性细胞图像是,例如,2个或更多个细胞图像的编绘图。
[0088]在不同的实施方案中,所述系统还可以显示关于染色试剂产品的信息。所述存储器可以进一步存储就一种或多种染色颜色中的每种染色颜色而言可以产生所述染色颜色的一种或多种试剂产品。所述处理器可以进一步从所述存储器中检索选定的染色颜色的一种或多种试剂产品。所述处理器可以在显示器上显示选定的染色颜色的一种或多种试剂产品。所述处理器可以从所述输入装置接收选择的试剂产品。最后,所述处理器可以在显示器上显示选择的试剂产品。在不同的实施方案中,所述处理器可以进一步在显示器上显示选择的试剂产品作为可选项,当其被选定时会提供关于选择的试剂产品的更多信息。在不同的实施方案中,所述处理器可以进一步在显示器上显示可选项,当其被选定时会开始定购选择的试剂产品的过程。
[0089]在不同的实施方案中,所述系统可以显示在来自不同细胞结构的染色剂的发射光之间是否存在串扰。所述处理器可以进一步从所述输入装置接收第二种选定的细胞结构。所述第二种选定的细胞结构是与以前选择的选定的细胞结构不同的细胞结构。所述处理器可以从所述存储器检索第二种选定的细胞结构的一种或多种染色颜色。所述处理器可以在显示器上显示第二种选定的细胞结构的一种或多种染色颜色。所述处理器可以从所述输入装置接收第二种选定的染色颜色。所述处理器可以在显示器上显示在示例性细胞图像中具有第二种选定的染色颜色的第二种选定的细胞结构,以便表明在以前选定的染色颜色和第二种选定的染色颜色之间是否存在串扰。
[0090]虚拟细胞染色方法
[0091]图14是根据不同的实施方案,显示了用于显示生物细胞的细胞结构的方法1400的示例性流程图。
[0092]在方法1400的步骤1410中,使用存储器,存储生物细胞的多个细胞结构,并存储所述多个细胞结构中的每个细胞结构的一种或多种染色颜色。
[0093]在步骤1420中,使用处理器,从输入装置接收选定的细胞结构。
[0094]在步骤1430中,使用处理器,从所述存储器检索选定的细胞结构的一种或多种染色颜色。
[0095]在步骤1440中,使用处理器,在显示器上显示所述选定的细胞结构的一种或多种染色颜色。
[0096]在步骤1450中,使用处理器,从输入装置接收选定的染色颜色。
[0097]在步骤1460中,使用处理器,将选定的细胞结构以选定的染色颜色显示在显示器上的示例性细胞图像中。显示的图像代表具有选定的染色颜色的选定的细胞结构的染色。
[0098]虚拟细胞染色计算机程序产品
[0099]在不同的实施方案中,计算机程序产品包括非暂时的和实体的计算机可读的存储介质,其内容包括具有指令的程序,所述指令在处理器上执行,从而实现用于显示生物细胞的细胞结构的方法。该方法由包括一个或多个不同软件模块的系统实现。
[0100]图15是根据不同的实施方案,一个系统1500的示意图,所述系统1500包括一个或多个不同的软件模块,所述软件模块执行用于显示生物细胞的细胞结构的方法。在不同的实施方案中,系统1500可以包括存储模块1510和染色模块1520。
[0101]存储模块1510可以在存储器中存储生物细胞的多个细胞结构,并存储所述多个细胞结构中的每个细胞结构的一种或多种染色颜色。染色模块1520可以从输入装置接收选定的细胞结构。存储模块1510可以从所述存储器检索所述选定的细胞结构的一种或多种染色颜色。染色模块1520可以在显示器上显示所述选定的细胞结构的一种或多种染色颜色。染色模块1520可以从输入装置接收选定的染色颜色。染色模块1520可以在显示器上显示在示例性细胞图像中具有选定的染色颜色的选定的细胞结构。显示的图像代表在成像实验中具有选定的染色颜色的选定的细胞结构的染色。
