专利名称：一段白色念珠菌dna序列的特异性确定及其应用的制作方法
技术领域：
本发明涉及一段白色念珠菌(Candida albicans)DNA序列的特异性确定及其应用，属于生物医学技术领域。
本发明的技术方案为本发明利用现有的方法确定了长度为241bp的一段白色念珠菌(Candida albicans)特异DNA序列及其PCR引物，用引物进行PCR扩增，其序列如下1 gagaccaact ggttgggaaa aacaagattt acaattataa tgatttgttt gtttgtttgc61 tttatattta tggtttggta taagttagat agtctagttt gatagtcttg tttgattgtt121 tatatatgta tagatttaat ggtttgcttt gttttatgag tttttttgat atctggagta181 gttaaagact catctttgag aaataggaga ccaaacttgt tgagttacaa ttgacgtcgc241 a引物序列为1.5’-gagaccaactggttgggaaa-3’2.5’-tgcgacgtcaattgtaactca-3’上述的白色念珠菌特异DNA序列作为基因芯片诊断的探针及PCR扩增检测序列，用于白色念珠菌的临床诊断。
图2、图2续是测序图。其中图2是测定的序列、图2续是原始测序图谱。
图3是用Blast软件对PCR扩增产物的测序结果与预计序列的比较分析。
图4、图4续(1)、图4续(2)是基因数据库中Blast搜索结果。
图5.基因芯片杂交结果。
本发明可用于PCR方法或基因芯片方法进行白色念珠菌的临床检测。用本发明提供的序列进行PCR扩增，根据PCR方法获得产物是否出现和大小判断是否为白色念珠菌感染。也可用本序列为探针，作为基因芯片中的一个检测位点，然后用本发明中的PCR引物序列扩增临床标本，并标记后进行杂交检测。
权利要求
1.一段白色念珠菌DNA序列的特异性确定，其特征在于该序列的长度为241bp，序列及PCR引物如下1 gagaccaact ggttgggaaa aacaagattt acaattataa tgatttgttt gtttgtttgc61 tttatattta tggtttggta taagttagat agtctagttt gatagtcttg tttgattgtt121 tatatatgta tagatttaat ggtttgcttt gttttatgag tttttttgat atctggagta181 gttaaagact catctttgag aaataggaga ccaaacttgt tgagttacaa ttgacgtcgc241 a引物序列为1.5’-gagaccaactggttgggaaa-3’2.5’-tgcgacgtcaattgtaactca-3’
2.一段白色念珠菌DNA序列的应用，其特征在于该序列作为白色念珠菌的特异序列用于基因芯片诊断的探针，及PCR扩增检测序列。
全文摘要
本发明涉及一段白色念珠菌DNA序列的特异性确定及其应用，属于生物医学技术领域。本发明通过基因数据库资料的搜寻和分析，确定了一段白色念珠菌DNA序列的特异性及PCR扩增引物，该序列长度为241bp。通过对妇女生殖道白色念珠菌感染标本的PCR扩增，克隆，获得该序列，测序证明与预计序列一致。再经生物信息学方法分析，基因芯片杂交分析，结果证实了该序列对于白色念珠菌的特异性。本发明作为基因芯片诊断的探针及PCR扩增检测序列，用于白色念珠菌的诊断。
文档编号C12Q1/68GK1436857SQ0211335
公开日2003年8月20日 申请日期2002年2月6日 优先权日2002年2月6日
发明者谭德勇, 朱宝生 申请人:昆明寰基生物芯片开发有限公司