NFKBIZ基因在垂体腺瘤生物标记中的应用及表达的制作方法

文档序号:14827958发布日期:2018-06-30 09:14阅读:435来源:国知局

本发明涉及NFKBIZ基因在垂体腺瘤生物标记中的应用及表达,具体为天然核糖核苷酸的用途技术领域。



背景技术:

垂体腺瘤(简称垂体瘤)是人类最常见的颅内肿瘤之一,约占颅内肿瘤的10%~15%。垂体瘤在组织学上属于良性肿瘤,但有些垂体瘤呈侵袭性生长,包绕或侵犯周围组织结构,该部分肿瘤手术难以彻底切除,是肿瘤复发的主要原因之一。根据垂体瘤的生物学行为可分为非侵袭性垂体瘤、侵袭性垂体瘤和垂体癌。侵袭性垂体瘤介于非侵袭性垂体瘤和垂体癌之间,其组织学形态属于良性,生物学特征却似恶性。侵袭性与非侵袭性垂体腺瘤的临床表现、预后均明显不同。侵袭性垂体腺瘤的坏死、卒中、囊变发生率明显高于非侵袭性垂体腺瘤。侵袭性生长使得外科手术难以做到全切肿瘤,而常用药物溴隐停、生长抑素对这类肿瘤的疗效较差;侵袭性生长同样限制了其对放疗的敏感性,且鞍区放疗容易导致正常垂体、下丘脑及视神经等重要结构的损伤。这些因素导致侵袭性垂体腺瘤术后复发率高,肿瘤残余组织增长快。显而易见,对侵袭性垂体瘤的治疗是神经外科领域和肿瘤治疗领域面临的巨大挑战。因此,寻找与垂体腺瘤侵袭性相关的分子标记对于及时治疗和改善预后至关重要。

NFKBIZ基因编码Iκ Bζ蛋白,是能够抑制NF κB蛋白功能及其信号通路的因子之一。Iκ Bζ蛋白通过将NF κ B隔离在胞浆以失活其功能,从而调控NF κB下游基因的表达,影响肿瘤生长、凋亡及分化等生物学行为。在脑胶质瘤中NFKBIZ基因编码的Iκ Bζ蛋白能够作为致癌因子促进肿瘤恶性生长。本发明利用实时定量PCR的方法,检测分析NFKBIZ基因与垂体腺瘤侵袭性有很好相关性,可用于制备垂体腺瘤辅助诊断或者预后判断制剂。



技术实现要素:

本发明的目的在于提供NFKBIZ基因在垂体腺瘤生物标记中的应用及表达。

为实现上述目的,本发明提供如下技术方案:NFKBIZ基因在垂体腺瘤生物标记中的应用,提供NFKBIZ基因编码Iκ Bζ蛋白,通过将NF κB隔离在胞浆以失活其功能,从而调控NF κB下游基因的表达,用于鉴别可能患有垂体腺瘤的对象或垂体腺瘤的侵袭性。

所述方法包括检测来自所述对象的垂体腺瘤组织样本中NFKBIZ的表达量,其中较高量的NFKBIZ为所述对象垂体腺瘤侵袭性强,并与所述对象预后不良可能性增加有关。

本发明还提供NFKBIZ基因在垂体腺瘤生物标记中表达,所述的表达方法包含以下步骤:

步骤一、侵袭性和非侵袭性垂体腺瘤组织RNA提取;

步骤二、总RNA反转录cDNA;

步骤三、将cDNA进行定时定量PCR检测,反应结束后检测样品中NFKBIZ的PCR识别序列,然后与PCR产物序列结果进行对比可知NFKBIZ在垂体腺瘤组织中进行表达。

进一步优选,所述的步骤一中侵袭性和非侵袭性垂体腺瘤组织RNA提取方法是相同的,具体提取方法为:称取2克组织材料,加入250微升RNAiso Plus,手持电动器研磨后,转移至1.5毫升RNase-free的离心管中,12000转4℃离心10分钟,去上清200微升加入1.5毫升RNase-free的离心管中,加入1毫升RNAiso P lus新混匀后室温静置5分钟。加入200微升的氯仿,充分混匀后,室温静置3分钟,12000转4℃离心15分钟,取上清250ul,加入500微升异丙醇混匀后室温静置10分钟,12000转4℃离心10分钟。弃掉上清,加入75%乙醇,颠倒混匀后,7500转4℃离心5分钟,弃掉上清,室温静置5分钟,加入15-20微升Nuclease-Free water溶解。Nanodrop测算所得液体的OD值及浓度。

