利用外代谢转换剂(辅酶q10)治疗肉瘤的方法

专利名称：利用外代谢转换剂(辅酶q10)治疗肉瘤的方法
利用外代谢转换剂(辅酶Q10)治疗肉瘤的方法相关申请本申请要求2009年8月 25 日提交的题为“Methods for Treatment of a Sarcoma Using an Epimetabolic Shifter (Coenzyme Q10) ”(代理人案卷号117732-(^601)的 61/236，845号美国临时申请的优先权。上述申请的全文通过引用在此引入。发明背景癌症是目前发达国家的主要死亡原因之一，也是现代社会的一个严重的威胁。特别地，肉瘤代表了在包括骨骼肌、平滑肌、骨骼和软骨的遍及全身的原发部位发生的，间充质细胞源的异质恶性肿瘤组。尤文氏肿瘤族(EFT)代表包括经典骨骼尤文氏肉瘤(ES)、骨外尤文氏肉瘤(EOE)和原始神经外胚叶肿瘤(PNET)的一类形态上的小圆形细胞恶性肿瘤。 他们代表几乎3%的小儿癌症和在儿童和青少年中第二普遍的恶性肿瘤。尤文氏肉瘤在西半球的发病率是大约1-3例/100万。虽然在治疗尤文氏肉瘤中的相当大的进展已经增加了 5年生存率，但患有转移性疾病的尤文氏瘤患者的结果仍然严峻，其低于25%生存超过5 年。尤文氏肉瘤是一种其发病率似乎与孟德尔遗传、环境或药物暴露不相关的高度侵袭性的癌症。尤文氏肉瘤最一致的特征是由于EWSRl基因座和ETS转录因子基因之间的染色体易位而导致的融合基因的存在。EWS-ETS融合基因编码转录因子如EWS-FLI1，其异常的功能与尤文氏肉瘤的发病机理相关。尽管最近的研究已经极大地增加了我们对许多肿瘤发生的分子机制的理解，并提供了许多治疗癌症的新途径，但对包括尤文氏肿瘤族的大多数恶性肿瘤的标准疗法包括完全切除、化疗和放疗。这些治疗可能会引起许多不希望的副作用。例如，外科手术可能导致疼痛、对健康组织的外伤性损伤和疤痕。放射疗法具有杀死癌细胞的优势，但它同时也损害非癌性组织。化疗涉及向病人施用各种抗癌药物。这些标准疗法常常伴随着有害的副作用， 例如，恶心、免疫抑制、胃溃疡和继发性肿瘤发生。多年来，许多个人和公司已经进行了广泛的研究以寻找改善对治疗包括尤文氏肿瘤族的各种各样的癌症的方法。多家公司正在开发有望提供更为有利的癌症疗法的生物活性剂，包括化学实体如小分子，和生物制剂如抗体。例如，正在研究胰岛素样生长因子受体-1 (IGF-IR)抗体单独地和与其它标准化疗相结合作为潜在的疗法用于复发性尤文氏族肿瘤的治疗。然而，到目前为止，尤文氏庭肿瘤的治疗仍然非常困难。因此，迫切需要开发成功治疗尤文氏肉瘤的新疗法。辅酶Q10，本文也称之为CoQIO、Q10、泛醌或泛癸利酮，是一种流行的营养补充剂且可以在营养品商店、保健食品商店、药店等等中作为维生素类补充品以胶囊的形式找到， 其有助于通过泛醇(辅酶QlO的还原形式)的抗氧化性质保护免疫系统。辅酶QlO是本领域内公知的，并进一步在国际公开号WO 2005/069916中被公开，其全部公开在本文中通过引用引入。Turunen 等，Biochimica et Biophysica Acta 1660 :171-199(2004)中描述了辅酶QlO的代谢和功能，包括辅酶Q 10的代谢产物，该文献的全部内容在此通过引用引入。辅酶QlO被发现遍及人体的大部分组织和其它哺乳动物的组织。在MiagavanHN 等的综述文献，Coenzyme QlO :Absorption， tissue uptake， metabolism and pharmacokinetic，Free Radical Research 40 (5)，445-453 (2006)(以下，Bhagavan 等) 中综述了辅酶QlO在人体中的组织分布和氧化还原状态。作者报告，“作为一般规则，具有高能源需求或代谢活性的组织，如心脏、肾脏、肝脏和肌肉，含有相对高浓度的辅酶Q10。” 作者进一步地报告，“除脑部和肺部以外，组织中辅酶QlO的主要部分是对苯二酚或泛醇 (uniquinol)的还原形式”，其“在这两种组织中表现为增强的氧化应激的反映”。特别是， Miagavan等报告，在心脏、肾脏、肝脏、肌肉、肠和血液(血浆)中，分别约61%、75%、95%、 65%、95%和96%的辅酶QlO是还原形式的。类似地，Ruiz-Jiminez等，Determination of the ubiquinol-10 and ubiquinone-10(coenzyme Q10)in human serum by liquid chromatography tandem mass spectrometry to evaluate the oxidative stress, J. Chroma A 1175(2),242-248(2007)(以下，Ruiz-Jiminez 等)报告，当测量人血浆的 QlO 和还原形式的Q10(Q10H2)时，发现大多数(90% )的分子为还原形式。辅酶QlO是高度亲脂性的，且对于其大部分来说，不溶于水。由于其在水中的不溶解性、在脂质中有限的溶解度和相对大的分子量，口服辅酶QlO的吸收率很差。Miagavan 等报告，“在用大鼠进行的一项研究中，据报告只有大约2-3%的口服施用的辅酶QlO被吸收”。Miagavan等进一步报告，“来自大鼠研究的数据表明，辅酶QlO在肠道内吸收过程中或吸收之后被还原为泛醇”。辅酶QlO在文献中已经与癌症相关联很多年了。下面描述一些有代表性的，但不是包括所有文献中报告的相关性的例子。Karl Folkers等，Survival of Cancer Patients on Therapy with Coenzyme Q10,Biochemical and Biophysical Research Communication 192,241-245(1993)(以下，‘Tolkers等”)描述了 8个“用辅酶QlO治疗”的癌症患者的病
历及“5-15年时间的”他们的生存史.......向八个患有包括胰腺癌、腺癌、喉癌、乳腺癌、
结肠癌、肺癌和前列腺癌的不同类型癌症的患者口服施用辅酶Q10。folkers等阐述，“目前这些结果证明了全身性的方案”。Lockwood 等，Progress on Therapy of Breast Cancer with Vitamin QlO and the Regression of Metastases, Biochemical and Biophysical Research Communication 212，172-177 (1995)(以下，“Lockwood 等”)是另一个报道关于 “用维生素QlO治疗乳腺癌的进展”的综述文章。Lockwood等引用R)lkers等，其“涵盖了 35年的关于动物和人类的国际研究，显示在非肿瘤和肿瘤组织中维生素QlO的不同水平且包括基于具有肿瘤的处理小鼠的生存者增加的宿主防御系统固有的维生素QlO的数据”。 Lockwood等进一步阐述，依靠测定在199个瑞典和美国的癌症患者中的辅酶QlO血液浓度的研究(其表明在乳腺癌的情况下不同水平的缺乏)，“人类癌症的维生素QlO疗法的潜力在1961年得到证明”。2002年7月9日授权的6，417，233号美国专利(以下，Sears等) 描述了含有脂溶性苯醌的组合物，如辅酶Q10，用于预防和/或治疗线粒体病。kars等阐述了 “辅酶QlO治疗已被报道在癌症患者中提供了一些优势(见第2栏，30-31行)”。截至提交本申请之日，据美国国家癌症研究所报告，还没有进行涉及大量患者的辅酶QlO用于癌症治疗的良好设计的临床试验，因为“进行研究的方法和报道的信息量使得该益处是由辅酶QlO还是由其它物质所引起的还不清楚”。可通过www. cancer, gov/ cancertopics/pdq/cam/coenzymeQ10/patient/allpages (2008 年 9 月 29 日)访问美国国家癌症研究所(NCI)。特别地，NCI引用了关于在乳腺癌患者的标准治疗后使用辅酶QlO作