[0102]还应当明白,显示为系统1500的部分的各种模块/器械可以组合或收缩成单个模块/器械/数据存储器,这取决于特定应用或系统体系结构的需求。此外,在不同的实施方案中,所述系统1500可以根据特定应用或系统体系结构的需求而包含额外的模块、器械、组件或数据存储器。
[0103]3-D细胞显示器系统
[0104]图1的框图解释了可以在其上面实现本教导的实施方案的系统100。用于显示生物细胞的三维细胞结构的系统可以包括存储器、包括触摸屏的显示器和处理器。所述系统可以是,例如,计算机、小片装置或移动电话。所述系统可以连接至网络,或者可以没有连接地运行。所述存储器可以包括、但不限于,RAM106、R0M108、或系统100的磁盘存储器110。所述触摸屏可以包括、但不限于,输入装置114或与输入/输出端口 118连接的其它装置。所述显示器可以包括、但不限于,显示器112。所述显示器可以是,例如,电子显示器。所述处理器可以是,但不限于,处理器104。所述处理器是,例如,微处理器、信号处理器、专用集成电路或现场可编程门阵列。
[0105]所述存储器可以存储生物细胞的三维图像,其包括三维细胞结构。所述处理器可以在显示器上显示三维图像。所述处理器可以从触摸屏接收移动选择。所述移动选择可以包括、但不限于,平移、倾斜、旋转或缩放之一。最后,所述处理器可以根据移动选择在显示器上显示三维图像,以显示三维细胞结构的不同视图。
[0106]在不同的实施方案中,可以选择细胞结构,并在三维图像中突出显示。所述存储器进一步可以存储多个细胞结构。所述处理器可以进一步从所述存储器检索多个细胞结构。所述处理器可以在显示器上显示多个细胞结构。所述处理器可以从触摸屏接收选定的细胞结构。最后,所述处理器可以在显示器上显示三维图像,其中选定的细胞结构被突出显示。
[0107]在不同的实施方案中,可以选择细胞结构,并提供关于所述细胞结构的更多信息。所述存储器可以进一步存储多个细胞结构。所述处理器可以进一步从所述存储器检索多个细胞结构。所述处理器可以在显示器上显示多个细胞结构。所述处理器可以从触摸屏接收选定的细胞结构。最后,所述处理器可以在显示器上显示具有关于选定的细胞结构的信息的屏幕。所述信息可以包括例如选定的细胞结构的二维染色图像。所述信息可以包括例如可以用于将选定的细胞结构染色的一种或多种试剂产品。
[0108]3-D细胞显示方法
[0109]图16是根据不同的实施方案,显示了用于显示生物细胞的三维细胞结构的方法1600的示例性流程图。
[0110]在方法1600的步骤1610中,使用存储器可以存储生物细胞的三维图像,其包括三维细胞结构。
[0111]在步骤1620中,使用处理器,可以在显示器上显示三维图像,所述显示器包括触摸屏。
[0112]在步骤1630中,使用处理器,可以从触摸屏接收移动选择。
[0113]在步骤1640中,使用处理器,可以根据移动选择在显示器上显示三维图像,以显示三维细胞结构的不同视图。
[0114]3-D细胞显示计算机程序产品
[0115]在不同的实施方案中,计算机程序产品包括非暂时的和实体的计算机可读的存储介质,所述存储介质的内容包括具有指令的程序,所述指令在处理器上执行,从而执行用于显示生物细胞的三维细胞结构的方法。该方法由可以包括一个或多个不同的软件模块的系统执行。
[0116]图17是根据不同的实施方案的系统1700的不意图,所述系统1700可以包括一个或多个不同的软件模块,所述软件模块执行用于显示生物细胞的三维细胞结构的方法。系统1700可以包括存储模块1710和显示模块1720。
