一种快速鉴别PRV、PCV2、PRRSV、CSFV、PPV和SIV的mPCR检测试剂盒及其检测方法

文档序号:9320899阅读:626来源:国知局
一种快速鉴别PRV、PCV2、PRRSV、CSFV、PPV和SIV的mPCR检测试剂盒及其检测方法
【技术领域】
[0001] 本发明涉及一种快速鉴别PRV、PCV2、PRRSV、CSFV、PPV和SIV的mPCR检测试剂盒 及其检测方法。
【背景技术】
[0002] 随着现代养猪业规模化和集约化程度越来越高,猪群发生多种病原混合感染和继 发感染的情况越来越普遍,猪病的复杂程度及其危害也与日倶增。目前,猪呼吸道疾病是影 响养猪业发展的主要疾病,也是我国规模化猪场的常发病、多发病,已经引起人们的普遍重 视,给我国养猪业带来极大的经济损失。在猪场常发生的各类病毒性呼吸道疾病中,PRV、 PCV2、PRRSV、CSFV、PPV和SIV等是较为多见的病原。这些病毒引起的猪呼吸道疾病主要 以发热、咳嗽、气喘、呼吸困难、眼鼻分泌物增多、食欲减退、迅速消瘦等为特征;同时PRV、 PCV2、PRRSV、CSFV和PPV还是引起妊娠母猪发生流产,产死胎、木乃伊胎、无活力弱仔、畸形 胎,少仔和不育的猪繁殖障碍性疾病的主要病因之一;怀孕母猪感染SIV时,也可引起繁殖 障碍。PRV、PCV2、PRRSV、CSFV、PPV和SIV均可以不同程度地损伤机体免疫系统,降低机体 对外界的抵抗能力,引起继发性混合感染,导致疫病复杂化,病症加重。
[0003] 目前,猪病毒性疾病已严重危害世界规模化养猪业,我国许多规模化猪场均不同 程度受到猪病毒性呼吸道疾病的威胁,PRV、PCV2、PRRSV、CSFV、PPV、SIV是主要的病毒性呼 吸道疾病病原,同时都还可以不同程度地损伤机体免疫系统,降低机体对外界的抵抗能力, 引起继发性混合感染,使得疾病的诊断难度越来越大,因此快速、准确地诊断出发病原因对 于及时并有针对性地对发病猪场采取药物治疗或免疫预防措施,对降低养猪生产中的疾病 风险具有重要的现实意义。

【发明内容】

[0004] 本发明要解决的技术问题是:提供一种快速鉴别PRV、PCV2、PRRSV、CSFV、PPV和 SIV的mPCR检测试剂盒及其检测方法,已解决现有技术的不足。
[0005] 本发明的技术方案是:一种快速鉴别PRV、PCV2、PRRSV、CSFV、PPV和SIV的mPCR 检测试剂盒,包含Parti和Part2, Parti :2X1 St印Buffer 25-40微升,RNase Free H20 7.5-15微升,卩1';[11163(31'1。1:0116 3七6。£112:71116]\^12-4微升,阳性对照;?&1^2:3〇1111:;[011八 200-400微升,Solution B 75-150微升,Rinse A 500-1000微升,Rinse B 800-1600微升, Elution Buffer 50-10微升,Spin Column 1-2支,Collection Tube 2-3支,薄壁PCR管 1-2支,上样缓冲液1-2微升。
[0006] Part 1零下20 °C保存,Part2室温保存。
[0007] -种快速鉴别PRV、PCV2、PRRSV、CSFV、PPV和SIV的mPCR检测试剂盒的使用方法, 包含以下步骤: (1)取病料样本,加入离心管中;后加入Solution A,振荡混匀后,室温放置; (2) 加入Solution B,混合均匀后,室温放置,后离心;将上清液转移到l#Collection Tube中,加异丙醇和冰乙酸混匀; (3) 将Spin Column安置于2#Collection Tube上;将步骤(2)的上清液转移至Spin Column中,离心,弃滤液; (4) 将Rinse A加入至上述Spin Column中,室温静置,离心,弃滤液; (5) 将Rinse B加入至Spin Column中,离心,弃滤液;再次离心; (6) 将Spin Column安置于离心管上,在Spin Column膜的中央处加入灭菌蒸馏水或 Elution Buffer,室温静置;离心,洗脱病毒RNA/DNA,得到病料模板; (7) mPCR 扩增:2 XI Step Buffer、PrimeScript One Step Enzyme Mix、上下游引物 PRV、PCV2、上下游引物PRRSV、上下游引物PPV、上下游引物CSFV、上下游引物SIV、模板 PRV、PCV2、PRRSV、CSFV、PPV、SIV 和 RNase Free H20 进行 PCR 扩增反应; (8) 取PCR产物及阳性对照分别与上样缓冲液混合均匀后,于1 XTAE琼脂糖凝胶中电 泳检测,紫外灯下观察结果,即可。
