专利名称：：免疫原性抗炎组合物的制作方法
技术领域：
：在各个方面，本发明涉及用于治疗由炎症表征的疾病状态的免疫学疗法。在可替代实施方案中，本发明提供了配制用于治疗炎症性疾病状态的抗原组合物的方法。
背景技术：
：在发达国家中多于三分之一的人群被诊断患有癌症。多于四分之一的人因其而死亡。用于癌症的疗法主要依赖于诸如外科手术、化学疗法和辐射的治疗。然而，尽管这些方法对某些类型和阶段的癌症有益，但已证实在许多常见类型和阶段的癌症中具有有限的效能。例如，肿瘤的外科手术治疗需要完全除去癌组织以防止复发。同样，辐射疗法需要完全破坏癌细胞。这是困难的，因为，在理论上，单个恶性细胞能增殖，足以导致癌症复发。此外，外科手术治疗和辐射疗法涉及癌症的局部区域，并且当癌症转移时相对无效。通常，外科手术或辐射或二者都与诸如化学疗法的全身方法组合地使用。然而，化学疗法具有非特异性的问题，有害副作用的共存问题，以及癌细胞发展为对药物耐受的可能性。化学疗法的固有缺点已导致对复原各方面免疫系统的不同尝试来治疗癌症。该工作的子集涉及使用微生物疫苗的免疫。尽管该方法具有较长的历史，但如在下面更详细所讨论的，该领域是非常混乱的混杂状态，该混杂状态有时为与许多失败混在一起的引人注目的成功，这些成功与失败一起没有产生经受得住广泛临床采纳检验的综合性治疗方法。用于治疗癌症的可替代的方法已包括涉及增强免疫系统功能的疗法，例如细胞因子疗法(例如，用于肾癌的重组白介素2和Y干扰素)、树突状细胞疗法、自体肿瘤疫苗疗法、基因改造疫苗疗法、淋巴细胞疗法以及微生物疫苗疗法，后者被认为能以非特异性方式作用于宿主系统。微生物疫苗已经用于针对与癌症相关的病原体而接种个体，所述病原体例如人类乳头瘤病毒。未靶向诱发癌症的生物体的免疫刺激性微生物疫苗，即非特异性免疫刺激性疫苗，例如致热疫苗，具有长久的临床历史，其包括在治疗各种癌症中的成功和失败的报道。例如，已报道Coley疫苗(酿脓链球菌(Streptococcuspyogenes)和粘质沙雷氏菌(Serratiamarcescens)的组合)有助于治疗肉瘤和淋巴瘤(参见,例如NautsHCjFowlerGAAjBogatoFH.Areviewoftheinfluenceofbacterialinfectionandofbacterialproducts[Coley^stoxins]onmalignanttumorsinman.ActaMedScandl953;145[Suppl.276]:5-103)。据报道，临床试验表明Coley疫苗治疗对淋巴瘤和黑色素瘤的益处(参见，例如，KempinS，CirrinconeC，MyersJetal!Combinedmodalitytherapyofadvancednodularlymphomas:theroleofnonspecificimmunotherapy[MBV]asanimportantdeterminantofresponseandsurvival.ProcAmSocClinOncol1983;24:56;KolmelKFjVehmeyerK.Treatmentofadvancedmalignantmelanomabyapyrogenicbacteriallysate:apilotstudy.0nkologiel991;14:411-17)。已经表明，某些非特异性细菌癌症疫苗的效能归因于特定细菌的组分或产物，例如细菌的DNA或内毒素(LPS)，或者是由于它们诱导特定因子的表达，例如肿瘤坏死因子(TNF)或白介素-12。相对广泛的生理学机制已归因于这样的治疗，从发烧的广义效应到抗血管生成机制。根据这些各种原理，已测试了许多微生物疫苗作为用于治疗癌症的一般性免疫刺激物。尽管大部分已表现出阴性结果，但少数已在某些情况下表现出一些引人注目的阳性结果，如下所讨论的。