本发明属于生物技术领域,具体地说,涉及一种精确测定中华绒螯蟹线粒体全基因组序列方法以及由该方法测得的中华绒螯蟹线粒体全基因组序列。
背景技术:
线粒体具有双层膜结构以及独特的dna分子,也是动物细胞中唯一具有“染色体外”基因组的半自主性细胞器,同时其也具有完整遗传信息传递与表达系统的能力。近年来,线粒体基因组已经成为非常有特点的分子标记,因为其具有一些独特的性质,比如:分子量较小、结构简单、母系遗传、无内含子、进化率高以及无基因重组等等。由于线粒体结构功能和遗传的重要性和特殊性,线粒体dna在系统发育学、分子进化学和遗传学等方面得到了广泛的应用。
目前,对线粒体dna序列进行测序主要分为三大类方法:第一代测序、第二代测序和第三代测序。第一代测序技术的主要特点是测序读长可达1000bp,准确性高达99.999%,但其测序成本高,通量低等方面的缺点,严重影响了其真正大规模的应用。因而第一代测序技术并不是最理想的测序方法。第二代测序技术(又称“高通量测序技术”)大大降低了测序成本,并且大幅提高了测序速度,但是读取片段(200bp–500bp)让其应用有所受限,且准确性也比一代测序技术低,主要原因就是来源于碱基的替换。第三代测序技术与前两代相比,他们最大的特点就是单分子测序,测序速度很快,每秒可读10个dntp,但是其测序错误率比较高,达到15%,这几乎是目前单分子测序技术的通病。
对线粒体基因组进行测序时,①如果使用第一代测序技术,会造成测序成本过高,工作量太大等问题,严重影响了其真正大规模的应用,因而第一代测序技术并不是最理想的测序方法;②如果使用第二代测序技术(又称“高通量测序技术”),会造成其测序的准确性降低,而影响最终结果。③第三代测序技术与前两代相比,其也存在测序错误率比较高的缺点。可见,这些测序技术都不能非常理想地获得线粒体基因组。
目前,绒螯蟹分类在学术界依然有很大争议,对绒螯蟹的线粒体dna进行准确测定以准确定位其分类是很有必要的。为此,开发一种快速且准确性高的测序方法也是很有必要的。
技术实现要素:
针对现有技术中存在的上述技术问题,本发明的一个目的是提供一种精准测定中华绒螯蟹线粒体全基因组序列的方法,该方法基于高通量测序,具有快速、准确性高的优点。
本发明的另一目的是提供一种中华绒螯蟹线粒体全基因组dna序列,根据该序列可准确定位中华绒螯蟹的生物学分类。
作为本发明的第一方面,本发明提供了一种精确测定中华绒螯蟹线粒体全基因组序列的方法,该方法基于高通量测序,包括以下步骤:
(1)提取所述中华绒螯蟹肌肉组织中的全基因组dna,构建基因文库,利用第二代测序技术(高通量测序技术)进行测序;
(2)通过参考近缘物种线粒体全基因组序列对高质量的测序读段进行筛选,除去核dna片段,然后进行线粒体基因组的拼接,选取最优的拼接结果,再对拼接好的线粒体基因组的编码蛋白基因、rrna和trna进行预测注释;
(3)将拼装好的线粒体基因组序列和近缘物种线粒体基因组序列比对,根据保守区,再参考所述近缘物种线粒体全基因组序列设计引物,对对应的第二代测序样品进行pcr扩增测序,pcr产物利用第一代测序技术进行,最后对拼接的线粒体基因组序列进行校正,即可获得中华绒螯蟹线粒体全基因组序列。
在本发明的一个优选实施方案中,步骤(1)中提取所述中华绒螯蟹肌肉组织中的全基因组dna使用的是苯酚/氯仿法。
在本发明的一个优选实施方案中,步骤(2)中所述近缘物种是日本绒螯蟹(eriocheirjaponica)、肉球近方蟹(hemigrapsussanguineus)、伍氏厚蟹(helicanawuana)和中华绒螯蟹(eriocheirsinensis)。
在本发明的一个优选实施方案中,步骤(2)中线粒体基因组的拼接是利用novoplasty拼接软件进行多kmer参数的拼接。
在本发明的一个优选实施方案中,步骤(2)中对线粒体基因组的编码蛋白基因、rrna和trna进行预测注释分别利用blast软件、barrnap0.4.2和trnascan-sev1.3.1软件。
在本发明的一个优选实施方案中,步骤(3)中所述pcr扩增所用引物包括以下19对引物:
第1对引物:f:seqidno.1和r:seqidno.2,
第2对引物:f:seqidno.3和r:seqidno.4,
第3对引物:f:seqidno.5和r:seqidno.6,
第4对引物:f:seqidno.7和r:seqidno.8,
第5对引物:f:seqidno.9和r:seqidno.10,
第6对引物:f:seqidno.11和r:seqidno.12,
第7对引物:f:seqidno.13和r:seqidno.14,
第8对引物:f:seqidno.15和r:seqidno.16,
第9对引物:f:seqidno.17和r:seqidno.18,
第10对引物:f:seqidno.19和r:seqidno.20,
第11对引物:f:seqidno.21和r:seqidno.22,
第12对引物:f:seqidno.23和r:seqidno.24,
第13对引物:f:seqidno.25和r:seqidno.26,
第14对引物:f:seqidno.27和r:seqidno.28,
第15对引物:f:seqidno.29和r:seqidno.30,
第16对引物:f:seqidno.31和r:seqidno.32,
第17对引物:f:seqidno.33和r:seqidno.34,
第18对引物:f:seqidno.35和r:seqidno.36,
第19对引物:f:seqidno.37和r:seqidno.38。
在本发明的一个优选实施方案中,步骤(3)中所述pcr扩增的体系总体积为50μl,其中包括正反向引物各2μl,dna模板2μl(浓度为50ng/μl),dnase-free去离子水19μl,taqpcrmastermix25μl。
在本发明的一个优选实施方案中,步骤(3)中所述pcr扩增的反应程序为:94℃预变性5分钟;94℃变性30秒,55℃退火30秒,72℃延伸1分钟,共35个循环;循环结束后,72℃在延伸10分钟,10℃终止反应。
作为本发明的第二方面,本发明提供了一种中华绒螯蟹线粒体全基因组dna序列,如seqidno.58所示。
本发明还提供了一种用于扩增中华绒螯蟹线粒体全基因组dna的引物,该引物包括以下19对引物:
第1对引物:f:seqidno.1和r:seqidno.2,
第2对引物:f:seqidno.3和r:seqidno.4,
第3对引物:f:seqidno.5和r:seqidno.6,
第4对引物:f:seqidno.7和r:seqidno.8,
第5对引物:f:seqidno.9和r:seqidno.10,
第6对引物:f:seqidno.11和r:seqidno.12,
第7对引物:f:seqidno.13和r:seqidno.14,
第8对引物:f:seqidno.15和r:seqidno.16,
第9对引物:f:seqidno.17和r:seqidno.18,
第10对引物:f:seqidno.19和r:seqidno.20,
第11对引物:f:seqidno.21和r:seqidno.22,
第12对引物:f:seqidno.23和r:seqidno.24,
第13对引物:f:seqidno.25和r:seqidno.26,
第14对引物:f:seqidno.27和r:seqidno.28,
第15对引物:f:seqidno.29和r:seqidno.30,
第16对引物:f:seqidno.31和r:seqidno.32,
第17对引物:f:seqidno.33和r:seqidno.34,
第18对引物:f:seqidno.35和r:seqidno.36,
第19对引物:f:seqidno.37和r:seqidno.38。
本发明的方法是在第二代测序的基础上,快速测定中华绒螯蟹线粒体基因组。将拼装好的线粒体全基因组序列和参考物种(即,近缘物种线粒体全基因组序列)线粒体全基因组序列比对,然后使用第一代测序技术对异常序列片段修正,最终获得非常精确的获得中华绒螯蟹线粒体基因组序列。
本发明的方法结合了第一代和第二代测序技术的优点,该方法克服了第一代测序技术的工作量大、成本高、耗时长等缺陷,并且克服了第二代测序技术的读取片段受限、测序错误率高等缺陷,解决了其不能真正大规模的应用的缺陷。利用第一代测序技术的优点针对性地修正异常中华绒螯蟹线粒体基因组序列,显著提高了测序的准确率。
与现有技术相比,本发明具有如下优势:
本发明的中华绒螯蟹线粒体全基因组dna的序列准确性高,为中华绒螯蟹进行准确的生物学分类奠定了基础;
采用本发明的引物可以准确定位所需线粒体基因片段,来修正线粒体基因组序列,克服了利用第二代测序技术会经常产生的overlap、gap以及错误序列;
减少引物设计等繁琐步骤和设计成本;
相较于第一代测序,本发明的测定中华绒螯蟹线粒体全基因组序列的方法省去了大量的人力资源和物力资源,并且也节省了大量的时间;
相较于第二代测序,本发明的测定中华绒螯蟹线粒体全基因组序列的方法测序准确率要更高,达到了第一代测序的准确率,且可以准确定位和修正错误序列,科研结果更加准确可信。
附图说明
图1是本发明的中华绒螯蟹全基因组dna环状图。
图2是本发明采用illuminahiseqtm平台测序的原始数据碱基组成分布例图。
图3是本发明采用illuminahiseqtm平台测序的原始数据碱基质量分布例图。
具体实施方式
本申请发明人在获得该dna序列过程中,首先利用第二代测序技术对构建的中华绒螯蟹全基因组dna的基因文库进行测序,然后通过参考近缘物种线粒体全基因组序列对高质量的测序读段进行筛选,除去核dna片段后进行线粒体基因组的拼接,选取最优的拼接结果,再对拼接好的线粒体基因组的编码蛋白基因、rrna和trna进行预测注释;最后将拼装好的线粒体基因组序列和近缘物种线粒体基因组序列比对,根据保守区,再参考所述近缘物种的线粒体全基因组序列设计引物,对对应的第二代测序样品进行扩增,pcr产物利用第一代测序技术进行测序,最后对拼接的线粒体基因组序列进行校正。本发明的方法可快速、准确地获得中华绒螯蟹线粒体基因组序列,为准确定位其生物学分类奠定了基础。
中华绒螯蟹线粒体全基因组dna的序列如seqidno.58所示。
ttacatgcaacggaattgcaccgtttcttaaaagatcaaaacttcttatgctctttacatcagcatataaattattttcaaaccctagtgatttacacatctttaaacttgcaatttaatattatttttatactatagggcctaataaaggaatctcattcgtctacagatttacaatctgccgcttacaactcagccactttattaatttttaaataaatagtatactcgatgactgaaaggtaagtatagatcttttaaatctaatatagtaatttaacatttacttcgagtaaggaattagttaaaatataataacatttgcttgtcatgcaaaagtcatctttaagatactccttaaatttcagttttatttgttttatggtgtagataacacattgtattttcgttacaaaaccgaaactaatgtttctagaacattataatactttgcccacagataatatttatctcttttgcagcttcaatgcaatattctatataaattatataagctacttatattaatctagctttacgttatacgccattaactaaatttaaatttaaaattaacatatttaaaggaaatcaatgtaaaaatagaactaaatattctcgaacttttcctgacctacaagaatataaactactgacgaaaatcccatgctgacttaaactatatatgtataaagtataagctgctctgaaaaaagaaagaaatataattcccattactgtaaatgtccttcaccttattaaactaataatcaacctaatctccccgaatagatttaaagtagggggagcagccatattacccactctaaataaaaatcatcacaaacctatcctaggtataaaatttaataaacccttactaactaaaagactacgcctaccaactcgctcgtatactatattagccaaacaaaataatccagaagaacataacccgtgtccgactattactacaacagctcctattagtcctcatcatctaaaaatcattagaccacatagtactattctcatatgaacaaccgaagaataagcaatcaaggactttatatctacctggcgtagacacaaaagactcactactactccccctactaaactaattctaacccataacgacgaaaaattcaagctaattttctgaaatatcaataacacccgaatcaaaccatacccgcctaactttaataaaactcctgctaaaattatagaaccagcaaccggggcttctacgtgagcttttggcaaccataaatgaaatatatatatcggtaatttaactaaaaaagccatcacccttctaaaatatcaaatactgtttgcccagctaacttctaaaataagatttcttaatattataactaacctatattcttttatataaatatacaataaagaccccaataaaggtaaagatagtgacaaagtataaaaaagtatataaactccagcttgaattcgttcaggttgatatccccatccaagaatcaaaattaaagtgggaattaacgatatttcaaatataatataaaacaacaaataatttaatgaagaaaatgttactaaaagcctaaataaaagtactaaatttaccaagataaacatacccctaaaattatttattatttttactcgctccctcgaaataacaataagaaatataattcaaacacttaaataaactataatataactgacataatctattcctaaattaaatcccaaactatatatatatatattatgaaaacatcttaaaccaactaaaaatcttaataatcctaatcctatctgagctgactttcagtcatcctttaattttatcaatagaactacaggtaacaaaaactttaacattccagaagattaaatcttttaaaataatcatttccatgcctacgaacaataagaactaataaagataaaccaagagctccttcacatacagctaaagttaaaaaaaataaagaaatgtaaatttccctaccaactatagacaactgtaaccttaataatcaaaaaactccaagcattataaattctaatcttaacaacgaatttaataaatgtttattataagaaataaatctccataaaccacaaaaaattataaataccgccccaaacactctcaaaaatctaaaatttatcattagttttaatagttaatttaaaaaactaaaacattggtgttaaaatcctaaacatgaaattttttcttaaaactcaagagaattattatctctattatttttatattaacaatccccttattaattgtttcttccttcttttttatacaactctctcaccctttggcaataggccttatattatttattcaaacagtcttaatttcaattacaattggagtttccaacttttctttttgattttcttatattctgtttttagtgtttttaggaggaatactagttttattcatttatattgcttctttagcttcaaatgaatcattttctttttctttaattacttttttctttgctattattttaacaggtttaattatctttattttattatttttagatcctatcttaatttctcctaattcttcatccctttcaacatcatcattaaaatatttagtctcgaccccattcattgttaattgagtttataataccccatctataatatttactatttttattgtctcctatctactacttatattaattgttgttgttaaaattattaatttgtttaaaggcccacttcgtcttatattataatgacaacacctatacgcaaatcccaccctttatttaaaattgccaatggagcattagtagatatacctttaccaagtaacatttccacattttgaaactttggttccttgctaggcctttgtttagttatccaaatcgcgacagggttattcttagctatacactactctgctcacgtagatctagctttttctagagttgcccacatttgtcgtgacgtaaattacggttgaatactacgaacccttcacgctaatggggcctctttcttctttatttgcctctaccttcatattggacgaggcatctactttagatcttatataaaccttcatgcttgaatagtaggggtagtaattttatttataattatagcgactgcatttttaggctatgttctaccatgaggacaaatatctttttgaggcgctacagttattacaaatttattttccgctatcccatttatcggtaccgacctagtacaatgaatctgaggagggttttctgttgataatgccactttaactcgatttttttcattccattttattttacctttagtagcatcagcattttctataattcacattctatttttacaccaaacaggagctaataaccccttaggtatttcaagacaaactgataaagtaccatttcatccttactttacatttaaagatattgttggatttgtagttatattaacagccctaattttattaactcttctagccccatattttctaggagatccagataattttattcctgcaaaccctttagtaacccctcctcatatccaaccagaatggtattttctttttgcttacgctattttacgatcaattcctaataaattaggaggagttgtagcattagccgcttcagtggccattcttataattttaccatttacacacacttcaaaatttcaaagattagcattttaccccattaatcaaatgttattctgaacctttgtagtcattgtagtactattgacctgaattggagcacgcccggttgaagacccttatgtcattactggacagattttaaccgtatcctatttcttgttctatattattaatcctcttattcttatttgatgagataacatacttaaatgactatttagtttaaaaaaaacaaatgttttgaaaacattaaataagaataaattcttaatagtcgagtgtttcttaaataactatttacatttataaaattttaatatcttcctataaacttaatttttactcccattacttctaatatagtgcctgataaaaggatagttttgatagaactaattatgtaatttccagttacctatgttattaaaatctttattaaaaagataagctaaataagctaatgggctcataccccgtaaatgaaagtttaatctctctctttttaatcgcttttcctacctcttatttctttttcctaataacactaatctcagggtcaattatctctatttcctcaacttcctgatttggagcttgaattggattagaactaaatctcatatcatttattcctcttattgcttttaaaataaacccacttttttctgaagcagctttaaaatattttcttattcaggcattaggatctgtgctatttatttcttcaagattccttttaatgtctttttattcttttagacttttatctatttttttagccctcttattaaaactaggaggagcccctttccacttctgatttcctcaagttatagaaggtctaaaatgaccacaaatcttccttctatctacaattcaaaaactagcccccttaaccttaatttcttacctaataaacaacgaaatcttaattaaaattacaattttttcagctattttatcagctttaatcggaagacttggtggtttaaacttaaccctattacgaaaaattattgccttttcttcaattaatcacttatcttgaatattaatagcaatctcaattagagactcctcatgacttttttatttttttatttattcccttattgtactttctattaccagagtatttcataaattacaaaccttctccctttctatactaattcaatctgatcaaaatagaacacttcacgctactattatttcacttaattttttatccttgagtggtcttccacctataacaggatttattcccaaatgaattgttattcaagttatattaaatttaaatatatttatccccttattttttcttcttgtttctgctttgattactttatatttttatttgcgaatcatcattaccataatcttaatattcaaccctattttaaattttaatatgaaatataaatctctaacagattccccatcttctctattttttaaatcctccttcaacttttttggtcttctactaccagtatatttcacctttatctagaattttaagttatttaaactaaaagccttcaaagctttctaaaaaagtattaaccttttaaattctatattttaattattatgcaacgatgacttttttctacaaatcataaagatattggaacattatattttattttcggtgcttgggccggaatagtaggaacatcattaagattaattattcgagctgaattaagacaaccaggcagactaattggtaacgatcaaatttataatgtagttgtaacagctcacgcttttgtaataattttttttatagtaatgcccattataattggtggatttggcaactgacttgtccctcttatactaggggccccagatatagctttcccacgaataaacaatataagattctgacttttacccccttctctctctcttttacttacaagaagaatagtagaaagaggagttggtactgggtggactgtctacccacctttagcagcagccatcgctcatgctggagcatcagttgatcttggtatcttctctctacatcttgccggagtttcctcaattttaggagctgttaatttcataacaacagttattaacatacgatcatatggaataacaatggatcaaatacctctttttgtttgagctgtatttattactgctattttacttctcttatcccttccagttttagctggagctattaccatactgcttacagatcgtaacctaaatacgtcatttttcgacccagcagggggaggtgacccagttctataccagcacttattctgatttttcggtcacccagaagtttatattctaattttgcctgccttcggtataatctctcatattgtaagtcaagaatcaggtaaaaaggaatcttttggaactttaggtataatttacgctatactagctattggaattttgggctttgtagtatgagctcatcatatatttacagtaggtatagacgtagatacccgagcttactttacctcagccactataattattgctatccccaccggaattaaaatctttagatgactaaggaccttacatggaactcaaataaattattcaccatctcttctatgagctttagggtttatctttttatttactattggaggtctgacaggagtagttttagctaattcctcaattgatattattctccatgatacttattatgttgttgcccactttcattatgtactctctatgggagcagttttcggaatctttgctggagttgctcactgattttctctaataacaggtttatctttcaaccctaaatgactaaaaattcactttttagtaactttcgtcggagtcaatttaacattttttccccaacactttttaggattaaacggcataccacgacgatactctgattatcctgacgcctatgcaacttgaaatattgtatcatctataggttctataatttcttttgtagccgcattaggattcttattaatcgtttgagaagcatttgtttctaatcgcccagtaatcttttctccttttctgccctcttctattgaatggaaacatgcttatcctccagccgaccattcatatatggaaatcccactaattactaacttctaaaatggcagacagatgtgtaggatttaagctcctataaggaagaataatttcttcttttagaataacttatggcaacatgagcgtatttaaattttcaagacagagcttctcctcttatagaacaattaattttttttcacgatcatattatattagtgattgtgttaattgtaacatttgttggttatataatagcaacattgtttttcaactccctcattaaccgctatatattagaaaatcaaccaatcgaagtaatttgaacatcagttccagcttttattttaatctttattgctttaccatcccttcgcttactttatcttttagatgaagtaaacaatccttctataactcttaaaacaattggccaccaatgatattgaaggtatgaatattcagatttccttcaagtagaatttgactcatatatagtaccatctaatgagctggaagtatcagggttccggctactagacgtagacaatcgtaccgttcttccaataaatactcaaatccgagttctaattacagctgcagatgtcatccattcctggacagtcccatccttaggtattaaagccgatgcaattcccgggcggctaaatcaatcaaggtttttaatcaaccgacctggactattttacggtcaatgttcagaaatttgcggggcaaaccacagatttatgcccattgttattgaaagaacttctattaactcatttctaaattgaatttctctatcaattgaagcgtcaccctaactcatccttagttttactaatttttgggtgaaacaattccttctgtgaattactatttatgccacaaatagcacctatttattgactatttatatttttcttttttttagccagattcctattatttttcgctcttaattacttcattaaacctttttataaagttaattttcttcaagataataaaaaacctttaatttataaacattgaaaattataacaaatttattctcaatttttgaaccttcttcaagaatctttaatttatcgataaattgaatctcaactatcctaggattgatattcttaccttatatatactgagcatccccttctcgttgatctttactttggggaaaaattatttcaaccttgcataaagaatttaaagctcttttacagccttcacataatggagcttctatagtattcattgctttatttaggttaattgtatttaataattttctaggcttattaccttatgtatttactagctctagtcatatggtaataacattatctttatctttgcccttgtgaattactttaataacatttgggtgaattaaacacactaaacatatatttgcccatttagttccccaagggacgcctttcgctttaatgccatttatagtgttaattgaaaccattagaaatgtaattcggcctggtaccttagcaattcggctagccgctaatataattgccggtcatttacttttaaccttattaggaaatactggcccttcattatcaacctccatcctattcattttattgtcagctcaaatactcctactaatcttagaatctgccgtagctattattcaatcttatgttttcgctgttttaagaactctctacactagagaaattaactaatgacatcatcacacggctttcatccttatcatttagtagatattagaccctgaccaattactgggtctattagagctataatactaaccactggtttagtaaaatgatttcaccaacacaatataaaccttttaattttaagatttattgcaactttgttaactataattcaatgatggcgagatattacccgtgaaggtacttaccaaggatcacacactttaacagtaataaaggggctacgctgaggtataattttatttattgtatcagaagttttatttttcttttcttttttttgagcttttttccatagaagactatctcctgctgtagaaattgggatatattggccgccattaggtattcaaccttttaaccctttccaaatcccccttctaaacactacgattcttctatcgtcaggtgctacagttacttgggctcatcacgcaattctagagggtaactactctcaagctgtacaaagactaggtttaactattatcctaggtatttattttacaatgctccaagcatttgaatatattgaagcttctttcactattgccgactcagtctttggttcaacattttttgtagcaactgggttccatggattacacgttatcattggaacttcatttttatttgtttgttttattcgactttataaatgtcacttttcttcttctcatcatttaggatttgaggcagctgcttgatactgacactttgttgatgttgtttgattattcttatatattttcatttattgatgaggcggataatttttttaatataataagtatatctgatttccaatcagaaagtctaacttttagaaaaaataatctttacaatattgacaatttcagttattactctcatggtttcatatatcgttataactttagcgaccctcttatctaaaaagacaattatagatcgagaaaaaaattctccgtatgaatgtggattcgatcccaaaggatccgcccgtctacctttttctctacgcttttttttaattgccgtaattttcctaatctttgatgtagaaattacacttctgctgcctattgcttctacattaaacctaaccaatatgttttcttgattttttacaagtttaatttttttattaattttgttatttggtctttattatgaatgatcacaaagtgctctagattgatcttagtaagaccatagtcaatatatgacgtatgagttgcattcataaagagttttctaaactggttttaaaaattagaaagcgaataattgcatttagtttcgacctaaattttagactttagtcttctaattttggtggaaaccaaaaagaggtatatcactgttaatgataaaattgagttcaaactcctaccaagaagggatattatgctaaaggcagaaagcttctaactttttactaagcggttaaattccgtttatatccctttgttatatatatgtacatatctatcaacctagccctagcactttgtttttatagtttaaaccaacccaaaacattggtcttgtaaaccaataatgaattattttctaaaaactttcagaaaaaaagagtaactctttatctttaattcccaaaattaatattttttaaactatttcctgaatttattactctaaattttatgctgctagacaaaaacaaaacattttaaatctaacaaaaaaaatcaaataattaatagaaacaggaagataactttttcatgctaaatatatcaatttatcataccgcagtcgaggtaaagtacctcggactcatacaaacccaaaagctactattacactcttaaaataaaacattactctgaacggccccctacccaaaaaaaaaataacaaataaaaccctcatgaatagaatacttgcgtattcagctataaaaattaatgcaaacccgccagccccgtactctgtattaaagccagagactagctcagattcaccttcagaaaaatcaaatggagttcgattagtctcagctaaacatgacctaaatcacaccattcttaaaggaaatctaattacaacaaatcaaaaataattttgatatttattaaacaactctaaattaaatccaccaattaatattacaaaagataataaaattaaagctaacctaacttcataagaaatagtttgagctaccgctcgcaaagaacctaataaagaatatttacaatttgatgatcatcccgccactatagttgaatacacccctacacttaaacaacacaaaaaaaacagaattctcagattaaaccttattaatccagtttcataaggtaaaactgatcatactaataaagaaataaacaaactaaatacaggacataaatagtaaactaaaaagtttgatatagtaggaataatttgttccttagtgaaaagctttactgcatcagaaaaaggctgtaaaattcctatatagcctactttatttgggcctttacgaatttgaatataacctaaaatttttcgttcaagtaaagttacaaaagccacgccaattaaaacacacactattaataccaaaaaattaactatctctacaattattaaagtcacaaaacaattagattactaataatttaactatttatagaattgctctattttataggatcctaaatccaacacatattatctgccaaaatagtaatcattatataaaataattttaattatttaatcctttcgtactaaaataatttttctttattaaaagatagaaaccaacctggcttacgccggtttgaactcaaatcatgtaaaattttaaaggtcgaacagacctacttatataactgctacaattataaagatattttaattcaacatcgaggtcgcaaacttttctttcgataagtactcttaagaaaaataacgctgttatccctaaagtaacttaaacttttaatctttaattaggatcatttaaaattttaatcacatataagtgtacttaatgttaagcagttaataatcattttactcttatcgccccaataaaataaattcaatttacaaaatctttataacctaaaatttgactatataaaatttaatattaagctttatagggtcttatcgtccctttaatacatttaagccttttcacttaaaagtaaaattcaataaacaatataaagacagatcttcttttgtccaaccattcatacaagattccaattaaaaaactaacgattatgctacctttgcacggtcaaaataccgcggccatttaatactatcaatcagtgggcaggttaaactttttataacttcaaacagacatgtttttgataaacaggcaaagaagttatttttgccgagttcctttattccgccctatcaattttaaacaatatttattatttaaatgttttgctttaataaaaaacttttactaataaaatcattataacttaactctttatatttaaattaattttttaatactccaaaaaagtttatataaatattatccaattttaatttagctagaacactttataaatatagctacttttaagcctaattcaccaattaaactattttaaactatttatcattttaattataagaagctaatccctcctacacttaaattttacatcttatcaacgtaaaaattaaattaaatttactttttaaaaaactagatataataaaactcgactagcgtttcacctttaattttatattaaaaatttattttctacaaaaaattttttataaaattagctatattttatttcgagatatttaatttttattaacttatataaattttccctgatacacaaggtacaatatttaaaattttttacttcaaattttcttgctttcctttacagtactcttaactatagtttataaattgtgtttattaaaaattactagcatgaacaaattacaaattatttttcataaatataaaattttcaaatttatttaacaagtcattaataaatagatgggtaattattaatttataaagaaaatatacatatcctcatctttactagatacactttccagtacatctactatgttacgacttatttcacttataaatgaaagcgacgggcgatatgtacacaatttagaacttatatcttgttagcttattaaactaaaaatacaatcaaatccatctttataataatattatcttattaatccgcagtaaagtaatttactgtaacccattttaccttgcttattggctgcaccatgatctaattttactaaacaactaaatttaataatttttcctttaagaattatctgataatgatggtatacaaactgttagaattactaaagcaagtaagatttttcgtggtttatcgattctaaaacaggttcctctgaatagattaaattgccgccaaattttttaaattttaagtatttatcttttactaattcagttttatattaaatttattttagaataatagggtatctaatcctagtttatttctaaacttttttagcttcaattataattttactccatacataataatatcctaattttaccttttattacctgtatgagatttttaatttaatcatctaactataaccttagaatttttactcaatcttaaagtataaccgcgaatgctggcacaaatatatatcagattttaatattattactatatcacaccttcatgtataattttataatattttatgctgagacaataaaggtttataattttatttcactcgaataccaatttaatatttaattaaattgtttaaatcacactttaattttcatacaattttaataataatgtaaaaacttaagccaaaatcaaacatttgtcgtgattgcaaataataactttaaaaaacttaaatatactatatataacataaaaatgagaataagcttatacttaaagtataacttatacatcttaagcgccacaagctaacgttttaatattttaaactatttaagttttgttataactaatattgctacaaatatatttattatctacacaaaaacaaacaatataatcaccaacccaaccacaaaaatttttataaacactttaatattattaagttgtaactcatttaacaacctaaaatatttcttaaacaaaaaatacatcccctggccaccaaaatattcaaatcaccctttgtctcctaatttttcaacacctaccccactaatgagactagaccctctaattttttttgtcctaagaaaaggtataaatcatatagacccccttattactactatcttataattattaatagattttaaattgtaacttacatttaataaattaaatatataacctataactccccctgctaatcttacccccaacactatatttttcattattacattcaaacaaattatataaggctctgggaaaataacccaagatagaacagctcctataaaaatagctcttacacctagtaaaatcatagaatttcttataattttatcctcatccctaatatttattataactcttaaatttgaattacctcttaacctataaaaaattagacgtatagtatacataactgttaaccctgtagctaaaatatataacagtaaagaaataaaattaatccatctcataaaagccacctctaaaattatatctttagaataaaaccctgctaaaaaagggaacccacataaggctaaatttgaaactcttataaaagacactcttaacggcataaatttaattaaaccacctatacatcgaatatcctgataattgccaaccctatggataataatacctgcgcatataaataacaatgctttaaataatgcatgactcagcagatgaaaaaaagaaagatcagggtatcctaaagctaaaatacttaacataacccccaattgacttaacgttgataaggcaataattttttttaaatcatattcaaaattggcccctaatcccgccataaatatagttaagcaagaaataattaataatattccttggattttagaaccttctaacgcaccactaaatcgaattattaaatacaccccagcagttactaaagtagaagaatgtactaaagcagaaacaggagtaggagctgctatagcggcaggaagccatgctgagaaaggaatttgagcacttttagtcatagctcttaacattaacaaaaacttaaacaaaattcactcagtatctataatatagtaagaataaataacaaaatttcatctacctaacctggccattagtccaatactaagtaaaatagcaacatcacctactcgattagataagatagttaacatcccagcattagcagacttttcattttgataaaaaattactaaagcataagaaactaaacctaatccatcccatcctaaaagaatacttaccaagttaggtcttaaaactattatagccatagataaaacaaacattaaaactaaatatataaatcgattaaagtttttatcctccttcatatatctacctctataatacatcacacttccagaaataagcaatacaaaacacaaaaaaagtatcgaaattcaatcaaaaattaaaacaaacaccactgataatgaatttaatcttgctaaatcccattcaattacactagtaacaccactaaataattttattaaagaaactgttccacaaactaaagaccccgctcatagcccaagtattctaatcttatgtatataaattattcaaaccattatttaaatattaaattattaatttaatacaaaatacagtaacatttctaccaatggtacaaaacaattagtagtaattaaatctaaataaatcaaagcaaatcgatttgcacgataaatcttttcaacgtaactgaaatgctgttctattttagctctgctttgacactatcatattatatttccaatctactttacatttaaataatttattaaaaaaagctactaaaaatattaagaaatgataatactattatattatacaattttatttttctttatttatacggaggtatataaggtatatataaatatatcacattagatataagtaaataatataaacaaatcaaatatataaaaattaaatatgtatattcgcctccacaattataccccatccaatataatacaggatagataaaacattaaaattataaaagggtaaaattataaataaatagaagtatataatgtcttagtttatatggaacattgaaacattttatataaaagtaaaaattatatgtaacttcattatataaatatatgatttatactatttttatttattctatgggttgaaaaaaagtagtagtctcaaccctagaccctaattcctctagaggggaaacgggtctagaccgttgagactactactataataggggcaaagaacattatattatatttaggtaaatataaattaaatatttaattatactaacaaataatttaacattaatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatgtatatatgtatatgtatatatgtatatgtatatatgtatatgtatatatgtatatgtatatatgtatatgctttgtactctacaatatataatatctactatatac(seqidno.58)。
引物1的上游引物序列如seqidno:1所示:
catgcaacggaattgcac(seqidno:1)。
引物1的下游引物序列如seqidno:2所示:
gggtatggtttgattcgg(seqidno:2)。
引物2的上游引物序列如seqidno:3所示:
ggactttatatctacctggcg(seqidno:3)。
引物2的下游引物序列如seqidno:4所示:
gtatgtgaaggagctcttgg(seqidno:4)。
引物3的上游引物序列如seqidno:5所示:
gagctgactttcagtcatcc(seqidno:5)。
引物3的下游引物序列如seqidno:6所示:
gctaagaataaccctgtcgc(seqidno:6)。
引物4的上游引物序列如seqidno:7所示:
tctcgaccccattcattg(seqidno:7)。
引物4的下游引物序列如seqidno:8所示:
gtgctccaattcaggtcaa(seqidno:8)。
引物5的上游引物序列如seqidno:9所示:
ccccatattttctaggagac(t)c(seqidno:9)。
引物5的下游引物序列如seqidno:10所示:
agtacagatcctaatgcctg(seqidno:10)。
引物6的上游引物序列如seqidno:11所示:
aagctaatgggctcataccc(seqidno:11)。
引物6的下游引物序列如seqidno:12所示:
taggtggaagaccactcaagg(seqidno:12)。
引物7的上游引物序列如seqidno:13所示:
ccttgagtggtcttccaccta(seqidno:13)。
引物7的下游引物序列如seqidno:14所示:
ccaagatcaactgatgctcc(seqidno:14)。
引物8的上游引物序列如seqidno:15所示:
tattttcggtgcttgggc(seqidno:15)。
引物8的下游引物序列如seqidno:16所示:
agattataccgaaggcaggc(seqidno:16)。
引物9的上游引物序列如seqidno:17所示:
ctacatcttgccggagtttc(seqidno:17)。
引物9的下游引物序列如seqidno:18所示:
acgctcaggttgccataaa(g)(seqidno:18)。
引物10的上游引物序列如seqidno:19所示:
tggcagacagatt(g)tgtagga(seqidno:19)。
引物10的下游引物序列如seqidno:20所示:
aagatcaacgagaaggggag(t)(seqidno:20)。
引物11的上游引物序列如seqidno:21所示:
c(a)tccccttctcgttgatctt(seqidno:21)。
引物11的下游引物序列如seqidno:22所示:
taactgtagcaccg(t)gacgat(seqidno:22)。
引物12的上游引物序列如seqidno:23所示:
ttga(g)ccgccattaggtattc(seqidno:23)。
引物12的下游引物序列如seqidno:24所示:
gaccaatgttttgggttgg(seqidno:24)。
引物13的上游引物序列如seqidno:25所示:
caaactcctaccaagaaggg(seqidno:25)。
引物13的下游引物序列如seqidno:26所示:
gtgtgttttaattggt(c)gtggc(seqidno:26)。
引物14的上游引物序列如seqidno:27所示:
ctgcatcagaaaaaggctg(seqidno:27)。
引物14的下游引物序列如seqidno:28所示:
acctgcccactgattgatag(seqidno:28)。
引物15的上游引物序列如seqidno:29所示:
gaaaccaacctggcttacg(seqidno:29)。
引物15的下游引物序列如seqidno:30所示:
ttgtgtacatatcgcccgtc(seqidno:30)。
引物16的上游引物序列如seqidno:31所示:
ctcgactagcgtttcacctt(seqidno:31)。
引物16的下游引物序列如seqidno:32所示:
ccagcattcgcggttata(seqidno:32)。
引物17的上游引物序列如seqidno:33所示:
tataaccgcgaatgctgg(seqidno:33)。
引物17的下游引物序列如seqidno:34所示:
tagccttatgtgggttccct(seqidno:34)。
引物18的上游引物序列如seqidno:35所示:
agggaacccacataaggct(seqidno:35)。
引物18的下游引物序列如seqidno:36所示:
cggggtctttagtttgtgga(seqidno:36)。
引物19的上游引物序列如seqidno:37所示:
catgcctgaatagtaggagt(seqidno:37)。
引物19的下游引物序列如seqidno:38所示:
gtgctccaattcaggtcaat(seqidno:38)。
下面结合具体实施例,进一步阐述本发明。具体实施例是在以本发明技术方案为前提下进行实施的,给出了详细的实施方式和操作过程。应理解,这些实施例仅用于说明本发明而不用于限制本发明的范围。下列实施例中未注明具体条件的实验方法,通常按照常规条件进行。除非另有说明,百分比和份数按重量计。
实施例1
本实施例所使用的中华绒螯蟹样品于2017年10月至2017年12月间采自长江流域,具体地点:江苏省镇江市,经纬度:119.27°e,32.11°n。样品采集方式为地笼抓捕或者人工捕捞。取出肌肉组织,避免其他组织污染,并保存于–40℃的冰箱中待用。
1.1dna的提取:本实验采取经典的酚氯法进行dna提取,具体步骤如下(以下试剂均购自国药集团化学试剂有限公司):
①取样品肌肉组织50mg左右,晾干酒精,剪碎处理,并放置1.5ml的离心管中;
②向离心管加入500μl缓冲液(100mmol/lnacl;10mmol/ltris-cl,ph8.0;1mmol/ledta,ph8.0),50μl10%sds溶液及10μl20mg/μl的蛋白酶k,然后立刻使用研磨棒磨碎大块肌肉组织,56℃水浴消化(一般3个小时左右),直至离心管中溶液清澈;
③向离心管中加入250μl的饱和苯酚和250μl的氯仿/异戊醇的混合液(体积比为24:1),然后轻摇10分钟,室温13000r/min离心8分钟;
④吸取上清液至新离心管中,并重复步骤③一次;
⑤吸取上清液至新离心管中,向离心管中加入500μl的氯仿/异戊醇的混合液(体积比为24:1),然后轻摇10分钟,室温13000r/min离心8分钟;
⑥吸取上清液至新离心管中,并重复步骤⑤一次;
⑦吸取上清液至新离心管中,加入50μl3mol/lnaac溶液和1ml的冰无水乙醇,放置于-20℃冰箱1小时,取出离心13000r/min离心8分钟,得到核酸沉淀;
⑧使用75%的冰乙醇洗涤沉淀两次;
⑨最后,使用冰无水乙醇洗涤沉淀,待沉淀自然干燥后,加入50μl的te缓冲液溶解,并加入0.2μl的核糖核酸酶a(浓度为0.05mg/ml)去除rna。
1.2dna的质量检测:
按照1.1的方法从肌肉中提取dna,取2μldna样本在紫外分光光度计q5000(美国quawell公司)上进行浓度测定。测得dna浓度要求od260/od280比值在1.8~2.0之间,od260/od230比值在1.8~2.2之间,以上两个比值可以判断所提取dna纯度的优劣。如果超出上述范围,则可认为提取dna纯度不符合要求,需要重新提取或再纯化。将质量检测合格的dna样本根据测定的浓度,用dna溶解缓冲液进一步稀释到浓度50ng/μl,备用。
1.3基因文库构建,高通量测序:
样品基因组dna检测合格后,用物理方法(超声波)将dna打断,然后对打断后的dna进行纯化构建测序文库,步骤依次为:dna末端修复,3’端加a,连接测序接头,琼脂糖凝胶电泳法回收目的片段,对目的片段进行pcr扩增,最终建成测序文库。测序前对构建好的文库进行质检,质检合格后采用illuminahiseqtm平台测序。
1.4原始测序数据质量评估:
利用生物信息统计学方法,对所有测序reads的碱基分布和质量波动进行统计,从宏观上可以直观的反映出测序样本测序质量。图1是原始数据下机的碱基分布图,该反映了高通量测序的a、t、g、c4种碱基的分布情况,碱基越均匀代表测序结果好。图2为原始数据碱基质量分布图,一般来说,质量值超过30(测序错误率小于千分之一)的碱基比例越多,高通量测序的数据质量越好。
1.5线粒体基因组的拼接和注释
基于参考物种线粒基因组序列(日本绒螯蟹(eriocheirjaponica)(fj455505.1)、肉球近方蟹(hemigrapsussanguineus)(kx456205.1)、伍氏厚蟹(helicanawuana)(kx344898.1)、中华绒螯蟹线粒体基因组序列(eriocheirsinensis)(kp126617.1)),对于高质量的测读段进行过滤,除去核dna片段序列;利用novoplasty(https://github.com/ndierckx/novoplasty)拼接软件进行多kmer参数的拼接,选取最优的组装结果;利用blast软件对每个个体的线粒体基因组的编码蛋白基因进行预测,利用专业的barrnap0.4.2和trnascan-sev1.3.1软件分别对rrna和trna在线粒体基因组范围内进行查收与预测。
1.6中华绒螯蟹线粒体基因组特异性引物设计:
参照近缘物种线粒基因组序列(日本绒螯蟹(eriocheirjaponica)(fj455505.1)、肉球近方蟹(hemigrapsussanguineus)(kx456205.1)、伍氏厚蟹(helicanawuana)(kx344898.1)、中华绒螯蟹线粒体基因组序列(eriocheirsinensis)(kp126617.1)),使用primerpremierversion6,结合发明人自身经验设计出19对覆盖中华绒螯蟹线粒体全基因组dna序列的引物(参见表1),引物序列长度范围均在1.2kb以内,相邻片段一定的重叠区域。
表1.pcr扩增所用引物:
注:以上引物均由生工生物工程(上海)股份有限公司合成
1.7利用以上引物进行pcr扩增:
pcr扩增使用eppendorf热循环仪,pcr反应总体积为50μl,其中包括正反向引物各2μl,dna模板2μl(浓度为50ng/μl),dnase-free去离子水19μl,taqpcrmastermix25μl(购买于novoproteinbiotech公司)。pcr扩增的反应程序为:94℃预变性5分钟;94℃变性30秒,55℃退火30秒,72℃延伸1分钟,共35个循环;循环结束后,72℃在延伸10分钟,10℃终止反应。实际得到的序列均由生工生物工程(上海)股份有限公司测序。各个引物pcr扩增所得序列参见表2。
1.8pcr产物序列预处理:
为确保序列的可靠性,序列拼接时,需对测序质量进行评估,去除测序结果两端的低质量部分,序列方向应与pcr扩增正向引物方向一致。
1.9对拼接的线粒体基因组进行校正
与已公布的中华绒螯蟹线粒体基因组序列(kp126617.1)对比后,第二代测序获得的中华绒螯蟹线粒体基因组中经常会出现overlap、gap以及错误序列,此时通过第一代测序可准确定位相关序列,并使用mega5软件进行人工修正,最后可获得完整的中华绒螯蟹线粒体基因序列(seqidno:58)。
本发明使用的第二代测序除了线粒体控制区的基因序列外,线粒体基因组其他序列的错误率为0.0173%(控制区的基因序列,本发明使用第一代测序修补),将第二代测序获得的原始序列与参考序列对比之后,用第一代测序技术对pcr扩增的产物进行测序,并以该序列为准,对第二代测序序列的异常位点进行了人工修正,具体为:首先切除多余的1-369和16808-17028片段,获得16438bp的序列,然后对拼接好的序列进行人工修正,其中,第373个位点的“g”,人工修改为“a”,第6442个位点的“a”修改为“g”;第9181个位点的“t”修改为“c”,修正后的序列具体参见seqidno:58。。
