Sars相关冠状病毒的多等位分子检测的制作方法

专利名称：Sars相关冠状病毒的多等位分子检测的制作方法
技术领域：
本发明主要涉及SARS病毒的检测和/或定量方法，以及在此方法中所用的试剂与包含所述试剂的检测试剂盒。
背景技术：
严重急性呼吸系统综合征(severe acute respiratory syndrome)(SARS)是新近出现的一种急性感染性疾病。SARS的病因已被确定为冠状病毒科家族的一种新冠状病毒，国际卫生组织(WHO)在依照柯赫氏法则进行包括猴接种在内的因果关系评估后[3]，将该病毒命名为“SARS冠状病毒”(SARS-CoV)[1，2]。冠状病毒是一种有包膜的正义单链RNA病毒，其基因组长约30kb，是所有RNA病毒基因组中最大的，无需经过DNA中间物即可在宿主细胞的胞浆中复制。冠状病毒已被报道可导致人类普通感冒，亦可在动物中导致呼吸道、消化道、神经系统疾病及肝炎。人类冠状病毒通常很难进行体外培养，而大多数动物冠状病毒及SARS-CoV均易在Vero E6中进行培养[4]。冠状病毒有三组，第1组和第2组包含哺乳类病毒，而第3组包含禽类病毒。每组中的冠状病毒又根据宿主范围、抗原关系及基因组结构而被分为不同的种。人类冠状病毒(HCoVs)曾被报道属于第1组(HCoV-229E)和第2组(HCoV-OC43)，可导致轻度的呼吸道疾病。
不久前，两个独立的工作组分别于加拿大不列颠哥伦比亚癌症研究所(BCCA)[5](Tor2分离株)和美国疾病控制预防中心(CDCP)[6](Urbani分离株)首次完成了SARS-CoV的全基因组序列测定。基于基因组序列的系统进化分析显示，两个分离株均与以往检定的冠状病毒亲源性较远，包括以往分离得到的两个非致病性人冠状病毒株HCoV-OC43和HCoV-229E。Tor2 CoV分离株的基因组长29,751个核苷酸，Urbani CoV分离株的基因组长29,727个核苷酸，二者的序列仅有24个核苷酸的位置不同。两个分离株的基因组结构均具有冠状病毒的特征，包含如下典型基因顺序5′-复制酶(rep)，刺突(S)，包膜(E)，膜(M)及核壳(N)。SARS-CoV的rep基因长约20,000个核苷酸，其被预测编码两个参与蛋白酶解加工并生成数个非结构蛋白的多聚蛋白(ORFIa和ORFIb)。Rep基因下游有4个分别编码结构蛋白的基因S、E、M和N。
SARS-CoV的基因组具有多个具有生物学意义的独特基因组特点，使其显著区别于冠状病毒的其它分离株。包括出现在第2组冠状病毒(和部分第3组冠状病毒)ORFIa和S之间的编码红细胞凝集素酯酶的基因缺失，以及S蛋白的短锚缺失。此外，S蛋白的短锚、小ORFs的数量和位置，以及只有一个拷贝的PLPPRO所共同构成的遗传学特征，可以很容易地将SARS-CoV分离株与既往报告过的冠状病毒区别开来[5，6]。已有多篇文献报告了用逆转录聚合酶链式反应检测法(RT-PCR法)来检测SARS-CoV。
Perris等[2]设计了一种RT-PCR检测法，对SARS-CoV感染患者鼻咽吸取标本中的病毒进行鉴定。来自临床样本的所有RNA均通过任意的六聚物进行逆转录，所得cDNA通过引物5′-TACACACCTCAGCGTTG-3′和5′CACGAACGTGACGAAT-3′进行扩增。为确定未知RNA病毒的遗传序列，他们采用的是随机RT-PCR法。来自感染病毒和未感染病毒的恒河猴胚胎肾细胞的所有RNA均被分离，并通过引物5′-GCCGGAGCTCTGCAGAATTCNNNNNN-3′进行逆转录，所得cDNA通过引物5′-GCCGGAGCTCTGCAGAATTC-3′进行扩增。
Ksiazek等[1]设计了一种逆转录及实时PCR法来鉴定SARS-CoV。用于SARS相关冠状病毒扩增和测序的寡核苷酸引物是在对冠状病毒聚合酶基因序列中的开放读码框架1b进行序列对比而设计的。为获得与冠状病毒/属的广泛反应性，他们采用了原本设计用于与开放读码框架Ib(ORFIb)保守区杂交的引物对IN-2(+)5′GGGTTGGGACTATCCTAAGTGTGA-3′和IN-4(-)5′-TAACACACAACICCATCATCA-3′。这些引物被用于从SARS分离株中扩增DNA，所得扩增子序列用于设计SARS特异性引物Cor-p-F2(+)5′-CTAACATGCTTAGGATAATGG-3′，Cor-p-F3(+)5′-GCCTCTCTTGTTCTTGCTCGC-3′和Cor-p-RI(-)5′-CAGGTAAGCGTAAAACTCATC-3′，依次用于检测患者标本。Drosten等[4]采用基于PCR的随机扩增法，对长300个核苷酸的SARS-CoV基因组片段进行了遗传性鉴定。在所得序列的基础上，建立了专门检测SARS-CoV ORFIb的常规PCR法和实时PCR法。Poon等[7]设计了一种逆转录实时PCR法。分离自SARS-CoV感染个体粪便标本的所有RNA均通过任意六聚物进行逆转录，所得cDNA通过引物coro35′-TACACACCTCAGCGTTG-3′和coro4 5′-CACGAACGTGACGAAT-3′进行扩增，后两种引物可识别病毒聚合酶基因区域。值得注意的是，这些作者在文章中承认，他们在检测中所用的引物可与非致病性人类冠状病毒株HCoV-OC43发生交叉反应。
SARS特异性PCR引物及诊断程序在世界卫生组织的多个实验室网点已得到开发，用于SARS-CoV聚合酶基因序列开放读码框架Ib(ORFIb)某一区域的扩增[8]。这些引物目前正在接受评估，以确定其对病程中不同时间所取的不同标本的相对性能及灵敏度。Lipkin与Briese称他们在PCR基础上开发了一种SARS诊断法，可检测到一种在多个拷贝中表达的SARS-CoV基因，但文献中未见进一步的信息。
以往的技术中存在一些有待当前发明解决的问题。现有分子诊断检测法的主要问题有a)未能考虑到冠状病毒所固有的多态特性，包括目前起源于Tor2和Urbani分离株的SARS-CoV分离株-即病毒在感染个体中存活期间及在水平传播期间的突变和重组能力；b)不能解释非非-遗传相同的SARS-CoV分离株连续和/或多次感染人群的可能性。
RNA病毒的高遗传突变率是其特征之一，可导致新病毒株的进化，也众所周知是病毒逃脱免疫系统监视的机制之一。冠状病毒，包括SARS-CoV，在进行遗传物质复制的时候相当马虎，每复制10000个核苷酸就会发生一个错误，这与人类免疫缺陷病毒HIV-1复制中的错误率大致相同。冠状病毒的RNA聚合酶有时会在感染细胞中存在的病毒基因组的多个拷贝中发生跳跃。因此，每个新基因组实际上均是从多个模板拷贝而来，从而降低了任一特定突变在病毒群中被确定下来的几率。此外，如果其中某一跳跃不准确，则可能发生基因组的大段遗漏，从而导致某个重要基因部分缺失。其结果可能是显著的，特别是当变异影响到能使病毒结合到宿主细胞表面的蛋白刺突时。例如，1984年欧洲的养猪场中发生了一种新的呼吸系统疾病。最后发现是一种原先感染小猪胃部的冠状病毒缺失突变体所致[9]。它具有一种变异的刺突蛋白，可使病毒感染不同的细胞类型。尽管这种新的疾病并非致死性疾病，但它从此在全世界传播，使肠道疾病的诊断变得更加复杂。另一个例子就是最近SARS-CoV传入人群中。遗传缺失很可能有助于SARS病毒从其动物宿主传染到人类。对中国南部市场上所售动物中发现的病毒株进行遗传学分析后提示，在这些SARS病毒株中，编码一未知功能蛋白的基因缺少29个核苷酸，该基因的蛋白产物附着于病毒壳蛋白的内侧。此外，在最近的一篇文献中，对来自新加坡、多伦多、中国及香港SARS-CoV感染患者的14个分离株的全基因组序列进行了比较，发现14个突变[10]。该发现在一方面可被视作表明SARS病毒未能突变；然而该病毒迄今为止在新的人类宿主中甚少受到抵抗，因此导致新突变体出现的选择压力也很小。SARS-CoV将来可能不会仍象现今一样保持稳定。我们的免疫系统可能会迫使其发生变化，恰如流感病毒中常常发生的变化一样。总之，我们认为有必要开发一种能解释包括SARS-CoV在内的冠状病毒遗传学多样性特征的新型SARS-CoV诊断检测法。
发明概述本发明包括一种基于分子信标的多等位逆转录实时聚合酶链反应法，其主要用于临床样本中检测SARS相关冠状病毒和其它冠状病毒分离株之间的差别。本检测法设计的主要组成部分包括a)耐错配(mismatch-tolerant)的分子信标；b)针对4个不同病毒基因的4组PCR引物及4种不同的分子信标(每一种均用相同的荧光团进行标记，每一种均特异于一个不同的SARS-CoV基因)；c)一种能被其中一组引物进行逆转录和扩增的、被加入到样本中的外源RNA标准物(standard)；d)一种用不同荧光团标记的第5分子信标，专门针对外源RNA标准物。本检测法还包括从临床样本(血液、组织、痰、鼻咽吸入样本及其它)中分离RNA、逆转录、PCR扩增和在荧光分光光度计热循环仪中的扩增子同时自动检测，所述的热循环仪在每个热循环的退火相过程中检测每种颜色的荧光强度。
鉴定SARS-CoV的S、E、M和N基因(Urbani和Tor2分离株)的多重标靶序列。S、M和E基因编码存在于病毒外侧的结构蛋白，而N基因则编码一个在病毒粒内部包装病毒RNA所需的结构蛋白。选择4种(而非1种标靶序列)准确鉴定SARS-CoV标靶序列的基本原理是使用4种不同的标靶能使病毒基本遗传漂变不会导致假阴性结果的可能性增加-也就是说，散弹枪打中移动标靶的机会要高于步枪。因此，通过在同一测试管中检测4种不同的标靶等位基因及使用单个荧光团检测系统，该检测法的设计显著降低了因病毒序列的连续病毒进化而遗漏临床样本中存在SARS-CoV的可能性。此外，通过在同一测试管中同时检测四种不同标靶序列，该检测法的固有灵敏度得到提高。
为了在每个病毒基因中确定出能区分SARS-Urbani和SARS-Tor2与其它非致病性人类和动物冠状病毒株的最佳标靶序列，我们用GenBank中现存的冠状病毒基因序列进行了DNA序列比对及系统发生分析。SARS-CoV基因的DNA序列与代表已知3组冠状病毒各种类参考病毒的基因序列[第1组(G1)人类冠状病毒229E(HCoV-229E)，af304460；猪流行性腹泻病毒(PEDV)，af353511；传染性胃肠炎病毒(TGEV)，aj271965；犬科冠状病毒(CCoV)，dl3096；猫科冠状病毒(FCoV)，ay204704；猪呼吸道冠状病毒(PRCoV)，z24675；第2组(G2)牛冠状病毒(BCoV)，af220295；鼠肝炎病毒(MHV)，af201929；人冠状病毒OC43(HCoV-OC43)，m76373；猪血凝性脑脊髓炎病毒(HEV)，ay078417；大鼠冠状病毒(RtCoV)，af207551；第3组(G3)传染性支气管炎病毒(IBV)，m95169]进行比对。通过在生物信息学界普遍应用的多序列比较分析工具CLUSTRALW进行序列比较。它从三个主要方面进行全面的多序列比较a)两两比较，b)导引树(guild-tree)的构建，和c)多重比较。导引树由CLUSTALW生成，是对序列间关系的一种估计，其非常类似于系统树。
SARS-CoV基因特异性PCR引物的选择标准基于a)通过序列比较检查的结果，确定SARS-CoV中显示SARS-CoV与其它冠状病毒株间最大遗传距离的基因组区域；b)选择构成引物-标靶杂交体的SARS-CoV标靶扩增所需的引物序列，其理论解链温度使引物即使在存在核苷酸替换的情况下仍可最大程度地与标靶结合(耐错配)，而在多元测定中仍可使所有引物在同一温度与其标靶杂交(Tm约为60℃)；和c)选择引物序列，其使分别包含4种标靶序列之一的扩增子能长度近似(相对较短，长约100个核苷酸)。
分子信标探针序列及其臂序列的选择标准基于a)通过序列比较检查的结果，确定SARS-CoV中显示SARS-CoV(在将要被生成的扩增子中)与其它冠状病毒株间最大遗传距离的长约30个核苷酸的基因组区域(特别着重于与其它冠状病毒序列相比，SARS-CoV中包含裂隙或缺失的探针标靶序列)；；b)选择构成探针-标靶杂交体的探针序列，其理论解链温度应使探针在存在核苷酸置换的情况下仍可最大程度地与标靶序列结合(耐错配)，而在多元检测中亦可使所有探针在同一温度下与其标靶杂交(Tm约为63℃)；和c)选择可为所有分子信标探针的干杂交提供同级别稳定性的臂序列(干杂交Tm约70℃)。
此处所述之检测法可以以同源或者异源模式操作。实施该检测所需之试剂可以试剂盒的形式提供。该试剂盒包含用于检测两种或更多冠状病毒基因S、E、M及N所必需的检测剂(decectant)。建议该试剂盒同时包含内标(internal)物IPC。包括检测剂在内的试剂可被分别包装于独立的容器中。试剂盒也可包含底物，其包括对特定样本进行检测的反应管。试剂盒还可包含用于进行包括PCR在内的扩增反应以及样本预处理的附加试剂，包括释放和/或提纯冠状病毒所必需的那些试剂。
如需对同一样本进行两种或两种以上的不同检测，大多数时候是在同一容器中并且在大约同一时间进行，则可采用多重检测模式。此种模式在本领域已知。多重检测通常用于同时测定对被分析样本中一种以上分子的存在或其浓度，或者备选地用于同时测定单一分子的多种特性。
附图简述

图1显示分离自不同种类的冠状病毒S基因的DNA序列比较。
图2显示S基因的系统发生分析。
图3显示针对SARS相关S基因的分子设计。
图4列出针对S基因的分子设计。
图5显示分离自不同种类的的冠状病毒E基因的DNA序列比较。
图6显示E基因的系统发生分析。
图7显示针对SARS相关E基因的分子设计。
图8显示针对SARS相关E基因的分子设计。
图9显示分离自不同种类的的冠状病毒M基因的DNA序列比较。
图10显示M基因的系统发生分析。
图11显示针对SARS相关M基因的分子设计。
图12列出针对M基因的分子设计。
图13显示分离自不同种类的冠状病毒N基因的DNA序列比较。
图14显示N基因的系统发生分析。
图15显示针对SARS相关N基因的分子设计。
图16列出针对N基因的分子设计。
图17显示内标阳性对照(IPC)的分子设计。
图18列出IPC的分子设计。
图19显示分子信标的解链曲线。
图20显示Uniplex的实时PCR扩增(连续稀释-动态范围)。
发明详述本检测法的主要步骤涉及以下几步操作第1步在从样本中分离RNA之前，将可通过引物组之一进行逆转录及扩增的RNA标准物加入到每个标本中。然后从每个临床样本中(从怀疑感染SARS-CoV的患者中所取得的鼻咽吸入物、粪便标本或全血)提取RNA。之后按照生产商的说明书，用QIAamp病毒RNA试剂盒(Qiagen公司，Valencia，CA)进行RNA提纯。
第2步从各个临床样本分离所得的RNA通过4种标靶特异性引物(S基因，S-RT5′-AGGCTGTAAGAA-3′；E-基因，E-RT5′-TATTGCAGCAGTAC-3′；M基因，M-RT5′-AAGCAACGAAGTAG-3′；N基因，N-RT5′-GCCTTCTTTGTTAG-3′；内标阳性对照，E-RT5′-TATTGCAGCAGTAC-3′)进行逆转录。来自患者样本的SARS-CoV病毒RNA进行逆转录时需将20μL病毒RNA加入0.125μM(各)基因特异性引物的混合物中，在80℃下孵育5分钟以使二级结构变性。之后立即将试管置于冰上至少2分钟。逆转录反应体系包括PCR缓冲液II(应用生物系统公司)、3mM MgCl2、0.5mM(每种)dNTP、10mM二硫苏糖醇、20单位核糖核酸酶抑制剂(罗氏分子生物化学公司，印第安纳波利斯，印第安纳州)和80单位SuperScript II核糖核酸酶H-逆转录酶(GibcoBRL)，调整最终容积至40μL。之后反应体系在42℃下孵育50分钟，再于70℃下钝化15分钟。
第3步在同一反应中使用4个引物对和5个分子信标进行SARS-CoV cDNA实时PCR扩增，每个引物对针对一个病毒基因(内标阳性对照可通过为其中一个病毒基因标靶扩增设计的引物对进行扩增)。每个PCR反应体系均由终容积为50μL的20μL cDNA产物、1×PCR缓冲液II(应用生物系统公司)、3.5mM MgCl2、0.5mM(每种)dNTP、0.4μM各自引物和2.5单位AmpliTaq Gold DNA聚合酶(应用生物系统公司)组成。于7700Prism荧光分光光度计热循环仪(应用生物系统公司)中扩增50个循环。为进行定量检测，在对样本进行特定实验流程的同时，将RNA标准物进行6倍连续稀释作为定量对照(106到10拷贝)。将实验测得的被测样本循环阈值插入用RNA标准物对照测得的标准回归曲线中，可计算出各临床样本的病毒RNA拷贝数(临床样本中基因组拷贝数的对数与测得之循环阈值成反比)。
本发明如何解决以往技术所存在问题的说明。
以往技术的主要问题是其未能考虑到冠状病毒所固有的多变特性，同时也不能解释非非-遗传相同SARS-CoV株连续和/或多次感染人群的可能性。本发明通过采用多重遗传序列作为标靶(S、E、M和N基因)而解决了上述问题。采用4种不同遗传标靶来鉴定SARS-CoV的主要原理是避免病毒的基本遗传漂变。因此，通过采用4种分别特异于不同扩增的SARS-CoV标靶且被同色荧光团标记的分子信标，令因连续进化性改变所致不能测出SARS-CoV的可能性降至最低。此外，检测设计包含了一种内标阳性对照RNA，其逆转录及PCR扩增会产生一种不同颜色的荧光信号，从而确保在RNA分离、逆转录或标靶扩增过程中出现意外问题时，该对照信号的缺失可提示存在问题。
其它SARS核酸检测法的特征及其与本发明差异描述之概述。
如前所述，目前有5种SARS核酸检测法Perris等[2]发表的一种RT-PCR法，Ksiazek等[1]发表的一种RT-实时-PCR法，Drosten等[4]发表的一种类似的RT-实时-PCR法，Poon等[7]发表的另一种RT-实时-PCR法，以及Lipkin和Briese在PCR基础上开发的一种SARS诊断检测法-未见描述此法的发表文献。所有已发表的检测法均使用提取自临床样本的RNA。另外，所有已发表的检测法均采用随机引物进行SARS-CoVRNA逆转录，且所有已发表的检测法均采用以往为开放读码框架Ib(ORFIb)保守区的扩增而设计的引物来扩增cDNA，以期获得与冠状病毒属的广泛反应性。本发明在许多方面不同于上述发明。本检测法采用了4种不同的标靶而非1种，且包含一种能通过针对病毒基因设计的引物(它具有一种能被一独特分子信标检出的独特标靶识别序列)进行逆转录和扩增的内标阳性RNA对照(人造RNA分子)。此RNA分子在RNA分离、逆转录和PCR扩增中被用作对照。本发明采用实时PCR进行核酸扩增，采用分子信标进行实时检测。本发明采用双色检测方案，黄色信号(四氯荧光素)用于所有4种SARS-CoV标靶，绿色信号(荧光素)表明内标阳性对照已被分离、逆转录及PCR扩增。
本发明所具备的另一重要特征为以往发表之检测法所从未涉及，即包含3′端嵌入的基因特异性逆转录序列的4种病毒RNA标靶的构建。总体而言，这些分子被用作具有SARS特异性的阳性对照。本发明的所有设计都是热力学兼容的，从而在5-扩增子多重检测中协同作用。
多重聚合酶链式反应(mPCR)亦有涉及。这是一种同时进行两种以上不同序列PCR的方法。mPCR反应体系包括处理上述提取所得DNA以形成单链互补链，加入标记的寡核苷酸多重引物对，每对引物针对一种不同的短串联重复序列，每对引物中的一个主要与正义链中的部分序列互补，而另一个则与互补反义链中相同序列的不同部分互补，将多个配对的引物对与其互补序列退火，同时自每个引物的3′端开始延伸上述已退火的多个引物以合成与各引物退火序列互补的延伸产物，将上述延伸产物从互补链上分离后作为合成各自引物对中另一引物延伸产物的模板，将上述延伸产物从上述模板分离产生单链分子，通过重复上述退火、延伸和分离步骤至少一次来扩增上述单链分子。
不太严格的实验条件被常规用于容纳在其核酸序列中含有变化的多个标靶序列的捕获。实验条件的严格性的降低可以通过调整杂交温度和冲洗来实现或通过对缓冲液的改变来实现。当实验条件的严格性被降低并且标靶核酸序列又与另一属的核酸序列非常相似时，捕获探针对标靶属的特异性将丧失。
当采用多重捕获探针且选择与标靶核酸序列的变异兼容时，高严格实验条件下的特异性将得到恢复。多重探针的混合允许对一组标靶有机物存在的单一阳性反应。
在多重检测中，同时要检查许有关的条件。多重检测依赖于在检测中或检测完成后分辨出样本的组分或得到与之相关的数据的能力。
实施例实施例1-SARS-CoV特异的分子信标，及逆转录和PCR所需引物的设计目的设计本SARS检测法所需之分子信标和寡核苷酸的总体基本原理是构建热力学相容的耐错配分子以在5扩增子多重检测中使用。
设计分子信标的设计要使其能在PCR退火温度下与其标靶进行杂交，而未结合的分子信标仍保持封闭构像。这些基本的方面的实现是通过使用冠状病毒基因特异性多重比较和热力学因素考虑来选择标靶序列、PCR引物的同一性和长度、探针序列(标靶识别序列)的同一性和长度，及臂序列的长度。
材料为了从理论上计算PCR引物和探针-标靶杂交的解链温度，采用互联网上提供的Oligo Toolkit。用互联网上提供的Michael Zuker开发的DNA折叠程序计算分子信标的解链温度并预测其二级结构。
结果PCR引物的理论解链温度为60℃左右；逆转录引物的Tm为47℃；探针-标靶杂交的Tm为63℃左右；分子信标的干杂交Tm为70℃左右。
结论具有热力学相容的耐错配分子信标是为在最终5扩增子多重SARS-CoV检测中使用而设计的。
见下图针对SARS-CoV检测中S基因标靶的分子设计详见图1-4；针对E基因标靶的分子设计见图5-8；针对M基因标靶的分子设计见图9-12；针对N基因标靶的分子设计见图13-16；针对内标阳性对照(IPC)的分子设计见图17和18。
实施例2-分子信标和分子信标-标靶复合物的实验特性目的此组实验的总原理是在进行实时PCR实验之前评价所构建分子信标的热力学性质。
设计对于每个分子信标，我们已用ABI Prism 7700荧光分光光度计热循环仪测定了两条解链曲线--其一为单纯分子信标的曲线，另一为信标-标靶复合物的曲线。
材料对于每个分子信标，其解链曲线可通过以下步骤得出制备两管50μL的溶于3.5mM MgCl2和10mM Tris-HCl的200nM分子信标，pH 8.0，向其中一管加入一种互补寡核苷酸标靶使其最终浓度为400nM。
用可监测荧光的热循环仪，将每种溶液的荧光确定为温度的函数。温度从80℃随时间线性降至10℃，每次降低1℃；每个温度阶持续时间1分钟，测定每个温度阶期间的荧光强度。
结果PCR引物的理论解链温度为60℃±2℃；逆转录引物的理论Tm为47℃±2℃；探针标靶杂交的理论Tm为63℃±3℃左右；分子信标干杂交的理论Tm为70℃±2℃。
结论所设计的耐错配分子信标已被确定为能正确识别其DNA标靶且是热力学相容的，从而在5扩增子多重SARS-CoV检测中协同作用。
图分子信标的解链曲线和分子信标-标靶杂交解链曲线见图19。
实施例3-采用SYBR Green检测扩增子的Uniplex SARS-CoV病毒及IPC PCR扩增目的此组实验的总原理是评价PCR引物和PCR条件。
设计针对每种SARS-CoV基因特异性扩增和IPC扩增，采用合成的标靶DNA。用荧光分光光度计热循环仪(Cepheid)进行PCR反应。
材料PCR方案如下所示对S基因(A)基于SYBR Green的SARS相关CoV的S基因扩增子(LK250)的检测混合物每反应体系dH2O 15μL10X PCR缓冲液(10X) 2.5μLMgCl2(25mM)4.0μLPlat Taq DNA Pol(5 0.3μLUμL-1)dNTP(25mM) 0.3μLLK251(10pmole/μL) 0.5μLLK252(10pmole/μL) 0.5μLSybr Green DNA(25X) 1.0μL标靶DNA 1.0μL
总计 25.0μLSmart循环仪(Cepheid)DNA变性及酶活化
一级扩增
(B)基于分子信标的SARS相关冠状病毒的S基因扩增子(LK250)的检测混合物每反应体系dH2O 15.75μL10X PCR缓冲液(10X) 2.5μLMgCl2(25mM)4.0μLPlat Taq DNA Pol(5 0.3μLUμL-1)dNTP(25mM) 0.3μLLK251(10pmole/μL) 0.5μL
LK252(10pmole/μL)0.5μLLK249信标(10 0.25μLpmole/μL)标靶DNA 1.0μL总计 25.0μLSmart循环仪(Cepheid)DNA变性及酶活化
一级扩增
(C)基于SYBR Green的S基因扩增子(T7-及RT-扩增子)的检测混合物每反应体系dH2O 15μL10X PCR缓冲液(10X) 2.5μLMgCl2(25mM)4.0μLPlat Taq DNA Pol(5 0.3μLUμL-1)
dNTP(25mM)0.3μLLK251-T7(10 0.5μLpmole/μL)LK252-RT(10 0.5μLpmole/μL)Sybr Green DNA(25X) 1.0μL标靶DNA 1.0μL总计 25.0μLSmart循环仪(Cepheid)DNA变性及酶活化
一级扩增
对E基因(A)基于SYBR Green的SARS相关冠状病毒的E基因扩增子(LK254)的检测混合物每反应体系
dH2O 15μL10X PCR缓冲液(10X) 2.5μLMgCl2(25mM)4.0μLPlat Taq DNA Pol(5 0.3μLUμL-1)dNTP(25mM) 0.3μLLK255(10pmole/μL) 0.5μLLK256(10pmole/μL) 0.5μLSybr Green DNA(25X) 1.0μL标靶DNA 1.0μL总计25.0μLSmart循环仪(Cepheid)DNA变性及酶活化
一级扩增
(B)基于分子信标的SARS相关冠状病毒E基因扩增子(LK254)的检测混合物每反应体系dH2O 15.75μL10X PCR缓冲液(10X) 2.5μLMgCl2(25mM)4.0μLPlat Taq DNA Pol(5 0.3μLUμL-1)dNTP(25mM) 0.3μLLK255(10pmole/μL) 0.5μLLK256(10pmole/μL) 0.5μLLK253信标(100.25μLpmole/μL)标靶DNA 1.0μL总计25.0μLSmart循环仪(Cepheid)DNA变性及酶活化
一级扩增
基于SYBR Green的E基因扩增子(T7-及RT-扩增子)的检测混合物每反应体系dH2O 15μL10X PCR缓冲液(10X) 2.5μLMgCl2(25mM)4.0μLPlat Yaq DNA Pol(5 0.3μLUμL-1)dNTP(25mM) 0.3μLLK255-T7(10 0.5μLpmole/μL)LK256-RT(10 0.5μLpmole/μL)Sybr Green DNA(25X) 1.0μL标靶DNA 1.0μL总计25.0μLSmart循环仪(Cepheid)DNA变性及酶活化
一级扩增
针对M基因
(A)基于SYBR Green的SARS相关冠状病毒M基因扩增子(LK258)的检测混合物每反应体系dH2O 15μL10X PCR缓冲液(10X) 2.5μLMgCl2(25mM) 4.0μLPlat Taq DNA Pol(5 0.3μLUμL-1)dNTP(25mM) 0.3μLLK259(10pmole/μL) 0.5μLLK260(10pmole/μL) 0.5μLSybr Green DNA(25X) 1.0μL标靶DNA 1.0μL总计25.0μLSmart循环仪(Cepheid)DNA变性及酶活化
一级扩增
(B)基于分子信标的SARS相关冠状病毒M基因扩增子(LK258)的检测混合物每反应体系dH2O 15.75μL10X PCR缓冲液(10X) 2.5μLMgCl2(25mM)4.0μLPlat Taq DNA Pol(5 0.3μLUμL-1)dNTP(25mM) 0.3μLLK259(10pmole/μL) 0.5μLLK260(10pmole/μL) 0.5μLLK257信标(100.25μLpmole/μL)标靶DNA 1.0μL总计25.0μLSmart循环仪(Cepheid)DNA变性及酶活化
一级扩增
(C)基于SYBR Green的M基因扩增子(T7-及RT-扩增子)的检测混合物每反应体系dH2O 15μL10X PCR缓冲液(10X) 2.5μLMgCl2(25mM)4.0μLPlat Taq DNA Pol(5 0.3μLUμL-1)dNTP(25mM) 0.3μLLK259-T7(10 0.5μLpmole/μL)LK260-RT(10 0.5μLpmole/μL)Sybr Green DNA(25X) 1.0μL标靶DNA 1.0μL总计25.0μLSmart循环仪(Cepheid)DNA变性及酶活化
一级扩增
对N基因(A)基于SYBR Green的SARS相关冠状病毒N基因扩增子(LK262)的检测混合物每反应体系dH2O 15μL10X PCR缓冲液(10X) 2.5μLMgCl2(25mM)4.0μLPlat Taq DNA Pol(5 0.3μLUμL-1)dNTP(25mM) 0.3μLLK263(10pmole/μL) 0.5μLLK264(10pmole/μL) 0.5μLSybr Green DNA(25X) 1.0μL标靶DNA 1.0μL总计25.0μLSmart循环仪(Cepheid)DNA变性及酶活化
一级扩增
(B)基于分子信标的SARS相关冠状病毒N基因扩增子(LK262)的检测混合物每反应体系dH2O 15.75μL10X PCR缓冲液(10X) 2.5μLMgCl2(25mM)4.0μLPlat Taq DNA Pol(5 0.3μLUμL-1)dNTP(25mM) 0.3μLLK263(10pmole/μL) 0.5μLLK264(10pmole/μL) 0.5μLLK261信标(100.25μLpmole/μL)标靶DNA 1.0μL总计25.0μLSmart循环仪(Cepheid)
DNA变性及酶活化
一级扩增
(C)基于SYBR Green的N基因扩增子(T7-及RT-扩增子)的检测混合物每反应体系dH2O 15μL10X PCR缓冲液(10X) 2.5μLMgCl2(25mM)4.0μLPlat Taq DNA Pol(5 0.3μLUμL-1)dNTP(25mM) 0.3μLLK263-T7(10 0.5μLpmole/μL)LK264-RT(10 0.5μLpmole/μL)Sybr Green DNA(25X) 1.0μL标靶DNA 1.0μL总计25.0μL
Smart循环仪(Cepheid)DNA变性及酶活化
一级扩增
对内标阳性对照(IPC)(A)基于SYBR Green的内标阳性对照(LK266)的检测混合物每反应体系dH2O 15μL10X PCR缓冲液(10X) 2.5μLMgCl2(25mM)4.0μLPlat Taq DNA Pol(5 0.3μLUμL-1)dNTP(25mM) 0.3μLLK251(10pmole/μL) 0.5μLLK256(10pmole/μL) 0.5μLSybr Green DNA(25X) 1.0μL标靶DNA 1.0μL
总计25.0μLSmart循环仪(Cepheid)DNA变性及酶活化
一级扩增
(B)基于分子信标的内标阳性对照(LK266)的检测混合物每反应体系dH2O 15.75μL10X PCR缓冲液(10X) 2.5μLMgCl2(25mM)4.0μLPlat Taq DNA Pol(5 0.3μLUμL-1)dNTP(25mM) 0.3μLLK251(10pmole/μL) 0.5μLLK256(10pmole/μL) 0.5μLLK265信标(100.25μLpmole/μL)标靶DNA 1.0μL总计25.0μLSmart循环仪(Cepheid)DNA变性及酶活化
一级扩增
(C)基于SYBR Green的内标阳性对照(T7-及RT-扩增子)的检测混合物每反应体系dH2O 15μL10X PCR缓冲液(10X) 2.5μLMgCl2(25mM 4.0μLPlat Taq DNA Pol(5 0.3μLUμL-1)dNTP(25mM) 0.3μLLK251-T7(10 0.5μLpmole/μL)LK256-RT(10 0.5μLpmole/μL)Sybr Green DNA(25X) 1.0μL标靶DNA 1.0μL总计25.0μLSmart循环仪(Cepheid)DNA变性及酶活化
一级扩增
结果实时PCR扩增曲线与标靶DNA的出现或缺失相一致，PCR反应中合成的扩增子具有正确的长度。
结论合成的引物在统一的PCR条件下工作良好。
实施例4-采用基因特异性分子信标的Uniplex SARS-CoV病毒及IPC PCR扩增目的此组实验的总原理是在PCR引物测试中建立的统一PCR条件下对分子信标进行评价。
设计针对每种SARS-CoV基因特异性和IPC扩增采用合成的标靶DNA和分子信标。用荧光分光光度计热循环仪(Cepheid)进行PCR反应。在每项检测中对所用标靶进行稀释以确定基于分子信标实时PCR检测的线性关系及动态范围。
材料针对S基因、E基因、M基因、N基因及内标阳性对照(IPC)的PCR方案如例3中所示。
结果实时PCR扩增曲线与标靶DNA的出现或缺失相一致。
结论SARS-CoV特异的及IPC特异的分子信标在统一的PCR条件下工作良好。见图20(证据(Exibit)25)。
实施例5-采用噬菌体T7RNA聚合酶与逆转录酶标靶PCR引物的Uniplex SARS-CoV病毒及IPC PCR扩增目的此组实验的总原理是针对5种扩增子(SARS-CoV的S、E、M、N基因及IPC)分别制备在5′端包含噬菌体T7启动区标靶识别序列并在3′端包含基因特异性逆转录酶引物结合位点的dsDNA分子。合成的扩增子被用于体外RNA生成。合成的RNA分子在其3’端具有特异的逆转录酶引物结合位点。
设计针对每种SARS-CoV基因特异性和IPC扩增采用合成的标靶DNA和噬菌体T7-RT-PCR引物。用荧光分光光度计热循环仪(Cepheid)进行PCR反应，用SYBR Green来检测扩增子。
材料PCR方案如实施例3中所示。
结果实时PCR扩增曲线与标靶DNA的出现或缺失相一致，PCR反应中合成的扩增子具有正确的长度。
结论生成的SARS-CoV特异性噬菌体T7-RT扩增子被用作体外RNA转录的模板，以产生将被用来鉴定PCR检测的标靶RNA。见图20。
实施例6-SARS-CoV及IPC特异性RNA分子的体外RNA转录目的此组实验的总原理是制备在其3′端包含特异性逆转录引物结合位点的RNA分子。
设计针对每种SARS-CoV基因特异性和IPC扩增，采用T7-RT-PCRdsDNA扩增子(得自实验5)。
材料相应于4种SARS-CoV特异性及IPC等位基因的RNA转录产物，是用MEGAscript T7试剂盒(Ambion，Houston，TX)对包含T7RNA聚合酶启动子位点的PCR产物进行体外转录制备而成的。
结果基于产物链的8％聚丙烯酰胺凝胶电泳分析，RNA分子具有正确的长度。
结论SARS-CoV特异性T7-RT扩增子被制备用于体外RNA转录。
例7-Uniplex SARS-CoV特异的及IPC特异的RNA逆转录及基于分子信标的实时PCR目的此组实验的总原理是测试在其3′端包含特异性逆转录引物结合位点的RNA分子是否能被逆转录，以及所得cDNA是否能被扩增并被实时PCR进行检测。
