检测eps8l3基因表达的试剂在制备骨质疏松症诊断产品中的应用

文档序号:9392015阅读:550来源:国知局
检测eps8l3基因表达的试剂在制备骨质疏松症诊断产品中的应用
【技术领域】
[0001] 本发明属于分子诊断领域,涉及一种用于骨质疏松症诊断的分子标志物,具体涉 及血液中的分子标志物-EPS8L3基因在制备诊断骨质疏松症的产品中的应用。
【背景技术】
[0002] 骨质疏松即骨质疏松症,是多种原因引起的一组骨病,骨组织有正常的钙化,钙盐 与基质呈正常比例,以单位体积内骨组织量减少为特点的代谢性骨病变。在多数骨质疏松 中,骨组织的减少主要由于骨质吸收增多所致。以骨骼疼痛、易于骨折为特征。
[0003] 流行病学资料显示,美国约8百万人患骨质疏松症,2千万人骨量减少,每年有150 万患者由于骨质疏松引发骨折。绝经后白人妇女骨质疏松发病率为17%,黑人妇女发病率 为6 %。年龄大于50岁人群中,将近50 %女性和25 %男性存在骨质疏松性骨折的潜在风 险。我国是老年人口绝对数数量最多的国家,《骨质疏松症防治中国白皮书》根据2006年全 国性汉族人群抽样调查结果显示,估算全国50岁以上人群中,约有6944万人(男1534万, 女5410万)患有骨质疏松症,有2. 1亿人患低骨量,存在骨质疏松症风险,预计到2020年 我国骨质疏松和低骨量患者将增加至2. 8亿。
[0004]目前诊断骨质疏松症主要依赖骨密度影像学检测方法,骨密度测定方法包括以下 几种:X线光密度法、单光子吸收法、双光子吸收法、双能x线吸收法、定量计算机体层摄影、 中子活化分析法、超声定量测量、磁共振测量、定量磁共振成像、高分辨率磁共振成像。上述 方法主要的局限在于不能在骨质疏松症发生的早期给出可靠的判断。
[0005] 为了提高骨质疏松症的治疗有效率,降低患者和国家的经济负担,寻找一种用于 骨质疏松症早期诊断的方法是亟待解决的问题。