根据本发明测序所得的中华绒螯蟹线粒体基因组dna序列对该中华绒螯蟹进行生物学分类,得出该中华绒螯蟹隶属于节肢动物门(arthropoda)、甲壳纲(crustacea)、十足目(decapoda)、方蟹科(grapsidae),绒螯蟹属(eriocheir)。
本发明的方法还适用于科研和生产单位使用,可快速且准确的测出中华绒螯蟹属物种的线粒体全基因组序列,提高科研以及生产单位的遗传标记开发、种质资源评估和人工育苗等方面的效率,对科研和产业有着重要的意义。
以上显示和描述了本发明的基本原理和主要特征和本发明的优点。本行业的技术人员应该了解,本发明不受上述实施例的限制,上述实施例和说明书中描述的只是说明本发明的原理,在不脱离本发明精神和范围的前提下,本发明还会有各种变化和改进,这些变化和改进都落入要求保护的本发明范围内。本发明要求保护范围由所附的权利要求书及其等效物界定。
序列表
<110>上海海洋大学
<120>基于高通量测序测定中华绒螯蟹线粒体全基因组的方法
<130>2018
<160>58
<170>siposequencelisting1.0
<210>1
<211>18
<212>dna
<213>人工序列()
<400>1
catgcaacggaattgcac18
<210>2
<211>18
<212>dna
<213>人工序列()
<400>2
gggtatggtttgattcgg18
<210>3
<211>21
<212>dna
<213>人工序列()
<400>3
ggactttatatctacctggcg21
<210>4
<211>20
<212>dna
<213>人工序列()
<400>4
gtatgtgaaggagctcttgg20
<210>5
<211>20
<212>dna
<213>人工序列()
<400>5
gagctgactttcagtcatcc20
<210>6
<211>20
<212>dna
<213>人工序列()
<400>6
gctaagaataaccctgtcgc20
<210>7
<211>18
<212>dna
<213>人工序列()
<400>7
tctcgaccccattcattg18
<210>8
<211>19
<212>dna
<213>人工序列()
<400>8
gtgctccaattcaggtcaa19
<210>9
<211>21
<212>dna
<213>人工序列()
<220>
<221>misc_feature
<222>(20)..(20)
<223>n=c或t
<400>9
ccccatattttctaggaganc21
<210>10
<211>20
<212>dna
<213>人工序列()
<400>10
agtacagatcctaatgcctg20
<210>11
<211>20
<212>dna
<213>人工序列()
<400>11
aagctaatgggctcataccc20
<210>12
<211>21
<212>dna
<213>人工序列()
<400>12
taggtggaagaccactcaagg21
<210>13
<211>21
<212>dna
<213>人工序列()
<400>13
ccttgagtggtcttccaccta21
<210>14
<211>20
<212>dna
<213>人工序列()
<400>14
ccaagatcaactgatgctcc20
<210>15
<211>18
<212>dna
<213>人工序列()
<400>15
tattttcggtgcttgggc18
<210>16
<211>20
<212>dna
<213>人工序列()
<400>16
agattataccgaaggcaggc20
<210>17
<211>20
<212>dna
<213>人工序列()
<400>17
ctacatcttgccggagtttc20
<210>18
<211>19
<212>dna
<213>人工序列()
<220>
<221>misc_feature
<222>(19)..(19)
<223>n=a或g
<400>18
acgctcaggttgccataan19
<210>19
<211>20
<212>dna
<213>人工序列()
<220>
<221>misc_feature
<222>(13)..(13)
<223>n=t或g
<400>19
tggcagacagatntgtagga20
<210>20
<211>20
<212>dna
<213>人工序列()
<220>
<221>misc_feature
<222>(20)..(20)
<223>n=g或t
<400>20
aagatcaacgagaaggggan20
<210>21
<211>20
<212>dna
<213>人工序列()
<220>
<221>misc_feature
<222>(1)..(1)
<223>n=c或a
<400>21
ntccccttctcgttgatctt20
<210>22
<211>20
<212>dna
<213>人工序列()
<220>
<221>misc_feature
<222>(14)..(14)
<223>n=g或t
<400>22
taactgtagcaccngacgat20
<210>23
<211>20
<212>dna
<213>人工序列()
<220>
<221>misc_feature
<222>(4)..(4)
<223>n=a或g
<400>23
ttgnccgccattaggtattc20
<210>24
<211>19
<212>dna
<213>人工序列()
<400>24
gaccaatgttttgggttgg19
<210>25
<211>20
<212>dna
<213>人工序列()
<400>25
caaactcctaccaagaaggg20
<210>26
<211>21
<212>dna
<213>人工序列()
<220>
<221>misc_feature
<222>(16)..(16)
<223>n=t或c
<400>26
gtgtgttttaattggngtggc21
<210>27
<211>19
<212>dna
<213>人工序列()
<400>27
ctgcatcagaaaaaggctg19
<210>28
<211>20
<212>dna
<213>人工序列()
<400>28
acctgcccactgattgatag20
<210>29
<211>19
<212>dna
<213>人工序列()
<400>29
gaaaccaacctggcttacg19
<210>30
<211>20
<212>dna
<213>人工序列()
<400>30
ttgtgtacatatcgcccgtc20
<210>31
<211>20
<212>dna
<213>人工序列()
<400>31
ctcgactagcgtttcacctt20
<210>32
<211>18
<212>dna
<213>人工序列()
<400>32
ccagcattcgcggttata18
<210>33
<211>18
<212>dna
<213>人工序列()
<400>33
tataaccgcgaatgctgg18
<210>34
<211>20
<212>dna
<213>人工序列()
<400>34
tagccttatgtgggttccct20
<210>35
<211>19
<212>dna
<213>人工序列()
<400>35
agggaacccacataaggct19
<210>36
<211>20
<212>dna
<213>人工序列()
<400>36
cggggtctttagtttgtgga20
<210>37
<211>20
<212>dna
<213>人工序列()
<400>37
catgcctgaatagtaggagt20
<210>38
<211>20
<212>dna
<213>人工序列()
<400>38
gtgctccaattcaggtcaat20
<210>39
<211>1194
<212>dna
<213>人工序列()
<400>39
catgcaacggaattgcaccgtttcttaaaagatcaaaacttcttatgctctttacatcag60
catataaattattttcaaaccctagtgatttacacatctttaaacttgcaatttaatatt120
atttttatactatagggcctaataaaggaatctcattcgtctacagatttacaatctgcc180
gcttacaactcagccactttattaatttttaaataaatagtatactcgatgactgaaagg240
taagtatagatcttttaaatctaatatagtaatttaacatttacttcgagtaaggaatta300
gttaaaatataataacatttgcttgtcatgcaaaagtcatctttaagatactccttaaat360
ttcagttttatttgttttatggtgtagataacacattgtattttcgttacaaaaccgaaa420
ctaatgtttctagaacattataatactttgcccacagataatatttatctcttttgcagc480
ttcaatgcaatattctatataaattatataagctacttatattaatctagctttacgtta540
tacgccattaactaaatttaaatttaaaattaacatatttaaaggaaatcaatgtaaaaa600
tagaactaaatattctcgaacttttcctgacctacaagaatataaactactgacgaaaat660
cccatgctgacttaaactatatatgtataaagtataagctgctctgaaaaaagaaagaaa720
tataattcccattactgtaaatgtccttcaccttattaaactaataatcaacctaatctc780
cccgaatagatttaaagtagggggagcagccatattacccactctaaataaaaatcatca840
caaacctatcctaggtataaaatttaataaacccttactaactaaaagactacgcctacc900
aactcgctcgtatactatattagccaaacaaaataatccagaagaacataacccgtgtcc960
gactattactacaacagctcctattagtcctcatcatctaaaaatcattagaccacatag1020
tactattctcatatgaacaaccgaagaataagcaatcaaggactttatatctacctggcg1080
tagacacaaaagactcactactactccccctactaaactaattctaacccataacgacga1140
aaaattcaagctaattttctgaaatatcaataacacccgaatcaaaccataccc1194
<210>40
<211>905
<212>dna
<213>人工序列()
<400>40
ggactttatatctacctggcgtagacacaaaagactcactactactccccctactaaact60
aattctaacccataacgacgaaaaattcaagctaattttctgaaatatcaataacacccg120
aatcaaaccatacccgcctaactttaataaaactcctgctaaaattatagaaccagcaac180
cggggcttctacgtgagcttttggcaaccataaatgaaatatatatatcggtaatttaac240
taaaaaagccatcacccttctaaaatatcaaatactgtttgcccagctaacttctaaaat300
aagatttcttaatattataactaacctatattcttttatataaatatacaataaagaccc360
caataaaggtaaagatagtgacaaagtataaaaaagtatataaactccagcttgaattcg420
ttcaggttgatatccccatccaagaatcaaaattaaagtgggaattaacgatatttcaaa480
tataatataaaacaacaaataatttaatgaagaaaatgttactaaaagcctaaataaaag540
tactaaatttaccaagataaacatacccctaaaattatttattatttttactcgctccct600
cgaaataacaataagaaatataattcaaacacttaaataaactataatataactgacata660
atctattcctaaattaaatcccaaactatatatatatatattatgaaaacatcttaaacc720
aactaaaaatcttaataatcctaatcctatctgagctgactttcagtcatcctttaattt780
tatcaatagaactacaggtaacaaaaactttaacattccagaagattaaatcttttaaaa840
taatcatttccatgcctacgaacaataagaactaataaagataaaccaagagctccttca900
catac905
<210>41
<211>1123
<212>dna
<213>人工序列()
<400>41
gagctgactttcagtcatcctttaattttatcaatagaactacaggtaacaaaaacttta60
acattccagaagattaaatcttttaaaataatcatttccatgcctacgaacaataagaac120
taataaagataaaccaagagctccttcacatacagctaaagttaaaaaaaataaagaaat180
gtaaatttccctaccaactatagacaactgtaaccttaataatcaaaaaactccaagcat240
tataaattctaatcttaacaacgaatttaataaatgtttattataagaaataaatctcca300
taaaccacaaaaaattataaataccgccccaaacactctcaaaaatctaaaatttatcat360
tagttttaatagttaatttaaaaaactaaaacattggtgttaaaatcctaaacatgaaat420
tttttcttaaaactcaagagaattattatctctattatttttatattaacaatcccctta480
ttaattgtttcttccttcttttttatacaactctctcaccctttggcaataggccttata540
ttatttattcaaacagtcttaatttcaattacaattggagtttccaacttttctttttga600
ttttcttatattctgtttttagtgtttttaggaggaatactagttttattcatttatatt660
gcttctttagcttcaaatgaatcattttctttttctttaattacttttttctttgctatt720
attttaacaggtttaattatctttattttattatttttagatcctatcttaatttctcct780
aattcttcatccctttcaacatcatcattaaaatatttagtctcgaccccattcattgtt840
aattgagtttataataccccatctataatatttactatttttattgtctcctatctacta900
cttatattaattgttgttgttaaaattattaatttgtttaaaggcccacttcgtcttata960
ttataatgacaacacctatacgcaaatcccaccctttatttaaaattgccaatggagcat1020
tagtagatatacctttaccaagtaacatttccacattttgaaactttggttccttgctag1080
gcctttgtttagttatccaaatcgcgacagggttattcttagc1123
<210>42
<211>1169
<212>dna
<213>人工序列()
<400>42
tctcgaccccattcattgttaattgagtttataataccccatctataatatttactattt60
ttattgtctcctatctactacttatattaattgttgttgttaaaattattaatttgttta120
aaggcccacttcgtcttatattataatgacaacacctatacgcaaatcccaccctttatt180
taaaattgccaatggagcattagtagatatacctttaccaagtaacatttccacattttg240
aaactttggttccttgctaggcctttgtttagttatccaaatcgcgacagggttattctt300
agctatacactactctgctcacgtagatctagctttttctagagttgcccacatttgtcg360
tgacgtaaattacggttgaatactacgaacccttcacgctaatggggcctctttcttctt420
tatttgcctctaccttcatattggacgaggcatctactttagatcttatataaaccttca480
tgcttgaatagtaggggtagtaattttatttataattatagcgactgcatttttaggcta540
tgttctaccatgaggacaaatatctttttgaggcgctacagttattacaaatttattttc600
cgctatcccatttatcggtaccgacctagtacaatgaatctgaggagggttttctgttga660
taatgccactttaactcgatttttttcattccattttattttacctttagtagcatcagc720
attttctataattcacattctatttttacaccaaacaggagctaataaccccttaggtat780
ttcaagacaaactgataaagtaccatttcatccttactttacatttaaagatattgttgg840
atttgtagttatattaacagccctaattttattaactcttctagccccatattttctagg900
agatccagataattttattcctgcaaaccctttagtaacccctcctcatatccaaccaga960
atggtattttctttttgcttacgctattttacgatcaattcctaataaattaggaggagt1020
tgtagcattagccgcttcagtggccattcttataattttaccatttacacacacttcaaa1080
atttcaaagattagcattttaccccattaatcaaatgttattctgaacctttgtagtcat1140
tgtagtactattgacctgaattggagcac1169
<210>43
<211>899
<212>dna
<213>人工序列()
<400>43
ccccatattttctaggagatccagataattttattcctgcaaaccctttagtaacccctc60
ctcatatccaaccagaatggtattttctttttgcttacgctattttacgatcaattccta120
ataaattaggaggagttgtagcattagccgcttcagtggccattcttataattttaccat180
ttacacacacttcaaaatttcaaagattagcattttaccccattaatcaaatgttattct240