已报道真皮内BCG(牛结核分枝杆菌(Mycobacteriumbovis))疫苗治疗对治疗下列癌症是有效的:胃癌(参见，例如OchiaiT,SatoJ,HayashiR,etal:PostoperativeadjuvantimmunotherapyofgastriccancerwithBCG-cellwallendoskeleton.Three—tosix-yearfollow-upofarandomizedclinicaltrial.CancerImmunolImmunotherl983;14:167-171)以及结肠癌(SmithRE，ColangeloL,WieandHS,BegovicM,WolmarkN.Randomizedtrialofadjuvanttherapyincoloncarcinoma:10-YearresultsofNSABPprotocolC-O1.J.NCI2004;96[15]:1128-32;Uyl-deGrootCA,VermorkenJB，HannaMG,VerboonP，GrootMT，BonselGJ，MeijerCJ，PinedoHM.1mmunotherapywithautologoustumorcel1-BCGvaccineinpatientswithcoloncancer:aprospectivestudyofmedicalandeconomicbenefitsVaccine2005;23[17-18]:2379-87)。发现与化学疗法和福射组合的分枝杆菌w(Mycobacteriumw)疫苗疗法在患有肺癌的患者中显著改善生命质量以及对治疗的应答(参见例如SurPjDastidarA.RoleofMycobacteriumwasadjuvanttreatmentoflungcancer[non-smallcelllungcancer]JIndianMedAssoc2003Feb;101[2]:118-120)。类似地，发现母牛分枝杆菌(Mycobacteriumvaccae)疫苗在肺癌患者中改善生命质量(参见例如0’BrienM，AndersonH，KaukelE,etal.SRL172[killedMycobacteriumvaccae]inadditiontostandardchemotherapyimprovesqualityoflifewithoutaffectingsurvival,inpatientswithadvancednon-small-celllungcancer:phaseIIIresults.Ann0ncol2004Jun;15[6];906-14)以及症状控制(Harper-WynneC，SumpterK，RyanC，etal.AdditionofSRL172tostandardchemotherapyinsmallcelllungcancer[SCLC]improvessymptomcontrol.LungCancer2005Feb;47[2]:289-90)。对于治疗黑色素瘤，短小棒状杆菌(Corynebacteriumparvum)疫苗与趋于改善的存活的趋势有关(参见例如BalchCM，SmalleyRVjBartolucciAAjetal.ArandomizedprospectivetrialofadjuvantC.parvumimmunotherapyin260patientswithclinicallylocalizedmelanoma[stageI]Cancerl982Marl5;49[6]:1079-84)。发现真皮内酿脓链球菌疫苗疗法对治疗胃癌是有效的(参见例如HanaueH，KimDY，MachimuraT,etal.HemolyticstreptococcuspreparationOK-432jbeneficialadjuvanttherapyinrecurrentgastriccarcinoma.TokaiJExpClinMedl987Nov;12[4]:209-14)。