设计针对每种SARS-CoV基因特异的和IPC扩增采用T7-RT-PCRdsDNA扩增子(得自实验5)。
材料病毒和IPC RNA的逆转录通过以下步骤完成向0.125μM的SARS-CoV特异的及IPC特异的引物中加入20μL SARS-CoV特异的及IPC特异的RNA并在80℃下孵育5分钟。PCR管随之立即置于冰上至少2分钟。终体积为40μL的逆转录反应体系包括PCR缓冲液II(应用生物系统公司)、3mM MgCl2、每种dNTP各0.5mM(GibcoBRL)、10mM二硫苏糖醇、20单位核糖核酸酶抑制剂(罗氏分子生物化学公司，印第安纳波利斯，印第安纳州)和80单位SuperScript II核糖核酸酶H-逆转录酶(GibcoBRL)。之后反应体系在42℃下孵育50分钟，再于70℃下钝化15分钟。cDNA实时PCR采用10μL cDNA、1xPCR缓冲液、3.5mM MgCl2、每种dNTP各0.5mM、每种分子信标各0.4μM、2.5单位AmpliTaq Gold DNA聚合酶，其终体积为50μL。于7700Prism荧光分光光度计热循环仪(应用生物系统公司)中扩增35个循环(94℃下15秒钟，53℃下30秒钟，72℃下30秒钟)。
结果SARS-CoV特异的及IPC特异的RNA分子可被逆转录，所得cDNA可被扩增并可在实时PCR检测中被SARS-CoV特异的及IPC特异的分子信标检出。
结论SARS-CoV特异性RNA分子可在最终检测中被用作对照。
例8-多重SARS-CoV特异的及IPC特异的RNA逆转录与基于分子信标的实时PCR目的此组实验的总原理是在多重RT-PCR反应中进行单SARS-CoV特异的及IPC特异的RT-PCR反应的多重检测。
设计所有5种RT-PCR反应体系被整合到一个反应体系中。
材料除了所有5种RT引物、4组PCR引物及5种分子信标在单一RT-PCR反应中使用外，其余均与实验7相同。
结果SARS-CoV特异的及IPC特异的RNA分子可被逆转录并生成cDNA，随后可被扩增并在实时PCR检测中被SARS-CoV特异的及IPC特异的分子信标检出。
结论SARS-CoV特异性RNA分子可在多重检测中用作对照。
实施例9-用临床样本评价完整的SARS-CoV检测法目的此组实验的总原理是用实际样本(从培养物中分离得到的SARS-CoV、从唾液、全血和粪便标本中分离得到的患者原代分离株)来评价该SARS-CoV检测法。
设计同实验8。
材料同实验8。
结果该SARS-CoV检测法可检出SARS-CoV并区分SARS-CoV与其它非致病性冠状病毒。
结论该SARS-CoV检测法可检出提取自培养的SARS株和原代分离株的SARS RNA。
实施例10-临床评价64份样本采自根据CDC、WHO和Health Canada的案例定义被临床诊断患有SARS的23名患者。
样本类型包括支气管灌洗液与痰(生前样本)以及肺、肝脏、小肠、大肠及脾脏组织(死后标本)。
采自15例患者的65份样本作为对照。26份为骨髓标本，将其进行常规病原体筛查。39份为采自疾病爆发期间因其它原因死亡的10名患者的死后器官样本，所述的其它原因包括充血性心力衰竭、脑血管意外、动脉粥样硬化性心脏病、慢性阻塞性肺病、侵袭性A型链球菌感染、胺碘酮肺中毒(amiodorone pulmonary toxicity)及肺纤维化。
所有标本均采用本发明的检测法进行盲法检测(采用所有4种基因S、E、M、N)，特异性为100％。
1.Ksiazek，T.G.，et al.，A novel coronavirus associated with severeacute respiratory syndrome.N Engl J Med，2003.348(20)p.1953-66.
2.Peiris，J.S.，et al.，Coronavirus as a possible cause of severe acuterespiratory syndrome.Lancet，2003.361(9366)p.1319-25.
3.Munch，R.，Robert Koch.Microbes Infect，2003.5(1)p.69-74.
4.Drosten，C.，et al.，Identification of a novel coronavirus in patientswith severe acute respiratory syndrome.N Engl J Med，2003.348(20)p.1967-76.
5.Marra，M.A.，etal.，TheGenome sequence of the SARS-associatedcoronavirus.Science，2003.300(5624)p.1399-404.
6.Rota，P.A.，etal.，Characterization of a novel coronavirus associatedwith severe acute respiratory syndrome.Science，2003.300(5624)p.1394-9.
7.Poon，L.L.，etal.，Rapid diagnosis of a coronavirus associated withsevere acute respiratory syndrome(SARS).Clin Chem，2003.49(6Pt1)p.953-5.
8.Organization，W.H.，http://www.who.int/csr/sars/primers/en/.
9.Pensaert，M.，P.CaLLebaut，and J.Vergote，Isolation of a porcinerespiratory，non-enteric coronavirus related to transmissiblegastroenteritis.Vet Q，1986.8(3)p.257-61.
10.Ruan，Y.J.，etal.，Comparative full-length genome sequenceanalysis of 14SARS coronavirus isolates and common mutationsassociated with putative origins of infection.Lancet，2003.361(9371)p.1779-85.
上述各个文献的内容以及本说明书中引用的文献在此全部加入以供参考。
序列表序列表<110>博驰生物医疗研究有限公司<120>SARS相关冠状病毒的多等位分子检测<130>42392-203686<140>
<141>
<150>60/496,995<151>2003-08-22<160>94<170>PatentIn Ver.3.2<210>1<211>4356<212>DNA<213>犬科冠状病毒<400>1atgattgtgc ttacattgtg ccttttcttg tttttgtaca gtagtgtgag ctgtacatca 60aacaatgact gtgtacaagt taatgtgaca caactgcctg gcaatgaaaa tattatcaaa 120gattttctat ttcagaactt taaagaagaa ggaagtttag ttgttggtgg ttattacccc 180acagaggtgt ggtataactg ttccacaact caacaaacta ccgcttataa gtattttagt 240aatatacatg cattttattt tgatatggaa gccatggaga atagtactgg caatgcacgt 300ggtaaacctt tactagtaca tgttcatggt aatcctgtta gtatcattgt ttacatatca 360gcttatagag atgatgtgca atttaggccg cttttaaagc atggtttatt gtgtataact 420aaaaatgaca ccgttgacta taatagcttt acaattaacc aatggcgaga catatgtttg 480ggtgacgaca gaaaaatacc attctctgta gtacccacag ataatggtac gaaattattt 540ggtcttgagt ggaatgatga ctatgttaca gcctatatta gtgatgagtc tcaccgtttg 600aatatcaata ataattggtt taacaatgtt acactcctat actcacgtac aagcaccgcc 660acgtggcaac acagtgctgc atatgtttat caaggtgttt caaattttac ttattacaag 720ttaaataaaa ccgctggctt aaaaagctat gaattgtgtg aagattatga atactgcact 780ggctatgcaa ccaatgtgtt tgctccgaca tcaggtggtt atatacctga tggattcagt 840tttaacaatt ggtttatgct tacaaacagc tccacttttg ttagtggcag atttgtaaca 900aatcaaccgc tgctagttaa ttgcttgtgg ccagtgccca gttttggcgt cgcagcacaa 960gaattttgtt ttgaaggtgc tcagtttagc caatgtaacg gtgtttcttt aaataataca 1020gtagatgtta ttagatttaa ccttaatttc actacagatg tacaatctgg catgggtgct 1080acagtatttt cactgaatac aacaggcggt gtcattcttg agatttcttg ttataatgac 1140acagtgagtg agtcgagttt ctacagttat ggtgaaattc cattcggcgt aactgatgga 1200ccacgttact gttatgtact ctacaatggc acagctctta agtatttagg aacattacca 1260cctagtgtca aggaaattgc tattagtaag tggggacatt tttatattaa tggttacaat 1320ttctttagca cgtttcctat tgattgtata gcttttaatt taaccactgg tgctagtgga 1380gcattttgga caattgctta tacgtcgtac acagaagcat tagtacaagt tgaaaacaca 1440gctattaaaa aggtgacgta ttgtaacagt cacattaata acatcaaatg ttctcaactt 1500actgctaatt tgcaaaatgg tttttaccct gttgcttcaa gtgaagttgg tcttgtcaat 1560aagagtgttg tgttactacc tagtttctat tcacatacca gtgttaatat aactattgat 1620cttggtatga agcgtagtgt tacggtcacc atagcctcac cattaagtaa catcacacta 1680ccaatgcagg ataataacat agacgtgtac tgtattcgtt ctaaccaatt ctcagtttat 1740gttcattcca cttgcaaaag ttctttatgg gataacaatt ttaattcagc atgtaccgac 1800gttttagacg ccacagctgt tataaaaact ggtacttgtc ctttctcatt tgataaattg 1860aataattact taacttttaa caagttctgt ttgtcgttga atcccgttgg tgccaactgt 1920aagttagatg ttgccgcccg tacaagaacc aatgagcagg tttttggaag tttatatgta 1980
atatatgaag aaggagacaa catagtgggt gtaccgtctg ataatagtgg tttgcacgat 2040ttgtcagtgt tgcacttaga ctcttgtaca gattacaata tatatggtag aactggtgtt 2100ggtattatta gaaaaactaa cagcacacta cttagtggct tatattacac atcactatca 2160ggtgatttgt taggttttaa aaatgttagt gatggtgttg tctactctgt aacgccatgt 2220gatgtaagtg cacaagctgc tgttattgat ggtgccatag ttggagctat gacttccatt 2280aatagtgaac tgttaggtct aactcattgg acaacaacac ctaattttta ttactactcc 2340atatataatt atacaaatgt gatgaatcgt ggcacggcaa ttgataatga tattgattgt 2400gaacctatca taacatattc taatataggt gtttgtaaaa atggagcttt ggtttttatt 2460aacgtcacac attctgatgg agacgttcaa ccaattagca ccggtaatgt cacgataccc 2520acaaatttta ctatatctgt gcaagtcgaa tatattcagg tttacactac accagtttca 2580atagactgtg caagatacgt ttgcaatggt aacccaagat gcaataagtt attaacacaa 2640tacgtttctg catgtcaaac tattgagcaa gcgcttgcaa tgggtgccag acttgaaaac 2700atggagattg attccatgtt atttgtttcg gaaaatgccc ttaaattggc atctgttgaa 2760gcattcaata gtacggaaaa tttagaccct atttataaag aatggcctaa cattggtggt 2820tcttggctag gaggtttaaa agatatattg ccatctcata atagcaaacg taagtaccgc 2880tcggctatag aagacttgct ttttgataag gttgtaacat ctggcttagg tacagttgac 2940gaagattaca aacgttctgc aggtggttat gacatagctg acttagtgtg tgcacgatat 3000tacaatggca tcatggtgct acctggtgta gctaatgatg acaagatgac tatgtacact 3060gcatctctta caggtggtat aacattaggt gcacttagtg gtggcgcagt ggctatacct 3120tttgcagtag cagttcaggc tagacttaat tatgttgctc tacaaactga tgtattgaac 3180aaaaaccaac aaatcttggc taatgctttc aatcaagcta ttggtaacat tacacaggca 3240tttggtaagg ttaatgacgc tatacatcaa acatcaaaag gtcttgctac tgttgctaaa 3300gcattggcaa aggtgcaaga tgttgttaac acgcaaggtc aagctttaag ccacctaaca 3360gtacaattgc aaaacaattt tcaagccatt agcagttcta ttagtgacat ttataacagg 3420cttgatgaat tgagtgctga tgcacaagtt gacaggctga ttacaggacg acttacagca 3480cttaatgcat ttgtgtctca gactttaacc agacaagcag aggttagggc tagtagacaa 3540cttgctaaag acaaggttaa tgaatgcgtt aggtctcaat cccagagatt tggattctgt 3600ggtaatggta cacatttgtt ttcacttgca aatgcggcac caaatggcat gattttcttt 3660cacacagtgc tattaccaac agcttatgaa actgtgacgg cctggtcagg tatttgtgcg 3720tcagatggca gtcgcacttt tggacttgtt gttgaggatg tccagctgac gctatttcgc 3780aatttagatg aaaaatttta tttgacgccc agaactatgt atcagcccag agttgcaact 3840agttctgatt ttgttcaaat agaaggctgt gatgtgttgt ttgttaatgg aactgtaatt 3900gaattgccta gtatcatacc tgactatatc gatattaatc aaactgttca ggacatatta 3960gaaaatttca gaccaaattg gactgtaccc gagttgccac ttgacatttt tcatgcaacc 4020tacttaaacc tgactggtga aattaatgac ttagaattta ggtcagaaaa gttacataac 4080accacagtag aacttgctat tctcattgat aatattaata acacattagt caatcttgaa 4140tggctcaaca gaattgaaac ttatgtaaaa tggccttggt atgtttggct actaattgga 4200ttagtagtaa tattctgcat acccatattg ctattttgtt gttgtagtac tggttgttgt 4260ggatgtatcg ggtgtttagg aagctgttgt cattccatat gtagtagagg ccaatttgaa 4320agttatgaac ctattgaaaa agttcatgtt cactga 4356<210>2<211>4359<212>DNA<213>猫科冠状病毒<400>2atgattgtgc tcgtaacttg cctcttgttg ttatgttcat accacacagt tttgagtaca 60acaaataatg aatgcataca agttaacgta acacaattgg ctggcaatga aaaccttatc 120agagattttc tgtttagtaa ctttaaagaa gaaggaagtg tagttgttgg tggttattac 180cctacagagg tgtggtacaa ctgctctaga acagctcgaa ctactgcctt tcagtatttt 240aataatatac atgcctttta ttttgttatg gaagccatgg aaaatagcac tggtaatgca 300cgtggtaaac cattattatt tcatgtgcat ggtgagcctg ttagtgttat tatatcggct 360tatagggatg atgtgcaaca aaggcccctt ttaaaacatg ggttagtgtg cataactaaa 420aatcgccata ttaactatga acaattcacc tccaaccagt ggaattccac atgtacgggt 480gctgacagaa aaattccttt ctctgtcata cccacggaca atggaacaaa aatctatggt 540cttgagtgga atgatgactt tgttacagct tatattagtg gtcgttctta tcacttgaac 600
atcaatacta attggtttaa caatgtcaca cttttgtatt cacgctcaag cactgctacc 660tgggaataca gtgctgcata tgcttaccaa ggtgtttcta acttcactta ttacaagtta 720aataacacca atggtctaaa aacctatgaa ttatgtgaag attatgaaca ttgcactggc 780tatgctacca atgtatttgc tccgacatca ggtggttaca tacctgatgg atttagtttt 840aacaattggt tcttgcttac aaatagttcc acttttgtta gtggcaggtt tgtaacaaat 900caaccattat tgattaattg cttgtggcca gtgcccagtt ttggtgtagc agcacaagaa 960ttttgttttg aaggtgcaca gtttagccaa tgtaatggtg tgtctttaaa taacacagtg 1020gatgttatta gattcaacct taatttcact gcagatgtac aatctggtat gggtgctaca 1080gtattttcac tgaatacaac aggtggtgtc attcttgaaa tttcatgtta tagtgacaca 1140gtgagtgagt ctagttctta cagttatggt gaaatcccgt tcggcataac tgacggacca 1200cgatactgtt atgtacttta caatggcaca gctcttaaat atttaggaac attaccaccc 1260agtgtaaagg aaattgctat tagtaagtgg ggccattttt atattaatgg ttacaatttc 1320tttagcacat ttcctattgg ttgtatatct tttaatttaa ccactggtgt tagtggagct 1380ttttggacaa ttgcttacac atcgtatact gaagcattag tacaagttga aaacacagct 1440attaaaaatg tgacgtattg taacagtcac attaataaca ttaaatgttc tcaacttact 1500gctaatttga ataatggatt ttatcctgtt gcttcaagtg aagtaggttt cgttaataag 1560agtgttgtgt tattacctag ctttttcaca tacaccgctg tcaatataac cattgatctt 1620ggtatgaagc ttagtggtta tggtcaaccc atagcctcga cactaagtaa catcacacta 1680ccaatgcagg ataacaatac tgatgtgtac tgtattcgtt ctaaccaatt ctcagtttat 1740gttcattcca cttgcaaaag ttctttatgg gacaatattt ttaatcaaga ctgcacggat 1800gttttagagg ctacagctgt tataaaaact ggtacttgtc ctttctcatt tgataaattg 1860aacaattact tgacttttaa caagttctgt ttgtcgttga gtcctgttgg tgctaattgc 1920aagtttgatg ttgctgcacg tacaagaacc aatgagcagg ttgttagaag tctatatgta 1980atatatgaag aaggagacaa catagtgggt gtaccgtctg ataatagcgg tctgcacgat 2040ttgtctgtgc tacacctaga ctcctgtaca gattacaata tatatggtag aactggtgtt 2100ggtattatta gacgaactaa cagtacgcta cttagtggct tatattacac atcactatca 2160ggtgatttgt taggctttaa aaatgttagt gatggtgtca tttattctgt gacgccatgt 2220gatgtaagcg cacaagcggc tgttattgat ggtgccatag ttggagctat gacttccatt 2280aacagtgaac tgttaggtct aacacattgg acaacgacac ctaattttta ttactactct 2340atatataatt acacaagtga gaggactcgt ggcactgcaa ttgacagtaa cgatgttgat 2400tgtgaacctg tcataaccta ttctaatata ggtgtttgta aaaatggtgc tttggttttt 2460attaacgtca cacattctga cggagacgtg caaccaatta gcactggtaa tgtcacgata 2520cctacaaatt ttactatatc tgtgcaagtt gaatacatgc aggtttacac tacaccagta 2580tcaatagatt gtgcaagata cgtttgtaat ggtaacccta gatgtaacaa attgttaaca 2640caatatgtgt ctgcatgtca aactattgaa caagcacttg caatgggtgc cagacttgaa 2700aacatggagg ttgattccat gttgtttgtc tcggaaaatg cccttaaatt ggcatctgtt 2760gaggcgttca atagtacaga aaatttagat cctatttaca aagaatggcc tagcataggt 2820ggttcttggc taggaggtct aaaagatata ctaccgtccc ataatagcaa acgtaagtat 2880ggttctgcta tagaagattt gctttttgat aaagttgtaa catctggttt aggtacagtt 2940gatgaagatt ataaacgttg tactggtggt tacgacatag cagacttggt gtgtgctcaa 3000tattacaatg gcatcatggt tctaccaggt gtagctaatg ctgacaagat gactatgtac 3060acagcatcac ttgcaggtgg tataacatta ggtgcacttg gtggtggcgc cgtggctata 3120ccttttgcag tagcagtaca ggctagactt aattatgttg ctctacaaac tgatgtattg 3180aataaaaacc aacagatcct ggctaatgct ttcaatcaag ctattggtaa cattacacag 3240gcttttggta aggttaatga tgctatacat caaacatcac aaggtcttgc cactgttgct 3300aaagcgttgg caaaagtgca agatgttgtc aacacacaag ggcaagcttt aagtcacctt 3360acagtacaat tgcaaaataa ttttcaagcc attagtagtt ctattagtga tatttataac 3420aggcttgacg aactgagtgc tgatgcacaa gttgataggc tgattacagg tagacttaca 3480gcacttaatg catttgtgtc tcagactcta accagacaag cagaggttag ggctagtaga 3540caacttgcca aagacaaggt taatgaatgt gttaggtctc agtctcagag attcggattc 3600tgtggtaatg gtacacattt gttttcacta gcaaatgcag caccaaatgg catgattttc 3660tttcatacag tactattacc aacagcttat gaaactgtaa cagcttggtc aggtatttgt 3720gcttcagatg gcgatcgcac tttcggactt gtcgttaaag atgtgcagtt gacgttgttt 3780cgtaatctag atgacaagtt ctatttgacc cccagaacta tgtatcagcc tagagttgca 3840actagttctg attttgttca aattgaaggg tgtgatgtgt tgtttgtcaa cgcgactgta 3900attgatttgc ctagtattat acctgactat attgacatta atcaaactgt tcaagacata 3960ttagaaaatt acagaccaaa ctggactgta cctgaattta cacttgatat tttcaacgca 4020acctatttaa atctgactgg tgaaattgat gacttagagt ttaggtcaga aaagctacat 4080
aacactacag tagaacttgc cattctcatt gataacatta ataatacatt agtcaatctt 4140gaatggctca atagaattga aacttatgta aaatggcctt ggtatgtgtg gctactgata 4200ggtttagtag tagtattttg cataccatta ctgctatttt gctgttttag cacaggttgt 4260tgtggatgca taggttgttt aggaagttgt tgtcactcta tatgtagtag aagacaattt 4320gaaaattatg aaccaattga aaaagtgcat gtccactaa4359<210>3<211>4344<212>DNA<213>传染性胃肠炎病毒<400>3atgaaaaaac tatttgtggt tttggtcgta atgccattga tttatggaga caattttcct 60tgttctaaat tgactaatag aactataggc aaccagtgga atctcattga aaccttcctt 120ctaaactata gtagtaggtt accacctaat tcagatgtgg tgttaggtga ttattttcct 180actgtacaac cttggtttaa ttgcattcgc aatgatagta atgaccttta tgttacactg 240gaaaatctta aagcattgta ttgggattat gctacagaaa atatcacttg gaatcacaga 300caacggttaa acgtagtcgt taatggatac ccatactcca tcacagttac aacaacccgc 360aattttaatt ctgctgaagg tgctattata tgcatttgta agggctcacc acctactacc 420accacagaat ctagtttgac ttgcaattgg ggtagtgagt gcaggttaaa ccataagttc 480cctatatgtc cttctaattc agaggcaaat tgtggtaata tgctgtatgg cctacaatgg 540tttgcagatg aggttgttgc ttatttacat ggtgctagtt accgtattag ttttgaaaat 600caatggtctg gcactgtcac atttggtgat atgcgtgcga caacattaga agtcgctggc 660acgcttgtag acctttggtg gtttaatcct gtttatgatg tcagttatta tagggttaat 720aataaaaatg gtactaccgt agtttccaat tgcactgatc aatgtgctag ttatgtggct 780aatgttttta ctacacagcc aggaggtttt ataccatcag attttagttt taataattgg 840ttccttctaa ctaatagctc cacgttggtt agtggtaaat tagttaccaa acagccgtta 900ttagttaatt gcttatggcc agtccctagc tttgaagaag cagcttctac attttgtttt 960gagggtgctg gctttgatca atgtaatggt gctgttttaa ataatactgt agacgtcatt 1020aggttcaacc ttaattttac tacaaatgta caatcaggta agggtgccac agtgttttca 1080ttgaacacaa cgggtggtgt cactcttgaa atttcatgtt atacagtgag tgactcgagc 1140tttttcagtt acggtgaaat tccgttcggc gtaactgatg gaccacggta ctgttacgta 1200cactataatg gcacagctct taagtattta ggaacattac cacctagtgt caaggagatt 1260gctattagta agtggggcca tttttatatt aatggttaca atttctttag cacatttcct 1320attgattgta tatcttttaa tttgaccact ggtgatagtg acgttttctg gacaatagct 1380tacacatcgt acactgaagc attagtacaa gttgaaaaca cagctattac aaaggtgacg 1440tattgtaata gtcacgttaa taacattaaa tgctctcaaa ttactgctaa tttgaataat 1500ggattttatc ctgtttcttc aagtgaagtt ggtcttgtca ataagagtgt tgtgttacta 1560cctagctttt acacacatac cattgttaac ataactattg gtcttggtat gaagcgtagt 1620ggttatggtc aacccatagc ctcaacatta agtaacatca cactaccaat gcaggatcac 1680aacaccgatg tgtactgtat tcgttctgac caattttcag tttatgttca ttctacttgc 1740aaaagtgctt tatgggacaa tatttttaag cgaaactgca cggacgtttt agatgccaca 1800gctgttataa aaactggtac ttgtcctttc tcatttgata aattgaacaa ttacttaact 1860tttaacaagt tctgtttgtc gttgagtcct gttggtgcta attgtaagtt tgatgtagct 1920gcccgtacaa gaaccaatga gcaggttgtt agaagtttgt atgtaatata tgaagaagga 1980gacaacatag tgggtgtacc gtctgataat agtggtgtgc acgatttgtc agtgctacac 2040ctagattcct gcacagatta caatatatat ggtagaactg gtgttggtat tattagacaa 2100actaacagga cgctacttag tggcttatat tacacatcac tatcaggtga tttgttaggt 2160tttaaaaatg ttagtgatgg tgtcatctac tctgtaacgc catgtgatgt aagcgcacaa 2220gcagctgtta ttgatggtac catagttggg gctatcactt ccattaacag tgaactgtta 2280ggtctaacac attggacaac aacacctaat ttttattact actctatata taattacaca 2340aatgatagga ctcgtggcac tgcaattgac agtaatgatg ttgattgtga acctgtcata 2400acctattcta acataggtgt ttgtaaaaat ggtgcttttg tttttattaa cgtcacacat 2460tctgatggag acgtgcaacc aattagcact ggtaatgtca cgatacctac aaactttacc 2520atatccgtgc aagtcgaata tattcaggtt tacactacac cagtgtcaat agactgttca 2580agatatgttt gtaatggtaa ccctaggtgt aacaaattgt taacacaata cgtttctgca 2640tgtcaaacta ttgagcaagc acttgcaatg ggtgccagac ttgaaaacat ggaggttgat 2700
