一种基于核糖体dnaits1基因检测华支睾吸虫囊蚴的pcr扩增试剂盒及扩增引物的制作方法

文档序号:9411634阅读:327来源:国知局
一种基于核糖体dna its1基因检测华支睾吸虫囊蚴的pcr扩增试剂盒及扩增引物的制作方法
【技术领域】
[0001] 本发明涉及寄生虫检测技术领域,特别涉及一种基于核糖体DNA ITS1基因检测华 支睾吸虫囊蝴的PCR扩增试剂盒及扩增引物。
【背景技术】
[0002] 华支睾吸虫病(Clonorchiasis)是由于感染华支睾吸虫(Clonorchis sinensis, Cs)引起的食源性人兽共患寄生虫病,严重危害人类的健康。该病主要分布在东亚、东南亚 和东欧的部分国家,如中国、韩国、老挝和越南等。据统计全球约有3 500万人感染这种吸 虫,其中1500万人分布在我国的各个省市区(除内蒙古、青海、西藏和新疆外均有发现), 以广东、广西和东北三省尤为严重。目前,华支睾吸虫的鉴定方法还没有统一的标准,目前 对华支睾吸虫囊蝴的诊断依赖于显微镜检查。众所周知,显微镜检查耗费时间长,检查效率 低,对检查者临床工作经验要求较高,而且对于与华支睾吸虫亲缘关系相近的囊蝴,虫卵形 态相似,普通光镜无法区分,使用这种方法往往会出现误判。免疫诊断法虽然较显微镜检查 法效率高,但也常常为灵敏度和特异性所局限。

