技术总结
本发明公开了一种基因表达的定量方法和装置，包括：获取含有核酸序列信息的读段序列；将读段序列与所有参考基因进行比对，获取比对上的读段序列；对比对上的读段序列进行过滤，舍去软剪切比例超过第一预设值，序列长度小于第二预设值，以及比对得分小于第三预设值的读段序列，软剪切比例是指没有比对上的碱基数目占该读段序列总碱基数目的比例；比对得分是按照每个读段序列与参考基因的匹配程度以及读段序列的长度而确定的数值；对于已过滤的读段序列，使用RPKM对目标基因表达进行定量。通过将读段序列与参考基因进行比对，而不是现有的与参考基因组进行比对，可以简化比对过程，提高比对效率。
技术研发人员：黄文潘;卢志远;龚梅花;章文蔚;席凤;韩鸿雁
受保护的技术使用者：深圳华大基因科技有限公司
文档号码：201410108121
技术研发日：2014.03.21
技术公布日：2017.03.22