tccatgttgt ttgtttctga aaatgccctt aaattggcat ctgttgaagc attcaatagt 2760tcagaaactt tagaccctat ttacaaagaa tggcctaata taggtggttc ttggctagaa 2820ggtctaaaat acatacttcc gtcccataat agcaaacgta agtatcgttc agctatagag 2880gacttgcttt ttgataaggt tgtaacatct ggtttaggta cagttgatga agattataaa 2940cgttgtacag gtggttatga catagctgac ttagtatgtg ctcaatacta taatggcatc 3000atggtgctac ctggtgtggc taatgctgac aaaatgacta tgtacacagc atcccttgca 3060ggtggtataa cattaggtgc acttggtgga ggcgccgtgg ctataccttt tgcagtagca 3120gttcaggcta gacttaatta tgttgctcta caaactgatg tattgaacaa aaaccagcag 3180attctggcta gtgctttcaa tcaagctatt ggtaacatta cacagtcatt tggtaaggtt 3240aatgatgcta tacatcaaac atcacgaggt cttgctactg ttgctaaagc attggcaaaa 3300gtgcaagatg ttgtcaacat acaagggcaa gctttaagcc acctaacagt acaattgcaa 3360aataatttcc aagccattag tagttctatt agtgacattt ataataggct tgacgaattg 3420agtgctgatg cacaagttga caggctgatc acaggaagac ttacagcact taatgcattt 3480gtgtctcaga ctctaaccag acaagcggag gttagggcta gtagacaact tgccaaagac 3540aaggttaatg aatgcgttag gtctcagtct cagagattcg gattctgtgg taatggtaca 3600catttgtttt cactcgcaaa tgcagcacca aatggcatga ttttctttca cacagtgcta 3660ttaccaacgg cttatgaaac tgtgactgct tggccaggta tttgtgcttc agatggtgat 3720cgcacttttg gacttgtcgt taaagatgtc cagttgactt tgtttcgtaa tctagatgac 3780aagttctatt tgacccccag aactatgtat cagcctagag ttgcaactag ttctgacttt 3840gttcaaattg aagggtgcga tgtgctgttt gttaatgcaa ctgtaagtga tttgcctagt 3900attatacctg attatattga tattaatcag actgttcaag acatattaga aaattttaga 3960ccaaattgga ctgtacctga gttgacattt gacattttta acgcaaccta tttaaacctg 4020actggtgaaa ttgatgactt agaatttagg tcagaaaagc tacataacac cactgtagaa 4080cttgccattc tcattgacaa cattaacaat acattagtca atcttgaatg gctcaataga 4140attgaaacct atgtaaaatg gccttggtat gtgtggctac taataggctt agtagtaata 4200ttttgcatac cattactgct attttgctgt tgtagtacag gttgctgtgg atgcatagg 4260tgtttaggaa gttgttgtca ctctatatgt agtagaagac aatttgaaaa ttacgaacca 4320attgaaaaag tgcacgtcca ttaa4344<210>4<211>3678<212>DNA<213>猪呼吸冠状病毒<400>4atgaaaaaat tatttgtggt cttggttgta atgccattga tttatggaga caagtttcct 60acttccgtag tttccaattg cactgatcaa tgtgctagtt atgtggctaa tgtttttact 120atactaccag gaggctttat accatcagat tttagtttta ataattggtt cctcctaact 180aatagctcca cgttggttaa tggtaaatta gttaccaaac agcctctatt agttaattgc 240ttatggccag tccctagctt tgaagaagta gcttctacat tttgttttga aggtgctgac 300tttgatcaat gtaatggtgc tgttttaaat aacactgtag acgtcattag gtttaacctt 360aattttacta caaatgtaca atcaggtaag ggtgctacag tgttttcatt gaacacaacg 420ggtggtgtca ctcttgaaat ctcatgttat aatgatacag tgagtgattc gagcttttcc 480agttacggtg aaattccgtt cggcgtaact aatggaccac ggtactgtta cgtactctat 540aatggcacag ctcttaagta tctaggaaca ttaccaccta gtgtcaagga gattgctatt 600agtaagtggg gccattttta tattaatggt tacaatttct ttagcacatt tcctattgat 660tgtatatctt ttaatttgac tactggtgat agtgacgtct tctggacaat agcttacaca 720tcgtacactg aagcattagt acaagttgaa aacacagcta ttacaaatgt gacgtattgt 780aatagttatg ttaataacat taaatgctct caacttactg ctaatttgaa taatggattt 840tatcctgttt cttcaagtga agttggttct gtcaataaga gtgttgtgtt actacctagc 900tttctgacac ataccattgt taacataact attggtcttg gtatgaagcg tagtggttat 960ggtcaaccca tagcctcaac gctaagtaac attacactac caatgcagga taacaacaac 1020gatgtgtact gtgttcgttc tgaccaattt tcagtttatg ttcattctac ttgcaaaagt 1080gttttatggg acaatgtttt taagcgaaac tgcacggacg ttttagatgc cacagctgtt 1140ataaaaactg gtacttgtcc tttctcattt gataaattga acaattactt aacttttaac 1200aagttctgtt tgtcgttgag tcccgttggt gctaattgta agtttgatgt agctgcccgt 1260acaagaacca atgatcaggt tgttagaagt ttgtatgtaa tatatgaaga aggagacagc 1320
atagttggtg taccgtctga caatagtggt ttgcacgatt tgtcagtgct acacctagat 1380tcgtgcacag attacaatat atatggtaga actggtgttg gtattattag acaaactaac 1440aggacgatac ttagtggctt atattacaca tcactatctg gtgatttgtt aggttttaca 1500aatgttagtg atggtgttat ctactctgta acgccatgtg atgttagcgc acaagcagct 1560attattgatg gtaccatagt tggggctatc acttccatta acagtgaatt gttaggtcta 1620acacattgga caacaacacc taatttttat tactactcta tatataatta cacaaatgat 1680aagactcgtg gcactccaat tggcagtaat gacgttgatt gtgaacctgt cataacctat 1740tctaacatag gtgtttgtaa aaatggtgct ttggttttta ttaacgtcac acattctgat 1800ggagacgtgc aaccaattag cactggtaac gtcacgatac ctactaactt tactatatcc 1860gtgcaagtcg aatacattca ggtttacact acaccagtgt caatagactg ttcaagatat 1920gtttgtaatg gcaaccctag gtgtaacaaa ctgttaacac aatacgtttc tgcatgtcaa 1980actattgagc aagcacttgc aatgggtgcc agacttgaaa acatggaagt tgattccatg 2040ttatttgttt ctgaaaatgc ccttaaattg gcttctgtcg aagcattcaa tagttcagaa 2100actttagatc ctatttacaa agaatggcct aatataggtg gcttttggct agaaggtcta 2160aaatacatac ttccgtccga taatagcaaa cgtaagtatc gttcagctat agaggacttg 2220cttttttcta aggttgtaac atctggttta ggtacagttg atgaagatta caaacgttgt 2280acaggtggtt atgacatagc tgacttagta tgtgctcaat actataatgg cattatggtg 2340ctacctggtg tggctaatgc tgacaaaatg actatgtaca cagcatccct cgcaggtggt 2400ataacattag gtgcacttgg tggaggcgcc gtggctatac cttttgcagt agcagttcag 2460gctagactta attatgttgc tctacaaact gatgtattga acaaaaacca gcagatcctg 2520gctagtgctt ttaatcaagc tattggtaac attacacagt catttggtaa ggttaatgat 2580gctatacatc aaacatcacg aggtcttaca actgttgcta aagcattggc aaaagtgcaa 2640gatgttgtca acacacaagg tcaagcttta agacacctaa cagtacaatt gcaaaataat 2700ttccaagcca ttagtagttc tattagtgac atttataata ggcttgatga attgagtgct 2760gatgcacaag tcgacaggct gatcacagga agacttacag cacttaatgc atttgtgtct 2820cagactctaa ccagacaagc cgaggttagg gctagtagac aacttgctaa agacaaggtt 2880aatgaatgcg ttaggtctca gtctcagaga ttcggcttct gtggtaatgg tacacatttg 2940ttttcactcg caaatgcagc accaaatggc atgatcttct ttcacacagt gctattacca 3000acggcgtatg aaactgtgac tgcttggtca ggtatttgtg ctttagatgt tgatcgcact 3060tttggacttg tcgttaaaga tgtccagttg actttatttc gtaatctaga tgacaagttc 3120tatttgacac ccagaactat gtatcagcct agagtggcaa ctagttctga ttttgttcaa 3180attgaagggt gcgatgtgct gtttgttaat acaactgtaa gtgatttgcc tagtattata 3240cctgattata ttgatattaa tcagactgtt caagacatat tagaaaattt tagaccaaat 3300tggactgtac ctgagctgac attggacgtt tttaacgcaa cctatttaaa cctgactggt 3360gaaattgatg acttagagtt taggtcagaa aagctacata acactactgt agaacttgcc 3420attctcattg acaacattaa caatacagta gtcaatcttg aatggcttaa tagaattgaa 3480acttatgtaa aatggccttg gtatgtgtgg ctactaatag gcttagtagt aatattttgc 3540ataccattac tgctattttg ctgttgtagt acaggttgct gtggatgcat aggttgttta 3600ggaagttgtt gtcactctat attcagtaga agacaatttg aaaattatga acctattgaa 3660aaagtgcacg tccattaa 3678<210>5<211>3522<212>DNA<213>人冠状病毒0C43<400>5atgtttgttt tgcttgttgc atatgccttg ttgcatattg ctggttgtca aactacaaat 60gggctgaaca ctagttactc tgtttgcaac ggctgtgttg gttattcaga aaatgtattt 120gctgttgaga gtggtggtta tataccctcc gactttgcat tcaataattg gttccttcta 180actaatacct catctgttgt agatggtgtt gtgaggagtt ttcagccttt gttgcttaat 240tgcttatggt ctgtttctgg cttgcggttt actactggtt ttgtctattt taatggtact 300gggagaggtg attgtaaagg tttttcctca gatgttttgt ctgatgtcat acgttacaac 360ctcaattttg aagaaaacct tagacgtgga accattttgt ttaaaacatc ttatggtgtt 420gttgtgtttt attgtaccaa caacacttta gtttcaggtg atgctcacat accatttggt 480acagttttgg gcaattttta ttgctttgta aatactacta ttggcaatga aactacgtct 540gcttttgtgg gtgcactacc taagacagtt cgtgagtttg ttatttcacg cacaggacat 600
ttttatatta atggctatcg ctatttcact ttaggtaatg tagaagccgt taatttcaat 660gtcactactg cagaaaccac tgatttttgt actgttgcgt tagcttctta tgctgacgtt 720ttggttaatg tgtcacaaac ctctattgct aatataattt attgcaactc tgttattaac 780agactgagat gtgaccagtt gtcctttgat gtaccagatg gtttttattc tacaagccct 840attcaatccg ttgagctacc tgtgtctatt gtgtcgctac ctgtttatca taaacatacg 900tttattgtgt tgtacgttga cttcaaacct cagagtggcg gtggcaagtg ctttaactgt 960tatcctgctg gtgttaatat tacactggcc aattttaatg aaactaaagg gcctttgtgt 1020gttgacacat cacacttcac taccaaatac gttgctgttt atgccaatgt tggtaggtgg 1080agtgctagta ttaacacggg aaattgccct ttttcttttg gcaaagttaa taactttgtt 1140aaatttggca gtgtatgttt ttcgctaaag gatatacccg gtggttgcgc aatgcctata 1200gtggctaatt gggcttatag taagtactat actataggct cattgtatgt ttcttggagt 1260gatggtgatg gaattactgg cgtcccacaa cctgttgagg gtgttagttc ctttatgaat 1320gttacattgg acaaatgtac taaatataat atttatgatg tatctggtgt gggtgttatt 1380cgcgttagca atgacacctt tcttaatgga attacgtaca catcaacttc aggtaacctt 1440ctgggtttta aagatgttac taagggcacc atctactcta tcactccttg taacccacca 1500gatcagcttg ttgtttatca gcaagctgtt gttggtgcta tgttgtctga aaattttact 1560agttacggct tttctaatgt tgtagaactg ccgaaatttt tctatgcgtc caatggcact 1620tataattgca cagacgctgt tttaacttat tctagttttg gcgtttgtgc agatggttct 1680ataattgctg ttcaaccacg taatgtttca tatgatagtg tttcagctat cgtcacagct 1740aatttgtcta taccttccaa ttggaccact tcggtccagg ttgagtattt acaaattaca 1800agtacaccta tcgtagttga ttgctccact tatgtttgca atggtaatgt gcgctgtgtt 1860gaattgctta agcagtatac ttctgcttgt aaaactattg aagacgcctt aagaaatagc 1920gccaggctgg agtctgcaga tgttagtgag atgctcactt ttgacaagaa agcgtttaca 1980cttgctaatg ttagtagttt tggtgactac aaccttagca gcgtcatacc tagcttgccc 2040acaagtggta gtagagtggc tggtcgcagt gccatagaag acatactttt tagcaaactt 2100gttacttctg gacttggcac tgtggacgca gactacaaaa agtgcactaa gggtctttcc 2160attgctgact tggcttgtgc tcaatattat aatggcatta tggttttgcc tggcgtcgct 2220gatgctgaac gaatggccat gtatacaggt tctttaattg gtggaattgc tttaggaggt 2280ctaacatcag ccgtttcaat accattttca ttagcaattc aggcacgttt aaattatgtt 2340gcattgcaga ctgatgtttt acaagaaaat cagaaaattc ttgctgcatc ttttaacaaa 2400gcaatgacca acatagtaga tgcctttact ggtgttaatg atgctattac acaaacttca 2460caagccctac aaacagttgc tactgcactt aacaagatcc aggatgttgt taatcaacaa 2520ggcaactcat tgaaccattt aacttctcag ttgaggcaga attttcaagc tatctctagc 2580tctattcagg ctatctatga cagacttgac actattcagg ctgatcaaca agtagatagg 2640ctgattactg gtagattggc tgctttgaat gtattcgttt ctcatacatt gactaagtac 2700actgaagttc gtgcttccag acagcttgca caacaaaaag tgaatgagtg tgtcaaatcc 2760cagtctaagc gttatggctt ctgtggaaat ggcactcaca ttttctcaat tgttaatgct 2820gctcctgagg ggcttgtttt tctccacact gtcttgttgc cgacacaata taaggatgtt 2880gaagcgtggt ctgggttgtg cgttgatggt acaaacggtt atgtgttgcg acaacctaat 2940cttgctcttt acaaagaagg caattattat agaatcacat ctcgcataat gtttgaacca 3000cgtattccta ccatggcaga ttttgttcaa attgaaaatt gcaatgtcac atttgttaac 3060atttctcgct ctgagttgca aaccattgtg ccagagtata ttgatgttaa taagacgctg 3120caagaattaa gttacaaatt gccaaattac actgttccag acctagttgt cgaacagtac 3180aaccagacta ttttgaattt gaccagtgaa attagcaccc ttgaaaataa atctgcggag 3240cttaattaca ctgttcaaaa attgcaaact ctgattgaca acataaatag cacattagtc 3300gacttaaagt ggctcaaccg ggttgagact tacatcaagt ggccgtggtg ggtgtggttg 3360tgcatttcag tcgtgctcat ctttgtggtg agtatgttgc tattatgttg ttgttctact 3420ggttgctgtg gcttctttag ttgttttgca tcttctatta gaggttgttg tgaatcaact 3480aaacttcctt attacgacgt tgaaaagatc cacatacagt aa3522<210>6<211>4152<212>DNA<213>猪流行性腹泻病毒<400>6atgaggtctt taatttactt ctggttgctc ttaccagtac ttccaacact cagcctacca 60
caagatgtca ctaggtgcca gtctactact aactttaggc ggttcttttc aaaatttaat 120gttcaggcac ctgccgtcgt cgttttgggt ggttacctac ctagtatgaa ctcttctagc 180tggtactgtg gcacaggcat tgaaactgct agtggcgttc atggtatttt tctcagctac 240atcgattctg gtcagggctt tgagattggc atttcgcaag agccgtttga tcctagtggt 300taccagcttt atttacataa ggccactaat ggtaacacta atgctattgc acgactgcgc 360atttgccagt ttcccgataa taaaacattg ggccctactg ttaatgatgt tacaacaggt 420cgtaactgcc tattcaacaa agccattcca gcttatatgc gtgatggaaa agatattgtt 480gtcggcataa catgggataa tgatcgtgtc actgtttttg ctgacaagat ctatcatttt 540tatcttaaaa atgattggtc ccgcgttgcg acaagatgtt acaatcgcag aagttgtgct 600atgcaatatg tttatacacc tacctactac atgcttaatg ttactagtgc aggtgaggat 660ggcatttatt atgaaccctg tacagctaat tgcactggtt acgctgccaa tgtatttgcc 720actgattcca atggccatat accagaaggt tttagtttta ataattggt ttcttttatcc 780aatgactcca ctttgttgca tggtaaagtg gtttccaacc aacccttgtt ggtcaattgt 840cttttggcca ttcctaagat ttatggacta ggccaatttt tctcattcaa tcacacgatg 900gatggcgttt gtaatggagc tgctgtggat cgtgccccag aggctctgag gtttaatatt 960aatgacacct ccgtcattct tgctgaaggc tcaattgtac ttcatactgc tttaggaaca 1020aatctttctt ttgtttgcag taattcctca gatcctcatt tagccatctt tgccatacct 1080ctgggtgcta ctgaagtacc ctactattgc tttcttaaag tggatactta caactccact 1140gtttataaat tcttggctgt tttacctcct actgtcaggg aaattgtcat caccaagtat 1200ggtgatgttt atgtcaatgg gtttggctat ttgcatctcg gtttgttgga tgctgtcaca 1260attaatttca ctggtcatgg cactgacgat gacgtttcag gtttctggac catagcatcg 1320actaattttg ttgatgcact catcgaggtt caaggaactt ccattcagcg tattctttat 1380tgtgatgatc ctgttagcca actcaagtgt tctcaggttg cttttgacct tgacgatggt 1440ttttacccca tctcttctag aaaccttctg agtcacgaac agccaatttc ttttgttact 1500ttgccatcat ttaatgatca ttcttttgtt aatattactg tctctgcggc ttttggtggt 1560cttagtagtg ccaatctcgt tgcatctgac actactatca atgggtttag ttctttctgt 1620gttgacacta gacaatttac cattacactg ttttataatg ttacaaacag ttatggttat 1680gtgtctaaat cacaggatag taattgtcct ttcaccttgc aatctgttaa tgattacctg 1740tcttttagca aattttgtgt ttcaaccagc cttttggctg gtgcttgtac catagatctt 1800tttggttacc ctgcgttcgg tagtggtgtt aagttgacgt ccctttattt tcaattcaca 1860aaaggtgagt tgattactgg cacgcctaaa ccacttgaag gtatcacaga cgtttctttt 1920atgactctgg atgtgtgtac caagtatact atctatggct ttaaaggtga gggtattatt 1980acccttacaa attctagcat tttggcaggt gtttattata catctgattc tggacagttg 2040ttagccttta agaatgtcac tagtggtgct gtttattctg tcacgccatg ttctttttca 2100gagcaggctg catatgttaa tgatgatata gtgggtgtta tttctagttt gtctaactcc 2160acttttaaca atactaggga gttgcctggt ttcttctacc attctaatga cggctccaat 2220tgtacagagc ctgtgttggt gtatagtaac ataggtgttt gtaaatctgg cagtattggc 2280tatgttccat ctcagtatgg ccaagtcaag attgcaccca cggttactgg gaatattagt 2340attcccacca actttagtat gagtattaga acagaatatt tacagcttta caacacgcct 2400gttagtgttg attgtgctac atatgtttgt aatggtaact ctcgttgtaa acaattactc 2460acccagtaca ctgcagcatg taagaccata gagtcagcat tacaactcag cgctaggctt 2520gagtctgttg aagttaactc tatgcttacc atttctgaag aggctttaca gttagctacc 2580atcagttcgt ttaatggtga tggatataac tttactaatg tgctgggtgc ttccgtgtac 2640gatcctgcaa gtggcagggt ggtacaaaaa aggtctgtta ttgaagactt gctttttaat 2700aaagtggtta ctaatggcct tggtactgtt gatgaagact ataagcgctg ttctaatggt 2760cgctctgtgg ctgatctagt ctgtgcgcag tattactctg gtgtcatggt actacctggc 2820gttgttgacg ctgagaagct tcacatgtac agtgcgtctc tcataggtgg tatggcgcta 2880ggaggtataa ctgctgcagc ggcattgcct tttagctatg ctgttcaagc gagactcaat 2940tatcttgctt tacagacgga tgttctacag cggaaccagc aattgcttgc tgagtctttt 3000aactctgcta ttggtaatat aacttcagcc tttgagagtg ttaaagaggc tattagtcaa 3060acttccaagg gtttgaacac tgtggctcat gcgcttacta aggttcaaga ggttgttaat 3120tcgcagggtt cagctttgaa ccaacttacc gtacagctgc aacacaactt ccaagccatt 3180tctagttcta ttgatgacat ttattcccga ctggacattc tttcagccga tgttcaggtt 3240gatcgtctca tcaccggcag attatcagca cttaatgctt ttgttgccca aaccctcact 3300aagtatactg aggttcaggc tagcaggaag ctagcacagc aaaaggttaa tgagtgcgtc 3360aaatcgcaat ctcagcgtta cggtttttgt ggtggtgatg gcgagcacat tttctctctg 3420gtacaggccg cacctcaggg cctgctgttc ttacatacag tacttgtacc gggtgatttt 3480gtaaatgttc ttgccatcgc tggcttatgc gttaatggtg aaattgcctt gactctacgt 3540