10为辅助疗法的3个小型研究，其中一些患者表现出受益于该治疗，并重申“然而，研究设计和报告的缺陷使得该益处是由辅酶QlO还是由其它物质所造成的并不清楚”。NCI特别指出，“这些研究具有以下缺点这些研究不是随机的或对照的；除了辅酶QlO外患者还使用了其它的补充剂；患者在辅酶QlO疗法之前或期间接受标准治疗；且在研究中没有报告所有患者的详细情况”。NCI进一步报告了关于“辅酶QlO已帮助一些癌症患者，包括患有胰腺癌、肺癌、结肠癌、直肠癌和前列腺癌的患者，活得更长的未经证实的报道”，但是其指出“然而，在这些报告中所描述的病人也接受了除辅酶QlO以外的其它治疗，包括化疗、放疗和手术”。2006年2月16日公布的美国专利申请公开2006/0035981 (以下称“Mazzio 2006”)描述了使用组合物治疗或预防人类和动物的癌症的方法和制剂，该组合物利用了癌症与宿主相反的对葡萄糖的非氧化磷酸化以获取能量的厌氧需求的弱点。Mazzio 2006的制剂包含一种或多种协同地促进氧化代谢和/或阻碍乳酸脱氢酶或无氧糖代谢的化合物， 和特别地描述为含有“2，3_ 二甲氧基-5-甲基-1，4-苯醌(本文也称为“DMBQ”)(醌式碱) 和整个泛醌系列的可选项，包括相应的对苯二酚、泛色烯醇、泛色烯醇或合成的/天然的衍生物和类似物。见mazzio2006第3页，第0010段。Mazzio 2006确认“短链泛醌(CoQ < 3) 作为抗癌剂”，且甚至进一步确认“2，3_ 二甲氧基-5-甲基-1，4-苯醌(DMBQ)作为抗癌剂比辅酶QlO效力高出1000倍”。见mazzio 2006第3页，第0011段。Mazzio 2006进一步阐述，该研究“没有发现辅酶QlO如所预计的一样是致死性的”且似乎“采用辅酶QlO对抗癌症的先前研究存在一些矛盾”。见mazzio 2006第3_4页大量列出的支持了这一论述的引用文献列表。2007年10月25日公布的美国专利申请公开2007/0M8693 (本文以下称“Mazzio 2007”)还描述了营养保健组合物及其用于治疗或预防癌症的用途。而且，公布的该专利申请集中于短链泛醌，并具体地阐明辅酶QlO不是该发明的关键成分。根据Mazzio 2007，“虽然辅酶QlO可以增加癌细胞中线粒体复合体II活性的Vmax(Mazzio和Soliman，Biochem Pharmacol. 67 :1167-84，2004)，它没有控制通过复合体IV的线粒体呼吸率或氧气利用率。 而且，辅酶QlO没有如预计的一样是致死性的。同样地，辅酶QlO对抗癌症的结果是矛盾的，，。见 mazzio 2007 第 5 页，第 0019 段。申请人:先前已经描述了辅酶QlO的局部制剂和在动物受试者中降低肿瘤的生长速度的方法(Hsia等，2005年8月4日公开的W02005/069916)。在Hsia等所描述的该实验中，证明辅酶QlO增加了皮肤癌细胞而非正常细胞的培养物中的细胞凋亡速率。此外，证明用辅酶QlO的局部制剂治疗荷瘤动物显著地降低了该动物中肿瘤的生长速率。本发明至少部分地基于对辅酶QlO在人体和/或细胞中作用的更完全的了解。特别地，本发明的方法和制剂至少部分地基于从辅酶QlO体外治疗肉瘤细胞的广泛研究中获得的关于辅酶QlO 的治疗机制的知识。具体来说，在至少一个实施方式中，本发明的方法和制剂至少部分地基于用辅酶 QlO治疗的原代肉瘤细胞中调节相当数目的基因的表达的惊人发现。发现这些被调节的蛋白质被群集到几个细胞途径中，包括细胞过程、代谢过程、转录调控、程序性细胞死亡(细胞凋亡)、细胞发育、细胞骨架、细胞核、蛋白质组和器官发育的调节。综上所述，本文所述的结果已经为QlO的治疗机制提供了深刻的理解。虽然不希望被理论约束，本文所述的结果表明，辅酶QlO诱导细胞骨架蛋白的全面的表达，从而破坏细胞的结构体系的稳定并启动以不同寻常和出乎意料的速度达到顶点的细胞过程和稳定的细胞凋亡反应。因此，本发明的一个方面提供了通过向人体局部施用辅酶QlO分子(例如，辅酶 QlO、辅酶QlO的组成部分、辅酶QlO的衍生物、辅酶QlO的类似物、辅酶QlO的代谢产物或辅酶生物合成途径的中间产物)来治疗或预防发生以治疗或预防人类中的肉瘤的方法。在一个实施方式中，局部施用是用于对特定的待治疗肉瘤在人体中提供疗效而选择的剂量。在某些实施方式中，通过施用辅酶QlO的氧化形式进行肉瘤的治疗或预防。在某些实施方式中，被治疗或预防的肉瘤不是通常通过局部施用进行治疗或预防的肉瘤，而是预期系统递送治疗上有效水平的活性剂。在一些实施方式中，被治疗的人类组织中的辅酶QlO分子的浓度与代表健康或正常状态的人类组织的对照标准浓度不同。在本发明的另一些实施方式中，向人类施用的所述辅酶QlO分子的形式与在人类的体循环中发现的主要形式不同。在本发明的另一实施方式中，该治疗涉及或者通过辅酶QlO分子(如CoQ10、CoQ10 的组成部分、CoQlO的衍生物、CoQlO的类似物、CoQlO的代谢物或辅酶生物合成途径的中间体)与选自于 ANGPTL3、CCL2、CDH5、CXCLl、CXCL3、PRMT3、HDAC2、一氧化氮合酶 bNOS、 乙酰磷酸化组蛋白H3AL9S10、MTA 2、谷氨酸脱羧酶GAD65 67、KSR、HDAC4、BOBl OBFU al 互生蛋白(Syntrophin)、BAPl、Importina 57、α E-联蛋白(Catenin)、Grb2、Bax、蛋白酶体26S亚基13(End0philin Bi)、类肌动蛋白6A(真核起始因子4A11)、核氯离子通道蛋白、蛋白酶体26S亚基、Cu/Si过氧化物歧化酶、转位蛋白(Translin)相关因子X、亚砷酸盐移位ATP酶(精胺合成酶)、核糖体蛋白质SA、dCTP焦磷酸酶1、蛋白酶体β 3、蛋白酶体β 4、酸性磷酸酶1、苯二氮草结合抑制剂、a2-HS糖蛋白(黄牛(Bos Taurus)，牛)、核糖体蛋白P2 (RPIi^)；组蛋白H2A、微管相关蛋白、蛋白酶体α 3、真核翻译延长因子1δ、 核纤层蛋白Bl、mif 二 3同源物2(mif two 3 homolog 2)的SMT3抑制因子、热休克蛋白27kD、hnRNP C1/C2、真核翻译延长因子1 β 2、类似于HSPC-300、DNA指导的DNA聚合酶 epislon 3 ； (canopy 2 同源物)、LAMA5、PXLDCl、p300CBP、P53R2、磷脂酰丝氨酸受体、细胞角蛋白肽17、细胞角蛋白肽13、神经丝160 200、Rab5、晶丝蛋白(Filensin)、P53R2、MDM2、 MSH6、热休克因子 2、AFX、FLIPg d、JAB 1、肌球蛋白(Myosine)、MEKK4、cfcif pSer62UFKHR FOXOla, MDM2、Fas 配体、P53R2、肌球蛋白调节轻链、hnRNP C1/C2、Ubiquilin 1 (磷酸酶 2A)、hnRNP C1/C2、a2_HS糖蛋白(黄牛，牛)、β-肌动蛋白、hnRNP C1/C2、热休克蛋白 70kD、β -微管蛋白、ATP依赖的解旋酶II、真核翻译延长因子1 β 2、ER脂筏相关2同型体 1(β肌动蛋白)、信号序列受体IS、真核翻译起始因子3、亚基3 Y、胆绿素(Bilverdin) 还原酶A (转醛醇酶1)、角蛋白1，10 (旁胸腺素(Parathymosin))、GSTco 1、B链多巴胺苯醌结合DJ-1、蛋白酶体激活剂Reg(Ci)、T-复合蛋白1同型体A、链A甲巯蛋白(Tapasin) ERP57(含伴侣蛋白(Chaperonin)的TCP1)、泛素激活酶El ；丙氨酰-tRNA合成酶、动力蛋白激活蛋白(Dynactin) 1、热休克蛋白60kd、β肌动蛋白、亚精胺合成酶(β肌动蛋白)、 热休克蛋白70kd、视网膜母细胞瘤结合蛋白4同型体A、TAR DNA结合蛋白、真核翻译延长因子1 β 2、含伴侣蛋白的TCP1、亚基3、胞质动力蛋白IC-2、血管紧张素转化酶(ACE)、半胱天冬酶3、GARS、基质金属蛋白酶(MMP-6)、溶神经素(NLN)-催化结构域和溶神经素(NLN)、ADRB, CEACAM1、DUSP4、F0XC2、F0XP3、GCGR、GPDl、HMOXl、IL4R、INPPLl、IRS2、VEGFA、假定的c-myc反应性同型体1、PDK1、半胱天冬酶12、磷脂酶DU P34cdc2, P53BP1、BTK、ASC2、 BUBRl、ARTS、PCAF, Rafl、MSKl、SNAP25、APRIL、DAPK, RAIDD、HATl、PSF, HDACl、Radl7、生存素(surviving)、SLIPR、MAG13、半胱天冬酶 10、Crk2、Cdc 6、P21 WAF 1 Cip UASPP 1、 HDAC 4、细胞周期蛋白B1、CD40、GAD 65、TAP、Par4(前列腺凋亡反应蛋白4)、MRP1、MDC1、层粘连蛋白2 a2、b联蛋白，FXR2、膜联蛋白V、SMAC Diablo、MBNLl、二甲基组蛋白h3、独立生长因子 1、U2AF65、mTOR、E2F2、Kaiso、糖原合酶激酶 3、ATF2、HDRP MITR、Neurabin I、APl 和Apafl组成的组的基因(或蛋白质)的相互作用进行。在一个实施方式中，以在向人施用所述的辅酶QlO分子后至少1个小时诱导肉瘤细胞的细胞凋亡的剂量施用辅酶QlO分子。在其它实施方式中，通过以在向人施用辅酶QlO 后至少约2小时、3小时、4小时、5小时、6小时、7小时、8小时、9小时、10小时、12小时、15 小时、18小时、M小时、36小时、48小时后诱导肉瘤细胞的细胞凋亡的剂量施用辅酶QlO分子。在本发明的某些实施方式中，提供了通过向人局部地施用辅酶QlO分子以进行治疗或预防而用于治疗或预防人的肉瘤的方法，其中向人类施用外用剂量的外用介质中的辅酶Q10，其中以每平方厘米的皮肤约0. 01至约0. 5毫克的辅酶QlO的剂量范围向靶组织应用辅酶Q10。在一个实施方式中，以每平方厘米的皮肤约0. 09至约0. 15毫克的辅酶QlO的剂量范围向靶组织应用该辅酶Q10。在另一个实施方式中，以每平方厘米的皮肤约0. 12毫克的辅酶QlO的剂量向靶组织应用辅酶Q10。在本发明的某些实施方式中，被治疗和预防的肉瘤是尤文氏肿瘤族中的肉瘤类型。在某些实施方式中，被治疗和预防的尤文氏肿瘤族中的肉瘤类型是尤文氏肉瘤。本发明的某些方面提供了通过向人局部地施用辅酶QlO分子以进行治疗或预防而用于治疗或预防人的肉瘤的方法，其中每M小时局部应用该辅酶QlO分子一次或多次， 持续六星期或更多的时间。在另一个方面，本发明提供了用于治疗或预防人中肉瘤的方法，包括以使辅酶QlO 在肉瘤的治疗过程中维持其氧化形式的方式向人施用辅酶Q10。