[0117]存储模块1710可以存储生物细胞的三维图像,其包括三维细胞结构。显示模块1720可以在显示器上显示三维图像,所述显示器包括触摸屏。使用显示模块,显示模块1720可以从触摸屏接收移动选择。显示模块1720可以根据移动选择在显示器上显示三维图像。所述三维图像然后显示三维细胞结构的不同视图。
[0118]试剂产品方法
[0119]在不同的实施方案中,台式仪器(例如数字显微镜)可以运行应用程序,用户从该应用程序可以运行模拟,并得到关于在该模拟中涉及的试剂的销售信息和/或定购所述试剂。
[0120]图18的示例性流程图显示了用于获得关于在模拟环境中使用的试剂产品的信息的方法1800。
[0121]在方法1800的步骤1810中,可以提供包括处理器的计算机程序产品,从而允许用户在装置中执行涉及试剂产品的模拟。
[0122]在步骤1820中,使用计算机程序产品,可以在装置上显示与试剂产品相对应的可选项。当被用户选定时,处理器可以被构造成显示关于所述装置上的试剂产品的销售信息。
[0123]计算机程序产品可以包括例如移动电话装置或实验室仪器。在不同的实施方案中,所述计算机程序产品可以是计算机、小片装置、游戏装置、音乐播放器和视频播放器中的一个或多个。
[0124]图19的示例性流程图显示了用于允许用户定购试剂产品的方法1900。
[0125]在方法1900的步骤1910中,可以提供包括处理器的计算机程序产品,从而允许用户在装置中执行涉及试剂产品的模拟。
[0126]在步骤1920中,使用计算机程序产品,可以在装置上显示与试剂产品相对应的可选项。当被用户选定时,处理器可以被构造成触发试剂产品的定购。
[0127]在步骤1930中,使用处理器可以处理触发的试剂产品定购。
[0128]试剂产品选择系统、方法和计算机程序产品
[0129]根据一个示例性的实施方案,本文提供了用于给潜在用户显示一种或多种试剂产品的系统,所述系统包括:(I)存储器,其可以存储关于多个试剂产品的信息,所述试剂产品被分类在多个试剂产品种类中,所述信息包括所述试剂产品中的每一种的身份信息和一个或多个特征;(2)输入装置;(3)显示器;和(4)处理器,其与所述存储器、所述输入装置和所述显示器通信,所述处理器被构造成:(a)使用输入装置接收选自多个试剂产品种类的一个试剂产品种类;(b)从所述存储器检索与接收的试剂产品种类相对应的一种或多种试剂产品;(C)在显示器上显示检索的一种或多种试剂产品,包括显示检索的一种或多种试剂产品的身份信息和所述一个或多个特征中的至少一个;(d)使用输入装置接收试剂产品,其选自显示的一种或多种试剂产品;(e)在用户选择试剂产品信息图标以后,显示信息观看屏幕,其包括接收的试剂产品的一个或多个特征;和(f)在用户选择试剂产品方案图标以后,显示方案观看屏幕,其包括使用接收的试剂产品的实验方案的一个或多个步骤。
[0130]在该系统中,试剂产品种类可以包括、但不限于下述的一个或多个:GFP种类、细胞跟踪种类、抗衰退种类、细胞骨架种类、运输种类、抗体标记种类、细胞器染色剂种类、细胞凋亡种类、细胞周期种类、细胞生存力种类、氧化性应激种类、细胞增殖种类、免疫荧光种类、自噬种类、DNA染色剂种类、附加表位种类、RNA生物学种类、离子指示剂种类、必要物种类和蛋白标记种类。所述处理器可以进一步被构造成显示(当显示检索的一种或多种试剂产品时,在显示器上)检索的一种或多种试剂产品中的每一种的一个或多个特征,包括图形标度盘,其图解了执行与检索的一种或多种试剂产品中的每一种相对应的实验方案所需的从事时间或总时间。