gaacctttgtagtcattgtagtactattgacctgaattggagcacgcccggttgaagacc300
cttatgtcattactggacagattttaaccgtatcctatttcttgttctatattattaatc360
ctcttattcttatttgatgagataacatacttaaatgactatttagtttaaaaaaaacaa420
atgttttgaaaacattaaataagaataaattcttaatagtcgagtgtttcttaaataact480
atttacatttataaaattttaatatcttcctataaacttaatttttactcccattacttc540
taatatagtgcctgataaaaggatagttttgatagaactaattatgtaatttccagttac600
ctatgttattaaaatctttattaaaaagataagctaaataagctaatgggctcatacccc660
gtaaatgaaagtttaatctctctctttttaatcgcttttcctacctcttatttctttttc720
ctaataacactaatctcagggtcaattatctctatttcctcaacttcctgatttggagct780
tgaattggattagaactaaatctcatatcatttattcctcttattgcttttaaaataaac840
ccacttttttctgaagcagctttaaaatattttcttattcaggcattaggatctgtgct899
<210>44
<211>796
<212>dna
<213>人工序列()
<400>44
aagctaatgggctcataccccgtaaatgaaagtttaatctctctctttttaatcgctttt60
cctacctcttatttctttttcctaataacactaatctcagggtcaattatctctatttcc120
tcaacttcctgatttggagcttgaattggattagaactaaatctcatatcatttattcct180
cttattgcttttaaaataaacccacttttttctgaagcagctttaaaatattttcttatt240
caggcattaggatctgtgctatttatttcttcaagattccttttaatgtctttttattct300
tttagacttttatctatttttttagccctcttattaaaactaggaggagcccctttccac360
ttctgatttcctcaagttatagaaggtctaaaatgaccacaaatcttccttctatctaca420
attcaaaaactagcccccttaaccttaatttcttacctaataaacaacgaaatcttaatt480
aaaattacaattttttcagctattttatcagctttaatcggaagacttggtggtttaaac540
ttaaccctattacgaaaaattattgccttttcttcaattaatcacttatcttgaatatta600
atagcaatctcaattagagactcctcatgacttttttatttttttatttattcccttatt660
gtactttctattaccagagtatttcataaattacaaaccttctccctttctatactaatt720
caatctgatcaaaatagaacacttcacgctactattatttcacttaattttttatccttg780
agtggtcttccaccta796
<210>45
<211>798
<212>dna
<213>人工序列()
<400>45
ccttgagtggtcttccacctataacaggatttattcccaaatgaattgttattcaagtta60
tattaaatttaaatatatttatccccttattttttcttcttgtttctgctttgattactt120
tatatttttatttgcgaatcatcattaccataatcttaatattcaaccctattttaaatt180
ttaatatgaaatataaatctctaacagattccccatcttctctattttttaaatcctcct240
tcaacttttttggtcttctactaccagtatatttcacctttatctagaattttaagttat300
ttaaactaaaagccttcaaagctttctaaaaaagtattaaccttttaaattctatatttt360
aattattatgcaacgatgacttttttctacaaatcataaagatattggaacattatattt420
tattttcggtgcttgggccggaatagtaggaacatcattaagattaattattcgagctga480
attaagacaaccaggcagactaattggtaacgatcaaatttataatgtagttgtaacagc540
tcacgcttttgtaataattttttttatagtaatgcccattataattggtggatttggcaa600
ctgacttgtccctcttatactaggggccccagatatagctttcccacgaataaacaatat660
aagattctgacttttacccccttctctctctcttttacttacaagaagaatagtagaaag720
aggagttggtactgggtggactgtctacccacctttagcagcagccatcgctcatgctgg780
agcatcagttgatcttgg798
<210>46
<211>704
<212>dna
<213>人工序列()
<400>46
tattttcggtgcttgggccggaatagtaggaacatcattaagattaattattcgagctga60
attaagacaaccaggcagactaattggtaacgatcaaatttataatgtagttgtaacagc120
tcacgcttttgtaataattttttttatagtaatgcccattataattggtggatttggcaa180
ctgacttgtccctcttatactaggggccccagatatagctttcccacgaataaacaatat240
aagattctgacttttacccccttctctctctcttttacttacaagaagaatagtagaaag300
aggagttggtactgggtggactgtctacccacctttagcagcagccatcgctcatgctgg360
agcatcagttgatcttggtatcttctctctacatcttgccggagtttcctcaattttagg420
agctgttaatttcataacaacagttattaacatacgatcatatggaataacaatggatca480
aatacctctttttgtttgagctgtatttattactgctattttacttctcttatcccttcc540
agttttagctggagctattaccatactgcttacagatcgtaacctaaatacgtcattttt600
cgacccagcagggggaggtgacccagttctataccagcacttattctgatttttcggtca660
cccagaagtttatattctaattttgcctgccttcggtataatct704
<210>47
<211>1182
<212>dna
<213>人工序列()
<400>47
ctacatcttgccggagtttcctcaattttaggagctgttaatttcataacaacagttatt60
aacatacgatcatatggaataacaatggatcaaatacctctttttgtttgagctgtattt120
attactgctattttacttctcttatcccttccagttttagctggagctattaccatactg180
cttacagatcgtaacctaaatacgtcatttttcgacccagcagggggaggtgacccagtt240
ctataccagcacttattctgatttttcggtcacccagaagtttatattctaattttgcct300
gccttcggtataatctctcatattgtaagtcaagaatcaggtaaaaaggaatcttttgga360
actttaggtataatttacgctatactagctattggaattttgggctttgtagtatgagct420
catcatatatttacagtaggtatagacgtagatacccgagcttactttacctcagccact480
ataattattgctatccccaccggaattaaaatctttagatgactaaggaccttacatgga540
actcaaataaattattcaccatctcttctatgagctttagggtttatctttttatttact600
attggaggtctgacaggagtagttttagctaattcctcaattgatattattctccatgat660
acttattatgttgttgcccactttcattatgtactctctatgggagcagttttcggaatc720
tttgctggagttgctcactgattttctctaataacaggtttatctttcaaccctaaatga780
ctaaaaattcactttttagtaactttcgtcggagtcaatttaacattttttccccaacac840
tttttaggattaaacggcataccacgacgatactctgattatcctgacgcctatgcaact900
tgaaatattgtatcatctataggttctataatttcttttgtagccgcattaggattctta960
ttaatcgtttgagaagcatttgtttctaatcgcccagtaatcttttctccttttctgccc1020
tcttctattgaatggaaacatgcttatcctccagccgaccattcatatatggaaatccca1080
ctaattactaacttctaaaatggcagacagatgtgtaggatttaagctcctataaggaag1140
aataatttcttcttttagaataacttatggcaacatgagcgt1182
<210>48
<211>1108
<212>dna
<213>人工序列()
<400>48
tggcagacagatgtgtaggatttaagctcctataaggaagaataatttcttcttttagaa60
taacttatggcaacatgagcgtatttaaattttcaagacagagcttctcctcttatagaa120
caattaattttttttcacgatcatattatattagtgattgtgttaattgtaacatttgtt180
ggttatataatagcaacattgtttttcaactccctcattaaccgctatatattagaaaat240
caaccaatcgaagtaatttgaacatcagttccagcttttattttaatctttattgcttta300
ccatcccttcgcttactttatcttttagatgaagtaaacaatccttctataactcttaaa360
acaattggccaccaatgatattgaaggtatgaatattcagatttccttcaagtagaattt420
gactcatatatagtaccatctaatgagctggaagtatcagggttccggctactagacgta480
gacaatcgtaccgttcttccaataaatactcaaatccgagttctaattacagctgcagat540
gtcatccattcctggacagtcccatccttaggtattaaagccgatgcaattcccgggcgg600
ctaaatcaatcaaggtttttaatcaaccgacctggactattttacggtcaatgttcagaa660
atttgcggggcaaaccacagatttatgcccattgttattgaaagaacttctattaactca720
tttctaaattgaatttctctatcaattgaagcgtcaccctaactcatccttagttttact780
aatttttgggtgaaacaattccttctgtgaattactatttatgccacaaatagcacctat840
ttattgactatttatatttttcttttttttagccagattcctattatttttcgctcttaa900
ttacttcattaaacctttttataaagttaattttcttcaagataataaaaaacctttaat960
ttataaacattgaaaattataacaaatttattctcaatttttgaaccttcttcaagaatc1020
tttaatttatcgataaattgaatctcaactatcctaggattgatattcttaccttatata1080
tactgagcatccccttctcgttgatctt1108
<210>49
<211>1000
<212>dna
<213>人工序列()
<400>49
atccccttctcgttgatctttactttggggaaaaattatttcaaccttgcataaagaatt60
taaagctcttttacagccttcacataatggagcttctatagtattcattgctttatttag120
gttaattgtatttaataattttctaggcttattaccttatgtatttactagctctagtca180
tatggtaataacattatctttatctttgcccttgtgaattactttaataacatttgggtg240
aattaaacacactaaacatatatttgcccatttagttccccaagggacgcctttcgcttt300
aatgccatttatagtgttaattgaaaccattagaaatgtaattcggcctggtaccttagc360
aattcggctagccgctaatataattgccggtcatttacttttaaccttattaggaaatac420
tggcccttcattatcaacctccatcctattcattttattgtcagctcaaatactcctact480
aatcttagaatctgccgtagctattattcaatcttatgttttcgctgttttaagaactct540
ctacactagagaaattaactaatgacatcatcacacggctttcatccttatcatttagta600
gatattagaccctgaccaattactgggtctattagagctataatactaaccactggttta660
gtaaaatgatttcaccaacacaatataaaccttttaattttaagatttattgcaactttg720
ttaactataattcaatgatggcgagatattacccgtgaaggtacttaccaaggatcacac780
actttaacagtaataaaggggctacgctgaggtataattttatttattgtatcagaagtt840
ttatttttcttttcttttttttgagcttttttccatagaagactatctcctgctgtagaa900
attgggatatattggccgccattaggtattcaaccttttaaccctttccaaatccccctt960
ctaaacactacgattcttctatcgtcaggtgctacagtta1000
<210>50
<211>1198
<212>dna
<213>人工序列()
<400>50
ttggccgccattaggtattcaaccttttaaccctttccaaatcccccttctaaacactac60
gattcttctatcgtcaggtgctacagttacttgggctcatcacgcaattctagagggtaa120
ctactctcaagctgtacaaagactaggtttaactattatcctaggtatttattttacaat180
gctccaagcatttgaatatattgaagcttctttcactattgccgactcagtctttggttc240
aacattttttgtagcaactgggttccatggattacacgttatcattggaacttcattttt300
atttgtttgttttattcgactttataaatgtcacttttcttcttctcatcatttaggatt360
tgaggcagctgcttgatactgacactttgttgatgttgtttgattattcttatatatttt420
catttattgatgaggcggataatttttttaatataataagtatatctgatttccaatcag480
aaagtctaacttttagaaaaaataatctttacaatattgacaatttcagttattactctc540
atggtttcatatatcgttataactttagcgaccctcttatctaaaaagacaattatagat600
cgagaaaaaaattctccgtatgaatgtggattcgatcccaaaggatccgcccgtctacct660
ttttctctacgcttttttttaattgccgtaattttcctaatctttgatgtagaaattaca720
cttctgctgcctattgcttctacattaaacctaaccaatatgttttcttgattttttaca780
agtttaatttttttattaattttgttatttggtctttattatgaatgatcacaaagtgct840
ctagattgatcttagtaagaccatagtcaatatatgacgtatgagttgcattcataaaga900
gttttctaaactggttttaaaaattagaaagcgaataattgcatttagtttcgacctaaa960
ttttagactttagtcttctaattttggtggaaaccaaaaagaggtatatcactgttaatg1020
ataaaattgagttcaaactcctaccaagaagggatattatgctaaaggcagaaagcttct1080
aactttttactaagcggttaaattccgtttatatccctttgttatatatatgtacatatc1140
tatcaacctagccctagcactttgtttttatagtttaaaccaacccaaaacattggtc1198
<210>51
<211>1181
<212>dna
<213>人工序列()
<400>51
caaactcctaccaagaagggatattatgctaaaggcagaaagcttctaactttttactaa60
gcggttaaattccgtttatatccctttgttatatatatgtacatatctatcaacctagcc120
ctagcactttgtttttatagtttaaaccaacccaaaacattggtcttgtaaaccaataat180
gaattattttctaaaaactttcagaaaaaaagagtaactctttatctttaattcccaaaa240
