1.一种分离的细胞,其中abo基因的表达因所述abo基因的有害变异或通过插入所述abo基因的外显子6258delg变异而部分或完全失活,而rhd基因的表达因所述rhd基因的有害变异而部分或完全失活。
2.如权利要求1所述的细胞,其中所述abo基因的表达因所述abo基因的外显子1的acacct内;外显子2的agtgcg内;或外显子8的caagcgc、ggcgca、tgggcg、accacg、gccgca、ccacgt、tgccgt、tactcg、actcgg、gagcgc、gcctgg、gtcctt、tcacgc、tggacg、tggtcg、gctggc、cacgcg、aggtga或gcatcg内的插入或缺失而部分或完全失活。
3.如权利要求1或2所述的细胞,其中所述abo基因的所述有害变异是使用包含指导rna靶序列的crispr-cas9基因编辑产生的,所述指导rna靶序列包含选自由表a-表c中的那些序列组成的组中的一个。
4.如权利要求1至3中任一项所述的细胞,其中所述abo基因的所述有害变异包括编码外显子中的插入/缺失,并且所述指导rna靶序列包含seq id no:1或seq id no:2。
5.如权利要求3所述的细胞,其中所述abo基因的所述有害变异包括移码插入/缺失,并且所述指导rna靶序列包含seq id no:3。
6.如权利要求1至2中任一项所述的细胞,其中所述abo基因的所述有害变异是纯合变异,使得所述细胞是组织血型o细胞。
7.如权利要求1所述的细胞,其中所述abo基因的所述外显子6258delg变异是使用crispr-cas9基因编辑产生的,所述crispr-cas9基因编辑包含指导rna靶序列和同源定向修复(hdr)模板,所述指导rna靶序列包含选自由seq id no:3-5组成的组中的一个,所述同源定向修复(hdr)模板包含编码258de1g变异的序列、pam序列、间隔子区和两个同源臂,每个同源臂包含约10个核苷酸到约1kb的所述abo基因的同源序列。
8.如权利要求7所述的细胞,其中所述hdr模板还包含在所述pam序列和/或所述间隔子区中的一个或多个沉默突变,以确保所述hdr模板不被cas9切割。
9.如权利要求1和7至8中任一项所述的细胞,其中所述abo基因的所述外显子6258delg变异是使用crispr-cas9基因编辑产生的,所述crispr-cas9基因编辑包含有包含选自由seq id no:3-5组成的组中的一个的指导rna靶序列并且所述hdr模板包含选自由seq idno:6-8组成的组中的一个。
10.如权利要求1和7至9中任一项所述的细胞,其中所述abo基因的所述外显子6258delg变异是纯合变异,使得所述细胞是组织血型o细胞。
11.如权利要求1至10中任一项所述的细胞,其中所述rhd基因的所述有害变异是通过使用包含一个或多个指导rna靶序列的crispr-cas9基因编辑产生的,所述指导rna靶序列包含选自由表d-表f中的那些序列组成的组中的一个。
12.如权利要求11所述的细胞,其中所述有害变异包括缺失包含所述rhd基因的外显子1-8的基因组区,并且通过使用crispr-cas9基因编辑产生,所述crispr-cas9基因编辑包含有包含seq id no:11的指导rna靶序列和包含seq id no:12的另一个指导rna。
13.如权利要求11所述的细胞,其中所述rhd基因的所述有害变异包括移码插入/缺失,并且所述指导rna靶序列包含seq id no:9或seq id no:10。
14.如权利要求1至13中任一项所述的细胞,其中所述rhd基因的表达因所述rhd基因的外显子2的tcatgg、gaggtg、aactcg、agtttc、ttggct或cacagc内;外显子3的ccgtga内;外显子4的gggtag或agggaa内;外显子5的ttcgat、tcagcg、catagt或atcgaa内;外显子6的cgtcgg或tccgtc内;外显子7的cggcaa、cggagc、taccgt、gcttgc或cttgct内;或外显子8的ggttct或tcctac内的插入或缺失而部分或完全失活。
15.如权利要求1至14中任一项所述的细胞,其中所述rhd基因的所述有害变异是纯合变异,使得所述细胞是恒河猴因子(rh)阴性细胞。
16.如权利要求1至15中任一项所述的细胞,其中所述rhd基因的所述有害变异是纯合变异,使得所述细胞是o型阴性细胞。
17.一种分离的细胞,其中abo基因的表达因所述abo基因的有害变异或通过插入所述abo基因的外显子6 258deig变异而部分或完全失活。
18.如权利要求17所述的细胞,其中所述细胞是rh阴性细胞。