[0008] 首次使用前,在Rinse A中添加12. 5mL的100%乙醇;在Rinse B中添加31. 5mL 的100%乙醇。
[0009] 设计的PRV病毒gB基因的上下游引物: F1 :5,- GACCACGCGGTCAATGTCG -3,, R1 : 5' - ATGGTGGAGGTGCCCG -3',片段 192bp。
[0010] 设计的PCV2病毒0RF2基因上下游引物: F2:5, - TGGGGGATTGTATGGCGGG -3r , R2:5' -GGCGGTGGACATGCTGAGAT-3',片段 255bp。
[0011] 设计的PRRSV病毒0RF6基因上下游引物: 卩3:5' -TTCTGCCACCCAACACGAGG-3,, R3:5,-GGCCGACTGCTAGGGCTTTT-3',片段 364bp。
[0012] 设计的CSFV病毒C基因上下游引物: F4:5, - ACCTCGCAGAACTGCACTT -3r , R4 :5' -GTCAGTAGTTCGACGTGAGCAG -3 ',片段 530bp。
[0013] 设计的PPV病毒NS1基因上下游引物: -TGATGCTGTCACACAGGTGAA-3r , R5 :5' -GCTCCTGGTTGGTAACCTCGG-3',片段 759bp。
[0014] 设计的SIV病毒M基因上下游引物: F6:5' - AGCGCTATGTTGACAAAATGACC -3', R6:5,-TTAAAGATGAGCCTTCTGACCGAGG-3',片段 981bp。
[0015] 本发明的独特效果在于:本发明建立了 PRV、PCV2、CSFV、SIV等病毒的四重PCR检 测方法,PRV、PCV2、PRRSV、CSFV、SIV等病毒的五重PCR检测方法以及PRV、PCV2、PRRSV、 CSFV、PPV、SIV等病毒的六重PCR检测方法,实现了上述几种病毒的同时并同步检测。
【附图说明】
[0016] 图 1 为 PRV,PCV2, PRRSV,CSFV,PPV,SIV 六重 PCR 退火温度优化; 图 2 为 PRV,PCV2, PRRSV,CSFV,PPV,SIV 六重 PCR 的特异性试验; 图 3 为 PRV,PCV2, PRRSV,CSFV,PPV,SIV 六重 PCR 的敏感性试验。
【具体实施方式】
[0017] 实施例1 : 本试剂盒分试剂PartI与PartII两部
+ 1使用时请置于冰盒上使用。
[0018] +2含有强变性剂,应避免与皮肤、衣物等接触。若不小心接触到眼睛或皮肤,请立 即到医院进行处理。
[0019] * 3首次使用前,请在Rinse A添加12. 5mL的100%乙醇,混合均匀;请在Rinse B 添加31. 5mL的100%乙醇,混合均匀。
[0020] * 4准备异丙醇(1%冰乙酸):在99mL的异丙醇中加入lmL冰乙酸,混合均勾,应于 室温密闭保存。操作时应戴上双层手套 2试剂盒保存期:6个月 操作方法 1病料模板核酸(RNA和DNA)的提取 操作前,提前把所需移液器、tip头(全用RNA酶处理后的tip头)、试剂盒、一次性手 套、异丙醇(1%冰乙酸)等放于工作台,紫外灯照射30min。操作时全部在工作内完成,且带 双层手套。
[0021] (1)取200uL上述病料样本,加入1.5mL离心管(可用一般EP管)中。
[0022] (2)加入200uL的SolutionA,剧烈振荡混匀后(用力在手上拍打),室温放置 5min〇
[0023] (3)加入75uL的Solution B,混合均勾后,室温放置5min。12000rpm离心5min。