ttaatattttttaaactatttcctgaatttattactctaaattttatgctgctagacaaa300
aacaaaacattttaaatctaacaaaaaaaatcaaataattaatagaaacaggaagataac360
tttttcatgctaaatatatcaatttatcataccgcagtcgaggtaaagtacctcggactc420
atacaaacccaaaagctactattacactcttaaaataaaacattactctgaacggccccc480
tacccaaaaaaaaaataacaaataaaaccctcatgaatagaatacttgcgtattcagcta540
taaaaattaatgcaaacccgccagccccgtactctgtattaaagccagagactagctcag600
attcaccttcagaaaaatcaaatggagttcgattagtctcagctaaacatgacctaaatc660
acaccattcttaaaggaaatctaattacaacaaatcaaaaataattttgatatttattaa720
acaactctaaattaaatccaccaattaatattacaaaagataataaaattaaagctaacc780
taacttcataagaaatagtttgagctaccgctcgcaaagaacctaataaagaatatttac840
aatttgatgatcatcccgccactatagttgaatacacccctacacttaaacaacacaaaa900
aaaacagaattctcagattaaaccttattaatccagtttcataaggtaaaactgatcata960
ctaataaagaaataaacaaactaaatacaggacataaatagtaaactaaaaagtttgata1020
tagtaggaataatttgttccttagtgaaaagctttactgcatcagaaaaaggctgtaaaa1080
ttcctatatagcctactttatttgggcctttacgaatttgaatataacctaaaatttttc1140
gttcaagtaaagttacaaaagccacgccaattaaaacacac1181
<210>52
<211>874
<212>dna
<213>人工序列()
<400>52
ctgcatcagaaaaaggctgtaaaattcctatatagcctactttatttgggcctttacgaa60
tttgaatataacctaaaatttttcgttcaagtaaagttacaaaagccacgccaattaaaa120
cacacactattaataccaaaaaattaactatctctacaattattaaagtcacaaaacaat180
tagattactaataatttaactatttatagaattgctctattttataggatcctaaatcca240
acacatattatctgccaaaatagtaatcattatataaaataattttaattatttaatcct300
ttcgtactaaaataatttttctttattaaaagatagaaaccaacctggcttacgccggtt360
tgaactcaaatcatgtaaaattttaaaggtcgaacagacctacttatataactgctacaa420
ttataaagatattttaattcaacatcgaggtcgcaaacttttctttcgataagtactctt480
aagaaaaataacgctgttatccctaaagtaacttaaacttttaatctttaattaggatca540
tttaaaattttaatcacatataagtgtacttaatgttaagcagttaataatcattttact600
cttatcgccccaataaaataaattcaatttacaaaatctttataacctaaaatttgacta660
tataaaatttaatattaagctttatagggtcttatcgtccctttaatacatttaagcctt720
ttcacttaaaagtaaaattcaataaacaatataaagacagatcttcttttgtccaaccat780
tcatacaagattccaattaaaaaactaacgattatgctacctttgcacggtcaaaatacc840
gcggccatttaatactatcaatcagtgggcaggt874
<210>53
<211>1376
<212>dna
<213>人工序列()
<400>53
gaaaccaacctggcttacgccggtttgaactcaaatcatgtaaaattttaaaggtcgaac60
agacctacttatataactgctacaattataaagatattttaattcaacatcgaggtcgca120
aacttttctttcgataagtactcttaagaaaaataacgctgttatccctaaagtaactta180
aacttttaatctttaattaggatcatttaaaattttaatcacatataagtgtacttaatg240
ttaagcagttaataatcattttactcttatcgccccaataaaataaattcaatttacaaa300
atctttataacctaaaatttgactatataaaatttaatattaagctttatagggtcttat360
cgtccctttaatacatttaagccttttcacttaaaagtaaaattcaataaacaatataaa420
gacagatcttcttttgtccaaccattcatacaagattccaattaaaaaactaacgattat480
gctacctttgcacggtcaaaataccgcggccatttaatactatcaatcagtgggcaggtt540
aaactttttataacttcaaacagacatgtttttgataaacaggcaaagaagttatttttg600
ccgagttcctttattccgccctatcaattttaaacaatatttattatttaaatgttttgc660
tttaataaaaaacttttactaataaaatcattataacttaactctttatatttaaattaa720
ttttttaatactccaaaaaagtttatataaatattatccaattttaatttagctagaaca780
ctttataaatatagctacttttaagcctaattcaccaattaaactattttaaactattta840
tcattttaattataagaagctaatccctcctacacttaaattttacatcttatcaacgta900
aaaattaaattaaatttactttttaaaaaactagatataataaaactcgactagcgtttc960
acctttaattttatattaaaaatttattttctacaaaaaattttttataaaattagctat1020
attttatttcgagatatttaatttttattaacttatataaattttccctgatacacaagg1080
tacaatatttaaaattttttacttcaaattttcttgctttcctttacagtactcttaact1140
atagtttataaattgtgtttattaaaaattactagcatgaacaaattacaaattattttt1200
cataaatataaaattttcaaatttatttaacaagtcattaataaatagatgggtaattat1260
taatttataaagaaaatatacatatcctcatctttactagatacactttccagtacatct1320
actatgttacgacttatttcacttataaatgaaagcgacgggcgatatgtacacaa1376
<210>54
<211>966
<212>dna
<213>人工序列()
<400>54
ctcgactagcgtttcacctttaattttatattaaaaatttattttctacaaaaaattttt60
tataaaattagctatattttatttcgagatatttaatttttattaacttatataaatttt120
ccctgatacacaaggtacaatatttaaaattttttacttcaaattttcttgctttccttt180
acagtactcttaactatagtttataaattgtgtttattaaaaattactagcatgaacaaa240
ttacaaattatttttcataaatataaaattttcaaatttatttaacaagtcattaataaa300
tagatgggtaattattaatttataaagaaaatatacatatcctcatctttactagataca360
ctttccagtacatctactatgttacgacttatttcacttataaatgaaagcgacgggcga420
tatgtacacaatttagaacttatatcttgttagcttattaaactaaaaatacaatcaaat480
ccatctttataataatattatcttattaatccgcagtaaagtaatttactgtaacccatt540
ttaccttgcttattggctgcaccatgatctaattttactaaacaactaaatttaataatt600
tttcctttaagaattatctgataatgatggtatacaaactgttagaattactaaagcaag660
taagatttttcgtggtttatcgattctaaaacaggttcctctgaatagattaaattgccg720
ccaaattttttaaattttaagtatttatcttttactaattcagttttatattaaatttat780
tttagaataatagggtatctaatcctagtttatttctaaacttttttagcttcaattata840
attttactccatacataataatatcctaattttaccttttattacctgtatgagattttt900
aatttaatcatctaactataaccttagaatttttactcaatcttaaagtataaccgcgaa960
tgctgg966
<210>55
<211>1085
<212>dna
<213>人工序列()
<400>55
tataaccgcgaatgctggcacaaatatatatcagattttaatattattactatatcacac60
cttcatgtataattttataatattttatgctgagacaataaaggtttataattttatttc120
actcgaataccaatttaatatttaattaaattgtttaaatcacactttaattttcataca180
attttaataataatgtaaaaacttaagccaaaatcaaacatttgtcgtgattgcaaataa240
taactttaaaaaacttaaatatactatatataacataaaaatgagaataagcttatactt300
aaagtataacttatacatcttaagcgccacaagctaacgttttaatattttaaactattt360
aagttttgttataactaatattgctacaaatatatttattatctacacaaaaacaaacaa420
tataatcaccaacccaaccacaaaaatttttataaacactttaatattattaagttgtaa480
ctcatttaacaacctaaaatatttcttaaacaaaaaatacatcccctggccaccaaaata540
ttcaaatcaccctttgtctcctaatttttcaacacctaccccactaatgagactagaccc600
tctaattttttttgtcctaagaaaaggtataaatcatatagacccccttattactactat660
cttataattattaatagattttaaattgtaacttacatttaataaattaaatatataacc720
tataactccccctgctaatcttacccccaacactatatttttcattattacattcaaaca780
aattatataaggctctgggaaaataacccaagatagaacagctcctataaaaatagctct840
tacacctagtaaaatcatagaatttcttataattttatcctcatccctaatatttattat900
aactcttaaatttgaattacctcttaacctataaaaaattagacgtatagtatacataac960
tgttaaccctgtagctaaaatatataacagtaaagaaataaaattaatccatctcataaa1020
agccacctctaaaattatatctttagaataaaaccctgctaaaaaagggaacccacataa1080
ggcta1085
<210>56
<211>1019
<212>dna
<213>人工序列()
<400>56
agggaacccacataaggctaaatttgaaactcttataaaagacactcttaacggcataaa60
tttaattaaaccacctatacatcgaatatcctgataattgccaaccctatggataataat120
acctgcgcatataaataacaatgctttaaataatgcatgactcagcagatgaaaaaaaga180
aagatcagggtatcctaaagctaaaatacttaacataacccccaattgacttaacgttga240
taaggcaataattttttttaaatcatattcaaaattggcccctaatcccgccataaatat300
agttaagcaagaaataattaataatattccttggattttagaaccttctaacgcaccact360
aaatcgaattattaaatacaccccagcagttactaaagtagaagaatgtactaaagcaga420
aacaggagtaggagctgctatagcggcaggaagccatgctgagaaaggaatttgagcact480
tttagtcatagctcttaacattaacaaaaacttaaacaaaattcactcagtatctataat540
atagtaagaataaataacaaaatttcatctacctaacctggccattagtccaatactaag600
taaaatagcaacatcacctactcgattagataagatagttaacatcccagcattagcaga660
cttttcattttgataaaaaattactaaagcataagaaactaaacctaatccatcccatcc720
taaaagaatacttaccaagttaggtcttaaaactattatagccatagataaaacaaacat780
taaaactaaatatataaatcgattaaagtttttatcctccttcatatatctacctctata840
atacatcacacttccagaaataagcaatacaaaacacaaaaaaagtatcgaaattcaatc900
aaaaattaaaacaaacaccactgataatgaatttaatcttgctaaatcccattcaattac960
actagtaacaccactaaataattttattaaagaaactgttccacaaactaaagaccccg1019
<210>57
<211>875
<212>dna
<213>人工序列()
<400>57
cctctataatacatcacacttccagaaataagcaatacaaaacacaaaaaaagtatcgaa60
attcaatcaaaaattaaaacaaacaccactgataatgaatttaatcttgctaaatcccat120
tcaattacactagtaacaccactaaataattttattaaagaaactgttccacaaactaaa180
gaccccgctcatagcccaagtattctaatcttatgtatataaattattcaaaccattatt240
taaatattaaattattaatttaatacaaaatacagtaacatttctaccaatggtacaaaa300
caattagtagtaattaaatctaaataaatcaaagcaaatcgatttgcacgataaatcttt360
tcaacgtaactgaaatgctgttctattttagctctgctttgacactatcatattatattt420
ccaatctactttacatttaaataatttattaaaaaaagctactaaaaatattaagaaatg480
ataatactattatattatacaattttatttttctttatttatacggaggtatataaggta540
tatataaatatatcacattagatataagtaaataatataaacaaatcaaatatataaaaa600
ttaaatatgtatattcgcctccacaattataccccatccaatataatacaggatagataa660
aacattaaaattataaaagggtaaaattataaataaatagaagtatataatgtcttagtt720
tatatggaacattgaaacattttatataaaagtaaaaattatatgtaacttcattatata780
aatatatgatttatactatttttatttattctatgggttgaaaaaaagtagtagtctcaa840
ccctagaccctaattcctctagaggggaaacgggt875
<210>58
<211>16438
<212>dna
<213>人工序列()
<400>58
ttacatgcaacggaattgcaccgtttcttaaaagatcaaaacttcttatgctctttacat60
cagcatataaattattttcaaaccctagtgatttacacatctttaaacttgcaatttaat120
attatttttatactatagggcctaataaaggaatctcattcgtctacagatttacaatct180
gccgcttacaactcagccactttattaatttttaaataaatagtatactcgatgactgaa240
aggtaagtatagatcttttaaatctaatatagtaatttaacatttacttcgagtaaggaa300
ttagttaaaatataataacatttgcttgtcatgcaaaagtcatctttaagatactcctta360
aatttcagttttatttgttttatggtgtagataacacattgtattttcgttacaaaaccg420
aaactaatgtttctagaacattataatactttgcccacagataatatttatctcttttgc480
agcttcaatgcaatattctatataaattatataagctacttatattaatctagctttacg540
ttatacgccattaactaaatttaaatttaaaattaacatatttaaaggaaatcaatgtaa600
aaatagaactaaatattctcgaacttttcctgacctacaagaatataaactactgacgaa660