gagcctggct tagtcttgtt tacgcatgaa cttcaaactt atactgcgac ggaatatttt 3600gtttcatcgc gacgtatgtt tgaacctaga aaacctaccg ttagtgattt tgttcaaatt 3660gagagttgtg tggtcaccta tgtcaatctg actagcgacc agctaccaga tgtaatccca 3720gattacatcg atgttaacaa aacacttgat gagattttag cttctctgcc caatagaact 3780ggtccaagtc ttcccctaga tgtttttaat gccacttatc ttaatcttac tggtgaaatt 3840gcagatctag agcagcgttc agagtctctc cgtaatacta cagaagagct ccgaagtctc 3900attaacaaca tcaacaacac acttgttgac cttgagtggc tcaaccgagt tgagacatac 3960atcaagtggc cgtggtgggt ttggttgatc attgttattg ttctcatctt tgttgtgtca 4020ttactagtgt tctgctgcat ttccacgggt tgttgtggat gctgcggttg ctgcggtgct 4080tgtttttcag gttgttgtag gggtcctaga cttcaacctt acgaagcttt tgaaaaggtc 4140cacgtgcagt ga 4152<210>7<211>3768<212>DNA<213>SARS冠状病毒urbani<400>7atgtttattt tcttattatt tcttactctc actagtggta gtgaccttga ccggtgcacc 60acttttgatg atgttcaagc tcctaattac actcaacata cttcatctat gaggggggtt 120tactatcctg atgaaatttt tagatcagac actctttatt taactcagga tttatttctt 180ccattttatt ctaatgttac agggtttcat actattaatc atacgtttgg caaccctgtc 240atacctttta aggatggtat ttattttgct gccacagaga aatcaaatgt tgtccgtggt 300tgggtttttg gttctaccat gaacaacaag tcacagtcgg tgattattat taacaattct 360actaatgttg ttatacgagc atgtaacttt gaattgtgtg acaacccttt ctttgctgtt 420tctaaaccca tgggtacaca gacacatact atgatattcg ataatgcatt taattgcact 480ttcgagtaca tatctgatgc cttttcgctt gatgtttcag aaaagtcagg taattttaaa 540cacttacgag agtttgtgtt taaaaataaa gatgggtttc tctatgttta taagggctat 600caacctatag atgtagttcg tgatctacct tctggtttta acactttgaa acctattttt 660aagttgcctc ttggtattaa cattacaaat tttagagcca ttcttacagc cttttcacct 720gctcaagaca tttggggcac gtcagctgca gcctattttg ttggctattt aaagccaact 780acatttatgc tcaagtatga tgaaaatggt acaatcacag atgctgttga ttgttctcaa 840aatccacttg ctgaactcaa atgctctgtt aagagctttg agattgacaa aggaatttac 900cagacctcta atttcagggt tgttccctca ggagatgttg tgagattccc taatattaca 960aacttgtgtc cttttggaga ggtttttaat gctactaaat tcccttctgt ctatgcatgg 1020gagagaaaaa aaatttctaa ttgtgttgct gattactctg tgctctacaa ctcaacattt 1080ttttcaacct ttaagtgcta tggcgtttct gccactaagt tgaatgatct ttgcttctcc 1140aatgtctatg cagattcttt tgtagtcaag ggagatgatg taagacaaat agcgccagga 1200caaactggtg ttattgctga ttataattat aaattgccag atgatttcat gggttgtgtc 1260cttgcttgga atactaggaa cattgatgct acttcaactg gtaattataa ttataaatat 1320aggtatctta gacatggcaa gcttaggccc tttgagagag acatatcta atgtgcctttc 1380tcccctgatg gcaaaccttg caccccacct gctcttaatt gttattggcc attaaatgat 1440tatggttttt acaccactac tggcattggc taccaacctt acagagttgt agtactttct 1500tttgaacttt taaatgcacc ggccacggtt tgtggaccaa aattatccac tgaccttatt 1560aagaaccagt gtgtcaattt taattttaat ggactcactg gtactggtgt gttaactcct 1620tcttcaaaga gatttcaacc atttcaacaa tttggccgtg atgtttctga tttcactgat 1680tccgttcgag atcctaaaac atctgaaata ttagacattt caccttgctc ttttgggggt 1740gtaagtgtaa ttacacctgg aacaaatgct tcatctgaag ttgctgttct atatcaagat 1800gttaactgca ctgatgtttc tacagcaatt catgcagatc aactcacacc agcttggcgc 1860atatattcta ctggaaacaa tgtattccag actcaagcag gctgtcttat aggagctgag 1920catgtcgaca cttcttatga gtgcgacatt cctattggag ctggcatttg tgctagttac 1980catacagttt ctttattacg tagtactagc caaaaatcta ttgtggctta tactatgtct 2040ttaggtgctg atagttcaat tgcttactct aataacacca ttgctatacc tactaacttt 2100tcaattagca ttactacaga agtaatgcct gtttctatgg ctaaaacctc cgtagattgt 2160aatatgtaca tctgcggaga ttctactgaa tgtgctaatt tgcttctcca atatggtagc 2220ttttgcacac aactaaatcg tgcactctca ggtattgctg ctgaacagga tcgcaacaca 2280cgtgaagtgt tcgctcaagt caaacaaatg tacaaaaccc caactttgaa atattttggt 2340
ggttttaatt tttcacaaat attacctgac cctctaaagc caactaagag gtcttttatt 2400gaggacttgc tctttaataa ggtgacactc gctgatgctg gcttcatgaa gcaatatggc 2460gaatgcctag gtgatattaa tgctagagat ctcatttgtg cgcagaagtt caatggactt 2520acagtgttgc cacctctgct cactgatgat atgattgctg cctacactgc tgctctagtt 2580agtggtactg ccactgctgg atggacattt ggtgctggcg ctgctcttca aatacctttt 2640gctatgcaaa tggcatatag gttcaatggc attggagtta cccaaaatgt tctctatgag 2700aaccaaaaac aaatcgccaa ccaatttaac aaggcgatta gtcaaattca agaatcactt 2760acaacaacat caactgcatt gggcaagctg caagacgttg ttaaccagaa tgctcaagca 2820ttaaacacac ttgttaaaca acttagctct aattttggtg caatttcaag tgtgctaaat 2880gatatccttt cgcgacttga taaagtcgag gcggaggtac aaattgacag gttaattaca 2940ggcagacttc aaagccttca aacctatgta acacaacaac taatcagggc tgctgaaatc 3000agggcttctg ctaatcttgc tgctactaaa atgtctgagt gtgttcttgg acaatcaaaa 3060agagttgact tttgtggaaa gggctaccac cttatgtcct tcccacaagc agccccgcat 3120ggtgttgtct tcctacatgt cacgtatgtg ccatcccagg agaggaactt caccacagcg 3180ccagcaattt gtcatgaagg caaagcatac ttccctcgtg aaggtgtttt tgtgtttaat 3240ggcacttctt ggtttattac acagaggaac ttcttttctc cacaaataat tactacagac 3300aatacatttg tctcaggaaa ttgtgatgtc gttattggca tcattaacaa cacagtttat 3360gatcctctgc aacctgagct cgactcattc aaagaagagc tggacaagta cttcaaaaat 3420catacatcac cagatgttga tcttggcgac atttcaggca ttaacgcttc tgtcgtcaac 3480attcaaaaag aaattgaccg cctcaatgag gtcgctaaaa atttaaatga atcactcatt 3540gaccttcaag aattgggaaa atatgagcaa tatattaaat ggccttggta tgtttggctc 3600ggcttcattg ctggactaat tgccatcgtc atggttacaa tcttgctttg ttgcatgact 3660agttgttgca gttgcctcaa gggtgcatgc tcttgtggtt cttgctgcaa gtttgatgag 3720gatgactctg agccagttct caagggtgtc aaattacatt acacataa 3768<210>8<211>3768<212>DNA<213>SARS冠状病毒Tor2<400>8atgtttattt tcttattatt tcttactctc actagtggta gtgaccttga ccggtgcacc 60acttttgatg atgttcaagc tcctaattac actcaacata cttcatctat gaggggggtt 120tactatcctg atgaaatttt tagatcagac actctttatt taactcagga tttatttctt 180ccattttatt ctaatgttac agggtttcat actattaatc atacgtttgg caaccctgtc 240atacctttta aggatggtat ttattttgct gccacagaga aatcaaatgt tgtccgtggt 300tgggtttttg gttctaccat gaacaacaag tcacagtcgg tgattattat taacaattct 360actaatgttg ttatacgagc atgtaacttt gaattgtgtg acaacccttt ctttgctgtt 420tctaaaccca tgggtacaca gacacatact atgatattcg ataatgcatt taattgcact 480ttcgagtaca tatctgatgc cttttcgctt gatgtttcag aaaagtcagg taattttaaa 540cacttacgag agtttgtgtt taaaaataaa gatgggtttc tctatgttta taagggctat 600caacctatag atgtagttcg tgatctacct tctggtttta acactttgaa acctattttt 660aagttgcctc ttggtattaa cattacaaat tttagagcca ttcttacagc cttttcacct 720gctcaagaca tttggggcac gtcagctgca gcctattttg ttggctattt aaagccaact 780acatttatgc tcaagtatga tgaaaatggt acaatcacag atgctgttga ttgttctcaa 840aatccacttg ctgaactcaa atgctctgtt aagagctttg agattgacaa aggaatttac 900cagacctcta atttcagggt tgttccctca ggagatgttg tgagattccc taatattaca 960aacttgtgtc cttttggaga ggtttttaat gctactaaat tcccttctgt ctatgcatgg 1020gagagaaaaa aaatttctaa ttgtgttgct gattactctg tgctctacaa ctcaacattt 1080ttttcaacct ttaagtgcta tggcgtttct gccactaagt tgaatgatct ttgcttctcc 1140aatgtctatg cagattcttt tgtagtcaag ggagatgatg taagacaaat agcgccagga 1200caaactggtg ttattgctga ttataattat aaattgccag atgatttcat gggttgtgtc 1260cttgcttgga atactaggaa cattgatgct acttcaactg gtaattataa ttataaatat 1320aggtatctta gacatggcaa gcttaggccc tttgagagag acatatctaa tgtgcctttc 1380tcccctgatg gcaaaccttg caccccacct gctcttaatt gttattggcc attaaatgat 1440tatggttttt acaccactac tggcattggc taccaacctt acagagttgt agtactttct 1500tttgaacttt taaatgcacc ggccacggtt tgtggaccaa aattatccac tgaccttatt 1560
aagaaccagt gtgtcaattt taattttaat ggactcactg gtactggtgt gttaactcct 1620tcttcaaaga gatttcaacc atttcaacaa tttggccgtg atgtttctga tttcactgat 1680tccgttcgag atcctaaaac atctgaaata ttagacattt caccttgcgc ttttgggggt 1740gtaagtgtaa ttacacctgg aacaaatgct tcatctgaag ttgctgttct atatcaagat 1800gttaactgca ctgatgtttc tacagcaatt catgcagatc aactcacacc agcttggcgc 1860atatattcta ctggaaacaa tgtattccag actcaagcag gctgtcttat aggagctgag 1920catgtcgaca cttcttatga gtgcgacatt cctattggag ctggcatttg tgctagttac 1980catacagttt ctttattacg tagtactagc caaaaatcta ttgtggctta tactatgtct 2040ttaggtgctg atagttcaat tgcttactct aataacacca ttgctatacc tactaacttt 2100tcaattagca ttactacaga agtaatgcct gtttctatgg ctaaaacctc cgtagattgt 2160aatatgtaca tctgcggaga ttctactgaa tgtgctaattt gcttctcca atatggtagc 2220ttttgcacac aactaaatcg tgcactctca ggtattgctg ctgaacagga tcgcaacaca 2280cgtgaagtgt tcgctcaagt caaacaaatg tacaaaaccc caactttgaa atattttggt 2340ggttttaatt tttcacaaat attacctgac cctctaaagc caactaagag gtcttttatt 2400gaggacttgc tctttaataa ggtgacactc gctgatgctg gcttcatgaa gcaatatggc 2460gaatgcctag gtgatattaa tgctagagat ctcatttgtg cgcagaagtt caatggactt 2520acagtgttgc cacctctgct cactgatgat atgattgctg cctacactgc tgctctagtt 2580agtggtactg ccactgctgg atggacattt ggtgctggcg ctgctcttca aatacctttt 2640gctatgcaaa tggcatatag gttcaatggc attggagtta cccaaaatgt tctctatgag 2700aaccaaaaac aaatcgccaa ccaatttaac aaggcgatta gtcaaattca agaatcactt 2760acaacaacat caactgcatt gggcaagctg caagacgttg ttaaccagaa tgctcaagca 2820ttaaacacac ttgttaaaca acttagctct aattttggtg caatttcaag tgtgctaaat 2880gatatccttt cgcgacttga taaagtcgag gcggaggtac aaattgacag gttaattaca 2940ggcagacttc aaagccttca aacctatgta acacaacaac taatcagggc tgctgaaatc 3000agggcttctg ctaatcttgc tgctactaaa atgtctgagt gtgttcttgg acaatcaaaa 3060agagttgact tttgtggaaa gggctaccac cttatgtcct tcccacaagc agccccgcat 3120ggtgttgtct tcctacatgt cacgtatgtg ccatcccagg agaggaactt caccacagcg 3180ccagcaattt gtcatgaagg caaagcatac ttccctcgtg aaggtgtttt tgtgtttaat 3240ggcacttctt ggtttattac acagaggaac ttcttttctc cacaaataat tactacagac 3300aatacatttg tctcaggaaa ttgtgatgtc gttattggca tcattaacaa cacagtttat 3360gatcctctgc aacctgagct tgactcattc aaagaagagc tggacaagta cttcaaaaat 3420catacatcac cagatgttga tcttggcgac atttcaggca ttaacgcttc tgtcgtcaac 3480attcaaaaag aaattgaccg cctcaatgag gtcgctaaaa atttaaatga atcactcatt 3540gaccttcaag aattgggaaa atatgagcaa tatattaaat ggccttggta tgtttggctc 3600ggcttcattg ctggactaat tgccatcgtc atggttacaa tcttgctttg ttgcatgact 3660agttgttgca gttgcctcaa gggtgcatgc tcttgtggtt cttgctgcaa gtttgatgag 3720gatgactctg agccagttct caagggtgtc aaattacatt acacataa 3768<210>9<211>4092<212>DNA<213>牛冠状病毒<400>9atgtttttga tacttttaat ttccttacca atggcttttg ctgttatagg agatttaaag 60tgtactacgg tttccattaa tgatgttgac accggtgctc cctctattag cactgatatt 120gtcgatgtta ctaatggttt aggtacttat tatgttttag atcgtgtgta tttaaatact 180acgttgttgc ttaatggtta ctaccctact tcaggttcta catatcgtaa tatggcactg 240aagggaactt tactattgag cagactatgg tttaaaccac cttttctttc tgattttatt 300aatggtattt ttgctaaggt caaaaatacc aaggttatta aaaagggtgt aatgtatagt 360gagtttcctg ctataactat aggtagtact tttgtaaata catcctatag tgtggtagta 420caaccacata ctaccaattt ggataataaa ttacaaggtc tcttagagat ctctgtttgc 480cagtatacta tgtgcgagta cccacatacg atttgtcatc ctaagctggg taataaacgc 540gtagaactat ggcattggga tacaggtgtt gtttcctgtt tatataagcg taatttcaca 600tatgatgtga atgctgatta cttgtatttc catttttatc aagaaggtgg tactttttat 660gcatatttta cagacactgg tgttgttact aagtttctgt ttaatgttta tttaggcacg 720gtgctttcac attattatgt cctgcctttg acttgttcta gtgctatgac tttagaatat 780
tgggttacac ctctcacttc taaacaatat ttactagctt tcaatcaaga tggtgttatt 840tttaatgctg ttgattgtaa gagtgatttt atgagtgaga ttaagtgtaa aacactatct 900atagcaccat ctactggtgt ttatgaatta aacggttaca ctgttcagcc aattgcagat 960gtttaccgac gtatacctaa tcttcccgat tgtaatatag aggcttggct taatgataag 1020tcggtgccct ctccattaaa ttgggaacgt aagacctttt caaattgtaa ttttaatatg 1080agcagcctga tgtcttttat tcaggcagac tcatttactt gtaataatat tgatgctgct 1140aagatatatg gtatgtgttt ttccagcata actatagata agtttgctat acccaatggt 1200aggaaggttg acctacaatt gggcaatttg ggctatttgc agtcttttaa ctatagaatt 1260gatactactg ctacaagttg tcagttgtat tataatttac ctgctgctaa tgtttctgtt 1320agcaggttta atccttctac ttggaatagg agatttggtt ttacagaaca atttgttttt 1380aagcctcaac ctgtaggtgt ttttactcat catgatgttg tttatgcaca acattgtttt 1440aaagctccca aaaatttctg tccgtgtaaa ttggatgggt ctttgtgtgt aggtaatggt 1500cctggtatag atgctggtta taaaaatagt ggtataggca cttgtcctgc aggtactaat 1560tatttaactt gccataatgc tgcccaatgt gattgtttgt gcactcccga ccccattaca 1620tctaaatcta cagggcctta caagtgcccc caaactaaat acttagttgg cataggtgag 1680cactgttcgg gtcttgctat taaaagtgat tattgtggag gtaatccttg tacttgccaa 1740ccacaagcat ttttgggttg gtctgttgac tcttgtttac aaggggatag gtgtaatatt 1800tttgctaatt ttatttttca tgatgttaat agtggtacta cttgttctac tgatttacaa 1860aaatcaaaca cagacataat tcttggtgtt tgtgttaatt atgatcttta tggtattaca 1920ggccaaggta tttttgttga ggttaatgcg acttattata atagttggca gaacctttta 1980tatgattcta atggtaatct ctatggtttt agagactact taacaaacag aacttttatg 2040attcgtagtt gctatagcgg tcgtgtttca gcggcctttc atgctaactc ttccgaacca 2100gcattgctat ttcggaatat taaatgcaat tacgttttta ataatactct ttcacgacag 2160ctgcaaccta ttaactattt tgatagttat cttggttgtg ttgtcaatgc tgataatagt 2220acttctagtg ttgttcaaac atgtgatctc acagtaggta gtggttactg tgtggattac 2280tctacaaaaa gacgaagtcg tagagcgatt accactggtt atcggtttac taattttgag 2340ccatttactg ttaattcagt aaatgatagt ttagaacctg taggtggttt gtatgaaatt 2400caaatacctt cagagtttac tataggtaat atggaggagt ttattcaaac aagctctcct 2460aaagttacta ttgattgttc tgcttttgtc tgtggtgatt atgcagcatg taaatcacag 2520ttggttgaat atggtagctt ctgtgacaat attaatgcta tactcacaga agtaaatgaa 2580ctacttgaca ctacacagtt gcaagtagct aatagtttaa tgaatggtgt cactcttagc 2640actaagctta aagatggcgt taatttcaat gtagacgaca tcaatttttc ccctgtatta 2700ggttgtttag gaagcgcttg taataaagtt tccagcagat ctgctataga ggatttactt 2760ttttctaaag taaagttatc tgatgtcggt ttcgttgagg cttataataa ttgtactgga 2820ggtgccgaaa ttagggacct catttgtgtg caaagttata atggtatcaa agtgttgcct 2880ccactgctct cagtaaatca gatcagtgga tacactttgg ctgccacctc tgctagtctg 2940tttcctcctt tgtcagcagc agtaggtgta ccattttatt taaatgttca gtatcgtatt 3000aatgggattg gtgttaccat ggatgtgtta agtcaaaatc aaaagcttat tgctaatgca 3060tttaacaatg ctcttgatgc tattcaggaa gggtttgatg ctaccaattc tgctttagtt 3120aaaattcaag ctgttgttaa tgcaaatgct gaagctctta ataacttatt gcaacaactc 3180tctaatagat ttggtgctat aagttcttct ttacaagaaa ttctatctag actggatgct 3240cttgaagcgc aagctcagat agacagactt attaatgggc gtcttaccgc tcttaatgtt 3300tatgtttctc aacagcttag tgattctaca ctagtaaaat ttagtgcagc acaagctatg 3360gagaaggtta atgaatgtgt caaaagccaa tcatctagga taaatttttg tggtaatggt 3420aatcatatta tatcattagt gcagaatgct ccatatggtt tgtattttat ccactttagc 3480tatgtcccta ctaagtatgt cactgcgaag gttagtcccg gtctgtgcat tgctggtgat 3540agaggtatag cccctaagag tggttatttt gttaatgtaa ataatacttg gatgttcact 3600ggtagtggtt attactaccc tgaacccata actggaaata atgttgttgt tatgagtacc 3660tgtgctgtta actatactaa agcgccggat gtaatgctga acatttcaac acccaacctc 3720catgatttta aggaagagtt ggatcaatgg tttaaaaacc aaacatcagt ggcaccagat 3780ttgtcacttg attatataaa tgttacattc ttggacctac aagatgaaat gaataggtta 3840caggaggcaa taaaagtttt aaatcagagc tacatcaatc tcaaggacat tggtacatat 3900gagtattatg taaaatggcc ttggtatgta tggcttttaa ttggctttgc tggtgtagct 3960atgcttgttt tactattctt catatgctgt tgtacaggat gtgggactag ttgttttaag 4020atatgtggtg gttgttgtga tgattatact ggacaccagg agttagtaat taaaacatca 4080catgacgact aa 4092