19.如权利要求17或18所述的细胞,其中所述abo基因的所述有害变异是使用包含指导rna靶序列的cr1spr-cas9基因编辑产生的,所述指导rna靶序列包含选自由表a-表c中的那些序列组成的组中的一个。
20.如权利要求17至19中任一项所述的细胞,其中所述abo基因的所述有害变异包括编码外显子中的插入/缺失,并且指导rna靶序列包含seq id no:1或seq id no:2。
21.如权利要求17至19中任一项所述的细胞,其中所述abo基因的所述有害变异包括移码插入/缺失,并且所述指导rna靶序列包含seq id no:3。
22.如权利要求17至21中任一项所述的细胞,其中所述abo基因的表达因所述abo基因的外显子1的acacct内;外显子2的agtgcg内;或外显子8的caagcgc、ggcgca、tgggcg、accacg、gccgca、ccacgt、tgccgt、tactcg、actcgg、gagcgc、gcctgg、gtcctt、tcacgc、tggacg、tggtcg、gctggc、cacgcg、aggtga或gcatcg内的插入或缺失而部分或完全失活。
23.如权利要求17至22中任一项所述的细胞,其中所述abo基因的所述有害变异是纯合变异,使得所述细胞是o型阴性细胞。
24.如权利要求17所述的细胞,其中所述abo基因的所述外显子6 258delg变异是使用crispr-cas9基因编辑产生的,所述crispr-cas9基因编辑包含指导rna靶序列和hdr模板,所述指导rna靶序列包含选自由seq id no:3-5中的那些序列组成的组中的一个,所述hdr模板包含编码258delg变异的序列、pam序列、间隔子区和两个同源臂,每个同源臂包含约10个核苷酸到约1kb的所述abo基因的同源序列。
25.如权利要求24所述的细胞,其中所述hdr模板还包含在所述pam序列和/或所述间隔子区中的一个或多个沉默突变,以确保所述hdr模板不被cas9切割。
26.如权利要求17和24至25中任一项所述的细胞,其中所述abo基因的所述外显子6258delg变异是使用cr1spr-cas9基因编辑产生的,所述crispr-cas9基因编辑包含有包含选自由seq id no:3-5组成的组中的一个的指导rna靶序列并且所述hdr模板包含选自由seq id no:6-8组成的组中的一个。
27.如权利要求17和24至26中任一项所述的细胞,其中所述abo基因的所述外显子6258delg变异是纯合变异,使得所述细胞是o型阴性细胞。
28.一种分离的细胞,其中fut1基因的表达因所述fut1基因的有害变异而部分或完全失活,而rhd基因的表达因所述rhd基因的有害变异而部分或完全失活。
29.如权利要求28所述的细胞,其中所述fut1基因的表达因所述fut1基因的外显子4的atcgac、agtacg、cgccct、gtttgc、cgacaa、ggtgcg、cgccgt、acgccg、ccggtt、cgcggg、ttttcg、ataccg、gtgcgc、ccattg、tgtcgg、atctgc、ctttgt、ggggcc、ggccat、tgcgat、cgtgca或atggac内的插入或缺失而部分或完全失活。
30.如权利要求28或29所述的细胞,其中所述rhd基因的表达因所述rhd基因的外显子2的tcatgg、gaggtg、aactcg、agtttc、ttggct或cacagc内;外显子3的ccgtga内;外显子4的gggtag或agggaa内;外显子5的ttcgat、tcagcg、catagt或atcgaa内;外显子6的cgtcgg或tccgtc内;外显子7的cggcaa、cggagc、taccgt、gcttgc或cttgct内;或外显子8的ggttct或tcctac内的插入或缺失而部分或完全失活。
31.如权利要求28至30中任一项所述的细胞,其中所述fut1基因的所述有害变异是使用包含指导rna靶序列的crispr-cas9基因编辑产生的,所述指导rna靶序列包含选自由表g-表i中的那些序列组成的组中的一个。
32.如权利要求28至31中任一项所述的细胞,其中所述有害变异包括所述fut1基因的外显子4中的缺失和包含seq id no:13或seq id no:14的指导rna靶序列。
33.如权利要求28至32中任一项所述的细胞,其中所述fut1基因的所述有害变异是纯合变异,使得所述细胞具有孟买表型。
34.如权利要求28至33中任一项所述的细胞,其中所述rhd基因的所述有害变异是通过使用包含一个或多个指导rna靶序列的crispr-cas9基因编辑产生的,所述指导rna靶序列包含选自由表d-表f中的那些序列组成的组中的一个或多个。
