用以对头颈癌进行识别、监测、以及治疗的生物标记物的制作方法

文档序号:580768阅读:901来源:国知局

专利名称::用以对头颈癌进行识别、监测、以及治疗的生物标记物的制作方法用以对头颈癌进行识别、监测、以及治疗的生物标记物相关申请本申请要求享有申请日为2008年5月14日的U.S.S.N61/053210所拥有的权益,上述文献中的全部内容被引入作为参考。发明的领域本发明总体而言涉及对生物标记物的识别以及使用这样的生物标记物的方法,其中所述的生物标记物被用来进行头颈癌的筛选、预防、诊断、治疗、监测、以及预后。发明的
背景技术
:头颈癌代表了世界范围内的第五大最为常见的恶性肿瘤,它是存在于所述的上呼吸消化道之中的最为常见的肿瘤(参见ParkinDM等人于2001年发表的文章)。所述的头颈(HN)恶性肿瘤中的绝大多数是鳞状上皮细胞癌(SCC)。出于实际应用的目的,头颈癌被划分为三种临床阶段早期的,局部晚期的,以及转移性的或者复发性的。治疗的方法可以依据所述的疾病阶段而进行变化。在对所述的局部晚期头颈癌所进行的治疗之中,化学疗法具有改进的不产生疾病的结果和/或整体存活的结果,并且同步的化学放射性疗法已经被认可作为针对患有局部晚期的不可切除性疾病的患者的标准治疗方法(参见kiwertTY等人于2007年发表的文章;SalamaJK等人于2007年发表的文章)。然而,目前的治疗决策通常不能够对患者所取得的结果进行预测。相对较少的生物标记物信息能够被利用,来进行头颈癌患者的层级化(stratification)以及对治疗决策进行指导。因此,癌症探测的更优方法,分子切缘的评价方法以及预后性的生物标记物是相当有用的。这应当能够使得在具有较高危险的患者与具有较低危险的患者之间进行提高的层级化作用,其中所述的患者能够获得一种更为有选择性的以及更为个性化的形式的治疗。DNA的修复指的是一批过程,通过这些过程,细胞能够对发生在所述的DNA分子上的损伤进行识别以及修正,其中所述的DNA分子编码了所述细胞的基因组。在人类细胞中,正常的代谢活动以及环境因素均能够导致DNA的损伤,致使每天在每个细胞中存在一百万个个体分子的损害,其中所述的环境因素例如是紫外(UV)光。这些损害中有许多能够导致对所述的DNA分子产生的结构性损伤并且能够对所述的细胞所具有的转录基因的能力进行改变或者消除,其中所述的基因是所述受到影响的DNA所编码的。其他的损害包括在所述的细胞基因组中发生的潜在的有害变异,在所述的细胞经历过有丝分裂之后,所述的有害变异将对其子细胞的存活产生影响。因此,所述的DNA的修复过程必须时常处于活性状态下,这样一来它能够对发生在所述的DNA结构之中的任何损伤进行快速的应答。所述的DNA修复的速度取决于许多因素,包括所述的细胞类型,所述细胞的年龄,以及所述的细胞外环境。当一个细胞已经积累了大量的DNA损伤时,或者当一个细胞已经不能够对由所述细胞的DNA所招致的损伤进行有效的修复时,所述的细胞能够进入下述三种可能的状态中的一种一种不可逆的冬眠状态,被称之为衰老;细胞自杀,也被称之为细胞凋亡或者程序性细胞死亡或者紊乱的细胞分裂,这能够导致一种肿瘤的形成。发明概述本发明在一定程度上涉及到对于某些生物学标记物(在本发明中被称为“头颈癌标记物HNCMARKERS”)的发现,其中所述的生物学标记物例如是蛋白质,核酸,多形体,代谢物,以及其他的分析物,以及某些生理学条件及状态。本发明提供了一种方法,用以对一个宿主的治疗方案所具有的有效性进行评价,其中所述的宿主患有头颈癌,所述的方法是通过下述方式来实现的对存在于一种来自于所述宿主的样本之中的一种或者多种有效剂量的头颈癌标记物(HNCMARKERQ所具有的水平进行探测,并且将所述的一种或者多种有效剂量的头颈癌标记物(HNCMARKERQ所具有的水平与一种参考值进行比较。在本发明中的另外一个方面,提供了一种方法,所述的方法能够对一个宿主的治疗方案进行监测,其中所述的宿主患有头颈癌,所述的方法是通过下述方式来实现的在第一个时间段内,对来自于所述的宿主的第一个样本中所存在的一种或者多种有效剂量的头颈癌标记物(HNCMARKERQ所具有的水平进行探测,并且在第二个时间段内,对来自于所述的宿主的第二个样本中所存在的一种或者多种有效剂量的头颈癌标记物(HNCMARKERS)所具有的水平进行探测。将在所述的第一个样本中所探测到的所述一种或者多种有效剂量的头颈癌标记物(HNCMARKERS)的水平与在所述的第二个样本中所探测到的剂量进行比较,或者与一种参考值进行比较。在一个进一步的方面,本发明提供了一种方法,所述的方法用以确定一个患有头颈癌的患者能否从一种治疗方案中获得益处,所述的方法是通过下述方式来实现的对一种或者多种有效剂量的头颈癌标记物(HNCMARKERQ所具有的水平进行探测,并且将探测得到的所述一种或者多种有效剂量的头颈癌标记物(HNCMARKERQ所具有的水平与一种参考值进行比较。在另外一个进一步的方面,本发明提供了一种方法,所述的方法用以对一个被诊断为患有头颈癌的宿主所具有的存活能力进行评价,所述的方法是通过下述方式来实现的对存在于一种来自于所述宿主的样本之中的一种或者多种有效剂量的头颈癌标记物(HNCMARKERS)所具有的水平进行探测,并且将所述的一种或者多种有效剂量的头颈癌标记物(HNCMARKERQ所具有的水平与一种参考值进行比较。在另外一个方面,本发明提供了一种方法,所述的方法用以确定一种头颈癌对一种化学治疗试剂所具有的敏感性,所述的方法包括对发生在至少一种头颈癌标记物(HNCMARKERS)中的变化进行识别。所述的变化的存在表明所述的细胞对于一种化学治疗试剂而言是敏感的。在一个方面,本发明提供了一种方法,所述的方法用以确定一种头颈癌对一种化学治疗试剂所具有的抗性,所述的方法包括对发生在至少一种头颈癌标记物(HNCMARKERS)中的变化进行识别。所述的变化的缺失表明所述的细胞对于一种化学治疗试剂而言是具有抗性的。所述的变化指的是一种增加或者一种减少。所述的变化是通过下述方式来确定的对发生在一种头颈癌标记物(HNCMARKERS)中的变异进行探测或者对发生在一种头颈癌标记物(HNCMARKERQ中的翻译后的修饰进行探测。翻译后的修饰包括例如,磷酸化作用,泛素化作用,类泛素化作用,乙酰基化作用,烷基化作用,甲基化作用,氨基乙酰基化作用,糖基化作用,异戊二烯化作用,脂化作用,磷酸泛酰巯基乙胺基化作用,硫酸盐化作用,硒化作用以及C-末端的酰胺化作用。所述的治疗方案是免疫疗法例如西妥昔单克隆抗体(Cetuximab),诱导化学疗法,同步化学放射性疗法或者是上述疗法的结合。所述的化学疗法或者化学放射性疗法包括卡波钼,或者是一种相关类别的钼类药物,紫杉烷,或者是一种类别的紫杉烷,或者是两者。所述的宿主已经接受过针对头颈癌的治疗。例如,所述的宿主已经接受过免疫疗法,诱导化学疗法,同步化学放射性疗法或者是上述疗法的结合。可供选择的,所述的宿主没有接受过针对头颈癌的治疗。任选的,在本发明所述的方法中进一步的包括对与一个肿瘤有关的至少一个标准参数进行测量。通过免疫组织化学方法对所述的一种头颈癌标记物(HNCMARKERQ所具有的水平进行测量。所述的头颈癌标记物(HNCMARKERQ是在本发明中所公开的任意一种标记物。例如,所述的头颈癌标记物(HNCMARKERQ是在表格1中所列出的任意一种标记物。在某些方面,所述的头颈癌标记物(HNCMARKERQ是着色性干皮病D组蛋白(XPF),范科尼贫血互补组D2(FANCD2),RAD51,乳腺癌易感基因1(BRCAl),细胞周期关卡基因蛋白(ATM),聚二磷酸腺苷核糖(PAR),p53,核苷酸切除修复交叉互补组I(ERCCl),磷酸化H2AX(pH2AX),或者膦-有丝分裂原活化的蛋白激酶活化的蛋白激酶2(pMK2)。在一个方面,所述的头颈癌标记物(HNCMARKERS)是a)着色性干皮病D组蛋白(XPF)以及至少一种选自由下述物质所组成的组中的头颈癌标记物(HNCMARKERS)范科尼贫血互补组D2(FANCD2),膦-有丝分裂原活化的蛋白激酶活化的蛋白激酶2(pMK2),磷酸化H2AX(pH2AX),乳腺癌易感基因1(BRCAl),聚二磷酸腺苷核糖(PAR),细胞周期关卡基因蛋白(ATM),核苷酸切除修复交叉互补组I(ERCCl),RAD51,p53,多角体蛋白基因(POLH),MUS81,pl6,以及人类乳头瘤病毒(HPV)b)范科尼贫血互补组D2(FANCD2)以及至少一种选自由下述物质所组成的组中的头颈癌标记物(HNCMARKERQ着色性干皮病D组蛋白(XPF),膦-有丝分裂原活化的蛋白激酶活化的蛋白激酶2(pMK2),磷酸化H2AX(pH2AX),乳腺癌易感基因1(BRCAl),聚二磷酸腺苷核糖(PAR),细胞周期关卡基因蛋白(ATM),核苷酸切除修复交叉互补组I(ERCCl),RAD51,p53,多角体蛋白基因(POLH),MUS81,pl6,以及人类乳头瘤病毒(HPV)。c)膦-有丝分裂原活化的蛋白激酶活化的蛋白激酶2(pMK2)以及至少一种选自由下述物质所组成的组中的头颈癌标记物(HNCMARKERQ着色性干皮病D组蛋白(XPF),范科尼贫血互补组D2(FANCD2),磷酸化H2AX(pH2AX),乳腺癌易感基因1(BRCAl),聚二磷酸腺苷核糖(PAR),细胞周期关卡基因蛋白(ATM),核苷酸切除修复交叉互补组I(ERCCl),RAD51,P53,多角体蛋白基因(POLH),MUS81,pl6,以及人类乳头瘤病毒(HPV)。d)磷酸化H2AX(pH2AX)以及至少一种选自由下述物质所组成的组中的头颈癌标记物(HNCMARKERS)着色性干皮病D组蛋白(XPF),范科尼贫血互补组D2(FANCD2),膦-有丝分裂原活化的蛋白激酶活化的蛋白激酶2(pMK2),乳腺癌易感基因I(BRCAl),聚二磷酸腺苷核糖(PAR),细胞周期关卡基因蛋白(ATM),核苷酸切除修复交叉互补组I(ERCCl),RAD51,p53,多角体蛋白基因(POLH),MUS81,pl6,以及人类乳头瘤病毒(HPV)。e)乳腺癌易感基因I(BRCAl)以及至少一种选自由下述物质所组成的组中的头颈癌标记物(HNCMARKERS)着色性干皮病D组蛋白(XPF),范科尼贫血互补组D2(FANCD2),膦-有丝分裂原活化的蛋白激酶活化的蛋白激酶2(pMK2),磷酸化H2AX(pH2AX),聚二磷10酸腺苷核糖(PAR),细胞周期关卡基因蛋白(ATM),核苷酸切除修复交叉互补组I(ERCCl),RAD51,p53,多角体蛋白基因(POLH),MUS81,pl6,以及人类乳头瘤病毒(HPV)。f)聚二磷酸腺苷核糖(PAR)以及至少一种选自由下述物质所组成的组中的头颈癌标记物(HNCMARKERS)着色性干皮病D组蛋白(XPF),范科尼贫血互补组D2(FANCD2),膦-有丝分裂原活化的蛋白激酶活化的蛋白激酶2(pMK2),磷酸化H2AX(pH2AX),乳腺癌易感基因I(BRCAl),细胞周期关卡基因蛋白(ATM),核苷酸切除修复交叉互补组I(ERCCl),RAD51,p53,多角体蛋白基因(POLH),MUS81,pl6,以及人类乳头瘤病毒(HPV)。g)细胞周期关卡基因蛋白(ATM)以及至少一种选自由下述物质所组成的组中的头颈癌标记物(HNCMARKERS):着色性干皮病D组蛋白(XPF),范科尼贫血互补组D2(FANCD2),膦-有丝分裂原活化的蛋白激酶活化的蛋白激酶2(pMK2),磷酸化H2AX(pH2AX),乳腺癌易感基因1(BRCAl),聚二磷酸腺苷核糖(PAR),核苷酸切除修复交叉互补组I(ERCCl),RAD51,p53,多角体蛋白基因(POLH),MUS81,pl6,以及人类乳头瘤病毒(HPV)。h)核苷酸切除修复交叉互补组I(ERCCl)以及至少一种选自由下述物质所组成的组中的头颈癌标记物(HNCMARKERS)着色性干皮病D组蛋白(XPF),范科尼贫血互补组D2(FANCD2),膦-有丝分裂原活化的蛋白激酶活化的蛋白激酶2(pMK2),磷酸化H2AX(pH2AX),乳腺癌易感基因I(BRCAl),聚二磷酸腺苷核糖(PAR),细胞周期关卡基因蛋白(ATM),RAD51,p53,多角体蛋白基因(POLH),MUS81,pl6,以及人类乳头瘤病毒(HPV)。i)RAD51以及至少一种选自由下述物质所组成的组中的头颈癌标记物(HNCMARKERS)着色性干皮病D组蛋白(XPF),范科尼贫血互补组D2(FANCD2),膦-有丝分裂原活化的蛋白激酶活化的蛋白激酶2(pMK2),磷酸化H2AX(pH2AX),乳腺癌易感基因1(BRCAl),聚二磷酸腺苷核糖(PAR),细胞周期关卡基因蛋白(ATM),核苷酸切除修复交叉互补组1(ERCCl),p53,多角体蛋白基因(POLH),MUS81,pl6,以及人类乳头瘤病毒(HPV)。j)p53以及至少一种选自由下述物质所组成的组中的头颈癌标记物(HNCMARKERS)着色性干皮病D组蛋白(XPF),范科尼贫血互补组D2(FANCD2),膦-有丝分裂原活化的蛋白激酶活化的蛋白激酶2(pMK2),磷酸化H2AX(pH2AX),乳腺癌易感基因1(BRCAl),聚二磷酸腺苷核糖(PAR),细胞周期关卡基因蛋白(ATM),核苷酸切除修复交叉互补组I(ERCCl),RAD51,多角体蛋白基因(POLH),MUS81,pl6,以及人类乳头瘤病毒(HPV)。k)多角体蛋白基因(POLH)以及至少一种选自由下述物质所组成的组中的头颈癌标记物(HNCMARKERS)着色性干皮病D组蛋白(XPF),范科尼贫血互补组D2(FANCD2),膦-有丝分裂原活化的蛋白激酶活化的蛋白激酶2(pMK2),磷酸化H2AX(pH2AX),乳腺癌易感基因I(BRCAl),聚二磷酸腺苷核糖(PAR),细胞周期关卡基因蛋白(ATM),核苷酸切除修复交叉互补组1(ERCCl),RAD51,p53,MUS81,ρ16,以及人类乳头瘤病毒(HPV)。DMUS81以及至少一种选自由下述物质所组成的组中的头颈癌标记物(HNCMARKERS)着色性干皮病D组蛋白(XPF),范科尼贫血互补组D2(FANCD2),膦-有丝分裂原活化的蛋白激酶活化的蛋白激酶2(pMK2),磷酸化H2AX(pH2AX),乳腺癌易感基因1(BRCAl),聚二磷酸腺苷核糖(PAR),细胞周期关卡基因蛋白(ATM),核苷酸切除修复交叉互补组1(ERCCl),RAD51,p53,多角体蛋白基因(POLH),pl6,以及人类乳头瘤病毒(HPV)。m)pl6以及至少一种选自由下述物质所组成的组中的头颈癌标记物(HNCMARKERS)着色性干皮病D组蛋白(XPF),范科尼贫血互补组D2(FANCD2),膦-有丝分裂原活化的蛋白激酶活化的蛋白激酶2(pMK2),磷酸化H2AX(pH2AX),乳腺癌易感基因1(BRCAl),聚二磷酸腺苷核糖(PAR),细胞周期关卡基因蛋白(ATM),核苷酸切除修复交叉互补组I(ERCCl),RAD51,p53,多角体蛋白基因(POLH),MUS81,以及人类乳头瘤病毒(HPV)。η)人类乳头瘤病毒(HPV)以及至少一种选自由下述物质所组成的组中的头颈癌标记物(HNCMARKERS)着色性干皮病D组蛋白(XPF),范科尼贫血互补组D2(FANCD2),膦-有丝分裂原活化的蛋白激酶活化的蛋白激酶2(pMK2),磷酸化H2AX(pH2AX),乳腺癌易感基因I(BRCAl),聚二磷酸腺苷核糖(PAR),细胞周期关卡基因蛋白(ATM),核苷酸切除修复交叉互补组1(ERCCl),RAD51,p53,多角体蛋白基因(POLH),MUS81,以及pl6。在另外一个方面,所述的头颈癌标记物(HNCMARKERS)是a)着色性干皮病D组蛋白(XPF)以及至少两种选自由下述物质所组成的组中的头颈癌标记物(HNCMARKERS)范科尼贫血互补组D2(FANCD2),膦-有丝分裂原活化的蛋白激酶活化的蛋白激酶2(pMK2),磷酸化H2AX(pH2AX),乳腺癌易感基因1(BRCAl),聚二磷酸腺苷核糖(PAR),细胞周期关卡基因蛋白(ATM),核苷酸切除修复交叉互补组I(ERCCl),RAD51,p53,多角体蛋白基因(POLH),MUS81,pl6,以及人类乳头瘤病毒(HPV)b)范科尼贫血互补组D2(FANCD2)以及至少两种选自由下述物质所组成的组中的头颈癌标记物(HNCMARKERS):着色性干皮病D组蛋白(XPF),膦-有丝分裂原活化的蛋白激酶活化的蛋白激酶2(pMK2),磷酸化H2AX(pH2AX),乳腺癌易感基因1(BRCAl),聚二磷酸腺苷核糖(PAR),细胞周期关卡基因蛋白(ATM),核苷酸切除修复交叉互补组I(ERCCl),RAD51,p53,多角体蛋白基因(POLH),MUS81,pl6,以及人类乳头瘤病毒(HPV)。c)膦-有丝分裂原活化的蛋白激酶活化的蛋白激酶2(pMK2)以及至少两种选自由下述物质所组成的组中的头颈癌标记物(HNCMARKERQ着色性干皮病D组蛋白(XPF),范科尼贫血互补组D2(FANCD2),磷酸化H2AX(pH2AX),乳腺癌易感基因1(BRCAl),聚二磷酸腺苷核糖(PAR),细胞周期关卡基因蛋白(ATM),核苷酸切除修复交叉互补组I(ERCCl),RAD51,P53,多角体蛋白基因(POLH),MUS81,pl6,以及人类乳头瘤病毒(HPV)。d)磷酸化H2AX(pH2AX)以及至少两种选自由下述物质所组成的组中的头颈癌标记物(HNCMARKERS)着色性干皮病D组蛋白(XPF),范科尼贫血互补组D2(FANCD2),膦-有丝分裂原活化的蛋白激酶活化的蛋白激酶2(pMK2),乳腺癌易感基因I(BRCAl),聚二磷酸腺苷核糖(PAR),细胞周期关卡基因蛋白(ATM),核苷酸切除修复交叉互补组I(ERCCl),RAD51,p53,多角体蛋白基因(POLH),MUS81,pl6,以及人类乳头瘤病毒(HPV)。e)乳腺癌易感基因I(BRCAl)以及至少两种选自由下述物质所组成的组中的头颈癌标记物(HNCMARKERS)着色性干皮病D组蛋白(XPF),范科尼贫血互补组D2(FANCD2),膦-有丝分裂原活化的蛋白激酶活化的蛋白激酶2(pMK2),磷酸化H2AX(pH2AX),聚二磷酸腺苷核糖(PAR),细胞周期关卡基因蛋白(ATM),核苷酸切除修复交叉互补组I(ERCCl),RAD51,p53,多角体蛋白基因(POLH),MUS81,pl6,以及人类乳头瘤病毒(HPV)。f)聚二磷酸腺苷核糖(PAR)以及至少两种选自由下述物质所组成的组中的头颈癌标记物(HNCMARKERS)着色性干皮病D组蛋白(XPF),范科尼贫血互补组D2(FANCD2),膦-有丝分裂原活化的蛋白激酶活化的蛋白激酶2(pMK2),磷酸化H2AX(pH2AX),乳腺癌易感基因I(BRCAl),细胞周期关卡基因蛋白(ATM),核苷酸切除修复交叉互补组I(ERCCl),12RAD51,p53,多角体蛋白基因(POLH),MUS81,pl6,以及人类乳头瘤病毒(HPV)。g)细胞周期关卡基因蛋白(ATM)以及至少两种选自由下述物质所组成的组中的头颈癌标记物(HNCMARKERQ:着色性干皮病D组蛋白(XPF),范科尼贫血互补组D2(FANCD2),膦-有丝分裂原活化的蛋白激酶活化的蛋白激酶2(pMK2),磷酸化H2AX(pH2AX),乳腺癌易感基因I(BRCAl),聚二磷酸腺苷核糖(PAR),核苷酸切除修复交叉互补组I(ERCCl),RAD51,p53,多角体蛋白基因(POLH),MUS81,pl6,以及人类乳头瘤病毒(HPV)。h)核苷酸切除修复交叉互补组I(ERCCl)以及至少两种选自由下述物质所组成的组中的头颈癌标记物(HNCMARKERS)着色性干皮病D组蛋白(XPF),范科尼贫血互补组D2(FANCD2),膦-有丝分裂原活化的蛋白激酶活化的蛋白激酶2(pMK2),磷酸化H2AX(pH2AX),乳腺癌易感基因l(BRCAl),聚二磷酸腺苷核糖(PAR),细胞周期关卡基因蛋白(ATM),RAD51,p53,多角体蛋白基因(POLH),MUS81,pl6,以及人类乳头瘤病毒(HPV)。i)RAD51以及至少两种选自由下述物质所组成的组中的头颈癌标记物(HNCMARKERS)着色性干皮病D组蛋白(XPF),范科尼贫血互补组D2(FANCD2),膦-有丝分裂原活化的蛋白激酶活化的蛋白激酶2(pMK2),磷酸化H2AX(pH2AX),乳腺癌易感基因1(BRCAl),聚二磷酸腺苷核糖(PAR),细胞周期关卡基因蛋白(ATM),核苷酸切除修复交叉互补组1(ERCCl),p53,多角体蛋白基因(POLH),MUS81,pl6,以及人类乳头瘤病毒(HPV)。j)p53以及至少两种选自由下述物质所组成的组中的头颈癌标记物(HNCMARKERS)着色性干皮病D组蛋白(XPF),范科尼贫血互补组D2(FANCD2),膦-有丝分裂原活化的蛋白激酶活化的蛋白激酶2(pMK2),磷酸化H2AX(pH2AX),乳腺癌易感基因1(BRCAl),聚二磷酸腺苷核糖(PAR),细胞周期关卡基因蛋白(ATM),核苷酸切除修复交叉互补组I(ERCCl),RAD51,多角体蛋白基因(POLH),MUS81,pl6,以及人类乳头瘤病毒(HPV)。k)多角体蛋白基因(POLH)以及至少两种选自由下述物质所组成的组中的头颈癌标记物(HNCMARKERS)着色性干皮病D组蛋白(XPF),范科尼贫血互补组D2(FANCD2),膦-有丝分裂原活化的蛋白激酶活化的蛋白激酶2(pMK2),磷酸化H2AX(pH2AX),乳腺癌易感基因I(BRCAl),聚二磷酸腺苷核糖(PAR),细胞周期关卡基因蛋白(ATM),核苷酸切除修复交叉互补组1(ERCCl),RAD51,p53,MUS81,pl6,以及人类乳头瘤病毒(HPV)。DMUS81以及至少两种选自由下述物质所组成的组中的头颈癌标记物(HNCMARKERS)着色性干皮病D组蛋白(XPF),范科尼贫血互补组D2(FANCD2),膦-有丝分裂原活化的蛋白激酶活化的蛋白激酶2(pMK2),磷酸化H2AX(pH2AX),乳腺癌易感基因1(BRCAl),聚二磷酸腺苷核糖(PAR),细胞周期关卡基因蛋白(ATM),核苷酸切除修复交叉互补组1(ERCCl),RAD51,p53,多角体蛋白基因(POLH),pl6,以及人类乳头瘤病毒(HPV)。m)pl6以及至少两种选自由下述物质所组成的组中的头颈癌标记物(HNCMARKERS)着色性干皮病D组蛋白(XPF),范科尼贫血互补组D2(FANCD2),膦-有丝分裂原活化的蛋白激酶活化的蛋白激酶2(pMK2),磷酸化H2AX(pH2AX),乳腺癌易感基因1(BRCAl),聚二磷酸腺苷核糖(PAR),细胞周期关卡基因蛋白(ATM),核苷酸切除修复交叉互补组I(ERCCl),RAD51,p53,多角体蛋白基因(POLH),MUS81,以及人类乳头瘤病毒(HPV)。η)人类乳头瘤病毒(HPV)以及至少两种选自由下述物质所组成的组中的头颈癌标记物(HNCMARKERS)着色性干皮病D组蛋白(XPF),范科尼贫血互补组D2(FANCD2),膦-有丝分裂原活化的蛋白激酶活化的蛋白激酶2(pMK2),磷酸化H2AX(pH2AX),乳腺癌易感基因I(BRCAl),聚二磷酸腺苷核糖(PAR),细胞周期关卡基因蛋白(ATM),核苷酸切除修复交叉互补组1(ERCCl),RAD51,p53,多角体蛋白基因(POLH),MUS81,以及pl6。