发现红色诺卡菌(Nocardiarubra)对治疗肺癌是有效的(参见例如YasumotoK，YamamuraY.Randomizedclinicaltrialofnon-specificimmunotherapywithcell-wallskeletonofNocardiarubra.BiomedPharmacotherl984;38[I]:48-54;OguraT.1mmunotherapyofrespectablelungcancerusingNocardiarubracellwallskeleton.GanToKagakuRyohol983Feb;10[2Pt2]:366-72)，并且对于治疗急性骨髓性白血病，其与改善的存活的趋势有关(OhnoR，NakamuraH，KoderaY，etal.Randomizedcontrolledstudyofchemoimmunotherapyofacutemyelogenousleukemia[AML]inadultswithNocardiarubracell-wallskeletonandirradiatedallogeneicAMLcells.Cancer1986Apr15;57[8]:1483-8)。发现与辐射组合的干酪乳杆菌(Lactobacilluscasei)疫苗治疗对治疗宫颈癌比仅用福射更有效。(参见，例如OkawaT,KitaM,AraiT,etal.PhaseIIrandomizedclinicaltrialofLC9018concurrentlyusedwithradiationinthetreatmentofcarcinomaoftheuterinecervix.1tseffectontumorreductionandhistology.Cancer1989Novl;64[9]:1769-76)。发现铜绿假单胞菌(Pseudomonasaeruginosa)疫苗治疗在治疗淋巴瘤和肺癌中增加了化学疗法的效能(参见例如LiZjHaoD,ZhangH，RenL,etal.AclinicalstudyonPA—MSHAvaccineusedforadjuvanttherapyoflymphomaandlungcancer.HuaXiYiKeDaXueXueBao2000S印；31[3]:334-7)。发现使用天花疫苗(即，牛痘苗病毒疫苗)的儿童期疫苗接种与下列有关:在以后生活中降低黑色素瘤的风险(参见，例如PfahlbergA,KolmelKFjGrangeJM.etal.1nverseassociationbetweenmelanomaandpreviousvaccinationsagainsttuberculosisandsmalIpox:resultsoftheFEBIMstudy.JInvestDermatol2002[119]:570-575)以及在未发展黑色素瘤的那些患者中降低死亡率(参见，例如KolmelKFjGrangeJMjKroneB，etal.PriorimmunizationofpatientswithmalignantmelanomawithvacciniaorBCGisassociatedwithbettersurvival.EuropeanOrganizationforResearchandTreatmentofCancercohortstudyon542patients.EurJCancer41[2005]:118-125)。发现使用狂犬病毒疫苗的治疗在患有黑色素瘤的30个患者中导致8个患者的暂短性缓解(参见，例如HigginsGjPackG.Virustherapyinthetreatmentoftumors.BullHospJointDis1951;12:379-382;PackG.Noteontheexperimentaluseofrabiesvaccineformelanomatosis.ArchDermatol1950;62:694-695)。尽管对使用非特异性免疫剌激性微生物疫苗使免疫系统参与对抗癌症进行了大量尝试，但这些尝试中的大多数已经失败，并且在改善癌症患者人群的存活中仅存在少数普适成功的临床和研究证据。