35.如权利要求28或34所述的细胞,其中所述有害变异包括缺失包含所述rhd基因的外显子1-8的基因组区以及包含seq id no:11的指导rna靶序列和包含seq id no:12的另一个指导rna。
36.如权利要求28或34所述的细胞,其中所述rhd基因的所述有害变异包括移码插入/缺失,并且指导rna靶序列包含seq id no:9或seq id no:10。
37.如权利要求28至36中任一项所述的细胞,其中所述rhd基因的所述有害变异是纯合变异,使得所述细胞是恒河猴因子(rh)阴性的。
38.如权利要求28至37中任一项所述的细胞,其中所述rhd基因的所述有害变异是纯合变异,使得所述细胞具有孟买表型并且是rh阴性的。
39.一种分离的细胞,其中fut1基因的表达因所述fut1基因的有害变异而部分或完全失活。
40.如权利要求39所述的细胞,其中所述细胞是rh阴性细胞。
41.如权利要求39或40所述的细胞,其中所述fut1基因的表达因所述fut1基因的外显子4的atcgac、agtacg、cgccct、gtttgc、cgacaa、ggtgcg、cgccgt、acgccg、ccggtt、cgcggg、ttttcg、ataccg、gtgcgc、ccattg、tgtcgg、atctgc、ctttgt、ggggcc、ggccat、tgcgat、cgtgca或atggac内的插入或缺失而部分或完全失活。
42.如权利要求39至41中任一项所述的细胞,其中所述fut1基因的所述有害变异是使用包含指导rna靶序列的cr1spr-cas9基因编辑产生的,所述指导rna靶序列包含选自由表g-表i中的那些序列组成的组中的一个。
43.如权利要求39至42中任一项所述的细胞,其中所述有害变异包括所述fut1基因的外显子4中的缺失并且是使用crispr-cas9基因编辑产生的,所述crispr-cas9基因编辑包含有包含seq id no:13或seq id no:14的指导rna靶序列。
44.如权利要求39至43中任一项所述的细胞,其中所述fut1基因的所述有害变异是纯合变异,使得所述细胞是通用孟买阴性细胞。
45.一种分离的细胞,其中rhd基因的表达因所述rhd基因的有害变异而部分或完全失活。
46.如权利要求45所述的细胞,其中所述细胞具有o型或孟买表型。
47.如权利要求45或46所述的细胞,其中所述rhd基因的表达因所述rhd基因的外显子2的tcatgg、gaggtg、aactcg、agtttc、ttggct或cacagc内;外显子3的ccgtga内;外显子4的gggtag或agggaa内;外显子5的ttcgat、tcagcg、catagt或atcgaa内;外显子6的cgtcgg或tccgtc内;外显子7的cggcaa、cggagc、taccgt、gcttgc或cttgct内;或外显子8的ggttct或tcctac内的插入或缺失而部分或完全失活。
48.如任一权利要求45所述的细胞,其中所述rhd基因的所述有害变异是通过使用包含一个或多个指导rna靶序列的crispr-cas9基因编辑产生的,所述指导rna靶序列包含选自由表d-表f中的那些序列组成的组中的一个。
49.如权利要求45至48中任一项所述的细胞,其中所述有害变异包括缺失包含所述rhd基因的外显子1-8的基因组区以及包含seq id no:11的指导rna靶序列和包含seq id no:12的另一个指导rna。
50.如权利要求45至49中任一项所述的细胞,其中所述rhd基因的所述有害变异包括移码插入/缺失,并且所述指导rna靶序列包含seq id no:9或seq id no:10。
51.如权利要求45至50中任一项所述的细胞,其中所述rhd基因的所述有害变异是纯合变异,使得所述细胞是o型阴性细胞或孟买阴性细胞。
52.一种分离的细胞,其中abo基因的表达因所述abo基因的有害变异或通过插入所述abo基因的外显子6 258delg变异而部分或完全失活。
53.如权利要求52所述的分离的细胞,其中所述abo基因的表达因所述abo基因的外显子1的acacct内;外显子2的agtgcg内;或外显子8的caagcgc、ggcgca、tgggcg、accacg、gccgca、ccacgt、tgccgt、tactcg、actcgg、gagcgc、gcctgg、gtcctt、tcacgc、tggacg、tggtcg、gctggc、cacgcg、aggtga或gcatcg内的插入或缺失而部分或完全失活。
54.如权利要求52或53所述的细胞,其中所述abo基因的所述有害变异是使用包含指导rna靶序列的crispr-cas9基因编辑产生的,所述指导rna靶序列包含选自由表a-表c中的那些序列组成的组中的一个。
55.如权利要求52至54中任一项所述的细胞,其中所述abo基因的所述有害变异包括编码外显子中的插入或缺失,并且所述指导rna靶序列包含seq id no:1或seq id no:2。
