骨关节炎诊治标志物及其应用_3

文档序号:9411668阅读:来源:国知局
br>[0069] 7) 14000g,室温,离心lmin,使细胞碎片沉淀于离心管底部,取上清转移到另外一 个不含RNA酶1. 5mL的离心管中;
[0070] 8)加入450ul的95%乙醇,涡旋混匀;
[0071] RNA 吸附:
[0072] 9)取650ul含乙醇的裂解液加到离心柱中,14000g离心lmin ;
[0073] 10)弃下层,重置收集管于柱上;
[0074] 11)依照裂解液的容量,重复9)~10)步;
[0075] 12)加入 400ulWash solution,14000g 离心 2min ;
[0076] 13)弃下层,将柱置于一新的收集管上;
[0077] DNase 处理:
[0078] 14)加入 lOOulEnzyme Incubation Buffer 和 15ulDNase I,14000g 离心 lmin ;
[0079] 15)将收集管中的溶液重新移入柱中;
[0080] 16)室温放置 15min ;
[0081] RNA 洗涤:
[0082] 17)加入400ulWash solution,14000g离心lmin,弃下层,重置收集管于柱上;
[0083] 18)加入 400ulWash solution,14000g 离心 2min,弃收集管;
[0084] RNA 洗脱:
[0085] 19)把柱子放入 1. 7mL Elution 管中;
[0086] 20)加入 30ul Elution Buffer ;
[0087] 21) 200g离心2min,使溶液充分与柱结合,然后14000g离心lmin。
[0088] 2、RNA样品的质量分析(NanoDroplOOO分光光度计)
[0089] NanoDroplOOO 分光光度计检测 RNA 样品:0D260/0D280 为 1. 8-2. 2。
[0090] 3、基因芯片杂交及扫描
[0091] 总RNA经线性化扩增后,cy3-UTP标记,荧光标记后的cRNAs采用RNEASY Mini Kit 纯化,用Amhion的RNA Fragmentation Reagents对标记好的cRNAs进行片段化处理。采用 美国Agilent公司的人全基因表达谱芯片(4x 44K基因),在芯片杂交炉中65°C杂交17h, 然后洗脱、染色,最后用Agilent DNA MicroarrayScanner扫描仪扫描。
[0092] 4、芯片数据处理与分析
[0093] 杂交后的芯片经芯片扫描仪读取数据点后,将数据导入分析软件,对于两组比值 的自然对数绝对值大于2. 0或小于0. 5的基因作为差异表达基因。
[0094] 5、统计学处理
[0095] 采用SPSS 13. 0统计软件进行数据分析,组间差异比较采用单因素方差分析法, P〈0. 05差异有显著性意义。
[0096] 6、结果
[0097] 结果显示(如图1所示),与正常人相比,骨关节炎患者滑膜组织中SLC5A8基因的 mRNA水平显著降低,差异具有统计学意义(P〈0. 05)。
[0098] 实施例2 0A滑膜组织和正常滑膜组织中SLC5A8蛋白的表达差异
[0099] 1、步骤
[0100] 1. 1滑膜组织细胞体外培养
[0101] 将无菌获取的滑膜组织用PBS清洗后,用无菌手术剪刀反复剪切成约1mmX1mmX 1mm的组织块,加入胶原酶II (0. 5mg/ml) 37°C、消化2h后,经200目纱网过滤,离心去上清 后,将细胞重悬于DMEM培养液,置于37°C,5 % C02细胞培养箱内培养。当细胞长成梭形并 成片后,进行传代培养。当细胞传至第3代后,分别加入FITC标记的小鼠抗人CD3、CD14、 ⑶19和PE标记的小鼠抗人⑶1 lb进行标记,流式细胞仪检测鉴定。上述4种标记均为阴性 的细胞为成纤维样滑膜细胞(Fibroblast-like Synoviocytes,FLS)用于本研究。