<210>10<211>4050<212>DNA<213>猪血凝性脑脊髓炎冠状病毒<400>10atgtttttta tacttttaat ctccctgcct tctgcttttg cagttatagg ggatttaaag 60tgtactactt cattaattaa tgacgttgac actggtgtgc catctattag ctctgaagtt 120gttgatgtca ctaatggttt ggggactttc tatgttttag atcgtgtcta tttaaatacc 180acattgttgc tcaatggtta ttacccaatt tcaggtgcta catttcgtaa tatggctctg 240aaaggaactc gattattgag caccttgtgg tttaagccgc cttttttatc accttttaat 300gatggtattt ttgccaaggt taaaaacagc agattttcta aagatggtgt tatttatagt 360gagtttcctg ctattactat aggtagtact tttgtaaata cttcctatag catagtagta 420gagcctcata cctcacttat taatggtaat ttacaaggtt tgttgcaaat ttctgtttgt 480caatacacta tgtgtgaata cccacatact atttgtcatc ctaatttggg taatcaacgc 540atagaattat ggcattatga cacagatgtt gtttcttgtt tatacaggcg taatttcaca 600tatgatgtga atgctgatta tttatatttt cacttttatc aggaaggtgg cactttttat 660gcatacttta cagatactgg ttttgtgacc aagtttctgt ttaagttgta tttaggcact 720gtgctgtcac attattatgt tatgccattg acttgtaata gcgctttatc tttagaatac 780tgggttacac ctctcactac tagacaattt cttctagcct ttgaccagga tggtgtttta 840taccatgctg ttgattgtgc tagtgatttt atgagtgaga ttatgtgtaa aacttcttca 900attacaccac ctactggtgt ttatgaacta aacggttaca cagttcaacc tgttgccact 960gtatatcgta gaatacctga tttacccaat tgcgatatcg aagcttggct taattctaag 1020accgtttctt cgcctcttaa ttgggaacgt aaaatttttt ctaattgtaa ttttaacatg 1080ggcaggctga tgtcttttat tcaggctgac tcttttggtt gtaacaatat tgatgcttct 1140cgcttatatg gtatgtgttt tggtagcatt actattgata agtttgctat acccaatagt 1200agaaaggttg atctgcaagt gggtaaatct ggttatttac aatcttttaa ttataagatt 1260gacactgctg ttagcagttg tcaactctat tatagtttgc ctgcagcaaa cgtatctgtc 1320actcattata atccttcatc ttggaataga aggtatgggt ttaataatca gagttttggt 1380tccagaggcc ttcatgatgc tgtttattca cagcaatgtt ttaatacacc taacacatat 1440tgtccttgta gaacaagtca atgcataggt ggtgcaggca caggaacttg tcctgtaggc 1500accactgtgc gcaagtgttt tgctgcagtt acaaaagcta ctaagtgtac ttgctggtgt 1560caaccagatc cttccacata taaaggtgta aacgcctgga cttgtccgca atctaaagtt 1620tctatacaac caggtcagca ttgccctggt ttgggtcttg tggaggatga ttgctctggc 1680aacccttgca cttgtaaacc acaggctttc ataggctgga gttcagaaac ttgtttgcaa 1740aatggtaggt gtaatatttt tgctaatttt attctgaatg atgttaatag cggtacaacc 1800tgttctactg atttacaaca gggtaatact attattacta ctgatgtttg tgttaattat 1860gacctatatg gcattacagg ccagggcata cttatagaag ttaatgccac ttattataat 1920agttggcaga atcttcttta tgattctagt ggtaatctct atggctttag agattattta 1980tcaaatagaa cttttcttat tcgtagctgc tatagtggaa gagtttcagc agtttttcat 2040gctaactcat ctgaaccagc tttgatgttt cgtaatctta aatgcagcca cgtttttaat 2100aataccattt taagacaaat acagcttgtt aactattttg atagttacct tggttgtgtt 2160gttaatgctt ataataatac agctagtgct gtaagtactt gtgatttaac cgttggtagc 2220ggctattgtg ttgattatgt tacagcactt agatcacgta gatcttttac tacaggttat 2280cgctttacta attttgaacc atttgccgct aatttggtaa atgatagtat agaacctgtt 2340ggtggtttgt atgaaataca gataccttca gagtttacca ttggtaattt agaagagttc 2400attcaaacga gatcccctaa ggttactata gactgtgcta catttgtttg tggtgactat 2460gcagcatgta gacaacagtt agctgagtat ggtagttttt gtgagaacat taatgctata 2520ctcacagaag taaatgaact acttgacact acacagttgc aagtagctaa tagtttaatg 2580aatggagtca cccttagtac caagattaag gatggcatta atttcaatgt tgacgatatc 2640aacttctccc ctgtattagg ttgtttagga agcgaatgta atagagcttc cactagatct 2700gctatagagg atttactttt tgataaagta aaattgtctg atgtcggctt tgtacaggcc 2760tataataact gcactggagg tgccgaaatt agggatctca tttgtgtgca aagttataat 2820ggtatcaaag tgttgcctcc attgttatct gaaaatcaga tcagtggcta cactttggca 2880gccaccgctg ctagcttatt ccctccttgg acagctgcag caggtgtacc attttattta 2940aatgttcagt atcgtataaa tgggcttggc gtcactatgg atgtgctaag tcaaaaccaa 3000aagcttattg ctagtgcatt taacaatgct cttgatgcta tccaggaagg gttcgacgca 3060accaattctg ctttagttaa aattcaggct gttgttaatg caaatgctga agcacttaat 3120
aacttattgc agcaactctc taacagattt ggtgccataa gtgcctcttt acaagaaatt 3180ttatccaggc tcgatgctct tgaagctaaa gctcagatag acagacttat caatgggcgt 3240ctcaccgctc ttaatgctta tgtttctcag cagcttagtg attctacact agtaaaattt 3300agtgcagcac aagctattga gaaagttaat gaatgtgtta aaagccaatc atctaggata 3360aatttctgtg gtaatggtaa tcatattata tcattagtac agaatgctcc atatggtttg 3420tattttatcc attttagcta tgtccccacc aagtatgtta cagcaaaggt tagtcctggt 3480ttgtgcattg ctggcgatat aggaatatcg cctaagagtg gttattttat taatgtaaat 3540aattcttgga tgttcactgg tagtagctat tactaccctg aacctataac ccaaaataat 3600gttgttgtga tgagtacctg tgctgttaat tatactaaag caccggatct aatgctgaac 3660acatcgacac ccaaccttcc tgacttcaag gaagaattgt atcaatggtt taaaaaccaa 3720tcttcagtgg caccagattt gtcacttgat tatattaatg ttacgttctt ggacctacaa 3780gatgaaatga ataggttaca agaggctata aaagttttaa atcagagcta catcaatctc 3840aaggacattg gtacatatga gtattatgtg aaatggcctt ggtatgtatg gcttttaatt 3900ggccttgctg gtgtagctat gcttgtttta ctattcttca tatgctgctg tacaggatgt 3960gggactagtt gttttaagaa atgtggcggt tgttgtgatg attatactgg acaccaggag 4020tttgtaatca aaacttcaca tgacgattaa 4050<210>11<211>4086<212>DNA<213>鼠肝炎病毒<400>11atgctattcg tgtttttaac cttgttgccc tcttctctag ggtatattgg tgattttaga 60tgtatccaac ttgtaaatac cgacacctct aatgccagcg ctccaagcgt tagtacagag 120gtagttgatg tttccaaagg gattggtact tattatgttt tagatcgagt ctatttaaat 180gccacactat tgcttactgg ttattaccct gtagatgggt ccatgtatag aaacatggct 240ctaacgggaa ttaataccat aagccttaat tggtacaaac cacccttttt atcagagttt 300aatgatggca tatttgctaa ggtaaagaac cttaaagcat ctttgcccaa agattctatt 360tcatatttcc ctactataat tataggtagt aattttgtca ccacttccta tactgtagta 420ttggaaccgt ataatggtat aattatggca tccatttgcc agtataccat ttgtcaacta 480ccgtacacgg attgcaaacc gaatacgggc ggtaataagt taattggctt ttggcacaca 540gagctaaaat cccctgtgtg cattttaaag cgtaatttta cgtttaatgt taatgccgaa 600tggctttatt ttcattttta ccagcagggt ggtacttttt atgcgtatta tgcggatgtt 660tcttctgcta ctacgttttt gtttagtatg tatattggtg atgtgttaac acaatatttt 720gtgttgcctt atatgtgtac tctcactaca acaggtgtct tttcaccgca gtattgggtt 780acacctcttg tcaagcgcca atatttattt aattttaatc aaaagggtat tattactagt 840gctgttgatt gtgctagtag ttataccagc gaaataaagt gtaagaccca aagtatgaat 900cccaatacgg gagtttatga tttatccggt tacaccgtcc aacctgtagg attagtgtac 960cggcgtgtta gaaatttgcc tgattgtaaa attgaggaat ggctaactgc taagtctgta 1020ccttctcctc tcaattggga gcgcaaaaca tttcaaaatt gtaacttcga cctgagcagt 1080ctattaagat ttgttcaggc tgagtcactc tcatgtagta atatagatgc ttccaaggtt 1140tatggtatgt gctttggtag tatatctata gacaagtttg cgatacccaa tagacgccga 1200gttgatttgc agctaggcaa ctctgggttt ttgcaatcct ttaattacaa aatagataca 1260agagctactt cgtgtcagct ctattatagt cttgcaaaaa ataatgtcac tgtcaataac 1320cataacccgt cctcttggaa caggcgttat gggttcaatg atgtggctac atttggaact 1380ggtaaacatg acgttgctta tgctgaggct tgttttaccg tgggagcatc atattgccct 1440tgcgcgaacc ccagcatagt gtcgccatgt accactggaa aacctaactt tgccaattgc 1500cctacaggca cctcgaatcg tgagtgcact gttatgccat tggctaataa tcaatttaag 1560tgtgattgca cttgtaaccc tagtcctcta accacctatg atcttagatg tctccaagca 1620agaagcatgc ttggcgtagg tgatcattgt gaaggtctag gagttttaga agataaatgt 1680ggtggcagca acacctgcaa ttgttctgct catgcctttg ttggctgggc taaggatagt 1740tgcttggcta atggccgctg tcacattttt agtaatttga tgttaaatgg cattaatagt 1800ggtactacat gttccatgga tttgcaattg cctaatactg aagtggtcac tggcgtctgc 1860gtcaaatatg acctctacgg tataacaggc caaggtattt ttaaggaggt taaggctgac 1920tattatcata gttggcaaaa cctcttatat gatgttaatg gcaacttaat cggatttcgc 1980gattttgttg ctaataagag ttatactatt cgaagttgct atagtgggcg ggtctcggct 2040
gcatatcatc aagatgcacc agaaccagcg ctactatatc gcaatttaaa atgtgactat 2100gtctttaaca acaacatatc ccgtgaggag acaccactta actatttcga tagttatctt 2160ggttgtgttg ttaatgctga caactcaact gaagaagctg ttgacgcgtg tgatttgcgt 2220atgggtagtg ggctttgtgt caactattca acgtctcacc gcgctcgcag ctctgtcagc 2280acgggttata aattaactac ttttgaacca tttacagtcc gcattgtcaa tgatagtgtt 2340gagtctgttg atgggttata tgagctgcaa ataccaacca actttactat agctagccat 2400caggagttcg ttcaaacgag gtctccaaag gttactatag actgtgctgc atttgtctgt 2460ggtggccaca cagcatgccg tcagcagttg gttgagtacg gctcattctg tgataatatt 2520aatgccattc ttggcgaggt aaataacctc atagatacta tgcaacttca agttgcaagt 2580gctttaatcc aaggtgtcac gttaagctca cgcttatcgg atggcattgg tggtcaaata 2640gatgatatta attttagtcc tctgcttggt tgtttaggtt ctgactgtgg cgaagttacc 2700atggcagctc aaaccggacg atctgctata gaggatgtat tatttgacaa agtcaaactc 2760tctgatgttg gctttgtcga agcatataac aattgcactg gaggccaaga agttagagac 2820ctactttgtg tgcaatcttt taatggcatc aaagtgctac cgcctgtgtt gtctgagaat 2880caaatttctg gttatacagc gggagctact gtatctgcta tgttcccatg gtctgcagct 2940gcaggtgtgc cattttcttt aagtgttcaa tatagaatta atggtcttgg tgtcactatg 3000aatgttctta gtgaaaatca gaaaatgata gcaagtgcat ttaacaacgc gataggtgct 3060atacaggaag ggtttgctgc aaccaattct gccttagcaa aaatgcagtt cgttgtcaat 3120gcaaatgcgg aagcactcaa taatttatta aaccagcttt ccaataggtt cggtgcaatt 3180agtgcttctt tacaagaaat tctatctcgc ctagatgctc ttgaagcgca ggctcagata 3240gaccgtctta ttaatggcag attaactgca cttaatgcat atgtctctaa gcagctgagt 3300gacatgaccc ttgttaaggt gagtgcagcc caggctatag agaaagttaa tgagtgtgtt 3360aaaagccaat catctaggat aaatttctgt ggcaatggca atcatatatt gtcattagtc 3420cagaatgcgc cttatggttt atattttatt catttcagct atgtgcctac ttcctttaca 3480acggcaaatg tgagtcctgg gctatgcatt tctggtgata gaggattagc acctaaagct 3540ggatattttg ttcaagatga tggagagtgg aagttcacag gtagtaatta ttattaccct 3600gaacccatta cagataaaaa tagtgtcgtg atgagtagtt gcgcagcaaa ctacacaaag 3660gcacctgaag ttttcttgaa cacttcaata cctaatctac ccgactttaa ggaggagtta 3720gataaatggt ttaaaaatca gacgtctatt gcgcctgatt tatctctcga tttcgagaaa 3780ttaaacgtta ccctcctgga cctgactgat gagatgaaca ggattcagga tgcaattaag 3840aagttaaatg agagttacat caacctcaag gacgttggca catatgaaat gtatgtgaaa 3900tggccttggt atgtgtggtt gctaattgga ttagctggtg tagctgtttg tgtgttgtta 3960tttttcatat gttgctgcac gggttgtggc tcatgttgtt tcaagaagtg tggaaattgt 4020tgtgatgagt gtggaggaca ccaggacagt attgtgatac ataatatttc ctctcatgag 4080gattga4086<210>12<211>4083<212>DNA<213>大鼠冠状病毒<400>12atgctattcg tgtttttaac cctattgccc tcttgtctag ggtatattgg tgattttaga 60tgtatcaacc ttgtaaacac ccgcatttct aatgcgcgcg cacccagtgt tagcacagag 120gtagttgatg tttctaaagg tcttggtaca tattacgttt tagatcgtgt ttatttaaat 180gccacgttat tgcttactgg ttactaccct gtagatgggt ccatgtatcg taacatggct 240ctaatgggta ctaatacctt aagccttaat tggtttgaac cgcccttttt atcagagttt 300aacgatggca tatatgctaa ggtaaagaac ctcaaagcat ctttgcccat aggctcggct 360tcatactttc ctactataat tataggtagt aattttgtta atacttccta tactgtagta 420ttggaaccat acaatggtat tattatggca tctatttgcc agtataccat ttgtcaatta 480ccgcacacgg attgcaaacc taacacgggc ggtaacacgc taattggttt ttggcacaca 540gatttaaggc ctccggtgtg cattttaaag cgtaatttta cgtttaatgt taatgccgaa 600tggctttatt ttcattttta ccagcagggt ggtacttttt atgcgtatta tgcagatgtt 660tcttctgcca ctacgttttt gtttagttcg tatattggtg ctgtgttaac acagtatttt 720gtgttgcctt atatgtgtag tcccactacc tcaggtgttt cctcaccgca gtattgggtt 780acaccacttg ttaagcgcca atatttattt aattttaacc aaaagggtat tattactagc 840gctgttgatt gtgctagtag ttataccagt gaaataaagt gtaagactca aagtatgaat 900
cccaatacgg gagtctatga tttatccggt tacaccgtcc aacctgtagg actagtgtac 960cggcgtgtta gaaatttgcc tgattgtaaa attgaggaat ggttggctgc taacacagta 1020ccctctcctc tcaattggga gcgcaaaaca tttcaaaatt gtaacttcaa cctgagcagt 1080ctattaagat ttgttcaggc tgagtcactc tcatgtagta atatagatgc ttccaaggtt 1140tatggaatgt gctttggtag catatctata gataaatttg caatacccaa cagtcgccgt 1200gttgatcttc agctaggtaa atcgggtctt ttgcaatctt ttaattataa aattgataca 1260agagcgacct cgtgtcagct ctattacagt cttgcacaag ataatgtcac tgtcattaac 1320cacaacccat cctcctggaa taggcgttat ggatttaatg acgtggctac atttcatagt 1380ggtgaacatg acgttgctta tgcagaggca tgtttcactg ttggagcttc atattgccct 1440tgtgcgaagc ccagcacagt ctattcatgt gtcacaggta aacctaagtc tgctaattgc 1500ccaacaggta cctcgaatcg tgagtgtaat gttcaggctt caggttttaa gtctaagtgc 1560gattgcacat gtaaccctag tcctctaacc acctatgatc ctagatgtct tcaagcgcgg 1620agcatgcttg gcgtaggtga tcattgtgaa ggtctaggta ttttagaaga taaatgtggt 1680ggcagcaaca tatgcaattg ttcggctgat gcctttgttg gctgggctat ggacagctgt 1740ctatctaatg cccgctgcca tatttttagt aatttgatgt taaatggcat taatagtggt 1800actacatgtt ccacggattt tcaattgcct aatacggaag tggtcactgg cgtttgtgtc 1860aagtatgacc tctacggtag tacaggccaa ggtgttttta aggaggttaa ggctgattat 1920tacaatagtt ggcagaacct cttatatgat gttaatggta acttaaatgg tttccgtgac 1980attgttacca ataagactta tttattaaga agttgctata gtgggcgcgt ttcggctgca2040tatcatcaag atgcacctga accagcgcta ctatatcgca atttaaaatg tgattatgtg 2100tttaataaca acatatcccg tgaggagaca ccacttaact attttgatag ttatttgggt 2160tgtgttatta atgctgataa ctcaactgag cagtctgttg acgcgtgtga tttgcgtatg 2220ggtagtgggc tttgtgtcaa ctattcaatc gctcaccgtg cgcgcaggtc tgtcagtacg 2280ggttataaat taactacttt tgaaccattt acagtcagca ttgtcaatga tagtgttgag 2340tctgttggtg gattatatga gatgcaaata cctactaatt ttactatagc tagccatcag 2400gagttcattc aaacgaggtc tccgaaggtt actatagatt gtgctgcatt tgtctgtggt 2460gattatacag cgtgtagaca acagttggtt gattatggct ctttttgtga taatattaat 2520gccattcttg gcgaggtgaa taacctcata gatactatgc aattacaagt tgctagtgct 2580ctgatccaag gtgtcacgct aagttcacgc ttggcagatg gcatctcagg tcagattgat 2640gatattaatt ttagtcctct tctaggttgc cttggctcag attgtagcga aggcaccaag 2700gcagcgcaag ggcgatctgc tatagaggat gtattatttg ataaggtcaa actctctgat 2760gttggctttg tcgaatcata taataattgc actggaggtc aagaagttag agacctactt 2820tgtgtgcaat cttttaatgg cattaaagtg ctaccgcctg tattatccga gagtcaaatc 2880tctggttata cagcgggagc tactgcatct gctatgttcc ctccatggtc tgcagctgca 2940ggtgtgccat ttgctttaag tgttcaatat agaattaatg gtcttggtgt cactatgaat 3000gttcttagtg aaaaccagaa aatgatagct agttcattta acaacgcgat aggtgctata 3060caggaagggt tcgatgcaac caattctgct ttagcgaaaa ttcagtccgt tgtcaacgca 3120aatgcagaag cactcaataa ccttttgaat cagctttcca ataggtttgg tgcaattagt 3180gcttctttac aggaaattct atctcgcctc gatgctcttg aagctcaggc tcagatagac 3240cgtcttatta atggcagatt aactgcactt aatgcatatg tctctaagca gctgagcgac 3300atgaccctta ttaaggtgag tgctgcccag gctatagaga aagttaatga gtgtgttaaa 3360agccaatcac ctaggataaa tttctgtggc aatggcaatc atatattgtc attagtccag 3420aatgcgcctt acggtttata ttttattcat ttcagctatg tgcctacatc ctttacaacg 3480gtaaatgtga gtcctggact atgcatttct ggtgatagag gattagcacc taaagctgga 3540tattttgttc aagatcatgg agaatggaag ttcacaggta gcaattatta ctaccctgaa 3600tccattacag ataaaaacag tgtcgtgatg agtagttgcg cagtaaacta cacaaaggca 3660cctgaagttt tcttgaacac ttcaataact aatctacccg actttaagga ggagttagat 3720aaatggttta agaatcagac gtctattgtg cctgatttat ctttcgatat cgggaaatta 3780aatgttacat tccttgacct gtcctatgag atgaacagga ttcaggatgc aattaagaat 3840ttaaatgaga gttacatcaa cctcaaggaa attggcacat atgagatgta tgtgaaatgg 3900ccttggtatg tttggctgct aattggatta gctggtgtag ctgtttgtgt tttgttattt 3960tttatatgtt gctgcacagg ttgtggctct tgttgtttta agaaatgtgg aaattgttgt 4020gatgagtatg gaggacgtca ggcaggtatt gtgatacata atatttcctc tcatgaggat 4080tga 4083