56.如权利要求52至54中任一项所述的细胞,其中所述abo基因的所述有害变异包括移码插入/缺失,并且所述指导rna靶序列包含seq id no:3。
57.如权利要求52至55中任一项所述的细胞,其中所述abo基因的所述有害变异是纯合变异。
58.如权利要求52或53所述的细胞,其中所述abo基因的所述外显子6 258delg变异是使用crispr-cas9基因编辑产生的,所述crispr-cas9基因编辑包含指导rna靶序列和hdr模板,所述指导rna靶序列包含选自由seq 1d no:3-5中的那些序列组成的组中的一个,所述hdr模板包含编码258delg变异的序列、pam序列、间隔子区和两个同源臂,每个同源臂包含约10个核苷酸到约1kb的所述abo基因的同源序列。
59.如权利要求58所述的细胞,其中所述hdr模板还包含在所述pam序列和/或所述间隔子区中的一个或多个沉默突变,以确保所述hdr模板不被cas9切割。
60.如权利要求52至53和58至59中任一项所述的细胞,其中所述abo基因的所述外显子6258delg变异是使用crispr-cas9基因编辑产生的,所述crispr-cas9基因编辑包含有包含选自由seq id no:3-5组成的组中的一个的指导rna靶序列并且所述hdr模板包含选自由seq id no:6-8组成的组中的一个。
61.如权利要求52至53和58至60中任一项所述的细胞,其中所述abo基因的所述外显子6 258delg变异是纯合变异。
62.一种分离的细胞,其中rhd基因的表达因所述rhd基因的有害变异而部分或完全失活。
63.如权利要求62所述的分离的细胞,其中所述rhd基因的表达因所述rhd基因的外显子2的tcatgg、gaggtg、aactcg、agtttc、ttggct或cacagc内;外显子3的ccgtga内;外显子4的gggtag或agggaa内;外显子5的ttcgat、tcagcg、catagt或atcgaa内;外显子6的cgtcgg或tccgtc内;外显子7的cggcaa、cggagc、taccgt、gcttgc或cttgct内;或外显子8的ggttct或tcctac内的插入或缺失而部分或完全失活。
64.如权利要求62或63所述的细胞,其中所述rhd基因的所述有害变异是通过使用包含一个或多个指导rna靶序列的crispr-cas9基因编辑产生的,所述指导rna靶序列包含选自由表d-表f中的那些序列组成的组中的一个或多个。
65.如权利要求62至64中任一项所述的细胞,其中所述有害变异包括缺失包含所述rhd基因的外显子1-8的基因组区以及包含seq id no:11的指导rna靶序列和包含seq id no:12的另一个指导rna。
66.如权利要求62至65中任一项所述的细胞,其中所述rhd基因的所述有害变异包括移码插入/缺失,并且指导rna靶序列包含seq id no:9或seq id no:10。
67.如权利要求62至66中任一项所述的细胞,其中所述rhd基因的所述有害变异是纯合变异。
68.一种分离的细胞,其中fut1基因的表达因所述fut1基因的有害变异而部分或完全失活。
69.如权利要求68所述的分离的细胞,其中所述fut1基因的表达因所述fut1基因的外显子4的atcgac、agtacg、cgccct、gtttgc、cgacaa、ggtgcg、cgccgt、acgccg、ccggtt、cgcggg、ttttcg、ataccg、gtgcgc、ccattg、tgtcgg、atctgc、ctttgt、ggggcc、ggccat、tgcgat、cgtgca或atggac内的插入或缺失而部分或完全失活。
70.如权利要求68或69所述的细胞,其中所述fut1基因的所述有害变异是使用包含指导rna靶序列的crispr-cas9基因编辑产生的,所述指导rna靶序列包含选自由表g-表i中的那些序列组成的组中的一个。
71.如权利要求68至70中任一项所述的细胞,其中所述有害变异包括所述fut1基因的外显子4中的缺失和包含seq id no:13或seq id no:14的指导rna靶序列。
72.如权利要求68至71中任一项所述的细胞,其中所述rhd基因的所述有害变异是纯合变异。
73.如权利要求1至72中任一项所述的细胞,其中所述细胞是人类细胞。
74.如权利要求1至51中任一项所述的细胞,其中所述细胞选自由以下组成的组:诱导多能干细胞、胚胎干细胞、成体干细胞和分化细胞。
75.如权利要求1至74中任一项所述的细胞,其还包含编码一种或多种mhc-i的转录调节因子的一种或多种部分或完全失活的基因和/或编码一种或多种mhc-ii的转录调节因子的一种或多种部分或完全失活的基因。