进一步优选,所述的步骤二中总RNA反转录cDNA的方法为:按照反转录试剂盒PrimeScriptTM RT reagent Kit with gDNA Eraser说明,加入1微克RNA进行基因组DNA的去除,具体加入DNA酶、反应缓冲液及Nuclease-Free水补齐10微升反应体系,PCR仪42℃孵育2分钟。而后进行反转录,具体加入反转录所需的随机引物,缓冲液、反转录酶及Nuclease-Free水补齐20微升反应体系,PCR仪37℃孵育15分钟,85℃孵育30秒,4℃保温,将反转录产物1∶10稀释,在冰上制备qPCR混合物。

作为优选,所述的步骤三中将cDNA进行定时定量PCR检测反应条件如下:首先95℃下预变性30秒,然后95℃变性5秒,56℃退火30秒,72℃延伸30秒,40个循环,热融解阶段95℃下变性60秒,56℃下热融解30秒,95℃热融解30秒。

本发明的有益效果是:(1)提出了NFKBIZ基因的用途。(2)本发明的研究表明异常量的NFKBIZ为所述对象垂体腺瘤侵袭性强,并与所述对象预后不良可能性增加有关。(3)NFKBIZ基因在侵袭性垂体腺瘤与非侵袭性垂体腺瘤病人组织中表达量存在差异,因此NFKBIZ基因具有成为垂体腺瘤生物标志物的应用前景。

附图说明

图1为使用NFKBIZ筛查引物对垂体腺瘤患者组织样本表达量筛选结果图。

具体实施方式

下面将结合本发明实施例中的附图,对本发明实施例中的技术方案进行清楚、完整地描述,显然,所描述的实施例仅仅是本发明一部分实施例,而不是全部的实施例。基于本发明中的实施例,本领域普通技术人员在没有做出创造性劳动前提下所获得的所有其他实施例,都属于本发明保护的范围。下面结合具体实施方式对本发明进行进一步描述

1、实验材料,临床样品:19例垂体腺瘤(8例侵袭性垂体腺瘤,9例非侵袭性垂体腺瘤)组织样本有大连医科大学附属第二医院所提供。

试剂:NFKBIZ筛查引物由Invitrogen公司合成;

RNAiso Plus(货号9109)购自Takara公司;

氯仿购自永大化学试剂(天津)有限公司;

异丙醇购自永大化学试剂(天津)有限公司;

乙醇购自国药集团化学试剂有限公司;

反转录试剂盒PrimeScriptTM RT reagent Kit with gDNA Eraser(货号:RR047Q)购自Takara公司;

SuperReal PreMix Plus(SYBR Green)(货号:FP205-02)购自天根生化科技(北京)有限公司;

Nuclease-Free water(货号RT121)购自根生化科技(北京)有限公司。

2、实验方法,称取2克组织材料,加入250微升RNAiso Plus,手持电动器研磨后,转移至1.5毫升RNase-free的离心管中,12000转4℃离心10分钟,去上清200微升加入1.5毫升RNase-free的离心管中,加入1毫升RNAiso Plus新混匀后室温静置5分钟。加入200微升的氯仿,充分混匀后,室温静置3分钟,12000转4℃离心15分钟,取上清250ul,加入500微升异丙醇混匀后室温静置10分钟,12000转4℃离心10分钟。弃掉上清,加入75%乙醇,颠倒混匀后,7500转4℃离心5分钟,弃掉上清,室温静置5分钟,加入15-20微升Nuclease-Free water溶解。Nanodrop测算所得液体的OD值及浓度。

3、表达量筛查,按照反转录试剂盒PrimeScriptTM RT reagentKit with gDNA Eraser说明,加入1微克RNA进行基因组DNA的去除,具体加入DNA酶、反应缓冲液及Nuclease-Free水补齐10微升反应体系,PCR仪42℃孵育2分钟。而后进行反转录,具体加入反转录所需的随机引物,缓冲液、反转录酶及Nuclease-Free水补齐20微升反应体系,PCR仪37℃孵育15分钟,85℃孵育30秒,4℃保温。

配置反应混合物

去基因组DNA

B.Real-Time PCR(SYRB Green法)

