一种鼻咽癌相关eb病毒检测试剂盒及检测方法

文档序号:9320891阅读:538来源:国知局
一种鼻咽癌相关eb病毒检测试剂盒及检测方法
【技术领域】
[0001] 本发明涉及一种生物技术领域,尤其涉及一种鼻咽癌相关EB病毒检测试剂盒及 检测方法。
【背景技术】
[0002] EB病毒(EBV)在世界各地感染比较普遍,成人超过90%均曾感染过。EB病毒感 染可引起传染性单核细胞增多症,与Burkitt淋巴瘤、Hodgkin病和鼻咽癌(NPC)等密切相 关。目前研究发现EBV感染与多种人类肿瘤发生相关。包括伯基特淋巴瘤、霍奇金淋巴瘤、 胃癌、鼻咽癌等。EBV在这些肿瘤发生中起到相当重要的作用,因此在1997年已经把EBV归 为第一类致癌物。近年来研究人员发现血浆游离EBV-DNA是一种可靠的监测指标,对鼻咽 癌的诊断、监测疗效及预后判断等方面都起到很好的作用。检测EBV-DNA含量对高危地区 NPC患者进行筛查和和辅助诊断有很高的实用价值。
[0003] 目前ELISA检测EBV各项抗体是临床诊断EBV感染的重要指标之一,但它实际上 检测的是人体对EBV感染的免疫反应状态,无法检测病毒自身,也就无法准确灵敏地反映 EBV感染的情况。由于鼻咽癌外周血循环的游离EBV-DNA的拷贝数随着全身化疗周期的 进行而呈现动态变化,所以检测鼻咽癌患者EBV-DNA的表达水平对判断病灶残留、复发、转 移、判断治疗的敏感性、综合治疗方案的及时更改、确认以及判断疗效、预后均具有重要的 指导意义,EBV目前已经成为鼻咽癌诊治中重要的血清分子标志物,可以作为诊断和治疗中 的一项参考依据。
[0004] 目前国外已经上市的检测EBV-DNA的试剂盒有几种,检测的方法主要是荧光免疫 杂交(HIGH),国内检测EBV主要采用ELISA方法,未见有批准上市检测EBV-DNA的试剂盒。 基于EBV感染情况如此严重,开发一种简单、易行、成本较低的检测方法就显得尤为重要。