所述处理器可以进一步被构造成显示(当显示检索的一种或多种试剂产品时,在显示器上)检索的一种或多种试剂产品中的每一种的一个或多个特征,包括关于下述方面的指示:检索的一种或多种试剂产品中的每一种是否是活细胞产品或已经通过化学处理固定的产品。所述输入装置可以包括显示器的触摸屏。所述处理器可以进一步被构造成在显示器上显示检索的一种或多种试剂产品作为一个或多个可选项,当被选择时,所述可选项会提供关于选定的项目的更多信息,且可以进一步被构造成在显示器上显示可选择的图标,当被选定时,所述图标开始定购选定的项目的过程。所述系统可以是计算机、移动电话、小片装置、游戏装置、音乐播放器、视频播放器和a实验室仪器中的一个或多个。
[0131]根据另一个示例性的实施方案,本文提供了用于显示关于试剂产品的信息和实验方案的方法,所述方法包括:(1)使用存储器,存储被归类在多个试剂产品种类中的多个试剂产品,包括所述试剂产品中的每一种的身份信息和一个或多个特征;(2)使用处理器,接收选自多个试剂产品种类的一个试剂产品种类;(3)使用处理器,从所述存储器中检索与接收的试剂产品种类相对应的一种或多种试剂产品;(4)使用处理器在显示器上显示检索的一种或多种试剂产品,包括显示检索的一种或多种试剂产品的身份信息和一个或多个特征中的至少一个;(5)使用处理器,接收选自显示的一种或多种试剂产品的一种试剂产品;
(6)在用户选择试剂产品信息图标以后,显示信息观看屏幕,其包括接收的试剂产品的一个或多个特征;和(7)在用户选择试剂产品方案图标以后,显示方案观看屏幕,其包括使用接收的试剂产品的实验方案的一个或多个步骤。
[0132]在该方法中,存储被归类在多个试剂产品种类中的多个试剂产品可以进一步包括、但不限于,将所述试剂产品归类在下述种类中的一个或多个中:GFP种类、细胞跟踪种类、抗衰退种类、细胞骨架种类、运输种类、抗体标记种类、细胞器染色剂种类、细胞凋亡种类、细胞周期种类、细胞生存力种类、氧化性应激种类、细胞增殖种类、免疫荧光种类、自噬种类、DNA染色剂种类、附加表位种类、RNA生物学种类、离子指示剂种类、必要物种类和蛋白标记种类。此外,接收选自多个试剂产品种类的一个试剂产品种类可以进一步包括:从显示器的触摸屏接收一个试剂产品种类。所述方法可以进一步包括:显示选自显示的一种或多种试剂产品的所述试剂产品作为可选项,当被选择时,所述可选项会提供关于选定的试剂产品的更多信息,且所述方法可以进一步包括:在显示器上显示可选择的图标,当被选择时,所述图标开始定购选自显示的一种或多种试剂产品的所述试剂产品的过程。
[0133]根据另一个示例性的实施方案,本文提供了计算机程序产品,其包括非暂时的和实体的计算机可读的存储介质,所述存储介质的内容可以包括具有指令的程序,所述指令在处理器上执行,从而实现用于显示关于试剂产品的信息和实验方案的方法,所述方法包括:(1)提供系统,其中所述系统包括一个或多个不同的软件模块,且其中所述不同的软件模块包括存储模块和显示模块;(2)使用存储器,存储被归类在多个试剂产品种类中的多个试剂产品,包括所述试剂产品中的每一种的身份信息和一个或多个特征;(3)使用处理器,接收选自多个试剂产品种类的一个试剂产品种类;(4)使用处理器,从所述存储器检索与接收的试剂产品种类相对应的一种或多种试剂产品;(5)使用处理器。在显示器上显示检索的一种或多种试剂产品,包括显不检索的一种或多种试剂产品的身份信息和一个或多个特征中的至少一个;(6)使用处理器,接收选自显示的一种或多种试剂产品的一种试剂产品;(7)在用户选择试剂产品信息图标以后,显示信息观看屏幕,其包括接收的试剂产品的一个或多个特征;和(8)在用户选择试剂产品方案图标以后,显示方案观看屏幕,其包括使用接收的试剂产品的实验方案的一个或多个步骤。