在一个实施方式中，被治疗的肉瘤不是通常通过局部给药治疗的肉瘤，而是预期以治疗有效水平系统递送活性剂治疗的肉瘤，如尤文氏肉瘤。然而本发明的再另一个方面提供了抑制在尤文氏肉瘤中发现的通过染色体11和 22之间的易位产生的融合蛋白(即EWS-FLIl融合蛋白)的活性的方法，这些方法包括选择或治疗患有肉瘤的人类受试者和向所述的人类受试者施用治疗上有效量的辅酶QlO分子， 从而抑制EWS-FLI1融合蛋白的活性。在某些实施方式中，辅酶QlO分子是CoQlO生物合成途径的中间体，包括(a)苯醌或至少一种促进苯醌环生物合成的分子，和(b)至少一种促进类异戊二烯单元合成和/ 或连接到苯醌环的分子。在其它实施方式中，所述的至少一种促进苯醌环生物合成的分子包括L-苯丙氨酸、DL-苯丙氨酸、D-苯丙氨酸、L-酪氨酸、DL-酪氨酸、D-酪氨酸、4-羟基-苯丙酮酸、3-甲氧基-4-羟基扁桃酸(香草基扁桃酸酯或VMA)、香草酸、吡哆醇或泛酰醇。在其它实施方式中，所述的至少一种促进类异戊二烯单元合成和/或连接到苯醌环的分子包括乙酸苯酯、4-羟基苯甲酸、甲羟戊酸、醋甘氨酸、乙酰辅酶A或法呢基。在其它实施方式中，所述中间体包括(a) L-苯丙氨酸、L-酪氨酸和4-羟基苯丙酮酸中的一种或多种；和(b)4_羟基苯甲酸、乙酸苯酯和苯醌中的一种或多种。在其它实施方式中，该中间体 (a)抑制Bcl-2的表达和/或促进半胱天冬酶-3的表达；和/或(b)抑制细胞增殖。在另一个方面，本发明提供了用于治疗或预防人的肉瘤的方法。该方法包括按给药方案向需要的人施用辅酶QlO分子，从而调节人的细胞膜的渗透性和进行治疗或预防。在一些实施方式中，用于治疗或预防人的肉瘤或抑制人的EWS-FLIl融合蛋白活性的方法进一步地包括上调选自于LAMA5、PXLDCl、p300CBP、P53R2、磷脂酰丝氨酸受体、细胞角蛋白肽17、细胞角蛋白肽13、神经丝160 200、Rab5、晶丝蛋白、P53R2、MDM2、MSH6、热休克因子 2、AFX、FLIPg d、JAB 1、肌球蛋白、MEKK4、cRaf pSer62U FKHR FOXOla、MDM2、 Fas配体、P53R2、蛋白酶体^S亚基13 (Endophilin Bi)、肌球蛋白调节轻链、hnRNP Cl/ C2、Ubiquilin 1 (磷酸酶 2A)、hnRNP C1/C2、a2_HS 糖蛋白(黄牛，牛)、β-肌动蛋白、 hnRNP C1/C2、热休克蛋白70kD、微管相关蛋白、β微管蛋白、蛋白酶体a 3、ΑΤΡ依赖的解旋酶II、真核翻译延长因子1 S、热休克蛋白27kD、真核翻译延长因子1β2、类似于HSPC-300、 ER脂筏相关2同型体1 ( β肌动蛋白)、铜/锌过氧化物歧化酶和信号序列受体1 δ、ADRB、 CEACAMU DUSP4、F0XC2、F0XP3、GCGR、GPDU HMOXU IL4R、INPPLU IRS2 和 VEGFA、假定的 c-myc反应性同型体1、PDKl、半胱天冬酶12、磷脂酶Dl、P34 cdc2、P53BP1、BTK、ASC2、 BUBRl、ARTS、PCAF, Rafl、MSKl、SNAP25、APRIL、DAPK, RAIDD、HATl、PSF, HDACl、Radl7、生存素、SLIPR、MAG13、半胱天冬酶 10、Crk2、Cdc 6、P21 WAF 1 Cip UASPP UHDAC 4、细胞周期蛋白Bi、⑶40、GAD 65、TAP、Par4(前列腺凋亡反应蛋白4)和MRPl组成的组的一个或者多个基因的表达水平；和/或下调选自于ANGPTL3、CCL2、CDH5、CXCLl、CXCL3、PRMT3、 HDAC2、一氧化氮合酶bNOS、乙酰磷酸化组蛋白H3 AL9 S10、MTA 2、谷氨酸脱羧酶GAD65 67、 KSR、HDAC4、BOBl OBFl、al 互生蛋白、BAPl、Importina 57、α E-联蛋白、Grb2、Bax、蛋白酶体26S亚基13(End0philin Bi)、类肌动蛋白6A(真核起始因子4A11)、核氯离子通道蛋白、蛋白酶体26S亚基，Cu/Zn过氧化物歧化酶、转位蛋白相关因子X、亚砷酸盐移位ATP酶 (精胺合成酶)、核糖体蛋白质SA、dCTP焦磷酸酶1、蛋白酶体β 3、蛋白酶体β 4、酸性磷酸酶1、苯二氮革结合抑制剂、核糖体蛋白Ρ2 (RPIi^)；组蛋白Η2Α、微管相关蛋白、蛋白酶体 α 3，真核翻译延长因子1 δ，核纤层蛋白Bl、mif 二 3同源物2的SMT3抑制因子、热休克蛋白27kD，hnRNP C1/C2，真核翻译延长因子1 β 2、类似于HSPC-300、DNA指导的DNA聚合酶 epislon 3 ； (canopy 2同源物)、血管紧张素转化酶(ACE)、半胱天冬酶3、GARS、基质金属蛋白酶(MMP-6)、溶神经素(NLN)-催化结构域和溶神经素(NLN)、MDC1、层粘连蛋白h2、b联蛋白、FXR2、膜联蛋白V、SMAC Diablo、MBNL1、二甲基组蛋白h3、独立生长因子1、U2AF65、 mT0R、E2F2、Kaiso、糖原合酶激酶 3、ATF2、HDRP MITR、Neurabin I、API 和 Apafl 组成的组的一个或者多个基因的表达水平。在本发明的一些实施方式中，用于治疗或预防人的肉瘤或抑制人的EWS-FLIl融合蛋白活性的方法包括或通过辅酶QlO分子与选自于ANGPTL3、CCL2、⑶H5、CXCLl、CXCL3、 PRMT3、HDAC2、一氧化氮合酶bNOS、乙酰磷酸化组蛋白H3 AL9 S10, MTA 2、谷氨酸脱羧酶 GAD65 67、KSR、HDAC4、B0B1 OBFl、al 互生蛋白、BAPl、Importina 57、0已-联蛋白、6计2、 Bax、蛋白酶体26S亚基13 (EndophilinBl)、类肌动蛋白6A(真核起始因子4A11)、核氯离子通道蛋白、蛋白酶体26S亚基，Cu/Zn过氧化物歧化酶、转位蛋白相关因子X、亚砷酸盐移位ATP酶(精胺合成酶)、核糖体蛋白质SA、dCTP焦磷酸酶1、蛋白酶体β 3、蛋白酶体β 4、 酸性磷酸酶1、苯二氮革结合抑制剂、a2-HS糖蛋白(黄牛，牛)、核糖体蛋白P2(RPLP2)； 组蛋白H2A、微管相关蛋白、蛋白酶体α 3，真核翻译延长因子1 δ、核纤层蛋白Bi、mif 二 3同源物2的SMT3抑制因子、热休克蛋白27kD，hnRNP C1/C2、真核翻译延长因子1 β 2、类似于 HSPC-300、DNA 指导的 DNA 聚合酶印i si on 3 ； (canopy 2 同源物)、LAMA5、PXLDCl、 P300CBP、P53R2、磷脂酰丝氨酸受体、细胞角蛋白肽17、细胞角蛋白肽13、神经丝160 200、 Rab5、晶丝蛋白、P53R2、MDM2、MSH6、热休克因子 2、AFX、FLIPg d、JAB 1、肌球蛋白、MEKK4、 CRafpSer62U FKHR FOXOla、MDM2、Fas 配体、P53R2、肌球蛋白调节轻链、hnRNP C1/C2、 Ubiquilin 1 (磷酸酶 2A)、hnRNP C1/C2、a2_HS 糖蛋白(黄牛，牛)、β-肌动蛋白、hnRNP C1/C2、热休克蛋白70kD、β-微管蛋白、ATP依赖的解旋酶II、真核翻译延长因子1 β 2、ER 脂筏相关2同型体1 ( β肌动蛋白)、信号序列受体1 δ、真核翻译起始因子3、亚基3 γ、胆绿素还原酶A (转醛醇酶1)、角蛋白1，10 (旁胸腺素)、GST ω 1、B链多巴胺苯醌结合DJ-I、 蛋白酶体激活剂Reg(a)、T_复合蛋白1同型体A、链A甲巯蛋白ERP57 (含伴侣蛋白的 TCP1)、泛素激活酶El ；丙氨酰-tRNA合成酶、动力蛋白激活蛋白1、热休克蛋白60kd、β肌动蛋白、亚精胺合成酶(β肌动蛋白)、热休克蛋白70kd、视网膜母细胞瘤结合蛋白4同型体A、TAR DNA结合蛋白、真核翻译延长因子1 β 2、含伴侣蛋白的TCP1、亚基3、胞质动力蛋白IC-2、血管紧张素转化酶(ACE)、半胱天冬酶3、GARS、基质金属蛋白酶(MMP-6)、溶神经素(NLN)-催化结构域和溶神经素(NLN)、ADRB, CEACAM1、DUSP4, F0XC2,F0XP3, GCGR,GPDl、 HMOXl、IL4R、INPPLl、IRS2、VEGFA、假定的c_myc反应性同型体1、PDK1、半胱天冬酶12、磷脂酶 Dl、P34 cdc2、P53 BPl、BTK、ASC2、BUBRl、ARTS、PCAF、Rafl、MSKl、SNAP25、APRIL、DAPK、 RAIDD、HATU PSF, HDACU Radl7、生存素、SLIPR、MAG13、半胱天冬酶 10、Crk2、Cdc 6、P21 WAFl Cip UASPP 1、HDAC 4、细胞周期蛋白 Bi、CD 40、GAD 65、TAP、Par4(前列腺凋亡反应蛋白4)、MRPl、MDCl、层粘连蛋白2a2、b联蛋白，FXR2、膜联蛋白V、SMAC Diablo、MBNLl、 二甲基组蛋白h3、独立生长因子1、似六 65、11111( 32 2、1^丨80、糖原合酶激酶3、六1 2、皿1^ MITR, Neurabin I, APl和Apaf 1组成的组的基因的相互作用进行。在本发明的某些实施方式中，该方法进一步包含包括外科手术、放射疗法、激素治疗、抗体治疗、应用生长因子、细胞因子的疗法、化疗和同种异体干细胞疗法中的任何一个或者其组合的治疗方案。而在再另一个方面，本发明提供了评估用于治疗受试者中肉瘤的疗法的效力的方法。该方法包括将向受试者施用治疗方案的至少一部分前从该受试者获得的第一样品中存在的标志物的表达水平(其中该标志物选自于表2-9中列出的标志物组成的组)和从施用了治疗方案的至少一部分后的受试者中获得的第二样品中存在的标志物的表达水平进行比较，其中与第一样品相比，第二样品中的标志物的表达水平的调节表明该疗法对治疗受试者中的肉瘤是有效的。但在再另一个方面，本发明提供了评估受试者是否患有肉瘤的方法。该方法包括测定从受试者中获得的生物样品中存在的标志物的表达水平(其中该标志物选自于表2-9 中列出的标志物组成的组)及比较从受试者获得的生物样品中存在的标志物的表达水平和对照样品中存在的标志物的表达水平，其中相对于对照样品中标志物的表达水平，从受试者中获得的生物样品中标志物的表达水平的调节表明该受试者患有肉瘤，由此评估受试者是否患有肉瘤。