76.如权利要求74或75所述的细胞,其中b2m基因的表达是部分或完全失活的。
77.如权利要求74至76中任一项所述的细胞,其中ciita基因的表达是部分或完全失活的。
78.如权利要求74至77中任一项所述的细胞,其还包含cd47转基因。
79.如权利要求74至78中任一项所述的细胞,其中所述b2m和ciita基因的表达是部分或完全失活的并且还包含cd47转基因。
80.一种药物组合物,其包含根据权利要求1至74中任一项所述的细胞。
81.一种治疗需要细胞替代疗法的患者的方法,其包括向所述患者施用根据权利要求1至74中任一项所述的细胞。
82.一种生成工程化的组织相容性细胞的方法,其包括:
83.如权利要求82所述的方法,其中所述指导rna靶序列包含选自由seq id no:1-3组成的组中的一个。
84.如权利要求82或83中任一项所述的方法,其还包括(i)将rhd基因的指导rna靶序列引入所述细胞中,所述指导rna靶序列包含选自由表d-表f中的那些序列组成的组中的一个;以及(ii)选择工程化细胞,其中所述rhd基因是部分或完全失活的。
85.如权利要求84所述的方法,其中所述指导rna靶序列包含seq id no:11并且另一个指导rna包含seq id no:12。
86.如权利要求84所述的方法,其中所述指导rna靶序列包含seq id no:9或seq idno:10。
87.一种生成工程化的组织相容性细胞的方法,其包括:
88.如权利要求87所述的方法,其中所述hdr模板还包含在所述pam序列和/或所述间隔子区中的一个或多个沉默突变,以确保所述hdr模板不被cas9切割。
89.如权利要求87或88所述的方法,其中所述指导rna靶序列包含选自由seq id no:3-5组成的组中的一个,并且所述hdr模板包含选自由seq id no:6-8组成的组中的一个。
90.如权利要求87至89中任一项所述的方法,其还包括(i)将rhd基因的指导rna靶序列引入所述细胞中,所述指导rna靶序列包含选自由表d-表f中的那些序列组成的组中的一个;以及(ii)选择工程化细胞,其中所述rhd基因是部分或完全失活的。
91.如权利要求90所述的方法,其中所述指导rna靶序列包含seq id no:11并且另一个指导rna包含seq id no:12。
92.如权利要求90所述的方法,其中所述指导rna靶序列包含seq id no:9或seq idno:10。
93.一种生成工程化的组织相容性细胞的方法,其包括:
94.如权利要求93所述的方法,其中所述指导rna靶序列包含seq id no:11并且另一个指导rna包含seq id no:12。
95.如权利要求93所述的方法,其中所述指导rna靶序列包含seq id no:9或seq idno:10。
96.如权利要求93至95中任一项所述的方法,其还包括(i)将abo基因的指导rna靶序列引入所述细胞中,所述指导rna靶序列包含选自由表a-表c中的那些序列组成的组中的一个;以及(ii)选择工程化细胞,其中所述abo基因是部分或完全失活的。
97.如权利要求96所述的方法,其中所述指导rna靶序列包含seq id no:1-3。
98.如权利要求93至97中任一项所述的方法,其还包括(i)将用于产生abo基因的外显子6258delg变异的指导rna靶序列和hdr模板引入所述细胞中,所述指导rna靶序列包含选自由seq id no:3-5中的那些序列组成的组中的一个,所述hdr模板包含编码258delg变异的序列、pam序列、间隔子区和两个同源臂,每个同源臂包含约10个核苷酸到约1kb的所述abo基因的同源序列;以及(ii)选择工程化细胞,其中所述abo基因是部分或完全失活的。
99.如权利要求98所述的方法,其中所述hdr模板还包含在所述pam序列和/或所述间隔子区中的一个或多个沉默突变,以确保所述hdr模板不被cas9切割。
100.如权利要求98或99所述的方法,其中所述指导rna靶序列包含选自由seq id no:3-5组成的组中的一个,并且所述hdr模板包含选自由seq id no:6-8组成的组中的一个。
101.一种生成工程化的组织相容性细胞的方法,其包括:
102.如权利要求101所述的方法,其中所述指导rna靶序列包含seq id no:13或seq idno:14。
103.如权利要求101或102所述的方法,其还包括(i)将rhd基因的指导rna靶序列引入所述细胞中,所述指导rna靶序列包含选自由表d-表f中的那些序列组成的组中的一个;以及(ii)选择工程化细胞,其中所述rhd基因是部分或完全失活的。