尽管已经认识到免疫剌激性微生物疫苗方法具有希望，但也已认识到巨大挑战为本领域的特点(参见，例如RalfKleef,MaryAnnRichardson,NancyRussell,CristinaRamirez."EndotoxinandExotoxinInducedTumorRegressionwithSpecialReferencetoColeyToxins:ASurveyoftheLiteratureandPossibleImmunologicalMechanisms."ReporttotheNationalCancerInstituteOfficeofAlternativeandComplementaryMedicineAugust1997;DLMager.“BacteriaandCancer:Cause,CoincidenceorCureAReview.，，JournalofTranslationalMedicine28March20064[14]:do1:10.1186/1479-5876-4-14)。炎症性肠疾病(IBD)是常给予结肠和小肠的一组炎症性疾病状态的名称，通常特征为相似的症状和不确定的病因。IBD的主要子型在临床上被认为是克罗恩病和溃疡性结肠炎。除了克罗恩病和溃疡性结肠炎，IBD还可以包括被认为是下列任一种的疾病状态:胶原性结肠炎、淋巴细胞性结肠炎、缺血性结肠炎、改道性结肠炎、贝赫切特综合征或不确定性结肠炎。这些疾病状态之间的差异主要涉及胃肠道(GIT)之间的炎症变化的位置和性质。例如，克罗恩病通常被认为可能影响胃肠道的任何部分，从口腔到肛门，并且大多数情况表现为末端回肠和结肠中复发和减轻消化道的肉芽肿性炎症。相反地，溃疡性结肠炎通常被认为限于结肠和直肠。其中这些炎症性疾病状态可以表现出症状的胃肠道的各种区域包括:肠(bowel)或肠(intestine)，包括小肠(其具有三个部分:十二指肠、空肠和回肠)；大肠(其具有三个部分，盲肠；结肠，其包括升结肠、横结肠、降结肠和乙状弯曲；以及直肠)；以及肛门。对炎症性肠疾病的理解正在发展,但在许多方面还不完全(参见,例如BaumgartDC,CardingSR(2007)"Inflammatoryboweldisease:causeandimmunobiology^TheLancet369(9573):1627-40;BaumgartDC,SandbornWJ(2007)"Inflammatoryboweldisease:clinicalaspectsandestablishedandevolvingtherapies〃TheLancet369(9573):1641-57;XavierRJ,PodolskyDK(2007)"UnravelIingthepathogenesisofinflammatoryboweldisease^Nature448(7152):427-34;J.H.Cho(2008)〃Thegeneticsandimmunopathogenesisofinflammatoryboweldisease〃NatureReviewsImmunology8,458-466)。可以在治疗IBD中使用抗炎症药物和免疫系统抑制剂，例如柳氮磺胺吡啶(Azulfidine)、美沙拉嗪(Asacol、Rowasa)、皮质类固醇(例如，强的松)、硫唑嘌呤(Imuran)、巯嘌呤(Purinethol)、英夫利息(Remicade)、阿达木单抗(Humira)、赛妥珠单抗(Cimzia)、甲氛蝶呤(Rheumatrex)、环抱霉素(Gengraf、Neoral、Sandimmune)或那他珠单抗(Tysabri)。已经建议了用于IBD的可替代的治疗，包括使用各种生物制剂或据称调节天然肠内菌群、有时称为益生菌治疗的治疗(US2007/0258953;US2008/0003207;W02007/076534;W02007/136719;W02010/099824)。例如，已经报道了可以用寄生虫的蓄意感染来治疗IBD,例如通过消耗猪鞭肠虫的活卵细胞(Summersetal.