在一个进一步的方面,所述的头颈癌标记物(HNCMARKERQ是a)着色性干皮病D组蛋白(XPF)以及至少三种选自由下述物质所组成的组中的头颈癌标记物(HNCMARKERS)范科尼贫血互补组D2(FANCD2),膦-有丝分裂原活化的蛋白激酶活化的蛋白激酶2(pMK2),磷酸化H2AX(pH2AX),乳腺癌易感基因1(BRCAl),聚二磷酸腺苷核糖(PAR),细胞周期关卡基因蛋白(ATM),核苷酸切除修复交叉互补组I(ERCCl),RAD51,p53,多角体蛋白基因(POLH),MUS81,pl6,以及人类乳头瘤病毒(HPV)b)范科尼贫血互补组D2(FANCD2)以及至少三种选自由下述物质所组成的组中的头颈癌标记物(HNCMARKERQ着色性干皮病D组蛋白(XPF),膦-有丝分裂原活化的蛋白激酶活化的蛋白激酶2(pMK2),磷酸化H2AX(pH2AX),乳腺癌易感基因1(BRCAl),聚二磷酸腺苷核糖(PAR),细胞周期关卡基因蛋白(ATM),核苷酸切除修复交叉互补组I(ERCCl),RAD51,p53,多角体蛋白基因(POLH),MUS81,pl6,以及人类乳头瘤病毒(HPV)。c)膦-有丝分裂原活化的蛋白激酶活化的蛋白激酶2(pMK2)以及至少三种选自由下述物质所组成的组中的头颈癌标记物(HNCMARKERQ着色性干皮病D组蛋白(XPF),范科尼贫血互补组D2(FANCD2),磷酸化H2AX(pH2AX),乳腺癌易感基因1(BRCAl),聚二磷酸腺苷核糖(PAR),细胞周期关卡基因蛋白(ATM),核苷酸切除修复交叉互补组I(ERCCl),RAD51,P53,多角体蛋白基因(POLH),MUS81,pl6,以及人类乳头瘤病毒(HPV)。d)磷酸化H2AX(pH2AX)以及至少三种选自由下述物质所组成的组中的头颈癌标记物(HNCMARKERS)着色性干皮病D组蛋白(XPF),范科尼贫血互补组D2(FANCD2),膦-有丝分裂原活化的蛋白激酶活化的蛋白激酶2(pMK2),乳腺癌易感基因I(BRCAl),聚二磷酸腺苷核糖(PAR),细胞周期关卡基因蛋白(ATM),核苷酸切除修复交叉互补组I(ERCCl),RAD51,p53,多角体蛋白基因(POLH),MUS81,pl6,以及人类乳头瘤病毒(HPV)。e)乳腺癌易感基因I(BRCAl)以及至少三种选自由下述物质所组成的组中的头颈癌标记物(HNCMARKERS)着色性干皮病D组蛋白(XPF),范科尼贫血互补组D2(FANCD2),膦-有丝分裂原活化的蛋白激酶活化的蛋白激酶2(pMK2),磷酸化H2AX(pH2AX),聚二磷酸腺苷核糖(PAR),细胞周期关卡基因蛋白(ATM),核苷酸切除修复交叉互补组I(ERCCl),RAD51,p53,多角体蛋白基因(POLH),MUS81,pl6,以及人类乳头瘤病毒(HPV)。f)聚二磷酸腺苷核糖(PAR)以及至少三种选自由下述物质所组成的组中的头颈癌标记物(HNCMARKERS)着色性干皮病D组蛋白(XPF),范科尼贫血互补组D2(FANCD2),膦-有丝分裂原活化的蛋白激酶活化的蛋白激酶2(pMK2),磷酸化H2AX(pH2AX),乳腺癌易感基因I(BRCAl),细胞周期关卡基因蛋白(ATM),核苷酸切除修复交叉互补组I(ERCCl),RAD51,p53,多角体蛋白基因(POLH),MUS81,pl6,以及人类乳头瘤病毒(HPV)。g)细胞周期关卡基因蛋白(ATM)以及至少三种选自由下述物质所组成的组中的头颈癌标记物(HNCMARKERQ:着色性干皮病D组蛋白(XPF),范科尼贫血互补组D2(FANCD2),膦-有丝分裂原活化的蛋白激酶活化的蛋白激酶2(pMK2),磷酸化H2AX(pH2AX),乳腺癌易感基因I(BRCAl),聚二磷酸腺苷核糖(PAR),核苷酸切除修复交叉互补组I(ERCCl),RAD51,p53,多角体蛋白基因(POLH),MUS81,pl6,以及人类乳头瘤病毒(HPV)。h)核苷酸切除修复交叉互补组I(ERCCl)以及至少三种选自由下述物质所组成的组中的头颈癌标记物(HNCMARKERS)着色性干皮病D组蛋白(XPF),范科尼贫血互补组D2(FANCD2),膦-有丝分裂原活化的蛋白激酶活化的蛋白激酶2(pMK2),磷酸化H2AX(pH2AX),乳腺癌易感基因I(BRCAl),聚二磷酸腺苷核糖(PAR),细胞周期关卡基因蛋白(ATM),RAD51,p53,多角体蛋白基因(POLH),MUS81,pl6,以及人类乳头瘤病毒(HPV)。i)RAD51以及至少三种选自由下述物质所组成的组中的头颈癌标记物(HNCMARKERS)着色性干皮病D组蛋白(XPF),范科尼贫血互补组D2(FANCD2),膦-有丝分裂原活化的蛋白激酶活化的蛋白激酶2(pMK2),磷酸化H2AX(pH2AX),乳腺癌易感基因1(BRCAl),聚二磷酸腺苷核糖(PAR),细胞周期关卡基因蛋白(ATM),核苷酸切除修复交叉互补组1(ERCCl),p53,多角体蛋白基因(POLH),MUS81,pl6,以及人类乳头瘤病毒(HPV)。j)p53以及至少三种选自由下述物质所组成的组中的头颈癌标记物(HNCMARKERS)着色性干皮病D组蛋白(XPF),范科尼贫血互补组D2(FANCD2),膦-有丝分裂原活化的蛋白激酶活化的蛋白激酶2(pMK2),磷酸化H2AX(pH2AX),乳腺癌易感基因1(BRCAl),聚二磷酸腺苷核糖(PAR),细胞周期关卡基因蛋白(ATM),核苷酸切除修复交叉互补组I(ERCCl),RAD51,多角体蛋白基因(POLH),MUS81,pl6,以及人类乳头瘤病毒(HPV)。k)多角体蛋白基因(POLH)以及至少三种选自由下述物质所组成的组中的头颈癌标记物(HNCMARKERS)着色性干皮病D组蛋白(XPF),范科尼贫血互补组D2(FANCD2),膦-有丝分裂原活化的蛋白激酶活化的蛋白激酶2(pMK2),磷酸化H2AX(pH2AX),乳腺癌易感基因I(BRCAl),聚二磷酸腺苷核糖(PAR),细胞周期关卡基因蛋白(ATM),核苷酸切除修复交叉互补组1(ERCCl),RAD51,p53,MUS81,ρ16,以及人类乳头瘤病毒(HPV)。DMUS81以及至少三种选自由下述物质所组成的组中的头颈癌标记物(HNCMARKERS)着色性干皮病D组蛋白(XPF),范科尼贫血互补组D2(FANCD2),膦-有丝分裂原活化的蛋白激酶活化的蛋白激酶2(pMK2),磷酸化H2AX(pH2AX),乳腺癌易感基因1(BRCAl),聚二磷酸腺苷核糖(PAR),细胞周期关卡基因蛋白(ATM),核苷酸切除修复交叉互补组1(ERCCl),RAD51,p53,多角体蛋白基因(POLH),pl6,以及人类乳头瘤病毒(HPV)。m)pl6以及至少三种选自由下述物质所组成的组中的头颈癌标记物(HNCMARKERS)着色性干皮病D组蛋白(XPF),范科尼贫血互补组D2(FANCD2),膦-有丝分裂原活化的蛋白激酶活化的蛋白激酶2(pMK2),磷酸化H2AX(pH2AX),乳腺癌易感基因1(BRCAl),聚二磷酸腺苷核糖(PAR),细胞周期关卡基因蛋白(ATM),核苷酸切除修复交叉互补组I(ERCCl),RAD51,p53,多角体蛋白基因(POLH),MUS81,以及人类乳头瘤病毒(HPV)。η)人类乳头瘤病毒(HPV)以及至少三种选自由下述物质所组成的组中的头颈癌标记物(HNCMARKERS)着色性干皮病D组蛋白(XPF),范科尼贫血互补组D2(FANCD2),膦-有丝分裂原活化的蛋白激酶活化的蛋白激酶2(pMK2),磷酸化H2AX(pH2AX),乳腺癌易感基因I(BRCAl),聚二磷酸腺苷核糖(PAR),细胞周期关卡基因蛋白(ATM),核苷酸切除修复交叉互补组1(ERCCl),RAD51,p53,多角体蛋白基因(POLH),MUS81,以及pl6。在另外一个方面,所述的头颈癌标记物(HNCMARKERQ是在表格2_10中所列举的任意标记物。本发明同样提供了一种运算法则,所述的运算法则源自于在表格1以及表格2中所述的生物标记物列表,所述的运算法则具体说明了所述的生物标记物是怎样与存在于所述小组中的其他生物标记物之间发生关联的,这样一来所述的生物标记物运算法则代表了一种预测值或者预后值,其中所述的预测值或者预后值是存在于头颈癌的治疗应答之中的。除非另外定义,在本发明中使用到的所有的技术术语以及科学术语均具有发明所属
技术领域
的普通技术人员所普遍理解的含义。尽管在本发明的实践中可以使用到与那些在本发明中所描述的相类似的或者等价的方法以及材料,但在下文中描述的是适宜的方法以及材料。在本发明中所提及的所有公开出版物、专利申请、专利、以及其他的参考文献中的全部内容均被清楚的引入作为参考。如果存在矛盾的情形,本说明书,包括定义,将占主导地位。除此之外,在本发明中所描述的材料、方法、以及实施例仅仅是说明性的,并且并不意在构成限制。本发明所具有的其他特征以及优点将通过下面的详细说明以及权利要求而变得显而易见。附图的简要说明附图1病理学者的强度以及数量值打分与机器协助的成像分析及量化打分之间的关联。针对每一位头颈癌患者,在免疫组织化学的两种可供选择的打分策略之间进行比较,其中使用了所述的着色性干皮病D组蛋白(XPF)DNA修复生物标记物。机器打分包括细胞核的百分比(%N),细胞核X平均强度的百分比(%NxAvI),以及%细胞核χ强度(%NχI)。病理学者的打分是通过强度(I)或者数量(Q)来进行的。对所表示出的相关性图表进行所述的相似度的计算,其中利用一个R2值来进行上述的计算。在这些相关性中,R2的值存在于0.744-0.839的范围之内。附图2在患者间所存在的标记物的输出变化远远超过了存在于头颈癌中的样本间的可变性。A,计算值的理论定义,其中所述的计算值指的是核-核可变性以及对等级变化所进行的评价;B,表格表示出的是对头颈癌标记物(HNCMARKERQ进行评价时所得到的平均误差以及患者的数量N;C,来自于患者的结果,其中所述的患者被分为四种头颈癌标记物(HNCMARKERQ等级。由最低值到最高值,对患者的标记物得分进行分类,并且用一条垂直的虚线来展示出每个患者所产生的核-核变化。附图3在对头颈癌患者的整体存活率所进行的辨别测试中,对全部的1-头颈癌标记物(HNCMARKERQ模型、2-头颈癌标记物(HNCMARKERQ模型、3-头颈癌标记物(HNCMARKERS)模型、以及4-头颈癌标记物(HNCMARKERS)模型所进行的剖分分析,其中所述的分析是在所述的头颈癌患者接受了同步化学放射性疗法之后进行的。在对ι-头颈癌标记物(HNCMARKERS)模型、2-头颈癌标记物(HNCMARKERS)模型、3-头颈癌标记物(HNCMARKERS)模型、以及4-头颈癌标记物(HNCMARKERS)模型的例子所进行的研究中,对所述的头颈癌标记物(HNCMARKERQ的剖分分析进行计算。所表示出的是这些类型的全部模型的分布,这是通过对下述统计学参数进行确定的方式来实现的P值,阳性预测值,相对危险,以及平均错误率(AER)。通过所述的箱线图的收缩来表示的是每一种类型中的全部模型所具有的中间值,并且通过所述的括号来表示出所述的数值所存在的范围。阴影部分的箱线代表的是模型的每一种分布的95%的值。显而易见的是,对于这四种统计学参数而言,通过增加存在于所述的运算法则之中的所述标记物的数量来描述一种提高,这样一来在统16计学效能方面1<2<3<4。附图4在接受了同步化学放射性疗法之后,对于整体的存活率而言,在多重标记物模型中固定标记物的性能的提高。在带有具体的单一生物标记物的目标起始点的研究中,对所述的头颈癌标记物(HNCMARKERS)的剖分分析进行计算。在所表示出的例子中,对五种固定的标记物进行了计算,所述的五种标记物是范科尼贫血互补组D2(FANCD2),着色性干皮病D组蛋白(XPF),乳腺癌易感基因I(BRCAl),细胞周期关卡基因蛋白(ATM)以及RAD51。所表示出的是所述起始的1-标记物模型以及随后的所有的2-标记物模型、3-标记物模型以及4-标记物模型,这些标记物模型将总是含有所述相同的固定标记物。在每一种情形中,对每一种固定的标记物单独、以及所述的标记物与其他的头颈癌标记物(HNCMARKERS)所进行的组合所具有的计算得到的IoglOP值(方块)、阳性预测值(PPV)(三角)、以及平均错误率(AER)(黑色圆圈)进行了表示,其中所述的与头颈癌标记物(HNCMARKERS)所进行的组合是在2-标记物模型、3-标记物模型以及4-标记物模型中进行的。对于每一种模型而言,对所有模型的中间值进行了绘制。附图5在预测头颈癌患者的整体存活率时,对头颈癌标记物(HNCMARKERQ多重标记物运算法则的剖分分析,其中所述的头颈癌患者进行了同步化学放射性疗法的治疗。通过在筛选的2-标记物模型、3-标记物模型以及4-标记物模型之间进行的比较,对存在于具体的标记物组合中的一种固定标记物所起到的作用的两个例子进行了描述。所表示出的统计学分析来自于datatable(—种数据网格控件),对存在于所述组中的所述头颈癌标记物(HNCMARKERS)的卡普兰-迈耶(Kaplan-Meier)存活曲线进行了高亮显示。在每一个图表中插入了P值并且所述的黑色虚线表示的是在所述的研究中的全部患者的趋势。例子1,所述的固定标记物是聚二磷酸腺苷核糖(PAR),并且在2-标记物组合、3-标记物组合以及4-标记物组合中添加的所述标记物是RAD51,着色性干皮病D组蛋白(XPF),以及范科尼贫血互补组D2(FANCD2)。例子2,所述的固定标记物是膦_有丝分裂原活化的蛋白激酶活化的蛋白激酶2(pMK2),并且在2-标记物组合、3-标记物组合以及4-标记物组合中添加的所述标记物是乳腺癌易感基因1(BRCAl),范科尼贫血互补组D2(FANCD2),以及p53。附图6概率分析示意。概率分析是一种计算方法,其能够允许对所述的头颈癌标记物(HNCMARKERQ的输出进行一种连续的打分。在所述的运算法则中,通过对所述的概率密度分布所进行的估算,提出了一个死亡的低发病率区域以及一个死亡的高发病率区域。对于所述的高存活率组(即,不存在疾病的存活率或者整体的存活率)以及低存活率组而言,一个能够反映组内成员的单一的得分是通过所述的各个组的概率来进行构建的。可以针对其他的端点值来进行类似的分析,其中所述的端点值例如是复发率。附图7对头颈癌患者进行的单一的头颈癌标记物(HNCMARKERQ的概率分析,其中所述的患者接受了化学放射性疗法的治疗。所表示出的是一个头颈癌标记物(HNCMARKERS)的例子,着色性干皮病D组蛋白(XPF),表示的是对下述参数的投影结果的得分(ScoresbyOutcomes),卡普兰_迈耶疾病特异件存活曲线,来自于得分的预测结果,来自于所沭的MM^mmnfmfm^mm^mmmMm(ROC)s表。对于存活率结果的卡普兰-迈耶投影而言,HIGH代表高存活率的亚组,LOW代表低疾病特异性存活率(DSS)的亚组。黑色虚线代表所有的患者。附图8患者的整体存活率的单一头颈癌标记物(HNCMARKERQ的概率预测,其中所述的患者接受了同步的化学放射性疗法的治疗。所述的例子中表示出了在所述的单变量概率分析的研究中的五种生物标记物(着色性干皮病D组蛋白(XPF),以及范科尼贫血互补组D2(FANCD2),乳腺癌易感基因I(BRCAl),细胞周期关卡基因蛋白(ATM),以及RAD51)。卡普兰-迈耶存活曲线,HIGH以及LOW指的是分别被细分至高整体存活率(良好的结果)以及低整体存活率亚组(差的结果)中的所述患者。具有其他的统计学参数的其他数据存在于表格6中。附图9在头颈癌患者的整体存活率的全部1-头颈癌标记物(HNCMARKERQ模型、2-头颈癌标记物(HNCMARKERQ模型、3-头颈癌标记物(HNCMARKERQ模型、以及4-头颈癌标记物(HNCMARKERS)模型中,对所述的DNA修复头颈癌标记物(HNCMARKERS)所进行的概率分析,其中所述的患者接受了同步化学放射性疗法的治疗。存在于所述的分析中的所述标记物包括所述的头颈癌标记物(HNCMARKERQ组。对所有的1_标记物、2-标记物、3-标记物、以及4-标记物组合模型进行比较并且将其作为1,2,3,4在χ轴上进行绘制。在所述的组中,全部的模型所具有的中间值由一个窄小的白色盒子来代表,存在于每一个被绘制的值的中心区域内。黑色盒子代表的是所述的中间值的95%的置信区间。白色盒子的外部代表的是所述数据的中点(middlehalf)(存在于中间值之上的白色部分是四分之一的数据,存在于中间值之下的白色部分是四分之一的数据)。参与评价的所述的统计学数值是所选定的样本的分数(FractionSampleAssigned),曲线下面积(AUC),敏感度,以及特异性。附图10固定标记物的性能的概率分析。在带有具体的单一生物标记物的目标起始点的研究中,对所述的头颈癌标记物(HNCMARKERQ的概率分析进行计算。在所表示出的例子中,对五种固定的标记物进行了计算,所述的五种标记物是范科尼贫血互补组D2(FANCD2),着色性干皮病D组蛋白(XPF),乳腺癌易感基因1(BRCAl),细胞周期关卡基因蛋白(ATM)以及RAD51。所表示出的是所述起始的1_标记物模型以及随后的所有的2-标记物模型、3-标记物模型以及4-标记物模型,这些标记物模型将总是含有所述相同的固定标记物。在每一种情形中,对每一种固定的标记物单独、以及所述的标记物与其他的头颈癌标记物(HNCMARKERQ所进行的组合所具有的计算得到的IoglOP值(方块)、阳性预测值(PPV)(三角)、以及外视错误率(AER)(黑色圆圈)进行了表示,其中所述的与头颈癌标记物(HNCMARKERQ所进行的组合是在2-标记物模型、3-标记物模型以及4-标记物模型中进行的。对于每一种模型而言,对所有模型的中间值进行了绘制。附图11对多重标记物模型所具有的降低混淆的作用进行的概率分析证明。所表示出的例子阐述了所述的头颈癌标记物(HNCMARKERQ在逐渐减少存在于一个研究组中的某些患者的整体数量方面所起到的作用,其中所述的患者所具有的测试结果是混淆不清的,这意味着所述的患者究竟是存在于一个良好存活组还是差的存活组中,这是不明确的。所述的结果得分来自于概率分析,其存在于+1至-1的范围之内。对参与评价的每一位患者进行记录,使其作为所述的X轴上的一个入口。黑色的垂直线表示的是全部的ι-头颈癌标记物(HNCMARKERS)模型(左)以及4-头颈癌标记物(HNCMARKERS)模型的95%的置信区间,并且虚线表示的是所述测试中的所述患者的范围。所述的被框起的区域表示的是在95%的置信区间内具有所述的混淆不清的测试结果的患者的部分。在所述的患者组中,所述的四种头颈癌标记物(HNCMARKERS)的模型对所述的混淆组进行了显著的减小。附图12—个三种标记物的模型的概率分析——针对头颈癌患者的整体存活率,其中所述的标记物为RAD51,乳腺癌易感基因1(BRCAl),范科尼贫血互补组D2(FANCD2),所述的患者正在接受同步化学放射性疗法的治疗。描述了几个不同的统计学结果,用以证明所述的头颈癌标记物(HNCMARKERS)的组合在评价临床数据方面所具有的作用。通过结果的得分,将患者进行分割,分为那些发生了事件(死亡)或者没有发生事件(存活)的患者,并且在-1.0至+1.0的数值范围内对使用所述的四种标记物测试能够正确的感知(calling)所述的测试所取得的结果的概率进行绘制。卡普兰-迈耶(Kaplan-Meier)存活曲线,HIGH以及LOW指的是那些被进行亚分组的所述患者,所述的亚分组是分别被分为高的整体存活率(良好的结果)以及低的整体存活率(较差的结果)的组。黑色虚线表示的是在所述的评价中的全部患者所具有的趋势。来自于得分的预测结果,是通过针对所述的概率得分绘制的所述的事件(死亡)发生的可能性(利用虚线表示的是95%的置信区间)来表示的;所列出的通过得分绘制出的接受者操作特性曲线(ROC),曲线下面积(AUC)敏感度/特异性的确定,其数值在0-1的范围之内。附图13在头颈癌患者的整体存活率的一个四种标记物的模型的概率分析,其中所述的患者正在接受同步化学放射性疗法的治疗。在这个例子中使用到的所述的四种头颈癌标记物(HNCMARKERQ是着色性干皮病D组蛋白(XPF),范科尼贫血互补组D2(FANCD2),乳腺癌易感基因l(BRCAl),以及细胞周期关卡基因蛋白(ATM)。描述了几个不同的统计学结果,用以证明所述的头颈癌标记物(HNCMARKERQ的组合在评价临床数据方面所具有的作用。通过结果的得分,将患者进行分割,分为那些发生了事件(死亡)或者没有发生事件(存活)的患者,并且在-ι.0至+1.0的数值范围内对使用所述的四种标记物测试能够正确的感知(calling)所述的测试所取得的结果的概率进行绘制。卡普兰-迈耶(Kaplan-Meier)存活曲线,HIGH以及LOW指的是那些被进行亚分组的所述患者,所述的亚分组是分别被分为高的整体存活率(良好的结果)以及低的整体存活率(较差的结果)的组。黑色虚线表示的是在所述的评价中的全部患者所具有的趋势。来自于得分的预测结果,是通过针对所述的概率得分绘制的所述的事件(死亡)发生的可能性(利用虚线表示的是95%的置信区间)来表示的;所列出的通过得分绘制出的接受者操作特性曲线(ROC),曲线下面积(AUC)敏感度/特异性的确定,其数值在0-1的范围之内。附图14在头颈癌患者的整体存活率的一个四种标记物的模型的概率分析,其中所述的患者正在接受同步化学放射性疗法的治疗。在这个例子中使用到的所述的头颈癌标记物(HNCMARKERS)是着色性干皮病D组蛋白(XPF),范科尼贫血互补组D2(FANCD2),RAD51,以及细胞周期关卡基因蛋白(ATM)。描述了几个不同的统计学结果,用以证明所述的头颈癌标记物(HNCMARKERS)的组合在评价临床数据方面所具有的作用。通过结果的得分,将患者进行分割,分为那些发生了事件(死亡)或者没有发生事件(存活)的患者,并且在-1.0至+1.0的数值范围内对使用所述的四种标记物测试能够正确的感知(calling)所述的测试所取得的结果的概率进行绘制。卡普兰-迈耶(Kaplan-Meier)存活曲线,HIGH以及LOW指的是那些被进行亚分组的所述患者,所述的亚分组是分别被分为高的整体存活率(良好的结果)以及低的整体存活率(较差的结果)的组。黑色虚线表示的是在所述的评价中的全部患者所具有的趋势。来自于得分的预测结果,是通过针对所述的概率得分绘制的所述的事件(死亡)发生的可能性(利用虚线表示的是95%的置信区间)来表示的;所列出的通过得分绘制出的接受者操作特性曲线(ROC),曲线下面积(AUC)敏感度/特异性的确定,其数值在0-1的范围之内。附图15在头颈癌的治疗中,头颈癌标记物(HNCMARKERS)模型能够显著的辨别患者的疾病特异性存活亚组。对一个可供选择的临床参数进行评价,所述的临床参数是疾病特异性存活率(DSQ。所述的例子表示出的是针对单一的头颈癌标记物(HNCMARKERQ所进行的剖分分析计算,在所述的计算中,使用了logIOp值的统计学结果。对于列举的四种所述标记物而言,所述的数值为着色性干皮病D组蛋白(XPF)(p=1.7如-5),乳腺癌易感基因1(BRCAl)(p=8.5e-4),范科尼贫血互补组D2(FANCD2)(p=4.58e_4),以及RAD51(p=0.0013)。HIGH表示高存活率亚组,LOW表示低疾病特异性存活率(DSS)亚组。黑色虚线代表所有的患者。附图16用于识别化学放射性疗法所带来的益处的四种头颈癌标记物(HNCMARKERS)模型,所述的识别是通过对所述的头颈癌患者的疾病特异性存活率进行监测的方法来进行的。对一个可供选择的临床参数进行评价,所述的临床参数是疾病特异性存活率(DSS),其中使用到一个四种头颈癌标记物(HNCMARKERQ的模型,所述的模型是由乳腺癌易感基因I(BRCAl)、着色性干皮病D组蛋白(XPF)、RAD51、以及范科尼贫血互补组D2(FANCD》组成的。