将反转录产物1∶10稀释,在冰上制备qPCR混合物:

将样品放入qPCR仪器中运行,程序如下

4、实验结果,图1为使用NFKBIZ筛查引物对垂体腺瘤患者样品表达量筛查的结果图。实验结果表明NFKBIZ基因在侵袭性垂体腺瘤中的表达显著升高,平均表达量(Ct值)差-2.162,相当于侵袭性垂体腺瘤中NFKBIZ的表达量是非侵袭性垂体腺瘤中的4.47倍。如此大的表达差异给了NFKBIZ作为侵袭性垂体腺瘤生物标记物的应用前景。

尽管已经示出和描述了本发明的实施例,对于本领域的普通技术人员而言,可以理解在不脱离本发明的原理和精神的情况下可以对这些实施例进行多种变化、修改、替换和变型,本发明的范围由所附权利要求及其等同物限定。

序列表

<110> 大连医科大学附属第二医院

<120> NFKBIZ基因在垂体腺瘤生物标记中的应用及表达

<141> 2018-01-04

<160> 2

<170> SIPOSequenceListing 1.0

<210> 1

<211> 3801

<212> DNA

<213> 人类(homo sapiens)

<400> 1

ctcctcttgc cacgaggtca gacggcgagt tcttagagaa aaaggctgct tagctgctgc 60

ttatcatgta acctcaaaag gaaactgatc gtctttctca tgctgtcacg tacttgggtt 120

attatcgctg attacagctg gaaacaattg atttgctctt acgtatttgt gtgacttgac 180

tcttcaaaca caaaggttaa caggaagatc tcgagggccc tggctgaact tcaccttttg 240

gctttcttgg cctgatgctg aactctcgag gttgagcccc atatgggggt tggcaggcag 300

cagagaggcc cctttcaagg tgttcgggta aagaactcag tgaaggaact cctgttgcac 360

atccgaagtc ataaacagaa ggcttctggc caagctgtgg atgattttaa gacacaaggt 420

gtgaacatag aacagttcag agaattgaag aacacagtat catacagtgg gaaaaggaaa 480

gggcccgatt cgttgtctga tggacctgct tgcaaaaggc cagctctgtt gcattcccaa 540

tttttgacac cacctcaaac accaacgccc ggggagagca tggaagatgt tcatctcaat 600

gaacccaaac aggagagcag tgctgatctg cttcagaaca ttatcaacat taagaatgaa 660

tgcagccccg tttccctgaa cacagttcaa gttagctggc tgaaccccgt ggtggtccct 720

cagagctccc ccgcagagca gtgtcaggac ttccatggag ggcaggtctt ttctccacct 780

cagaaatgcc aaccattcca agtcaggggc tcccaacaaa tgatagacca ggcttccctg 840

taccagtatt ctccacagaa ccagcatgta gagcagcagc cacactacac ccacaaacca 900

actctggaat acagtccttt tcccatacct ccccagtccc ccgcttatga accaaacctc 960

tttgatggtc cagaatcaca gttttgccca aaccaaagct tagtttccct tcttggtgat 1020

caaagggaat ctgagaatat tgctaatccc atgcagactt cctccagtgt tcagcagcaa 1080

aatgatgctc acttgcacag cttcagcatg atgcccagca gcgcctgtga ggccatggtg 1140

gggcacgaga tggcctctga ctcttcaaac acttcactgc cattctcaaa catgggaaat 1200

ccaatgaaca ccacacagtt agggaaatca ctttttcagt ggcaggtgga gcaggaagaa 1260

agcaaattgg caaatatttc ccaagaccag tttctttcaa aggatgcaga tggtgacacg 1320

ttccttcata ttgctgttgc ccaagggaga agggcacttt cctatgttct tgcaagaaag 1380

atgaatgcac ttcacatgct ggatattaaa gagcacaatg gacagagtgc ctttcaggtg 1440

gcagtggctg ccaatcagca tctcattgtg caggatctgg tgaacatcgg ggcacaggtg 1500

aacaccacag actgctgggg aagaacacct ctgcatgtgt gtgctgagaa gggccactcc 1560

caggtgcttc aggcgattca gaagggagca gtgggaagta atcagtttgt ggatcttgag 1620

gcaactaact atgatggcct gactcccctt cactgtgcag tcatagccca caatgctgtg 1680

gtccatgaac tccagagaaa tcaacagcct cattcacctg aagttcagga gcttttactg 1740

aagaataaga gtctggttga taccattaag tgcctaattc aaatgggagc agcggtggaa 1800

