专利名称：一段白色念珠菌dna序列(3)特异性的确定及其应用的制作方法
技术领域：
本发明涉及一段白色念珠菌(Candida albicans)DNA序列(3)的特异性确定及其应用，属于生物医学技术领域。
本发明的技术方案为本发明利用现有的方法确定了长度为192bp的一段白色念珠菌(Candida albicans)特异DNA序列(3)及其PCR引物，用引物进行PCR扩增，其序列如下tgcctcggaa aggtcaatac tatgaaagtg ttgaatatat tcactgttgt tcgaacatat 60acacgattga gtgattaaat catttcttcc gagccctttt tttttgatcc ttaattccat 120tttcgagtgc gtgtgttggt gatatttaca aaaagtgtaa aataaccttg cttagggaga 180gtgggggtga ta 192引物序列为1.5’-tgcctcggaaaggtcaatac-3’2.5’-tatcacccccactctcccta-3’上述的白色念珠菌特异DNA序列(3)用于诊断白色念珠菌的基因芯片的探针序列，并通过上述的引物序列进行PCR扩增，标记后进行杂交检测或直接用于PCR诊断。
用本发明建立的临床检测技术所使用的方法具有快速、准确、操作简便、成本低等优点。
图2、图2续是测序图。其中图2是测定的序列、图2续是原始测序图谱。
图3是用Blast软件对PCR扩增产物的测序结果与预计序列的比较分析。
图4、图4续是基因数据库中Blast搜索结果。
图5.基因芯片杂交结果。
本发明可用于PCR方法或基因芯片方法进行白色念珠菌的临床检测。用本发明提供的序列进行PCR扩增，根据PCR方法获得产物是否出现和大小判断是否为白色念珠菌感染。也可用本序列为探针，作为基因芯片中的一个检测位点，然后用本发明中的PCR引物序列扩增临床标本，并标记后进行杂交检测。
说明书序列表<110>昆明寰基生物芯片开发有限公司<120>一段白色念珠菌DNA序列(3)特异性的确定及其应用<140><141><160>1<210>1<211>192<212>DNA<213>白色念珠菌(Candida albicans)<220><221>gene<222>(1)…(192)<400>1tgcctcggaa aggtcaatac tatgaaagtg ttgaatatat tcactgttgt tcgaacatat60acacgattga gtgattaaat catttcttcc gagccctttt tttttgatcc ttaattccat 120tttcgagtgc gtgtgttggt gatatttaca aaaagtgtaa aataaccttg cttagggaga 180gtgggggtga ta 19权利要求
1.一段白色念珠菌DNA序列(3)特异性的确定，其特征在于该序列的长度为192bp，序列及PCR引物如下tgcctcggaa aggtcaatac tatgaaagtg ttgaatatat tcactgttgt tcgaacatat 60acacgattga gtgattaaat catttcttcc gagccctttt tttttgatcc ttaattccat 120tttcgagtgc gtgtgttggt gatatttaca aaaagtgtaa aataaccttg cttagggaga 180gtgggggtga ta 192引物序列为1.5’-tgcctcggaaaggtcaatac-3’2.5’-tatcacccccactctcccta-3’
2.一段白色念珠菌DNA序列(3)特异性的应用，其特征在于该序列用于诊断白色念珠菌的基因芯片的探针序列，并通过上述的引物序列进行PCR扩增，标记后进行杂交检测或直接用于PCR诊断。
全文摘要
本发明涉及一段白色念珠菌DNA序列(3)特异性的确定及其应用，属于生物医学技术领域。本发明通过基因数据库资料的搜寻和分析，确定了一段白色念珠菌DNA序列(3)的特异性及PCR扩增引物，该序列长度为192bp。通过对妇女生殖道白色念珠菌感染标本的PCR扩增，克隆，获得该序列，测序证明与预计序列一致。再经生物信息学方法分析，基因芯片杂交分析，结果证实了该序列对于白色念珠菌的特异性。本发明作为基因芯片诊断的探针及PCR扩增检测序列，用于白色念珠菌的诊断用本发明建立的临床检测技术所使用的方法具有快速、准确、操作简便、成本低等优点。
文档编号C07H21/00GK1465708SQ0211388
公开日2004年1月7日 申请日期2002年6月12日 优先权日2002年6月12日
发明者谭德勇, 朱宝生 申请人:昆明寰基生物芯片开发有限公司