对卡普兰-迈耶疾病特异性存活曲线进行绘制并且通过logIOp值对存在于HIGH存活率组以及LOW存活率组之间的显著性进行评价。在左侧的剖分分析中,logIOp值为2.9e-6。在右侧的剖分分析中,logIOp值为5.35e_4。HIGH表示高存活率亚组,LOW表示低疾病特异性存活率(DSQ亚组。黑色虚线代表所有的患者。附图17着色性干皮病D组蛋白(XPF)单变量分析表现出了提高的应答预测,其中所述的应答是针对头颈癌的诱导化学疗法的应答。所述的图表表示出的是所述的着色性干皮病D组蛋白(XPF)生物标记物得分的单变量分析,其中所述的分析是相对于在应答者亚组(CR以及PR)与稳定疾病(SD)间的区分而言的。低的着色性干皮病D组蛋白(XPF)得分表示的是对诱导化学疗法治疗的100%的应答。在参与所述研究的37位患者中,11位具有完全的应答,19位具有部分的应答,并且7位具有稳定的疾病。附图18两种头颈癌标记物(HNCMARKERS)的分析,用以对诱导化学疗法在头颈癌中的成功率进行预测。所表示出的是两个DNA修复生物标记物的例子所进行的比较,其中所述的两个生物标记物与这三个标记物是成对组合使用的着色性干皮病D组蛋白(XPF),膦-有丝分裂原活化的蛋白激酶活化的蛋白激酶2(pMK2),磷酸化H2AX(pH2AX)。三角形代表的是稳定疾病(SD)患者;圆圈代表的是CR/PR(应答者)患者。通过剖分分析对患者进行分割。点状的方框代表的是含有稳定疾病(SD)的组,其中对于两种标记物而言,存在一个100%的稳定疾病(SD)组的预测。较低的象限代表的是所述的成对组合的曲线下面积(AUC)的值。附图19在头颈癌的诱导化学疗法的预测方面所进行的头颈癌标记物(HNCMARKERS)的两种标记物的分析可供选择的球面映照分析。在两种标记物的运算法则中,将NE05(着色性干皮病D组蛋白)、DR07(磷酸化H2AX)、DR02(膦-有丝分裂原活化的蛋白激酶活化的蛋白激酶幻头颈癌标记物(HNCMARKERQ彼此之间进行评价,其中对所述的两个同中心的椭圆形所具有的中心进行CP/PR(应答者)以及SD(稳定的疾病)(非应答者)的比较。与一个组或者另外一个组所具有的关联最紧密的患者组具有被进行正确分配的最大可能性,其中所述的分配是由所述的两种标记物的运算法则来进行的。附图20多个头颈癌标记物(HNCMARKERQ为患者对头颈癌的诱导化学疗法所产生的应答所带来的益处。所述的DNA修复生物标记物小组的意图在于对应答者亚组(CR以及PR)及稳定疾病(SD)进行辨别。为了表现出所述的生物标记物和/或2-生物标记物小组或者3-生物标记物小组在识别真实应答者的患者方面所具有的价值,进行所述的计算,其中在正确感知(calling)所述的稳定疾病患者方面是不存在误差的(100%的稳定疾病/恶化疾病的正确率)。通过这种方式,将所有的1-标记物模型与所有的2-标记物模型以及3-标记物模型进行比较。2-标记物模型是Ml+M2(相加)以及Ml/M2(比值)。3-标记物模型是Ml+M2+M3(相加)以及Ml/M2+M3(比值+相加)。对结果进行计算,将其作为合并的曲线下面积(AUC)并且根据被正确感知的所述的CR/TO(应答者)所占的分数来进行分级。附图21头颈癌对诱导化学疗法所产生的应答的分类树分析,其中涉及到头颈癌标记物(HNCMARKERS)。通过递归分割技术对所述的分类树的每一个节点的决策点进行决策,其中每一次划分都能够最大程度的对所述的应答亚组(SD对CR/PR)进行辨别。连续进行划分,直至达到了所述的可以终止的组内数量(组内数量为1时将产生完美的分类)。依据成本-复杂程度目标函数,通过削减(priming)去除具有最小辨识度的分支。对于这种决策树而言,一种4-标记物模型能够给出最佳的患者应答种类的5个节点的分割。所述的DNA修复以及应答生物标记物是着色性干皮病D组蛋白(XPF),膦-有丝分裂原活化的蛋白激酶活化的蛋白激酶2(pMK2),聚二磷酸腺苷核糖(PAR),以及磷酸化H2AX(pH2AX),它们代表了所述的DNA修复途径中的几种。所述的附图表示出了在每一个节点上所述的患者的分布。b部分,5节点的头颈癌标记物(HNCMARKERQ模型削减的分类树的混淆矩阵,其中所述的分类树来自于诱导化学疗法。所述的方法将针对所述患者应答的预测分布与所述的实际分布进行了比较。依据每一个具有相继数量的树的误差的减小,存在5个节点的非随机选择。值得注意的是,所述的5个节点模型表示出了所描述的大约1/2的总体变化,并且是一个良好的简便的“经验法则”。发明的详细描述本发明涉及对一种生物标记物的识别,其中所述的生物标记物与头颈癌有关。具体的,这些生物标记物是蛋白质,所述的蛋白质与DNA的修复途径有关。DNA的修复途径对于所述的细胞应答网络而言是重要的,其中所述的应答网络是针对化学疗法以及放射物而产生的。肿瘤细胞具有改变的DNA修复以及DNA损伤应答途径并且这些途径中的一个途径发生损失将致使所述的癌症对于一个特定类别的DNA损伤试剂而言更为敏感。癌症治疗的操作方法是通过对所述的细胞所具有的修复DNA损伤的能力进行压制的方式来实现的,从而导致细胞的死亡,其中所述的癌症治疗的操作方法例如是化学疗法以及放射性疗法。存在六种主要的DNA修复途径,所述的修复途径能够通过几个标准来对其进行识别,其中所述的DNA修复途径可以被划分为三个组,是能够对单链的损伤进行修复的组以及能够对双链的损伤进行修复的组。单链损伤的修复途径包括碱基切除修复(BER);核苷酸切除修复(NER);错配修复(MMR);同源性重组/范科尼贫血途径(HR/FA);非同源性末端连接(NHEJ),以及跨损伤DNA合成修复(TLS)。单链损伤的修复途径包括碱基切除修复(BER),核苷酸切除修复(NER),以及错配修复(MMR)能够对单链DNA的损伤进行修复。当存在于一个双倍螺旋体中的两条链上仅有一条链存在缺陷时,所述的另外一条链可以被用来作为一种模板,用来对所述的受损伤的链的修正作用进行指导。为了对存在于DNA上的两个成对分子中的一个所具有的损伤进行修复,存在许多的切除修复机制,所述的切除修复机制能够除去所述的受到损伤的核苷酸并且利用一个未被损伤的核苷酸对其进行替代,其中所述的未被损伤的核苷酸与在所述的未被损伤的DNA链上所找到的核苷酸是互补的。碱基切除修复(BER)修复的损伤是由单个的核苷酸所产生的,其中所述的损伤是通过氧化反应,烷基化反应,水解反应,或者去氨基反应而引发的。核苷酸切除修复(NER)修复的是能够影响2-30个碱基的较长的链的损伤。这种过程能够识别出大量的、使螺旋体产生扭曲的变化,例如胸腺嘧啶二聚物以及单链上的断裂(利用酶对其进行修复,其中所述的酶是例如UvrABC核酸内切酶)。一种特定形式的核苷酸切除修复(NER)被称之为转录偶联修复(TCR),所述的修复能够在基因上配置具有高优先性的核苷酸切除修复(NER)修复酶,其中所述的基因是被转录活化的。错配修复(MMR)能够修正在DNA的复制以及重组中所产生的错误,其中所述的在DNA重组中所产生的错误能够在经过DNA的复制之后产生错配的核苷酸。非同源性末端连接(NEHJ)以及同源性重组(HR)能够对双链DNA的损伤进行修复。双链的损伤对于细胞的分裂而言是格外危险的。当所述的细胞还没有对一种DNA的区域进行复制而在所述的DNA区域上已经发生了损伤时,所述的非同源性末端连接(NHEJ)途径开始运转。所述的方法能够在不需要模板的情况下直接对所述的受损伤的DNA链的两个末端进行连接,在所述的过程中会丢失序列信息。因此,这种修复机制必然是诱变性的。然而,如果所述的细胞并没有进行分裂并且没有对其DNA进行复制,所述的非同源性末端连接(NHEJ)途径是所述细胞的唯一选择。非同源性末端连接(NHEJ)依靠的是偶然的配对,或者微同源性,其中所述的偶然配对或者微同源性是发生在或者存在于被进行连接的两条DNA片段的单链尾端的。在较为高级的真核细胞中,非同源性末端连接(NEHJ)中存在着多种独立的“故障自动保险(failsafe)”途径。重组性的修复需要存在一种相同的序列或者几乎相同的序列,其中所述的序列被用来作为一种模板,用于对所述的断裂之处进行修复。产生这种修复方法的酶学机制与产生染色体交叉的机制几乎相同,其中所述的染色体交叉是在减数分裂的过程中出现的。这种途径允许使用所述的新生成的姐妹染色单体作为一种模板,对一种受到损伤的染色体进行修复,其中所述的新生成的姐妹染色单体即,一种相同的拷贝,所述的拷贝同样经由所述的着丝点与所述的受损伤的区域进行了连接。通过这种机制进行修复的双链断裂一般而言是由所述的复制机制而引发的,其中所述的复制机制试图越过一个单链的断裂处或者未被修复的损伤处进行合成,上述两种情况均能够导致所述的复制叉的瓦解。跨损伤合成是一种倾向于出错的(几乎一定会出错)、用于进行一种DNA损伤的修复的最后的手段和方法,其中所述的DNA损伤已经不能通过其他任何的机制来进行修复。所述的DNA复制机制在经过一个DNA损伤位点时不能进行连续的复制,因而所述的行进中的复制叉将在遭遇到一种受到损伤的碱基时产生停滞。所述的跨损伤合成途径受到特异性的DNA聚合酶的介导,其中所述的DNA聚合酶能够在所述的损伤位点之上插入额外的碱基并且因此允许复制作用绕过所述的受到损伤的碱基而继续进行染色体的重复。通过所述的跨损伤合成机制而被插入的所述碱基是不依赖于模板的,但并不是随意的;例如,当所述的合成经过一种胸腺嘧啶二聚物时,一种人类聚合酶会插入腺嘌呤碱基。正常的细胞加工以及外源性的试剂均能够促成所述的DNA损伤的累积,针对这一22点,真核细胞已经进化出复杂的以及过剩的修复机制,用以确保所述的遗传物质的稳定性以及遗传物质的高忠实度的复制。尽管自然发生的变异不能够完全成为所述的终生癌症的危险的原因,但在DNA修复方面存在的缺陷能够产生一种“增变基因”表型,在所述的表型中,细胞以一种加速的速度对损伤进行累积,从而导致肿瘤的形成。尽管这些缺陷能够促成遗传的不稳定性以及侵略性,它们同样能够使肿瘤细胞对损伤变得敏感,其中所述的损伤是通过外源性的DNA损伤试剂来产生的,例如是化学疗法以及致电离辐射。因此,由于DNA的损伤修复缺陷更为有可能是普遍存在于癌症细胞之中的并且与侵略性有关,所述的细胞DNA修复机制能够为预测以及预后提供一种时机,也能够为治疗剂的研发提供一组目标。因此,本发明提供了用来确定一种癌症细胞对一个治疗性试剂(例如,化学疗法)或者致电离辐射所具有的应答能力的方法,所述的方法是通过确定哪一种DNA修复途径发生了改变的方式来实现的,其中所述的应答能力例如是敏感度或者抗性。这些方法同样能够被有效的用来对宿主进行监测以及对治疗方法及治疗方案进行选择,其中所述的宿主正在接受针对癌症或者其他的细胞增殖性疾病的治疗方案以及治疗方法,所选择的治疗方法及治疗方案对于患有癌症或者其他的细胞增殖性疾病的宿主而言应当是有效的,其中对这样的治疗方案以及治疗方法的选择和使用能够对所述癌症或者其他的细胞增殖性疾病的恶化进行减缓。更为具体的,本发明提供了用以确定一位患有头颈癌的患者将能否对诱导化学疗法产生应答的方法。定义“准确率”指的是一种被测量得到的质量或者被计算得到的质量(一种测试报告值)与其实际(或者真实)值之间的一致性程度。临床准确率涉及到所述的真实结果(真实阳性(TP)或者真实阴性(TN))占错误分类结果(假阳性(FP)或者假阴性(FN))的比例,并且其可以被称为敏感度,特异性,阳性预测值(PPV)或者阴性预测值(NPV),或者除了其他的测量物之外,作为一种可能性,还可以被称为让步比。“生物标记物”在本发明的上下文中涵盖,但不局限于,蛋白质,核酸,以及代谢产物,以及它们的多形体,变异形式,变体,修饰形式,亚单元,片段,蛋白-配体复合物,以及降解产物,蛋白-配体复合物,元素,相关代谢产物,以及其他的分析物或者来源于样本的测量物。生物标记物同样可以包括变异的蛋白质或者变异的核酸。生物标记物同样能够涵盖非血液中产生的因子或者健康状态的非分析物生理学标记物,例如在本发明中所定义的“临床参数”,以及同样在本发明所定义的“传统实验室危险因素”。生物标记物同样包括任何通过计算得到的指数,其中所述的指数是通过数学的方法或者通过前述测量方法中的任意一种或者多种的组合而建立的,包括暂时性的趋势以及差异。在可以利用的情况中,并且除非在本发明中另有描述,当生物标记物是基因产物时,可以根据所述的官方的字母缩略语或者被指定的基因符号对所述的生物标记物进行识别,其中所述的基因符号是由国际人类基因命名委员会(internationalHumanGenomeOrganizationNamingCommittee(HGNC))指定的,以及在本申请日前在所述的美国生物技术信息中心(USNationalCenterforBiotechnologyInformation(NCBI))歹lj[JB白勺。“头颈癌标记物(HNCMARKER),,或者“HNCMAERKERS”涵盖了全部的核酸或者多肽中的一种或者多种,其中所述的多肽的水平在宿主体内发生了变化,其目的在于对一种治疗方法进行应答。在本发明中所使用的头颈癌标记物(HNCMARKER)包括着色性干皮病D组蛋白(XPF),范科尼贫血互补组D2(FANCD2),膦-有丝分裂原活化的蛋白激酶活化的蛋白激酶2(pMK2),磷酸化H2AX(pH2AX),乳腺癌易感基因1(BRCAl),聚二磷酸腺苷核糖(PAR),聚二磷酸腺苷核糖聚合酶1(PARPl),错配修复蛋白1(MLHl),细胞周期关卡基因蛋白(ATM),核苷酸切除修复交叉互补组I(ERCCl),RAD51,磷酸化热休克蛋白27(pHSP27),P53,多角体蛋白基因(POLH),MUS81,Κ67,pl6,以及人类乳头瘤病毒(HPV)。在本发明中,各个头颈癌标记物(HNCMARKERQ共同被称之为,尤其是,“头颈癌相关性蛋白质”,“头颈癌标记物(HNCMARKER)多肽”,或者“头颈癌标记物(HNCMARKER)蛋白质”。编码所述多肽的相应的核酸被称之为“头颈癌相关性核酸”,“头颈癌相关性基因”,“头颈癌标记物(HNCMARKER)核酸”,或者“头颈癌标记物(HNCMARKER)基因”。除非另外指明,“头颈癌标记物(HNCMARKER)”,“头颈癌相关性蛋白质”,“头颈癌相关性核酸”意在指的是在本发明中所公开的所述生物标记物中的任意一种,其中所述的生物标记物是,例如,着色性干皮病D组蛋白(XPF),范科尼贫血互补组D2(FANCD2),膦-有丝分裂原活化的蛋白激酶活化的蛋白激酶2(pMK2),磷酸化H2AX(pH2AX),乳腺癌易感基因1(BRCAl),聚二磷酸腺苷核糖(PAR),聚二磷酸腺苷核糖聚合酶I(PARPl),错配修复蛋白1(MLHl),细胞周期关卡基因蛋白(ATM),核苷酸切除修复交叉互补组I(ERCCl),RAD51,磷酸化热休克蛋白27(pHSP27),p53,多角体蛋白基因(POLH),MUS81,Κ67,pl6,以及人类乳头瘤病毒(HPV)。所述的头颈癌标记物(HNCMARKER)蛋白质或者核酸所具有的相应的代谢产物同样是可以被测量的,以及上述提及的传统危险标记物代谢产物中的任意一种。健康状态的生理学标记物(例如,年龄,家族历史,以及普遍被用来作为传统的危险因素的其他测量值)被称之为“头颈癌标记物(HNCMARKER)生理学”。经过计算得到的指数被称之为“头颈癌标记物(HNCMARKER)指数”,其中所述的指数是通过数学的方法将一种或者多种测量值进行组合来建立的,其中所述的测量值优选为两种或者多种,是针对前述提及的头颈癌标记物(HNCMARKERQ类型所进行的测量。“临床指示剂”指的是任何的生理学数据,所述的生理学数据可以单独使用或者与其他的数据联合使用,用以对收集到的细胞或者收集到的有机体的生理学状况进行评价。这个术语包括潜伏期指示剂。“临床参数”涵盖了所有的宿主健康状态的非样本生物标记物或者非分析物生物标记物或者其他的特征,例如,但不局限于,年龄(Age),种族(RACE),性别(kx),或者家族历史(!^mffiO。“FN”指的是假阴性,当其被用在一种疾病状态的测试中时,指的是将一个患有疾病的宿主错误的分类为未患有疾病或者正常。“FP”指的是假阳性,当其被用在一种疾病状态的测试中时,指的是将一个正常的宿主错误的分类为患有疾病。“公式”、“运算法则”、或者“模型”指的是任何的数学等式,算法,解析或者程序化的过程,或者统计学技术,其能够进行一个或者多个连续的或者分类的输入(在本发明中被称为“参数”)并且计算出一个输出值,有时其被称之为“指数”或者“指数值”。“公式”的非限制性的例子包括求和操作,比例操作,以及回归操作,例如系数或者指数,生物标记物值的转化以及正态化(包括,但不局限于,那些基于临床参数的正态化方案,其中所述的临床参数是例如性别,年龄,或者种族),标准以及指导方针,统计学分类模型,已经在历史群体中训练得到的神经网络。当在组合的头颈癌标记物(HNCMARKERQ以及其他的生物标记物中进行特定的使用时,其是线性等式以及非线性等式,以及统计学分类分析,用以确定存在于一个宿主样本中的所述头颈癌标记物(HNCMARKERS)的水平与所述的宿主对化学疗法所具有的应答能力之间存在的关系。在评判小组(panel)以及混合结构中,特别感兴趣的是结构以及合成统计分类运算法则,以及用来进行危险指数构建的方法,其中所述的方法利用到了图案识别的特征,包括已经建立的技术例如交叉相关,主成分分析(PCA),因素轴转,吉斯回归(LogReg),线性判断分析(LDA),Eigengene线性判断分析(ELDA),支持向量机(SVM),随机森林(RF),递归分割树(RPART),以及除此之外的其他相关的决策树分类技术,缩小重心(SC),StepAIC,K最近邻取样,Boosting,决策树,神经网络,贝叶斯网络,支持向量机,以及隐式马可夫模型。可以被用在存活率以及事件时机危险分析中的其他技术包括比例风险模型(Cox),可靠性和寿命数据分析(Weibull),卡普兰-迈耶(Kaplan-Meier)模型以及Greenwood模型,均是本领域技术人员所熟知的。这些技术中的许多在用来与一种头颈癌标记物(HNCMARKER)筛选技术进行组合使用时同样是有效的,其中所述的头颈癌标记物(HNCMARKER)筛选技术例如是前向选择,后向选择,或者逐步选择,在一种给定大小的范围内对所有可能的小组进行的全数调查,遗传运算法则,或者它们本身可以包括以它们自己的技术来完成的生物标记物筛选方法。可以将这些与信息准则进行偶联,其中所述的信息准则是例如赤池信息准则(Akaike’sInformationCriterion)(AIC)或者贝叶斯信息准则(BayesInformationCriterion)(BIC),其目的在于对存在于另外的生物标记物与模型改进之间的折衷进行量化,并且帮助对这种过度拟合进行最小化。上述得到的预测模型可以在其他的研究中对其进行验证,或者在它们最初进行训练的研究中对其进行交叉验证,其中所述的验证或者交叉验证使用的是这样的技术例如仿真程序(Bootstrap),留一法(LOO)以及10倍交叉验证(10-FoldCV)。在各种不同的步骤中,可以通过数值的置换检验对错误发现率进行估算,这可以依照本领域已知的技术来实现。“健康经济利用率函数(healtheconomicutilityfunction)”是一种来自于一定范围内的临床结果的预期概率的组合的一个公式,其中所述的临床结果来自于一个理想化的可以适用的患者群体,其得自于在向所述的标准治疗过程中插入诊断性干预或者治疗性干预之前以及之后。其涵盖了对这种干预所具有的下述参数的估算准确率,有效性以及性能特征,以及与每一种结果相关的成本和/或价值测量(利用率),所述的结果可以来自于真实的医疗卫生系统成本(服务,补给,设备以及药物,等等)和/或一种估算得到的可以被接受的在每一个质量调整生命年(QALY)中的价值,其中所述的价值是能够产生每一种结果的价值。将产生一种结果的参与预测的所述群体的大小乘以各自结果的预期可利用率,将所有的预测结果的上述乘积求和,就得到了对于一种给定的标准治疗而言的整体的健康经济利用率。在(P存在所述干预的情况下,计算得到的所述标准治疗所具有的总体的健康经济利用率与()不存在所述干预的情况下,计算得到的所述标准治疗所具有的总体的健康经济利用率之间所存在的差异产生了对所述的干预而言的健康经济成本或者价值的整体测量值。可以将该数值除以参与进行分析的整体的患者组(或者单独的除以所述的干预组),从而获得了每一个单位干扰所具有的成本,并且能够对下述决策起到指导作用,其中所述的决策是市场定位,定价,以及对健康系统的接受程度的设想。这样的健康经济利用率函数是普遍被使用的,用以对所述的干预所具有的成本-有效性进行比较,但是同样可以对上述函数进行转化,用以估算在每一个质量调整生命年(QALY)中有意愿对所述的健康治疗系统进行购买的可接受值,或者用以估算一种新的干预所需要具有的可接受的成本-有效性临床性能特征。对于本发明中所述的诊断性的(或者预后性的)干预而言,由于每一种结果(这在一项疾病分类诊断性测试中可以是一种真阳性,假阳性,真阴性,或者假阴性)承受着不同的成本,一个健康经济利用率函数可能对敏感度而不是特异性进行优先的证明,或者可能对阳性预测值(PPV)而不是阴性预测值(NPV)进行优先的证明,这是根据所述的临床状况以及各个结果所具有的成本以及价值来决定的,并且因此提供了另外一种健康经济性能以及价值的测量值,所述的测量值可能与更直接的临床性能测量值或者分析性能测量值存在差异。这些不同的测量值及其相关的折衷值一般而言仅仅在一种完美的测试中才能会聚在一点,具有零错误率(或者换句话说,有零个被预测的宿主的结果是被错误分类的或者是假阳性的以及假阴性的),其中所有的性能测量值都将偏向于不完整性,只是在程度上有所不同。“测量”或者“测量方法”,或者可供选择的“探测”或者“探测方法”,指的是在一个临床样本或者来自于宿主的样本中,对一种任意给定的物质的存在、不存在、质量或者剂量(其可能是一种有效剂量)所进行的评价,包括这样的物质所具有的定性的浓度水平或者定量的浓度水平的衍生,或者另外的对一种宿主的非分析物临床参数所具有的价值或者分类所进行的评价。“阴性预测值”或者“NPV”是由真阴性(TN)/(真阴性+假阴性)计算得到的,或者是由所述的真阴性部分占全部的阴性测试结果的比例计算得到的。其同样会固有的受到所述疾病的流行程度的影响,以及所述群体所具有的测试前概率的影响,其中所述的群体是意在接受测试的群体。参见,例如,0,MarcaighAS,JacobsonRM于1993年在Clin.Ped.《儿科临床学》32(8):485-491中发表的文章“EstimatingThePredictiveValueOfADiagnosticTest,HowToPreventMisleadingOrConfusingResults《对一禾中诊断性测试所具有的预测值的估算,怎样防止误导或者混乱的结果》”,其中对一种测试所具有的特异性、敏感度、以及阳性预测值和阴性预测值进行了讨论,所述的测试例如是一种临床诊断性测试。