在另一个方面，本发明提供了预测受试者是否具有患肉瘤的倾向的方法。该方法包括测定从受试者获得的生物样品中存在的标志物的表达水平，其中该标志物选自于表 2-9中列出的标志物组成的组，和比较从受试者获得的生物样品中存在的标志物的表达水平和对照样品中存在的标志物的表达水平，其中相对于对照样品中标志物的表达水平，从受试者获得的生物样品中标志物的表达水平的调节表明该受试者具有患肉瘤的倾向，从而预测受试者是否有患肉瘤的倾向。而在再另一个方面，本发明提供了预测受试者中肉瘤复发的方法。该方法包括测定从受试者获得的生物样品中存在的标志物的表达水平，其中该标志物选自于表2-9中列出的标志物组成的组，和比较从受试者获得的生物样品中存在的标志物的表达水平和对照样品中存在的标志物的表达水平，其中相对于对照样品中标志物的表达水平，从受试者获得的生物样品中标志物的表达水平的调节表明肉瘤的复发，从而预测受试者中肉瘤的复发。一个方面，本发明提供了预测患有肉瘤的受试者的生存的方法，该方法包括测定从受试者中获得的生物样品中存在的标志物的表达水平，其中该标志物选自于表2-9中列出的标志物组成的组，和比较从受试者获得的生物样品中存在的标志物的表达水平和对照样品中存在的标志物的表达水平，其中相对于对照样品中存在的标志物的表达水平，从受试者获得的生物样品中标志物的表达水平的调节是受试者的生存的指示，从而预测患有肉瘤的受试者的生存。在再另一个方面，本发明提供了监测受试者中肉瘤发展的方法。该方法包括比较向受试者施用治疗方案的至少一部分前从该受试者获得的第一样品中存在的标志物的表达水平和从施用了治疗方案的至少一部分后从受试者中获得的第二样品中存在的标志物的表达水平，其中该标志物选自于表2-9中列出的标志物组成的组，从而监测受试者中肉瘤的发展。在再另一个方面，本发明提供了鉴定用于治疗受试者中肉瘤的化合物的方法。该方法包括从受试者中获得生物样品，将该生物样品与受试化合物接触，测定从受试者获得的生物样品中存在的一个或多个标志物的表达水平，其中该标志物选自于表2-9中列出的具有正倍数变化和/或负倍数变化的标志物组成的组，比较生物样品中存在的一个或多个标志物的表达水平和适合的对照，及选择降低生物样品中存在的具有负倍数变化的一个或多个标志物的表达水平和/或提高生物样品中存在的具有正倍数变化的了一个或多个标志物的表达水平的受试化合物，从而鉴定用于治疗受试者中肉瘤的化合物。在一个实施方式中，该肉瘤是尤文氏肿瘤族中的肉瘤类型。在一个实施方式中，该肉瘤类型是尤文氏肉瘤。适合用于本发明的方法中的样品包括，例如，流体，例如从受试者获得的血液流体、呕吐物、唾液、淋巴液、囊肿液(cystic fluid)、尿液、通过支气管灌洗收集的流体、通过腹膜冲洗收集的流体和妇科流体。在一个实施方式中，该样品是血液样品或其成分。适用于本发明的方法中的样品也可以包括，例如，组织或其组成部分，例如，骨骼、结缔组织、软骨、 肺、肝、肾、肌肉组织、心脏、胰腺和/或皮肤。 在一个实施方式中，该受试者是人类。 在一个实施方式中，通过分析样品中转录的多核苷酸或其部分(例如，通过扩增该转录的多核苷酸)而测定生物样品中标志物的表达水平。在另一个实施方式中，通过使用例如与样品中的蛋白质特异地结合的试剂(例如，标记试剂)分析蛋白质或其部分测定受试者样品中的标志物的表达水平。在一个实施方式中，该试剂选自于抗体和抗原结合的抗体片段组成的组。在一个实施方式中，使用选自于所述样品的聚合酶链反应(PCR)扩增反应、 逆转录酶PCR分析、单链构象多态性分析(SSCP)、错配裂解检测(mi smatch c 1 eavage detection)、异源双链体分析、Southern印迹分析、Northern印迹分析、Western印迹分析、 原位杂交、阵列分析、脱氧核糖核酸测序、限制性片段长度多态性分析及其组合或亚组合组成的组的技术测定样品中标志物的表达水平。在另一个实施方式中，使用选自于免疫组织化学、免疫细胞化学、流式细胞仪、 ELISA和质谱分析组成的组的技术测定样品中标志物的表达水平。在另一个实施方式中，该标志物是选自于ANGPTL3、CCL2、CDH5、CXCLU CXCL3、 PRMT3、HDAC2、一氧化氮合酶bNOS、乙酰磷酸化组蛋白H3 AL9 S10, MTA 2、谷氨酸脱羧酶 GAD65 67、KSR、HDAC4、B0B1 OBFl、al 互生蛋白、BAPl、Importina 57、α E-联蛋白、GA2、 Bax、蛋白酶体26S亚基13 (Endophilin Bi)、类肌动蛋白6A(真核起始因子4A11)、核氯离子通道蛋白、蛋白酶体26S亚基，Cu/Zn过氧化物歧化酶、转位蛋白相关因子X、亚砷酸盐移位ATP酶(精胺合成酶)、核糖体蛋白质SA、dCTP焦磷酸酶1、蛋白酶体β 3、蛋白酶体β 4、 酸性磷酸酶1、苯二氮草结合抑制剂、α 2-HS糖蛋白(黄牛，牛)、核糖体蛋白P2(RPLP2)；组蛋白H2A、微管相关蛋白、蛋白酶体α 3、真核翻译延长因子1 δ、核纤层蛋白Bl、mif 二 3同源物2的SMT3抑制因子、热休克蛋白27kD，hnRNP C1/C2，真核翻译延长因子1 β 2、类似于 HSPC-300、DNA 指导的 DNA 聚合酶印islon 3 ； (canopy 2 同源物)、LAMA5、PXLDCl、p300CBP、 P53R2、磷脂酰丝氨酸受体、细胞角蛋白肽17、细胞角蛋白肽13、神经丝160200、Rab5、晶丝蛋白、P53R2、MDM2、MSH6、热休克因子 2、AFX、FLIPg d、JAB 1、肌球蛋白、MEKK4、cfcif pSer62UFKHR F0X0 la、MDM2、Fas 配体、P53R2、肌球蛋白调节轻链、hnRNPCl/C2、Ubiquilin 1 (磷酸酶2A)、hnRNP C1/C2、a2_HS糖蛋白(黄牛，牛)、β-肌动蛋白、hnRNP C1/C2、热休克蛋白70kD、β-微管蛋白、ATP依赖的解旋酶II、真核翻译延长因子li32、ER脂筏相关的2同型体1 ( β肌动蛋白)、信号序列受体1 δ、真核翻译起始因子3、亚基3 γ、胆绿素还原酶A (转醛醇酶1)、角蛋白1，10 (旁胸腺素)、GST ω 1、B链多巴胺苯醌结合DJ-I、蛋白酶体激活剂Reg(a)、T-复合蛋白1同型体A、链A甲巯蛋白ERP57 (含伴侣蛋白的TCP1)、泛素激活酶El ；丙氨酰-tRNA合成酶、动力蛋白激活蛋白1、热休克蛋白60kd、β肌动蛋白、 亚精胺合成酶(β肌动蛋白)、热休克蛋白70kd、视网膜母细胞瘤结合蛋白4同型体A、TAR DNA结合蛋白、真核翻译延长因子1 β 2、含伴侣蛋白的TCP1、亚基3、胞质动力蛋白IC-2、血管紧张素转化酶(ACE)、半胱天冬酶3、GARS、基质金属蛋白酶(MMP-6)、溶神经素(NLN)-催化结构域和溶神经素(NLN)、ADRB、CEACAM1、DUSP4、F0XC2、F0XP3、GCGR、GPD1、HM0X1、IL4R、 INPPLU IRS2、VEGFA、假定的c_myc反应性同型体1、PDK1、半胱天冬酶12、磷脂酶Dl、P34 cdc2、P53 BPl、BTK、ASC2、BUBRl、ARTS、PCAF, Rafl、MSKl、SNAP25、APRIL、DAPK, RAIDD、 HATU PSF、HDACU Radl7、生存素、SLIPR、MAG13、半胱天冬酶 10、Crk2、Cdc 6、P21 WAF 1 Cip UASPP UHDAC 4、细胞周期蛋白Bi、CD 40, GAD 65、TAP、Par4 (前列腺凋亡反应蛋白 4)、MRPl、MDCl、层粘连蛋白 2 a2、b 联蛋白，FXR2、膜联蛋白 V、SMAC Diablo、MBNLl、二甲基组蛋白h3、独立生长因子1、似々 65、!1111( 32 2、1^丨80、糖原合酶激酶3、41 2、!101^ MITR、 Neurabinl, APl和Apafl组成的组的标志物在一个实施方式中，测定多个标志物的表达水平。在一个实施方式中，用选自于环境影响剂(environmental influencer)化合物、 外科手术、放射疗法、激素治疗、抗体治疗、应用生长因子、细胞因子的疗法、化学疗法、同种异体干细胞疗法组成的组的疗法治疗受试者。在一个实施方式中，该疗法包括环境影响剂化合物和任选地进一步地包括选自于外科手术、放射疗法、激素治疗、抗体治疗、应用生长因子、细胞因子的疗法、化学疗法、同种异体干细胞疗法组成的组的治疗方案。