(2003)"Trichurissuisseemstobesafeandpossiblyeffectiveinthetreatmentofinflammatoryboweldisease".Am.J.Gastroenterol.98(9):2034-41;Biiningetal.,(2008)"Helminthsasgovernorsofinflammatoryboweldisease"Gut57:1182-1183;WeinstockandElIiott(2009)"HelminthsandtheIBDhygienehypothesiInflammBowelDis.2009Jan;15(I):128-33)。发明简述在一方面，提供了配制用于治疗在特定器官或组织中特征为炎症的疾病状态的抗炎组合物的方法。所述方法包括选择在所述特定器官或组织中为致病性的至少一种病原体；制备包含抗原决定子的抗原组合物，所述抗原决定子在一起对病原体为特异性的；以及将用于给药的抗原组合物配制为能在所述特定器官或组织中诱发抗炎症应答的抗炎组合物，其中所述特征为炎症的疾病状态不为癌症。所述方法还可以包括在制备所述抗原组合物之前，确定其中炎症为症候的特定器官或组织的诊断步骤。任选地，肿瘤或增殖性疾病状态可以位于特定器官或组织。任选地，可以将抗原组合物配制为用于皮下注射或真皮内注射。任选地，可以将抗原组合物配制为用于注射，从而在给药位点产生局部皮肤免疫应答。任选地，提供了本文详述的方法，以便当特定组织或器官为X时，病原体选自Y。更具体地，认为下列组合在该方法权利要求1.配制用于治疗在特定器官或组织中特征为炎症的疾病状态的抗炎组合物的方法，其包括:a.选择至少一种在所述特定器官或组织中为致病性的病原体；b.制备包含抗原决定子的抗原组合物，所述抗原决定子在一起对所述病原体为特异性的；以及c.将用于给药的所述抗原组合物配制为能在所述特定组织或器官中引发抗炎症应答的抗炎组合物，其中所述特征为炎症的疾病状态不为癌症。2.如权利要求1所述的方法，其还包括在制备所述抗原组合物之前，确定所述炎症为症候的所述特定器官或组织的诊断步骤。3.如权利要求1所述的方法，其中肿瘤位于所述特定器官或组织。4.如权利要求1所述的方法，其中配制所述抗原组合物以用于皮下注射或真皮内注射。5.如权利要求1所述的方法，其中配制所述抗原组合物以用于注射，从而在给药位点产生局部皮肤免疫应答。6.如权利要求1至5中任一项所述的方法，其中所述特定器官或组织为X，并且所述病原体选自Y，其中:7.如权利要求1至5中任一项所述的方法，其中所述特定器官或组织为X，并且所述病原体选自Y，其中:8.如权利要求1至7中任一项所述的方法，其中配制所述抗原组合物以用于重复的皮下或真皮内给药。9.如权利要求1至7中任一项所述的方法，其中配制所述抗原组合物以用于通过非肠途径给药。10.如权利要求1所述的方法，其中所述病原体为细菌、病毒、原生动物、真菌或寄生虫。11.如权利要求10所述的方法，其还包括杀灭病原体以将抗原组合物配制为全杀灭病原体组合物。12.如权利要求10或11所述的方法，其中所述病原体为在所述特定器官或组织中为内源性菌群的物种的成员。13.如权利要求1所述的方法，其中所述病原体为外源性物种。14.治疗个体的在特定器官或组织中特征为炎症的疾病状态的方法，其包括向所述个体给予包含抗原决定子的抗炎组合物，选择或配制所述抗原决定子以便它们在一起对在所述特定器官或组织中为致病性的至少一种病原体为特异性的。15.如权利要求14所述的方法，其中在至少两周的剂量持续时间内，以一小时至一个月的给药间隔给予的连续剂量，在给药位点给予所述抗炎组合物。16.抗炎组合物在用于治疗个体的在特定器官或组织中特征为炎症的疾病状态的用途，其中所述抗炎组合物包含抗原决定子，选择或配制所述抗原决定子以便它们在一起对在所述特定器官或组织中为致病性的至少一种微生物病原体为特异性的。17.抗炎组合物在配制用于治疗个体的在特定器官或组织中特征为炎症的疾病状态的药物的用途，其中所述抗炎组合物包含抗原决定子，选择或配制所述抗原决定子以便它们在一起对在所述特定器官或组织中为致病性的至少一种微生物病原体为特异性的。18.如权利要求16或17所述的用途，其中所述个体患有位于所述器官或组织的癌症。19.如权利要求16或17所述的用途，其中在至少两周的给药持续时间内，以一小时至一个月的给药间隔给予的连续剂量，在给药位点给予所述抗炎组合物。20.