[0134]在该计算机程序产品,存储被归类在多个试剂产品种类中的多个试剂产品可以进一步包括、但不限于,将所述试剂产品归类在下述种类中的一个或多个中:GFP种类、细胞跟踪种类、抗衰退种类、细胞骨架种类、运输种类、抗体标记种类、细胞器染色剂种类、细胞凋亡种类、细胞周期种类、细胞生存力种类、氧化性应激种类、细胞增殖种类、免疫荧光种类、自噬种类、DNA染色剂种类、附加表位种类、RNA生物学种类、离子指示剂种类、必要物种类和蛋白标记种类。使用显示器的触摸屏,可以接收所述试剂产品种类和选择的试剂产品。由所述指令实现的方法可以进一步包括:显示选自显示的一种或多种试剂产品的所述试剂产品作为可选项,当被选择时,所述可选项会提供关于选择的试剂产品的更多信息。由所述指令实现的方法可以进一步包括:在显示器上显示可选择的图标,当被选择时,所述图标开始定购选自显示的一种或多种试剂产品的所述试剂产品的过程。
[0135]根据另一个示例性的实施方案,本文提供了用于列出试剂产品的方法,所述方法包括:(1)使用装置中的存储器,存储关于多个试剂产品的信息和对应的组成信息和实验方案信息;(2)在装置上的显示器的第一视图屏幕中,显示多个试剂产品的一个或多个子集、以及描述显示的试剂产品的概要信息、和与显示的试剂产品相对应的实验方案;和(3)在与用户选定的试剂产品相对应的显示器的第二视图屏幕中,且在用户进一步选择信息图标以后,显示关于下述一个或多个方面的详细信息:用户选定的试剂产品的每种组分的量、浓度、分子量和贮存条件。
[0136]该方法可以进一步包括,在与用户选定的试剂产品相对应的第三视图屏幕中,且在用户选择方案图标以后,显示关于使用用户选定的试剂产品的实验方案的一个或多个步骤的详细信息,所述一个或多个步骤包括下述步骤中的一个或多个:取出步骤、洗涤步骤、制备步骤、稀释步骤、预混合步骤、离心步骤、转移步骤、搅拌步骤、添加步骤、温育步骤和成像步骤。在该方法中,所述装置可以是移动电话装置,或者它可以是实验室仪器,或者它可以是例如计算机、小片装置、游戏装置、音乐播放器和视频播放器中的一个或多个。
[0137]根据另一个示例性的实施方案,本文提供了用于允许用户定购试剂产品的方法,所述方法包括:(I)使用装置提供计算机程序产品,其包括处理器,所述处理器用于允许用户获得关于一种或多种试剂产品的信息;(2)在装置上的显示器的第一视图屏幕中,显示多个试剂产品的一个或多个子集、以及描述显示的试剂产品的信息、和与显示的试剂产品相对应的一个或多个实验方案;(3)在与用户选定的试剂产品相对应的显示器的第二视图屏幕中,且在用户进一步选择信息图标以后,显示关于下述一个或多个方面的详细信息:用户选定的试剂产品的每种组分的量、浓度、分子量和贮存条件;(4)在与用户选定的试剂产品相对应的显示器的第三视图屏幕中,且在用户进一步选择方案图标以后,显示关于使用用户选定的试剂产品的实验方案的一个或多个步骤的详细信息,所述一个或多个步骤包括下述步骤中的一个或多个:取出步骤、洗涤步骤、制备步骤、稀释步骤、预混合步骤、离心步骤、转移步骤、搅拌步骤、添加步骤、温育步骤和成像步骤;(5)利用计算机程序产品和在显示器上,显示与用户选定的试剂产品相对应的可选项,其中当被用户选择时,所述处理器被构造成触发试剂产品的定购;和(6)使用处理器处理触发的试剂产品定购。
[0138]在该方法中,所述装置可以是例如:移动电话装置,或者实验室仪器,或者计算机、小片装置、游戏装置、音乐播放器和视频播放器中的一个或多个。
[0139]如上所述,所述计算机程序产品可以包括例如移动电话装置或实验室仪器。在不同的实施方案中,所述计算机程序产品可以是计算机、小片装置、游戏装置、音乐播放器和视频播放器中的一个或多个。