环境影响剂化合物可以是多维细胞内分子(multidimensional intracellular molecule) (MIM)、外代谢转换剂(epimetabolic shifter)(外-转换剂(epi-shifter))、辅酶QlO分子、维生素D3、乙酰辅酶A、棕榈酰基、L-肉毒碱、酪氨酸、苯丙氨酸、半胱氨酸、小分子、纤维连接蛋白、TNF-α、IL-5、IL-12、IL-23、血管生成因子和/或细胞凋亡因子。在本发明的再另一个方面，提供了用于评估受试者是否患有肉瘤的试剂盒。该试剂盒包括用于测定选自于表2-9中列出的标志物组成的组的至少一个标志物的表达水平的试剂，和应用该试剂盒评估受试者是否患有肉瘤的说明。一方面，本发明提供了用于预测受试者是否具有患肉瘤的倾向的试剂盒，该试剂盒包括用于测定选自于表2-9中列出的标志物组成的组的至少一个标志物的表达水平的试剂，和应用该试剂盒预测受试者是否具有患肉瘤的倾向的说明。在另一个方面，本发明提供了用于预测受试者中肉瘤复发的试剂盒，该试剂盒包括用于评估选自于表2-9中列出的标志物组成的组的至少一个标志物的表达水平的试剂， 和应用该试剂盒预测肉瘤复发的说明。在另一个方面，本发明提供了用于预测肉瘤复发的试剂盒，该试剂盒包括用于测定选自于表2-9中列出的标志物组成的组的至少一个标志物的表达水平的试剂，和应用该试剂盒预测肉瘤复发的说明。在再另一个方面，本发明提供了用于预测患有肉瘤的受试者的生存的试剂盒，该试剂盒包括用于测定选自于表2-9中列出的标志物组成的组的至少一个标志物的表达水平的试剂，和应用该试剂盒预测患有肉瘤的受试者的生存的说明。在另一个方面，本发明提供了用于监测受试者中肉瘤发展的试剂盒，该试剂盒包括用于测定选自于表2-9中列出的标志物组成的组的至少一个标志物的表达水平的试剂， 和应用该试剂盒预测受试者中肉瘤的发展的说明。在再另一个方面，本发明提供了用于评估治疗肉瘤的疗法的效果的试剂盒，该试剂盒包括用于测定选自于表2-9中列出的标志物组成的组的至少一个标志物的表达水平的试剂，和应用该试剂盒评估治疗肉瘤的疗法的效力的说明。本发明的试剂盒可以进一步包含从受试者获得生物样品的手段、对照样品和/或环境影响剂化合物。用于测定至少一个标志物的表达水平的手段可以包括用于分析样品中转录的多核苷酸或其部分的手段和/或用于分析样品中的蛋白质或其部分的手段。在一个实施方式中，该试剂盒包含用于测定多个标志物的表达水平的试剂。
附图简要说明本公开的各种实施方式将在本文下面根据附图进行描述，其中

图1 来自不同的处理组的NCIES0808细胞的显微照片。㈧3小时培养基，⑶3小时50uM的Q10, (C)3小时IOOuM的Q10, (D) 6小时媒介，(E) 6个小时50uM的Q10, (F) 6个小时IOOuM的Q10, (G) 24小时培养基，(H) 24小时50uM的Q10, (I) 24小时IOOuM的Q10, (J) 48小时培养基，(K) 48小时50uM的Q10, (L) 48小时IOOuM的Q10，在任何组中，QlO处理后的细胞数量或形态都没有明显差异。图2 从用50 μ M辅酶QlO处理3个小时的NCIES0808细胞分离的蛋白的示例性抗体阵列的图样分析(pattern analysis)。图3 用辅酶QlO处理M个小时的NCIES0808细胞的2_D凝胶电泳示例凝胶分析。 标记了切除用于鉴别的点。图4 从用50uM或IOOuM辅酶QlO处理M小时的NCIES0808细胞中分离的蛋白质使用不同的抗体进行的Western印迹分析。(A)抗血管紧缩素转化酶(ACE) (Santa Cruz 生物技术公司，sc-23908)。(B)抗半胱天冬酶(abeam公司，ab44976)。(C)抗GARS (abeam 公司，ab42905)。(D)抗基质金属蛋白酶(MMP-6) (Santa Cruz生物技术公司，sc_101453)。 (E)抗溶神经素(NON)-催化结构域(abeam公司，ab59523)。(F)抗溶神经素(NLN) (abeam 公司，ab59519)。图5 ㈧EWS和FLIl蛋白的蛋白质相互作用的网络。(B)ANGPTL3蛋白的蛋白质相互作用的网络。发明详述为了更容易地理解本发明，首先定义一些术语。一、定义本文所使用的下列各个术语具有与其在本节中相关的含义。本文所使用的冠词“一 (a) ”和“一个(an) ”是指一个或多于一个(即指至少一个) 该冠词语法上的宾语。举例来说，“一个元件”是指一个元件或多于一个元件。本文所使用的术语“包括”是指“包括但不限于”并与该短语可互换地使用。本文所使用的术语“或”是指“和/或”并与该术语可互换地使用，除非上下文清楚地表明另外的情况。本文所使用的术语“例如”是指“例如但不限于”，并与该短语可互换地使用。本发明的方法治疗的“患者”或“受试者”可以指人或者非人类的动物，优选地是哺乳动物。应当指出，本文所描述的临床观察是对人类受试者进行的，且至少在某些实施方式中，该受试者是人类。“治疗有效量”是指当用于治疗疾病而向患者施用时，足以实现对该疾病的治疗的化合物的量。当用以预防疾病而施用时，该量足以避免或延缓疾病的发作。“治疗有效量” 将根据化合物、疾病及其严重程度和被治疗的患者的年龄、体重等发生变化。“预防”或“防止”是指减少获得疾病或失调的风险(即导致在可能会暴露于或具有患疾病的倾向但还没有发生或显示疾病症状的患者中不出现该疾病的至少一种临床症状)。术语“预防性的”或“治疗性的”治疗是指向受试者施用一种或多种所述组合物。
19CN 102548549 A如果在有害的病症(例如，宿主动物的疾病或其它有害的状态)的临床表现之前施用，那么该治疗是预防性的，即它保护宿主抵抗有害的病症发生，然而如果在有害的病症表现后施用，该治疗是治疗性的(即，它的目的是减少、缓解或维持现有的有害的病症或由其产生的副作用)。术语“疗效”是指由药理活性物质引起的，在动物中，特别地是哺乳动物中，更特别地是在人体中，局部的或全身性的效应。因此该术语是指在动物或人类中意图用于疾病的诊断、治愈、缓解、治疗或预防的或用于增强希望的身体或精神的发展和状态的任何物质。 短语“治疗有效量”意思是以适用于任何治疗的合理的利益/风险比产生想要的局部或全身性效应的这种物质的量。在某些实施方式中，化合物的治疗有效量将取决于其治疗指数、 溶解性等等。例如，由本发明的方法发现的某些化合物可以足够的量施用以产生适用于这种治疗的合理的利益/风险比。“患者”是指包括马、狗、猫、猪、山羊、兔、仓鼠、猴、豚鼠、大鼠、小鼠、蜥蜴、蛇、绵
羊、牛、鱼和鸟类的任何动物(如人类)。“代谢途径”是指将一种化合物转化为另一种化合物并为细胞功能提供中间体和能源的一系列酶介导的反应。代谢途径可以是线性的或环状的。“代谢状态”是指在给定的时间点通过各种化学和生物指示剂测量的特定细胞、多细胞或组织环境的分子含量，因为它们与健康或疾病的状态有关。术语“微阵列”是指在基底，如纸、尼龙或其它类型的膜、滤器、芯片、载玻片或任何其它合适的固体载体上合成的不同的多核苷酸、寡核苷酸、多肽(如抗体)或肽的阵列。术语“失调”和“疾病”以包容的方式使用，并指与身体的任何部分、器官或系统 (或其任何组合)的正常结构或功能的任何偏离。特定的疾病由特征性的症状和体征表现， 包括生物的、化学的和物理的变化，并且常常与包括，但不仅限于，人口统计的、环境的、职业、遗传的和医疗史的因素的多种其它因素相关。可以通过多种方法定量某些特征性的体征、症状和相关的因素，以产生重要的诊断信息。术语“肉瘤”指连接、支持或包围身体的其它结构和器官的组织的恶性肿瘤。在一个实施方式中，肉瘤是“尤文氏肿瘤族”的肿瘤类型。本文所用的术语“尤文氏肿瘤族”与术语“EFT”互换地使用，并指影响骨骼或附近的软组织的一组癌症。本文所使用的“尤文氏肿瘤族”包括骨骼的尤文氏肿瘤(也称为尤文氏肉瘤)，最常见类型的EFT，骨外尤文氏肉瘤(EOE)，在骨外软组织中生长的肿瘤，以及外周原发性神经外胚层瘤(PPNET)，在骨骼和软组织中发现的癌症，包括Askin肿瘤，其是胸壁的PPNET。本文所使用的术语“表达”是指从DNA产生多肽的过程。该过程包括将基因转录成mRNA和该mRNA翻译成多肽。根据在其中使用的上下文，“表达”可指RNA、蛋白质或两者的产生。术语“细胞中的基因表达水平”或“基因表达水平”是指细胞中基因编码的mRNA、 以及pre-mRNA初生转录本、转录本加工中间体、成熟的mRNA和降解产物的水平。术语“调节”是指反应的上调(即激活或刺激)、下调(即，抑制或阻止)或这两者组合或分离。“调节剂”是调节的化合物或分子，且可以是例如，激动剂、拮抗剂、活化剂、刺激物、抑制物或抑制剂。