<210>13<211>3489<212>DNA<213>传染性支气管炎病毒<400>13atgttggtaa cacctctttt actagtgact cttttgtgtg cactatgtag tgctgttttg 60tatgacagta gttcttacgt ttactactac caaagtgcct tcagaccacc tagtggttgg 120catttacaag ggggtgctta tgcggtagtt aacatttcta gcgaatttaa taatgcaggc 180tcttcatcag ggtgtactgt tggtattatt catggtggtc gtgttgttaa tgcttcttct 240atagctatga cggcaccgtc atcaggtatg gcttggtcta gcagtcagtt ttgtactgca 300cactgtaatt tttcagatac tacagtgttt gttacacatt gttataaaca tggtgggtgt 360cctttaactg gcatgcttca acagaatctt atacgtgttt ctgctatgaa aaatggccag 420cttttctata atttaacagt tagtgtagct aagtacccta cttttagatc atttcagtgt 480gttaataatt taacatccgt atatttaaat ggtgatcttg tttacacctc taatgagacc 540atagatgtta catctgcagg tgtttatttt aaagctggtg gacctataac ttataaagtt 600atgagagaag ttaaagccct ggcttatttt gttaatggta ctgcacaaga tgttattttg 660tgtgatggat cacctagagg cttgttagca tgccagtata atactggcaa tttttcagat 720ggcttttatc cttttactaa tagtagttta gttaagcaga agtttattgt ctatcgtgaa 780aatagtgtta atactacttg tacgttacac aatttcattt ttcataatga gactggcgcc 840aaccctaatc ctagtggtgt tcagaatatt caaacttacc aaacaaaaac agctcagagt 900ggttattata attttaattt ttcctttctg agtagttttg tttataagga gtctaatttt 960atgtatggat cttatcaccc aagttgtaaa tttagactag aaactattaa taatggcttg 1020tggtttaatt cactttcagt ttcaattgct tacggtcctc ttcaaggtgg ttgcaagcaa 1080tctgtcttta aaggtagagc aacttgttgt tatgcttatt catatggagg tccttcgctg 1140tgtaaaggtg tttattcagg tgagttagat cataattttg aatgtggact gttagtttat 1200gttactaaga gcggtggctc tcgtatacaa acagccactg aaccgccagt tataactcaa 1260aacaattata ataatattac tttaaatact tgtgttgatt ataatatata tggcagaact 1320ggccaaggtt ttattactaa tgtgaccgac tcagctgtta gttataatta tctagcagac 1380gcaggtttgg ctattttaga tacatctggt tccatagaca tctttgttgt acaaggtgaa 1440tatggtctta attattataa ggttaaccct tgcgaagatg tcaaccagca gtttgtagtt 1500tctggtggta aattagtagg tattcttact tcacgtaatg agactggttc tcagcttctt 1560gagaaccagt tttacatcaa aatcactaat ggaacacgtc gttttagacg ttctattact 1620gaaaatgttg caaattgccc ttatgttagt tatggtaagt tttgtataaa acctgatggc 1680tcaattgcca caatagtacc aaaacaattg gaacagtttg tggcaccttt atttaatgtt 1740actgaaaatg tgctcatacc taacagtttc aacttaactg ttacagatga gtacatacaa 1800acgcgtatgg ataaggtcca aattaattgc ctgcagtatg tttgtggcag ttctctggat 1860tgtagaaagt tgtttcaaca atatgggcct gtttgcgaca acatattgtc tgtagtaaat 1920agtgttggtc aaaaagaaga tatggaactt ttgaatttct attcttctac taaaccggct 1980ggttttaata caccagttct tagtaatgtt agcactggtg agtttaatat ttctcttctg 2040ttaacaaatc ctagtagtcg tagaaagcgt tctcttattg aagaccttct atttacaagc 2100gttgaatctg ttggactacc aacaaatgac gcatataaaa attgcactgc aggaccttta 2160ggctttttta aggaccttgc gtgtgctcgt gaatataatg gtttgcttgt gttgcctcct 2220atcataacag cagaaatgca agctttgtat actagttctc tagtagcttc tatggctttt 2280ggtggtatta ctgcagctgg tgctatacct tttgccacac aactgcaggc tagaattaat 2340cacttgggta ttacccagtc acttttgttg aagaatcaag aaaaaattgc tgcttccttt 2400aataaggcca ttggtcatat gcaggaaggt tttagaagta catctctagc attacaacaa 2460attcaagatg ttgttagtaa acagagtgct attcttactg agactatggc atcacttaat 2520aaaaattttg gtgctatttc ttctgtgatt caagaaatct accagcaatt tgacgccata 2580caagcaaatg ctcaagtgga tcgtcttata actggtagat tgtcatcact ttctgtttta 2640gcatctgcta agcaggcgga gtatattaga gtgtcacaac agcgtgagtt agctactcag 2700aaaattaatg agtgtgttaa gtcacagtct attaggtact ccttttgtgg taatggacga 2760catgttctaa ccataccgca aaatgcacct aatggtatag tgtttataca cttttcttat 2820actccagata gttttgttaa tgttactgca atagtgggtt tttgtgtaaa gccagctaat 2880gctagtcagt atgcaatagt gcccgctaat ggtaggggta tttttataca agttaatggt 2940agttactaca tcactgcacg agatatgtat atgccaagag ctattactgc aggagatgta 3000gttacgctta cttcttgtca agcaaattat gtaagtgtaa ataagaccgt cattactaca 3060ttcgtagaca atgatgattt tgattttaat gacgaattgt caaaatggtg gaatgatact 3120
aagcatgagc taccagactt tgacaaattc aattacacag tacctatact tgacattgat 3180agtgaaattg atcgtattca aggcgttata cagggtctta atgactctct aatagacctt 3240gaaaaacttt caatactcaa aacttatatt aagtggcctt ggtatgtgtg gttagccata 3300gcttttgcca ctattatctt catcttaata ctaggatggg ttttcttcat gactggttgt 3360tgtggttgtt gttgtggatg ctttggcatt atgcctctaa tgagtaagtg tggtaagaaa 3420tcttcttatt acacgacttt tgataacgat gtggtaactg aacaatacag acctaaaaag 3480tctgtttga 3489<210>14<211>36<212>DNA<213>SARS冠状病毒GD69<400>14cccacgccag aaggtagatc acgaactaca cgtggg 36<210>15<211>95<212>DNA<213>SARS冠状病毒GD69<400>15ctctatgttt ataagggcta tcaacctata gatgtagttc gtgatctacc ttctggtttt 60aacactttga aacctatttt taagttgcct cttgg95<210>16<211>26<212>DNA<213>人工序列<220>
<223>人工序列描述合成引物<400>16ctctatgttt ataagggcta tcaacc 26<210>17<211>27<212>DNA<213>人工序列<220>
<223>人工序列描述合成引物<400>17ccaagaggca acttaaaaat aggtttc 27<210>18<211>12<212>DNA<213>人工序列
<220>
<223>人工序列描述合成引物<400>18aggctgtaag aa 12<210>19<211>38<212>DNA<213>人工序列<220>
<223>人工序列描述合成引物<400>19gcccacgcca gaaggtagat cacgaactac acgtgggc 38<210>20<211>45<212>DNA<213>人工序列<220>
<223>人工序列描述合成引物<400>20taatacgact cactataggc tctatgttta taagggctat caacc 45<210>21<211>39<212>DNA<213>人工序列<220>
<223>人工序列描述合成引物<400>21aggctgtaag aaccaagagg caacttaaaa ataggtttc39<210>22<211>231<212>DNA<213>SARS冠状病毒urbani<400>22atgtactcat tcgtttcgga agaaacaggt acgttaatag ttaatagcgt acttcttttt 60cttgctttcg tggtattctt gctagtcaca ctagccatcc ttactgcgct tcgattgtgt 120gcgtactgct gcaatattgt taacgtgagt ttagtaaaac caacggttta cgtctactcg 180cgtgttaaaa atctgaactc ttctgaagga gttcctgatc ttctggtcta a 231
<210>23<211>231<212>DNA<213>SARS冠状病毒Tor2<400>23atgtactcat tcgtttcgga agaaacaggt acgttaatag ttaatagcgt acttcttttt 60cttgctttcg tggtattctt gctagtcaca ctagccatcc ttactgcgct tcgattgtgt 120gcgtactgct gcaatattgt taacgtgagt ttagtaaaac caacggttta cgtctactcg 180cgtgttaaaa atctgaactc ttctgaagga gttcctgatc ttctggtcta a 231<210>24<211>234<212>DNA<213>人冠状病毒OC43<400>24atgttcctta agctagtgga tgatcatgct ttggttgtta atgtactact ctggtgtgtg 60gtgcttatag tgatactact agtgtgtatt acaataatta aactaattaa gctttgtttc 120acttgccata tgttttgtaa tagaacagtt tatggcccca ttaaaaatgt gtaccacatt 180taccaatcat atatgcacat agaccctttc cctaaacgag ttattgattt ctaa 234<210>25<211>231<212>DNA<213>猪流行性腹泻病毒<400>25atgctacaat tagtgaatga taatggtcta gtagttaatg ttatactttg gcttttcgta 60ctctttttcc tgcttattat aagcattacc ttcgtccaat tggttaatct gtgcttcact 120tgtcaccggt tgtgtaatag cgcagtttat acacctatag ggcgcctgta tagagtttat 180aagtcttaca tgcgaattga ccccctcccc agtactgtta ttgacgtata a 231<210>26<211>249<212>DNA<213>传染性胃肠炎病毒<400>26atgacgtttc ctagggcatt gactgtcata gatgacaatg gaatggtcat taacatcatt 60ttctggttcc tgttgataat tatattgata ttactttcaa tagcattgct aaatataatt 120aagctatgca tggtgtgttg caatttagga aggacagtta ttattgttcc agcgcaacat 180gcttacgatg cctataagaa ttttatgcga attaaagcat acaaccccga tggagcactc 240cttgcttga 249<210>27<211>249<212>DNA<213>猪呼吸冠状病毒<400>27atgacgtttc ctagggcatt gactgtcata gatgacaacg gaatggtcat tagcatcatt 60
ttttggttcc tgttgataat tatattgata ttactttcaa tagcattgct aaatataatt 120aagctatgca tggtgtgttg caatttagga aggacagtta ttattgttcc agtgcaacat 180gcttacgatg cctataagaa ttttatgcga attaaagcat acaaccctga tggagcactc 240cttgtttga 249<210>28<211>249<212>DNA<213>犬科冠状病毒属<400>28atgacgttcc ctcgggcatt gactgtcata gatgacaatg gaatggtcat tagtatcatt 60ttctggttcc tgttgataat tatattgata ttattttcaa tagcattgct aaatataatt 120aagctatgca tggtatgttg caatttagga agaacagtta ttattgttcc agctcgacat 180gcctatgatg cctataagaa ttttatgcaa attagagcat acaaccctga tgaagcactc 240cttgtttga 249<210>29<211>249<212>DNA<213>猫科冠状病毒<400>29atgacgttcc ctagggcatt tactatcata gatgaccatg gcatggttgt tagcgtcttc 60ttctggctcc tgttgataat tatattgata ttgttttcaa tagcattgct aaatgttatt 120aaattgtgca tggtatgttg caatttgggt aagactatta tagtactacc tgcacgccat 180gcatatgatg cctataagac ctttatgcaa accaaggcat ataatcccga cgaagcattt 240ttggtttga 249<210>30<211>267<212>DNA<213>鼠肝炎病毒<400>30atgtttaatt tattccttac agatacagta tggtatgtgg ggcagattat ttttatagtc 60gcagtgtgtt tgatggtcac cataatagtg gttgccttcc ttgcgtctat caaactttgt 120attcaacttt gcggtttgtg taatactttg ttgctgtctc cttctatttg tgtgtataat 180aggagtaagc agctttataa gtattataat gaagaagtga gaccgccccc gttagaggtg 240gatgatataa taatccaaac attatga 267<210>31<211>267<212>DNA<213>大鼠冠状病毒<400>31atgtttaatt tattccttat agacacagta tggtacgtgg ggcagattat ttttatagtc 60gcagtgtgtt tgatggtcac cataattgtg gttgccttcc ttgcgtctat taaactttgt 120attcaacttt gcggtttgtg taatactttg ttgctgtctc cttctattta tgtgtataat 180aggagtaagc agctttataa gtattataat gaagaagtga gaccgccccc gttagaggtg 240gatgatataa taatccaaac attatga 267
<210>32<211>255<212>DNA<213>牛冠状病毒<400>32atgtttatgg ctgatgctta ttttgcagac actgtgtggt atgtggggca aataattttt 60atagttgcca tttgtttatt ggttataata gttgtagtgg catttttggc aacttttaaa 120ttgtgtattc aactttgcgg tatgtgtaat accttagtac tgtccccttc tatttatgtg 180tttaatagag gtaggcagtt ttatgagttt tacaacgatg taaaaccacc agttcttgat 240gtggatgacg tttag 255<210>33<211>327<212>DNA<213>传染性支气管炎病毒<400>33atgaatttat tgaataagtc gctagaggag aatggaagtt ttctaacagc gctttacata 60attgtaggat ttttagcact ttatcttcta ggtagagcac ttcaagcatt tgtacaggct 120gctgatgctt gttgtttatt ttggtataca tgggtagtaa ttccaggagc taagggtaca 180gcctttgtat acaagtatac atatggtaga aaacttaaca atccggaatt agaagcagtt 240attgttaacg agtttcctaa gaacggttgg aataataaaa atccagcaaa ttttcaagat 300gcccaacgag acaaattgta ctcttga 327<210>34<211>38<212>DNA<213>SARS冠状病毒GD69<400>34cctccgcacg aaagcaagaa aaagaagtac gccggagg 38<210>35<211>95<212>DNA<213>SARS冠状病毒GD69<400>35cggaagaaac aggtacgtta atagttaata gcgtacttct ttttcttgct ttcgtggtat 60tcttgctagt cacactagcc atccttactg cgctt95<210>36<211>24<212>DNA<213>人工序列<220>
<223>人工序列描述合成引物<400>36cggaagaaac aggtacgtta atag24
<210>37<211>20<212>DNA<213>人工序列<220>
<223>人工序列描述合成引物<400>37aagcgcagta aggatggcta 20<210>38<211>14<212>DNA<213>人工序列<220>
<223>人工序列描述合成引物<400>38tattgcagca gtac 14<210>39<211>40<212>DNA<213>人工序列<220>
<223>人工序列描述合成引物<400>39gcctccgcac gaaagcaaga aaaagaagta cgccggaggc 40<210>40<211>43<212>DNA<213>人工序列<220>
<223>人工序列描述合成引物<400>40taatacgact cactataggc ggaagaaaca ggtacgttaa tag 43<210>41<211>34<212>DNA<213>人工序列
<220>
<223>人工序列描述合成引物<400>41tattgcagca gtacaagcgc agtaaggatg gcta 34<210>42<211>789<212>DNA<213>传染性胃肠炎病毒<400>42atgaagattt tgttaatatt agcgtgtgtg attgcatgcg catgtggaga acgctattgt 60gctatgaaat ccgatacaga tttgtcatgt cgcaatagta cagcgtctga ttgtgagtca 120tgcttcaacg gaggcgatct tatttggcat cttgcaaact ggaacttcag ctggtctata 180atattgatcg tttttataac tgtgctacaa tatggaagac ctcaattcag ctggttcgtg 240tatggcatta aaatgcttat aatgtggcta ttatggcccg ttgttttggc tcttacgatt 300tttaatgcat actcggaata ccaagtgtcc agatatgtaa tgttcggctt tagtattgca 360ggtgcaattg ttacatttgt actctggatt atgtattttg taagatccat tcagttgtac 420agaaggacta agtcttggtg gtctttcaac cctgaaacta aagcaattct ttgcgttagt 480gcattaggaa gaagctatgt gcttcctctc gaaggtgtgc caactggtgt cactctaact 540ttgctttcag ggaatttgta cgctgaaggg ttcaaaattg caggtggtat gaacatcgac 600aatttaccaa aatacgtaat ggttgcatta cctagcagga ctattgtcta cacacttgtt 660ggcaagaagt tgaaagcaag tagtgcgact ggatgggctt actatgtaaa atctaaagct 720ggtgattact caacagaggc aagaactgat aatttgagtg agcaagaaaa attattacat 780atggtataa 789<210>43<211>789<212>DNA<213>猪呼吸冠状病毒<400>43atgaagattt tgttgatatt agcgtgtgcg attgcatgca catgtggaga acgctattgt 60gctatgaaag acgatacagg tttgtcatgt cgcaatggca cggcgtctga ttgtgagtca 120tgcttcaaca gaggcgatct tatttggctt cttgcaaact ggaacttcag ctggtctata 180atattgatca tttttattac tgtgctacaa tatggaagac ctcaattcag ctggttcgtg 240tatggcatta aaatgcttat aatgtggcta ttatggccga ttgttttggc tcttacgatt 300tttaatgcat actcggaata ccaagtgtcc aggtatgtaa tgttcggctt tagtattgca 360ggtgcaattg ttacatttgt actctggatt atgtattttg taagatccat tcagttgtac 420agaaggacta agtcttggtg gtccttcaac cctgaaacta acgcaattct ttgcgttagt 480gcattaggaa gaagctatgt gcttcctctc gaaggtgtgc caactggtgt cactctaact 540ttgctttcag ggaatttgta cgctgaaggg ttcaaaattg caggtggtat gaccatcgac 600aatttgccaa aatacgtaat ggttgcatta cccagcagga ctattgttta cacacttgtt 660ggcaagaagt tgaaagcaag tagtgcgact ggatgggctt actatgtaaa atctaaagct 720ggtgattact caacagaggc aagaactgat aatttgagtg agcaagaaaa attattacat 780atggtataa 789<210>44<211>789<212>DNA<213>犬科冠状病毒
<400>44atgaagaaaa ttttgttttt actagcgtgt gcaattgcat gcgtctatgg agaacgctat 60tgtgccatga ctgaaagttc tacgtcatgt cgtaatagca cggctggcaa ctgtgcttca 120tgcttcgaaa caggtgatct tatttggcat cttgcaaact ggaacttcag ctggtctgta 180atattgatca tttttataac agtgttacaa tatggaagac ctcaatttag ctggttcgtg 240tgtggcatta aaatgcttat tatgtggctg ttatggccca ttgttttagc tcttacgatt 300tttaatgcat acctggaata ccgagtttcc agatatgtaa tgttcggctt tagtgttgca 360ggtgcaactg ttacatttat actttggatt atgtattttg ttagatccat tcagttatac 420agaaggacta agtcttggtg gtctttcaac cctgaaacta gcgcaattct ttgcgttagt 480gcgttaggaa gaagctatgt gcttcctctt gaaggtgtgc caactggtgt cactctaaca 540ttgctttcag ggaatttgtg tgctgaaggg ttcaaaattg caggtggtat gaacatcgac 600aatttaccaa aatatgtaat ggttgcatta cctgtcagaa ccatagtcta cacacttgtt 660ggcaagaaat tgaaagcaag tagtgcaaca ggatgggctt actatgtaaa gtctaaagct 720ggtgattact caacagatgc acgaactgat aatttgagtg agcatgaaaa attattacat 780atggtataa 789<210>45<211>870<212>DNA<213>猫科冠状病毒<400>45atgcatatga tgcctataag acctttatgc aaaccaaggc atataatccc gacgaagcat 60ttttggtttg aactaaacaa aatgaagtac attttgctaa tactcgcgtg cataattgca 120tgcgtttatg gtgaacgcta ctgtgccatg caagacagtg gcttgcagtg tattaatggc 180acaaattcaa gatgtcaaac ctgctttgaa cgtggtgatc ttatttggca tcttgctaac 240tggaacttca gctggtctgt aatattgatt gtttttataa cagtgttaca atatggcaga 300ccacaattta gctggctcgt ttatggcatt aaaatgctga tcatgtggct attatggcct 360attgttctag cgcttacgat ttttaatgca tactctgagt accaagtttc cagatatgta 420atgttcggct ttagtgttgc aggtgcagtt gtaacgtttg cactttggat gatgtatttt 480gtgagatctg ttcagctata tagaagaacc aaatcatggt ggtcttttaa tcctgagact 540aatgcaattc tttgtgttaa tgcattgggt agaagttatg tgcttccctt agatggtact 600cctacaggtg ttacccttac tctactttca ggaaatctat atgctgaagg tttcaaaatg 660gctggtggtt taaccatcga gcatttgcct aaatacgtca tgattgctac acctagtaga 720accatcgttt atacattagt tggaaaacaa ttaaaagcaa ctactgccac aggatgggct 780tactacgtaa aatctaaagc tggtgattac tcaacagaag cacgtactga caatttgagt 840gaacatgaaa aattattaca tatggtgtaa 870<210>46<211>678<212>DNA<213>人冠状病毒OC43<400>46atgtcaaatg acaattgtac gggtgacatt gtcacccatt tgaagaattg gaattttggt 60tggaatgtta ttctaaccat attcattgtt attcttcagt ttggacacta taaatactcc 120agattgtttt atggtttgaa gatgcttgta ctgtggcttc tttggccact cgtacttgct 180ttgtcaatct ttgacacctg ggctaattgg gattctaatt gggcctttgt tgcatttagc 240ttttttatgg ccgtatcaac actcgttatg tgggtgatgt acttcgcaaa cagtttcaga 300cttttccgac gtgctcgaac tttttgggca tggaatcctg aggttaatgc aatcactgtc 360acaaccgtgt tgggacagac atactatcaa cccattcaac aagctccaac aggcattact 420gtgaccttgc tgagcggcgt gctttacgtt gacggacata gattggcttc aggtgttcag 480gttcataacc tacctgaata catgacagtt gccgtgccga gcactactat aatttatagt 540agagtcggaa ggtccgtaaa ttcacaaaat agcacaggct gggttttcta cgtacgagta 600aaacacggtg atttttctgc agtgagctct cccatgagca acatgacaga aaacgaaaga 660ttgcttcatt ttttctaa 678
<210>47<211>681<212>DNA<213>猪流行性腹泻病毒<400>47atgtctaacg gttctattcc cgttgatgag gtgattgaac accttagaaa ctggaatttc 60acatggaata tcatactgac gatactactt gtagtgcttc agtatggcca ttacaagtac 120tctgtgttct tgtatggtgt caagatggct attctatgga tactttggcc tcttgtgttg 180gcactgtcac tttttgacgc atgggctagc ttccaggtca actgggtctt tttcgctttc 240agcatcctta tggcttgcat cactcttatg ctgtggataa tgtattttgt caatagcatt 300cggttgtggc gcaggacaca ttcttggtgg tctttcaatc ctgaaactga cgcgcttctc 360actacttctg tgatgggccg acaggtctgc attccagtgc ttggagcacc aactggtgta 420acgctaacac tccttagtgg tacattgctt gtagagggct ataaggttgc tactggcgta 480caggtaagtc aattacctaa tttcgtcaca gtcgccaagg ccactacaac aattgtctac 540ggacgtgttg gtcgttcagt caatgcttca tctggcactg gttgggcttt ctatgtccgg 600tcaaaacacg gcgactattc agctgtgagt aatccgagtg cggttctcac agatagtgag 660aaagtgcttc atttagtcta a 681<210>48<211>693<212>DNA<213>牛冠状病毒<400>48atgagtagtg taactacacc agcaccagtt tacacctgga ctgctgatga agctattaaa 60ttcctaaagg aatggaactt ttctttgggt attatactac tttttattac aatcatattg 120caatttggat atacaagtcg cagtatgttt gtttatgtta ttaagatgat cattttgtgg 180cttatgtggc cccttactat catcttaact attttcaatt gcgtgtatgc gttgaataat 240gtgtatcttg gcttttctat agttttcact atagtggcca ttatcatgtg gattgtgtat 300tttgtgaata gtatcaggtt gtttattaga actggaagtt ggtggagttt caacccagaa 360acaaacaact tgatgtgtat agatatgaag ggaaggatgt atgttaggcc gataattgag 420gactaccata cccttacggt cacaataata cgtggtcatc tttacatgca aggtataaaa 480ctaggtactg gctattcttt gtcagatttg ccagcttatg tgactgttgc taaggtctca 540cacctgctca cgtataagcg tggttttctt gacaagatag gcgatactag tggttttgct 600gtttatgtta agtccaaagt cggtaattac cgactgccat caacccaaaa gggttctggc 660atggacaccg cattgttgag aaataatatc taa 693<210>49<211>693<212>DNA<213>猪血凝性脑脊髓炎冠状病毒<400>49atgagtagtc caactacacc agtaccagtt attagctgga ctgctgatga agctattaaa 60ttcctaaagg aatggaattt ttctttgggt ataatagtac tctttatcac aatcatactt 120caatttggat atacaagtcg cagtatgttt gtttatgtta ttaagatggt tattctgtgg 180ctcatgtggc ctcttactat aattttaact atcttcaact gcgtatacgc gttgaataat 240gtgtaccttg gcttctctat agtttttact atagtggcca ttattatgtg ggttgtttat 300tttgtgaata gtatcaggtt gtttattaga actggaagtt ggtggagttt caacccagaa 360acaaacaact tgatgtgtat agatatgaag ggaagaatgt atgttaggcc gattattgag 420gactaccaca cccttactgc cacaataata cgtggccacc tctacatcca aggtataaaa 480ctaggtactg gctattcttt gtcagatttg cctgcttatg tgaccgttgc taaggttaca 540cacctgtgca catataagcg tggttttctt gataggatag gcgatactag tggttttgct 600
