一种放线菌及其应用
【技术领域】
[0001] 本发明涉及放线菌领域，特别涉及一种新的放线菌。
【背景技术】
[0002] 水稻是世界主要粮食作物，也是我国的主粮之一。水稻稻瘟病、纹枯病和白叶枯病 并称水稻的三大病害，其中稻瘟病是三大病害之首。稻瘟病是由稻瘟病菌(Magnaporthe oryzae)所引起的，由于该病菌在环境中极易生存，从而使其在各种生物胁迫中，成为对水 稻危害最为严重的病害，每年给水稻生产带来严重的经济损失。据估计，各个国家每年因稻 瘟病而损失10% - 30%的水稻产量，损失达数十亿美元(Kunova et al.，2013)。
[0003] 稻瘟病的发病机制是由于M. oryzae真菌在水稻叶片表面通过接触植物和在植物 体上萌发无性的分生孢子而引起的。常在水稻叶片上形成梭形病斑，最外面是黄色，稍内为 红褐色，中央灰白色，病斑两端有纵向伸展的褐色坏死线。稻瘟病可危害叶片、茎节、穗颈、 秧苗、枝梗和籽粒，分别称为苗瘟、叶瘟、节瘟、穗颈瘟、枝梗瘟和粒瘟。
[0004]目前农业上用于防治稻瘟病主要是化学农药，但是大量和长期使用化学农药，既 增加生产成本，也容易导致病原菌产生抗性，同时还造成严重的环境污染，给人类健康和环 境安全带来威胁。育种学家们采用培育新的抗病品种来抵抗稻瘟病，尽管具有一定的效果， 但是由于稻瘟病菌极易变异和致病多样性的特点，常常使得刚培育出的品种在推广数年内 失去抗性。因此，我们希望通过生物防治特别是生物农药来控制和解决稻瘟病。
[0005] 生防菌的种类繁多，目前生产上广泛应用的有真菌、细菌、放线菌和病毒等。对稻 瘟病防治有效的抗生素主要有灭瘟素 （blasticidin S)、春雷霉素/春日霉素 (1<381^&1115^;[11)、庆丰霉素（9；[1^€61^1115^;[11)(文等，2004)。131&81:;[(^(1;[113是1958年日本研 究者在变构菌素产生菌（Streptomyces griseochromogenes)中分离到的，用于替代有机萊 农药防治水稻稻瘟病。Blasticidin S曾大规模使用，但后来发现Blasticidin S对哺乳动 物具有毒性，限制了其大量使用。
[0006] 因而，筛选更多不同的能够抑制稻瘟菌生长的生防菌株成为开发生物农药防治水 稻稻瘟菌病害的首要工作。
【发明内容】
[0007] 因此，本发明之一提供了一种放线菌（Actinomycetes)，其为富阳链霉菌 (Streptomyces fuyangensis)〇
[0008] 在一个具体实施例中，所述放线菌为于2015年10月12日保藏于中国普通微生物菌 种保藏管理中心，保藏号为CGMCC No · 11482的富阳链霉菌（Streptomyces fuyangensis) BS014的菌株。
[0009] 本发明之二提供了一种组合物，其包括富阳链霉菌（Streptomyces fuyangensis) 以及农药上可接受的载体;特别是包括于2015年10月12日保藏于中国普通微生物菌种保藏 管理中心，保藏号为CGMCC No· 11482的富阳链霉菌（Streptomyces fuyangensis)BS014以 及农药上可接受的载体。
[0010]农药上可接受的载体也就是农药助剂，在农药制剂的加工或使用中，用于改善药 剂理化性质的辅助物，能提高药效，便于运输、贮藏等等。如润湿剂、乳化剂、分散剂、粘着 剂、稳定剂、增效剂。
[0011] 本发明之三提供了包括富阳链霉菌（Streptomyces fuyangensis)和农药上可接 受的载体的组合物在防治水稻稻瘟病、水稻恶苗病和水稻立枯病中的至少一种中的应用。 其中，水稻稻瘟病的病原菌为稻瘟菌(Magnaporthe oryzae)，水稻恶苗病的病原为串珠镰 抱(Fusarium moniliforme)，水稻立枯病的病原菌为禾谷镜抱菌（Fusarium graminearum Schw.)〇
[0012]在一个具体实施例中，包括于2015年10月12日保藏于中国普通微生物菌种保藏管 理中心，保藏号为CGMCC No · 11482的富阳链霉菌（Streptomyces fuyangensis)BS014，和农 药上可接受的载体的组合物在防治水稻稻瘟病、水稻恶苗病和水稻立枯病中的至少一种中 的应用。其中，水稻稻瘟病的病原菌为稻瘟菌(Magnaporthe oryzae)，水稻恶苗病的病原为 串珠镰孢（Fusarium moni 1 if orme )，水稻立枯病的病原菌为禾谷镰孢菌（Fusarium graminearum Schw.)〇
