一种用于检测人嗜T淋巴细胞病毒1型的试剂盒的制作方法

文档序号:14784070发布日期:2018-06-27 21:42阅读:244来源:国知局

本发明涉及生物检测领域,尤其是涉及一种用于检测人嗜T淋巴细胞病毒1型的试剂盒。



背景技术:

人嗜T淋巴细胞病毒1型与多种疾病有关,主要与成人T细胞白血病有密切关系,其传播途径主要是输血、性传播、静脉吸毒和家庭内传播,广泛分布与全世界,主要流行于日本西南部、加勒比海地区、非洲中部和中国东南沿海,严重威胁公共卫生安全。目前对人嗜T淋巴细胞病毒1型的检测主要采用传统的酶联免疫吸附法、明胶颗粒凝集法和间接荧光法,存在窗口期长、操作繁琐、假阳性和假阴性等问题。PCR技术由于其灵敏度高、特异性好和操作简便等优点,已经越来越广泛的应用于病毒检测,但目前尚未有将PCR技术应用于人嗜T淋巴细胞病毒1型检测方面。



技术实现要素:

本发明的目的在于提供一种采用PCR技术检测人嗜T淋巴细胞病毒1型的试剂盒。

为实现上述目的,本发明可采取下述技术方案:

本发明所述的用于检测人嗜T淋巴细胞病毒1型的试剂盒,包括由红细胞裂解液、反应液1、反应液2、阴性质控品和阳性质控品构成的反应体系;所述反应液1中包括根据人嗜T淋巴细胞病毒1型gap区的特异性设计的2条特异性引物和1条特异性探针,依据人基因组β珠蛋白的特异性设计的2条引物和1条特异性探针:

引物1:5’- AGCCTTACCACACCTTCGTAG -3’(SEQ ID No.1);

引物2:5’- TGGCATTCTTTGTTTGCATTGGAG -3’(SEQ ID No.2);

引物3:5’- TGGAACATATTTGACGGCTTT -3’(SEQ ID No.3);

引物4:5’- GATCTTAGCTACTACTGCCAA -3’(SEQ ID No.4);

探针1:FAM- ACGTAGCCCTTGACAACGGACT –BHQ1(SEQ ID No.5);

探针2:ROX- AAACCCACTGCATCACTCT –BHQ2(SEQ ID No.6)。

所述反应液2中含有20~30mM MgCl2和0.09%叠氮化钠。

所述阴性质控品中仅含人β珠蛋白基因质粒;所述阳性质控品中含有人嗜T淋巴细胞病毒1型RNA片段的质粒和人β珠蛋白基因质粒。

所述红细胞裂解液中包含0.1~0.2M NH4Cl,0.1~0.2mM EDTA和10~20mM NaHCO3。

本发明的优点在于利用聚合酶链式反应技术,在50℃ 2min,94℃ 2min,(94℃ 5s, 55℃ 30s)40循环扩增条件下,使用实时荧光定量PCR仪进行荧光检测,依据Ct值对人嗜T淋巴细胞病毒1型进行定性检测,使用内部对照(β珠蛋白)、阴性质控品和阳性质控品对检测结果进行监控。

使用本发明试剂盒,能在较短的时间内定性检测人嗜T淋巴细胞病毒1型;灵敏度高,最低检出限为100 Copies/ml;特异性好,本发明根据gap区基因序列设计1对引物,与其他病原体无交叉干扰,具有较高的特异性。本发明对于人嗜T淋巴细胞病毒1型的输血诊断与临床检测具有较高的参考价值,适于推广应用。

附图说明

图1是采用本发明试剂盒对20份最低检出限样本进行检测的扩增曲线图。

具体实施方式

实施例1 试剂盒反应体系(聚合酶链式反应)的准备:

1、红细胞裂解液:H2O 200ul,其中包含0.1~0.2M NH4Cl,0.1~0.2mM EDTA和10~20mM NaHCO3。

2、反应液1:pH8.0的 0.1M Tris-HCl 30ul,其中包括4pmol/µl引物1、4 pmol/µl引物2、4pmol/µl引物3、4 pmol/µl引物4、1 pmol/µl探针1、1 pmol/µl探针2、10U Taq酶、5U MMLV、0.1U UNG和10×PCR反应缓冲液,四条引物及两条探针分别为:

引物1:5’- AGCCTTACCACACCTTCGTAG -3’(SEQ ID No.1);

引物2:5’- TGGCATTCTTTGTTTGCATTGGAG -3’(SEQ ID No.2);

引物3:5’- TGGAACATATTTGACGGCTTT -3’(SEQ ID No.3);

引物4:5’- GATCTTAGCTACTACTGCCAA -3’(SEQ ID No.4);

探针1:FAM- ACGTAGCCCTTGACAACGGACT –BHQ1(SEQ ID No.5);

探针2:ROX- AAACCCACTGCATCACTCT –BHQ2(SEQ ID No.6)。

3、反应液2:H2O 10ul,其中包含20~30mM MgCl2和0.09%叠氮化钠。

4、阴性质控品:TE 50ul,含人β珠蛋白基因质粒,浓度为103 Copies/ml。

5、阳性质控品:TE 50ul,含人嗜T淋巴细胞病毒1型RNA片段的质粒和人β珠蛋白基因质粒,浓度均为103 Copies/ml。

实施例2 用实施例1的反应体系按以下方法对人嗜T淋巴细胞病毒1型进行定性检测

待测样品为含有100copies/ml人嗜T淋巴细胞病毒1型的人全血样本,当然,也可以为其他可能含有人嗜T淋巴细胞病毒1型的样本类型。

1、全血前处理

将全血样本与红细胞裂解液以1:3的体积比加入离心管中混合,上下颠倒混匀10次后,12000r/min离心5min;去上清,用1ml的生理盐水重悬沉淀。

2、模板RNA提取(可使用商用提取试剂盒提取模板RNA,以备后续PCR反应使用,如可使用芯超生物--全血基因组DNA/RNA提取试剂盒):

1)添加10ul磁珠混悬液到上述处理后的待检样本中(磁珠混悬液的基础液是H2O,包含直径为0.5nm~1nm的超纯磁性氧化硅纳米磁珠);

2)再添加1ml裂解液到待检样本中,室温裂解3min(裂解液的基础液是H2O,包含3~5M的异硫氰酸胍和0.5%的Tween-20);

3)使用磁板对待检样本靠磁30s,去上清液;

4)在上述离心管中添加2ml洗液A,吹打混匀(洗液A的基础液是H2O,包含1~3M的高氯酸钠,0.1~0.5M 乙酸钾和25%的乙醇);

5)使用磁板对待检样本靠磁30s,去上清液;

6)上述离心管中添加2ml洗液B,吹打混匀(洗液B的基础液是H2O,包含70~85%的乙醇);

7)使用磁板对待检样本靠磁30s,去上清液;

8)在离心管中添加0.2ml洗脱液,吹打混匀(洗脱液:pH8.0 TE);

9)70℃解离后靠磁取出上清液备用。

3、聚合酶链式反应:在100µl PCR管配制反应体系:PCR反应液1 10µl,PCR反应液2 10µl,模板RNA 20~50µl(阴阳性质控按照模板加样量直接添加),将上述反应管于50℃ 2min,94℃ 2min,(94℃ 5s, 55℃ 30s)40循环扩增条件下反应。

4、结果判定:阴性质控品应ROX显示Ct值≤40,FAM显示No Ct;阳性质控品应ROX显示Ct值≤40,FAM显示Ct值≤35。在以上2个条件下,仪器ROX显示Ct值≤40,FAM显示No Ct表示待检样品为阴性;仪器ROX显示Ct值≤40,FAM显示Ct值≤45表示待检样品为阴性。

按照上述方法对20份最低检出限样本进行检测,得到的扩增曲线如图1所示,数据如表1所示:

结论:采用本发明试剂盒对上述20例100 Copies/ml的阳性临床样本进行检测,结果均为阳性,证明本发明试剂盒的检测限可以达到100 Copies/ml。

当前第1页1 2 3 
网友询问留言 已有0条留言
  • 还没有人留言评论。精彩留言会获得点赞!
1