通常情况下,对于使用了一种连续性的诊断性测试的测量方法的二元疾病状态分类方法而言,通过接受者操作特性(ROC)曲线对所述的敏感度以及特异性进行了总结,并且通过所述的曲线下面积(AUC)或者C-统计量进行了总结,其中所述的接受者操作特性(ROC)曲线是依照P印e等人于2004年在Am.J.Epidemiol《美国流行病学杂志》159(9)882-890中发表的文章"LimitationsoftheOddsRatioinGaugingthePerformanceofaDiagnostic,Prognostic,orScreeningMarker《让步比在测定一种诊断性、预兆性、或者筛选性标记物的性能中所存在的局限性》”所描述的,所述的曲线下面积(AUC)或者C-统计量是一种允许用来仅使用一个单一的数值对一种测试、检测、或者方法在全体范围的测试(或者检测)分割点上所具有的敏感度以及特异性进行代表的指示剂。同样可以参见,例如,Shultz于1996年在由Burtis以及Ashwood(编辑)的Teitz,FundamentalsofClinicalChemistry《临床化学基础》第4版第14章中发表的文章“ClinicalInterpretationOfLaboratoryProcedures*;〈实验室操作的I临床干预〉〉,,,W·B·Saunders公司,第192-199页;以及Zweig等人于1992年在Clin.Chem.《临床化学》38(8)=1425-1428中发表的文章"ROCCurveAnalysis:AnExampleShowingTheRelationshipsAmong26SerumLipidAndApolipoproteinConcentrationsInIdentifyingSubjectsWithCoronoryArteryDisease《接受者操作特性曲线分析在对患有冠心病的患者进行识别时,一种能够表现出所述的血清血脂与阿朴脂蛋白之间的关系的例子》”。依照Cook于2007年在Circulation《循环》115:拟8_9;35中发表的文章"UseandMisuseoftheReceiverOperatingCharacteristicCurveinRiskPrediction《在危险预测中,对所述的接受者操作性特征曲线的使用以及滥用》”中的内容,对一种可供选择的方法进行了概述,其中在所述的方法中使用到了似然函数,让步比,信息论,预测值,校验(包括拟合度),以及重新分类的测量方法。最终,由一项测试来进行定义的危险比例以及在宿主组内的绝对危险比例及相对危险比例成为一项对临床准确率以及可利用率的进一步的测量方法。多种方法被频繁的用来对异常的或者疾病的值进行定义,其中所述的值包括引用极限,判定极限,以及危险阈值。“分析准确率”指的是所述的测量方法过程本身所具有的可再现性以及可预测性,并且可以在如下这样的测量方法中对其进行总结变异系数,以及所述的相同样本或者对照所具有的一致性以及校验测试,其中在所述的测量方法中使用到的是不同的时间、使用者、仪器和/或试剂。同样在Vasan于2006年发表的文章中总结概括了在评价新的生物标记物的过程中的这些考虑以及其他的考虑。“性能”是一个术语,所述的术语指的是一种诊断性的测试或者预后性的测试所具有的整体的有效性以及质量,其中包括临床准确率以及分析准确率,其他的分析特征以及加工特征,例如使用特征(例如,稳定性,使用的便利性),健康经济值,以及所述的测试中的组分所具有的相对成本。这些因素中的任何一个都可能是所述的优异性能产生的源泉以及因此使所述的测试具有有效性的源泉,并且可以通过适宜的“性能度量体系”来对其进行测量,其中所述的“性能度量体系”例如是曲线下面积(AUC),获得结果的时机,货架期,等等,只要相关即可。“阳性预测值”或者“PPV”是由真阳性(TP)/(真阳性+假阳性)计算得到的,或者是由所述的真阳性部分占全部的阳性测试结果的比例计算得到的。其同样会固有的受到所述疾病的流行程度的影响,以及所述群体所具有的测试前概率的影响,其中所述的群体是意在接受测试的群体。在本发明的上下文中,“危险”指的是在一个指定的时间段内一种事件将发生的概率,正如在对所述治疗的应答能力方面,癌症的复发方面或者存活率方面,并且能够意味着所述宿主的“绝对”危险或者“相对”危险。绝对危险可以根据下述来进行测量在进行测量之后的所述相关的时间组之后实际的观察情况,或者根据从统计学有效的历史组中得来的指数值来进行测量,其中所述的历史组是在所述的相关的时间段内被跟进的组。相对危险指的是一个宿主所具有的绝对危险与所述的低危险组所具有的绝对危险之间的比值,或者是一个宿主所具有的绝对危险与一种平均的群体危险之间的比值,这种比值可能因为临床危险因素的评价方式而存在变化。对于非转化的情况而言,让步比同样是被普遍使用的,让步比指的是对于一个给定的测试结果而言,所述的阳性事件与所述的阴性事件之间的比例(让步比是根据所述的公式ρ/(1-ρ)计算得到的,其中P指的是所述事件所具有的概率并且(I-P)指的是所述的未发生事件所具有的概率)。在本发明的上下文中,“危险评估”或者“对危险进行的评估”涵盖了对所述的概率、让步、或者可能性所进行的一种预测,其中所述的概率、让步、或者可能性指的是一种事件或者疾病状态可能发生,所述的事件所具有的出现几率或者从一种疾病状态向另外一种疾病状态进行的转化。危险评估同样能够包括对下述内容所进行的预测未来的临床参数,传统实验室危险因素值,或者癌症的其他指数,无论它们是以绝对的形式或者是相对的形式在先前已经被测量的群体中出现的。本发明中所述的方法可以被用来对针对所述的治疗方案所具有的应答能力进行连续性的测量或者分类的测量,并且因此对一种类型的宿主所具有的危险谱进行诊断以及定义,其中所述的这种类型的宿主被定义为应答者或者非应答者。在进行所述的分类测量的情况中,本发明可以被用来在正常的宿主与具有较高的应答危险的其他宿主组之间进行判定。这种不同的用途可能需要不同的头颈癌标记物(HNCMARKER)的组合以及有各自特点的评判小组,数学运算法则,和/或截止点,但是可以被进行相同的上述提及的测量,其中所述的测量针对的是对于各自的指定用途而言所具有的准确率以及性能。在本发明的上下文中,“样本”指的是一种从宿主中分离得到的生物学样本,并且可以包括,通过举例的方式而不构成限制,组织活切片,全血,血清,血浆,血细胞,内皮细胞,淋巴液,腹腔积液,间质流体(同样被称为“细胞外流体”并且涵盖了在细胞之间的间隙内被发现的所述流体,包括,尤其是,牙龈沟液),骨髓,脑脊髓液(CSF),唾液,粘液,痰液,汗液,尿液,或者任意其他的分泌物,排泄物,或者其他的体液。一个“样本”可以包括一种单个的细胞或者多个细胞或者细胞的片段。所述的样本同样可以是一种组织样本。所述的样本可以是一种流动的内皮细胞或者是一个流动的肿瘤细胞,或者所述的样本中可以含有一种流动的内皮细胞或者含有一个流动的肿瘤细胞。所述的样本包括一种原发性的肿瘤细胞,原发性肿瘤,复发性的肿瘤细胞,或者转移性的肿瘤细胞。“敏感度”是由真阳性(TP)/(真阳性+假阴性)计算得到的,或者是通过所述的疾病宿主所具有的真阳性比例计算得到的。“特异性”是由真阴性(TN)/(真阴性+假阳性)计算得到的,或者是通过所述的非疾病宿主或者正常宿主所具有的真阴性比例计算得到的。“统计学显著的”指的是所述的变化要比可能预期到的仅仅在偶然情况下发生的情况(其可能是一种“假阳性”)具有更高的程度。统计学显著性是可以通过本领域中已知的任何方法来确定的。普遍被使用的显著性的测量值包括所述的P值,其中所述的P值代表的是假定一个数据点仅仅是由偶然的原因所产生的结果,获得一个至少像所述给定的数据点一样极端的结果所具有的概率。如果所述的P值为0.05或者更小,则认为所述的结果是具有高度的显著性的。优选的,所述的P值为0.04,0.03,0.02,0.01,0.005,0.001或者更小。在本发明的上下文中,“宿主”优选是一种哺乳动物。所述的哺乳动物可以是人类,非人类的灵长动物,小鼠,大鼠,狗,猫,马,或者牛,但是并不局限于这些例子。除了人类之外的哺乳动物可以被有利的用来作为代表癌症动物模型的宿主。宿主可以是雄性的或者是雌性的。“ΤΝ”指的是真阴性,当其被用在一种疾病状态的测试中时,意味着对未患有疾病的宿主或者正常的宿主进行了正确的分类。“TP”指的是真阳性,当其被用在一种疾病状态的测试中时,意味着对患有疾病的宿主进行了正确的分类。“传统实验室危险因素”对应着从宿主样本中分离出来的生物标记物或者从宿主样本中得到的生物标记物,并且已经在所述的临床实验室中对这些生物标记物进行了普遍的评价,并且在传统性的全球危险评价运算法则中对它们进行了使用。针对肿瘤复发的传统实验室危险因素包括例如增殖指数,肿瘤浸润淋巴细胞。针对肿瘤复发的其他传统实验室危险因素对于本领域技术人员而言是已知的。本发明的方法及其用途在本发明中所公开的方法是针对这样的宿主进行使用的,所述的宿主正在接受针对一种头颈癌所进行的治疗方案和/或治疗方法,所述的宿主存在发展成为一种复发性的头颈癌的危险,并且所述的宿主已经被诊断为患有头颈癌并且本发明中所述的方法可以被用来为宿主进行治疗方案的监测或者筛选,其中所述的宿主患有一种头颈癌,以及被用来对预测的宿主存活能力和/或存活时间进行评价,其中所述的宿主被诊断为患有头颈癌。治疗方案包括例如但不局限于诱导疗法或者同步疗法,以及上述疗法的组合。一个细胞对DNA损伤试剂所具有的应答能力(例如,抗性或者敏感度)是通过下述方式来确定的,其中所述的DNA损伤试剂例如是一种化学治疗试剂或者致电离辐射对存在于一种测试样本(例如,一种来源于宿主的样本)中的一种有效剂量的头颈癌标记物(HNCMARKER)蛋白质、核酸、多形体、代谢产物、以及其他的分析物(其可能是两种或者更多种)进行测量,并且将所述的有效剂量与参考值或者指数值进行比较,通常利用数学运算法则或者公式,其目的在于将来自于多个单个的头颈癌标记物(HNCMARKERS)的结果的信息以及来自于非分析物的临床参数的信息进行组合,使其成为一个单一的测量值或者指数。所述的细胞例如是一个癌症细胞。任选的,所述的癌症是一种头颈癌,例如是下述部位的癌症鼻腔,鼻窦,嘴唇,口,唾液腺,咽,或者喉[voicebox]。所述的头颈癌标记物(HNCMARKER)是例如,着色性干皮病D组蛋白(XPF),范科尼贫血互补组D2(FANCD2),膦-有丝分裂原活化的蛋白激酶活化的蛋白激酶2(pMK2),聚二磷酸腺苷核糖(PAR),错配修复蛋白1(MLHl),聚二磷酸腺苷核糖聚合酶I(PARPl),磷酸化H2AX(pH2AX),磷酸化热休克蛋白27(pHSP27),乳腺癌易感基因1(BRCAl),RAD51,核苷酸切除修复交叉互补组1(ERCCl),p53,pl6,人类乳头瘤病毒(HPV)。抗性指的是一个细胞在应答一种试剂方面所表现出的失效。例如,对一种化学治疗性药物或者致电离辐射具有抗性意味着所述的细胞没有被所述的药物进行损伤或者杀伤。敏感度指的是所述的细胞对一种试剂产生了应答。例如,对一种化学治疗性药物或者辐射具有敏感度意味着所述的细胞能够被所述的药物进行损伤或者杀伤。例如,一个细胞对一种化学治疗试剂或者致电离辐射所具有的应答能力是通过下述方式来识别的对在一种或者多种头颈癌标记物(HNCMARKERS)的表达或者活性方面的降低进行识别。所述的头颈癌标记物(HNCMARKER)的缺乏现象的出现意味着所述的细胞对于一种化学治疗试剂或者致电离辐射而言是敏感的。然而,所述的缺乏现象的不存在则意味着所述的细胞对于一种化学治疗试剂或者致电离辐射而言是具有抗性的。本发明中所述的方法能够有效的用于对宿主的头颈癌进行治疗,对宿主的头颈癌所具有的症状进行缓解,对宿主的头颈癌的恶化情况进行监测,或者对宿主的头颈癌的发作进行延迟。优选的,本发明中所述的方法被用来对宿主进行识别和/或诊断,其中所述的宿主对于一种头颈癌的复发而言是无症状的。“无症状”意味着并不能够表现出所述的传统症状。本发明中所述的方法同样可以被用来对宿主进行识别和/或诊断,其中所述的宿主已经具有较高的发展成为一种头颈癌的危险,或者仅仅是基于所述的传统危险因素而言的。一种有效剂量的头颈癌标记物(HNCMARKER)蛋白质、核酸或者代谢产物所进行的表达同样可以允许被用来进行下述的测定,测定宿主将是否能够从一个具有特定过程的治疗方案中获得益处。在这个方法中,在宿主接受针对头颈癌的治疗之前,从宿主中提供一种生物学样本,其中所述的治疗例如是化学治疗或者同步的化学放射性疗法。“获得益处”意味着所述的宿主将能够对所述的治疗过程产生应答。应答意味着所述的治疗方案能够对宿主所患有的头颈癌所具有的尺寸、流行程度、或者转移的可能性进行减小。当以预防的目的对所述的治疗方案进行应用时,“应答”意味着所述的治疗延迟了或者阻止了一种头颈癌的形成或者一种头颈癌的复发,避免了临床性头颈癌的形成,或者延迟了、阻止了、或缓解了临床性头颈癌所具有的症状。可以使用标准的临床方案对头颈癌进行评估。一种有效剂量的头颈癌标记物(HNCMARKER)蛋白质、核酸或者代谢产物所进行的表达同样可以允许被用来对针对头颈癌的治疗过程进行监测。在这个方法中,在宿主接受针对头颈癌的治疗之前,从宿主中提供一种生物学样本,其中所述的治疗例如是化学治疗或者同步的化学放射性疗法的治疗。如果期望,可以在各种不同的时间点处从所述的宿主中获得生物学样本,其中所述的时间点可以在治疗之前,治疗的过程中或者治疗之后。之后,对一种有效剂量的头颈癌标记物(HNCMARKER)蛋白质、核酸或者代谢产物所进行的表达进行测定并且将其与一种参考值或者指数值进行比较并且在此之后进行识别,其中所述的参考值例如是一种对照的个体或者群体,所述的个体或者群体所具有的头颈癌的状况是已知的。所述的参考样本或者指数值可以从一个或者多个个体中获取,或者从一个或多个个体中得到,其中所述的个体已经接受了所述的治疗。可供选择的,所述的参考样本或者指数值可以从一个或者多个个体中获取,或者从一个或多个个体中得到,其中所述的个体尚未接受过所述的治疗。例如,可以从这样的宿主中收集样本,所述的宿主已经接受过针对头颈癌障碍的初始治疗以及随后的针对糖尿病的治疗,用以对所述的治疗的进展进行监测。一个参考值可以与来自于群体研究中的数量或者数值有关,包括但不局限于,这样的宿主,所述的宿主具有相同的癌症,所述的宿主具有相同或者相似的年龄范围,所述的宿主具有相同或者相似的种族集团,所述的宿主具有癌症的家族历史,或者所述的参考值可以与来自于宿主的起始样本有关,其中所述的宿主正在接受针对癌症所进行的治疗。这样的参考值可以从对群体进行的统计分析和/或群体的危险预测数据中得到,其中所述的统计分析和/或群体的危险预测数据是通过数学的运算法则以及对癌症复发的计算机计算得到的指数中获得的。同样可以对参考的头颈癌标记物(HNCMARKER)指数进行构建以及使用,其中所述的构建以及使用是利用了运算法则以及统计学分类和结构分类中的其他方法。在本发明的一种实施方式中,所述的参考值指的是存在于一种对照样本之中的所述的头颈癌标记物(HNCMARKERQ所具有的剂量,其中所述的对照样本来自于一个或者多个宿主,所述的宿主能够对针对头颈癌的化学疗法产生应答。在本发明的另外一种实施方式中,所述的参考值指的是存在于一种对照样本之中的所述的头颈癌标记物(HNCMARKERS)所具有的剂量,其中所述的对照样本来自于一个或者多个宿主,所述的宿主对于头颈癌而言具有较高的不发生疾病的比率或者较高的整体存活率。在本发明的其他实施方式中,所述的参考值指的是存在于一种对照样本之中的所述的头颈癌标记物(HNCMARKERQ所具有的剂量,其中所述的对照样本来自于一个或者多个宿主,所述的宿主不存在形成头颈癌复发的危险或者存在低的形成头颈癌复发的危险。在一个进一步的实施方式中,在经过这样的测试之后,在一个诊断学上相应的时间段内对这样的宿主进行监测和/或周期性的重复测试(“纵向研究”),用以验证一种头颈癌的持续性的不存在(没有疾病或者整体存活)。这样的时间段可以是一年,两年,两年至五年之间,五年,五年至十年之间,十年,或者十年至更多年之间,其中所述的时间是从为了确定所述的参考值而进行的初始测试的日期开始计算的。此外,在建立这些参考值时,可以对存在于被适当堆积的历史性的宿主样本中的头颈癌标记物(HNCMARKERS)进行追溯性的测量,因此可以缩短所述的研究所需要的时间。一种参考值同样可以包括来自于宿主的所述的头颈癌标记物(HNCMARKERQ所具有的剂量,其中所述的宿主表现出在危险因素方面的改善,这是针对所述的癌症所进行的治疗方案和/或治疗方法所产生的结果。一种参考值同样可以包括来自于宿主的所述的头颈癌标记物(HNCMARKERQ所具有的剂量,其中所述的宿主表现出了在针对治疗所具有的应答能力方面的提高,这种提高是针对所述癌症的治疗方案和/或治疗方法所产生的结果。一种参考值同样可以包括来自于宿主的所述的头颈癌标记物(HNCMARKERQ所具有的剂量,其中所述的宿主具有较高的不发生疾病的比率/整体存活率,或者具有高的发展成为头颈癌的危险,或者已经患有头颈癌。在另外一种实施方式中,所述的参考值是一个指数值或者是一个基线值。一种指数值或者基线值指的是一种有效剂量的头颈癌标记物(HNCMARKERS)的综合样本,其中所述的头颈癌标记物(HNCMARKERQ来自于一个或者多个宿主,所述的宿主并不存在头颈癌或者所述的宿主对于头颈癌而言是无症状的。一种基线值同样可以包括来自于宿主的样本中所述的头颈癌标记物(HNCMARKERQ所具有的剂量,其中所述的宿主表现出在针对治疗所产生的头颈癌应答能力方面的改善,或者是不发生疾病的比率/整体存活比率方面的改善,这是针对所述的癌症所进行的治疗方案和/或治疗方法所产生的结果。在这种实施方式中,为了与所述的来自于宿主的样本进行比较,采用类似的方法对所述的头颈癌标记物(HNCMARKERS)所具有的剂量进行计算并且将其与所述的指数值进行比较。任选的,对这样的宿主进行选择,所述的宿主被识别出患有头颈癌,或者具有发展成为头颈癌的增加的危险,使所述的宿主接受一种治疗方案,从而对所述的癌症的恶化进行减慢,或者对所述的发展成为一种头颈癌的危险进行降低或者阻止。可以通过下述方式,对所述的头颈癌的恶化或者一种癌症治疗方案所具有的有效性进行监测,所述的方式是在一段时间内,对来自于一个宿主的样本中的有效剂量的头颈癌标记物(HNCMARKER)(其可以是两种或者多种)进行探测并且将所探测到的所述的头颈癌标记物(HNCMARKERQ的剂量进行比较。例如,可以在所述的宿主接受治疗之前获得第一个样本,并且在所述的宿主接受治疗之后或者在治疗的过程中获取一个或者多个随后的样本。如果随着时间的过去所述的头颈癌标记物(HNCMARKER)所具有的剂量相对于所述的参考值而言发生了变化,则认为所述的癌症发生了恶化(或者,可供选择的,所述的治疗并没有对恶化进行阻止),而如果所述的头颈癌标记物(HNCMARKERQ所具有的剂量随着时间的过去仍然保持恒定,则所述的癌症并没有发生恶化(相对于所述的参考群体而言,或者相对于在本发明中所使用的“恒定”而言)。当被用在本发明的上下文中时,所述的术语“恒定”被解释为包括随着时间的过去伴随着所述的参考值所发生的变化。除此之外,可以通过下述方式对适合向一个特定的宿主进行施用的治疗性试剂或者预防性试剂进行识别对存在于一种样本之中的有效剂量的一种或者多种头颈癌标记物(HNCMARKERS)(其可以是两种或者更多种)进行探测,其中所述的样本来自于一个宿主,将所述的来自于宿主的样本暴露在一种受试化合物之下,并且测定存在于所述的来自于宿主的样本之中的所述头颈癌标记物(HNCMARKERQ所具有的剂量(其可以是两种或者更多种)。因此,可以根据存在于样本之中的所述头颈癌标记物(HNCMARKERQ所具有的剂量并且将其与一种参考值进行比较的方式,对适合在宿主中使用的处理方案或者治疗方案进行筛选,其中所述的样本来自于所述的宿主,所述的宿主患有一种癌症,或者所述的宿主对于治疗而言是没有应答能力的或者所述的宿主具有较低的不发生疾病的比率/整体存活比率。可以对两种或者多种处理方案或者治疗方案进行平行的评价,从而确定哪一种处理方案或者治疗方案在对宿主进行使用时应当是最为有效的,用以延缓所述癌症的发作,或者减慢所述癌症的恶化。本发明进一步提供了一种用于对标记物的表达变化进行筛选的方法,其中所述的标记物的表达与头颈癌有关,所述的方法通过下述方式来实现对存在于一种来自于宿主的样本中的所述的一种或者多种头颈癌标记物(HNCMARKERQ进行测定,将其与存在于一种参考样本中的所述头颈癌标记物(HNCMARKERQ所具有的剂量进行比较,并且对与所述的参考样本相比而言在所述的宿主样本中发生的剂量的变化进行识别。如果所述的参考样本,例如是一种对照样本,来自于一个没有患有头颈癌的宿主,来自于对于一种治疗性化合物或者辐射而言具有敏感度的细胞,或者如果所述的参考样本反映出的数值与这样的一个人相关,所述的人具有对所述的治疗产生应答能力的高度可能性,具有低的形成复发的危险或者具有较高的不发生疾病的比率/整体存活率,则存在于所述的测试样本以及所述的参考样本之中的头颈癌标记物(HNCMARKER)所具有的剂量上的相似性表明着所述的治疗是有效的。然而,存在于所述的测试样本以及所述的参考样本之中的头颈癌标记物(HNCMARKER)所具有的剂量上的差异表明着这是一种不太适合的临床结果或者预后。相反的,如果所述的参考样本,例如是一种对照样本,是来自于对于一种治疗性化合物或者辐射而言具有抗性的细胞,或者如果所述的参考样本反映出的数值与这样的一个人相关,所述的人具有对所述的治疗不产生应答能力的高度可能性,具有高的形成复发的危险或者具有较低的不发生疾病的比率/整体存活率,那么存在于所述的测试样本以及所述的参考样本之中的头颈癌标记物(HNCMARKER)所具有的剂量上的相似性表明着所述的利用这种化合物所进行的治疗将能够产生一种不太适合的临床结果或者预后。然而,存在于所述的测试样本以及所述的参考样本之中的头颈癌标记物(HNCMARKER)所具有的剂量上的变化则意味着利用这种治疗性化合物所进行的治疗将会是有效的。“有效的”意味着所述的治疗导致了在一种头颈癌标记物(HNCMARKER)蛋白质、核酸、多形体、代谢产物、或者其他分析物所具有的剂量或者活性方面的降低。可以使用标准的临床方案来实现对本发明所公开的危险因素的评价。可以与用于对头颈癌进行诊断、识别、或者治疗的任何已知的方法联合起来,对有效性进行确定。本发明同样包括一种带有探测性试剂的试剂盒,其中所述的探测性试剂能够与两种或者多种所述的头颈癌标记物(HNCMARKERQ蛋白质、核酸、多形体、代谢产物、或者其他的分析物进行结合。本发明中同样提供的是一种探测性试剂的阵列,其中所述的探测性试剂是例如抗体和/或寡核苷酸,其中所述的抗体和/或寡核苷酸能够分别与两种或者多种头颈癌标记物(HNCMARKER)蛋白质或者核酸进行结合。本发明中同样提供的是一种用于对一个或者多个宿主进行治疗的方法,所述的宿主在头颈癌方面对治疗不产生应答能力或者具有较低的不发生疾病的比率/整体存活率,所述的方法是通过下述方式来实现的对存在于一个样本中的有效剂量的所述头颈癌标记物(HNCMARKERQ是否存在剂量上的改变进行探测,其中所述的样本来自于所述的一个或者多个宿主;并且利用一种或者多种癌症调节药物对所述的一个或者多个宿主进行治疗,直至所述的头颈癌标记物(HNCMARKERS)的剂量的改变或者活性的改变恢复至一种基线值,其中所述的基线值是在一个或者多个宿主中测量得到的,所述的宿主在对治疗所产生的应答能力方面存在提高或者具有较高的不发生疾病的比率/整体存活率。本发明中同样提供的是一种对宿主所具有的针对治疗所产生的应答能力方面的变化或者在不发生疾病的比率/整体存活率方面的变化进行评价的方法,其中所述的宿主被诊断为患有癌症,所述的方法是通过下述的方式来实现的对存在于第一个样本之中的所述头颈癌标记物(HNCMARKERS)(其可以是两种或者是更多种)的有效剂量进行探测,其中所述的第一个样本是在第一个时间段内来自于所述宿主的,对存在于第二个样本之中的所述头颈癌标记物(HNCMARKERQ的剂量进行探测,其中所述的第二个样本是在第二个时间段内来自于所述宿主的,并且将在上述的第一个时间段以及第二个时间段内探测到的所述头颈癌标记物(HNCMARKERQ的剂量进行比较。