【发明内容】

[0005] 本发明旨在解决现有技术的不足,而提供一种鼻咽癌相关EB病毒检测试剂盒及 检测方法。
[0006] 本发明为实现上述目的,采用以下技术方案:一种鼻咽癌相关EB病毒检测试剂 盒,该试剂盒含有:
[0007] (1) EB-PCR 反应液:包括 buffer、dNTPs、taq 酶;
[0008] (2)第一 EB引物探针液:包括第一 EB引物、第一 EB探针;
[0009] (3)第二EB引物探针液;包括第二EB引物、第二EB探针;
[0010] (4)临界阳性质控品:为含有扩增目的基因片段的重组质粒;
[0011] (5)阳性质控品:为含有扩增目的基因片段的重组质粒;
[0012] (6)阴性质控品:DEPC水;
[0013] 所述第一 EB引物,序列如下:
[0014] 正向引物:TACGCITTGTTCCTTARA ;
[0015]反向引物:GTCAGGATAGCAAGAATR ;
[0016] 所述第一EB探针,序列如下:
[0017] TTACTGATTGTCGCTGGCATACTCT;
[0018] 由所述第一EB引物与第一EB探针扩增出的第一DNA序列为:TTACGCTTTG TTCCTTAGAT TTGTTCTGCA TGTTATTACT GATTGTCGCT GGCATACTCT TCATTCTTGC TATCCTGACC GAATG;
[0019] 所述第二EB引物,序列如下:
[0020]正向引物:CTGGACACTTATGITTCAA ;
[0021]反向引物:GGGACAATATCAGGCTAA ;
[0022] 所述第二EB探针,序列如下:
[0023] FAM-TATGGTCACTCAGGCACGGTC-BHQ1
[0024] 由所述第二EB引物与第二EB探针扩增出的第二DNA序列为:CTGGACACTT ATGTTTCAAG CAGCTCACCT ATGGTCACTC AGGCACGGTC GCCCCTCCGA GTGACCAGTC ACCTTCCAGA CTATGCATAC ACTGAATTTA GCCTGATATT GTCCC;
[0025] 本发明还提供一种利用上述试剂盒检测鼻咽癌相关EB病毒的检测方法:包括以 下步骤:
[0026] (1)标本提取:根据标本的不同选择不同的提取方式:咽拭子样本、组织及鼻咽部 石蜡切片,选择相应的试剂盒,按照其说明书和注意事项进行提取即可。EB病毒的阳性质控 品、阴性质控品和临界阳性质控品无需抽提,使用前室温融化混匀;
[0027] (2)试剂配置:
[0028] A、在试剂准备区内将盒内各组分取出,于室温充分融化之后,短暂震荡,瞬时离 心,算加到反应混合物中的量;
[0029] B、取1. 5mL离心管配置反应体系,试剂全部加入后震荡混勾,瞬时离心;
[0030] C、将上述混合液17 y L/管分装至PCR反应管中,将阴性质控品、临界阳性质控品、 定量标准品和已处理样本的提取产物8 y L分别加入PCR反应管中,盖紧管盖,瞬时离心将 管壁上的液体全部甩至管底,然后立即进行PCR扩增反应。
[0031] (3)PCR扩增:
[0032] 将各反应管放入荧光定量PCR仪器中,设置标记荧光基团种类、样本名称及类型, 按下列条件进行扩增:
[0033] 预变性94 °C 4分钟1个循环
[0034] 变性94°C 15秒45个循环
[0035] 退火、延伸、荧光信号采集60 °C 45秒45个循环
[0036] (4)分析判断:
[0037] 样品Ct值小于35,则表示为EB病毒感染阳性;样品的样品Ct值在35到38之间, FAM通道有比较明显的S型扩增曲线则要对样品进行复检;样品的样品Ct值大于38,则意 味EB病毒载量低于检测下限。
[0038] 本发明的有益效果是:本发明采用核酸扩增技术与Taqman荧光探针技术相结合, 提取过后的样本核酸在Taq-DNA聚合酶的作用下对靶区域进行扩增,同时利用Taqman荧光 探针技术实时监测扩增产物的累积。通过对扩增产物的检测判断EB病毒核酸的存在,并可 以通过定量标准曲线检测出病毒载量。根据病毒载量的多少可以判断出鼻咽癌发生的危险 性,本试剂盒具有特异、灵敏、快速、操作方便等优点。
【附图说明】
[0039] 图1为本发明第一EB引物的特异性实验结果图;
[0040] 图2为本发明第二EB引物的特异性实验结果图;
[0041] 以下将结合本发明的实施例参照附图进行详细叙述。
【具体实施方式】
[0042] 下面结合实施例对本发明作进一步说明:
[0043] -种鼻咽癌相关EB病毒检测试剂盒,该试剂盒含有:
[0044] (1) EB-PCR反应液:包括buffer、dNTPs、taq酶;
[0045] (2)第一EB引物探针液:包括第一EB引物、第一EB探针;
[0046] (3)第二EB引物探针液;包括第二EB引物、第二EB探针;
[0047] (4)临界阳性质控品:为含有扩增目的基因片段的重组质粒;
[0048] (5)阳性质控品:为含有扩增目的基因片段的重组质粒;
[0049] (6)阴性质控品:DEPC水;
[0050] 所述第一EB引物,序列如下:
[0051]正向引物:TACGCITTGTTCCTTARA ;
[0052]反向引物:GTCAGGATAGCAAGAATR ;
[0053] 所述第一EB探针,序列如下:
[0054] TTACTGATTGTCGCTGGCATACTCT ;
[0055] 由所述第一EB引物与第一EB探针扩增出的第一DNA序列为:TTACGCTTTG TTCCTTAGAT TTGTTCTGCA TGTTATTACT GATTGTCGCT GGCATACTCT TCATTCTTGC TATCCTGACC GAATG;
[0056] 所述第二EB引物,序列如下:
[0057]正向引物:CTGGACACTTATGITTCAA ;
[0058]反向引物:GGGACAATATCAGGCTAA ;
[0059] 所述第二EB探针,序列如下:
[0060] FAM-TATGGTCACTCAGGCACGGTC-BHQ1
[0061 ]由所述第二EB引物与第二EB探针扩增出的第二DNA序列为:CTGGACACTT ATGTTTCAAG CAGCTCACCT ATGGTCACTC AGGCACGGTC GCCCCTCCGA GTGACCAGTC ACCTTCCAGA CTATGCATAC ACTGAATTTA GCCTGATATT GTCCC;
[0062] 实施例1一种利用上述试剂盒检测鼻咽癌相关EB病毒的检测方法:包括以下步 骤:
[0063] (1)石蜡标本提取:
[0064] A、脱蜡:
[0065] ①、加入1ml的二甲苯,剧烈漩涡震荡10s ;
[0066]②、常温离心,12000rpm,2min ;
[0067]③、小心吸取上清液,弃掉,注意不要移走组织,如石蜡杂质过多,可重复一次;
[0068] ④、加入1ml的无水乙醇,剧烈震荡;
[0069]⑤、常温离心,12000rpm,2min ;
[0070]⑥.、小心吸取上清液,弃掉,注意不要移走组织;
[0071] ⑦.、放入金属浴中,37°C烘烤至完全干燥。
[0072] B、提取:
[0073]①、加入180yL的Buffer ATL,20yl proteinase K(蛋白酶K),剧烈震荡混匀;
[0074] ②、56°C放置lh,或是放置到组织完全溶解;
[0075] ③、90°C放置lh,拿出凉至室温,如果使用同一个金属浴,先将样品取出,待金属浴 到90度之后再放进去;
[0076]④、加入200 y 1 Buffer AL,剧烈漩涡震荡混匀,然后加入200 y 1无水乙醇,再次 震荡混勾;
[0077] ⑤、小心的将液体转移到QIAamp MinElute column (离心柱下面套有2ml,收集废 液的EP管),8000rpm离心lmin,弃掉废液管中的液体;
[0078]⑥、向QIAamp MinElute column离心柱中加入500 y 1 Buffer AW1,8000rpm离心 lmin,弃掉废液管中的液体;
[
当前第1页1 2 
网友询问留言 已有0条留言
  • 还没有人留言评论。精彩留言会获得点赞!
1