“较高的表达水平”、“较高的活性水平”、“提高的表达水平”或“提高的活性水平” 是指测试样品中大于用于评估表达和/或活性的试验的标准误差的表达水平和/或活性， 并且优选为对照样品(例如，源自未患肉瘤的健康受试者的样品)中的标志物的表达水平和/或活性和优选地几个对照样品中的标志物的平均表达水平和/或活性的至少两倍，和更优选地三倍、四倍、五倍或十倍或更多倍，且优选地。“较低的表达水平”、“较低的活性水平”、“降低的表达水平”或“降低的活性水平”是指测试样品中高于用于评估表达和/或活性的试验的标准误差的表达水平和/或活性，但是优选比对照样品(例如，已经被直接地或间接地针对具有用作用于标志物的预测能力的验证标准的随访信息校准的一组肉瘤校准的样品)中的标志物的表达水平和/或活性和优选地几个对照样品中的标志物的平均表达水平和/或活性低至少两倍，优选地三倍、四倍、 五倍或十倍或更多倍。本文所用的“抗体”包括，例如，自然发生的抗体形式(例如，IgG、IgA、IgM、IgE) 和重组抗体，如单链抗体、嵌合的和人源化的抗体及多特异性抗体，以及所有上述的片段及衍生物，该片段和衍生物至少具有抗原结合位点。抗体衍生物可以包含与抗体偶联的蛋白质或化学部分。本文所使用的“已知标准”或“对照”是指关于本发明的标志物的一个或多个量和 /或数学关系(如果适用的话)，和存在或不存在肉瘤。已知标准优选反映复发性肿瘤和非复发性肿瘤和/或侵袭性或非侵袭性肿瘤特征性的这类量和/或数学关系。用于产生已知标准的试剂包括，但不限于，从已知为侵袭性的肿瘤得到的肿瘤细胞、从已知为非侵袭性的肿瘤得到的肿瘤细胞和任选标记的抗体。已知标准也可以包括组织培养细胞系(包括，但不仅限于，已被操作以表达特定的标志物蛋白或者不表达特定的标志物蛋白的细胞系，或者组成地含有恒定量的标志物蛋白或可以被操作(例如，通过暴露于改变化的环境，其中这种改变的环境可以包括但不限于生长因子、激素类、类固醇、细胞因子、抗体、各种药物和抗代谢物、及细胞外基质)以表达标志物蛋白的肿瘤异种移植物。细胞系可直接装载在用于分析的载玻片上、固定、直接作为团粒包埋在石蜡中，或者悬浮于如琼脂糖的基质中，然后固定、石蜡包埋、切片和加工成组织样品。该标准必须针对具有用作标志物蛋白的预测能力的验证标准的随访信息的肉瘤组直接或间接地校准。本文所用的“初级治疗”是指患有肉瘤的受试者的原始治疗。初级治疗包括但不限于，外科手术、放疗、激素治疗、化疗、免疫疗法、血管生成疗法、同种异体干细胞疗法和通过生物调节剂的治疗。如果肉瘤的至少一种症状预计将或者被缓解、终止、减缓或防止，则肉瘤被“治疗”。如本文使用的，如果肉瘤的复发或转移被减少、减缓、延迟或防止，则肉瘤也被“治疗”。试剂盒是包含特异性地检测本发明的标志物的至少一种试剂，如探针，的任何制品(如包装或容器)，该制品作为用于执行本发明的方法的单位推销、分销或出售。本文所使用的术语“三乙醇胺(Tro 1 amine) ”是指三乙醇胺NF、三羟乙基胺、 TEAlan 、TEAlan 99%、三羟乙基胺，99%、三羟乙基胺，NF、或者三羟乙基胺，99%，NF。这些术语在此可以互换使用。本文所使用的“辅酶QlO分子”或“CoQIO分子”包括辅酶Q10、辅酶QlO的组成部分、辅酶QlO的衍生物、辅酶QlO的类似物、辅酶QlO的代谢产物或辅酶生物合成途径的中间体。CoQlO具有以下结构
权利要求
1.ー种治疗或预防人的肉瘤的方法，包括向该个人局部地施用辅酶QlO分子以治疗或预防肉瘤发生。
2.权利要求1的方法，其中所述局部施用是通过为在人体中对所治疗的肉瘤提供疗效而选择的剂量。
3.权利要求1的方法，其中被治疗的肉瘤不是通常通过局部施用来治疗的肉瘤，而是预期以治疗有效水平系统递送活性剂。
4.权利要求1的方法，其中所述辅酶QlO分子在被治疗的人类组织中的浓度与代表健康或正常状态的人类组织的对照标准的浓度不同。
5.权利要求1的方法，其中向人体施用的所述辅酶QlO分子的形式与在人体内系统循环中发现的主要形式不同。
6.权利要求1-5中的任ー项的方法，其中所述治疗通过辅酶QlO分子与选自下组的基因的相互作用进行ANGPTL3、CCL2、CDH5、CXCLl、CXCL3、PRMT3、HDAC2、ー氧化氮合酶 bNOS、 乙酰磷酸化组蛋白H3AL9S10、MTA 2、谷氨酸脱羧酶GAD65 67、KSR、HDAC4、BOBl OBFU al 互生蛋白、BAPl、Importina 57、α E-联蛋白、Grb2、Bax、蛋白酶体 ^S 亚基 13 (Endophilin Bi)、类肌动蛋白6A(真核起始因子4A11)、核氯离子通道蛋白、蛋白酶体26S亚基、Cu/Zn 过氧化物歧化酶、转位蛋白相关因子X、亚砷酸盐移位ATP酶(精胺合成酶)、核糖体蛋白质SA、dCTP焦磷酸酶1、蛋白酶体β 3、蛋白酶体β 4、酸性磷酸酶1、苯ニ氮草结合抑制剂、 ci2-HS糖蛋白(黄牛，牛)、核糖体蛋白P2(RPLP2)；组蛋白H2A、微管相关蛋白、蛋白酶体 α 3、真核翻译延长因子1 δ、核纤层蛋白Bi、mif ニ 3同源物2的SMT3抑制因子、热休克蛋白27kD、hnRNP C1/C2、真核翻译延长因子1 β 2、类似于HSPC-300、DNA指导的DNA聚合酶印islon 3 ； (canopy 2 同源物)、LAMA5、PXLDC1、p300CBP、P53R2、磷脂酰丝氨酸受体、细胞角蛋白肽17、细胞角蛋白肽13、神经丝160200、Rab5、晶丝蛋白、P53R2、MDM2、MSH6、热休克因子 2、AFX、FLIPg d、JAB 1、肌球蛋白、MEKK4、cRaf pSer621、FKHR FOXOla、MDM2、Fas 配体、P53R2、肌球蛋白调节轻链、hnRNPCl/C2、Ubiquilin 1 (磷酸酶 2A)、hnRNP C1/C2、 ci2-HS糖蛋白(黄牛，牛)、β-肌动蛋白、hnRNP C1/C2、热休克蛋白70kD、β-微管蛋白、 ATP依赖的解旋酶II、真核翻译延长因子1 β 2、ER脂筏相关的2同型体1 (β肌动蛋白)、 信号序列受体1 δ、真核翻译起始因子3、亚基3 γ、胆绿素还原酶A(转醛醇酶1)、角蛋白 1,10(旁胸腺素)、GST ω 1、B链多巴胺苯醌结合DJ-I、蛋白酶体激活剂Reg ( α )、T-复合蛋白1同型体Α、链A甲巯蛋白ERP57(含伴侶蛋白的TCP1)、泛素激活酶El ；丙氨酰_tRNA合成酶、动カ蛋白激活蛋白1、热休克蛋白60kd、β肌动蛋白、亚精胺合成酶(β肌动蛋白)、 热休克蛋白70kd、视网膜母細胞瘤结合蛋白4同型体A、TAR DNA结合蛋白、真核翻译延长因子1 β 2、含伴侶蛋白的TCP1、亚基3、胞质动力蛋白IC-2、血管紧张素转化酶(ACE)、半胱天冬酶3、GARS、基质金属蛋白酶(MMP-6)、溶神经素(NLN)-催化结构域和溶神经素(NLN)、 ADRB, CEACAM1、DUSP4、F0XC2、F0XP3、GCGR、GPDl、HM0X1、IL4R、INPPLl、IRS2、VEGFA、假定的c-myc反应性同型体1、PDK1、半胱天冬酶12、磷脂酶D1、P34 cdc2、P53 BP1、BTK、ASC2、 BUBRl、ARTS、PCAF, Rafl、MSKl、SNAP25、APRIL、DAPK, RAIDD、HATl、PSF, HDACl、Radl7、生存素、SLIPR、MAG13、半胱天冬酶 10、Crk2、Cdc 6、P21 WAF 1 Cip UASPP UHDAC 4、细胞周期蛋白Bi、⑶40, GAD 65、TAP、Par4(前列腺凋亡反应蛋白4)、MRPl、MDCl、层粘连蛋白 2 a2、b联蛋白，FXR2、膜联蛋白V、SMAC Diablo、MBNLl、ニ甲基组蛋白h3、独立生长因子1、U2AF65、mTOR、E2F2、Kaiso、糖原合酶激酶 3、ATF2、HDRP MITR、NeurabinI、API 和 Apafl。
7.权利要求2的方法，其中所述辅酶QlO分子以每平方厘米皮肤约0.01至约0. 5毫克辅酶QlO的剂量范围在局部载体中应用于靶组织。
8.权利要求2的方法，其中所述辅酶QlO分子以每平方厘米皮肤约0.09至约0. 15毫克辅酶QlO的剂量范围在局部载体中应用于靶组织。
9.权利要求2的方法，其中所述辅酶QlO分子以每平方厘米皮肤约0.12毫克辅酶QlO 的剂量范围在局部载体中应用于靶组织。
10.权利要求1的方法，其中所述肉瘤是尤文氏肿瘤族中的肉瘤类型。
11.权利要求10的方法，其中所述尤文氏肿瘤族中的肉瘤类型是尤文氏肉瘤。
12.—种抑制人中EWS-FLIl融合蛋白的活性的方法，包括选择患有肉瘤的人类受试者，以及向所述人类受试者施用治疗有效量的辅酶QlO分子，从而抑制EWS-FLIl融合蛋白的活性。
13.一种治疗或预防人中肉瘤的方法，包括按照给药方案向需要的人施用辅酶QlO分子以使得调节人的细胞膜的渗透性，和治疗或预防肉瘤发生。