本发明的诊断指示、预测指示以及预后指示可以对存在于一种测试样本中的所述的头颈癌标记物(HNCMARKER)蛋白质、核酸、多形体、代谢产物、或者其他的分析物所具有的剂量进行测量,并且将其与所述的“正常的对照水平”进行比较,利用诸如引用极限,判定极限,或者危险定义阈值这样的技术,从而对截止点以及异常值进行定义。这样的正常的对照水平以及截止点可能存在变化,这取决于头颈癌标记物(HNCMARKER)是否是单独进行使用的,还是在一个公式中与其他的头颈癌标记物(HNCMARKERQ进行组合成为一个指数。可供选择的,所述的正常的对照水平可以是一个头颈癌标记物(HNCMARKER)类型的数据库,其中所述的类型来自于先前接受过测试的宿主,所述的宿主在经过一段临床学上相关的时间范围之后对化学疗法(例如,诱导化学疗法,同步化学放射性疗法,或者两者并存的放射性疗法)产生了应答。本发明可以被用来针对对化学疗法所产生的应答或者癌症的存活率进行连续性的测量或者分类的测量,并且因此对一种类型的宿主所具有的危险谱进行诊断以及定义,其中所述的这种类型的宿主被定义为具有不对化学疗法产生应答的危险。在进行所述的分类测量的情况中,本发明可以被用来在治疗应答组与治疗无应答组之间进行判定。在其他的实施方式中,可以对本发明进行使用,从而对那些具有提高的存活可能性的宿主进行判定。这种不同的用途可能需要不同的头颈癌标记物(HNCMARKER)的组合以及有各自特点的小组,数学运算法则,和/或截止点,但是可以被进行相同的上述提及的测量,其中所述的测量针对的是对于各自的指定用途而言所具有的准确率以及性能度量体系。对那些将能够对治疗产生应答能力的宿主所进行的识别使得能够对各种不同的治疗性干预或者治疗方案进行筛选以及激发,其目的在于增加所述个体的存活可能性。一种头颈癌标记物(HNCMARKER)蛋白质、核酸、多形体、代谢产物、或者其他的分析物所具有的有效剂量的水平同样能够允许对所述的治疗过程进行监测,其中所述的治疗是针对转移性疾病或者转移性事件而进行的。在这个方法中,可以从一个宿主中获得一种生物学样本,其中所述的宿主正在接受针对癌症的治疗方案,例如,药物的治疗。如果期望的话,生物样本是在各种不同的时间点处从所述的宿主处获得的,其中所述的时间点是在治疗之前、治疗的过程中、或者治疗之后。在某些实施方式中,本发明中所述的方法能够对一位被诊断为头颈癌的宿主所具有的存活能力和/或存活时间进行预测,其中所述的宿主被预测为能够存活3个月,6个月,12个月,1年,2年,3年,4年,5年,6年,7年,8年,9年,10年,15年,20年,30年,40年,或者50年,上述时间是从所述的诊断日期开始计算的,或者是从开始进行针对头颈癌治疗的治疗方案开始计算的。由于所述的头颈癌标记物(HNCMARKER)在其功能上而言是被活化的,通过对其功能进行阐明,可以利用试剂和/或药物对具有高水平的头颈癌标记物(HNCMARKER)的宿主进行处理,其中所述的试剂和/或药物能够优先的作用于这样的途径。本发明同样可以被用来在任何不同的环境中对患者或者宿主的群体进行筛选。例如,一个健康维护组织,公共卫生单位或者学校健康计划可以对一组宿主进行筛选,从而按照上文中所描述的方法对他们中需要进行干预的那部分进行识别,或者用于收集所述的流行病学数据。保险公司(例如,健康保险,人寿保险或者残疾保险)可以在确定所述的保险范围或者定价的过程中对申请者进行筛选,或者对现有的客户所需要进行的可能的干预进行筛选。对从这样的群体中收集到的数据进行筛选,特别是当所述的数据与任何的临床病症例如癌症或者癌症的重新出现相关联时,这对于例如健康维护组织、公共健康计划以及保险公司的运作而言将是有价值的。这样的数据阵列或者数据收集可以被存储在计算机可读形式的介质之中并且在许多的与健康相关的数据管理系统中对其进行使用,从而提供改进的卫生保健服务,成本有效的卫生保健,改进的保险运作,等等。参见,例如,美国专利申itNo.2002/0038227;美国专利申请No.2004/0122296;美国专利申请No.2004/0122297;以及美国专利No.5018067。这样的系统能够直接从内部数据存储中对所述的数据进行存取,或者从一个或者多个数据存储站点中对所述的数据进行远程的存取,这将在本发明中进行进一步的详细描述。每一种程序都可以以一种高水平的程序性语言或者面向对象的程序设计语言来进行执行,从而使其能够与一种计算机系统进行交流。然而,如果期望的话,可以通过汇编语言或者计算机语言对所述的程序进行执行。所述的语言可以是一种经过编译的语言或者经过翻译的语言。每一种这样的计算机程序可以被存储在一个存储介质或者存储设备之上(例如,只读内存(ROM)或者磁性软盘或者在本公开物的其他内容中所定义的那些其他介质或者设备),其中所述的存储介质或者存储设备可以利用一种具有一般性目的或者特34殊性目的的可编程的计算机来进行阅读,当所述的存储介质或者存储设备被所述的计算机进行阅读用以完成本发明中所描述的操作程序时,其能够对所述的计算机进行配置以及运行。本发明中所述的健康相关数据管理系统同样可以被用来作为一种计算机可读形式的存储介质来进行执行,利用一种计算机程序对其进行配置,其中被进行了这样的配置的所述的存储介质能够引发计算机以一种特定的方式或者预先定义的方式来进行运行,从而实现在本发明中所描述的各种不同的功能。在此之后,可以对一种有效剂量的头颈癌标记物(HNCMARKER)蛋白质、核酸、多形体、代谢产物、或者其他分析物的水平进行测定并且将其与一种参考值或者指数值或者基线值进行比较,其中所述的参考值是例如一个对照的宿主或者群体,所述的宿主或者群体所具有的治疗应答能力是已知的。所述的参考样本或者指数值或者基线值可以从一个或者多个宿主处获取或者获得,其中所述的宿主已经接受过所述的治疗,或者可以从一个或者多个宿主处获取或者获得,其中所述的宿主具有幸免于癌症的低的危险,或者可以从这样的宿主处获取或者获得,其中所述的宿主已经表现出进展,这种进展是一种接受治疗的结果。可供选择的,所述的参考样本或者指数值或者基线值可以从一个或者多个宿主处获取或者获得,其中所述的宿主并没有接受过治疗。例如,样本可以从这样的宿主处进行收集,所述的宿主已经接受过针对癌症所进行的初始治疗以及随后的针对癌症或者转移性事件所进行的治疗,用以对所述的治疗所取得的进展进行监测。一种参考值同样能够包括这样的值,所述的值来自于危险预测运算法则或者计算机计算得到的指数,例如在本发明中所公开的那些,这些运算法则或者指数是来自于群体研究的。本发明中所述的头颈癌标记物(HNCMARKERS)因此可以被用来生成一种宿主的“参考头颈癌标记物(HNCMARKER)曲线”,其中所述的宿主被认为能够对癌症的治疗产生应答或者被认为不能够对癌症的治疗产生应答。本发明中公开的所述头颈癌标记物(HNCMARKERS)同样可以被用来生成一种“宿主的头颈癌标记物(HNCMARKER)曲线”,其中所述的曲线来自于这样的宿主,所述的宿主对癌症的治疗具有应答能力。可以将所述的宿主头颈癌标记物(HNCMARKER)曲线与一种参考头颈癌标记物(HNCMARKER)曲线进行比较,从而对存在发展成为化学疗法抗性的危险的宿主进行诊断或者识别,用以对所述疾病的恶化情况进行监测,以及对所述疾病所具有的恶化速率进行监测,并且对所述的治疗形式所具有的有效性进行监测。本发明中所述的参考头颈癌标记物(HNCMARKER)曲线以及宿主头颈癌标记物(HNCMARKER)曲线可以被容纳在一种计算机可读形式的介质中,所述的介质是例如但不局限于,模拟磁带,其中,像那些能够被一种盒式磁带录像机(VCR)、只读光盘(CD-ROM)、数字视盘(DVD-ROM)、通用串行总线(USB)闪存进行阅读的介质。这样的计算机可读形式的介质中同样可以容纳其他的测试结果,例如,但不局限于,对临床参数以及传统实验室危险因素的测量。可供选择的或者除此之外的,所述的计算机可读形式的介质中同样可以包括宿主信息,例如病历以及任何相关的家族历史。所述的计算机可读形式的介质中同样可以容纳与其他的疾病危险运算法则以及计算机计算得到的指数相关的信息,例如那些在本发明中所描述的。宿主在所述的遗传组成方面所存在的差异能够导致他们在代谢各种不同的药物方面所具有的相对能力上的差异,这种代谢药物的能力能够对癌症或者转移性事件所具有的症状或者危险因素进行调节。患有癌症的宿主、或者具有发展成为癌症或者转移性事件的危险的宿主可以在年龄、种族、以及其他的参数方面存在变化。因此,本发明中公开的所述头颈癌标记物(HNCMARKERS)的使用,无论是单独使用还是与药物代谢方面已知的遗传因素共同进行组合使用,使得存在一种具有预先确定的水平的可预测性,使需要在一个被选定的宿主体内进行测试的一种推定的治疗剂或者预防剂将能够适合于对所述的宿主进行治疗或者预防,其中所述的治疗或者预防针对的是一种癌症。为了对那些能够适合于一个具体宿主的治疗剂或者药物进行识别,同样可以将一个来自于所述宿主的测试样本暴露于一种治疗试剂或药物、或者放射物之中,并且对所述的一种或者多种头颈癌标记物(HNCMARKER)蛋白质、核酸、多形体、代谢产物或者其他的分析物所具有的水平进行测定。可以将所述的一种或者多种头颈癌标记物(HNCMARKERS)所具有的水平与来自于所述宿主的样本进行比较,其中所述的样本是在接受治疗之前以及接受治疗之后获得的,或者所述的样本是在被暴露于一种治疗剂或者药物之前以及被暴露于一种治疗剂或者药物之后获得的,或者可以将所述的一种或者多种头颈癌标记物(HNCMARKER)所具有的水平与来自于一个或者多个宿主的样本进行比较,其中所述的宿主在危险因素(例如,临床参数或者传统实验室危险因素)方面已经表现出了改善,这种改善是这样的治疗或者暴露所产生的结果。可以在存在有一种候选试剂的条件下对一个宿主细胞(即,一个从宿主中分离得到的细胞)进行培养,并且对存在于所述的测试样本中的所述头颈癌标记物(HNCMARKER)的表达类型进行测量并且将其与一种参考曲线或者一种指数值或者基线值进行比较,其中所述的参考曲线是例如,一种转移性疾病参考表达曲线或者非疾病参考表达曲线。所述的测试试剂可以是任何的化合物或者组合物或者两者的混合物,包括,膳食补充剂。例如,所述的测试试剂是那些被频繁的用于癌症治疗方案中的试剂以及在本发明中所描述的试剂。前述提及的本发明所述的方法可以被用来对宿主的恶化和/或改善进行评价或者监测,其中所述的宿主已经被诊断为患有一种癌症,并且所述的宿主已经接受了外科手术的干预。本发明的性能测量以及准确度测量按照上文中所记载的,可以通过多种方式对本发明所具有的性能以及因此所产生的绝对临床有效性以及相对临床有效性进行评价。在这些对所述的性能进行的各种不同的评价方法中,本发明意在提供在临床诊断以及预后方面所具有的准确率。一种诊断性、预测性或者预后性的测试、检测、或者方法所具有的准确率关系到所述的测试、检测、或者方法在辨别宿主的方面所具有的能力,其中所述的需要辨别的宿主是对化学疗法的治疗具有应答能力的宿主以及那些不具备应答能力的宿主,这种辨别是以下述为基础的所述的宿主是否具有“有效剂量”的头颈癌标记物(HNCMARKER),或者是否在所述的头颈癌标记物(HNCMARKER)的水平上发生了“显著性的改变”。“有效剂量”或者“显著性的改变”意味着适合数量的头颈癌标记物(HNCMARKERS)(其可以是一种或者是更多种)的测量值与针对该头颈癌标记物(HNCMARKER(Q)的预先确定的截止点(或者阈值)之间存在差异并且因此表明所述的宿主对疗法具备应答能力/是不存在疾病的/整体而言能够存活,其中在上述情况中所述的头颈癌标记物(HNCMARKER(Q)是一种决定性因素。存在于正常与异常的所述的头颈癌标记物(HNCMARKER)的水平之间的差异优选的是具有统计学显著性的。正如将在下文中进行记载的,并且并不构成对本发明的任何限制,达到统计学显著性,并且因此而被优选的分析准确率以及临床准确率,一般而言但不总是需要将几种头颈癌标记物(HNCMARKERS)的组合共同用于小组中并且将其与数学运算法则进行结合,其目的在于获得一个具有统计学显著性的头颈癌标记物(HNCMARKER)指数。在对一种疾病状态进行类别诊断时,一项测试(或者检测)的分割点或者阈值的改变通常会改变所述的敏感度以及特异性,但是是以一种相反的定性关系来进行改变的。因此,在对一种被提议的用以对宿主的情况进行评价的医学测试、检测、或者方法所具有的准确率以及有效性进行评价的时候,应当总是同时将敏感度以及特异性纳入考虑范围,并且注意到在对所述的敏感度以及特异性进行报告时当时所述的分割点为多少,因为敏感度以及特异性可能在一定的分割点的范围内存在显著性的变化。对于使用本发明的大部分分类的危险测量而言,统计学方法的使用是优选的,其中所述的统计学方法例如是曲线下面积(AUC),其涵盖了所有可能的分割点值,而对于连续性的危险测量而言,拟合度的统计学方法以及对观察到的结果所进行的校验或者其他的金标准是优选的。使用了这样的统计学方法,“可接受程度的诊断准确率”在本发明中被定义为对一种测试或者检测(例如是本发明中所述的测试,用以确定所述的头颈癌标记物(HNCMARKERS)的临床显著性是否存在)所具有的AUC(对于所述的测试或者检测而言,存在于所述的接受者操作特性曲线之下的面积)为至少0.60,期望的为至少0.65,更加期望的为至少0.70,优选的为至少0.75,更加优选的为至少0.80,并且最为优选的为至少0.85。“非常高程度的诊断准确率”意味着在一项测试或者检测中,所述的AUC(对于所述的测试或者检测而言,存在于所述的接受者操作特性曲线之下的面积)为至少0.80,期望的为至少0.85,更加期望的为至少0.875,优选的为至少0.90,更加优选的为至少0.925,并且最为优选的为至少0.95。对于任何一项测试而言,所述测试的预测值取决于所述的测试所具有的敏感度以及特异性,并且取决于所述的病症在接受测试的所述群体中的普遍程度。这种想法是以贝叶斯定理为依据,假定被进行筛选的所述病症在一个个体中或者在所述的群体中存在的可能性越大(测试前的概率),一种阳性测试所具有的有效性越高,并且所述的结果是一种真阳性的可能性就越大。因此,当一个任意的群体中存在所述的病症的可能性小时,在这个群体中使用一项测试所产生的问题是一种阳性的结果具有有限的价值(即,更为可能是一种假阳性)。与之相类似的,在具有非常高的危险的群体中,一种阴性的测试结果更为可能是一种假阴性。作为结果,在具有低的疾病普遍性的受试群体中(被定义为每年具有低于的发生率(发病率)的群体,或者在一段特定的时间范围内具有低于10%的累积普遍性的群体),关于测试所具有的临床可利用率方面,接受者操作特性曲线(ROC)以及曲线下面积(AUC)可能是容易令人误解的。可供选择的,在本公开物的其他内容中定义的绝对危险以及相对危险比例可以被用来确定所述的临床可利用率的程度。用于进行测试的宿主群体可以被分类为四分位数,所述的分类是通过所述的测试测量值来进行的,其中所述的顶端的四分位数(占所述群体中的25%)包括这样的宿主组,所述的宿主具有存在治疗无应答能力的最高的相对危险性,而所述的底端的四分位数包括这样的宿主组,所述的宿主具有存在治疗无应答能力的最低的相对危险性。一般而言,在一个具有低普遍性的群体之中,当来自于测试或者检测中的从顶端四分位数至底端四分位数的相对危险数值超过2.5倍时,我们认为其具有“高程度的诊断准确率”,并且那些对每一个四分位数而言所述的相对危险在五倍至七倍之间的,我们认为其具有“非常高度的诊断准确率”。虽然如此,当来自于测试或者检测中的每一个四分位数的相对危险数值仅仅为1.2倍至1.5倍时,其仍然具有临床意义上的有效性,能够被广泛的用来作为一种疾病的危险因素;这对于总胆固醇以及许多炎性生物标记物在它们对未来事件所进行的预测而言是常见的事情。通常情况下,这样的具有较低的诊断准确率的测试必须要与其他的参数进行结合,其目的在于得到有意义的临床阈值用以进行治疗性的干预,正如利用前述提及的全球性危险评价指数来完成的。一个健康经济利用率函数是另外一种方式,用于测量一种给定的测试所具有的性能以及临床价值,所述的方式是通过对所述的可能的分类测试结果进行加权处理来构成的,这种加权处理依据的是对每一种结果的临床价值以及经济价值所进行的实际测量。健康经济性能与准确率紧密相关,因为健康经济利用率函数能够为对受试宿主的正确分类所产生的利益指定一个经济学价值,并且能够为对受试宿主的错误分类所产生的成本指定一个经济学价值。作为一种性能的测量,需要一种能够达到一定的性能水平的测试并非不寻常的,其中所述的性能水平使得能够在每一次测试中产生一次在健康经济价值上的增加(在测试成本之前),使之超过所述的测试的目标价格。—般而言,在下述情况中,用于测定诊断准确率的可供选择的方法普遍被用来进行连续性的测量当一种疾病的类型或者危险的类型还没有被明确的定义出来的时候,其中所述的定义是通过相关的医学学会以及医学实践来完成的,当治疗性用途的阈值还没有被确立出来的时候,或者当目前还没有已有的金标准用来对所述的未疾病(pre-disease)进行诊断的时候。为了对危险进行连续性的测量,对于一种经过计算得到的指数而言,对诊断准确率的测量一般而言是基于曲线拟合以及在所述的经过预测的连续值与实际观察值(或者是一个历史指数计算得到的值)之间所进行的校验并且利用诸如下述的测量值R平方值,Hosmer-Lemeshow拟合度校验P值统计学方法以及置信区间。使用这样的被报道的运算法则以一种历史观察组的预测为依据对于所预测的值而言并非不寻常的,其中所述的运算法则包括置信区间(一般而言是90%或者95%的置信区间(Cl)),正如被GenomicHealth,Inc(红杉市,加利福尼亚)商业化的用于对未来的乳腺一般而言,通过对所述的诊断准确率所具有的程度进行定义,即,存在于一条接受者操作特性曲线(ROC)曲线上的分割点,对一种可接受的曲线下面积(AUC)值进行定义,以及通过对构成本发明中的有效剂量的所述头颈癌标记物(HNCMARKERS)的相对浓度的可接受范围的确定,可以使得本领域技术人员利用所述的头颈癌标记物(HNCMARKERQ对宿主进行识别,诊断,或者预后,其中所述的识别、诊断、或者预后是在具有一种预先确定的水平的可预测性以及性能的条件下完成的。临床运算法则的构建可以使用任何的公式对头颈癌标记物(HNCMARKER)的结果进行结合从而得到能够有效的用于进行本发明的实践的指数。正如在上文中所指示出的,并且并不局限于此,除了所述的各种不同的其他的指标之外,这样的指数能够对针对化学疗法或者化学放射性疗法所产生的应答方面所进行的转化所具有的概率、可能性、绝对危险或者相对危险进行指示。这可以针对的是在一段特定的时间段内或者时间范围内,或者针对剩余的终生危险,或者简单的作为一种指数被提供,其中所述的指数与另外一个参考宿主群体有关。尽管在此描述了各种不同的优选的公式,但在本发明中提及的范围之外以及在上文中进行定义的若干其他模型以及公式类型是本领域技术人员熟知的。所使用的实际的模型类型或者公式本身可以从所述的潜在模型组中被筛选出来,这种筛选依据的是其在一种训练群体中所取得的结果所具有的性能以及诊断准确率特征。所述的公式本身所具有的细节通常可以来自于头颈癌标记物(HNCMARKER)结果,其中所述的结果是在所述的相关性的训练群体中获得的结果。在其他的用途之中,这样的公式可能被打算用来将所述的特征空间在一组宿主类别中进行定位(map),其中所述的特征空间来自于一个或者多个头颈癌标记物(HNCMARKER)输入(例如,能够有效的用于预测宿主的类别属籍,将所述的宿主分为正常、应答者以及非应答者的类别),使用一种贝叶斯方法得到对危险的概率函数所进行的评估(例如,所述的患有癌症的危险或者出现一种转移性事件的危险),或者用以对所述的类别-条件概率进行评估,此后按照在先前的情况中那样,使用贝叶斯定理生成所述的类别概率函数。优选的公式包括很多类型的统计分类运算法则,并且特别是所述的判断分析的使用。所述的判断分析的目标在于通过一组先前被识别出的特征来预测类别的属籍。在使用线性判断分析(LDA)的情形中,通过某种标准对所述特征的线性结合进行识别,其中所述的线性结合能够使得组之间的分割最大化。可以使用一种基于eigengene的方法利用不同的阈值(ELDA)对用于线性判定分析(LDA)的特征进行识别,或者使用一种基于多变量方差分析(MANOVA)的梯度运算法则对所述的特征进行识别。可以进行前向、后向、以及逐步的运算法则,从而基于所述的Hotelling-Lawley统计学方法使没有产生分割的概率最小化。基于Eigengene的线性判断分析(ELDA)是一种特征筛选技术,是由Sien等人(于2006年)研发的。所述的公式能够在一个多变量的框架内进行特征(例如,生物标记物)的筛选,其中使用一种经过修饰的本征分析(eigenanalysis)对与所述的最为重要的本征向量有关的特征进行识别。“重要的”被定义为那些能够对存在于样本的差异中的最重要的变化进行解释的本征向量,其中所述的样本是那些被试图进行分类的样本,所述的分类是相对于某个阈值而言所进行的分类。支持向量机(SVM)是一种分类公式,试图在寻找一个能够将两种类别进行分割的超平面。这种超平面上含有支持向量,数据点,其中所述的数据点正是距离所述超平面的空白距离。在适合的事件中,在所述数据的当前维度内不存在分割的超平面,通过将所述的数据投射至更大的维度内的方式使所述的维度发生很大的扩张,其中所述的数据的投射是通过采取初始变量的非线性函数的方式来实现的(参见Venables以及Ripley于2002年发表的文章)。尽管不是必需的,对支持向量机(SVM)的特征进行过滤通常能够对预测进行提高。可以通过使用一种非参数性的Kruskal-WallisOiW)测试对所述的最佳单变量特征进行筛选的方式对支持向量机的特征(例如,生物标记物)进行识别。随机森林(RF,参见Breiman于2001年发表的文章)或者递归分割树(RPART,参见Breiman等人于1984年发表的文章)同样可以被单独进行使用或者进行组合使用,用以对生物标记物的组合进行识别,其中所述的生物标记物的组合是最为重要的。KruskaI-Wallis(KW)以及随机森林(RF)同样需要从所述的总体中筛选出许多的特征。递归分割树(RPART)能够通过使用一个可利用的生物标记物亚组建立一个单一的分类树。为了对各个头颈癌标记物(HNCMARKER)的测量方法所得到的结果进行预处理,使39其在被呈递到所述的预测公式之前被处理成为更具价值的信息形式,可以使用其他的公式。最为显著的,关于一种群体所具有的平均值而言,对生物标记物的结果所进行的正态化处理,使用常用的数学转化方法例如对数函数或者逻辑斯蒂函数,作为正常的或者其他的分配位置,等等,这些都是本领域技术人员所熟知的。格外令人感兴趣的是基于临床参数的一组正态化处理,其中所述的临床参数是例如年龄,性别(gender),种族,或者性别(sex),其中特定的公式仅仅被用在同一类别的宿主上或者对一个临床参数进行连续性的合并从而作为一个输入值。在其他的情况中,可以将基于分析物的生物标记物结合到经过计算得出的变量之中,在此之后将所述的变量呈递到一个公式中去。