[0140]尽管结合不同的实施方案描述了本教导,本教导无意限于这样的实施方案。相反,本教导包括本领域技术人员将会明白的各种替代方案、修改和等效方案。
[0141]此外,在描述不同的实施方案时,说明书可能将方法和/或过程呈现为特定的步骤序列。但是,就所述方法或过程不依赖于本文阐述的特定步骤次序而言,所述方法或过程不应限于所述的特定步骤序列。本领域普通技术人员会理解,其它步骤序列可以是可能的。因此,在说明书中阐述的特定步骤次序不应解释为对权利要求的限制。另外,涉及方法和/或过程的权利要求不应限于它们的步骤按照书写次序的执行,并且本领域技术人员可以容易地理解,所需序列可以变化,且仍然保持在不同实施方案的精神和范围内。
[0142]还应当理解,本文描述的实施方案可以采用其中涉及存储于计算机系统中的数据的各种计算机实现的操作。这些操作是要求物理量的物理处理的那些操作。这些量通常但不一定采取电或磁信号的形式,它们能够被存储、传送、组合、对比以及以其它方式处理。此夕卜,经常用诸如下述术语表示实现的操作:产生、鉴别、确定或对比。
[0143]构成本文所述实施方案的组成部分的任意操作是有用的机器操作。本文所述的实施方案还涉及用于执行这些操作的装置或设备。本文所述的系统和方法可专门构造用于所需目的,或者可以是通过在计算机中存储的计算机程序选择性地激活或配置的通用计算机。具体来说,各种通用机器可与根据本文的教导所编写的计算机程序一起使用,或者可能更为便利的是,构建更专用的设备来执行所需操作。
【权利要求】
1.一种用于显示生物细胞的一种或多种细胞结构的系统,所述系统包括: 存储器,所述存储器被构造成存储生物细胞的多个细胞结构和每个细胞结构的一种或多种染色颜色; 输入装置; 显不器;和 处理器,所述处理器与所述存储器、所述输入装置和所述显示器通信,所述处理器被构造成 从所述输入装置接收选定的细胞结构; 从所述存储器检索所述选定的细胞结构的一种或多种染色颜色; 将所述选定的细胞结构的一种或多种染色颜色显示在所述显示器上; 从所述输入装置接收选定的染色颜色;和 将具有所述选定的染色颜色的选定的细胞结构显示在所述显示器上的示例性细胞图像中,所述示例性细胞图像代表具有所述选定的染色颜色的选定的细胞结构的染色。
2.根据权利要求1所述的系统,其中所述存储器被进一步构造成,存储可以产生每种染色颜色的一种或多种试剂产品,且其中所述处理器被进一步构造成,从所述存储器检索所述选定的染色颜色的一种或多种试剂产品,在所述显示器上显示所述选定的染色颜色的一种或多种试剂产品,从所述输入装置接收选择的试剂产品,和在所述显示器上显示所述选择的试剂产品。`
3.根据权利要求1所述的系统,其中所述处理器被进一步构造成,从所述输入装置接收第二种选定的细胞结构,其中所述第二种选定的细胞结构不是与所述选定的细胞结构相同的细胞结构,从所述存储器检索所述第二种选定的细胞结构的一种或多种染色颜色,在所述显示器上显示所述第二种选定的细胞结构的一种或多种染色颜色,从所述输入装置接收第二种选定的染色颜色,和将具有所述第二种选定的染色颜色的第二种选定的细胞结构显示在所述显示器上的示例性细胞图像中,以显示在所述选定的染色颜色和所述第二种选定的染色颜色之间是否存在串扰。
4.根据权利要求1所述的系统,其中所述多个细胞结构被存储为图像。
5.根据权利要求4所述的系统,其中所述图像是三维图像。
6.根据权利要求1所述的系统,其中所述示例性细胞图像是2个或更多个细胞图像的编绘图。
7.根据权利要求2所述的系统,其中所述处理器被进一步构造成,在所述显示器上显示所述选择的试剂产品作为可选项,当被选择时,所述可选项会提供关于所述选择的试剂产品的更多信息。
