疾病生物标志物的筛选分析方法、平台、服务器及系统的制作方法
【技术领域】
[0001]本发明涉及生物信息技术领域，特别涉及一种疾病生物标志物的筛选分析方法、平台、服务器以及系统。
【背景技术】
[0002]随着计算机技术的不断发展以及统计算法的不断优化，临床医学诊断数据和实验中不确定的含混数据已逐渐的通过概率论、统计和决策分析等方法进行分析和处理。特别是在 HIS (Hospital Informat1n System,医院信息系统)和 PACS (Picture Archiving andCommunicat1n Systems,影像归档和通信系统)的广泛使用后,这些方法更加有力地推动了临床诊断、治疗效率和效果的进步。现在电子病历、专家诊断决策系统、虚拟医院、远程医疗和医学教育等正在改变医学的传统模式，孕育着医疗理论和体制的新飞跃。医学临床信息库正与生物信息数据库结合起来，建立的以疾病为中心的医学生物信息临床信息库，具有更广阔和有价值的增长点。
[0003]目前，临床信息数据库主要以实验和临床观察为数据来源，主要包含大量的医学临床资料和数据，如人体正常值、心电图、脑电图、器官呈像、病理呈像、临床药物等。因而只能根据个体的表型信息与疾病的关系，而不能发现更进一步的基因与疾病的关系。此外，当前的临床信息数据库大多数是建立后在一定范围内使用，如在一家或者几家有合作关系的医院之间，但是难以在整个医疗系统中共享，不利于根据多样化的数据对疾病进行分析。因此，当前的临床信息数据库以及分析方法难以最大化的理由各种临床观察数据进行医疗分析，不利于临床诊断，从而导致治疗效率和效果难以提高。
【发明内容】
[0004]本发明旨在至少在一定程度上解决上述技术问题。
[0005]为此，本发明的第一方面的目的在于提出一种疾病生物标志物的筛选分析方法，该方法能够通过临床信息指导生物信息分组研究，同时以生物分析结果指导临床诊断，促进转化医学的发展。
[0006]本发明的第二方面的目的在于提出另一种疾病生物标志物的筛选分析方法。
[0007]本发明的第三方面的目的在于提出一种疾病生物标志物的筛选分析平台。
[0008]本发明的第四方面的目的在于提出一种服务器。
[0009]本发明的第五方面的目的在于提出一种疾病生物标志物的筛选分析系统。
[0010]为达上述目的，根据本发明第一方面实施例提出了一种疾病生物标志物的筛选分析方法，包括:a.接收分析指令，其中，所述分析指令包括样本筛选条件和分析程序参数；b.根据所述样本筛选条件获取与所述样本筛选条件对应的待分析样本的临床信息，并根据所述待分析样本的临床信息获取相关联的生物信息将所述待分析样本的临床信息、所述相关联的生物信息以及所述分析程序参数发送至服务器，以通过所述服务器根据所述分析程序参数构建分析任务对所述待分析样本的临床信息和所述相关联的生物信息进行分析；d.接收所述服务器返回的分析结果，并对所述分析结果进行显著性检验；e.如果所述分析结果不显著，则重置样本筛选条件，并重复步骤b-d，直至所述分析结果显著。
[0011]在本发明的一个实施例中，所述临床信息存储于临床信息数据库中，所述生物信息存储于生物信息数据库中，其中，所述生物信息数据库以所述临床信息数据库的分组信息为索引文件，所述根据所述样本筛选条件获取与所述样本筛选条件对应的待分析样本的临床信息，并根据所述待分析样本的临床信息获取相关联的生物信息，具体包括:根据所述样本筛选条件查询所述临床信息数据库，并获取待分析样本的临床信息；根据所述临床信息查询所述生物信息数据库的索引文件，根据所述索引文件获取所述生物信息数据库中与所述临床信息相关联的生物信息。
[0012]在本发明的一个实施例中，该方法还包括以下任意一个或多个步骤:如果所述分析结果显著，则对所述分析结果、所述临床信息和/或所述生物信息进行统计分析，并对统计分析结果进行动态渲染以生成结果列表和/或统计图表；在所述接收分析指令之后，根据所述分析指令获取用户标识信息，并根据所述用户标识信息获取对应的用户权限，以根据所述用户权限查询所述临床信息数据库和所述生物信息数据库；如果所述临床信息数据库和/或所述生物信息数据库为加密数据库，则在查询所述临床信息数据库和/或所述生物信息数据库之前，发出输入密钥提示，并在接收到密钥时，根据所述密钥对所述临床信息数据库和/或所述生物信息数据库进行解密。
[0013]本发明第二方面实施例提出了另一种疾病生物标志物的筛选分析方法，包括:接收待分析样本的临床信息和生物信息以及分析程序参数，其中所述程序参数包括分析程序标识、分析算法标识以及接口参数；根据所述分析程序标识调用相应的分析程序，根据所述分析算法标识调用相应的分析算法，并根据所述接口参数、所述分析程序和所述分析算法建立分析任务；通过执行所述分析任务对所述待分析样本的临床信息和生物信息进行分析，并存储分析结果。
[0014]在本发明的一个实施例中，所述分析任务包括样本检测任务、生物信息检测任务、关联分析任务、显著性检验任务，所述通过执行所述分析任务对所述待分析样本的临床信息和生物信息进行分析具体包括:执行所述样本检测任务分析所述临床信息以对所述待分析样本进行检测；当所述待分析样本通过检测后，执行所述生物信息检测任务分析所述生物信息；当所述生物信息通过检测后，执行所述关联分析任务以获取生物标志物；通过执行所述显著性检验任务对所述生物标志物进行检验。
