本发明涉及食用菌,具体涉及一种银耳菌株tyh-sd1、indel标记及引物和鉴定方法。
背景技术:
1、银耳(tremella fuciformis berk)在分类学上隶属于担子菌门(basidiomycota)、银耳纲(tremellomycetes)、银耳目(tremellales)、银耳科(tremellaceae)、银耳属(tremella),是中温、好气性真菌,为我国久负盛名的食药用菌,产量占全球90%以上。银耳富含碳水化合物、17种人体必需氨基酸、维生素及多种生物活性物质,可提高机体免疫力,具有抗肿瘤、抗辐射、抗氧化、抗衰老、降血糖、降血脂等功效,拥有广阔的开发前景。
2、但随着人们生活水平的提供,对现有的银耳品种要求也越来越高,开发新的银耳品种也是极有意义的。
技术实现思路
1、为了解决现有技术存在的上述不足,本发明的第一个目的是提供一种银耳菌株,命名为银耳(tremella fuciformis)tyh-sd1(下称福银黄耳tyh-sd1),于2023年04月07日保藏于中国典型培养物保藏中心,保藏编号为cctcc no:m 2023494,保藏地址为中国.武汉.武汉大学。
2、本发明第二个目的是提供一种用于鉴定上述福银黄耳tyh-sd1品种的indel标记,该indel标记位于73bp-82bp,核苷酸序列为tgttcgtcgt;或
3、位于203bp-212bp,核苷酸序列为cgaacacgac;或
4、位于125bp-133bp,核苷酸序列为agccttgtt;或
5、位于141bp-142bp,核苷酸序列为cc;或
6、位于196bp-198bp,核苷酸序列为ttc;或
7、位于255bp-256bp,核苷酸序列为cc。
8、本发明第三个目的是提供用于扩增上述福银黄耳tyh-sd1品种indel标记的引物对,具体如下:
9、引物对1:
10、31-f:5’-aacgggcattgtgggtgcaagtat-3’;
11、31-r:5’-gagatgatgtctagggggagatcgag-3’;
12、引物对2:
13、32-f:5’-ttcgtcctgtaatttggacatttctactcgttcg-3’;
14、32-r:5’-ggagaggcgactgatgcagctttttcggtag-3’;
15、引物对3:
16、33-f:5’-aatgagctcgcgtacgacagccga-3’;
17、33-r:5’-tcatttcaagacctcccggcggg-3’。
18、本发明第四个目的是提供一种采用上述引物对鉴定福银黄耳tyh-sd1品种的方法,包括以下步骤:
19、(1)提取待测样品的基因组dna;
20、(2)以基因组dna为模板,利用上述引物对对基因组dna进行pcr扩增,得到pcr扩增产物;
21、(3)将pcr扩增产物回收、测序、比对,若位于73bp-82bp,核苷酸序列为tgttcgtcgt;或
22、位于203bp-212bp,核苷酸序列为cgaacacgac;或
23、位于125bp-133bp,核苷酸序列为agccttgtt;或
24、位于141bp-142bp,核苷酸序列为cc;或
25、位于196bp-198bp,核苷酸序列为ttc;或
26、位于255bp-256bp,核苷酸序列为cc,则说明待测样品为福银黄耳tyh-sd1。
27、在上述技术方案的基础上,本发明还可以做如下改进:
28、进一步,pcr扩增体系为:上下游引物各1μl,dna模板1μl,2×easytaq pcrsupermix 12.5μl,ddh2o 9.5μl。
29、进一步,pcr扩增程序为:94℃预变性5min,94℃变性30s,58℃退火30s,72℃延伸1min,33个循环,72℃延伸5min,4℃保存。
30、本发明具有以下有益效果:
31、本发明提供的福银黄耳tyh-sd1是以“古田银耳tr21”和“绣银1号”两个不同品种为亲本菌株,通过孢子弹射获得担孢子,芽殖形成酵母状孢子,将酵母状孢子杂交配对,根据杂交株具有双核菌丝和锁状联合的特征筛选获得“福银黄耳”。福银黄耳tyh-sd1子实体呈淡黄色,半透明,朵型圆整、紧密度小、呈菊花型,耳片细碎、边缘呈不规则锯齿状,耳片柔软且富有弹性,钙含量高,有更高的生物学效率,有很好的应用前景。
32、本发明提供的用于鉴定福银黄耳tyh-sd1品种的indel标记、引物和鉴定方法,能够很好的将福银黄耳tyh-sd1与其他银耳品种尤其是与亲本区分开来。
1.一种银耳(tremella fuciformis)菌株,命名为tyh-sd1,于2023年04月07日保藏于中国典型培养物保藏中心,保藏编号为cctcc no:m 2023494,保藏地址为中国.武汉.武汉大学。
2.一种用于鉴定权利要求1所述的tyh-sd1的indel标记,其特征在于,所述indel标记位于73bp-82bp,核苷酸序列为tgttcgtcgt;或
3.用于扩增权利要求2所述tyh-sd1的indel标记的引物对,其特征在于,引物对序列如下:
4.采用权利要求3所述的引物对鉴定tyh-sd1的方法,其特征在于,包括以下步骤:
5.根据权利要求4所述的方法,其特征在于,pcr扩增体系为:上下游引物各1μl,dna模板1μl,2×easytaq pcr supermix 12.5μl,ddh2o 9.5μl。
6.根据权利要求4所述的方法,其特征在于,pcr扩增程序为:94℃预变性5min,94℃变性30s,58℃退火30s,72℃延伸1min,33个循环,72℃延伸5min,4℃保存。
7.根据权利要求4所述的方法,其特征在于,若位于73bp-82bp,核苷酸序列为tgttcgtcgt;或