1.一种鉴定具有增加的白叶枯病抗性的水稻植物的方法,所述方法包括:
a.在所述水稻植物中检测与增加的白叶枯病抗性相关的抗性基因等位基因,其中所述抗性基因等位基因包含seqidno:5的核苷酸51处的blb4抗性基因中的“t”;并且
b.将所述水稻植物鉴定为具有qtl等位基因,其中所述水稻植物具有增加的blb4抗性。
2.如权利要求1所述的方法,所述方法进一步包括从育种程序中反向选择所述水稻植物。
3.一种鉴定具有增加的白叶枯病抗性的水稻植物的方法,所述方法包括:
a.在水稻植物的基因组中检测以下中的任一种:
i.多核苷酸,所述多核苷酸编码具有seqidno:3中所示的氨基酸序列的多肽;
ii.多核苷酸,所述多核苷酸编码具有与seqidno:3至少80%相同的氨基酸序列的多肽,所述多肽具有反向转运蛋白/钠离子转运蛋白活性;
iii.多核苷酸,所述多核苷酸包含seqidno:2中所示的序列;
iv.多核苷酸,所述多核苷酸包含seqidno:4中所示的序列;或
v.(i)或(ii)的5cm内的一个或多个标记等位基因,所述一个或多个标记等位基因与(i)或(ii)连锁并相关联;并且
b.如果检测到(i)、(ii)或(iii)中的任何一种,则将水稻植物鉴定为具有增加的白叶枯病抗性。
4.一种增加植物中blb疾病抗性的方法,所述方法包括:
a.在植物中表达重组多核苷酸,所述重组多核苷酸编码具有当与seqidno:3相比时具有至少80%序列同一性的氨基酸序列的多肽;并且
b.当与不包含所述重组多核苷酸的对照植物相比时,所述植物对白叶枯病的抗性增加。
5.如权利要求4所述的方法,所述方法进一步包括启动子区,所述启动子区包含如seqidno:4中所示的核酸。
6.如权利要求4所述的方法,所述方法进一步包括获得衍生自表达所述重组多核苷酸的植物的后代植物,其中所述后代植物在其基因组中包含所述重组多核苷酸,并且与不包含所述重组多核苷酸的对照植物相比,表现出增加的白叶枯病抗性。
7.如权利要求4所述的方法,其中所述植物选自由以下组成的组:拟南芥、玉蜀黍、大豆、向日葵、高粱、低芥酸菜籽、小麦、苜蓿、棉花、水稻、大麦、粟、甘蔗和柳枝稷。
8.如权利要求4所述的方法,其中所述植物是单子叶植物。
9.一种鉴定水稻blb4基因变体的方法,所述水稻blb4基因变体提供给植物增加的白叶枯病抗性,所述方法包括以下步骤:
a.通过基因改组组合一个或多个核苷酸序列以产生blb4基因的变体,所述一个或多个核苷酸序列编码seqidno:3的一个或多个片段、与seqidno:3至少80%相同的蛋白质或其片段;并且
b.鉴定表现出增加的白叶枯病抗性的变体。
10.如权利要求9所述的方法,其中所述方法进一步包括以下步骤:
a.将重组构建体引入可再生植物细胞,所述重组构建体包含通过如权利要求9所述的方法鉴定的blb4基因的变体;
b.在步骤(a)之后,由所述可再生植物细胞再生转基因植物,其中所述转基因植物在其基因组中包含重组dna构建体;并且
c.选择(b)的转基因植物,其中所述转基因植物包含所述重组dna构建体并且在与不包含所述重组dna构建体的对照植物进行比较时表现出对白叶枯病增加的抗性。
11.如权利要求9或10所述的方法,其中所述植物选自由以下组成的组:拟南芥、玉蜀黍、大豆、向日葵、高粱、低芥酸菜籽、小麦、苜蓿、棉花、水稻、大麦、粟、甘蔗和柳枝稷。
12.如权利要求9或10所述的方法,其中所述植物是单子叶植物。
13.如权利要求12所述的方法,其中所述单子叶植物是水稻。
14.一种鉴定blb4基因的等位基因变体的方法,其中所述等位基因变体与增加的对盐胁迫和/或干旱的耐受性相关联,所述方法包括以下步骤:
a.获得水稻植物的群体,其中所述水稻植物表现出不同水平的blb4抗性;
b.评估针对编码包含seqidno:3的蛋白质的多核苷酸序列的等位基因变异,或在调节编码所述蛋白质的多核苷酸的表达的基因组区域中的等位基因变异;
c.将等位基因变体与增加的白叶枯病抗性相关联;并且
d.鉴定与增加的白叶枯病抗性相关联的等位基因变体。
15.如权利要求14所述的方法,所述方法进一步包括检测与增加的白叶枯病抗性相关联的所述等位基因变体,和如果检测到所述等位基因变体,则选择水稻植物。
16.一种引入blb4基因的等位基因变体的方法,其中所述等位基因变体与对白叶枯病的抗性增加有关,所述方法包括使用锌指核酸酶、转录激活因子样效应核酸酶(talen)、crispr/cas系统或大范围核酸酶在内源性blb4基因中引入突变,使得所述等位基因变体包含编码与seqidno:3至少80%相同的蛋白的多核苷酸序列。
17.一种重组dna构建体,所述重组dna构建体包含与至少一个调节序列可操作地连接的多核苷酸,其中所述多核苷酸包含核酸序列,所述核酸序列编码当与seqidno:3相比时具有至少80%序列同一性的氨基酸序列。
18.如权利要求17所述的重组dna构建体,其中所述至少一个调节序列是在植物细胞中有功能的启动子。
19.一种转基因植物细胞,所述转基因植物细胞包含如权利要求17所述的重组dna构建体。
20.一种转基因植物,所述转基因植物包含如权利要求19所述的转基因植物细胞。
21.如权利要求20所述的转基因植物,其中所述转基因植物选自由以下组成的组:拟南芥、玉蜀黍、大豆、向日葵、高粱、低芥酸菜籽、小麦、苜蓿、棉花、水稻、大麦、粟、甘蔗和柳枝稷。
22.一种由如权利要求21所述的转基因植物产生的转基因种子。
23.一种鉴定和/或选择具有增加的白叶枯病抗性的水稻植物的方法,所述方法包括:
a.筛选具有标记的群体,所述标记位于7号染色体上的包含并侧翼有r1091-7-06和r1091-7-007的区间内,以确定来自所述群体的一个或多个水稻植物是否包含基因等位基因,所述等位基因包含在seqidno:5的核苷酸51处的blb4抗性基因中的“t”以及由以下组成的组中的成员:
i.在r1091-7-06处的“g”;
ii.在r1091-7-021处的“g”;
iii.在r1091-7-022处的“c”;
iv.在r1091-7-027处的“g”;
v.在r1091-7-028处的“g”;
vi.在r1091-7-026处的“g”;
vii.在r1091-7-42处的“t”;
viii.在r1091-7-037处的“a”;
ix.在r1091-7-030处的“c”;
x.在r1091-7-018处的“g”;
xi.在r1091-7-053处的“g”;
xii.在r1091-7-052处的“c”;
xiii.在r1091-7-040处的“g”;
xiv.在r1091-7-044处的“t”;
xv.在r1091-7-039处的“a”;
xvi.在r1091-7-024处的“c”;以及
xvii.在r1091-7-007处的“g”;并且
b.从所述群体中选择包含所述基因等位基因的至少一个水稻植物。
24.如权利要求23所述的方法,所述方法进一步包括:
a.将(b)中的水稻植物与第二水稻植物杂交;并且
b.获得具有所述基因等位基因的后代植物。