[0015]在本发明的一个实施例中，该方法还包括:在执行所述分析任务过程中，监控所述分析任务的执行状态，并实时记录执行日志；如果监控到异常状态，则发送异常提示和所述执行日志，以根据所述执行日志调整所述分析任务。
[0016]在本发明的一个实施例中，所述分析任务包括样本检测任务、生物信息检测任务、关联分析任务、显著性检验任务，所述通过执行所述分析任务对所述待分析样本的临床信息和生物信息进行分析具体包括:执行所述样本检测任务分析所述临床信息以对所述待分析样本进行检测；当所述待分析样本通过检测后，执行所述生物信息检测任务分析所述生物信息；当所述生物信息通过检测后，执行所述关联分析任务以获取生物标志物；通过执行所述显著性检验任务对所述生物标志物进行显著性检验。
[0017]在本发明的一个实施例中，还包括:在执行所述分析任务过程中，监控所述分析任务的执行状态，并实时记录执行日志；如果监控到异常状态，则发送异常提示和所述执行日志，以根据所述执行日志调整所述分析任务。
[0018]本发明第三方面实施例提出了一种疾病生物标志物的筛选分析平台，包括:第一接收模块，用于接收分析指令，其中，所述分析指令包括样本筛选条件和分析程序参数；查询模块，用于根据所述样本筛选条件获取与所述样本筛选条件对应的待分析样本的临床信息，并根据所述待分析样本的临床信息获取相关联的生物信息；发送模块，用于将所述待分析样本的临床信息、所述相关联的生物信息以及所述分析程序参数发送至服务器，以通过所述服务器根据所述分析程序参数构建分析任务对所述待分析样本的临床信息和所述相关联的生物信息进行分析；显著性检验模块，接收所述服务器返回的分析结果，并对所述分析结果进行显著性检验，如果所述分析结果不显著，则重置样本筛选条件，并重新查询所述临床信息数据库和所述生物信息数据库，以再次分析直至所述分析结果显著。
[0019]在本发明的一个实施例中，所述临床信息存储于临床信息数据库中，所述生物信息存储于生物信息数据库中，其中，所述生物信息数据库以所述临床信息数据库的分组信息为索引文件，所述查询模块具体用于:根据所述样本筛选条件查询所述临床信息数据库，并获取待分析样本的临床信息；根据所述临床信息查询所述生物信息数据库的索引文件，根据所述索引文件获取所述生物信息数据库中与所述临床信息相关联的生物信息。
[0020]在本发明的一个实施例中，该平台还包括以下任意一个或多个模块:统计分析模块，用于在所述分析结果显著时，对所述分析结果、所述临床信息和/或所述生物信息进行统计分析，并对统计分析结果进行动态渲染以生成结果列表和/或统计图表；获取模块，用于根据所述分析指令获取用户标识信息，并根据所述用户标识信息获取对应的用户权限，以根据所述用户权限查询所述临床信息数据库和所述生物信息数据库；密钥管理模块，用于在所述临床信息数据库和/或所述生物信息数据库为加密数据库时，发出输入密钥提示，并在接收到密钥时，根据所述密钥对所述临床信息数据库和/或所述生物信息数据库进行解密。
[0021]本发明第四方面实施例提出了一种服务器，包括:接收模块，用于接收待分析样本的临床信息和生物信息以及分析程序参数，其中所述程序参数包括分析程序标识、分析算法标识以及接口参数；任务管理模块，用于根据所述分析程序标识调用相应的分析程序，根据所述分析算法标识调用相应的分析算法，并根据所述接口参数、所述分析程序和所述分析算法建立分析任务；分析模块，用于通过执行所述分析任务对所述待分析样本的临床信息和生物信息进行分析，并存储分析结果。
[0022]在本发明的一个实施例中，所述分析任务包括样本检测任务、生物信息检测任务、关联分析任务、显著性检验任务，所述分析模块具体用于:执行所述样本检测任务分析所述临床信息以对所述待分析样本进行检测；在所述待分析样本通过检测后，执行所述生物信息检测任务分析所述生物信息；在所述生物信息通过检测后，执行所述关联分析任务以获取生物标志物；通过执行所述显著性检验任务对所述生物标志物进行显著性检验。
[0023]在本发明的一个实施例中，该服务器还包括:监控模块，用于在执行所述分析任务过程中，监控所述分析任务的执行状态，并实时记录执行日志；提示模块，用于在监控到异常状态时发送异常提示和所述执行日志；调整模块，用于根据所述执行日志调整所述分析任务。
[0024]本发明第五方面实施例提出了一种疾病生物标志物的筛选分析系统，包括:本发明第三方面实施例所述的疾病生物标志物的筛选分析平台；和本发明第四方面实施例所述的服务器。
[0025]本发明实施例的疾病生物标志物的筛选分析方法、平台、系统及服务器，根据分析指令从临床信息数据库和生物信息数据库中筛选相应的临床信息和生物信息，并发送至服务器自动进行分析，为科学家在疾病的基因发掘、基因验证等基因组学研究方面建立一个能够联系临床信息和基因组学分析的平台，更有利于实施大样本量基因验证实验。此外，还可移植应用到各种不同复杂疾病研究领域，