gcgaaggatc gcaaaagtgg ccgcacagcc ctgcatttgg cagctgaaga agcaaatctg 1860

gaactcattc gcctcttttt ggagctgccc agttgcctgt cttttgtgaa tgcaaaggct 1920

tacaatggca acactgccct ccatgttgct gccagcttgc agtatcggtt gacacaatta 1980

gatgctgtcc gcctgttgat gaggaaggga gcagacccaa gtactcggaa cttggagaac 2040

gaacagccag tgcatttggt tcccgatggc cctgtgggag aacagatccg acgtatcctg 2100

aagggaaagt ccattcagca gagagctcca ccgtattagc tccattagct tggagcctgg 2160

ctagcaacac tcactgtcag ttaggcagtc ctgatgtatc tgtacataga ccatttgcct 2220

tatattggca aatgtaagtt gtttctatga aacaaacata tttagttcac tattatatag 2280

tgggttatat taaaagaaaa gaagaaaaat atctaatttc tcttggcaga tttgcatatt 2340

tcatacccag gtatctggga tctagacatc tgaatttgat ctcaatggta acattgcctt 2400

caattaacag tagcttttga gtaggaaagg actttgattt gtggcacaaa acattattaa 2460

tatagctatt gacagtttca aagcaggtaa attgtaaatg tttctttaag aaaaagcatg 2520

tgaaaggaaa aaggtaaata cagcattgag gcttcatttg gccttagtcc ctgggagtta 2580

ctggcgttgg acaggcttca gtcattggac tagatgaaag gtgtccatgg ttagaatttg 2640

atctttgcaa actgtatata attgttattt ttgtccttaa aaatattgta catacttggt 2700

tgttaacatg gtcatatttg aaatgtataa gtccataaaa tagaaaagaa caagtgaatt 2760

gttgctattt aaaaaaattt tacaattctt actaaggagt ttttattgtg taatcactaa 2820

gtctttgtag ataaagcaga tggggagtta cggagttgtt cctttactgg ctgaaagata 2880

tattcgaatt gtaaagatgc tttttctcat gcattgaaat tatacattat ttgtagggaa 2940

ttgcatgctt tttttttttt ttctcccgag acagggtctt gctctggcgc ccaggctgga 3000

gtacagtggc atgatcttgg ctcacttcag ccttgacttg ggctcaagtg atcctcctac 3060

ctgagccttc tgagtaactg gaactacagg tgtgcactcc tcgcctggct aattttttat 3120

tttttgtaca ggcaggatct tgccaccttg cccaggctgg tcttgaactc ctgagctcat 3180

gccatctgcc tgccttagtc tcccaaaatg ctgggattac aggagtgagc caccatgccc 3240

ggctggcagt tgcatggaag agaacacctc tttatggctt accctctaga atttctaatt 3300

tatgtgttct gttgaaattt ttgttttttt acctttattg aaacaacaaa aagtcagtat 3360

tgaaacatat cttcctgttt tctgttgtca aatgatgata atgtgccatg atgttttata 3420

tatatcattc agaaaaagtt ttatttttta ataacattct attaacatta ttttgcttgc 3480

cgctggcatg cctgaggaat gtatttggct ttgattacac actaagtttt tgtaataaat 3540

ttgactcatt aaaaaccttt tttttttaaa aaaaaaaaaa aagaaaatct cattagtgaa 3600

cttatctttg cagctgagta cttaaattct ttttaaaaag ataccctttg gattgatcac 3660

attgtttgac ccagtatgtc ttgtagacac gttagttata atcaccttgt atctctaaat 3720

atggtgtgat atgaaccagt ccattcacat tggaaaaact gatggtttta aataaactaa 3780

ttcactaata ttaaaaaaaa a 3801

<210> 2

<211> 157

<212> DNA

<213> 人类(homo sapiens)

<400> 2

caaaggctta caatggcaac actgccctcc atgttgctgc cagcttgcag tatcggttga 60

cacaattaga tgctgtccgc ctgttgatga ggaagggagc agacccaagt actcggaact 120

tggagaacga acagccagtg catttggttc ccgatgg 157

当前第1页1 2 3 
网友询问留言 已有0条留言
  • 还没有人留言评论。精彩留言会获得点赞!
1