gtttatgtta agtccaaagt cggtaattat cgattgcctt caacccataa gggctcaggc 660atggacaccg cattgttgag aaataatatc taa 693<210>50<211>687<212>DNA<213>鼠肝炎病毒<400>50atgactagta ccactcaggc tccacagcct gtttatcagt ggacggctga tgaggcaatt 60cgattcctta aggaatggaa tttctctctc ggcattatac tactttttgt tactatcata 120ctacagttcg gttacacgag ccgtagcatg tttgtttatg ttgtgaaaat gatacttttg 180tggcttatgt ggccactaac tattgttttg tgtattttta actgcgtcta tgcgctaaat 240aatgtgtatc ttggattttc tatagtgttt actatagtgt ccattataat gtggattatg 300tattttgtta atagcatcag gttgtttatc aggactggca gctggtggag cttcaacccc 360gaaacaaaca acctaatgtg tatagatatg aaaggtactg tgtatgttag acccattata 420gaggattacc atacactaac agccactatc attcgtggtc acctctatat gcaaggtgtt 480aagctaggca ctggcttctc tttgtctgat ttgcctgctt atgttacagt tgctaaggtg 540tctcaccttt gcacttataa gcgcgcattc ttagacaagg tagacggtgt tagcggtttt 600gctgtttatg tgaagtccaa ggtcggaaat taccgactgc cctcaaataa accgagtggc 660atggacaccg cattgttgag aatctaa 687<210>51<211>687<212>DNA<213>大鼠冠状病毒<400>51atgagtagta ccactccagc cccccagact gtctatcaat ggacggccga tgtggcagtt 60cgattcctta aggaatggaa cttcttgttg ggcattatac tactctttat tactatcata 120ctacagttcg gttacacgag ccgtagcatg tttatatatg ttgtgaaaat gataatcttg 180tggttaatgt ggccactgac tattgttttg tgtattttta attgcgtgta tgcgctaaat 240aatgtgtatc ttggattttc tatagtgttt actatagtgt ccattgtaat gtggattatg 300tattttgtta atagcataag gttgtttatc aggactggta gctggtggag cttcaaccct 360gaaacaaaca acctaatgtg tatagatgtg aaaggtactg tgtatgttag acccattatt 420gaagattacc atacactaac agccacaaat gtacgtggcc acctttatat gcaaggtgtt 480aagctaggca ctggcttctc tttgtctgat ttgcccgctt atgttacagt tgctaaggtg 540tcgcaccttt gcacttataa gcgcgcattt ttagacaagg ttgacggtgt tagcggtttt 600gctgtttatg tgaagtccaa ggtcggtaat taccgactgc cctcaaataa accgagtggc 660gcggacaccg cattgttgag aatctaa 687<210>52<211>675<212>DNA<213>SARS冠状病毒urbani<400>52ttgcttatca tggcagacaa cggtactatt accgttgagg agcttaaaca actcctggaa 60caatggaacc tagtaatagg tttcctattc ctagcctgga ttatgttact acaatttgcc 120tattctaatc ggaacaggtt tttgtacata ataaagcttg ttttcctctg gctcttgtgg 180ccagtaacac ttgcttgttt tgtgcttgct gctgtctaca gaattaattg ggtgactggc 240gggattgcga ttgcaatggc ttgtattgta ggcttgatgt ggcttagcta cttcgttgct 300tccttcaggc tgtttgctcg tacccgctca atgtggtcat tcaacccaga aacaaacatt 360cttctcaatg tgcctctccg ggggacaatt gtgaccagac cgctcatgga aagtgaactt 420gtcattggtg ctgtgatcat tcgtggtcac ttgcgaatgg ccggacaccc cctagggcgc 480
tgtgacatta aggacctgcc aaaagagatc actgtggcta catcacgaac gctttcttat 540tacaaattag gagcgtcgca gcgtgtaggc actgattcag gttttgctgc atacaaccgc 600taccgtattg gaaactataa attaaataca gaccacgccg gtagcaacga caatattgct 660ttgctagtac agtaa 675<210>53<211>675<212>DNA<213>SARS冠状病毒Tor2<400>53ttgcttatca tggcagacaa cggtactatt accgttgagg agcttaaaca actcctggaa 60caatggaacc tagtaatagg tttcctattc ctagcctgga ttatgttact acaatttgcc 120tattctaatc ggaacaggtt tttgtacata ataaagcttg ttttcctctg gctcttgtgg 180ccagtaacac ttgcttgttt tgtgcttgct gctgtctaca gaattaattg ggtgactggc 240gggattgcga ttgcaatggc ttgtattgta ggcttgatgt ggcttagcta cttcgttgct 300tccttcaggc tgtttgctcg tacccgctca atgtggtcat tcaacccaga aacaaacatt 360cttctcaatg tgcctctccg ggggacaatt gtgaccagac cgctcatgga aagtgaactt 420gtcattggtg ctgtgatcat tcgtggtcac ttgcgaatgg ccggacactc cctagggcgc 480tgtgacatta aggacctgcc aaaagagatc actgtggcta catcacgaac gctttcttat 540tacaaattag gagcgtcgca gcgtgtaggc actgattcag gttttgctgc atacaaccgc 600taccgtattg gaaactataa attaaataca gaccacgccg gtagcaacga caatattgct 660ttgctagtac agtaa 675<210>54<211>678<212>DNA<213>传染性支气管炎病毒<400>54atgcccaacg agacaaattg tactcttgac tttgaacagt cagttcagct ttttaaagag 60tataatttat ttataactgc attcttgttg ttcttaacca taatacttca gtatggctat 120gcaacaagaa gtaaggttat ttatacactg aaaatgatag tgttatggtg cttttggccc 180cttaacattg cagtaggtgt aatttcatgt acatacccac caaacacagg aggtcttgtc 240gcagcgataa tacttacagt gtttgcgtgt ctgtcttttg taggttattg gatccagagt 300attagactct ttaagcggtg taggtcatgg tggtcattta atccagaatc taatgccgta 360ggttcaatac tcctaactaa tggtcaacaa tgtaattttg ctatagagag tgtgccaatg 420gtgctttctc caattataaa gaatggtgtt ctttattgtg agggtcagtg gcttgctaag 480tgtgaaccag accacttgcc taaagatata tttgtttgta caccggatag acgtaatatc 540taccgtatgg tgcagaaata tactggtgac caaagcggaa ataagaaaag gtttgctacg 600tttgtctatg caaagcagtc agtagatact ggcgagctag aaagtgtagc aacaggagga 660agtagtcttt acacataa 678<210>55<211>38<212>DNA<213>SARS冠状病毒GD69<400>55cctccgaccc aattaattct gtagacagca gccggagg 38
<210>56<211>107<212>DNA<213>SARS冠状病毒GD69<400>56cttgttttcc tctggctctt gtggccagta acacttgctt gttttgtgct tgctgctgtc 60tacagaatta attgggtgac tggcgggatt gcgattgcaa tggcttg 107<210>57<211>21<212>DNA<213>人工序列<220>
<223>人工序列描述合成引物<400>57cttgttttcc tctggctctt g 21<210>58<211>21<212>DNA<213>人工序列<220>
<223>人工序列描述合成引物<400>58caagccattg caatcgcaat c 21<210>59<211>14<212>DNA<213>人工序列<220>
<223>人工序列描述合成引物<400>59aagcaacgaa gtag 14<210>60<211>40<212>DNA<213>人工序列<220>
<223>人工序列描述合成引物
<400>60gcctccgacc caattaattc tgtagacagc agccggaggc 40<210>61<211>40<212>DNA<213>人工序列<220>
<223>人工序列描述合成引物<400>61taatacgact cactataggc ttgttttcct ctggctcttg 40<210>62<211>35<212>DNA<213>人工序列<220>
<223>人工序列描述合成引物<400>62aagcaacgaa gtagcaagcc attgcaatcg caatc35<210>63<211>1149<212>DNA<213>传染性胃肠炎病毒<400>63atggccaacc agggacaacg tgtcagttgg ggagatgaat ctaccaaaac acgtggtcgt 60tccaattccc gtggtcggaa gaataataac atacctcttt cattcttcaa ccccataacc 120ctccaacaag gttcaaaatt ttggaactta tgtccgagag actttgtacc caaaggaata 180ggtaacaggg atcaacagat tggttattgg aatagacaaa ctcgctatcg catggtgaag 240ggccaacgta aagagcttcc tgaaaggtgg ttcttctact acttaggtac tggacctcat 300gcagatgcca aatttaaaga taaattagat ggagttgtct gggttgccaa ggatggtgcc 360atgaacaaac caaccacgct tggtagtcgt ggtgctaata atgaatccaa agctttgaaa 420ttcgatggta aagtgccagg cgaatttcaa cttgaagtta atcaatcaag agacaattca 480aggtcacgct ctcaatctag atctcggtct agaaatagat ctcaatctag aggcaggcaa 540caattcaata acaagaagga tgacagtgta gaacaagctg ttcttgccgc acttaaaaag 600ttaggtgttg acacagaaaa acaacagcaa cgctctcgtt ctaaatctaa agaacgtagt 660aactctaaga caagagatac tacacctaag aatgaaaaca aacacacctg gaagagaact 720gcaggtaaag gtgatgtgac aagattttat ggagctagaa gcagttcagc caattttggt 780gacactgacc tcgttgccaa tgggagcagt gccaagcatt acccacaact ggctgaatgt 840gttccatctg tgtctagcat tctgtttgga agctattgga cttcaaagga agatggcgac 900cagatagaag tcacgttcac acacaaatac cacttgccaa aggatgatcc taagactgga 960caattccttc agcagattaa tgcctatgct cgtccatcag aagtggcaaa agaacagaga 1020aaaagaaaat ctcgttctaa atctgcagaa aggtcagagc aagatgtggt acctgatgca 1080ttaatagaaa attatacaga tgtgtttgat gacacacagg ttgagataat tgatgaggta 1140acgaactaa 1149
<210>64<211>1149<212>DNA<213>猪呼吸冠状病毒<400>64atggccaacc agggacaacg tgtcagttgg ggggatgaat ccaccaaaat acgtggtcgc 60tccaattccc gtggtcggaa gattaataac atacctcttt cattcttcaa ccccataacc 120ctccagcaag gtgcaaaatt ttggaactca tgtccgagag attttgtacc caaaggaata 180ggtaataggg atcaacagat tggttattgg aatagacaaa ctcgctatcg catggtgaag 240ggccaacgta aagagcttcc tgaaaggtgg ttcttttact acttaggcac tggacctcat 300gcagatgcca aatttaaaga taaattagat ggagttgtct gggttgccaa ggatggtgcc 360atgaacaaac caaccacgct tggtagtcgt ggtgctaata atgaatccaa agctttgaaa 420ttcgatggta aagtgccagg cgaatttcaa cttgaagtta accagtctag ggacaactca 480aggtcacgct ctcaatctag atcgcggtct agaaacagat ctcaatctag aggtaggcaa 540caatccaata acaagaagga tgacagtgta gaacaagctg ttcttgccgc acttaaaaag 600ttaggtgttt acacagaaaa acaacagcaa cgctctcgtt ctaaatctaa agaacgtagt 660aactctaaaa caagagatac tacgcctaag aatgaaaaca aacacacctg gaagagaact 720gcaggtaaag gtgatgtgac aagattttat ggagctagaa gcagctcagc caattttggt 780gacagtgacc tcgttgccaa tgggagcagt gccaagcatt acccacaatt ggctgaatgt 840gttccatctg tgtctagcat tttgtttgga agctattgga cttcaaagga agatggcgac 900cagatagaag tcacgttcac acacaaatac cacttgccaa aggatcatcc taaaactgaa 960caattccttc agcagattaa tgcctatgct agcccatcag aattggcaaa agaacagaga 1020aaaagaaagt ctcgttctaa atctgcagaa aggtcagagc aagaggtggt acctgattca 1080ttaatagaaa actatacaga tgtgtttgat gacacacagg ttgagatgat tgacgaggta 1140acgaactaa 1149<210>65<211>1146<212>DNA<213>犬科冠状病毒<400>65atggcctctc agggacaacg tgtcagttgg ggagatgaat ccaccaagag acgcggtcgt 60tctaattctc gtggccggaa gaataatgat atacctcttt cattcttcaa ccccattacc 120ctcgagcaag gatcaaagtt ttgggactta tgtccgagag actttgtacc caaaggaata 180ggtaataagg atcaacaaat tggttattgg aacaggcaaa cccgttatcg catggtgaag 240ggtcgacgta aaaatcttcc tgaaaagtgg ttcttctact atttaggaac tggacctcat 300gctgatgcca aatttaagca aaaattagat ggagttgtct gggttgctag gggagattcc 360atgactaagc caacaactct tggtactcgt ggcactaata atgaatcaaa ggctttgaaa 420ttcgatgtca aagtaccatc agaatttcac cttgaagtga accaattaag ggacaattca 480aggtctaggt ctcaatctag atctcagtcc agaaataggt ctcaatctag aggaaggcaa 540ctatccaata ataagaagga tgacaatgtt gaacaagctg ttcttgctgc actcaaaaag 600ttaggtgttg acacagaaaa acaacaaaga tctcgttcca aatctaagga acgtagcagc 660tctaagacaa gagatactac acctaagaat gaaaacaaac acacctggaa gagaactgca 720ggtaaaggtg atgtgacaaa attttatgga gctagaagta gttcagccaa ttttggtgac 780agcgatcttg ttgccaatgg gaacggtgcc aagcattacc cacaactggc tgaatgtgtt 840ccatctgtat ctagcattct gtttggaagc cattggactg ctaaggaaga tggtgaccag 900attgaagtca cattcacaca caaataccac ttgccaaagg atgatcctaa gactggacaa 960ttccttcagc agattaatgc atacgcccgt ccatcagagg tggctaaaga acagagacaa 1020cgcaaagctc gttctaaatc tgtagaaagg gtagagcaag aggttgtacc tgatgcatta 1080acagaaaatt acacagatgt gtttgatgac acacaggttg agattattga tgaggtaacg 1140aactaa1146
<210>66<211>1134<212>DNA<213>猫科冠状病毒<400>66atggccacac agggacaacg cgtcaactgg ggagatgaac cttccaaaag acgtggtcgt 60tctaactctc gtggtcggaa gaataatgat atacctttgt cattctacaa ccccattacc 120ctcgaacaag gatctaaatt ttggaattta tgtccgagag accttgttcc caaaggaata 180ggtaataagg atcaacaaat tggttattgg aatagacaga ttcgttatcg tattgtaaaa 240ggccagcgta aggaactcgc tgagaggtgg ttcttttact tcttaggtac aggacctcat 300gctgatgcta aattcaaaga caagattgat ggagtcttct gggttgcaag ggatggtgcc 360atgaacaagc ccacaacgct tggcactcgt ggaaccaata acgaatccaa accactgaga 420tttgatggta agataccgcc acagtttcag cttgaagtga accgttctag gaacaattca 480aggtctggtt ctcagtctag atctgtttca agaaacagat ctcaatctag aggaagacac 540cattccaata accagaataa taatgttgag gatacaattg tagccgtgct tgaaaaatta 600ggtgttactg acaaacaaag gtcacgttct aaacctagag aacgtagtga ttccaaacct 660agggacacaa cacctaagaa tgccaacaaa cacacctgga agaaaactgc aggcaaggga 720gatgtgacaa ctttctatgg tgctagaagt agttcagcta actttggtga tagtgatctc 780gttgccaatg gtaacgctgc caaatgctac cctcagatag ctgaatgtgt tccatcagtg 840tctagcataa tctttggcag tcaatggtct gctgaagaag ctggtgatca agtgaaagtc 900acgctcactc acacctacta cctgccaaag gatgatgcca aaactagtca attcctagaa 960cagattgacg cttacaagcg accttctgaa gtggctaagg atcagaggca aagaagatcc 1020cgttctaagt ctgctgataa gaagcctgag gagttgtctg taactcttgt ggaggcatac 1080acagatgtgt ttgatgacac acaggttgag atgattgatg aggttacgaa ctaa 1134<210>67<211>1269<212>DNA<213>SARS冠状病毒urbani<400>67atgtctgata atggacccca atcaaaccaa cgtagtgccc cccgcattac atttggtgga 60cccacagatt caactgacaa taaccagaat ggaggacgca atggggcaag gccaaaacag 120cgccgacccc aaggtttacc caataatact gcgtcttggt tcacagctct cactcagcat 180ggcaaggagg aacttagatt ccctcgaggc cagggcgttc caatcaacac caatagtggt 240ccagatgacc aaattggcta ctaccgaaga gctacccgac gagttcgtgg tggtgacggc 300aaaatgaaag agctcagccc cagatggtac ttctattacc taggaactgg cccagaagct 360tcacttccct acggcgctaa caaagaaggc atcgtatggg ttgcaactga gggagccttg 420aatacaccca aagaccacat tggcacccgc aatcctaata acaatgctgc caccgtgcta 480caacttcctc aaggaacaac attgccaaaa ggcttctacg cagagggaag cagaggcggc 540agtcaagcct cttctcgctc ctcatcacgt agtcgcggta attcaagaaa ttcaactcct 600ggcagcagta ggggaaattc tcctgctcga atggctagcg gaggtggtga aactgccctc 660gcgctattgc tgctagacag attgaaccag cttgagagca aagtttctgg taaaggccaa 720caacaacaag gccaaactgt cactaagaaa tctgctgctg aggcatctaa aaagcctcgc 780caaaaacgta ctgccacaaa acagtacaac gtcactcaag catttgggag acgtggtcca 840gaacaaaccc aaggaaattt cggggaccaa gacctaatca gacaaggaac tgattacaaa 900cattggccgc aaattgcaca atttgctcca agtgcctctg cattctttgg aatgtcacgc 960attggcatgg aagtcacacc ttcgggaaca tggctgactt atcatggagc cattaaattg 1020gatgacaaag atccacaatt caaagacaac gtcatactgc tgaacaagca cattgacgca 1080tacaaaacat tcccaccaac agagcctaaa aaggacaaaa agaaaaagac tgatgaagct 1140cagcctttgc cgcagagaca aaagaagcag cccactgtga ctcttcttcc tgcggctgac 1200atggatgatt tctccagaca acttcaaaat tccatgagtg gagcttctgc tgattcaact 1260caggcataa 1269
<210>68<211>1269<212>DNA<213>SARS冠状病毒Tor2<400>68atgtctgata atggacccca atcaaaccaa cgtagtgccc cccgcattac atttggtgga 60cccacagatt caactgacaa taaccagaat ggaggacgca atggggcaag gccaaaacag 120cgccgacccc aaggtttacc caataatact gcgtcttggt tcacagctct cactcagcat 180ggcaaggagg aacttagatt ccctcgaggc cagggcgttc caatcaacac caatagtggt 240ccagatgacc aaattggcta ctaccgaaga gctacccgac gagttcgtgg tggtgacggc 300aaaatgaaag agctcagccc cagatggtac ttctattacc taggaactgg cccagaagct 360tcacttccct acggcgctaa caaagaaggc atcgtatggg ttgcaactga gggagccttg 420aatacaccca aagaccacat tggcacccgc aatcctaata acaatgctgc caccgtgcta 480caacttcctc aaggaacaac attgccaaaa ggcttctacg cagagggaag cagaggcggc 540agtcaagcct cttctcgctc ctcatcacgt agtcgcggta attcaagaaa ttcaactcct 600ggcagcagta ggggaaattc tcctgctcga atggctagcg gaggtggtga aactgccctc 660gcgctattgc tgctagacag attgaaccag cttgagagca aagtttctgg taaaggccaa 720caacaacaag gccaaactgt cactaagaaa tctgctgctg aggcatctaa aaagcctcgc 780caaaaacgta ctgccacaaa acagtacaac gtcactcaag catttgggag acgtggtcca 840gaacaaaccc aaggaaattt cggggaccaa gacctaatca gacaaggaac tgattacaaa 900cattggccgc aaattgcaca atttgctcca agtgcctctg cattctttgg aatgtcacgc 960attggcatgg aagtcacacc ttcgggaaca tggctgactt atcatggagc cattaaattg 1020gatgacaaag atccacaatt caaagacaac gtcatactgc tgaacaagca cattgacgca 1080tacaaaacat tcccaccaac agagcctaaa aaggacaaaa agaaaaagac tgatgaagct 1140cagcctttgc cgcagagaca aaagaagcag cccactgtga ctcttcttcc tgcggctgac 1200atggatgatt tctccagaca acttcaaaat tccatgagtg gagcttctgc tgattcaact 1260caggcataa 1269<210>69<211>1347<212>DNA<213>牛冠状病毒<400>69atgtctttta ctcctggtaa gcaatccagt agtagagcgt cctttggaaa tcgttctggt 60aatggcatcc ttaagtgggc cgatcagtcc gaccaatcta gaaatgttca aaccaggggt 120agaagagctc aacccaagca aactgctact tctcagctac catcaggagg gaatgttgta 180ccctactatt cttggttctc tggaattact cagtttcaaa aaggaaagga gtttgaattt 240gcagagggac aaggtgtgcc tattgcacca ggagtcccag ctactgaagc taaggggtac 300tggtacagac acaacagacg ttcttttaaa acagccgatg gcaaccagcg tcaactgctg 360ccacgatggt atttttacta tcttggaaca ggaccgcatg ccaaagacca gtatggcacc 420gatattgacg gagtcttctg ggtcgctagt aaccaggctg atgtcaatac cccggctgac 480attctcgatc gggacccaag tagcgatgag gctattccga ctaggtttcc gcctggcacg 540gtactccctc agggttacta tattgaaggc tcaggaaggt ctgctcctaa ttccagatct 600acttcacgcg catccagtag agcctctagt gcaggatcgc gtagtagagc caattctggc 660aacagaaccc ctacctctgg tgtaacacct gatatggctg atcaaattgc tagtcttgtt 720ctggcaaaac ttggcaagga tgccactaag ccacagcaag taactaagca gactgccaaa 780gaaatcagac agaaaatttt gaataagccc cgccagaaga ggagccccaat aaacaatgc 840actgttcagc agtgttttgg gaagagaggc cccaatcaga attttggtgg tggagaaatg 900ttaaaacttg gaactagtga cccacagttc cccattcttg cagaactcgc acccacagct 960ggtgcgtttt tctttggatc aagattagag ttggccaaag tgcagaattt gtctgggaat 1020cttgacgagc cccagaagga tgtttatgaa ttgcgctata atggtgcaat tagatttgac 1080agtacacttt caggttttga gaccataatg aaggtgttga atgagaattt gaatgcatat 1140caacaacaag atggtatgat gaatatgagt ccaaaaccac agcgtcagcg tggtcagaag 1200aatggacaag gagaaaatga taatataagt gttgcagcgc ctaaaagccg tgtgcagcaa 1260aataagagta gagagttgac tgcagaggac atcagccttc ttaagaagat ggatgagccc 1320