104.如权利要求103所述的方法,其中所述指导rna靶序列包含seq id no:9或seq idno:10。
105.如权利要求103所述的方法,其中所述指导rna靶序列包含seq id no:11并且另一个指导rna靶序列包含seq id no:12。
106.如权利要求82至105中任一项所述的方法,其中所述分离的细胞是分离的人类细胞。
107.如权利要求82至106中任一项所述的方法,其中所述分离的细胞选自由以下组成的组:多能干细胞、诱导多能干细胞、胚胎干细胞、多能干细胞、成体干细胞和分化细胞。
108.如权利要求82至107中任一项所述的方法,其中所述分离的细胞包含编码一种或多种mhc-i的转录调节因子的一种或多种部分或完全失活的基因和/或编码一种或多种mhc-ii的转录调节因子的一种或多种部分或完全失活的基因。
109.如权利要求82至108中任一项所述的方法,其中所述分离的细胞包含部分或完全失活的b2m基因。
110.如权利要求82至109中任一项所述的方法,其中所述分离的细胞包含部分或完全失活的ciita基因。
111.如权利要求82至110中任一项所述的方法,其中所述分离的细胞包含cd47转基因。
112.如权利要求82至111中任一项所述的方法,其中所述分离的细胞包含部分或完全失活的b2m和ciita基因以及cd47转基因。
113.一种制备分化细胞的方法,其包括在分化条件下培养根据权利要求107至112中任一项所述的方法制备的干细胞,从而制备分化细胞。
114.如权利要求113所述的方法,其中所述分化条件适合于将干细胞分化成选自由以下组成的组的细胞类型:心肌细胞、肝细胞、肾细胞、胰腺细胞、神经细胞、免疫细胞、间充质细胞和内皮细胞。
115.一种治疗需要细胞替代疗法的患者的方法,其包括施用根据权利要求113或114所述的方法制备的分化细胞群。
116.一种源自rues2细胞系的分离的细胞,其中所述分离的细胞包含以下中的一种或两种:
117.如权利要求116所述的分离的细胞,其中使所述分离的细胞组织血型为o的所述修饰降低或消除了abo组织血型b抗原的抗原性。
118.如权利要求116或117所述的分离的细胞,其中所述修饰包括通过abo基因的有害变异或通过插入abo基因的外显子6258delg变异而使所述abo基因的表达部分或完全失活。
119.如权利要求118所述的分离的细胞,其中所述abo基因的表达因所述abo基因的外显子1的acacct内;外显子2的agtgcg内;或外显子8的caagcgc、ggcgca、tgggcg、accacg、gccgca、ccacgt、tgccgt、tactcg、actcgg、gagcgc、gcctgg、gtcctt、tcacgc、tggacg、tggtcg、gctggc、cacgcg、aggtga或gcatcg内的插入或缺失而部分或完全失活。
120.如权利要求118或119所述的分离的细胞,其中所述abo基因的所述有害变异是使用包含指导rna靶序列的crispr-cas9基因编辑产生的,所述指导rna靶序列包含选自由表a-表c中的那些序列组成的组中的一个。
121.如权利要求118至120中任一项所述的分离的细胞,其中所述abo基因的所述有害变异包括编码外显子中的插入或缺失,并且所述指导rna靶序列包含seq id no:1或seq idno:2。
122.如权利要求118至121中任一项所述的分离的细胞,其中所述abo基因的所述有害变异包括移码插入/缺失,并且所述指导rna靶序列包含seq id no:3。
123.如权利要求11 8至122中任一项所述的分离的细胞,其中所述abo基因的所述有害变异是纯合变异。
124.如权利要求11 8所述的分离的细胞,其中所述abo基因的所述外显子6 258delg变异是使用crispr-cas9基因编辑产生的,所述crispr-cas9基因编辑包含指导rna靶序列和hdr模板,所述指导rna靶序列包含选自由seq id no:3-5中的那些序列组成的组中的一个,所述hdr模板包含编码258delg变异的序列、pam序列、间隔子区和两个同源臂,每个同源臂包含约10个核苷酸到约1kb的所述abo基因的同源序列。
125.如权利要求124所述的分离的细胞,其中所述hdr模板还包含在所述pam序列和/或所述间隔子区中的一个或多个沉默突变,以确保所述hdr模板不被cas9切割。
126.如权利要求118、124和125中任一项所述的分离的细胞,其中所述abo基因的所述外显子6 258delg变异是使用crispr-cas9基因编辑产生的,所述crispr-cas9基因编辑包含有包含选自由seq id no:3-5组成的组中的一个的指导rna靶序列并且所述hdr模板包含选自由seq id no:6-8组成的组中的一个。