14.权利要求1-5和8-13中任一项的方法，进一步地包括上调选自于下组的一种或者多种基因的表达水平LAMA5、PXLDCl、p300 CBP, P53R2、 磷脂酰丝氨酸受体、细胞角蛋白肽17、细胞角蛋白肽13、神经丝160 200、Rab5、晶丝蛋白、 P53R2、MDM2、MSH6、热休克因子 2、AFX、FLIPg d、JAB 1、肌球蛋白、MEKK4、cRaf pSer62U FKHR F0X01a、MDM2、Fas配体、P53R2、蛋白酶体洸5亚基13 (Endophilin Bi)、肌球蛋白调节轻链、hnRNP C1/C2,Ubiquilin 1 (磷酸酶 2A)、hnRNP C1/C2、α 2-HS 糖蛋白(黄牛，牛)、 β-肌动蛋白、hnRNP C1/C2、热休克蛋白70kD、微管相关蛋白、β微管蛋白、蛋白酶体α 3、 ATP依赖的解旋酶II、真核翻译延长因子1 δ、热休克蛋白27kD、真核翻译延长因子1 β 2、类似于HSPC-300、ER脂筏相关的2同型体1 (β肌动蛋白)、铜/锌过氧化物歧化酶、信号序列受体 1 δ、ADRB, CEACAM1、DUSP4、F0XC2、F0XP3、GCGR、GPDl、HMOXl、IL4R、INPPLl、IRS2 和 VEGFA^Sm c-myc反应性同型体1、PDK1、半胱天冬酶12、磷脂酶Dl、P34 cdc2、P53BPU BTK、ASC2、BUBRl、ARTS、PCAF, Rafl、MSKl、SNAP25、APRIL、DAPK, RAIDD、HATl、PSF, HDACl、 Radl7、生存素、SLIPR、MAG13、半胱天冬酶 10、Crk2、Cdc 6、P21 WAF 1 Cip UASPP UHDAC 4、细胞周期蛋白Bi、CD 40、GAD 65、TAP、Par4 (前列腺凋亡反应蛋白4)和MRPl ；和/或下调选自于下组的一种或者多种基因的表达水平ANGPTL3、CCL2、raH5、CXCLl、CXCL3、 PRMT3、HDAC2、一氧化氮合酶bNOS、乙酰磷酸化组蛋白H3AL9S10、MTA 2、谷氨酸脱羧酶 GAD6567、KSR、HDAC4、BOBl OBFl、al 互生蛋白、BAPl、Importina 57、α E-联蛋白、Grb2、 Bax、蛋白酶体26S亚基13 (Endophilin Bi)、类肌动蛋白6A(真核起始因子4A11)、核氯离子通道蛋白、蛋白酶体26S亚基，Cu/Zn过氧化物歧化酶、转位蛋白相关因子X、亚砷酸盐移位ATP酶(精胺合成酶)、核糖体蛋白质SA、dCTP焦磷酸酶1、蛋白酶体β 3、蛋白酶体β 4、 酸性磷酸酶1、苯二氮草结合抑制剂、核糖体蛋白Ρ2 (RPIi^)；组蛋白Η2Α、微管相关蛋白、蛋白酶体α 3、真核翻译延长因子1 δ、核纤层蛋白Bi、mif 二 3同源物2的SMT3抑制因子、 热休克蛋白27kD、hnRNP C1/C2、真核翻译延长因子1 β 2、类似于HSPC_300、DNA指导的DNA聚合酶vision 3 ； (canopy 2同源物)、血管紧张素转化酶(ACE)、半胱天冬酶3、GARS、基质金属蛋白酶(MMP-6)、溶神经素(NLN)-催化结构域和溶神经素(NLN)、MDC1、层粘连蛋白 h2、b联蛋白、FXR2、膜联蛋白V、SMAC Diablo、MBNL1、ニ甲基组蛋白h3、独立生长因子1、 U2AF65、mT0R、E2F2、Kaiso、糖原合酶激酶 3、ATF2、HDRP MITR、NeurabinI、API 和 Apafl。
15.权利要求12或13的方法，其中所述治疗通过所述辅酶QlO分子与选自于下组的基因的相互作用进行ANGPTL3、CCL2、CDH5、CXCLl、CXCL3、PRMT3、HDAC2、ー氧化氮合酶 bNOS、 乙酰磷酸化组蛋白H3 AL9 S10,MTA 2、谷氨酸脱羧酶GAD65 67、KSR、HDAC4、B0B1 OBFUal 互生蛋白、BAPl、Importina 57、α E-联蛋白、Grb2、Bax、蛋白酶体 ^S 亚基 13 (Endophilin Bi)、类肌动蛋白6A(真核起始因子4A11)、核氯离子通道蛋白、蛋白酶体26S亚基，Cu/Zn 过氧化物歧化酶、转位蛋白相关因子X、亚砷酸盐移位ATP酶(精胺合成酶)、核糖体蛋白质SA、dCTP焦磷酸酶1、蛋白酶体β 3、蛋白酶体β 4、酸性磷酸酶1、苯ニ氮草结合抑制剂、 ci2-HS糖蛋白(黄牛，牛)、核糖体蛋白P2(RPLP2)；组蛋白H2A、微管相关蛋白、蛋白酶体 α 3、真核翻译延长因子1 δ、核纤层蛋白Bi、mif ニ 3同源物2的SMT3抑制因子、热休克蛋白27kD、hnRNP C1/C2、真核翻译延长因子1 β 2、类似于HSPC-300、DNA指导的DNA聚合酶印islon 3 ； (canopy 2 同源物)、LAMA5、PXLDC1、p300CBP、P53R2、磷脂酰丝氨酸受体、细胞角蛋白肽17、细胞角蛋白肽13、神经丝160200、Rab5、晶丝蛋白、P53R2、MDM2、MSH6、热休克因子 2、AFX、FLIPg d、JAB 1、肌球蛋白、MEKK4、cRaf pSer621、FKHR FOXOla、MDM2、Fas 配体、P53R2、肌球蛋白调节轻链、hnRNPCl/C2、Ubiquilin 1 (磷酸酶 2A)、hnRNP C1/C2、 ci2-HS糖蛋白(黄牛，牛)、β-肌动蛋白、hnRNP C1/C2、热休克蛋白70kD、β-微管蛋白、 ATP依赖的解旋酶II、真核翻译延长因子1 β 2、ER脂筏相关的2同型体1 (β肌动蛋白)、 信号序列受体1 δ、真核翻译起始因子3、亚基3 γ、胆绿素还原酶A(转醛醇酶1)、角蛋白 1,10(旁胸腺素)、GST ω 1、B链多巴胺苯醌结合DJ-I、蛋白酶体激活剂Reg ( α )、T-复合蛋白1同型体Α、链A甲巯蛋白ERP57(含伴侶蛋白的TCP1)、泛素激活酶El ；丙氨酰_tRNA合成酶、动カ蛋白激活蛋白1、热休克蛋白60kd、β肌动蛋白、亚精胺合成酶(β肌动蛋白)、 热休克蛋白70kd、视网膜母細胞瘤结合蛋白4同型体A、TAR DNA结合蛋白、真核翻译延长因子1 β 2、含伴侶蛋白的TCP1、亚基3、胞质动力蛋白IC-2、血管紧张素转化酶(ACE)、半胱天冬酶3、GARS、基质金属蛋白酶(MMP-6)、溶神经素(NLN)-催化结构域和溶神经素(NLN)、 ADRB, CEACAM1、DUSP4、F0XC2、F0XP3、GCGR、GPDl、HM0X1、IL4R、INPPLl、IRS2、VEGFA、假定的c-myc反应性同型体1、PDK1、半胱天冬酶12、磷脂酶D1、P34 cdc2、P53 BP1、BTK、ASC2、 BUBRl、ARTS、PCAF, Rafl、MSKl、SNAP25、APRIL、DAPK, RAIDD、HATl、PSF, HDACl、Radl7、生存素、SLIPR、MAG13、半胱天冬酶 10、Crk2、Cdc 6、P21 WAF 1 Cip UASPP UHDAC 4、细胞周期蛋白Bi、⑶40, GAD 65、TAP、Par4(前列腺凋亡反应蛋白4)、MRPl、MDCl、层粘连蛋白 2 a2、b联蛋白，FXR2、膜联蛋白V、SMAC Diablo、MBNLl、ニ甲基组蛋白h3、独立生长因子1、 じ2八ド65、11111( 』2ド2、1^丨80、糖原合酶激酶3、ム1ド2、!101^ MITR、Neurabin I、APl 和 Apafl。
16.权利要求1-15任ー项的方法，进ー步包含选自于外科手术、放射疗法、激素治疗、 抗体治疗、利用生长因子、細胞因子的疗法、化疗和同种异体干细胞疗法的治疗方案。
17.一种评估用于治疗受试者中肉瘤的疗法的效カ的方法，该方法包括比较向受试者施用治疗方案的至少一部分之前从该受试者获得的第一样品中存在的标志物的表达水平，其中该标志物选自于表2-9中列出的标志物組成的组；和从施用了治疗方案的至少一部分后从受试者获得的第二样品中存在的标志物的表达水平，其中与第一样品相比，第二样品中标志物的表达水平的调节表明该疗法对治疗受试者中的肉瘤是有效的。
18.—种评估受试者是否患有肉瘤的方法，该方法包括测定从受试者获得的生物样品中存在的标志物的表达水平，其中该标志物选自于表 2-9中列出的标志物组成的组；和对比从受试者获得的生物样品中存在的标志物的表达水平和对照样品中存在的标志物的表达水平，其中相对于对照样品中标志物的表达水平，从受试者获得的生物样品中标志物的表达水平的调节表明该受试者患有肉瘤，由此评估受试者是否患有肉瘤。
19.一种预测受试者是否有患肉瘤的倾向的方法，该方法包括测定从受试者获得的生物样品中存在的标志物的表达水平，其中该标志物选自于表 2-9中列出的标志物组成的组；和对比从受试者获得的生物样品中存在的标志物的表达水平和对照样品中存在的标志物的表达水平，其中相对于对照样品中标志物的表达水平，从受试者获得的生物样品中标志物的表达水平的调节表明该受试者易患肉瘤，从而预测受试者是否有患肉瘤的倾向。
20.一种预测受试者中肉瘤复发的方法，该方法包括测定从受试者获得的生物样品中存在的标志物的表达水平，其中该标志物选自于表 2-9中列出的标志物组成的组；和对比从受试者获得的生物样品中存在的标志物的表达水平和对照样品中存在的标志物的表达水平，其中相对于对照样品中标志物的表达水平，从受试者获得的生物样品中标志物的表达水平的调节表明肉瘤的复发，从而预测受试者中肉瘤的复发。
21.一种预测患有肉瘤的受试者的生存的方法，该方法包括测定从受试者获得的生物样品中存在的标志物的表达水平，其中该标志物选自于表 2-9中列出的标志物组成的组；和对比从受试者获得的生物样品中存在的标志物的表达水平和对照样品中存在的标志物的表达水平，其中相对于对照样品中标志物的表达水平，从受试者获得的生物样品中标志物的表达水平的调节是受试者的生存的指示，从而预测患有肉瘤的受试者的生存。
22.—种监测受试者中肉瘤发展的方法，该方法包括比较在向受试者施用治疗方案的至少一部分前从该受试者获得的第一样品中存在的标志物的表达水平和施用了治疗方案的至少一部分后从受试者获得的第二样品中存在的标志物的表达水平，其中该标志物选自于表2-9中列出的标志物组成的组，从而监测受试者中肉瘤的发展。