tatactgaag acacctcaga aatataa 1347<210>70<211>1350<212>DNA<213>猪血凝性脑脊髓炎冠状病毒<400>70atgtctttca ctcctggcaa gcagtccagc agtagagcgt cctctggaaa tcgttctggt 60aatggcatcc ttaagtgggc cgatcagtcc gaccagtcta gaaatgttca aaccaggggt 120agaagagttc aatccaagca aactgctact tctcagcaac catcaggagg gactgttgta 180ccctactatt cttggttctc tggaattact cagtttcaaa agggaaagga gtttgaattt 240gcagagggac aaggtgtgcc tattgcacca ggagtcccat ctactgaagc taaggggtac 300tggtacagac acaacagacg ttcttttaaa acagccgacg gcaatcagcg tcaactgctg 360ccacgatggt acttttacta cctgggaaca ggaccgcatg ccaaagacca gtacggcacc 420gacattgacg gagtcttctg ggtcgctagt aaccaggctg atattaatac cccggctgac 480attgtcgatc gggatccaag tagcgatgag gctattccga ctaggtttcc gcctggcacg 540gtactccctc aaggttacta tattgaaggc tcaggaaggt ctgctcctaa ttccagatct 600acttcgcgtg cacccaatag agcccctagt gcaggatcgc gtagtagagc caattctggc 660aatagaacct ctacccctgg tgtaacacct gacatggctg atcaaattgc tagtcttgtt 720ctggcaaaac ttggcaagga tgccactaag cctcagcaag taactaagca gactgccaaa 780gaggtcagac agaaaatctt gaataagccc cgccagaaga ggagccccaa caaacaatgc 840actgttcagc agtgttttgg gaagagaggc cccaatcaga attttggtgg tggagaaatg 900ttaaaacttg gaactagtga cccacagttc cccattcttg cagaactcgc acccacagct 960ggtgcgtttt tctttggatc aagattagag ttggccaaag tgcagaattt gtctgggaat 1020cctgacgagc cccagaagga tgtttatgaa ttgcgctata atggcgcgat tagatttgac 1080agcacactct caggttttga aaccattatg aaggtgctta accagaattt gaatgcctat 1140caacatcagg aagatgggat gatgaatatt agtcctaaac cacagcggca gcgtggtcag 1200aagaatggac aagtagaaaa tgataatgta agtgttgcag cgcctaaaag ccgtgtgcag 1260caaaataaga gtagagagtt gacagcagag gacatcagcc ttcttaagaa gatggatgag 1320ccctatactg aagatacctc agaaatataa 1350<210>71<211>1356<212>DNA<213>鼠肝炎病毒<400>71atgtcttttg ttcctgggca agaaaatgcc ggtagcagaa gctcctctgg aaaccgcgct 60ggtaatggca tcctcaagaa gaccacttgg gctgaccaaa ccgagcgtgg aaatagaggc 120agaaggaacc atcccaagca gactgcaact actcagccca atgccgggag tgtggttccc 180cattactctt ggttttcggg catcacccag tttcaaaagg gaaaggagtt ccagtttgca 240caaggacagg gagtgcctat tgccagtgga atccccgctt cagagcaaaa gggatattgg 300tatagacaca accgacgttc ttttaaaaca cctgatggcc agcacaagca gctactgccc 360agatggtatt tttactatct tggaacaggg ccccatgctg gcgcagagt atggcgacgat 420atcgaaggag ttgtctgggt cgcaagccaa caggccgaca ctaagaccac tgccgatgtt 480gttgaaaggg acccaagcag tcatgaggct attcctacta ggtttgcgcc cggcacggta 540ttgcctcagg gcttttatgt agaaggctcg ggaaggtctg cacctgctag tcgatctggt 600tcgcggtcac aatcccgtgg gccaaataat cgcgctagaa gcagttccaa ccagcgccag 660cctgcctctg ctgtaaaacc tgacatggcc gaagaaattg ctgctcttgt tttggctaag 720cttggtaaag atgccggcca gcccaagcag gtaactaagc aaagcgccaa agaagtcagg 780cagaaaattt taactaagcc tcgtcaaaag aggactccaa acaagcagtg cccagtgcag 840cagtgttttg ggaagagagg ccctaatcag aactttggag gctctgaaat gttaaaactt 900ggaactagtg atccgcagtt ccccattctt gcagagttgg ctccaacacc tagtgccttc 960ttctttggat ctaaattaga attggtcaaa aagaactctg gtggtgctga tgaacccacc 1020aaagatgttt atgaattgca gtattcaggt gcaattagat ttgatagtac tctacccggt 1080
tttgagacta tcatgaaagt gttgactgag aatttgaatg cctaccagga ccaagctggt 1140agtgtagatc tagtgagccc aaagcctcca agaagaggtc gtagacaggc tcaagaaaag 1200aaagatgaag tagataatgt aagcgttgca aagcccaaaa gcttggtgca gcgaaatgta 1260agtagagaat taacccccga ggatcgtagc ctgctggctc agatcctaga cgatggcgtt 1320gtgccagatg ggttggaaga tgactctaat gtgtaa 1356<210>72<211>1365<212>DNA<213>大鼠冠状病毒<400>72atgtcttttg ttcccggaca agaaaacgcc ggtagcagaa gctcctctgg aaaccgcgct 60ggtaatggaa tcctcaagaa gaccacttgg gctgaccaaa ccgagcgcgg acaaaataat 120ggaaatagag gcagaaggaa tcagcccaag cagactgcaa ctactcagcc caataccggg 180agtgtggttc cccattactc ttggttttcg ggcattaccc aattccagaa gggaaaagag 240ttccagtttg caggtggaca aggagtgcct attgccaatg gaatcccacc ttctgagcaa 300aagggatatt ggtatagaca caaccgtcgt tcttttaaaa cacctgatgg gcagcagaag 360caactactcc ccagatggta tttttactat cttgggacgg gcccccatgc tggagccagt 420ttcggagaca gcattgaggg agtcttctgg gttgcaaata gtcaggcgga taccaacacc 480tctgctgaca ttgttgaaag ggacccaagt agccatgagg ctattcctac taggtttgcg 540cccggtacgg tattgcctca gggtttctat gttgaaggct cgggaaggtc tgcacctgct 600agtcgatctg gttcgcggtc acaatcccgt gggccaaata atcgcgctag aagcagttcc 660aaccagcgcc agcctgcctc tactgtaaaa cctgatatgg ccgaagaaat tgctgctctt 720gttttggcta atctaggcaa agatgccgga cagcctaagc aagtaactaa gcaaagtgcc 780aaagaagtca ggcagaaaat tttaaataag cctcgccaaa agaggactcc aaacaagcag 840tgcccagtgc agcagtgttt tggaaagaga ggccccaatc agaattttgg aggccctgaa 900atgttaaaac ttggaactag tgatccacag ttccccattc ttgcagagtt ggccccaaca 960cctggtgcct tcttctttgg atctaaatta gaattggtca aaaagaattc tggtggcgtt 1020gatgaaccca ccaaagatgt gtatgagctg caatattcag gtgcagtcag atttgatagt 1080actctacctg gttttgagac tatcatgaaa gtgttgaatg agaatttgaa tgcctaccag 1140aatcaagctg gtggtgcaga tgtagtgagc ccaaagcccc aaagaaagag agggacgaaa 1200caaacggctc agaaagaaga attagatagt ataagcgttg caaagcccaa aagtgccgtg 1260cagcgaaatg taagcagaga attaacccca gaggatagaa gcctgttggc gcagatccta 1320gatgatggcg ttgtgcctga tgggttagat gactctaatg tgtaa 1365<210>73<211>1111<212>DNA<213>人冠状病毒OC43<400>73atggctacag tcaaatgggc tgatgcatct gaaccacaac gtggtcgtca gggtagaata 60ccttattctc tttatagccc tttgcttgtt gatagtgaac aaccttggaa ggtgatacct 120cgtaatttgg tacccatcaa caagaaagac aaaaataagc ttataggcta ttggaatgtt 180caaaaacgtt tcagaactag aaagggcaaa cgggtggatt tgtcacccaa gctgcatttt 240tattatcttg gcacaggacc ccataaagat gcaaaattta gagagcgtgt tgaaggtgtc 300gtctgggttg ctgttgatgg tgctaaaact gaacctacag gttacggtgt taggcgcaag 360aattcagaac cagagatacc acacttcaat caaaagctcc caaatggtgt tactgttgtt 420gaagaacctg actcccgtgc tccttcccgg tctcagtcga ggtcgcagag tcgcggtcgt 480ggtgaatcca aacctcaatc tcggaatcct tcaagtgaca gaaaccataa cagtcaggat 540gacatcatga aggcagttgc tgcggctctt aaatctttag gttttgacaa gcctcaggaa 600aaagataaaa agtcagcgaa aacgggtact cctaagcctt ctcgtaatca gagtcctgct 660tcttctcaaa cttctgccaa gagtcttgct cgttctcaga gttctgaaac aaaagaacaa 720aagcatgaaa tgcaaaagcc acggtggaaa agacagccta atgatgatgt gacatctaat 780gtcacacaat gttttggccc cagagacctt gaccacaact ttggaagtgc aggtgttgtg 840
gccaatggtg ttaaagctaa aggctatcca caatttgctg agcttgtgcc gtcaacagct 900gctatgctgt ttgatagtca cattgtttcc aaagagtcag gcaacactgt ggtcttgact 960ttcactacta gagtgactgt gcccaaagac catccacact tgggtaagtt tcttgaggag 1020ttaaatgcat tcactagaga aatgcaacaa cactgaacca gtgcgtgatg aagtttctat 1080tgaaactgac ataattgatg aagtaaacta a1111<210>74<211>1326<212>DNA<213>猪流行性腹泻病毒<400>74atggcttctg tcagctttca ggatcgtggc cgcaaacggg tgccattatc tctctatgcc 60cctcttaggg ttactaatga caagcccctt tctaaggtac ttgcaaacaa cgctgtaccc 120actaacaagg ggaataagga ccagcaaatt gggtactgga atgagcaaat tcgctggcgc 180atgcgccgtg gtgagcgaat tgaacaacct tccaattggc atttctacta cctcggaaca 240ggacctcacg gcgacctccg ttataggact cgtactgagg gtgttttctg ggttgctaaa 300gaaggcgcaa agactgaacc cactaatttg ggtgtcagaa aggcgtctga aaagccaatc 360attccaaaat tctctcaaca gctccccagt gtagttgaga ttgttgaacc taacacacct 420cctgcttcac gtgcaaattc gcgtagcagg agtcgtggca atggcaacaa taggtctaga 480tctccaagta acaacagagg caataaccag tcccgtggta attcacagaa tcgtggaaat 540aaccagggtc gtggagcttc tcagaacaga ggaggcaata ataataacaa taacaagtct 600cgtaaccagt ccaataacag gaaccagtca aatgaccgtg gtggtgtaac atcacgcgat 660gatctggtgg ctgctgtcaa ggatgcactt aaatctttgg gtattggaga aaatcctgac 720aggcataagc aacagcagaa gcctaagcag gaaaagtctg acaacagcgg caaaaataca 780cctaagaaga acaaatccag ggccacttcg aaggaacgtg acctcaaaga catcccagag 840tggaggagaa ttcccaaggg cgaaaatagc gtagcagctt gcttcggacc cagagggggc 900ttcaaaaact ttggagatgc ggaatttgtc gaaaaaggtg ttgatgcgtc aggctatgct 960cagatcgcca gtttagcacc aaatgttgca gcattgctct ttggtggtaa tgtggctgtt 1020cgtgagctag cggactctta cgagattaca tacaactata aaatgactgt gccaaagtca 1080gatccaaatg ttgagcttct tgtttcacag gtggatgcat ttaaaactgg gaatgcaaaa 1140ctccagagaa agaaggaaaa gaagaacaag cgtgaaacca cgctgcagca gcatgaagag 1200gccatctacg atgatgtggg tgcgccatct gatgtgaccc atgccaatct ggaatgggac 1260acagctgttg atggtggtga tacggccgtt gaaattatca acgagatctt cgatacagga 1320aattaa1326<210>75<211>1230<212>DNA<213>传染性支气管炎病毒<400>75atggcaagcg gtaaagcagc tggaaaaaca gacgccccag cgccagtcat taaactagga 60ggaccaaaac cacctaaagt cggttcttct ggaaatgcat cttggtttca agcaataaaa 120gccaagaagt taaatacacc tccgcccaag tttgaaggta gcggtgttcc tgataacgaa 180aacattaagc caagccagca acatggatac tggagacgcc aagccaggtt taagccaggc 240aaaggtggaa gaaaaccagt cccagatgct tggtactttt actatactgg aacaggacct 300gccgctgacc tgaactgggg tgatactcaa gatggtatag tgtgggttgc tgctaagggt 360gctgatacta aatctagatc caatcagggt acaagagatc ctgataagtt tgaccaatac 420ccactacgat tctcggatgg cggacctgat ggtaatttcc gttgggactt cattcccctg 480aaccgtggta ggagtggaag atcaacagca gcttcatcag cagcagctag tagagcacca 540tcacgtgaag gttcgcgtgg tcgtagaagt gattctggag atgaccttat tgctcgtgca 600gcaaagataa tccaggatca gcagaaaaag ggctctcgca ttaccaaggc aaaggcagat 660gaaatggctc atcgccggta ttgcaagcgc actatcccac ctaattatag ggttgatcaa 720gtgtttggtc cccgtactaa aggtaaggag gggaattttg gtgatgacaa gatgaatgag 780gaaggtatta aggatgggcg tgttacagca atgctcaacc tagtccctag cagccatgct 840
tgtctttttg gaagtagagt gacacccaaa cttcaactag atgggcttca cttgagattt 900gaatttacta ctgtggtccc atgtgatgac ccgcagtttg ataattatgt gaaaatttgt 960gatcagtgtg tcgatggtgt aggaacgcgt ccaaaagatg acgaaccaaa accaaagtca 1020cgctcaagtt caagacctgc tacaagagga aattctccag cgccaagaca acagcgccca 1080aagaaggaga aaaagctaaa gaagcaggat gatgaagcag ataaagcatt gacctcagat 1140gaggagagga acaatgcaca gctggaattt tatgatgagc ccaaggtaat taactggggg 1200gatgcagctc taggagagaa tgaactttga 1230<210>76<211>38<212>DNA<213>SARS冠状病毒GD69<400>76cctccgtacc atctggggct gagctctttc atcggagg 38<210>77<211>95<212>DNA<213>SARS冠状病毒GD69<400>77acgagttcgt ggtggtgacg gcaaaatgaa agagctcagc cccagatggt acttctatta 60cctaggaact ggcccagaag cttcacttcc ctacg95<210>78<211>19<212>DNA<213>人工序列<220>
<223>人工序列描述合成引物<400>78acgagttcgt ggtggtgac 19<210>79<211>19<212>DNA<213>人工序列<220>
<223>人工序列描述合成引物<400>79cgtagggaag tgaagcttc 19
<210>80<211>14<212>DNA<213>人工序列<220>
<223>人工序列描述合成引物<400>80gccttctttg ttag 14<210>81<211>40<212>DNA<213>人工序列<220>
<223>人工序列描述合成引物<400>81gcctccgtac catctggggc tgagctcttt catcggaggc 40<210>82<211>38<212>DNA<213>人工序列<220>
<223>人工序列描述合成引物<400>82taatacgact cactatagga cgagttcgtg gtggtgac 38<210>83<211>33<212>DNA<213>人工序列<220>
<223>人工序列描述合成引物<400>83gccttctttgttagcgtagg gaagtgaagc ttc 33<210>84<211>40<212>DNA<213>人工序列
<400>84gcccacgtac catctggggc tgtagacagc agccgtgggc 40<210>85<211>98<212>DNA<213>SARS冠状病毒G69<400>85ctctatgttt ataagggcta tcaacctata gatgctgctg tctacagccc cagatggtag 60tattcttgct agtcacacta gccatcctta ctgcgctt 98<210>86<211>17<212>DNA<213>人工序列<220>
<223>人工序列描述合成引物<400>86tacacacctc agcgttg17<210>87<211>16<212>DNA<213>人工序列<220>
<223>人工序列描述合成引物<400>87cacgaacgtg acgaat 16<210>88<211>26<212>DNA<213>人工序列<220>
<223>人工序列描述合成引物<220>修饰的碱基<221>
<222>(21)..(26)<223>a，c，g，t，未知，或者其它<400>88gccggagctc tgcagaattc nnnnnn 26
<210>89<211>20<212>DNA<213>人工序列<220>
<223>人工序列描述合成引物<400>89gccggagctc tgcagaattc 20<210>90<211>24<212>DNA<213>人工序列<220>
<223>人工序列描述合成引物<400>90gggttgggac tatcctaagt gtga24<210>91<211>21<212>DNA<213>人工序列<220>
<223>人工序列描述合成引物<220>
<221>修饰的碱基<222>(11)<223>i<400>91taacacacaa ncccatcatc a 21<210>92<211>21<212>DNA<213>人工序列<220>
<223>人工序列描述合成引物<400>92ctaacatgct taggataatg g 21
<210>93<211>21<212>DNA<213>人工序列<220>
<223>人工序列描述合成引物<400>93gcctctcttg ttcttgctcg c 21<210>94<211>21<212>DNA<213>人工序列<220>
<223>人工序列描述合成引物<400>94caggtaagcg taaaactcat c 2权利要求
1.一种冠状病毒的检测法，其中的改进包括这样的检测剂，其特异于至少两种选自由刺突(S)、包膜(E)、膜(M)和核壳(N)组成的组的基因。
2.权利要求1的检测法，其中冠状病毒是SARS病毒。
3.权利要求2的检测法，其中SARS病毒是SARS-CoV。
4.权利要求1的检测法，其中检测法为基于分子信标的多等位RT-实时-PCR检测。
5.权利要求4的检测法，其中检测剂为分子信标。
6.权利要求5的检测法，其中分子信标为耐错配的分子信标。
7.权利要求1的检测法，其中检测法为PCR检测。
8.权利要求7的检测法，其中存在4组用于4种不同病毒基因的PCR引物，以及4种不同的分子信标。
9.权利要求8的检测法，其中每个分子信标均用相同的荧光团进行标记。
10.权利要求8的检测法，其中每个分子信标特异于不同的SARS-CoV基因。
11.权利要求7的检测法，其中的改进还包括外源RNA标准物，其被加入样本中，其能被所述引物组中的一组逆转录并被扩增。
12.权利要求11的检测法，其中的改进还包括包含入第5分子信标，其被标记了不同的荧光团，其特异于所述的外源RNA标准物。
13.权利要求1的检测法，其中的改进还包括从临床样本中分离RNA。
14.权利要求13的检测法，其中样本包括血液、组织、痰或鼻咽吸入样本。
15.权利要求1或12的检测法，其中的改进还包括逆转录、PCR扩增和荧光分光光度计热循环仪中的同时自动的扩增子检测，所述的热循环仪在每个热循环的退火阶段过程中测量每种颜色的荧光强度。
16.权利要求1的检测法，其中的改进还包括对独特鉴别SARS-CoV的4种标靶序列的选择及检测。
17.权利要求1的检测法，其中的改进还包括将特异性扩增子、引物和IPC标准物与每种基因的所述检测剂一并包括在内。
18.权利要求17的检测法，其中每种基因的引物、扩增子和检测剂包括具有附图3、7、11和15中式中所示的那些并且IPC标准物选自附图17中所示的那些。
19.权利要求17的检测法，其中每种基因的引物、扩增子和检测剂包括具有附图4、8、12和16中式中所示的那些并且IPC标准物选自附图18中所示的那些。
20.权利要求1的检测法，其中的改进包括PCR多重模式。
21.一种试剂盒，其用于实施权利要求1-20任一项中的检测法。
22.权利要求21的试剂盒，其中所述的试剂被装在各自的容器中。
23.权利要求22的试剂盒，其中所述的试剂的量足以对单个样本进行检测。
24.权利要求21的试剂盒，其中试剂盒包括书面用法说明书。
25.一种试剂组合物，其包含以下试剂组中的一种或多种S基因LK2495’-FAM-CCCACGCCAGAAGGTAGATCACGAACTACACGTGGG-3’-DubcylLK249.N5’-FAM-GCCCACGCCAGAAGGTAGATCACGAACTACACGTGGGC-3’-DubcylLK2505’-CTCTATGTTTATAAGGGCTATCAACCTATAGATGTAGTTCGTGATCTACCTTCTGGTTTTAACACTTTGAAACCTATTTTTAAGTTGCCTCTTGG-3’LK2515’-CTCTATGTTTATAAGGGCTATCAACC-3’LK251-T75’-TAATACGACTCACTATAGGCTCTATGTTTATAAGGGCTATCAACC-3’LK2525’-CCAAGAGGCAACTTAAAAATAGGTTTC-3’LK252-RT5’-AGGCTGTAAGAACCAAGAGGCAACTTAAAAATAGGTTTC-3’S-RT5’-AGGCTGTAAGAA-3’；E基因LK2535’-FAM-CCTCCGCACGAAAGCAAGAAAAAGAAGTACGCCGGAGG-3’-DubcylLK253.N5’-FAM-GCCTCCGCACGAAAGCAAGAAAAAGAAGTACGCCGGAGGC-3’-DubcylLK2545’-CGGAAGAAACAGGTACGTTAATAGTTAATAGCGTACTTCTTTTTCTTGCTTTCGTGGTATTCTTGCTAGTCACACTAGCCATCCTTACTGCGCTT-3’LK2555’-CGGAAGAAACAGGTACGTTAATAG-3’LK255-T75’-TAACACCATATAGGCGGAAGAAACAGGTACGTTAATAG-3’LK2565’-AAGCGCAGTAAGGATGGCTA-3’LK256-RT5’-TATTGCAGCAGTACAAGCGCAGTAAGGATGGCTA-3’E-RT5’-TATTGCAGCAGTAC-3’；M基因LK2575’-FAM-CCTCCGACCCAATTAATTCTGTAGACAGCAGCCGGAGG-3’-DubcylLK257.N5’-FAM-CCTCCGACCCAATTAATTCTGTAGACAGCAGCCGAGGC-3’-DubcylLK2585’-CTTGTTTTCCTCTGGCTCTTGTGGCCAGTAACACTTGCTTGTTTTGTGCTTGCTGCTGTCTACAGAATTAATTGGGTGACTGGCGGGATTGCGATTGCAATGGCTTG-3’LK2595’-CTTGTTTCCTCTGGCTCTTG-3’5’-TATACGACCACTATAGGCTTGTTTTCCTCTGGCTCTTG-3’LK2605’-CAAGCCTTGCAATCGCAATC-3’LK260-RT5’-AAGCAACGAAGTAGCAAGCCATTGCAATCGCAATC-3’M-RT5’-AAGCACGAAGTAG-3’；或者IPCLK2655’-FAM-GCCCACGTACCATCTGGGGCTGTAGACAGCAGCCGTGGGC-3’-DubcylLK2665’-CTCTATGTTTATAAGGGCTATCAACCTATAGATGCTGCTGTCTACAGCCCCAGATGGTAGTATTCTTGCTAGTCACACTAGCCATCCTTACTGCGCTT-3’LK2515’-CTCTATGTTTATAAGGGCTATCAACC-3’LK251-T75’-TAATACGACTCACTATAGGCTCTATGTTTATAAGGGCTATCAACC-3’LK2565’AAGCGCAGTAAGGATGGCTA-3’LK256-RT5’TATTGCAGCAGTACAAGCGCAGTAAGGATGGCTA-3’E-RT5’-TATTGCAGCAGTAC-3’.
26.一种试剂盒，其包含权利要求25的试剂组合物。
全文摘要
本发明涉及对包括SARS基因在内的冠状病毒的多等位RT实时聚合酶链式反应(PCR)检测。鉴定了SARS－CoV的S，E，M和N基因内的多重标靶序列。4种不同遗传标靶的使用提高了病毒基本遗传漂变不会导致假阴性结果的可能性。可以预见用于该检测的多重检测模式。因此，本发明有助于SARS感染的早期诊断。该检测将在下列情况下有用监测治疗方式/状态，筛查潜在的抗SARS制剂，以及需要定性和定量测定的类似应用。
文档编号C12Q1/68GK1906306SQ200480031307
公开日2007年1月31日 申请日期2004年8月13日 优先权日2003年8月22日
发明者L·G·科斯特日克斯 申请人:博驰生物医疗研究有限公司