配制用于治疗在人类患者的胃肠道(GIT)区域中为症候的炎症性肠疾病(IBD)的免疫原性组合物的方法，其包括:a.选择至少一种在所述肠道区域为致病性的病原体；b.制备包含在一起对所述病原体为特异性的抗原决定子的抗原组合物；以及c.将用于给药的所述抗原组合物配制为能引发免疫应答以治疗患者的炎症性场疾病的免疫原性组合物。21.如权利要求20所述的方法，其中配制所述抗原组合物以用于皮下注射或真皮内注射。22.如权利要求20所述的方法，其还包括在制备所述抗原组合物之前，确定其中所述IBD为症候的GIT区域的诊断步骤。23.如权利要求20所述的方法，其中配制所述抗原组合物以用于注射，从而在给药位点产生局部皮肤免疫应答。24.如权利要求23所述的方法，其中所述皮肤免疫应答为炎症性免疫应答。25.如权利要求20所述的方法，其中所述GIT区域为口腔、胃、小肠、结肠、直肠或肛门区域。26.如权利要求20所述的方法，其中所述IBD为克罗恩氏病、溃疡性结肠炎、胶原性结肠炎、淋巴细胞性结肠炎、缺血性结肠炎、改道性结肠炎、贝赫切特综合征或不确定性结肠炎。27.如权利要求20至26中任一项所述的方法，其中配制所述抗原组合物以用于重复的皮下或真皮内给药。28.如权利要求20至26中任一项所述的方法，其中配制所述抗原组合物以用于通过非肠途径给药。29.如权利要求20至28中任一项所述的方法，其中所述病原体为细菌、病毒、真菌、原生动物或寄生虫。30.如权利要求29所述的方法，其还包括杀灭病原体以将抗原组合物配制为全杀灭病原体组合物。31.如权利要求29或30所述的方法，其中所述病原体为在所述GIT区域中为内源性菌群的物种的成员。32.如权利要求20至31中任一项所述的方法，其中所述抗原组合物能在患者中引发对所述病原体为特异性的免疫应答。33.如权利要求11所述的方法，其中所述病原体为外源性物种。34.如权利要求20所述的方法，其还包括配制所述抗原组合物以用于与抗炎症药物或免疫抑制药物一起给药。35.如权利要求34所述的方法，其中所述药物为柳氮磺胺吡啶、美沙拉嗪、皮质类固醇、硫唑嘌呤、巯嘌呤、英夫利息、阿达木单抗、赛妥珠单抗、甲氨蝶呤、环孢霉素或那他珠单抗。36.如权利要求20所述的方法，其中制备所述抗原组合物以便所述抗原组合物基本由在所述GIT区域各自为致病性的一种或多种病原体的抗原决定子组成。37.用于治疗人类患者的在胃肠道(GIT)区域为症候的炎症性疾病(IBD)的方法，其包括向所述患者给予包含有效量的抗原组合物的药物，所述抗原组合物包含在一起对至少一种病原体为特异性的抗原决定子，其中基于所述病原体在所述GIT区域为致病性而选择所述病原体。38.如权利要求37所述的方法，其中在至少两周的剂量持续时间内，以一小时至一个月的给药间隔给予的连续剂量，在给药位点给予所述药物。39.如权利要求37所述的方法，其中按剂量给予所述药物，从而每一剂量在给药位点有效诱发明显的局部炎症性免疫应答。40.如权利要求37至39中任一项所述的方法，其中真皮内或皮下给予所述药物。41.如权利要求37至39中任一项所述的方法，其中通过非肠途径给予所述药物。42.如权利要求37至41中任一项所述的方法，其中给予所述药物以便在I至48小时内出现给药位点处的明显局部炎症。43.如权利要求37至42中任一项所述的方法，其还包括向所述患者给予有效量的抗炎症药物或免疫抑制药物。44.如权利要求43所述的方法，其中所述药物为柳氮磺胺吡啶、美沙拉嗪、皮质类固醇、硫唑嘌呤、巯嘌呤、英夫利息、阿达木单抗、赛妥珠单抗、甲氨蝶呤、环孢霉素或那他珠单抗。45.如权利要求37至44中任一项所述的方法，其中所述区域为X，并且所述病原体选自Y，其中:当X为:Y为下列中的一种或多种:_46.如权利要求37至44中任一项所述的方法，其中所述抗原组合物基本由在所述GIT区域各自为致病性的一种或多种病原体的抗原决定子组成。47.如权利要求37至46中任一项所述的方法，其还包括诊断患者已经经过对所述病原体的在前致病性暴露的步骤。48.如权利要求37至47中任一项所述的方法，其中所述病原体为细菌，并且所述抗原组合物为全杀灭细菌细胞组合物。49.