[0024] (4)将上清液转移到新的Collection Tube (2mL,试剂盒中提供)中,加250uL异 丙醇(1%冰乙酸),上下颠倒混匀。
[0025] (5)将试剂盒中的Spin Column安置于另一新的Collection Tube(试剂盒提供) 上。
[0026] (6)将上述操作(4)的上清液转移至Spin Column中,12000rpm离心lmin,弃滤 液。(如Spin Column中有液体残留,可适当提高离心速度,再离心lmin) (7)将 500uL 的 Rinse A 加入至 Spin Column 中,室温静置 lmin,12000rpm 离心 lmin, 弃滤液。
[0027] (8)将 800uL 的 Rinse B 加入至 Spin Column 中,12000rpm 离心 lmin,弃滤液。 (备注:首次使用需确认Rinse B中已经加入了指定体积的100%乙醇) (9)再次进行12000rpm离心lmin。
[0028] (10)将Spin Column安置于新的1. 5mL的离心管上,在Spin Column膜的中央处 加入50uL的灭菌蒸馏水(RNase Free)或Elution Buffer,室温静置lmin。
[0029] (11) 12000rpm 离心 lmin,洗脱病毒 RNA/DNA。
[0030] 扩增 最佳反应体系: 2X1 Step Buffer 25)^L; PrimeScript One Step Enzyme Mix 2 u L; 上下游引物PRV、PCV2 各0. 5ML; 上下游引物PRRSV 各0. 8ML; 上下游引物PPV 各0. 7ML; 上下游引物CSFV 各1ML; 上下游引物SIV 各1.5ML; 模板PRV、PCV2、PRRSV、CSFV、PPV、SIV各 1MLRNase Free H20 7)^L〇
[0031] 反应程序:5(TC 40min ;94°C 5min ;94°C 30s,56. 5°C 30s,72°C 45s,35cycles ; 72〇C lOmin. 3结果判定 取5 y L PCR产物及5 y L阳性对照分别与1 y L上样缓冲液混合均匀后,于2%的 1XTAE琼脂糖凝胶中电泳检测(85V 50 min),紫外灯下观察结果。
[0032] 若出现192bp大小条带,则检测样品中含有PRV ;若出现255bp大小条带,则检测 样品中含有PCV2 ;若出现364bp大小条带,则检测样品中含有PRRV ;若出现530bp大小条 带,则检测样品中含有CSFV ;若出现759bp大小条带,则检测样品中含有PPV ;若出现981bp 大小条带,则检测样品中含有SIV。若同时出现几条带,则检测样品中同时含相应的几种病 毒,即表现为混合感染。
[0033] 实施例2 : 1材料与方法 1. 1病毒、质粒及菌株 PRV、PCV2、PRRSV、CSFV、PPV系贵州省动物疫病研究室鉴定并传代保存;SIV系从病料 中获得;PMD19-T、Vector购自大连宝生物公司;;大肠杆菌感受态ToplO由贵州省动物疫 病研究室制备和保存。
[0034] 主要试剂及仪器 分子量标准物DL2000 Marker购自大连宝生物公司;TaKaRa MiniBEST Universal Genomic DNA & RNA Extraction Kit Ver. 4. 0购自大连宝生物工程有限公司;E. Z. N. A. TM Gel Extraction Kit (50)胶回收试剂盒系OMEGA公司产品;普通质粒小提试剂盒为 TIANGEN公司产品;异丙醇、无水乙醇等为国产分析纯试剂。Icycler Thermal cycler型 PCR仪为BIO-RAD公司产品。
[0035] 引物设计 参照NCBI中PRVgB(AF257079)、PCV2 0RF2 (NC_005148)、PRRSV0RF6 (NC_001961)、CSFVC(AY805221)、PPVNS1 (NC_001718)、SIVM(⑶086140)等基因序列,应用多重PCR 引物设计系统Mpprime和多因素引物特异性
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