[0013]本发明之四提供了富阳链霉菌（Streptomyces fuyangensis)在防治水稻稻痕病、 水稻恶苗病和水稻立枯病中的至少一种中的应用。
[0014]在一个具体实施例中，于2015年10月12日保藏于中国普通微生物菌种保藏管理中 心，保藏号为CGMCC No · 11482的富阳链霉菌（Streptomyces fuyangens is )BS014在防治水 稻稻瘟病、水稻恶苗病和水稻立枯病中的至少一种中的应用。其中，水稻稻瘟病的病原菌为 稻痕菌(Magnaporthe oryzae)，水稻恶苗病的病原为串珠镰孢(Fusarium moniliforme)， 水稻立枯病的病原菌为禾谷镰孢菌(Fusarium graminearum Schw·)。
[0015] 本法之五提供了一种鉴定富阳链霉菌（Streptomyces fuyangensis)的方法，包括 对待测菌株进行16rDNA序列或16rDNA的部分序列测序，并且所述待测菌株的16rDNA序列或 16rDNA的部分序列与如SEQ ID N〇:l的序列的一致性在95%以上，优选所述待测菌株的 16rDNA序列或16rDNA的部分序列与如SEQ ID No: 1的序列的一致性在97 %以上，更优选所 述待测菌株的16rDNA序列或16rDNA的部分序列与如SEQ ID No: 1的序列的一致性在99 %以 上，最优选所述待测菌株的16rDNA序列或16rDNA的部分序列与如SEQ ID No: 1的序列的一 致性在99.5%以上，贝lj鉴定所述待测菌株为富阳链霉菌(Streptomyces fuyangensis)。
[0016] 在一个具体实施例中，所述待测菌株的16rDNA序列或16rDNA的部分序列的长度大 于或等于1300bp;优选所述待测菌株的16rDNA序列或16rDNA的部分序列的长度大于或等于 1350bp;更优选所述待测菌株的16rDNA序列或16rDNA的部分序列的长度大于或等于 1400bp;特别优选所述待测菌株的16rDNA序列或16rDNA的部分序列的长度大于或等于 1450bp;最优选所述待测菌株的16rDNA序列或16rDNA的部分序列的长度大于或等于 1500bp〇
[0017] 在一个具体实施例中，使用如SEQ ID No:2和SEQ ID No:3作为引物对进行PCR扩 增以获得的所述16rDNA的部分序列，并将所述16rDNA的部分序列进行测序来与如SEQID No: 1的序列比较以鉴定所述待测菌株。
[0018] 在一个具体实施例中，所述方法还包括将结合待测菌株的生长形态和/或生理生 化特性与富阳链霉菌(Streptomyces fuyangensis)的生长形态和/或生理生化特性的比较 以对所述待测菌株进行鉴定。
[0019] 一般来讲，利用微生物的16rDNA序列或16rDNA的部分序列对微生物进行鉴定具有 例如如下优点:对未知样品进行快速种属分析;为生化鉴定提供指导信息;对于难以获得纯 培养的细菌，如寄生菌等，使用16SrDNA鉴定是唯一可用的鉴定手段。
[0020] 但是有的微生物由于种间差异小，单独依靠16rDNA鉴定不能鉴定到种。需要其它 鉴定方法补充，例如微生物的生长形态和/或生理生化特性。当待测菌株与已知菌株间的 16rDNA序列或16rDNA的部分序列的一致性在上述水平时，且同时满足待测菌株与已知菌株 在相同的培养基上的生长形态相同时，可以更为准确地判断待测菌株与已知菌株同种，否 则可以判断待测菌株为不同的物种或者是新的物种；或者，当待测菌株与已知菌株间的 16rDNA序列或16rDNA的部分序列的一致性在上述水平时，且同时满足待测菌株与已知菌株 间的生理生化特性相同时，可以更为准确地判断待测菌株与已知菌株同种，否则可以判断 待测菌株为不同的物种或者是新的物种;或者，将待测菌株与已知菌株间的16rDNA序列或 16rDNA的部分序列一致性、生长形态和生理生化特性均进行比较，当待测菌株与已知菌株 间的16rDNA序列或16rDNA的部分序列的一致性在上述水平时，且同时满足待测菌株与已知 菌株在相同的培养基上的生长形态相同，以及进一步满足待测菌株与已知菌株间的生理生 化特性相同时，可以更为准确地判断待测菌株与已知菌株同种，否则可以判断待测菌株为 不同的物种或者是新的物种。
[0021] 其中，在待测菌株与已知菌株进行形态比较时，可以选用一种或多种培养基，例如 对于放线菌来说，可以选用ISP2、ISP3、ISP4和ISP5中的至少一种。
[0022] 在一个具体实施例中，所述