8.根据权利要求2所述的系统,其中所述处理器被进一步构造成,在所述显示器上显示可选项,当被选择时,所述可选项开始定购所述选择的试剂产品的过程。
9.一种用于显示生物细胞的细胞结构的方法,所述方法包括: 使用存储器,存储生物细胞的多个细胞结构和每个细胞结构的一种或多种染色颜色; 使用处理器,从输入装置接收选定的细胞结构; 使用所述处理器,从所述存储器检索所述选定的细胞结构的一种或多种染色颜色; 使用所述处理器,在显示器上显示所述选定的细胞结构的一种或多种染色颜色;使用所述处理器,从所述输入装置接收选定的染色颜色;和 使用所述处理器,将具有所述选定的染色颜色的选定的细胞结构显示在所述显示器上的示例性细胞图像中,所述示例性细胞图像代表具有所述选定的染色颜色的选定的细胞结构的染色。
10.根据权利要求9所述的方法,所述方法另外包括:存储可以产生每种染色颜色的一种或多种试剂产品,使用所述处理器从所述存储器检索所述选定的染色颜色的一种或多种试剂产品,使用所述处理器在所述显示器上显示所述选定的染色颜色的一种或多种试剂产品,使用所述处理器从所述输入装置接收选择的试剂产品,和使用所述处理器在所述显示器上显示所述选择的试剂产品。
11.根据权利要求9所述的方法,所述方法另外包括:使用所述处理器从所述输入装置接收第二种选定的细胞结构,其中所述第二种选定的细胞结构不是与所述选定的细胞结构相同的细胞结构,使用所述处理器从所述存储器检索所述第二种选定的细胞结构的一种或多种染色颜色,使用所述处理器在所述显示器上显示所述第二种选定的细胞结构的一种或多种染色颜色,使用所述处理器从所述输入装置接收第二种选定的染色颜色,和使用所述处理器将具有所述第二种选定的染色颜色的第二种选定的细胞结构显示在所述显示器上的示例性细胞图像中,以显示在所述选定的染色颜色和所述第二种选定的染色颜色之间是否存在串扰。
12.根据权利要求9所述的方法,其中所述多个细胞结构被存储为图像。
13.根据权利要求12所述的方法,其中所述图像是三维图像。
14.根据权利要求8所述的方法,其中将具有所述选定的染色颜色的选定的细胞结构显示在示例性细胞图像中另外包括:将所述选定的细胞结构显示为2个或更多个细胞图像的编绘图。
15.根据权利要求10所 述的方法,所述方法另外包括:使用所述处理器在所述显示器上显示所述选择的试剂产品作为可选项,当被选择时,所述可选项会提供关于所述选择的试剂产品的更多信息。
16.根据权利要求10所述的方法,所述方法另外包括:使用所述处理器在所述显示器上显示可选项,当被选择时,所述可选项开始定购所述选择的试剂产品的过程。
17.一种计算机程序产品,其包含非暂时的和实体的计算机可读的存储介质,所述存储介质的内容包括具有指令的程序,所述指令在处理器上执行,从而实现用于显示生物细胞的细胞结构的方法,所述方法包括: 提供系统,其中所述系统包括一个或多个不同的软件模块,且其中所述不同的软件模块包括存储模块和染色模块; 使用所述存储模块,在存储器中存储生物细胞的多个细胞结构和每个细胞结构的一种或多种染色颜色; 使用所述染色模块,从输入装置接收选定的细胞结构; 使用所述存储模块,从所述存储器检索所述选定的细胞结构的一种或多种染色颜色; 使用所述染色模块,在显示器上显示所述选定的细胞结构的一种或多种染色颜色; 使用所述染色模块,从所述输入装置接收选定的染色颜色;和 使用所述染色模块,将具有所述选定的染色颜色的选定的细胞结构显示在所述显示器上的示例性细胞图像中,所述示例性细胞图像代表具有所述选定的染色颜色的选定的细胞结构的染色。