除了可以对来自于一个宿主的所述的个体参数值进行可能的正态化处理之外,一个针对所有宿主或者任意已知类别的宿主而言的整体预测公式本身是可以进行重复校验的,或者依据对一个群体预期普遍性以及平均生物标记物参数值的调整方法对其进行调整,其中使用的是在D’Agostino等人(于2001年)在《美国医学学会杂志》(JAMA)286180-187中发表的文章中概述的技术,或者其他相类似的正态化技术以及重新校验技术。可以经由下述的方式对这样的流行病学调整的统计学方法进行连续的获取、证实、改进以及更新,其中所述的方式是经由呈递在所述的模型之上的过往数据的登记,其中所述的数据可以是计算机可读形式的或者是另外的形式,或者偶然的经由对存储的样本所进行的追溯性的查询,或者经由对这样的参数以及统计学方法所进行的历史研究的参考。能够成为所述的公式校验或者其他调整方式的主题的另外的例子包括那些在P印e,Μ.S.等人于2004年在对所述的让步比所具有的局限性进行的研究中所使用到的统计学方法;Cook,N.R.于2007年在涉及接受者操作特性曲线(ROC)曲线的研究中所使用到的统计学方法。最终,一个分类公式所得到的数字结果本身能够被转化进行后处理,其中所述的转化是通过对一个实际临床群体以及研究结果以及所观察到的端点进行的参考而实现的,其目的在于对绝对危险进行校验并且为所述的分类公式或者危险公式所得到的存在变化的数字结果提供置信区间。这方面的一个例子是所述的绝对危险的呈递,以及这个危险的置信区间的呈递,所述的绝对危险以及置信区间是通过使用一种实际的临床研究而得来的,并且在GenomicHealth,Inc.(红杉市,加利福尼亚)的OncotypeDx产品中根据所述的参考得分公式得到的输出量对其进行了选择。一种进一步的修饰是使其调整为适合进行较小的亚群体的研究,这种调整是基于所述的分类公式或者危险公式所得到的输出值来完成的,并且通过它们的临床参数进行了定义以及筛选,其中所述的临床参数是例如年龄或者性别。与临床参数以及传统实验室危险因素所进行的结合前述提及的临床参数中的任何一个可以被用在本发明的实践当中作为一种头颈癌标记物(HNCMARKER)输入值输入到一个公式中去或者作为一种进行预先筛选的标准,用于对一个需要进行测量的相关群体进行定义,其中所述的测量使用到的是一种特定的头颈癌标记物(HNCMARKER)小组以及公式。正如上文中所记载的,临床参数同样可以被有效的用于所述的生物标记物的正态化处理以及预处理中,或者用于头颈癌标记物(HNCMARKER)的筛选,小组的构建,公式类型的筛选以及推导,以及公式结果的后处理中。可以利用所述的传统实验室危险因素实现类似的方法,作为一个公式的输入值或者作为一种进行预先筛选的轨范。头颈癌标记物(HNCMARKER)的测量方法可以使用本领域中任何已知的方法,在所述的蛋白质水平或者核酸水平的条件下对所述的头颈癌标记物(HNCMARKERQ所具有的水平或者剂量进行实际的测量。例如,在所述的核酸水平的条件下,Northern杂交分析以及Southern杂交分析,以及使用探针的核糖核酸酶保护检测可以被用来对基因表达进行确定,其中所述的探针能够对这些序列中的一个或者多个进行特异性的识别。可供选择的,可以使用基于逆转录的聚合酶链式反应检测(RTPCR)对头颈癌标记物(HNCMARKERS)所具有的剂量进行测量,例如,使用对所述基因的差异性表达的序列具有特异性的引物,或者通过支链RNA的扩增作用以及Panomics,Inc.的探测方法。同样可以在所述的蛋白质水平的条件下对所述的头颈癌标记物(HNCMARKERS)所具有的剂量进行测定,例如,通过对所述肽的水平进行测量的方式,其中所述的肽是由本发明中所描述的基因产物来进行编码的,或者使用技术平台进行亚细胞的定位或者它们的活动,其中所述的技术平台例如是AQUA。这样的方法是本领域中熟知的并且包括,例如,基于抗体的免疫检测,核酸适体或者分子烙印,其中所述的抗体是由所述的基因所编码的蛋白质的抗体。任何的生物学材料均可以被用来进行所述蛋白质或其活性的探测/量化。可供选择的,可以选择出一种适当的方法,用以对蛋白质所具有的活性进行测定,其中所述的蛋白质是由所述的标记物基因来进行编码的,所述的方法的选择依据的是被分析的每一种蛋白质所具有的活性。可以以任何适当的方式对所述的头颈癌标记物(HNCMARKER)蛋白质、多肽、变异体、及其多形体进行探测,但是通常情况下是通过下述方式来进行探测的将一种来自于所述宿主的样本与一种抗体进行接触,其中所述的抗体能够与所述的头颈癌标记物(HNCMARKER)蛋白质、多肽、变异体、或者多形体进行结合并且在此之后探测一种反应产物的存在或者不存在。所述的抗体可以是单克隆的,多克隆的,嵌合抗体,或者前述抗体的片段,正如在上文中进行过详细讨论的,并且可以使用任何适当的免疫检测来实现对所述的反应产物的探测。所述的来自于所述宿主的样本通常情况下是一种生物学流体,正如在上文中所描述的,并且可以与那些被用来实现上文中所描述的方法的生物学流体样本相同。依照本发明进行实施的免疫检测可以是同源性检测或者是异源性检测。在一项同源性检测中,所述的免疫学反应通常涉及到所述的特异性抗体(例如,抗头颈癌标记物(HNCMARKER)蛋白抗体),一种被标记的分析物,以及所述的目标样本。当所述的抗体与所述的被标记的分析物进行结合的时候,来自于所述的标记之中的所述信号被进行了直接的或者间接的修饰。可以在一个同源性溶液中同时进行所述的免疫学反应以及对所述反应所具有的程度的探测。可以使用的免疫化学标记包括自由基,放射性同位素,荧光染料,酶,抗菌素,或者辅酶。在一项异源性检测方法中,所述的试剂通常是所述的样本,所述的抗体,以及用以生成一种可探测性信号的工具。在上文中所描述的抗体是可以被使用的。所述的抗体可以被固定在一个支持物,培养板或者载玻片之上,其中所述的支持物例如是一个珠子(例如蛋白质A以及蛋白质G琼脂糖珠子),并且将其在一种液相中与所述的样本进行接触,其中所述的样本是被怀疑为含有所述抗原的样本。在此之后将所述的支持物从所述的液相中分离出来并且对所述的支持相或者所述的液相进行一种可探测性信号的检查,其中使用工具以生成这样的信号。所述的信号与所述的样本中的分析物的存在有关。用于生成一种可探测性信号的工具包括下述物质的使用放射性标记,荧光标记,或者酶标记。例如,如果将要41被探测的所述抗原含有第二个结合位点,可以将能够在这个位点上进行结合的一种抗体与一种可探测性的基团进行共轭并且将其在所述的分离步骤之前添加到所述的液相反应溶液中去。在所述的固体支持物上,所述的可探测性基团的存在标志着在所述的测试样本中所述抗原的存在。适合的免疫检测的例子是寡核苷酸法,免疫印迹法,免疫荧光法,免疫沉淀反应,量子点,多重荧光染料,化学发光方法,电化学发光方法(ECL)或者酶联免疫吸附检测。本领域技术人员将熟知多种特异性的免疫检测形式及其变化形式,这些形式及其变化形式能够有效的用于实现本发明所公开的方法。大体上可以参见E.Maggio(于1980年)所著的Enzyme-Immunoassay〈〈酶-免疫检测》(CRCPress,Inc.,BocaRaton,Fla.);同样可以参见Skold等人的美国专利No.4727022,其名称为“MethodsforModulatingLigand-ReceptorInteractionsandtheirApplication〈〈用于调节配体-受体相互作用的方法以及它们的应用》”;Forrest等人的美国专利No.4659678,其名称为“ImmunoassayofAntigens《抗原的免疫检测》”;David等人的美国专利申请No.4376110,其名称为"ImmunometricAssaysUsingMonoclonalAntibodies《使用单克隆抗体的免疫量度检测》”;Litman等人的美国专利No.4275149,其名称为“MacromolecularEnvironmentControlinSpecificReceptorAssays《在特异性受体检测中的大分子环境的控制》”;Maggio等人的美国专利No.4233402,其名称为“ReagentsandMethodEmployingChanneling《利用通道的试剂以及方法》”;以及Boguslaski等人的美国专利No.4230767,其名禾尔为“HeterogenousSpecificBindingAssayEmployingaCoenzymeasLabel《利用辅酶作为标记的异源特异性结合检测》”。根据已知的技术,例如被动结合,可以将抗体与一种固体支持物进行共轭,其中所述的固体支持物适合进行一种诊断性的检测(例如,珠子,例如蛋白质A或者蛋白质G琼脂糖,微球体,培养板,载玻片或者孔,上述支持物是使用例如乳胶或者聚苯乙烯这样的材料来形成的。依照已知的技术,在本发明中所描述的抗体同样能够与可探测性的标记物或者基团进行共轭,其中所述的可探测性的标记物或者基团是例如放射性标记(例如,35硫,125碘,131碘),酶标记(例如,辣根过氧化物酶,碱性磷酸酶),以及荧光标记(例如荧光素,Alexa,绿色荧光蛋白,若丹明)。可以使用对具有高敏感度的抗体进行的探测方法,从而允许对以一种非扩增的构象形式发生的所述抗原-抗体的结合进行评价。除此之外,可以将抗体与寡核苷酸进行共轭,并且在此之后进行聚合酶链式反应以及各种不同的寡核苷酸探测方法。抗体同样能够有效的用来对头颈癌标记物(HNCMARKER)蛋白质、多肽、变异体、以及多形体的翻译后修饰进行探测,其中所述的修饰例如是酪氨酸的磷酸化作用,苏氨酸的磷酸化作用,丝氨酸的磷酸化作用,糖基化作用(例如,氧-乙酰葡萄糖胺)。这样的抗体能够特异性的探测到存在于一种目标蛋白质中的所述发生磷酸化的氨基酸,并且可以被用在本发明中所描述的免疫印迹法,免疫荧光法,以及酶联免疫吸附检测(ELISA)中。这些抗体是本领域技术人员熟知的,并且是可以通过商业购买获得的。同样可以使用亚稳定离子在反射基质辅助的激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-T0F)中对翻译后的修饰进行测定(参见Wirth,U.等人(于2002年)在ftOteomics《蛋白质组学》2(10):1445-51中发表的文章)。除了翻译后修饰之外,可以将这些方法与蛋白质的定位进行偶联,这样一来,可以对一种二次定位的方法进行监测,并且可以以一种相对的形式对所述的生物标记物进行评价,这是通过存在于不同的间隔之中的所述蛋白质的比例的恒定性质或者变化性质来展现的。对存在于肿瘤细胞中的头颈癌标记物(HNCMARKER)、细胞核、细胞核焦点、以及细胞质位点上的几种蛋白质的重要性是明显的。对于已知具有酶活性的头颈癌标记物(HNCMARKER)蛋白质、多肽、变异体、以及多形体而言,可以使用本领域已知的酶检测方法对所述的活性进行体外的检测。这样的检测包括,但不局限于,除了许多其他检测以外,激酶检测,磷酸酶检测,还原酶检测。可以通过使用已知的运算法则对所述的速率常数KM进行测量的方式,确定出所述的酶活性动力学的修饰作用,其中所述的运算法则是例如希尔标绘法(Hillplot),米氏方程(Michaelis-Menten),线性回归标绘法例如Lineweaver-Burk分析,以及Scatchard标绘法。通过使用序列信息能够对所述的头颈癌标记物(HNCMARKER)序列的表达(如果存在的话)进行探测并且使用本领域普通技术人员所熟知的技术对其进行测量,其中所述的序列信息是由所述的头颈癌标记物(HNCMARKER)序列的数据库条目来进行提供的。例如,存在于相对于头颈癌标记物(HNCMARKER)序列的序列数据库条目之中的序列,或者存在于本发明中公开的所述序列之中的序列,可以被用来构建探针,用于在例如下述方法中探测头颈癌标记物(HNCMARKER)的RNA序列=Northern印迹杂交分析或者方法,所述的方法能够特异性的,并且优选的,定量的扩增特异性的核酸序列,其中所述的序列数据库条目相对应于所述的头颈癌标记物(HNCMARKER)序列。作为另外一个例子,所述的序列可以被用来构建引物,用于在例如下述方法中对所述的头颈癌标记物(HNCMARKER)序列进行特异性的扩增基于扩增的探测方法例如基于逆转录的聚合酶链式反应(RT-PCR)。当存在于基因表达之中的改变与基因的扩增、缺失、多形体、以及变异有关时,可以通过对存在于所述的测试以及参考细胞群体中的接受检查的DNA序列的相对数量进行比较的方式,在测试以及参考群体之间进行序列的比较。可以使用任何本领域已知的方法在所述的RNA水平上对本发明中公开的所述基因的表达进行测量。例如,使用探针的Northern杂交分析可以被用来确定基因的表达,其中所述的探针能够对这些序列中的一个或者多个进行特异性的识别。可供选择的,可以使用基于逆转录的聚合酶链式反应检测(RT-PCR)对表达进行测量,例如,使用对所述的差异化表达的序列具有特异性的引物。同样可以使用例如其他的目标扩增方法(例如,转录介导扩增法(TMA),链置换扩增法(SDA),核酸序列依赖性扩增(NASBA)),或者信号扩增方法(例如,支链DNA杂交方法),以及类似的方法对RNA进行量化。可供选择的,可以对头颈癌标记物(HNCMARKER)蛋白质以及核酸的代谢产物进行测量。所述的术语“代谢产物”包括在一种代谢过程中存在的任意的化学产物或者生物化学产物,例如有一种生物分子(例如,蛋白质,核酸,碳水化合物,或者脂质体)的加工、断裂或者消耗而产生出的任何化合物。可以使用本领域技术人员已知的各种不同的方式对代谢产物进行探测,所述的方式包括所述的折射率光谱(RI),紫外光谱(UV),荧光分析,放射化学分析,近红外光谱(near-IR),核磁共振光谱(NMR),光散射分析(LS),质谱,高温分解质谱,比浊法,色散型拉曼光谱,质谱联用的气相色谱,质谱联用的液相色谱,质谱联用的基质辅助的激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-T0F),质谱联用的离子喷雾色谱,毛细管电泳,核磁共振光谱(NMR)以及红外光谱(IR)探测。(参见WO04/056456以及WO04/088309,上述文章中的全部内容均在此被引入作为参考)。就这一点而言,可以使用上述提及的探测方法或者本领域技术人员已知的其他方法对其他的头颈癌标记物(HNCMARKER)分析物进行测量。例如,可以使用荧光染料对存在于一个样本之中的流动的钙离子(Ca2+)进行探测,其中所述的荧光染料除了其他之外,例如是所述的氟系列,例如是FUra-2A,Ih0d-2。可以使用试剂对其他的头颈癌标记物(HNCMARKER)代谢产物进行类似性的探测,其中所述的试剂是经过特意的设计或者剪裁过的,用以对这样的代谢产物进行探测。试剂盒本发明同样包括一种头颈癌标记物(HNCMARKER)探测试剂,例如是一种核酸,所述的试剂能够通过具有同源性的核酸序列而对一个或者多个头颈癌标记物(HNCMARKER)核酸进行特异性的识别,例如是一个寡核苷酸序列,所述的头颈癌标记物(HNCMARKER)核酸的一部分的互补物或者由所述头颈癌标记物(HNCMARKER)核酸编码的蛋白质的抗体一同被包裹在所述的试剂盒形式中。所述的寡核苷酸可以是所述头颈癌标记物(HNCMARKER)基因的片段。例如,所述的寡核苷酸可以具有200、150、100、50、25、10或者更少个寡核苷酸的长度。所述的试剂盒中可以在各自分离的容器内装有一种核酸或者抗体(可以是已经与以一种固体基质进行结合的,或者与试剂进行单独的包装,其中所述的试剂能够将它们与所述的基质进行结合),对照制剂(阳性的和/或阴性的),和/或一种可探测性的标记例如荧光素,绿色荧光蛋白,若丹明,花青染料,Alexa染料,荧光素酶,放射性标记,除其他之外。用以实现所述检测的说明书(例如,书写形式的,录音形式的,盒式磁带录像机(VCR),只读光盘(CD-ROM),等等)可以被包含在所述的试剂盒之中。所述的检测可以是以例如一种Northern杂交或者夹心酶联免疫吸附检测(ELISA)的形式来进行的,这在本领域是已知的。例如,可以将头颈癌标记物(HNCMARKER)探测试剂固定在一种固体的基质上,其中所述的固体基质例如是一种多孔的条带,从而形成至少一个头颈癌标记物(HNCMARKER)探测位点。所述的多孔条带上的测量区域或者探测区域内可以包括许多个含有核酸的位点。一个测试条带上同样可以含有用于进行阴性对照和/或阳性对照的位点。可供选择的,对照位点可以定位于一个与所述的测试条带相分离的条带之上。任选的,所述的不同的探测位点上可以含有不同剂量的固定化的核酸,例如,在所述的第一个探测位点上具有一种较高的剂量而在随后的位点上具有较低的剂量。当加入了所述的测试样本时,所述的位点的数量呈现出一种可探测性的信号,从而为存在于所述样本之中的所述头颈癌标记物(HNCMARKERS)的剂量提供了定量的指示。所述的探测位点可以被配置成任意适当的可探测的形状,并且在通常情况下被配置成为一种条状或者圆点状,其跨越了所述测试条带的宽度。可供选择的,所述的试剂盒中含有一种核酸底物阵列,其中包括一个或者多个核酸序列。存在于所述阵列之上的所述核酸能够特异性的识别一个或者多个由头颈癌标记物(HNCMARKERQ所代表的核酸序列。所述的底物阵列可以存在于例如一种固体底物之上,例如是在美国专利No.5744305中所描述的一个“芯片”之上。可供选择的,所述的底物阵列可以是一种溶液阵列,例如xMAP(Luminex,Austin,TX),Cyvera(IIlumina,SanDiego,CA),CellCard(VitraBioscience,MountainView,CA)以及QuantumDots'Mosaic(Invitrogen,Carlsbad,CA)。用以对所述的头颈癌标记物(HNCMRKERQ进行探测的所述抗体的适合来源包括可商业购买获得的来源例如,Abazyme,Abnova,AffinityBiologicals,AntibodyShop,Biogenesis,BiosenseLaboratories,Calbiochem,CellSciences,ChemiconInternational,Chemokine,Clontech,Cytolab,DAKO,DiagnosticBioSystems,eBioscience,EndocrineTechnologies,EnzoBiochem,Eurogentec,FusionAntibodies,GenesisBiotech,GloboZymes,HaematologicTechnologies,Immunodetect,Immunodiagnostik,Immunometrics,Immunostar,Immunovision,Biogenex,Invitrogen,JacksonImmunoResearchLaboratory,KMIDiagnostics,KomaBiotech,LabFrontierLifeScienceInstitute,LeeLaboratories,Lifescreen,MaineBiotechnologyServices,Mediclone,MicroPharmLtd.,ModiQuest,MolecularInnovations,MolecularProbes,Neoclone,Neuromics,NewEnglandBiolabs,Novocastra,NovusBiologicals,OncogeneResearchProducts,Orbigen,OxfordBiotechnology,Panvera,PerkinElmerLifeSciences,Pharmingen,PhoenixPharmaceuticals,PierceChemicalCompany,PolymunScientific,Polysiences,Inc.,PromegaCorporation,Proteogenix,ProtosImmunoresearch,QEDBiosciences,Inc.,R&DSystems,RepIigen,ResearchDiagnostics,Roboscreen,SantaCruzBiotechnology,SeikagakuAmerica,SerologicalCorporation,Serotec,SigmaAldrich,StemCellTechnologies,SynapticSystemsGmbH,Technopharm,TerraNovaBiotechnology,TiterMax,TrilliumDiagnostics,UpstateBiotechnologyjUSBiological,VectorLaboratories,WakoPureChemicalIndustries,以及kptometrix。然而,本领域技术人员能够通过常规方法制备抗体,核酸探针,例如,作用于本发明公开的任何一种所述头颈癌标记物(HNCMARKERS)的寡核苷酸,核酸适体,siRNA,反义寡核苷酸。实施例实施例1利用生物标记物对头颈癌患者进行评价的一般方法患者组A.诱导化学疗法头颈部的鳞状上皮细胞对诱导化学疗法能够产生高度的应答性。处于第III阶段以及第IV阶段的局部晚期头颈癌鳞状上皮细胞癌(HNSCC)的头颈癌患者接受卡波钼/紫杉烷(C+T)的诱导化学疗法,在此之后接受基于FHX的化学放射性疗法[(紫杉醇,5-氟尿嘧啶,羟基脲),这是依照一种来自于合作癌症中心的被批准的方案来进行的。然而,化学疗法对于患者而言是有毒性的并且优选的是在接受治疗之前通过对所述的肿瘤细胞所具有的分子生物标记物进行的评价来了解所述的治疗所具有的益处。在诱导化学疗法之后,进行应答评价。评价标准是以肿瘤的测量尺寸为基础的。完全应答(CR)被定义为全部的可探测性的疾病的完全消失。通过对先前所涉及到的区域进行活组织检查或者外科手术的方式尝试对完全免除提供证明。部分应答(PR)被定义为可以测量的肿瘤损伤的最长垂径的乘积发生了至少50%的减小,并且不再有其他损伤的生长以及新的损伤的出现。稳定疾病(SD)是采用与部分应答所相同的标准来进行定义的,不同之处在于肿瘤的损伤在尺寸上保持稳定或者发生了低于50%的减少。讲展件疾病(PD)被定义为疾病的显著扩张,所述肿瘤的损伤所具有的垂径的乘积发生了大于等于25%的增加或者出现了新的转移性的损伤。利用患者的比例对所述的应答速率进行表示,其中所述的患者已经被证实为发生了完全应答和/或部分应答。最佳的应答被定义为临床方面的最佳应答或者放射线方面的最佳应答。患有晚于等于N2期疾病的患者被交付来经历治疗后的选择性颈部切开。在进行了化学放射性疗法之后,推荐使用保肢手术对残余的疾病进行处理。产生完全应答(CR)的患者可以在初期忽略外科手术,其中所述的完全应答(CR)是通过治疗后的身体检查、放射线成像、和/或阴性活组织检查来证实的(参见Vokes,EE等人于2000年发表的文章,KiesMS等人于2001年发表的文章,SalamaJK等人于2008年发表的文章)。对三十七位局部晚期的头颈癌(HNC)患者进行研究,在所述的研究中,已经对所述的肿瘤样本进行了福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)。对所有的患者进行了诱导化学疗法的治疗,其中所述的诱导化学疗法是由两个周期的紫杉醇以及卡波钼的循环构成的,共计八周时间并且在此之后对应答进行评价。在所述的研究中的37位头颈癌(HNC)患者中,11位产生了完全应答(CR),19位产生了部分应答(PR),而7位产生了稳定的疾病(SD)。所述的研究的目标在于在所述的活组织检查阶段建立一种生物标记物类型,所述的生物标记物类型能够对患者针对诱导化学疗法所产生的应答进行预测。