[0102] 1. 2细胞总蛋白的提取
[0103] 取对数期生长良好的纤维样滑膜细胞进行细胞总蛋白的提取,按照EpiQuik全细 胞提取试剂盒的说明书进行蛋白提取的操作。
[0104] 1. 3Western blot 检测
[0105] 将提取的蛋白定量进行SDS-PAGE电泳,之后进行转膜、封闭、一抗孵育、二抗孵 育、显色。
[0106] 2、统计学处理
[0107] 将蛋白条带的灰度值使用Image J软件进行分析,以0 -actin为内参,将SLC5A8 蛋白条带的灰度值进行归一化处理。结果数据都是以平均值土标准差的方式来表示,采用 SPSS13. 0统计软件来进行统计分析的,两者之间的差异采用t检验,认为当P〈0. 05时具有 统计学意义。
[0108] 3、结果
[0109] 结果如图2所示,与正常人相比,骨关节炎滑膜组织中SLC5A8蛋白的表达水平显 著降低,差异具有统计学意义(P〈〇. 05)。
[0110] 实施例3 SLC5A8基因表达质粒构建
[0111] USLC5A8基因表达载体的构建
[0112] 根据SLC5A8基因的编码序列(如SEQ ID NO. 1所示)设计扩增引物,引 物序列如下:正向引物为5' -GGCATCGGCACCTTCGTG-3'(SEQ ID N0. 3),反向引物为 5'-AAACGAGTCCCAITGCTCTT-3'(SEQ ID N0.4)。从成人胎脑的 cDNA 文库(clontech 公 司,货号:638831)中扩增全长的SLC5A8基因的编码序列,上述cDNA序列经限制性内切酶 BamHI和Xhol双酶切后插入到经限制性内切酶BamHI和Xhol双酶切的真核细胞表达载体 pcDNA3. 1中,连接获得的重组载体pcDNA3. 1-SLC5A8用于后续实验。
[0113] 2、转染
[0114]将0A成纤维样滑膜细胞分为两组,分别为对照组(转染pcDNA3. 1空载体)、和 SLC5A8过表达组(转染pcDNA3. 1-SLC5A8)。使用脂质体2000进行载体的转染,具体转染方 法按照说明书的指示进行。pcDNA3. 1空载体和pcDNA3. 1-SLC5A8的工作浓度均为0. 5 y g/ ml 〇
[0115] 3、QPCR 检测
[0116] 3. 1提取细胞总RNA利用常规方法进行操作。
[0117] 3. 2逆转录
[0118] 用逆转录缓冲液对1 y g总RNA进行逆转录合成cDNA。采用25 y 1反应体系,每 个样品取1 y g总RNA作为模板RNA,在PCR管中分别加入以下组分:DEPC水,5 X逆转录缓 冲液,10mmol/L dNTP,0.1mmol/l DTT,30ymmol/l Oligo dT,200U/yl M-MLV,模板 RNA。 42°C孵育lh,72°C 10min,短暂离心。
[0119] 3.3QPCR
[0120] 采用25 y 1反应体系,每个样本设置3个平行管,所有扩增反应均重复三次以上以 保证结果的可靠性。配制以下反应体系:SYBR Green聚合酶链式反应体系12. 5 y 1,正向引 物(5yM)lyl,反向引物(5yM)lyl,模板cDNA 2.0yl,无酶水8.5yl ;扩增SLC5A8基因 的正向引物序列为5'-0厶60厶(:〇^厶厶16厶6厶0厶-3'(5£0 10勵.5),反向引物序列为5'-厶八6八 ATACCAGTTATCCATCAGT-3'(SEQ ID N0. 6);扩增 GAPDH基因的正向引物序列为 5'-TTTAACTC 10勵.8),各项操作均于冰上进行。扩增程序为:95£€5!^11,(95°(:1〇8,6〇 1€6〇8)*45个循 环。以SYBR Green作为荧光标记物,在Light Cycler荧光实时定量PCR仪上进行PCR反
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