【发明内容】

[0006] 为了弥补现有技术的不足,本发明的目的在于提供一种可用于骨质疏松症 (Osterarthritis,0A)早期诊断的分子标志物。相比传统的骨质疏松症的诊断方法,使用 基因标志物来诊断骨质疏松症的具有及时性、特异性和灵敏性,从而使患者在疾病早期就 能知晓疾病风险,针对风险高低,采取相应的预防和治疗措施。
[0007] 为了实现上述目的,本发明采用如下技术方案:
[0008] 本发明提供了检测EPS8L3基因表达的产品在制备诊断骨质疏松症的工具中的应 用。
[0009] 进一步,上面所提到的检测产品包括:通过RT-PCR、实时定量PCR、免疫检测、原位 杂交、芯片或高通量测序平台检测EPS8L3基因的表达水平以诊断骨质疏松症的产品。
[0010] 进一步,所述用RT-PCR诊断骨质疏松症的产品至少包括一对特异扩增EPS8L3基 因的引物;所述用实时定量PCR诊断骨质疏松症的产品至少包括一对特异扩增EPS8L3基因 的引物;所述用免疫检测诊断骨质疏松症的产品包括:与EPS8L3蛋白特异性结合的抗体; 所述用原位杂交诊断骨质疏松症的产品包括:与EPS8L3基因的核酸序列杂交的探针;所述 用芯片诊断骨质疏松症的产品包括:蛋白芯片和基因芯片;其中,蛋白芯片包括与EPS8L3 蛋白特异性结合的抗体,基因芯片包括与EPS8L3基因的核酸序列杂交的探针。
[0011] 在本发明的具体实施方案中,所述用实时定量PCR诊断骨质疏松症的产品至少包 括一对特异扩增EPS8L3基因的引物的序列如SEQIDN0. 3和SEQIDN0. 4所示。
[0012] 优选地,所述诊断工具包括芯片、试剂盒、试纸或高通量测序平台。其中,高通量 测序平台是一种特殊的诊断工具,检测EPS8L3基因表达的产品可以应用于该平台实现对 EPS8L3基因的表达情况的检测。随着高通量测序技术的发展,对一个人的基因表达谱的构 建将成为十分便捷的工作。通过对比疾病患者和正常人群的基因表达谱,容易分析出哪个 基因的异常与疾病相关。因此,在高通量测序中获知EPS8L3基因的异常与骨质疏松症相关 也属于EPS8L3基因的用途,同样在本发明的保护范围之内。
[0013] 本发明还提供了一种诊断骨质疏松症的工具,所述产品包括芯片、试剂盒、试纸、 或高通量测序平台。
[0014] 其中,所述芯片包括基因芯片、蛋白质芯片;所述基因芯片包括固相载体以及固 定在固相载体的寡核苷酸探针,所述寡核苷酸探针包括用于检测EPS8L3基因转录水平的 针对EPS8L3基因的寡核苷酸探针;所述蛋白质芯片包括固相载体以及固定在固相载体 的EPS8L3蛋白的特异性抗体;所述基因芯片可用于检测包括EPS8L3基因在内的多个基 因(例如,与骨质疏松症相关的多个基因)的表达水平。所述蛋白质芯片可用于检测包括 EPS8L3蛋白在内的多个蛋白质(例如与骨质疏松症相关的多个蛋白质)的表达水平。通过 将多个与骨质疏松症的标志物同时检测,可大大提高骨质疏松症诊断的准确率。
[0015] 其中,所述试剂盒包括基因检测试剂盒和蛋白免疫检测试剂盒;所述基因检测试 剂盒包括用于检测EPS8L3基因转录水平的试剂;所述蛋白免疫检测试剂盒包括EPS8L3蛋 白的特异性抗体。进一步,所述试剂包括使用RT-PCR、实时定量PCR、免疫检测、原位杂交或 芯片方法检测EPS8L3基因表达水平过程中所需的试剂。优选度,所述试剂包括针对EPS8L3 基因的引物和/或探针。根据EPS8L3基因的核苷酸序列信息容易设计出可以用于检测 EPS8L3基因表达水平的引物和探针。
[0016] 所述高通量测序平台包括检测EPS8L3基因表达水平的试剂。
[0017] 所述试纸包括试纸载体和固定在试纸载体上的寡核苷酸,所述寡核苷酸能够检测 EPS8L3基因的转录水平。
[0018] 与EPS8L3基因的核酸序列杂交的探针可以是DNA、RNA、DNA-RNA嵌合体、PNA或 其它衍生物。所述探针的长度没有限制,只要完成特异性杂交、与目的核苷酸序列特异性结 合,任何长度都可以。所述探针的长度可短至25、20、15、13或10个碱基长度。同样,所述 探针的长度可长至60、80、100、150、300个碱基对或更长,甚至整个基因。由于不同的探针 长度对杂交效率、信号特异性有不同的影响,所述探针的长度通常至少是14个碱基对,最 长一般不超过30个碱基对,与目的核苷酸序列互补的长度以15-25个碱基对最佳。所述探 针自身互补序列最好少于4个碱基对,以免影响杂交效率。
[0019] 进一步,所述EPS8L3蛋白的特异性抗体包括单克隆抗体、多克隆抗体。所述 EPS8L3蛋白的特异性抗体包括完整的抗体分子、抗体的任何片段或修饰(例如,,嵌合抗 体、80?¥、?&13、?(313')2、?¥等。只要所述片段能够保留与£?5813蛋白的结合能力即可。用 于蛋白质水平的抗体的制备时本领域技术人员公知的,并且本发明可以使用任何方法来制 备所述抗体。
[0020] 在本发明的具体实施方案中,所述针对EPS8L3基因的引物序列如下:正向引物序 列如SEQIDN0. 3所示,反向引物如SEQIDN0. 4所示。
[0021] 用于诊断骨质疏松症的EPS8L3基因及其表达产物的来源包括但不限于血液、组 织液、尿液、唾液、脊髓液等可以获得基因组DNA的体液。在本发明的具体实施方案中,用于 诊断骨质疏松症的EPS8L3基因及其表达产物的来源是血液。
[0022] 在本发明的上下文中,"EPS8L3基因"包括EPS8L3基因以及EPS8L3基因的任何 功能等同物的多核苷酸。EPS8L3基因包括与目前国际公共核酸序列数据库GeneBank中 EPS8L3基因(NC_000001. 11)DNA序列具有70%以上同源性,且编码相同功能蛋白质的DNA 序列;
[0023] 优选地,EPS8L3基因的编码序列包括以下任--种DNA分子:
[0024] (1)序列表中SEQIDNO. 1所示的DNA序列;
[0025] (2)在严格条件下与1)限定的DNA序列杂交且编码相同功能蛋白质的DNA序列;
[0026] (3)与(1)或⑵限定的DNA序列具有70%、优选地,90%以上同源性,且编码相 同功能蛋白质的DNA分子。
[0027] 在本发明的具体实施方案中,所述EPS8L3基因的编码序列是SEQ ID NO. 1所示的 DNA序列。
[0028] 在本发明的上下文中,EPS8L3基因表达产物包括EPS8L3蛋白以及EPS8L3蛋白的 部分肽。所述EPS8L3蛋白的部分肽含有与骨质疏松症相关的功能域。
[0029] "EPS8L3蛋白"包括EPS8L3蛋白以及EPS8L3蛋白的任何功能等同物。
[0030] 所述功能等同物包括EPS8L3蛋白保守性变异蛋白质、或其活性片段,或其活性衍 生物,等位变异
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