选择用于治疗患者的在胃肠道(GIT)区域中为症候的炎症性肠疾病(IBD)的抗原组合物的方法，其包括:确定GIT区域；基于组合物包含在一起对在所述GIT区域中为治病性的至少一种病原体为特异性的抗原决定子，而选择抗原组合物。50.治疗位于个体肺部的癌症的方法，所述方法包括:a.向所述个体给予有效量的在所述肺部为致病性的一种或多种微生物物种的抗原；以及b.向所述个体给予有效量的含钼的化疗剂。51.如权利要求50所述的方法，其中所述微生物物种为病毒病原体、细菌病原体或真菌病原体。52.如权利要求51所述的方法，其中所述病毒病原体为流感病毒、腺病毒、呼吸道合胞体病毒或副流感病毒。53.如权利要求51所述的方法，其中所述细菌病原体为肺炎链球菌、卡他莫拉菌、肺炎支原体、肺炎克雷白杆菌、流感嗜血杆菌、金黄色葡萄球菌、肺炎衣原体或嗜肺军团杆菌。54.如权利要求51所述的方法，其中所述真菌病原体为烟曲霉、芽生菌、球孢子菌、Coccidiodesposadasi1、新型隐球菌、格特隐球菌、镰刀菌、荚膜组织胞衆菌、拟青霉、巴西副球孢子菌、马尔尼菲青霉菌、耶氏肺孢子菌、波伊德伪霉样真菌、尖端赛多孢子菌、根霉菌、毛霉菌、犁头霉、小克银汉霉、多育赛多孢、纸板葡萄穗霉、长枝木霉或多孢子菌。55.如权利要求50至54中任一项所述的方法，其中所述含钼的化疗剂为顺钼、卡钼或奥沙利钼。56.如权利要求55所述的方法，其中所述化疗剂为顺钼。57.比较免疫应答的方法，所述方法包括:向具有器官或组织的动物给予包含含有抗原决定子的抗原组合物的药物，选择或配制所述抗原决定子以便所述抗原决定子在一起对在所述器官或组织中为致病性的至少一种微生物病原体为特异性的；从所述器官或组织提取可量化的免疫样品；在给予所述药物之后，测量在所述可量化的免疫样品中的器官或组织的免疫应答特征；以及将所述可量化的免疫样品的免疫应答的特征与从相应的器官或组织获得的参考免疫样品中的免疫应答的相应特征进行比较。58.如权利要求57所述的方法，其中在给予药物的步骤之前从动物中的相应器官或组织获得所述参考免疫样品。59.如权利要求57所述的方法，其中从第二动物的相应器官或组织中获得所述参考免疫样品。60.如权利要求57所述的方法，其中所述动物患有位于所述器官或组织的癌症。61.如权利要求57所述的方法，其中比较所述免疫应答的特征可以包括比较在所述可量化和参考免疫样品中下列细胞中的任一种或多种的数量指征:炎症性单核细胞、巨噬细胞、CDllb+Gr-1+细胞、树突状细胞、CDllc+MHC11+类细胞、CD4+T细胞、CD8+T细胞或NK细胞。62.如权利要求61所述的方法，其中所述巨噬细胞可以包括下列中的任一种或多种:Ml-样巨噬细胞或M2-样巨噬细胞。63.如权利要求62所述的方法，其中比较所述免疫应答的特征包括比较巨噬细胞的激活态的变化。64.如权利要求63所述的方法，其中所述巨噬细胞从M2-样巨噬细胞变化为Ml-样巨噬细胞。65.如权利要求63所述的方法，其中所述巨噬细胞从Ml-样巨噬细胞变化为M2-样巨噬细胞。66.如权利要求57所述的方法，其中比较免疫应答的特征可以包括在所述可量化和参考免疫样品中确定在下列细胞中的任一种或多种上的细胞标记:炎症性单核细胞、巨噬细胞、CDllb+Gr-1+细胞、树突状细胞、CDllc+MHC11+类细胞、CD4+T细胞、CD8+T细胞或NK细胞。67.如权利要求66所述的方法，其中所述巨噬细胞可以包括下列中的任一种或多种:Ml-样巨噬细胞或M2-样巨噬细胞。68.如权利要求57所述的方法，其中比较免疫应答的特征可以包括在所述可量化和参考免疫样品中确定由下列细胞中的任一种或多种产生的细胞因子:炎症性单核细胞、巨噬细胞、CDllb+Gr-1+细胞、树突状细胞、CDllc+MHC11+类细胞、CD4+T细胞、CD8+T细胞或NK细胞。69.如权利要求68所述的方法，其中所述巨噬细胞可以包括下列中的任一种或多种:Ml-样巨噬细胞或M2-样巨噬细胞。70.如权利要求69所述的方法，其中由于巨噬细胞的激活态的变化而产生所述细胞因子。71.如权利要求70所述的方法，其中所述巨噬细胞从M2-样巨噬细胞变化为Ml-样巨噬细胞。