aatcccatgctgacttaaactatatatgtataaagtataagctgctctgaaaaaagaaag720
aaatataattcccattactgtaaatgtccttcaccttattaaactaataatcaacctaat780
ctccccgaatagatttaaagtagggggagcagccatattacccactctaaataaaaatca840
tcacaaacctatcctaggtataaaatttaataaacccttactaactaaaagactacgcct900
accaactcgctcgtatactatattagccaaacaaaataatccagaagaacataacccgtg960
tccgactattactacaacagctcctattagtcctcatcatctaaaaatcattagaccaca1020
tagtactattctcatatgaacaaccgaagaataagcaatcaaggactttatatctacctg1080
gcgtagacacaaaagactcactactactccccctactaaactaattctaacccataacga1140
cgaaaaattcaagctaattttctgaaatatcaataacacccgaatcaaaccatacccgcc1200
taactttaataaaactcctgctaaaattatagaaccagcaaccggggcttctacgtgagc1260
ttttggcaaccataaatgaaatatatatatcggtaatttaactaaaaaagccatcaccct1320
tctaaaatatcaaatactgtttgcccagctaacttctaaaataagatttcttaatattat1380
aactaacctatattcttttatataaatatacaataaagaccccaataaaggtaaagatag1440
tgacaaagtataaaaaagtatataaactccagcttgaattcgttcaggttgatatcccca1500
tccaagaatcaaaattaaagtgggaattaacgatatttcaaatataatataaaacaacaa1560
ataatttaatgaagaaaatgttactaaaagcctaaataaaagtactaaatttaccaagat1620
aaacatacccctaaaattatttattatttttactcgctccctcgaaataacaataagaaa1680
tataattcaaacacttaaataaactataatataactgacataatctattcctaaattaaa1740
tcccaaactatatatatatatattatgaaaacatcttaaaccaactaaaaatcttaataa1800
tcctaatcctatctgagctgactttcagtcatcctttaattttatcaatagaactacagg1860
taacaaaaactttaacattccagaagattaaatcttttaaaataatcatttccatgccta1920
cgaacaataagaactaataaagataaaccaagagctccttcacatacagctaaagttaaa1980
aaaaataaagaaatgtaaatttccctaccaactatagacaactgtaaccttaataatcaa2040
aaaactccaagcattataaattctaatcttaacaacgaatttaataaatgtttattataa2100
gaaataaatctccataaaccacaaaaaattataaataccgccccaaacactctcaaaaat2160
ctaaaatttatcattagttttaatagttaatttaaaaaactaaaacattggtgttaaaat2220
cctaaacatgaaattttttcttaaaactcaagagaattattatctctattatttttatat2280
taacaatccccttattaattgtttcttccttcttttttatacaactctctcaccctttgg2340
caataggccttatattatttattcaaacagtcttaatttcaattacaattggagtttcca2400
acttttctttttgattttcttatattctgtttttagtgtttttaggaggaatactagttt2460
tattcatttatattgcttctttagcttcaaatgaatcattttctttttctttaattactt2520
ttttctttgctattattttaacaggtttaattatctttattttattatttttagatccta2580
tcttaatttctcctaattcttcatccctttcaacatcatcattaaaatatttagtctcga2640
ccccattcattgttaattgagtttataataccccatctataatatttactatttttattg2700
tctcctatctactacttatattaattgttgttgttaaaattattaatttgtttaaaggcc2760
cacttcgtcttatattataatgacaacacctatacgcaaatcccaccctttatttaaaat2820
tgccaatggagcattagtagatatacctttaccaagtaacatttccacattttgaaactt2880
tggttccttgctaggcctttgtttagttatccaaatcgcgacagggttattcttagctat2940
acactactctgctcacgtagatctagctttttctagagttgcccacatttgtcgtgacgt3000
aaattacggttgaatactacgaacccttcacgctaatggggcctctttcttctttatttg3060
cctctaccttcatattggacgaggcatctactttagatcttatataaaccttcatgcttg3120
aatagtaggggtagtaattttatttataattatagcgactgcatttttaggctatgttct3180
accatgaggacaaatatctttttgaggcgctacagttattacaaatttattttccgctat3240
cccatttatcggtaccgacctagtacaatgaatctgaggagggttttctgttgataatgc3300
cactttaactcgatttttttcattccattttattttacctttagtagcatcagcattttc3360
tataattcacattctatttttacaccaaacaggagctaataaccccttaggtatttcaag3420
acaaactgataaagtaccatttcatccttactttacatttaaagatattgttggatttgt3480
agttatattaacagccctaattttattaactcttctagccccatattttctaggagatcc3540
agataattttattcctgcaaaccctttagtaacccctcctcatatccaaccagaatggta3600
ttttctttttgcttacgctattttacgatcaattcctaataaattaggaggagttgtagc3660
attagccgcttcagtggccattcttataattttaccatttacacacacttcaaaatttca3720
aagattagcattttaccccattaatcaaatgttattctgaacctttgtagtcattgtagt3780
actattgacctgaattggagcacgcccggttgaagacccttatgtcattactggacagat3840
tttaaccgtatcctatttcttgttctatattattaatcctcttattcttatttgatgaga3900
taacatacttaaatgactatttagtttaaaaaaaacaaatgttttgaaaacattaaataa3960
gaataaattcttaatagtcgagtgtttcttaaataactatttacatttataaaattttaa4020
tatcttcctataaacttaatttttactcccattacttctaatatagtgcctgataaaagg4080
atagttttgatagaactaattatgtaatttccagttacctatgttattaaaatctttatt4140
aaaaagataagctaaataagctaatgggctcataccccgtaaatgaaagtttaatctctc4200
tctttttaatcgcttttcctacctcttatttctttttcctaataacactaatctcagggt4260
caattatctctatttcctcaacttcctgatttggagcttgaattggattagaactaaatc4320
tcatatcatttattcctcttattgcttttaaaataaacccacttttttctgaagcagctt4380
taaaatattttcttattcaggcattaggatctgtgctatttatttcttcaagattccttt4440
taatgtctttttattcttttagacttttatctatttttttagccctcttattaaaactag4500
gaggagcccctttccacttctgatttcctcaagttatagaaggtctaaaatgaccacaaa4560
tcttccttctatctacaattcaaaaactagcccccttaaccttaatttcttacctaataa4620
acaacgaaatcttaattaaaattacaattttttcagctattttatcagctttaatcggaa4680
gacttggtggtttaaacttaaccctattacgaaaaattattgccttttcttcaattaatc4740
acttatcttgaatattaatagcaatctcaattagagactcctcatgacttttttattttt4800
ttatttattcccttattgtactttctattaccagagtatttcataaattacaaaccttct4860
ccctttctatactaattcaatctgatcaaaatagaacacttcacgctactattatttcac4920
ttaattttttatccttgagtggtcttccacctataacaggatttattcccaaatgaattg4980
ttattcaagttatattaaatttaaatatatttatccccttattttttcttcttgtttctg5040
ctttgattactttatatttttatttgcgaatcatcattaccataatcttaatattcaacc5100
ctattttaaattttaatatgaaatataaatctctaacagattccccatcttctctatttt5160
ttaaatcctccttcaacttttttggtcttctactaccagtatatttcacctttatctaga5220
attttaagttatttaaactaaaagccttcaaagctttctaaaaaagtattaaccttttaa5280
attctatattttaattattatgcaacgatgacttttttctacaaatcataaagatattgg5340
aacattatattttattttcggtgcttgggccggaatagtaggaacatcattaagattaat5400
tattcgagctgaattaagacaaccaggcagactaattggtaacgatcaaatttataatgt5460
agttgtaacagctcacgcttttgtaataattttttttatagtaatgcccattataattgg5520
tggatttggcaactgacttgtccctcttatactaggggccccagatatagctttcccacg5580
aataaacaatataagattctgacttttacccccttctctctctcttttacttacaagaag5640
aatagtagaaagaggagttggtactgggtggactgtctacccacctttagcagcagccat5700
cgctcatgctggagcatcagttgatcttggtatcttctctctacatcttgccggagtttc5760
ctcaattttaggagctgttaatttcataacaacagttattaacatacgatcatatggaat5820
aacaatggatcaaatacctctttttgtttgagctgtatttattactgctattttacttct5880
cttatcccttccagttttagctggagctattaccatactgcttacagatcgtaacctaaa5940
tacgtcatttttcgacccagcagggggaggtgacccagttctataccagcacttattctg6000
atttttcggtcacccagaagtttatattctaattttgcctgccttcggtataatctctca6060
tattgtaagtcaagaatcaggtaaaaaggaatcttttggaactttaggtataatttacgc6120
tatactagctattggaattttgggctttgtagtatgagctcatcatatatttacagtagg6180
tatagacgtagatacccgagcttactttacctcagccactataattattgctatccccac6240
cggaattaaaatctttagatgactaaggaccttacatggaactcaaataaattattcacc6300
atctcttctatgagctttagggtttatctttttatttactattggaggtctgacaggagt6360
agttttagctaattcctcaattgatattattctccatgatacttattatgttgttgccca6420
ctttcattatgtactctctatgggagcagttttcggaatctttgctggagttgctcactg6480
attttctctaataacaggtttatctttcaaccctaaatgactaaaaattcactttttagt6540
aactttcgtcggagtcaatttaacattttttccccaacactttttaggattaaacggcat6600
accacgacgatactctgattatcctgacgcctatgcaacttgaaatattgtatcatctat6660
aggttctataatttcttttgtagccgcattaggattcttattaatcgtttgagaagcatt6720
tgtttctaatcgcccagtaatcttttctccttttctgccctcttctattgaatggaaaca6780
tgcttatcctccagccgaccattcatatatggaaatcccactaattactaacttctaaaa6840
tggcagacagatgtgtaggatttaagctcctataaggaagaataatttcttcttttagaa6900
taacttatggcaacatgagcgtatttaaattttcaagacagagcttctcctcttatagaa6960
caattaattttttttcacgatcatattatattagtgattgtgttaattgtaacatttgtt7020
ggttatataatagcaacattgtttttcaactccctcattaaccgctatatattagaaaat7080
caaccaatcgaagtaatttgaacatcagttccagcttttattttaatctttattgcttta7140
ccatcccttcgcttactttatcttttagatgaagtaaacaatccttctataactcttaaa7200
acaattggccaccaatgatattgaaggtatgaatattcagatttccttcaagtagaattt7260
gactcatatatagtaccatctaatgagctggaagtatcagggttccggctactagacgta7320
gacaatcgtaccgttcttccaataaatactcaaatccgagttctaattacagctgcagat7380
gtcatccattcctggacagtcccatccttaggtattaaagccgatgcaattcccgggcgg7440
ctaaatcaatcaaggtttttaatcaaccgacctggactattttacggtcaatgttcagaa7500
atttgcggggcaaaccacagatttatgcccattgttattgaaagaacttctattaactca7560
tttctaaattgaatttctctatcaattgaagcgtcaccctaactcatccttagttttact7620
aatttttgggtgaaacaattccttctgtgaattactatttatgccacaaatagcacctat7680
ttattgactatttatatttttcttttttttagccagattcctattatttttcgctcttaa7740
ttacttcattaaacctttttataaagttaattttcttcaagataataaaaaacctttaat7800
ttataaacattgaaaattataacaaatttattctcaatttttgaaccttcttcaagaatc7860
tttaatttatcgataaattgaatctcaactatcctaggattgatattcttaccttatata7920
tactgagcatccccttctcgttgatctttactttggggaaaaattatttcaaccttgcat7980
aaagaatttaaagctcttttacagccttcacataatggagcttctatagtattcattgct8040
ttatttaggttaattgtatttaataattttctaggcttattaccttatgtatttactagc8100
tctagtcatatggtaataacattatctttatctttgcccttgtgaattactttaataaca8160
tttgggtgaattaaacacactaaacatatatttgcccatttagttccccaagggacgcct8220
ttcgctttaatgccatttatagtgttaattgaaaccattagaaatgtaattcggcctggt8280
accttagcaattcggctagccgctaatataattgccggtcatttacttttaaccttatta8340
ggaaatactggcccttcattatcaacctccatcctattcattttattgtcagctcaaata8400
ctcctactaatcttagaatctgccgtagctattattcaatcttatgttttcgctgtttta8460
agaactctctacactagagaaattaactaatgacatcatcacacggctttcatccttatc8520
atttagtagatattagaccctgaccaattactgggtctattagagctataatactaacca8580