127.如权利要求118和124至126中任一项所述的分离的细胞,其中所述abo基因的所述外显子6 258delg变异是纯合变异。
128.如权利要求116所述的分离的细胞,其中所述修饰包括通过fut1基因的有害变异而使所述fut1基因的表达部分或完全失活。
129.如权利要求128所述的分离的细胞,其中所述fut1基因的表达因所述fut1基因的外显子4的atcgac、agtacg、cgccct、gtttgc、cgacaa、ggtgcg、cgccgt、acgccg、ccggtt、cgcggg、ttttcg、ataccg、gtgcgc、ccattg、tgtcgg、atctgc、ctttgt、ggggcc、ggccat、tgcgat、cgtgca或atggac内的插入或缺失而部分或完全失活。
130.如权利要求128或129所述的分离的细胞,其中所述fut1基因的所述有害变异是使用包含指导rna靶序列的crispr-cas9基因编辑产生的,所述指导rna靶序列包含选自由表g-表i中的那些序列组成的组中的一个。
131.如权利要求128至130中任一项所述的分离的细胞,其中所述有害变异包括所述fut1基因的外显子4中的缺失和包含seq id no:13或seq id no:14的指导rna靶序列。
132.如权利要求116至131中任一项所述的分离的细胞,其中使所述分离的细胞为rh阴性的所述修饰降低或消除一种或多种恒河猴因子抗原的抗原性。
133.如权利要求118至132中任一项所述的分离的细胞,其中使所述分离的细胞为rh阴性的所述修饰包括通过rhd基因的有害变异而使所述rhd基因的表达部分或完全失活。
134.如权利要求133所述的分离的细胞,其中所述rhd基因的表达因所述rhd基因的外显子2的tcatgg、gaggtg、aactcg、agtttc、ttggct或cacagc内;外显子3的ccgtga内;外显子4的gggtag或agggaa内;外显子5的ttcgat、tcagcg、catagt或atcgaa内;外显子6的cgtcgg或tccgtc内;外显子7的cggcaa、cggagc、taccgt、gcttgc或cttgct内;或外显子8的ggttct或tcctac内的插入或缺失而部分或完全失活。
135.如权利要求133或134所述的分离的细胞,其中所述rhd基因的所述有害变异是通过使用包含一个或多个指导rna靶序列的crispr-cas9基因编辑产生的,所述指导rna靶序列包含选自由表d-表f中的那些序列组成的组中的一个。
136.如权利要求133至135中任一项所述的分离的细胞,其中所述有害变异包括缺失包含所述rhd基因的外显子1-8的基因组区以及包含seq id no:11的指导rna靶序列和包含seq id no:12的另一个指导rna。
137.如权利要求133至136中任一项所述的分离的细胞,其中所述rhd基因的所述有害变异包括移码插入/缺失,并且所述指导rna靶序列包含seq id no:9或seq id no:10。
138.如权利要求116至137中任一项所述的分离的细胞,其还包含编码一种或多种mhc-i的转录调节因子的一种或多种部分或完全失活的基因和/或编码一种或多种mhc-ii的转录调节因子的一种或多种部分或完全失活的基因。
139.如权利要求116至138中任一项所述的分离的细胞,其中b2m基因的表达是部分或完全失活的。
140.如权利要求116至139中任一项所述的分离的细胞,其中ciita基因的表达是部分或完全失活的。
141.如权利要求116至140中任一项所述的分离的细胞,其还包含cd47转基因。
142.如权利要求116至141中任一项所述的分离的细胞,其中所述b2m和ciita基因的表达是部分或完全失活的并且还包含cd47转基因。
143.一种生成工程化的组织相容性细胞的方法,其包括:
144.如权利要求143所述的方法,其中所述指导rna靶序列包含选自由seq id no:1-3组成的组中的一个。
145.如权利要求143或144所述的方法,其还包括(i)将rhd基因的指导rna靶序列引入所述细胞中,所述指导rna靶序列包含选自由表d-表f中的那些序列组成的组中的一个;以及(ii)选择工程化细胞,其中所述rhd基因是部分或完全失活的。
146.如权利要求145所述的方法,其中所述指导rna靶序列包含seq id no:11并且另一个指导rna包含seq id no:12。
147.如权利要求145所述的方法,其中所述指导rna靶序列包含seq id no:9或seq idno:10。
148.一种生成工程化的组织相容性细胞的方法,其包括:
149.如权利要求148所述的方法,其中所述hdr模板还包含在所述pam序列和/或所述间隔子区中的一个或多个沉默突变,以确保所述hdr模板不被cas9切割。
150.如权利要求148或149所述的方法,其中所述指导rna靶序列包含选自由seq idno:3-5组成的组中的一个,并且所述hdr模板包含选自由seq id no:6-8组成的组中的一个。
151.如权利要求148至150中任一项所述的方法,其还包括(i)将rhd基因的指导rna靶序列引入所述细胞中,所述指导rna靶序列包含选自由表d-表f中的那些序列组成的组中的一个;以及(ii)选择工程化细胞,其中所述rhd基因是部分或完全失活的。
152.如权利要求151所述的方法,其中所述指导rna靶序列包含seq id no:11并且另一个指导rna包含seq id no:12。
153.如权利要求151所述的方法,其中所述指导rna靶序列包含seq id no:9或seq idno:10。
154.一种生成工程化的组织相容性细胞的方法,其包括:
155.如权利要求154所述的方法,其中所述指导rna靶序列包含seq id no:11并且另一个指导rna包含seq id no:12。
156.如权利要求154所述的方法,其中所述指导rna靶序列包含seq id no:9或seq idno:10。
157.如权利要求154至156中任一项所述的方法,其还包括(i)将abo基因的指导rna靶序列引入所述细胞中,所述指导rna靶序列包含选自由表a-表c中的那些序列组成的组中的一个;以及(ii)选择工程化细胞,其中所述abo基因是部分或完全失活的。
158.如权利要求157所述的方法,其中所述指导rna靶序列包含seq id no:1-3。
159.如权利要求154至156中任一项所述的方法,其还包括(i)将用于产生abo基因的外显子6 258delg变异的指导rna靶序列和hdr模板引入所述细胞中,所述指导rna靶序列包含选自由seq id no:3-5中的那些序列组成的组中的一个,所述hdr模板包含编码258delg变异的序列、pam序列、间隔子区和两个同源臂,每个同源臂包含约10个核苷酸到约1kb的所述abo基因的同源序列;以及(ii)选择工程化细胞,其中所述abo基因是部分或完全失活的。
160.如权利要求159所述的方法,其中所述hdr模板还包含在所述pam序列和/或所述间隔子区中的一个或多个沉默突变,以确保所述hdr模板不被cas9切割。
161.如权利要求159或160所述的方法,其中所述指导rna靶序列包含选自由seq idno:3-5组成的组中的一个,并且所述hdr模板包含选自由seq id no:6-8组成的组中的一个。
162.一种生成工程化的组织相容性细胞的方法,其包括:
163.如权利要求162所述的方法,其中所述指导rna靶序列包含seq id no:13或seq idno:14。
164.如权利要求159或163所述的方法,其还包括(i)将rhd基因的指导rna靶序列引入所述细胞中,所述指导rna靶序列包含选自由表d-表f中的那些序列组成的组中的一个;以及(ii)选择工程化细胞,其中所述rhd基因是部分或完全失活的。
165.如权利要求164所述的方法,其中所述指导rna靶序列包含seq id no:9或seq idno:10。
166.如权利要求164所述的方法,其中所述指导rna靶序列包含seq id no:11并且另一个指导rna靶序列包含seq id no:12。
167.如权利要求143至166中任一项所述的方法,其中所述分离的细胞还包含编码一种或多种mhc-i的转录调节因子的一种或多种部分或完全失活的基因和/或编码一种或多种mhc-ii的转录调节因子的一种或多种部分或完全失活的基因。
168.如权利要求143至167中任一项所述的方法,其中所述分离的细胞包含部分或完全失活的b2m基因。
169.如权利要求143至168中任一项所述的方法,其中所述分离的细胞包含部分或完全失活的ciita基因。
170.如权利要求143至169中任一项所述的方法,其中所述分离的细胞包含cd47转基因。
171.如权利要求143至170中任一项所述的方法,其中所述分离的细胞包含部分或完全失活的b2m和ciita基因以及cd47转基因。
172.一种制备分化细胞的方法,其包括在分化条件下培养根据权利要求143至171中任一项所述的方法制备的工程化的组织相容性细胞,从而制备分化细胞。
173.如权利要求172所述的方法,其中所述分化条件适合于将干细胞分化成选自由以下组成的组的细胞类型:心肌细胞、肝细胞、肾细胞、胰腺细胞、神经细胞、免疫细胞、间充质细胞和内皮细胞。
174.一种治疗需要细胞替代疗法的患者的方法,其包括施用根据权利要求172或173所述的方法制备的分化细胞群。