72.如权利要求70所述的方法，其中所述巨噬细胞从Ml-样巨噬细胞变化为M2-样巨噬细胞。73.选择性靶向个体中癌组织或器官的免疫应答的方法，所述方法包括:向所述个体给予包含有效量的致病性抗原组合物的药物，其中所述抗原组合物可以在所述个体的特定癌器官或组织中为致病性的，并且所述抗原组合物包含在一起对所述病原体为特异性的抗原决定子。74.监测治疗方案在正被治疗特定器官或组织中的癌症的个体中的效能的方法，所述方法包括:在所述个体进行所述治疗方案一段时间之后，测量从所述特定器官或组织获得的治疗后免疫样品中的免疫应答特征，其中:比未进行所述治疗方案的个体所预期的更大量级的免疫应答特征存在时，表明所述治疗方案的效能；以及所述治疗方案包括给予包含微生物病原体的一种或多种抗原决定子的制剂，所述微生物病原体在健康个体的相应的特定器官或组织中为致病性的。75.如权利要求74所述的方法，其还包括下列步骤:测量在预治疗参考样品中的免疫应答的特征，其中在所述治疗方案开始之前、同时或之后但在获得后治疗免疫样品之前，从所述特定的器官或组织获得所述预治疗参考样品；以及比较在所述预治疗和后治疗样品中的免疫应答的特征；其中与所述预治疗参考样品相比，所述后治疗免疫样品中的免疫应答量级的增加表明治疗方案的效能。76.如权利要求75所述的方法，其中测量所述免疫应答的特征包括测定下列细胞类型中的任一种或多种的数量指征:单核细胞、巨噬细胞、CDllb+Gr-1+细胞、树突状细胞、CDllc+MHCII+型细胞、CD4+T细胞、CD8+T细胞或NK细胞。77.如权利要求75所述的方法，其中比较所述免疫应答的特征包括在所述参考和免疫样品中确定在下列细胞中的任一种或多种上的细胞标记:炎症性单核细胞、巨噬细胞、CDllb+Gr-1+细胞、树突状细胞、CDllc+MHC11+类细胞、CD4+T细胞、CD8+T细胞或NK细胞。78.如权利要求75所述的方法，其中比较所述免疫应答的特征包括在所述参考和免疫样品中确定由下列细胞中的任一种或多种产生的细胞因子:炎症性单核细胞、巨噬细胞、CDllb+Gr-1+细胞、树突状细胞、CDllc+MHC11+类细胞、CD4+T细胞、CD8+T细胞或NK细胞。79.如权利要求78所述的方法，其中由于巨噬细胞的激活态的变化而产生所述细胞因子。80.如权利要求79所述的方法，其中所述巨噬细胞从M2-样巨噬细胞变化为Ml-样巨噬细胞。81.如权利要求79所述的方法，其中所述巨噬细胞从Ml-样巨噬细胞变化为M2-样巨噬细胞。82.如权利要求75所述的方法，其中比较所述免疫应答的特征包括在所述参考和免疫样品中确定由下列细胞中的任一种或多种产生的差异基因表达:炎症性单核细胞、巨噬细胞、CDllb+Gr-1+细胞、树突状细胞、CDllc+MHC11+类细胞、CD4+T细胞、CD8+T细胞或NK细胞。83.如权利要求82所述的方法，其中所述巨噬细胞可以包括下列中的任一种或多种:Ml-样巨噬细胞或M2-样巨噬细胞。84.如权利要求82所述的方法，其中由于巨噬细胞的激活态的变化而产生所述差异基因表达。85.如权利要求84所述的方法，其中所述巨噬细胞从M2-样巨噬细胞变化为Ml-样巨噬细胞。86.如权利要求84所述的方法，其中所述巨噬细胞从Ml-样巨噬细胞变化为M2-样巨噬细胞。87.如权利要求1至5中任一项所述的方法，其中所述特定器官或组织为X，并且所述病原体选自Y:全文摘要本发明提供了配制用于治疗特定器官或组织中炎症性疾病状态的抗炎组合物的方法。所述方法包括选择在所述特定器官或组织中为致病性的至少一种病原体；制备包含抗原决定子的抗原组合物，所述抗原决定子在一起对病原体为特异性的；以及将用于给药的抗原组合物配制为能在所述特定器官或组织中诱发抗炎症应答的抗炎组合物，其中所述特征为炎症的疾病状态不为癌症。在本发明的实施方案中，癌症位于所述特定器官或组织。文档编号A61K39/12GK103140238SQ201180045079公开日2013年6月5日申请日期2011年7月26日优先权日2010年7月26日发明者哈罗尔·戴维·贡,萨利姆·丹吉申请人:Qu生物制药公司