1.一种包含干扰素-β(IFN-β)蛋白的组合物，其中至少80％的所述干扰素-β蛋白在对应于根据SEQ ID NO:1的干扰素-β1a蛋白的氨基酸25位的氨基酸位置上的氨基酸天冬酰胺处脱酰胺。
2.如权利要求1所述的组合物，其特征在于，所述IFN-β蛋白是IFN-β1a。
3.如权利要求1或2所述的组合物，其特征在于，在所述氨基酸天冬酰胺中，天冬酰胺残基被天冬氨酸残基、异天冬氨酸残基或环酰亚胺残基如琥珀酰亚胺替换。
4.如权利要求3所述的组合物，其特征在于，约65％至约70％的天冬酰胺残基被天冬氨酸残基替换。
5.如权利要求1-4中任一项所述的组合物，其显示出增加的免疫调节活性。
6.如前述权利要求中任一项所述的组合物，其特征在于，所述IFN-β蛋白经糖基化。
7.如权利要求6所述的组合物，其特征在于，所述IFN-β蛋白具有在CHO细胞中产生的IFN-β蛋白的糖基化模式。
8.如权利要求6所述的组合物，其特征在于，在所述IFN-β蛋白中，所有聚糖链经唾液酸化，优选如同CHO细胞进行的唾液酸化。
9.一种修饰的IFN-β1a蛋白，其中对应于根据SEQ ID NO:1的干扰素-β1a蛋白的氨基酸25位的氨基酸位置上的氨基酸天冬酰胺经脱酰胺。
10.用于治疗的如前述权利要求中任一项所述的组合物或修饰的IFN-β1a蛋白。
11.用作免疫调节剂的如前述权利要求中任一项所述的组合物或修饰的IFN-β1a蛋白。
12.用作疫苗或用于癌症免疫治疗的如前述权利要求中任一项所述的组合物或修饰的IFN-β1a蛋白。
13.如前述权利要求中任一项所述的组合物，还包含抗氧化剂。
14.如权利要求1-9中任一项所述的组合物或修饰的IFN-β1a蛋白，其用于治疗对象中选自下组的病症：病毒感染、癌症、和神经疾病。
15.权利要求14所述使用的组合物或修饰的IFN-β1a蛋白，其特征在于，所述治疗包括上调I型MHC复合物。
16.权利要求14或15所述使用的组合物或修饰的IFN-β1a蛋白，其特征在于，所述治疗与化学免疫疗法、化疗、放疗、和/或其他治疗剂，如抗病毒剂、细胞因子或化学治疗性抗体联用。
17.一种使蛋白质脱酰胺的方法，包括：
(a)在碱性条件下孵育待脱酰胺的蛋白质约16至约24小时，优选20小时；并且
(b)纯化脱酰胺的蛋白。
18.如权利要求17所述的方法，其特征在于，所述蛋白质是IFN-β，尤其是IFN-β1a。
19.如权利要求17或18所述的方法，其特征在于，所述孵育在约8.9至约9.5的pH下进行。
20.如权利要求17-19中任一项所述的方法，其特征在于，所述孵育在约20℃至约25℃的温度下进行。
21.如权利要求19-20中任一项所述的方法，其特征在于，所述纯化包括超滤。