B.同步化学放射性疗法在对头颈癌患者进行的治疗的晚期阶段,常常会使用到所述的放射物以及化学疗法,其被称为同步化学放射性疗法。患者可以在处于所述癌症的任何阶段时(I-IV)作为同步化学放射性疗法的参与者,并且之前可以接受过外科手术或者之前并未接受过外科手术。除此之外,存在肿瘤复发情况的患者同样能够作为同步化学放射性疗法的参与者和/或对其进行临床决策,确定是否接受再辐射。在每一种这样的情况下,不存在足够的患者肿瘤细胞的分子表达谱,用以判定它们是否如预想的那样会从所述的治疗中获得益处。在合作癌症中心,从组织微阵列中对活组织切片样本(石蜡包埋的肿瘤样本)进行评价,其中所述的样本来自于66位局部晚期的头颈癌(HNC)患者。所述的头颈癌(HNC)患者的活组织切片是从一期切除或者周期性活组织检查中获得的。样本来自于I期/11期研究1)预后不良的首次接受放射性疗法的样本,幻再辐射样本。利用基于TFHX的化学放射性疗法[(紫杉醇,5-氟尿嘧啶,羟基脲)]对所有样本进行处理。患者接受5-7个周期的化学疗法[(紫杉醇,5-氟尿嘧啶,羟基脲)]以及放射性疗法,所述的周期共计10-14周,每一个化学疗法以及放射性疗法周期进行5天。利用各种临床标准对患者进行评价,其中所述的患者已经接受了同步化学放射性疗法。利用这些临床参数对所述的生物标记物的测定进行权衡,其中所述的生物标记物的测定代表着所述的治疗所具有的预后益处以及预测益处。对于头颈癌而言,针对癌症相关性事件对患者进行监测,其中所述的癌症相关性事件例如是复发,远端转移,或者死亡。可评价的临床指示参数为整体存活率,不存在疾病或者不存在恶化的存活率,同样还有恶化时间或者发生事件的时间。可以通过所述的复发类型对患者进行亚分组或者分类,其中所述的复发类型例如是一种与非头颈癌的癌症相关的事件,或者通过第二处的头颈癌对患者进行亚分组或者分类。C.患有头颈癌的人类乳头瘤病毒(HPV)阳性患者或者人类乳头瘤病毒(HPV)阴性患者尽管烟草以及酒精的消费成为形成头颈癌的首要危险因素,高危险的人类乳头瘤病毒(HPV)是头颈癌的一个显现出来的逻辑学因素,其中所述的人类乳头瘤病毒(HPV)通常为人类乳头瘤病毒(HPV16)。与吸烟者相比,患有口咽癌的非吸烟者呈人类乳头瘤病毒(HPV)阳性的可能性高15倍。近来的研究已经表明,在头颈癌中,与存在病毒阴性的肿瘤的患者相比,存在人类乳头瘤病毒(HPV)感染的肿瘤的患者具有更加良好的预后(参见FakhryC等人于2008年发表的文章,LicitraL等人于2006年发表的文章,WeinbergerPM等人于2006年发表的文章,KumarB等人于2008年发表的文章)。同样值得注意的是,患有人类乳头瘤病毒(HPV)阳性的口咽肿瘤的患者具有一种存活率的优势,每个细胞中的人类乳头瘤病毒(HPV)拷贝数量与一种更好的应答是显著相关联的,并且与提高的疾病特异性存活率以及整体存活率是显著相关联的,其中所述的应答是针对诱导化学疗法以及同步化学放射性疗法而言的(参见WordenFP等人于2008年发表的文章)。所述的pl6蛋白(P16)是一种周期素依赖性激酶(CDK)抑制剂,能够抑制成视网膜细胞瘤(Rb)的磷酸化作用并且在所述的Gl至S检测点阻滞细胞周期的进行。人类乳头瘤病毒(HPV)阳性的肿瘤的特征在于P16的高度表达。磷酸化成视网膜细胞瘤(pRb)的功能灭活能够导致pl6的过表达,这使其成为一种人类乳头瘤病毒(HPV)的替代标记物,其中所述的磷酸化成视网膜细胞瘤的功能灭活是通过人类乳头瘤病毒(HPV)的E7蛋白质来实现的(参见^ΙΛιτC等人于2008年发表的文章,LicitraL等人于2006年发表的文章,WeinbergerPM等人于2006年发表的文章)。因此存在一种良好的证据,pl6的阳性可以被看作是一种肿瘤的生物标记物,其中在所述的肿瘤中存在有临床学方面以及致癌基因方面相关的人类乳头瘤病毒(HPV)感染。所述的组合的pl6/人类乳头瘤病毒(HPV)生物标记物数据与头颈癌(HNC)的不同的存活率结果相关,其中所述的不同的存活率结果是与单独利用每一种标记物所进行的评价进行比较的结果,这表明一同进行评价的所述的两种分子机制能够提供一种更加精确的针对临床结果的预测(参见SmithEM等人于2008年发表的文章)。通过使用基于抗体的免疫组织化学技术进行的生物标记物检测通过免疫组织化学技术(IHC)对所述肿瘤的完整切片或者所述的肿瘤样本核心的组织微阵列(TMA)进行染色,其中使用作用于存在于DNA的修复途径中的蛋白质的抗体对其进行染色(表格1)。成为头颈癌标记物(HNCMARKER)的所述蛋白质或者表位包括着色性干皮病D组蛋白(XPF)以及核苷酸切除修复交叉互补组I(ERCCl)(核苷酸切除修复),范科尼贫血互补组D2(FANCD》(范科尼贫血途径/同源性重组途径),错配修复蛋白1(MLHl)(错配修复),聚二磷酸腺苷核糖聚合酶1(PARPl)(碱基切除修复),PAR(聚二磷酸腺苷核糖,碱基切除修复),pMK2(膦-有丝分裂原活化的蛋白激酶活化的蛋白激酶2,DNA损伤应答),磷酸化热休克蛋白27(pHSP27)(DNA损伤应答),细胞周期关卡基因蛋白(ATM)(DNA损伤应答),磷酸化H2AX(pH2AX)(DNA损伤应答/非同源性末端连接),核苷酸切除修复交叉互补组1(ERCCl)(核苷酸切除修复),p53(DNA损伤应答),RAD51(同源性重组),Κ67(增殖标记物)。所述的抗体是从下述的来源中获得的着色性干皮病D组蛋白(XPF)以及核苷酸切除修复交叉互补组1(ERCCl)(AbCam),细胞周期关卡基因蛋白(ATM)(Epitomics),范科尼贫血互补组D2(FANCDW以及p53(SantaCruz),错配修复蛋白(MLHl)以及Ki67(BioCare47Medical),聚二磷酸腺苷核糖聚合酶I(PARPl)(AbDSerotec),PAR(聚二磷酸腺苷核糖)以及磷酸化H2AX(pH2AX)以及RAD51(Millipore),膦-有丝分裂原活化的蛋白激酶活化的蛋白激酶2以及磷酸化热休克蛋白27(pHSP27)(CellSignalingTechnology)0可以通过各种不同的探测方法对人类乳头瘤病毒(HPV)的状况进行监测,所述的方法包括基于DNA、RNA、以及蛋白质的测试,用以对所述的病毒基因组、转录物、或者蛋白质进行测试。进行人类乳头瘤病毒(HPV)的原位杂交(ISH),在所述的原位杂交(ISH)中使用石蜡包埋的肿瘤样本。使用(VentanaINFORMHPVII以及HPVIII试剂盒)来进行原位杂交(ISH),在所述的试剂盒中含有人类乳头瘤病毒(HPV)的高危险DNA探针以及低危险DNA探针,其中所述的DNA探针与一种基于色原体的探测方略联系在一起。除此之外,同样使用到人类乳头瘤病毒(HPV)感染的替代的生物标记物。P16,所述的肿瘤抑制剂,在人类乳头瘤病毒(HPV)感染细胞中被进行了上调节以及稳定化处理。利用免疫组织化学技术(IHC)对P16进行监测,其中所述的免疫组织化学技术(IHC)是关于DNA修复生物标记物方面的。除了在所述的研究组中的所述头颈癌样本之外,对阴性人类头颈癌对照切片以及阳性人类头颈癌对照切片进行了免疫组织化学处理(IHC)。使用标准技术对组织切片进行脱石蜡处理以及再水合。进行热诱导的表位修复并且利用抗体在4°C下对所述的组织进行过夜的染色。再生的TSAtm(酪胺信号放大)生物素系统(PerkinElmer)被用来进行着色性干皮病D组蛋白(XPF)以及范科尼贫血互补组D2(FANCD2)的探测。SuperSensitive^(超敏感)免疫组织化学(IHC)探测系统(BioGenex)被用来对下述物质进行探测错配修复蛋白1(MLHl),聚二磷酸腺苷核糖聚合酶I(PARPl),聚二磷酸腺苷核糖(PAR),膦-有丝分裂原活化的蛋白激酶活化的蛋白激酶2(pMK2),磷酸化的热休克蛋白27(pHSP27),磷酸化H2AX(pH2AX),核苷酸切除修复交叉互补组I(ERCCl)以及Ki67。Envision+System-辣根过氧化物酶(HRP)(Dako)被用来进行p53、细胞周期关卡基因蛋白(ATM)以及RAD51的探测。建立两倍的抗体稀释范围,并且设定抗原修复条件,这样一来,抗体过量并且能够在对照的癌症组织中被判定出来,并且从低表达水平与高表达水平中被判定出来。在头颈癌中能够频繁的观察到DNA修复蛋白的表达所发生的变化DNA修复途径对于针对化学疗法以及放射物所产生的细胞应答网络而言是重要的。在这项研究中,对来自于这些途径中的几种代表进行了研究,研究这些途径在诱导化学疗法研究中与临床结果之间存在的关联(表格1)。所述的头颈癌(HNC)患者的活组织切片是从一期切除或者周期性活组织检查中得到的。对三十七例头颈癌(HNC)患者样本的整体组织切片进行免疫组织化学技术的应用。在来自于头颈癌样本的连续切片中对十种选定的DNA修复蛋白表位进行了评价,其中所述的DNA修复蛋白表位是Ki67以及几种其他的生物标记物。通过病理学回顾对每一个切片进行肿瘤区域的界线划分。通过将显微镜载玻片扫描至一种数字病理学平台(Aperio)中的方式对所述的标记物所具有的表达差异性进行量化。将病理学者的打分以及基于计算机的染色亮度的收集集中在所述被注释的肿瘤区域内。在一种加权运算法则中将0,1+,2+,以及3+bins的标记物输出值进行结合从而生成一个在0-300范围内的相对亮度得分。对于几种标记物而言,所述的细胞核染色的亮度被进行了测量,在其他的情况中,对所述的标记物在不同的细胞间隔之中的定位进行了揭示。例如,可以通过免疫组织化学技术在三种具有代表性的癌症组织的活组织检查中对所述的核苷酸切除修复(NER)蛋白质生物标记物着色性干皮病D组蛋白(XPF)所具有的核染色类型进行证明。着色性干皮病D组蛋白(XPF)核染色的低亮度或者阴性亮度表示着核苷酸切除修复(NER)途径是关闭的,而着色性干皮病D组蛋白(XPF)核染色的中等亮度或者高亮度表示着核苷酸切除修复(NER)途径是开启的。利用对照的头颈癌肿瘤切片为每一种生物标记物建立成像分析的运算法则。同样的,利用存在于所述的组中的几种其他的抗体,以一种肿瘤特异性的方式选择性的对翻译后的调节作用进行证明。例如,通过对膦-有丝分裂原活化的蛋白激酶活化的蛋白激酶2(pMK2)或者磷酸化的细胞周期关卡基因蛋白(pATM)或者磷酸化H2AX(pH2AX)的磷酸化修饰作用所进行的监测,区分开了存在于患者样本之间的选择性的变化。除此之外,膦-有丝分裂原活化的蛋白激酶活化的蛋白激酶2(pMK2)的亚细胞定位只发生在包括细胞核的几种分布之中,或者发生在细胞核+细胞质之中,这取决于所述患者的肿瘤。几种生物标记物例如范科尼贫血互补组D2(FANCD》或者乳腺癌易感基因I(BRCAl)蛋白质在所述的细胞核内具有与众不同的图案,这些图案是在所述的DNA修复途径的活化作用中所发生的变化的指示剂。对于这些蛋白质而言,基于免疫组织化学技术(IHC)的核点或者基于免疫荧光技术的核点预示着所述的范科尼贫血(FA)/同源性重组(HR)途径的活化。对于头颈癌肿瘤的活组织检查而言,很显然的是,某些患者的样本能够表现出基于范科尼贫血互补组D2(FANCD2)或者乳腺癌易感基因1(BRCAl)的DNA修复途径的活化,而另外的样本则不能。打分利用数字病理学策略建立免疫组织化学(IHC)的定量比较,其中所述的数字病理学策略涉及到一种基于计算机的图像的显微镜载玻片色原体染色图案的变化,以及软件运算法则的运用、改编、以及训练。使用基于计算机的成像分析对上述被染色的组织进行评价并且对所导入的所述阳性肿瘤细胞核所具有的密度以及数量进行打分。扫描以及成像分析平台来自于Aperio。对每一个标记物的图案进行质量评价并且通过病理学整体状况对其进行评价。利用对照的头颈癌肿瘤切片为每一种生物标记物建立成像分析运算法则。为了对存在于计算机指导的成像分析与病理学者的打分之间的相关性进行测试,我们对着色性干皮病D组蛋白(XPF)进行了比较,其中所述的着色性干皮病D组蛋白(XPF)被进行了免疫组织化学(IHC)染色,所述的着色性干皮病D组蛋白(XPF)在所述的诱导化学疗法研究中被双盲的病理学者以及基于计算机的运算法则进行了分析(附图1)。所述的结果表明在计算机指导的成像分析与病理学者的打分之间存在着良好的相关性,R2的值存在于0.744-0.839的范围之内。为了判断所述的标记物输出值相对临床结果所具有的关联性,首先需要探求的是解决样本的核-核可变性是否能够对一个患者的分级方案产生影响,其中所述的分级方案是针对DNA修复标记物而言的。为了达到这个目的,从存在于所述组中的最低值到所述的最高值,建立一个患者等级的随意指数。对存在于三倍的组织微阵列(TMA)核之间的每一种标记物的变化水平进行测定,并且针对所述的患者等级值/标记物对其进行打分(附图2)。对于进行测试的八种头颈癌标记物(HNCMARKER)而言,已经发现所述的平均分级误差占总数的很低的百分程度(8.8-11.的DNA修复,11.的Ki67)。因此,对于接受测试的任何所述的标记物而言,存在于三倍的组织微阵列(TMA)核之间的相对小的可变性不会显著性的改变所述患者的等级次序。统计学分析将生物标记物的得分与临床数据联系起来从而对其与结果的关联性进行评价。针对每一种标记物,通过单变量分析确定出一组最佳的标记物阈值,其中所述的阈值能够生成最高程度的判断力,从而在所述的应答者组以及非应答者组(诱导化学疗法)之间进行判定,或者对良好的存活率组以及差的存活率组(同步化学放射性疗法)之间进行分割。同样进行判断分析以及剖分分析,从而在最大程度上将所述的训练数据组样本分割成为应答者组/非应答者组或者不存在疾病的组或者整体存活组。从不同的DNA修复途径中选择所述的生物标记物,这样一来使用多个标记物的运算法则能够捕获到多种途径中的信息,而不是捕获到同一途径中的多余的测量值。卡普兰-迈耶存活曲线(Kaplan-Meier)以及Cox比例风险模型被单独用来或者结合用来对与生物标记物相关的死亡时间进行评价。在可供选择的模型中,对下列数值的统计学输出值进行计算P值,外视错误率(AER),接受者操作性特性以及曲线下面积(AUC),敏感度,特异性,阳性预测能力,阴性预测能力,相对危险(RR),让步比。利用多标记物模型同样能够进行一种涉及到概率测试的单独的分析,从而生成曲线下面积(AUC)以及其他的统计学数值。实施例2具有对来自于同步化学放射件疗法的益处讲行识别的效用的头颈癌标记物(HNCMARKERS)使六十六位处于第III阶段以及第IV阶段的局部晚期头颈癌鳞状上皮细胞癌(HNSCC)的头颈癌(HNC)患者接受基于FFHX的同步化学放射性疗法,这是依照一种来自于合作癌症中心的被批准的方案来进行的。所述的患者的活组织检查是从一期切除或者周期性活组织检查中获得的并且构建三个组织微阵列(TMA)并且将所述的组织微阵列(TMA)应用在免疫组织化学生物标记物的研发中。讲展的时间是通过下沭方式来测量的在从所述治疗的第一天开始直至出现疾病的死亡、新的损伤的出现、或者所述的指示性损伤与先前的最小尺寸相比发生了大于25%的增长。存活是通过下述方式来测量的从进入研究的日期开始直至任何原因导致的死亡。不存在疾病的存活(DFS),以及整体存活(OS)以及疾病特异件存活(DSS)是从所沭的初始诊断的日期开始计算的。不存在疾病的存活(DFS)被定义为存在于组织的获得与疾病复发的显现之间的时间。整体存活(OS)被定义为从无规化到死亡之间的时间,其中所述的死亡是由任意原因所导致的(参见VokesEE等人于2000年发表的文章,MichielsS等人于2009年发表的文章)。出于统计学分析的目的,将局部的、区域性的或者远端的复发共同归结为疾病的复发。可以使用卡普兰-迈耶乘积限定曲线对进展的时间以及存活的时间进行概括。上述研究的目的在于在所述的活组织检查阶段建立一种生物标记物图案,所述的图案能够对所述的不存在疾病的比率或者整体存活率进行预测,并且告知一个患者的肿瘤在同步化学放射性疗法的条件下能够以怎样的攻势重新出现。对存在于这种临床设定中的这些生物标记物所具有的效用的几个例子进行了描述。实施例3.通过剖分分析确定头颈癌标记物(HNCMARKERQ与头颈癌患者存活组的分害|丨之.丨旬的相关+牛,其中所沭的患、者经历了同步化学放fH牛疗法对^^一种头颈癌标记物(HNCMARKERQ进行了分析,分析它们所具有的预测存活可能性的能力,其中所述的头颈癌标记物(HNCMARKER)来自于活组织检查材料,所述的存活可能性指的是在经历了所述的同步化学放射性疗法之后(表格1)。在此之后,针对所述组的分割对每一种头颈癌标记物(HNCMARKER)进行评价,其中所述的分割是在死亡组与不50存在疾病/整体存活组之间进行的。对所述标记物种的每一种构建单变量的Cox比例风险模型(单一标记物模型),用以检查它们所具有的潜在的预测能力。在单变量剖分分析中,高的着色性干皮病D组蛋白(XPF)(p=0.00422),范科尼贫血互补组D2(FANCD2)(p=0.00199),RAD51(p=0.0359),以及乳腺癌易感基因1(BRCAl)(p=0.0101)与较好的存活率相关联(表格2)。卡普兰-迈耶存活曲线同样表示出高的着色性干皮病D组蛋白(XPF)、范科尼贫血互补组D2(FANCD2)、乳腺癌易感基因(BRCAl)、RAD51、细胞周期关卡基因蛋白(ATM)与较好的存活率结果相关联,这与单变量剖分分析相一致(附图幻。对于存在于DNA修复中的几种其他的标记物而言,例如膦-有丝分裂原活化的蛋白激酶活化的蛋白激酶2(pMK2)以及磷酸化H2AX(pH2AX),核苷酸切除修复交叉互补组1(ERCCl),聚二磷酸腺苷核糖(PAR),p53,上述同样的分析没有能够达到统计学显著意义(表格2)。能够辨别存活组的多个DNA修复生物标记物小组的发现所述的DNA修复途径可以以一种商定的方式在细胞的存活以及化学疗法应答中运行。因此,可以通过对所述的标记物所具有的作用进行组合的方式来更为有效的确定DNA修复蛋白的变化,而不是通过单独的分析。为了对这样的相关性建立一种统计学驱动的假设,使用分布剖分对所述的多重标记物的组合进行分析。构建这样的模型,所述的模型是由标记物的组合所组成的,用以对存在于标记物与途径之间的可能的互补的相互关系进行调查,其中所述的途径是用以对死亡组以及存活组进行分割的途径。对两个标记物模型的剖分分析进行单独的计算,用以计算成对的生物标记物所具有的同步化学放射性疗法的相关性(表格幻。在78%的两种标记物的剖分以及概率模型中,出现了着色性干皮病D组蛋白(XPF)、范科尼贫血互补组D2(FANCD》、乳腺癌易感基因(BRCAl)、RAD51、细胞周期关卡基因蛋白(ATM),其中所述的模型具有较低的P值以及较高的曲线下面积(AUC)值。在两种标记物的分析中,范科尼贫血互补组D2(FANCD2)、乳腺癌易感基因(BRCAl)、RAD51、细胞周期关卡基因蛋白(ATM)表现出较好的存活组的分割,其中所述的存活组来自于头颈癌患者。其他的标记物没有在类似的成对测试中具有一致的表现,不能观察出它们属于另外的组,并且没有发现它们能够构成对存活组的更好的辨别。对所有的两种标记物的剖分模型进行所述的头颈癌标记物(HNCMARKERQ的计算(表格幻。统计学评价包括P值,外视错误率,相对危险,让步比,阳性预测能力,以及阴性预测能力。头颈癌标记物(HNCMARKERS)的组合比单独使用更为有效,并且以高性能识别出存在于标记物组合物之中的固定标记物是重要的。开发了一种平台,用以分析个体标记物所具有的能力,其中所述的能力指的是当其与其他标记物进行组合使用时所具有的能力。通过下述方式来运行所述的测试在经历了同步化学放射性疗法的治疗之后,对所述的固定标记物在多重标记物模型中在整体存活率方面的性能的改善进行评价。这项分析的任务是利用具体的标记物组为随后的测试提供帮助,其中所述的随后的测试是在另外的模型中进行的。针对存在于所述的研究中的头颈癌标记物(HNCMARKER)进行剖分分析的计算,其中在所述的研究中具有指定起点的具体的单一生物标记物。在下文中所述的实施例中(附图4),对五个固定的标记物进行了计算,所述的标记物是范科尼贫血互补组D2(FANCD2),着色性干皮病D组蛋白(XPF),乳腺癌易感基因I(BRCAl),细胞周期关卡基因蛋白(ATM)以及RAD51。所表示出的是所述的起始1-标记物模型以及随后的所有的2-标记物模型、3-标记物模型、以及4-标记物模型,其中所述的模型中将总是含有所述的固定标记物。在每一种情形中,针对每一种单独的固定标记物,以及它们在2-标记物模型、3-标记物模型以及4-标记物模型中与其他头颈癌标记物(HNCMARKERQ的组合,表示出了它们所具有的经计算得到的IoglOP值(正方形),阳性预测值(PPV)(三角形)以及外视错误率(AER)(黑色圆圈)。针对每一种模型,绘制出了所有的所述模型所具有的中间值在这项操作中,对向重要的固定标记物中添加标记物所取得的益处的例子进行了证明。从所述的固定标记物分析中选取了两个具体的例子,聚二磷酸腺苷核糖(PAR)以及膦-有丝分裂原活化的蛋白激酶活化的蛋白激酶2(pMK2),并且利用ρ值绘制出卡普兰-迈耶整体存活曲线,其中所述的P值是经过计算得到的,用以指示存在于高存活率患者亚组与低存活率患者亚组之间的区别。在所述含有聚二磷酸腺苷核糖(PAR)的第一个例子中,添加所述的头颈癌标记物(HNCMARKER)RAD51,着色性干皮病D组蛋白(XPF)以及范科尼贫血互补组D2(FANCD2)并且对分别得到的2-标记物模型、3-标记物模型、以及4-标记物模型进行计算(附图幻。所述的P值为聚二磷酸腺苷核糖(PAR)(0.0746),聚二磷酸腺苷核糖(PAR)、RAD51(0.00618),聚二磷酸腺苷核糖(PAR)、RAD51、着色性干皮病D组蛋白(XPF)(1.61e-4),以及聚二磷酸腺苷核糖(PAR)、RAD51、着色性干皮病D组蛋白(XPF)、范科尼贫血互补组D2(FANCD2)(6.06e-5),这标志着标记物的添加(标记物的组合)能够更好的对患者的存活亚组进行辨别。在所述含有膦-有丝分裂原活化的蛋白激酶活化的蛋白激酶2(pMK2)的第二个例子中,添加所述的头颈癌标记物(HNCMARKER)p53,范科尼贫血互补组D2(FANCD2),以及乳腺癌易感基因1(BRCAl),并且对分别得到的2-标记物模型、3-标记物模型、以及4-标记物模型进行计算(附图幻。所述的ρ值为膦-有丝分裂原活化的蛋白激酶活化的蛋白激酶2(pMK2)(0.四3),膦-有丝分裂原活化的蛋白激酶活化的蛋白激酶2(pMK2)、p53(0.0256),膦-有丝分裂原活化的蛋白激酶活化的蛋白激酶2(pMK2)、p53、范科尼贫血互补组D2(FANCD》(1.le_5),以及膦-有丝分裂原活化的蛋白激酶活化的蛋白激酶2(pMK2)、p53、范科尼贫血互补组D2(FANCD2)、乳腺癌易感基因1(BRCAl)(2.64e_6)。在两个例子中,利用一条黑色的虚线对存在于所述的研究中的全部患者进行划线分割,并且所描述的4-标记物模型能够对与所述的全部患者的趋势截然不同的患者亚组进行识别。多重标记物剖分模型被进一步的扩大,从而包括三种标记物的组合,以及四种标记物的组合。针对所述的头颈癌标记物(HNCMARKERS)以及通过统计学数值区分优先次序的所述列表对三种标记物的剖分模型进行计算(表格4)。在一个实施例中,与单一的标记物模型相比,高RAD51、乳腺癌易感基因I(BRCAl)以及范科尼贫血互补组D2(FANCD2)与较好的存活率结果相关,其具有1.22e-4的P值以及0.84的曲线下面积(AUC)(表格幻。