ctggtttagtaaaatgatttcaccaacacaatataaaccttttaattttaagatttattg8640
caactttgttaactataattcaatgatggcgagatattacccgtgaaggtacttaccaag8700
gatcacacactttaacagtaataaaggggctacgctgaggtataattttatttattgtat8760
cagaagttttatttttcttttcttttttttgagcttttttccatagaagactatctcctg8820
ctgtagaaattgggatatattggccgccattaggtattcaaccttttaaccctttccaaa8880
tcccccttctaaacactacgattcttctatcgtcaggtgctacagttacttgggctcatc8940
acgcaattctagagggtaactactctcaagctgtacaaagactaggtttaactattatcc9000
taggtatttattttacaatgctccaagcatttgaatatattgaagcttctttcactattg9060
ccgactcagtctttggttcaacattttttgtagcaactgggttccatggattacacgtta9120
tcattggaacttcatttttatttgtttgttttattcgactttataaatgtcacttttctt9180
cttctcatcatttaggatttgaggcagctgcttgatactgacactttgttgatgttgttt9240
gattattcttatatattttcatttattgatgaggcggataatttttttaatataataagt9300
atatctgatttccaatcagaaagtctaacttttagaaaaaataatctttacaatattgac9360
aatttcagttattactctcatggtttcatatatcgttataactttagcgaccctcttatc9420
taaaaagacaattatagatcgagaaaaaaattctccgtatgaatgtggattcgatcccaa9480
aggatccgcccgtctacctttttctctacgcttttttttaattgccgtaattttcctaat9540
ctttgatgtagaaattacacttctgctgcctattgcttctacattaaacctaaccaatat9600
gttttcttgattttttacaagtttaatttttttattaattttgttatttggtctttatta9660
tgaatgatcacaaagtgctctagattgatcttagtaagaccatagtcaatatatgacgta9720
tgagttgcattcataaagagttttctaaactggttttaaaaattagaaagcgaataattg9780
catttagtttcgacctaaattttagactttagtcttctaattttggtggaaaccaaaaag9840
aggtatatcactgttaatgataaaattgagttcaaactcctaccaagaagggatattatg9900
ctaaaggcagaaagcttctaactttttactaagcggttaaattccgtttatatccctttg9960
ttatatatatgtacatatctatcaacctagccctagcactttgtttttatagtttaaacc10020
aacccaaaacattggtcttgtaaaccaataatgaattattttctaaaaactttcagaaaa10080
aaagagtaactctttatctttaattcccaaaattaatattttttaaactatttcctgaat10140
ttattactctaaattttatgctgctagacaaaaacaaaacattttaaatctaacaaaaaa10200
aatcaaataattaatagaaacaggaagataactttttcatgctaaatatatcaatttatc10260
ataccgcagtcgaggtaaagtacctcggactcatacaaacccaaaagctactattacact10320
cttaaaataaaacattactctgaacggccccctacccaaaaaaaaaataacaaataaaac10380
cctcatgaatagaatacttgcgtattcagctataaaaattaatgcaaacccgccagcccc10440
gtactctgtattaaagccagagactagctcagattcaccttcagaaaaatcaaatggagt10500
tcgattagtctcagctaaacatgacctaaatcacaccattcttaaaggaaatctaattac10560
aacaaatcaaaaataattttgatatttattaaacaactctaaattaaatccaccaattaa10620
tattacaaaagataataaaattaaagctaacctaacttcataagaaatagtttgagctac10680
cgctcgcaaagaacctaataaagaatatttacaatttgatgatcatcccgccactatagt10740
tgaatacacccctacacttaaacaacacaaaaaaaacagaattctcagattaaaccttat10800
taatccagtttcataaggtaaaactgatcatactaataaagaaataaacaaactaaatac10860
aggacataaatagtaaactaaaaagtttgatatagtaggaataatttgttccttagtgaa10920
aagctttactgcatcagaaaaaggctgtaaaattcctatatagcctactttatttgggcc10980
tttacgaatttgaatataacctaaaatttttcgttcaagtaaagttacaaaagccacgcc11040
aattaaaacacacactattaataccaaaaaattaactatctctacaattattaaagtcac11100
aaaacaattagattactaataatttaactatttatagaattgctctattttataggatcc11160
taaatccaacacatattatctgccaaaatagtaatcattatataaaataattttaattat11220
ttaatcctttcgtactaaaataatttttctttattaaaagatagaaaccaacctggctta11280
cgccggtttgaactcaaatcatgtaaaattttaaaggtcgaacagacctacttatataac11340
tgctacaattataaagatattttaattcaacatcgaggtcgcaaacttttctttcgataa11400
gtactcttaagaaaaataacgctgttatccctaaagtaacttaaacttttaatctttaat11460
taggatcatttaaaattttaatcacatataagtgtacttaatgttaagcagttaataatc11520
attttactcttatcgccccaataaaataaattcaatttacaaaatctttataacctaaaa11580
tttgactatataaaatttaatattaagctttatagggtcttatcgtccctttaatacatt11640
taagccttttcacttaaaagtaaaattcaataaacaatataaagacagatcttcttttgt11700
ccaaccattcatacaagattccaattaaaaaactaacgattatgctacctttgcacggtc11760
aaaataccgcggccatttaatactatcaatcagtgggcaggttaaactttttataacttc11820
aaacagacatgtttttgataaacaggcaaagaagttatttttgccgagttcctttattcc11880
gccctatcaattttaaacaatatttattatttaaatgttttgctttaataaaaaactttt11940
actaataaaatcattataacttaactctttatatttaaattaattttttaatactccaaa12000
aaagtttatataaatattatccaattttaatttagctagaacactttataaatatagcta12060
cttttaagcctaattcaccaattaaactattttaaactatttatcattttaattataaga12120
agctaatccctcctacacttaaattttacatcttatcaacgtaaaaattaaattaaattt12180
actttttaaaaaactagatataataaaactcgactagcgtttcacctttaattttatatt12240
aaaaatttattttctacaaaaaattttttataaaattagctatattttatttcgagatat12300
ttaatttttattaacttatataaattttccctgatacacaaggtacaatatttaaaattt12360
tttacttcaaattttcttgctttcctttacagtactcttaactatagtttataaattgtg12420
tttattaaaaattactagcatgaacaaattacaaattatttttcataaatataaaatttt12480
caaatttatttaacaagtcattaataaatagatgggtaattattaatttataaagaaaat12540
atacatatcctcatctttactagatacactttccagtacatctactatgttacgacttat12600
ttcacttataaatgaaagcgacgggcgatatgtacacaatttagaacttatatcttgtta12660
gcttattaaactaaaaatacaatcaaatccatctttataataatattatcttattaatcc12720
gcagtaaagtaatttactgtaacccattttaccttgcttattggctgcaccatgatctaa12780
ttttactaaacaactaaatttaataatttttcctttaagaattatctgataatgatggta12840
tacaaactgttagaattactaaagcaagtaagatttttcgtggtttatcgattctaaaac12900
aggttcctctgaatagattaaattgccgccaaattttttaaattttaagtatttatcttt12960
tactaattcagttttatattaaatttattttagaataatagggtatctaatcctagttta13020
tttctaaacttttttagcttcaattataattttactccatacataataatatcctaattt13080
taccttttattacctgtatgagatttttaatttaatcatctaactataaccttagaattt13140
ttactcaatcttaaagtataaccgcgaatgctggcacaaatatatatcagattttaatat13200
tattactatatcacaccttcatgtataattttataatattttatgctgagacaataaagg13260
tttataattttatttcactcgaataccaatttaatatttaattaaattgtttaaatcaca13320
ctttaattttcatacaattttaataataatgtaaaaacttaagccaaaatcaaacatttg13380
tcgtgattgcaaataataactttaaaaaacttaaatatactatatataacataaaaatga13440
gaataagcttatacttaaagtataacttatacatcttaagcgccacaagctaacgtttta13500
atattttaaactatttaagttttgttataactaatattgctacaaatatatttattatct13560
acacaaaaacaaacaatataatcaccaacccaaccacaaaaatttttataaacactttaa13620
tattattaagttgtaactcatttaacaacctaaaatatttcttaaacaaaaaatacatcc13680
cctggccaccaaaatattcaaatcaccctttgtctcctaatttttcaacacctaccccac13740
taatgagactagaccctctaattttttttgtcctaagaaaaggtataaatcatatagacc13800
cccttattactactatcttataattattaatagattttaaattgtaacttacatttaata13860
aattaaatatataacctataactccccctgctaatcttacccccaacactatatttttca13920
ttattacattcaaacaaattatataaggctctgggaaaataacccaagatagaacagctc13980
ctataaaaatagctcttacacctagtaaaatcatagaatttcttataattttatcctcat14040
ccctaatatttattataactcttaaatttgaattacctcttaacctataaaaaattagac14100
gtatagtatacataactgttaaccctgtagctaaaatatataacagtaaagaaataaaat14160
taatccatctcataaaagccacctctaaaattatatctttagaataaaaccctgctaaaa14220
aagggaacccacataaggctaaatttgaaactcttataaaagacactcttaacggcataa14280
atttaattaaaccacctatacatcgaatatcctgataattgccaaccctatggataataa14340
tacctgcgcatataaataacaatgctttaaataatgcatgactcagcagatgaaaaaaag14400
aaagatcagggtatcctaaagctaaaatacttaacataacccccaattgacttaacgttg14460
ataaggcaataattttttttaaatcatattcaaaattggcccctaatcccgccataaata14520
tagttaagcaagaaataattaataatattccttggattttagaaccttctaacgcaccac14580
taaatcgaattattaaatacaccccagcagttactaaagtagaagaatgtactaaagcag14640
aaacaggagtaggagctgctatagcggcaggaagccatgctgagaaaggaatttgagcac14700
ttttagtcatagctcttaacattaacaaaaacttaaacaaaattcactcagtatctataa14760
tatagtaagaataaataacaaaatttcatctacctaacctggccattagtccaatactaa14820
gtaaaatagcaacatcacctactcgattagataagatagttaacatcccagcattagcag14880
acttttcattttgataaaaaattactaaagcataagaaactaaacctaatccatcccatc14940
ctaaaagaatacttaccaagttaggtcttaaaactattatagccatagataaaacaaaca15000
ttaaaactaaatatataaatcgattaaagtttttatcctccttcatatatctacctctat15060
aatacatcacacttccagaaataagcaatacaaaacacaaaaaaagtatcgaaattcaat15120
caaaaattaaaacaaacaccactgataatgaatttaatcttgctaaatcccattcaatta15180
cactagtaacaccactaaataattttattaaagaaactgttccacaaactaaagaccccg15240
ctcatagcccaagtattctaatcttatgtatataaattattcaaaccattatttaaatat15300
taaattattaatttaatacaaaatacagtaacatttctaccaatggtacaaaacaattag15360
tagtaattaaatctaaataaatcaaagcaaatcgatttgcacgataaatcttttcaacgt15420
aactgaaatgctgttctattttagctctgctttgacactatcatattatatttccaatct15480
actttacatttaaataatttattaaaaaaagctactaaaaatattaagaaatgataatac15540
tattatattatacaattttatttttctttatttatacggaggtatataaggtatatataa15600
atatatcacattagatataagtaaataatataaacaaatcaaatatataaaaattaaata15660
tgtatattcgcctccacaattataccccatccaatataatacaggatagataaaacatta15720
aaattataaaagggtaaaattataaataaatagaagtatataatgtcttagtttatatgg15780
aacattgaaacattttatataaaagtaaaaattatatgtaacttcattatataaatatat15840
gatttatactatttttatttattctatgggttgaaaaaaagtagtagtctcaaccctaga15900
ccctaattcctctagaggggaaacgggtctagaccgttgagactactactataatagggg15960
caaagaacattatattatatttaggtaaatataaattaaatatttaattatactaacaaa16020
taatttaacattaatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatata16080
tatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatata16140
tatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatata16200
tatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatata16260
tatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatata16320
tatatatatatgtatatatgtatatgtatatatgtatatgtatatatgtatatgtatata16380
tgtatatgtatatatgtatatgctttgtactctacaatatataatatctactatatac16438