18.根据权利要求17所述的计算机程序产品,其中由所述指令实现的方法另外包括:使用所述存储模块存储可以产生每种染色颜色的一种或多种试剂产品,使用所述存储模块从所述存储器检索所述选定的染色颜色的一种或多种试剂产品,使用所述染色模块在所述显示器上显示所述选定的染色颜色的一种或多种试剂产品,使用所述染色模块从所述输入装置接收选择的试剂产品,和使用所述染色模块在所述显示器上显示所述选择的试剂产品O
19.根据权利要求17所述的计算机程序产品,其中由所述指令实现的方法另外包括:使用所述染色模块从所述输入装置接收第二种选定的细胞结构,其中所述第二种选定的细胞结构不是与所述选定的细胞结构相同的细胞结构,使用所述存储模块从所述存储器检索所述第二种选定的细胞结构的一种或多种染色颜色,使用所述染色模块将所述第二种选定的细胞结构的一种或多种染色颜色显示在所述显示器上,使用所述染色模块从所述输入装置接收第二种选定的染色颜色,和使用所述染色模块将具有所述第二种选定的染色颜色的第二种选定的细胞结构显示在所述显示器上的示例性细胞图像中,以显示在所述选定的染色颜色和所述第二种选定的染色颜色之间是否存在串扰。
20.根据权利要求17所 述的计算机程序产品,其中所述多个细胞结构被存储为图像。
21.根据权利要求20所述的计算机程序产品,其中所述图像是三维图像。
22.根据权利要求17所述的计算机程序产品,其中示例细胞图像是2个或更多个细胞图像的编绘图。
23.根据权利要求17所述的计算机程序产品,其中由所述指令实现的方法另外包括:使用所述染色模块在所述显示器上显示所述选择的试剂产品作为可选项,当被选择时,所述可选项会提供关于所述选择的试剂产品的更多信息。
24.根据权利要求18所述的计算机程序产品,其中由所述指令实现的方法另外包括:使用所述染色模块在所述显示器上显示可选项,当被选择时,所述可选项开始定购所述选择的试剂产品的过程。
25.一种用于显示生物细胞的一种或多种细胞结构的系统,所述系统包括: 存储器,所述存储器被构造成存储生物细胞的多个细胞结构和每个细胞结构的一种或多种染色颜色;和 处理器,所述处理器与所述存储器和客户端装置通信,所述处理器进一步被构造成 从所述客户端装置接收选定的细胞结构; 从所述存储器检索所述选定的细胞结构的一种或多种染色颜色; 将所述选定的细胞结构的一种或多种染色颜色传送并显示在所述客户端装置上; 从输入装置接收选定的染色颜色;和 将具有所述选定的染色颜色的选定的细胞结构传送并显示在所述客户端装置上的示例性细胞图像中,所述示例性细胞图像代表具有所述选定的染色颜色的选定的细胞结构的染色。
26.根据权利要求25所述的系统,其中所述处理器经由网络连接与所述客户端装置通?目。
27.根据权利要求26所述的系统,其中所述选定的细胞结构和选定的染色颜色显示在网络浏览器上,所述网络浏览器运行在所述客户端装置上。
28.一种用于允许用户定购试剂产品的方法,所述方法包括: 提供包含处理器的计算机程序产品,所述处理器用于允许用户在装置中执行涉及所述试剂产品的模拟; 利用所述计算机程序产品和在所述装置上显示与所述试剂产品相对应的可选项,其中当被所述用户选择时,所述处理器被构造成触发所述试剂产品的定购;和使用所述处理器处理触 发的试剂产品定购。
【文档编号】G06K9/46GK103460224SQ201180066995
【公开日】2013年12月18日 申请日期:2011年12月7日 优先权日:2010年12月7日
【发明者】J.R.杨, K.E.弗里, E.S.布朗 申请人:生命科技公司
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