基于mNGS检测CAR-T细胞制品中病原微生物的方法建立及应用与流程

文档序号:33752493发布日期:2023-04-18 13:19阅读:来源:国知局

技术特征:

1.一种基于mngs技术检测car-t细胞制品中病原微生物的方法,其特征在于,包括:

2.根据权利要求1所述方法,其特征在于,所述供试品包括新鲜car-t细胞制品、冻存car-t细胞制品,所述car-t细胞来源于健康供体或者患者体内的t细胞。

3.根据权利要求1或2所述方法,其特征在于,所述car-t细胞包括从健康供体或者患者体内获得的t细胞一直到体外培养、刺激、转导和扩增之后的成品car-t细胞。

4.根据权利要求1-3任一项所述方法,其特征在于,所述car-t细胞包括以cd30为靶点的细胞制品,也包含其他所有靶点的car-t细胞制品。

5.根据权利要求1所述方法,其特征在于,步骤s4中所述比对分析包括:

6.根据权利要求5所述方法,其特征在于,所述宿主基因组包括人类参考基因组序列和炎黄基因组序列。

7.根据权利要求5所述方法,其特征在于,步骤s43中所述与病原微生物基因组进行比对,基于下列中的至少之一确定所述测序数据中来自于所述病原微生物的测序数据:

8.一种如权利要求1-7任一项所述的方法在病原微生物检测中的应用。


技术总结
本发明提出了基于mNGS(metagenomic next‑generation sequencing,宏基因组测序)技术检测CAR‑T细胞制品中病原微生物的方法及应用,属于基因检测技术领域。一种基于mNGS技术检测CAR‑T细胞制品中病原微生物的方法,包括:S1.基于mNGS检测CAR‑T细胞制品的核酸提取;S2.基于mNGS检测CAR‑T细胞制品的文库制备;S3.基于mNGS检测CAR‑T细胞制品的测序;S4.分析CAR‑T细胞制品测序数据。本发明建立了一种高效的、规范的、易于标准化的、能够用于CAR‑T细胞制品快速放行的检测方法。通过大大缩短CAR‑T细胞制品外源性病原微生物风险因子的检测时间,能极大缩短患者等待CAR‑T细胞产品的时间,从而更好地造福患者、服务临床。

技术研发人员:张同存,刘宇,祝海川,吴寒,孙钒
受保护的技术使用者:武汉波睿达生物科技有限公司
技术研发日:
技术公布日:2024/1/13
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