【发明内容】

[0003] 本发明的目的在于提供一种基于核糖体DNA ITS1基因检测华支睾吸虫囊蝴的 PCR扩增试剂盒,灵敏度高,特异性强,检测快速、准确,为华支睾吸虫感染的诊治和预防提 供有效的技术手段。
[0004] 本发明还提供了一种基于核糖体DNA ITS1基因检测华支睾吸虫囊蝴的扩增引物, 特异性强。
[0005] 本发明解决其技术问题所采用的技术方案是:
[0006] -种基于核糖体DNA ITS1基因检测华支睾吸虫囊蝴的PCR扩增试剂盒,包括 PCR扩增反应液,所述PCR扩增反应液包括:Tris-HCl 10mmol/L,KC1 50mmol/L,MgCl2 1. 5mmol/L, dNTPs 0. 8mmol/L,正向引物 0? 4 y mol/L,反向引物 0? 4 y mol/L,DNA 模板 20ng/ 1^,了39酶 0.0751]/1^。
[0007] 本发明以华支睾吸虫核糖体DNA内转录间隔区(ITS)基因-ITS1为目标,专门设 计了针对性的特异性引物,进一步的设计了检测试剂盒,检测结果特异,结果易判断,灵敏 度高,特异性强,检测快速、准确,为华支睾吸虫感染的诊治和预防提供有效的技术手段。
[0008] 作为优选,所述正向引物序列为:5' -CTAGTTCCGTCATCTGTCTTGC-3'(SEQ ID NO. 1) 〇
[0009] 作为优选,所述反向引物序列为:5' -ACCGAGGCGTTATCAGTCGTA-3'(SEQ ID NO. 2)。
[0010] 作为优选,所述Tris-HCl的pH为8. 3。
[0011] -种基于核糖体DNA ITS1基因检测华支睾吸虫囊蝴的扩增引物所述扩增引物包 括正向引物和反向引物,所述正向引物序列为:5'-CTAGTTCCGTCATCTGTCTTGC-3'(SEQ ID NO. 1),所述反向引物序列为:5'-ACCGAGGCGTTATCAGTCGTA-3'(SEQ ID NO. 2)。采用本发明 设计的特异性扩增引物,检测灵敏度高,特异性强。
[0012] 本发明的有益效果是:灵敏度高,特异性强,检测快速、准确,为华支睾吸虫感染的 诊治和预防提供有效的技术手段。
【附图说明】
[0013] 图1是本发明试剂盒对华支睾吸虫DNA的PCR扩增结果图,
[0014] 图中:M : 100bp DNA marker,1-2:目的扩增条带。
[0015] 图2是本发明试剂盒的特异性试验结果图,
[0016] 图中:M :100bp DNA marker ;1:目的扩增条带;2-4:简单异尖线虫、刺激隐核虫和 棘颚口线虫。
[0017] 图3是本发明试剂盒的敏感性试验结果图,
[0018] 图中:M :100bp DNA Marker ;1 :40ng/ y L华支睾吸虫 DNA ;2 :4ng/ y L 华支睾吸虫 DNA ;3 :400pg/ y L华支睾吸虫DNA ;4 :40pg/ y L华支睾吸虫DNA ;5 :4pg/ y L华支睾吸虫 DNA ;6 :0? 4pg/ y L 华支睾吸虫 DNA。
【具体实施方式】
[0019] 下面通过具体实施例,并结合附图,对本发明的技术方案作进一步的具体说明。
[0020] 本发明中,若非特指,所采用的原料和设备等均可从市场购得或是本领域常用的。 下述实施例中的方法,如无特别说明,均为本领域的常规方法。
[0021] 本发明实施如下:
[0022] 1、材料与方法
[0023] 1. 1 材料:
[0024] 囊蝴和华支睾吸虫DNA阳性对照来源:2013年5月底采集舟山市场上销售的麦穗 鱼,用消化法从鱼肉组织中分离获得华支睾吸虫囊蝴。华支睾吸虫DNA阳性对照品由舟山 出入境检验检疫局提供。简单异尖线虫、刺激隐核虫和棘颚口线虫由舟山出入境检验检疫 局提供。
[0025] dNTPs、Taq酶均购自大连宝生物公司。
[0026] 1. 2 方法
[0027] 1. 2. 1囊蝴的分离
[0028] 将麦穗鱼用清水洗净,去除鱼头、鱼尾、鱼鳍、鱼刺及内脏,将鱼肉用绞肉机加工 成肉泥,放入玻璃杯。按每克鱼肉加入10mL人工胃液(盐酸浓度为8mL/L,胃蛋白酶浓 度8g/L,氯化钠浓度为9g/L),37°C孵箱作用2h,将消化完全的鱼肉消化液经80目分离筛 过滤集中于2L的分液漏斗中沉淀0. 5h,放出约300mL的消化液至500mL的烧杯中,沉淀 10-30min后,弃去上面的浊液,用清水反复清洗至液体清亮,随后将含虫体的液体转移至 15mL尖底离心管内,沉淀lmin后将含囊蝴的上清液体吸至另一新管内,反复沉淀几次,显 微镜下检查囊蝴纯净度。将剩余的囊蝴保存在Alsever' s溶液(Alsever's Solution,市 售)中,置于4°C冰箱备用。
[0029]1. 2. 2囊蝴的形态学和DNA提取
[0030] 取少量上述收集到的囊蝴置于显微镜下观察,并对其进行了形态学鉴定。随后按 照Takara universal Genomic DNA Extraction kit (市售,购自大连宝生物公司)说明书 中提供的方法提取囊蝴的基因组DNA。
[0031] 1.2.3引物设计与合成
[0032] 针对华支睾吸虫rDNA ITSl(GenBank:KF740423)基因序列设计特异性引物1 对:正向引物序列为:5' -CTAGTTCCGTCATCTGTCTTGC-3'(SEQ ID NO. 1),反向引物序列为: 5'-ACCGAGGCGTTATCAGTCGTA-3'(SEQ ID N0. 2)。引物设计采用 DNASTAR5. 0 软件程序设计 完成,由生工生物(上海)有限公司合成,对上述2. 2提取的DNA进行PCR扩增,获得528kb 目标产物。
[0033] 1.2.4目的基因扩增与序列测定
[0034] 20 y L的PCR反应体系中组分如下:
[0035] pH8. 3 的 Tris-HCl 10mmol/L, KC1 50mmol/L, MgCl2 1. 5mmol/L, dNTPs 0. 8mmo 1 / 1,正向引物(5£0 10勵.1)0.4以111〇1/1,反向引物(5£0 10勵.2)0.411111〇1/1,0嫩模板 (1. 2. 2 节提取获得)20ng/ y L,Taq 酶 0? 075U/ y L,ddH20 补足至 20 y L。
[0036] PCR 扩增条件:94°C 5min - 94°C 30sec,(54。(:、56。(:
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