此外,在整体存活率分析中对所有的三种标记物模型进行了共同的分析,用以辨别经过同步化学放射性疗法之后的良好的存活组与差的存活组。为了证明多重头颈癌标记物(HNCMARKERQ能够表现出超越单一标记物的提高的性能,针对来自于所述的六个统计学数值以及对所述的1-标记物模型、2-标记物模型、3-标记物模型及4-标记物模型所进行的比较进行所述的剖分分析输出值评价,其中所述的模型是由存在于同步化学放射性疗法研究中的所述头颈癌标记物(HNCMARKERQ组形成的(表格2-。所述的结果表明根据下述的数值P值,相对危险,阳性预测值,特异性,以及外视错误率(AER),在所述的模型中来自于这个组中的所述标记物的数量的增加能够导致性能的增强,其中3-标记物模型、4-标记物模型以及5-标记物模型具有明显的优越性并52且并不是所述的1-标记物模型的重叠。因此,与单个的头颈癌标记物(HNCMARKER)相比,所述的四种头颈癌标记物(HNCMARKER)测试以及所述的五种头颈癌标记物(HNCMARKER)测试给出了更佳的判断以及更少的误差。_仿丨丨4·X糊碰示適(HNCMARKERS)傭舰趣众子讓舌舰讓舌会目傭捕白侧丨丨,讓■患触Ml独立的执行一种概率分析的统计学过程,用以对存在于同步化学放射性疗法研究之中的所述头颈癌标记物(HNCMARKERQ进行比较。建立一种操作步骤,用以对患者在死亡组或者存活组中的定位进行检查,这是通过在每一个组中对观察到标记物的评价的概率进行检查的方式来实现的(附图6)。在这项操作步骤中,我们对在上述的分析中所使用到的对组的属籍的定义进行了精确处理,这是通过除了对所述的死亡的高发病区域进行定义之外,还对死亡的低发病区域进行定义的方式来实现的。使用多变量概率分布为所述的可能死亡组以及不可能死亡组进行这些区域的构建,通过所述的各个组的概率能够构建出一个反映组的属籍(groupmembership)的单一得分。用于构建这种概率分布的一种方法是使用所述概率的参数性估算值,即,正态分布。另外一种方法是使用所述的概率密度的非参数性(分布无关性)估算值,其中所述的概率密度是针对每一组而言的。参数件方法(ιΗ杰分布)的理论以及计算通过对两个组进行平均向量μ以及协方差矩阵Σ的测量,在给定所述的标记物数值X的条件下,可以对所述的不可能复发组的概率密度函数fnl(x)以及所述的可能复发组的概率密度函数f\(x)进行评价。权利要求1.一种对治疗方案的有效性进行评价的方法,所述的治疗方法用于对患有头颈癌的宿主进行治疗,所述的方法包括a)对来自于所述的宿主的样本之中的一种或者多种有效剂量的头颈癌标记物所具有的水平进行探测,并且b)将所述的一种或者多种有效剂量的头颈癌标记物所具有的水平与一种参考值进行比较。2.一种对宿主的治疗方案进行监测的方法,其中所述的宿主患有头颈癌,所述的方法包括a)在第一个时间段内,对来自于所述的宿主的第一个样本之中的一种或者多种有效剂量的头颈癌标记物所具有的水平进行探测;b)在第二个时间段内,对来自于所述的宿主的第二个样本之中的一种或者多种有效剂量的头颈癌标记物所具有的水平进行探测;c)将在步骤(a)中探测到的所述的一种或者多种有效剂量的头颈癌标记物所具有的水平与在步骤(b)中探测到的所述剂量进行比较,或者与一种参考值进行比较。3.一种确定宿主是否能够从一项治疗方案中获得益处的方法,其中所述的宿主患有头颈癌,所述的方法包括a)对一种或者多种有效剂量的头颈癌标记物所具有的水平进行探测,并且b)将在步骤(a)中探测到的所述的一种或者多种有效剂量的头颈癌标记物所具有的水平与一种参考值进行比较。4.一种用于预测被诊断为头颈癌的宿主的存活能力的方法,所述的方法包括a)对来自于所述的宿主的样本之中的一种或者多种有效剂量的头颈癌标记物所具有的水平进行探测,并且b)将所述的一种或者多种有效剂量的头颈癌标记物所具有的水平与一种参考值进行比较。5.根据权利要求4中所述的方法,其中所述的宿主已经接受了针对头颈癌的治疗。6.根据权利要求5中所述的方法,其中所述的治疗是免疫疗法,诱导化学疗法,同步化学放射性疗法或者是上述疗法的组合。7.根据权利要求4中所述的方法,其中所述的头颈癌标记物选自由下述标记物所组成的组中着色性干皮病D组蛋白,范科尼贫血互补组D2,RAD51,乳腺癌易感基因1,细胞周期关卡基因蛋白,聚二磷酸腺苷核糖,P53,核苷酸切除修复交叉互补组1,磷酸化H2AX,以及膦-有丝分裂原活化的蛋白激酶活化的蛋白激酶2。8.根据权利要求7中所述的方法,包括对下述标记物进行探测a)着色性干皮病D组蛋白以及至少一种选自由下述物质所组成的组中的头颈癌标记物范科尼贫血互补组D2,膦-有丝分裂原活化的蛋白激酶活化的蛋白激酶2(pMK2),磷酸化H2AX,乳腺癌易感基因1,聚二磷酸腺苷核糖,细胞周期关卡基因蛋白,核苷酸切除修复交叉互补组1,RAD51,p53,多角体蛋白基因,MUS81,pl6,以及人类乳头瘤病毒;b)范科尼贫血互补组D2以及至少一种选自由下述物质所组成的组中的头颈癌标记物着色性干皮病D组蛋白,膦-有丝分裂原活化的蛋白激酶活化的蛋白激酶2(pMK2),磷酸化H2AX,乳腺癌易感基因1,聚二磷酸腺苷核糖,细胞周期关卡基因蛋白,核苷酸切除修复交叉互补组1,RAD51,p53,多角体蛋白基因,MUS81,pl6,以及人类乳头瘤病毒;c)膦-有丝分裂原活化的蛋白激酶活化的蛋白激酶2(pMK2)以及至少一种选自由下述物质所组成的组中的头颈癌标记物着色性干皮病D组蛋白,范科尼贫血互补组D2,磷酸化H2AX,乳腺癌易感基因1,聚二磷酸腺苷核糖,细胞周期关卡基因蛋白,核苷酸切除修复交叉互补组1,RAD51,p53,多角体蛋白基因,MUS81,pl6,以及人类乳头瘤病毒;d)磷酸化H2AX以及至少一种选自由下述物质所组成的组中的头颈癌标记物着色性干皮病D组蛋白,范科尼贫血互补组D2,膦-有丝分裂原活化的蛋白激酶活化的蛋白激酶2(pMK2),乳腺癌易感基因1,聚二磷酸腺苷核糖,细胞周期关卡基因蛋白,核苷酸切除修复交叉互补组1,RAD51,p53,多角体蛋白基因,MUS81,pl6,以及人类乳头瘤病毒;e)乳腺癌易感基因1以及至少一种选自由下述物质所组成的组中的头颈癌标记物着色性干皮病D组蛋白,范科尼贫血互补组D2,膦-有丝分裂原活化的蛋白激酶活化的蛋白激酶2(pMK2),磷酸化H2AX,聚二磷酸腺苷核糖,细胞周期关卡基因蛋白,核苷酸切除修复交叉互补组1,RAD51,p53,多角体蛋白基因,MUS81,pl6,以及人类乳头瘤病毒;f)聚二磷酸腺苷核糖以及至少一种选自由下述物质所组成的组中的头颈癌标记物着色性干皮病D组蛋白,范科尼贫血互补组D2,膦-有丝分裂原活化的蛋白激酶活化的蛋白激酶2(pMK2),磷酸化H2AX,乳腺癌易感基因1,细胞周期关卡基因蛋白,核苷酸切除修复交叉互补组1,RAD51,p53,多角体蛋白基因,MUS81,pl6,以及人类乳头瘤病毒;g)细胞周期关卡基因蛋白以及至少一种选自由下述物质所组成的组中的头颈癌标记物着色性干皮病D组蛋白,范科尼贫血互补组D2,膦-有丝分裂原活化的蛋白激酶活化的蛋白激酶2(pMK2),磷酸化H2AX,乳腺癌易感基因1,聚二磷酸腺苷核糖,核苷酸切除修复交叉互补组1,RAD51,p53,多角体蛋白基因,MUS81,pl6,以及人类乳头瘤病毒;h)核苷酸切除修复交叉互补组1以及至少一种选自由下述物质所组成的组中的头颈癌标记物着色性干皮病D组蛋白,范科尼贫血互补组D2,膦-有丝分裂原活化的蛋白激酶活化的蛋白激酶2(pMK2),磷酸化H2AX,乳腺癌易感基因1,聚二磷酸腺苷核糖,细胞周期关卡基因蛋白,RAD51,p53,多角体蛋白基因,MUS81,pl6,以及人类乳头瘤病毒;i)RAD51以及至少一种选自由下述物质所组成的组中的头颈癌标记物着色性干皮病D组蛋白,范科尼贫血互补组D2,膦-有丝分裂原活化的蛋白激酶活化的蛋白激酶2(pMK2),磷酸化H2AX,乳腺癌易感基因1,聚二磷酸腺苷核糖,细胞周期关卡基因蛋白,核苷酸切除修复交叉互补组1,P53,多角体蛋白基因,MUS81,pl6,以及人类乳头瘤病毒;j)p53以及至少一种选自由下述物质所组成的组中的头颈癌标记物着色性干皮病D组蛋白,范科尼贫血互补组D2,膦-有丝分裂原活化的蛋白激酶活化的蛋白激酶2(pMK2),磷酸化H2AX,乳腺癌易感基因1,聚二磷酸腺苷核糖,细胞周期关卡基因蛋白,核苷酸切除修复交叉互补组1,RAD51,多角体蛋白基因,MUS81,pl6,以及人类乳头瘤病毒;k)多角体蛋白基因以及至少一种选自由下述物质所组成的组中的头颈癌标记物着色性干皮病D组蛋白,范科尼贫血互补组D2,膦-有丝分裂原活化的蛋白激酶活化的蛋白激酶2(pMK2),磷酸化H2AX,乳腺癌易感基因1,聚二磷酸腺苷核糖,细胞周期关卡基因蛋白,核苷酸切除修复交叉互补组1,RAD51,p53,MUS81,ρ16,以及人类乳头瘤病毒;DMUS81以及至少一种选自由下述物质所组成的组中的头颈癌标记物着色性干皮病D组蛋白,范科尼贫血互补组D2,膦-有丝分裂原活化的蛋白激酶活化的蛋白激酶2(ρΜΚ2),磷酸化H2AX,乳腺癌易感基因1,聚二磷酸腺苷核糖,细胞周期关卡基因蛋白,核苷酸切除修复交叉互补组1,RAD51,p53,多角体蛋白基因,pl6,以及人类乳头瘤病毒;m)pl6以及至少一种选自由下述物质所组成的组中的头颈癌标记物着色性干皮病D组蛋白,范科尼贫血互补组D2,膦-有丝分裂原活化的蛋白激酶活化的蛋白激酶2(pMK2),磷酸化H2AX,乳腺癌易感基因1,聚二磷酸腺苷核糖,细胞周期关卡基因蛋白,核苷酸切除修复交叉互补组l,RAD51,p53,多角体蛋白基因,MUS81,以及人类乳头瘤病毒;η)人类乳头瘤病毒以及至少一种选自由下述物质所组成的组中的头颈癌标记物着色性干皮病D组蛋白,范科尼贫血互补组D2,膦-有丝分裂原活化的蛋白激酶活化的蛋白激酶2(ρΜΚ2),磷酸化Η2ΑΧ,乳腺癌易感基因1,聚二磷酸腺苷核糖,细胞周期关卡基因蛋白,核苷酸切除修复交叉互补组1,RAD51,ρ53,多角体蛋白基因,MUS81,以及ρ16。9.根据权利要求4中所述的方法,包括对下述标记物进行测量a)着色性干皮病D组蛋白以及至少两种选自由下述物质所组成的组中的头颈癌标记物范科尼贫血互补组D2,膦-有丝分裂原活化的蛋白激酶活化的蛋白激酶2(pMK2),磷酸化H2AX,乳腺癌易感基因1,聚二磷酸腺苷核糖,细胞周期关卡基因蛋白,核苷酸切除修复交叉互补组1,RAD51,p53,多角体蛋白基因,MUS81,pl6,以及人类乳头瘤病毒;b)范科尼贫血互补组D2以及至少两种选自由下述物质所组成的组中的头颈癌标记物着色性干皮病D组蛋白,膦-有丝分裂原活化的蛋白激酶活化的蛋白激酶2(pMK2),磷酸化H2AX,乳腺癌易感基因1,聚二磷酸腺苷核糖,细胞周期关卡基因蛋白,核苷酸切除修复交叉互补组1,RAD51,p53,多角体蛋白基因,MUS81,pl6,以及人类乳头瘤病毒;c)膦-有丝分裂原活化的蛋白激酶活化的蛋白激酶2(pMK2)以及至少两种选自由下述物质所组成的组中的头颈癌标记物着色性干皮病D组蛋白,范科尼贫血互补组D2,磷酸化H2AX,乳腺癌易感基因1,聚二磷酸腺苷核糖,细胞周期关卡基因蛋白,核苷酸切除修复交叉互补组1,RAD51,p53,多角体蛋白基因,MUS81,pl6,以及人类乳头瘤病毒;d)磷酸化H2AX以及至少两种选自由下述物质所组成的组中的头颈癌标记物着色性干皮病D组蛋白,范科尼贫血互补组D2,膦-有丝分裂原活化的蛋白激酶活化的蛋白激酶2(pMK2),乳腺癌易感基因1,聚二磷酸腺苷核糖,细胞周期关卡基因蛋白,核苷酸切除修复交叉互补组1,RAD51,p53,多角体蛋白基因,MUS81,pl6,以及人类乳头瘤病毒;e)乳腺癌易感基因1以及至少两种选自由下述物质所组成的组中的头颈癌标记物着色性干皮病D组蛋白,范科尼贫血互补组D2,膦-有丝分裂原活化的蛋白激酶活化的蛋白激酶2(pMK2),磷酸化H2AX,聚二磷酸腺苷核糖,细胞周期关卡基因蛋白,核苷酸切除修复交叉互补组1,RAD51,p53,多角体蛋白基因,MUS81,pl6,以及人类乳头瘤病毒;f)聚二磷酸腺苷核糖以及至少两种选自由下述物质所组成的组中的头颈癌标记物着色性干皮病D组蛋白,范科尼贫血互补组D2,膦-有丝分裂原活化的蛋白激酶活化的蛋白激酶2(pMK2),磷酸化H2AX,乳腺癌易感基因1,细胞周期关卡基因蛋白,核苷酸切除修复交叉互补组1,RAD51,p53,多角体蛋白基因,MUS81,pl6,以及人类乳头瘤病毒;g)细胞周期关卡基因蛋白以及至少两种选自由下述物质所组成的组中的头颈癌标记物着色性干皮病D组蛋白,范科尼贫血互补组D2,膦-有丝分裂原活化的蛋白激酶活化的蛋白激酶2(pMK2),磷酸化H2AX,乳腺癌易感基因1,聚二磷酸腺苷核糖,核苷酸切除修复交叉互补组1,RAD51,p53,多角体蛋白基因,MUS81,pl6,以及人类乳头瘤病毒;h)核苷酸切除修复交叉互补组1以及至少两种选自由下述物质所组成的组中的头颈癌标记物着色性干皮病D组蛋白,范科尼贫血互补组D2,膦-有丝分裂原活化的蛋白激酶活化的蛋白激酶2(pMK2),磷酸化H2AX,乳腺癌易感基因1,聚二磷酸腺苷核糖,细胞周期关卡基因蛋白,RAD51,p53,多角体蛋白基因,MUS81,pl6,以及人类乳头瘤病毒;i)RAD51以及至少两种选自由下述物质所组成的组中的头颈癌标记物着色性干皮病D组蛋白,范科尼贫血互补组D2,膦-有丝分裂原活化的蛋白激酶活化的蛋白激酶2(pMK2),磷酸化H2AX,乳腺癌易感基因1,聚二磷酸腺苷核糖,细胞周期关卡基因蛋白,核苷酸切除修复交叉互补组1,P53,多角体蛋白基因,MUS81,pl6,以及人类乳头瘤病毒;j)p53以及至少两种选自由下述物质所组成的组中的头颈癌标记物着色性干皮病D组蛋白,范科尼贫血互补组D2,膦-有丝分裂原活化的蛋白激酶活化的蛋白激酶2(pMK2),磷酸化H2AX,乳腺癌易感基因1,聚二磷酸腺苷核糖,细胞周期关卡基因蛋白,核苷酸切除修复交叉互补组1,RAD51,多角体蛋白基因,MUS81,pl6,以及人类乳头瘤病毒;k)多角体蛋白基因以及至少两种选自由下述物质所组成的组中的头颈癌标记物着色性干皮病D组蛋白,范科尼贫血互补组D2,膦-有丝分裂原活化的蛋白激酶活化的蛋白激酶2(pMK2),磷酸化H2AX,乳腺癌易感基因1,聚二磷酸腺苷核糖,细胞周期关卡基因蛋白,核苷酸切除修复交叉互补组1,RAD51,p53,MUS81,ρ16,以及人类乳头瘤病毒;DMUS81以及至少两种选自由下述物质所组成的组中的头颈癌标记物着色性干皮病D组蛋白,范科尼贫血互补组D2,膦-有丝分裂原活化的蛋白激酶活化的蛋白激酶2(ρΜΚ2),磷酸化Η2ΑΧ,乳腺癌易感基因1,聚二磷酸腺苷核糖,细胞周期关卡基因蛋白,核苷酸切除修复交叉互补组1,RAD51,ρ53,多角体蛋白基因,ρ16,以及人类乳头瘤病毒;m)pl6以及至少两种选自由下述物质所组成的组中的头颈癌标记物着色性干皮病D组蛋白,范科尼贫血互补组D2,膦-有丝分裂原活化的蛋白激酶活化的蛋白激酶2(pMK2),磷酸化H2AX,乳腺癌易感基因1,聚二磷酸腺苷核糖,细胞周期关卡基因蛋白,核苷酸切除修复交叉互补组l,RAD51,p53,多角体蛋白基因,MUS81,以及人类乳头瘤病毒;η)人类乳头瘤病毒以及至少两种选自由下述物质所组成的组中的头颈癌标记物着色性干皮病D组蛋白,范科尼贫血互补组D2,膦-有丝分裂原活化的蛋白激酶活化的蛋白激酶2(ρΜΚ2),磷酸化Η2ΑΧ,乳腺癌易感基因1,聚二磷酸腺苷核糖,细胞周期关卡基因蛋白,核苷酸切除修复交叉互补组1,肌051,?53,多角体蛋白基因^旧81,以及?16。10.根据权利要求4中所述的方法,包括对下述标记物进行测量a)着色性干皮病D组蛋白以及至少三种选自由下述物质所组成的组中的头颈癌标记物范科尼贫血互补组D2,膦-有丝分裂原活化的蛋白激酶活化的蛋白激酶2(pMK2),磷酸化H2AX,乳腺癌易感基因1,聚二磷酸腺苷核糖,细胞周期关卡基因蛋白,核苷酸切除修复交叉互补组1,RAD51,p53,多角体蛋白基因,MUS81,pl6,以及人类乳头瘤病毒;b)范科尼贫血互补组D2以及至少三种选自由下述物质所组成的组中的头颈癌标记物着色性干皮病D组蛋白,膦-有丝分裂原活化的蛋白激酶活化的蛋白激酶2(pMK2),磷酸化H2AX,乳腺癌易感基因1,聚二磷酸腺苷核糖,细胞周期关卡基因蛋白,核苷酸切除修复交叉互补组1,RAD51,p53,多角体蛋白基因,MUS81,pl6,以及人类乳头瘤病毒;c)膦-有丝分裂原活化的蛋白激酶活化的蛋白激酶2(pMK2)以及至少三种选自由下述物质所组成的组中的头颈癌标记物着色性干皮病D组蛋白,范科尼贫血互补组D2,磷酸化H2AX,乳腺癌易感基因1,聚二磷酸腺苷核糖,细胞周期关卡基因蛋白,核苷酸切除修复交叉互补组1,RAD51,p53,多角体蛋白基因,MUS81,pl6,以及人类乳头瘤病毒;d)磷酸化H2AX以及至少三种选自由下述物质所组成的组中的头颈癌标记物着色性干皮病D组蛋白,范科尼贫血互补组D2,膦-有丝分裂原活化的蛋白激酶活化的蛋白激酶2(pMK2),乳腺癌易感基因1,聚二磷酸腺苷核糖,细胞周期关卡基因蛋白,核苷酸切除修复交叉互补组1,RAD51,p53,多角体蛋白基因,MUS81,pl6,以及人类乳头瘤病毒;e)乳腺癌易感基因1以及至少三种选自由下述物质所组成的组中的头颈癌标记物着色性干皮病D组蛋白,范科尼贫血互补组D2,膦-有丝分裂原活化的蛋白激酶活化的蛋白激酶2(pMK2),磷酸化H2AX,聚二磷酸腺苷核糖,细胞周期关卡基因蛋白,核苷酸切除修复交叉互补组1,RAD51,p53,多角体蛋白基因,MUS81,pl6,以及人类乳头瘤病毒;f)聚二磷酸腺苷核糖以及至少三种选自由下述物质所组成的组中的头颈癌标记物着色性干皮病D组蛋白,范科尼贫血互补组D2,膦-有丝分裂原活化的蛋白激酶活化的蛋白激酶2(pMK2),磷酸化H2AX,乳腺癌易感基因1,细胞周期关卡基因蛋白,核苷酸切除修复交叉互补组1,RAD51,p53,多角体蛋白基因,MUS81,pl6,以及人类乳头瘤病毒;g)细胞周期关卡基因蛋白以及至少三种选自由下述物质所组成的组中的头颈癌标记物着色性干皮病D组蛋白,范科尼贫血互补组D2,膦-有丝分裂原活化的蛋白激酶活化的蛋白激酶2(pMK2),磷酸化H2AX,乳腺癌易感基因1,聚二磷酸腺苷核糖,核苷酸切除修复交叉互补组1,RAD51,p53,多角体蛋白基因,MUS81,pl6,以及人类乳头瘤病毒;h)核苷酸切除修复交叉互补组1以及至少三种选自由下述物质所组成的组中的头颈癌标记物着色性干皮病D组蛋白,范科尼贫血互补组D2,膦-有丝分裂原活化的蛋白激酶活化的蛋白激酶2(pMK2),磷酸化H2AX,乳腺癌易感基因1,聚二磷酸腺苷核糖,细胞周期关卡基因蛋白,RAD51,p53,多角体蛋白基因,MUS81,pl6,以及人类乳头瘤病毒;i)RAD51以及至少三种选自由下述物质所组成的组中的头颈癌标记物着色性干皮病D组蛋白,范科尼贫血互补组D2,膦-有丝分裂原活化的蛋白激酶活化的蛋白激酶2(pMK2),磷酸化H2AX,乳腺癌易感基因1,聚二磷酸腺苷核糖,细胞周期关卡基因蛋白,核苷酸切除修复交叉互补组1,P53,多角体蛋白基因,MUS81,pl6,以及人类乳头瘤病毒;j)p53以及至少三种选自由下述物质所组成的组中的头颈癌标记物着色性干皮病D组蛋白,范科尼贫血互补组D2,膦-有丝分裂原活化的蛋白激酶活化的蛋白激酶2(pMK2),磷酸化H2AX,乳腺癌易感基因1,聚二磷酸腺苷核糖,细胞周期关卡基因蛋白,核苷酸切除修复交叉互补组1,RAD51,多角体蛋白基因,MUS81,pl6,以及人类乳头瘤病毒;k)多角体蛋白基因以及至少三种选自由下述物质所组成的组中的头颈癌标记物着色性干皮病D组蛋白,范科尼贫血互补组D2,膦-有丝分裂原活化的蛋白激酶活化的蛋白激酶2(pMK2),磷酸化H2AX,乳腺癌易感基因1,聚二磷酸腺苷核糖,细胞周期关卡基因蛋白,核苷酸切除修复交叉互补组1,RAD51,p53,MUS81,ρ16,以及人类乳头瘤病毒;DMUS81以及至少三种选自由下述物质所组成的组中的头颈癌标记物着色性干皮病D组蛋白,范科尼贫血互补组D2,膦-有丝分裂原活化的蛋白激酶活化的蛋白激酶2(ρΜΚ2),磷酸化Η2ΑΧ,乳腺癌易感基因1,聚二磷酸腺苷核糖,细胞周期关卡基因蛋白,核苷酸切除修复交叉互补组1,RAD51,ρ53,多角体蛋白基因,ρ16,以及人类乳头瘤病毒;m)pl6以及至少三种选自由下述物质所组成的组中的头颈癌标记物着色性干皮病D组蛋白,范科尼贫血互补组D2,膦-有丝分裂原活化的蛋白激酶活化的蛋白激酶2(pMK2),磷酸化H2AX,乳腺癌易感基因1,聚二磷酸腺苷核糖,细胞周期关卡基因蛋白,核苷酸切除修复交叉互补组l,RAD51,p53,多角体蛋白基因,MUS81,以及人类乳头瘤病毒;η)人类乳头瘤病毒以及至少三种选自由下述物质所组成的组中的头颈癌标记物着色性干皮病D组蛋白,范科尼贫血互补组D2,膦-有丝分裂原活化的蛋白激酶活化的蛋白激酶2(ρΜΚ2),磷酸化Η2ΑΧ,乳腺癌易感基因1,聚二磷酸腺苷核糖,细胞周期关卡基因蛋白,核苷酸切除修复交叉互补组1,RAD51,ρ53,多角体蛋白基因,MUS81,以及ρ16。11.一种确定头颈癌对化学治疗试剂所具有的敏感度的方法,所述的方法包括对至少一种头颈癌标记物所发生的改变进行识别,其中所述的改变的存在表明了所述的细胞对一种化学治疗试剂而言是敏感的。12.一种确定头颈癌对化学治疗试剂所具有的抗性的方法,所述的方法包括对至少一种头颈癌标记物所发生的改变进行识别,其中所述的改变的缺失表明了所述的细胞对一种化学治疗试剂而言是具有抗性的。13.根据权利要求11中所述的方法,其中所述的改变是增加或者减少。14.根据权利要求11中所述的方法,其中所述的改变是通过对存在于一种头颈癌标记物中的变化进行探测的方式来确定的。15.根据权利要求11中所述的方法,其中所述的改变是通过对一种头颈癌标记物的翻译后修饰进行探测的方式来确定的。16.根据权利要求15中所述的方法,其中所述的翻译后修饰选自由下述作用所组成的组中磷酸化作用,泛素化作用,类泛素化作用,乙酰基化作用,烷基化作用,甲基化作用,氨基乙酰基化作用,糖基化作用,异戊二烯化作用,脂化作用,磷酸泛酰巯基乙胺基化作用,硫酸盐化作用,硒化作用以及C-末端的酰胺化作用。17.根据权利要求1、2或者3中所述的方法,其中所述的治疗方案是免疫疗法,诱导化学疗法,同步化学放射性疗法或者是上述疗法的组合。18.根据权利要求17中所述的方法,其中所述的化学疗法或者化学放射性疗法包括卡波钼,或者相关类型的钼类药物中的一种,紫杉烷,或者紫杉烷类型中的一种,或者两种同时存在。19.根据权利要求17中所述的方法,其中所述的免疫疗法是西妥昔单克隆抗体。20.一种来源于表格1以及表格2中所列出的生物标记物的运算法则,所述的运算法则中指定了所述的生物标记物与存在于所述小组中的其他生物标记物之间具有怎样的相关性,这样一来所述的生物标记物运算法则表示出了在头颈癌的治疗应答中的一种预测值或者预后值。全文摘要本发明提供了用以治疗癌症的组合物以及方法,以及用以对一种癌症细胞针对一种治疗性的化合物所具有的应答性进行评价/监测的方法。文档编号C12Q1/68GK102439168SQ200980127493公开日2012年5月2日申请日期2009年5月14日优先权日2008年5月14日发明者D·T·韦乌尔,K·M·斯波特,王晓哲申请人:迪纳公司
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