23.一种鉴别用于治疗受试者中肉瘤的化合物的方法，该方法包括从受试者获得生物样品；将该生物样品与测试化合物接触；测定从受试者获得的生物样品中存在的一种或多种标志物的表达水平，其中该标志物选自于表2-9中列出的具有正倍数变化和/或负倍数变化的标志物组成的组；对比生物样品中该一种或多种标志物的表达水平和适合的对照；和选择降低生物样品中存在的具有负倍数变化的一种或多种标志物的表达水平和/或提高生物样品中存在的具有正倍数变化的一种或多种标志物的表达水平的受试化合物，从而鉴别用于治疗受试者中肉瘤的化合物。
24.权利要求17-23中任一项的方法，其中所述肉瘤是尤文氏肿瘤族中的肉瘤类型。
25.权利要求M的方法，其中所述尤文氏肿瘤族中的肉瘤类型是尤文氏肉瘤。
26.权利要求17-23中任一项的方法，其中所述样品包括从受试者获得的流体。
27.权利要求沈的方法，其中所述流体选自于血液流体、呕吐物、唾液、淋巴液、囊肿液、尿液、通过支气管灌洗收集的流体、通过腹膜冲洗收集的流体和妇科流体组成的组。
28.权利要求27的方法，其中所述样品是血液样品或其成分。
29.权利要求17-23任一项的方法，其中所述样品包括从受试者获得的组织或其成分。
30.权利要求四的方法，其中所述组织选自于骨骼、结缔组织、软骨、肺、肝、肾、肌肉组织、心脏、胰和皮肤组成的组。
31.权利要求17-23中任一项的方法，其中所述受试者是人。
32.权利要求17-23中任一项的方法，其中通过分析样品中转录的多核苷酸或其部分而测定生物样品中标志物的表达水平。
33.权利要求32的方法，其中分析转录的多核苷酸包括扩增该转录的多核苷酸。
34.权利要求17-23中任一项的方法，其中通过分析样品中的蛋白质或其部分测定受试者样品中标志物的表达水平。
35.权利要求34的方法，其中所述蛋白质利用与该蛋白质特异性结合的试剂进行分析。
36.权利要求17-23中任一项的方法，其中使用选自于所述样品的聚合酶链反应(PCR) 扩增反应、逆转录酶PCR分析、单链构象多态性分析(SSCP)、错配裂解检测、异源双链体分析、Southern印迹分析、Northern印迹分析、^festern印迹分析、原位杂交、阵列分析、脱氧核糖核酸测序、限制性片段长度多态性分析及其组合或亚组合组成的组的技术测定样品中标志物的表达水平。
37.权利要求17-23中任一项的方法，其中使用选自于免疫组织化学、免疫细胞化学、 流式细胞分析、ELISA和质谱分析组成的组的技术测定样品中标志物的表达水平。
38.权利要求17-23中任一项的方法，其中所述标志物是选自于下组的标志物 ANGPTL3、CCL2、CDH5、CXCLU CXCL3、PRMT3、HDAC2、一氧化氮合酶 bNOS、乙酰磷酸化组蛋白 H3AL9S10、MTA2、谷氨酸脱羧酶 GAD6567、KSR、HDAC4、BOBl OBFU al 互生蛋白、BAP1、 Importina 57、α E-联蛋白、Grb2、Bax、蛋白酶体 ^S 亚基 13 (Endophilin Bi)、类肌动蛋白 6A(真核起始因子4A11)、核氯离子通道蛋白、蛋白酶体26S亚基，Cu/Zn过氧化物歧化酶、 转位蛋白相关因子X、亚砷酸盐移位ATP酶(精胺合成酶)、核糖体蛋白质SA、dCTP焦磷酸酶1、蛋白酶体β 3、蛋白酶体β 4、酸性磷酸酶1、苯二氮草结合抑制剂、α 2-HS糖蛋白(黄牛，牛)、核糖体蛋白P2(RPLP2)；组蛋白H2A、微管相关蛋白、蛋白酶体α 3、真核翻译延长因子1 S、核纤层蛋白Bi、mif 二 3同源物2的SMT3抑制因子、热休克蛋白27kD，hnRNP Cl/ C2、真核翻译延长因子1 β 2、类似于HSPC-300、DNA指导的DNA聚合酶^islon 3 ； (canopy 2同源物)、LAMA5、PXLDCU p300CBP、P53R2、磷脂酰丝氨酸受体、细胞角蛋白肽17、细胞角蛋白肽13、神经丝160200、Rab5、晶丝蛋白、P53R2、MDM2、MSH6、热休克因子2、AFX、FLIPgd、JAB 1、肌球蛋白、MEKK4、cfcif pSer62UFKHR FOXOla、MDM2、Fas 配体、P53R2、肌球蛋白调节轻链、hnRNP C1/C2、Ubiquilin 1 (磷酸酶 2A)、hnRNP C1/C2、a2_HS 糖蛋白(黄牛， 牛)、β-肌动蛋白、hnRNPCl/C2、热休克蛋白70kD、β -微管蛋白、ATP依赖的解旋酶II、真核翻译延长因子1 β 2、ER脂筏相关的2同型体1 (β肌动蛋白)、信号序列受体1 δ、真核翻译起始因子3、亚基3 γ、胆绿素还原酶A(转醛醇酶1)、角蛋白1，10 (旁胸腺素)、GSTco 1、 B链多巴胺苯醌结合DJ-I、蛋白酶体激活剂Reg( a )、T-复合蛋白1同型体A、链A甲巯蛋白ERP57(含伴侣蛋白的TCP1)、泛素激活酶El ；丙氨酰_tRNA合成酶、动力蛋白激活蛋白 1、热休克蛋白60kd、β肌动蛋白、亚精胺合成酶(β肌动蛋白)、热休克蛋白70kd、视网膜母细胞瘤结合蛋白4同型体A、TAR DNA结合蛋白、真核翻译延长因子1 β 2、含伴侣蛋白的 TCP1、亚基3、胞质动力蛋白IC-2、血管紧张素转化酶(ACE)、半胱天冬酶3、GARS、基质金属蛋白酶(MMP-6)、溶神经素(NLN)-催化结构域和溶神经素(NLN)、ADRB、CEACAM1、DUSP4、 F0XC2、F0XP3、GCGR、GPDU HMOXU IL4R、INPPLU IRS2、VEGFA、假定的 c_myc 反应性同型体 1、PDKl、半胱天冬酶 12、磷脂酶 Dl、P34cdc2、P53BP1、BTK、ASC2、BUBRl、ARTS、PCAF、Rafl、 MSK1、SNAP25、APRIL、DAPK、RAIDD、HATl、PSF、HDACl、Radl7、生存素、SLIPR、MAG13、半胱天冬酶 10、Crk2、Cdc 6, P2IffAF 1 Cip UASPP UHDAC 4、细胞周期蛋白 Bi、CD 40、GAD 65、 TAP、Par4(前列腺凋亡反应蛋白4)、MRP1、MDC1、层粘连蛋白h2、b联蛋白、FXR2、膜联蛋白 V,SMAC Diablo、MBNLl、二甲基组蛋白 h3、独立生长因子 l、U2AF65、mT0R、E2F2、Kaiso、糖原合酶激酶 3、ATF2、HDRP MITR、Neurabin I、API 和 Apafl。
39.权利要求17-23中任一项的方法，其中测定多个标志物的表达水平。
40.权利要求17-23中任一项的方法，其中所述受试者用选自于环境影响剂化合物、夕卜科手术、放射疗法、激素治疗、抗体治疗、用生长因子、细胞因子的疗法、化学疗法、同种异体干细胞疗法组成的组的疗法进行治疗。
41.权利要求40的方法，其中该环境影响剂化合物是辅酶QlO分子。
42.一种用于评估治疗肉瘤的疗法的效力的试剂盒，该试剂盒包括用于测定选自于表 2-9中列出的标志物组成的组的至少一个标志物的表达水平的试剂，和应用该试剂盒评估治疗肉瘤的疗法的效力的说明。
43.一种用于评估受试者是否患有肉瘤的试剂盒，该试剂盒包括用于测定选自于表 2-9中列出的标志物组成的组的至少一个标志物的表达水平的试剂，和应用该试剂盒评估受试者是否患有肉瘤的说明。
44.一种用于预测受试者是否易于发生肉瘤的试剂盒，该试剂盒包括用于测定选自于表2-9中列出的标志物组成的组的至少一个标志物的表达水平的试剂，和应用该试剂盒预测受试者是否易于发生肉瘤的说明。
45.一种用于预测受试者中肉瘤复发的试剂盒，该试剂盒包括用于评估选自于表2-9 中列出的标志物组成的组的至少一个标志物的表达水平的试剂，和应用该试剂盒预测肉瘤复发的说明。
46.一种用于预测肉瘤复发的试剂盒，该试剂盒包括用于测定选自于表2-9中列出的标志物组成的组的至少一个标志物的表达水平的试剂，和应用该试剂盒预测肉瘤复发的说明。
47.一种用于预测患有肉瘤的受试者的生存的试剂盒，该试剂盒包括用于测定选自于表2-9中列出的标志物组成的组的至少一个标志物的表达水平的试剂，和应用该试剂盒预测患有肉瘤的受试者的生存的说明。
48.一个用于监测受试者中肉瘤发展的试剂盒，该试剂盒包括用于测定选自于表2-9 中列出的标志物组成的组的至少一个标志物的表达水平的试剂，和应用该试剂盒预测受试者中肉瘤的发展的说明。
49.权利要求42-48中任一项的试剂盒，进一步包括从受试者获得生物样品的手段。
50.权利要求42-48中任一项的试剂盒，进一步包括对照样品。
51.权利要求42-48中任一项的试剂盒，其中用于测定至少一个标志物的表达水平的手段包括用于分析样品中转录的多核苷酸或其部分的手段。
52.权利要求42-48中任一项的试剂盒，其中用于测定至少一个标志物的表达水平的手段包括用于分析样品中蛋白质或其部分的方法。
53.权利要求42-48中任一项的试剂盒，进一步包括环境影响剂化合物。
54.权利要求42-48中任一项的试剂盒，其中该试剂盒包括用于测定多个标志物的表达水平的试剂。
全文摘要
本申请描述了利用外代谢转换剂，例如辅酶Q10、辅酶Q10的组成部分、辅酶Q10的衍生物、辅酶Q10的类似物、辅酶Q10的代谢产物或辅酶生物合成途径的中间体，治疗人类肉瘤的方法和制剂。还提供了评估肉瘤的治疗效果、诊断和预后的方法。
文档编号A61K31/122GK102548549SQ201080042757
公开日2012年7月4日 申请日期2010年8月25日 优先权日2009年8月25日
发明者J·P·麦库克, N·R·纳莱恩, R·萨兰加拉简 申请人:细胞研究有限公司